View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_21 (Length: 318)

Name: NF0157_low_21
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_21
NF0157_low_21
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (1-234)||(21395868-21396101)
chr8 (1-234)||(21790361-21790594)
chr8 (1-234)||(21389338-21389571)
chr8 (34-234)||(21778697-21778897)
chr8 (29-234)||(16199559-16199765)
chr8 (29-234)||(31971257-31971463)
chr8 (29-234)||(45130911-45131117)
chr8 (31-234)||(21918915-21919121)
chr8 (29-234)||(20536208-20536416)
chr8 (29-234)||(18879150-18879352)
chr8 (29-233)||(28648957-28649164)
chr8 (29-234)||(22626736-22626943)
chr8 (29-234)||(18818322-18818530)
chr8 (46-234)||(16092272-16092463)
chr8 (162-234)||(5866323-5866395)
chr8 (29-234)||(7372778-7372978)
chr8 (121-234)||(17140916-17141031)
chr8 (29-234)||(21923841-21924049)
chr8 (29-234)||(22875065-22875273)
chr8 (29-237)||(6759255-6759464)
chr8 (162-234)||(21490995-21491067)
chr8 (118-234)||(6520368-6520486)
chr8 (136-234)||(23406379-23406479)
chr8 (162-234)||(38855300-38855372)
chr8 (162-234)||(23760893-23760962)
chr8 (117-218)||(20498578-20498681)
chr8 (121-231)||(14409495-14409606)
chr8 (162-215)||(983455-983508)
chr8 (162-234)||(21249384-21249457)
chr8 (162-234)||(21255222-21255295)
chr8 (117-215)||(21285616-21285716)
chr8 (162-230)||(26355747-26355815)
chr8 (121-231)||(1484402-1484513)
chr8 (121-231)||(5853343-5853454)
chr8 (121-215)||(16413367-16413462)
chr8 (121-231)||(20403227-20403338)
chr8 (121-231)||(22001753-22001864)
chr8 (163-218)||(24353036-24353091)
chr8 (163-218)||(37116363-37116418)
chr8 (29-233)||(23648554-23648761)
chr8 (161-218)||(19154935-19154992)
chr8 (138-227)||(13508108-13508199)
chr8 (162-234)||(17612159-17612231)
chr8 (163-218)||(17267044-17267099)
chr8 (121-231)||(20046246-20046357)
chr8 (121-231)||(41598188-41598299)
chr8 (134-231)||(15203295-15203393)
chr8 (29-98)||(25363053-25363123)
chr8 (117-215)||(26219733-26219831)
chr8 (117-231)||(26225295-26225409)
chr8 (121-231)||(4483281-4483391)
chr8 (172-231)||(4542477-4542535)
chr8 (163-218)||(17439557-17439612)
chr8 (172-231)||(19896265-19896323)
chr8 (165-227)||(13597669-13597731)
chr8 (134-215)||(15070574-15070656)
chr8 (1-43)||(17353823-17353865)
chr8 (135-218)||(19801447-19801530)
chr8 (134-215)||(45290759-45290841)
chr8 (166-215)||(21673723-21673772)
chr8 (181-237)||(19937118-19937174)
chr8 (115-232)||(18678102-18678221)
chr8 (165-219)||(20502154-20502207)
chr8 (181-231)||(25484380-25484430)
chr8 (115-232)||(32121734-32121853)
chr8 (163-219)||(22525573-22525628)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (29-234)||(16282-16487)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (29-234)||(1289-1494)
scaffold0106 (29-234)||(7266-7471)
scaffold0106 (165-231)||(15291-15356)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (29-234)||(20309108-20309313)
chr2 (29-234)||(38029-38235)
chr2 (16-234)||(23285865-23286082)
chr2 (1-234)||(23103282-23103516)
chr2 (29-234)||(22731147-22731355)
chr2 (29-231)||(298727-298933)
chr2 (16-234)||(23654286-23654507)
chr2 (29-234)||(22738093-22738300)
chr2 (29-234)||(23076442-23076650)
chr2 (34-234)||(23060513-23060716)
chr2 (29-234)||(22337115-22337323)
chr2 (29-234)||(23660023-23660230)
chr2 (1-230)||(40622094-40622327)
chr2 (121-231)||(22105412-22105524)
chr2 (162-234)||(23071998-23072070)
chr2 (162-230)||(7679589-7679657)
chr2 (158-234)||(8946657-8946732)
chr2 (162-229)||(28405981-28406048)
chr2 (161-218)||(23207293-23207350)
chr2 (117-218)||(7735-7838)
chr2 (162-234)||(19671830-19671902)
chr2 (170-234)||(23040247-23040310)
chr2 (162-230)||(25175854-25175922)
chr2 (121-231)||(571397-571508)
chr2 (121-231)||(18808943-18809054)
chr2 (162-233)||(22134256-22134326)
chr2 (121-231)||(23130862-23130973)
chr2 (121-231)||(23133329-23133440)
chr2 (121-231)||(23135590-23135701)
chr2 (121-231)||(23709583-23709694)
chr2 (121-231)||(23712064-23712175)
chr2 (121-231)||(26505379-26505490)
chr2 (121-231)||(26507857-26507968)
chr2 (121-231)||(34402573-34402684)
chr2 (121-231)||(39682313-39682424)
chr2 (134-231)||(6725995-6726093)
chr2 (85-215)||(23708589-23708721)
chr2 (121-233)||(32214972-32215085)
chr2 (163-218)||(20520243-20520298)
chr2 (121-215)||(24367790-24367885)
chr2 (162-215)||(18786952-18787005)
chr2 (136-228)||(21155126-21155219)
chr2 (161-218)||(22413186-22413243)
chr2 (121-231)||(24898246-24898358)
chr2 (121-231)||(24900729-24900841)
chr2 (121-231)||(24903206-24903318)
chr2 (121-231)||(24905683-24905795)
chr2 (121-231)||(24908158-24908270)
chr2 (165-217)||(32451981-32452033)
chr2 (163-218)||(23004764-23004819)
chr2 (163-218)||(25108903-25108958)
chr2 (121-231)||(32039549-32039660)
chr2 (181-231)||(28577099-28577149)
chr2 (181-231)||(38967374-38967424)
chr2 (181-231)||(45029966-45030016)
chr2 (172-229)||(43137301-43137357)
chr2 (163-219)||(23287378-23287433)
chr2 (136-231)||(24529595-24529691)
chr2 (172-228)||(24643054-24643109)
chr2 (163-218)||(23791289-23791344)
chr2 (164-219)||(26392397-26392451)
chr2 (163-218)||(24697657-24697712)
chr2 (4-42)||(23038227-23038265)
chr2 (1-42)||(23019592-23019633)
chr2 (115-215)||(25616204-25616306)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (29-234)||(27847746-27847951)
chr7 (29-232)||(40443393-40443597)
chr7 (29-234)||(12698831-12699040)
chr7 (29-234)||(9509189-9509397)
chr7 (29-234)||(16386160-16386369)
chr7 (29-234)||(10589039-10589246)
chr7 (16-234)||(26211995-26212217)
chr7 (29-231)||(18456326-18456530)
chr7 (1-230)||(17137949-17138177)
chr7 (1-230)||(12187019-12187247)
chr7 (46-234)||(38227481-38227671)
chr7 (46-231)||(3564294-3564482)
chr7 (121-234)||(13647325-13647440)
chr7 (162-234)||(16495402-16495474)
chr7 (162-234)||(28505347-28505419)
chr7 (162-234)||(34200786-34200858)
chr7 (162-234)||(67745-67817)
chr7 (117-231)||(48273392-48273508)
chr7 (162-234)||(11996076-11996148)
chr7 (115-234)||(16219717-16219835)
chr7 (117-215)||(2280121-2280221)
chr7 (162-230)||(811180-811248)
chr7 (162-230)||(18005650-18005718)
chr7 (162-230)||(44014182-44014250)
chr7 (162-234)||(47831807-47831879)
chr7 (115-231)||(16213684-16213801)
chr7 (121-231)||(17061966-17062077)
chr7 (162-234)||(15754936-15755008)
chr7 (121-231)||(456321-456432)
chr7 (121-231)||(11972496-11972607)
chr7 (121-231)||(14949173-14949284)
chr7 (121-231)||(15376764-15376875)
chr7 (121-231)||(16232520-16232631)
chr7 (121-231)||(16410059-16410170)
chr7 (121-231)||(18640272-18640383)
chr7 (121-231)||(20385174-20385285)
chr7 (121-231)||(21189646-21189757)
chr7 (121-215)||(24275187-24275282)
chr7 (121-231)||(32125491-32125602)
chr7 (121-231)||(41522917-41523028)
chr7 (121-231)||(41525379-41525490)
chr7 (121-230)||(11393338-11393448)
chr7 (117-234)||(18430709-18430827)
chr7 (117-234)||(22072913-22073033)
chr7 (121-231)||(24704688-24704796)
chr7 (117-215)||(16056347-16056446)
chr7 (121-231)||(24702238-24702349)
chr7 (121-231)||(27216860-27216971)
chr7 (121-231)||(44116509-44116620)
chr7 (134-231)||(13869346-13869444)
chr7 (158-215)||(12901342-12901399)
chr7 (163-215)||(14044765-14044817)
chr7 (163-215)||(14354795-14354847)
chr7 (172-231)||(3386333-3386391)
chr7 (138-234)||(10063841-10063939)
chr7 (163-218)||(20220238-20220293)
chr7 (161-215)||(1868043-1868097)
chr7 (162-212)||(12255842-12255892)
chr7 (181-231)||(20110556-20110606)
chr7 (161-218)||(15008547-15008604)
chr7 (161-218)||(48991196-48991253)
chr7 (171-215)||(15144096-15144139)
chr7 (162-234)||(19486793-19486865)
chr7 (163-206)||(14036282-14036325)
chr7 (163-206)||(14346312-14346355)
chr7 (156-215)||(18154885-18154943)
chr7 (116-181)||(2530139-2530205)
chr7 (181-231)||(13831373-13831423)
chr7 (117-215)||(38898423-38898523)
chr7 (165-219)||(9177718-9177772)
chr7 (1-99)||(18154722-18154821)
chr7 (181-230)||(19649557-19649606)
chr7 (1-86)||(24054618-24054702)
chr7 (181-233)||(2832509-2832561)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (29-234)||(17046487-17046692)
chr4 (29-234)||(14053215-14053422)
chr4 (16-234)||(12902757-12902978)
chr4 (16-234)||(7088877-7089098)
chr4 (29-232)||(22636437-22636642)
chr4 (29-234)||(44052829-44053037)
chr4 (29-227)||(23374272-23374473)
chr4 (29-234)||(16270149-16270356)
chr4 (29-231)||(16377436-16377639)
chr4 (53-234)||(7798774-7798958)
chr4 (1-148)||(15121689-15121834)
chr4 (29-234)||(16239883-16240090)
chr4 (162-234)||(15551817-15551889)
chr4 (115-234)||(52873367-52873488)
chr4 (29-229)||(14038653-14038856)
chr4 (158-234)||(3096293-3096368)
chr4 (29-234)||(7893703-7893908)
chr4 (115-234)||(6899891-6900011)
chr4 (117-218)||(13853-13956)
chr4 (162-230)||(12774011-12774079)
chr4 (162-234)||(39706337-39706409)
chr4 (118-215)||(12288211-12288312)
chr4 (117-231)||(54798756-54798872)
chr4 (162-215)||(52243245-52243298)
chr4 (117-231)||(14280316-14280431)
chr4 (121-231)||(18215325-18215436)
chr4 (117-231)||(44928926-44929042)
chr4 (162-230)||(8846360-8846428)
chr4 (121-231)||(12358-12469)
chr4 (121-231)||(15118403-15118514)
chr4 (165-232)||(22353835-22353901)
chr4 (121-231)||(23803316-23803427)
chr4 (121-231)||(44615288-44615399)
chr4 (121-231)||(44773138-44773249)
chr4 (121-231)||(51463919-51464030)
chr4 (121-231)||(52312510-52312621)
chr4 (169-215)||(43198611-43198657)
chr4 (121-237)||(19242693-19242810)
chr4 (121-233)||(19618223-19618336)
chr4 (161-218)||(46640504-46640561)
chr4 (165-217)||(6190479-6190531)
chr4 (121-231)||(1837560-1837671)
chr4 (121-231)||(3515007-3515118)
chr4 (121-231)||(18239470-18239581)
chr4 (121-231)||(50222390-50222501)
chr4 (163-218)||(53082202-53082257)
chr4 (134-215)||(15355389-15355471)
chr4 (117-215)||(8574871-8574969)
chr4 (134-234)||(15367690-15367791)
chr4 (134-234)||(15370018-15370119)
chr4 (134-234)||(15371202-15371303)
chr4 (134-234)||(15373483-15373584)
chr4 (134-234)||(15402703-15402804)
chr4 (29-108)||(3096772-3096851)
chr4 (172-231)||(7641286-7641344)
chr4 (172-231)||(12610950-12611008)
chr4 (33-98)||(17047989-17048055)
chr4 (116-181)||(43256161-43256227)
chr4 (181-231)||(44102214-44102264)
chr4 (181-234)||(16223532-16223585)
chr4 (121-215)||(14970758-14970853)
chr4 (183-218)||(21815699-21815734)
chr4 (162-196)||(16596686-16596720)
chr4 (163-219)||(17333292-17333347)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (29-234)||(51582-51787)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (29-234)||(965-1170)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (29-234)||(16920546-16920751)
chr6 (29-234)||(22831503-22831710)
chr6 (28-222)||(11185517-11185711)
chr6 (62-234)||(35245586-35245758)
chr6 (29-234)||(20360873-20361081)
chr6 (29-234)||(20638196-20638404)
chr6 (29-234)||(29060540-29060748)
chr6 (115-234)||(16496244-16496365)
chr6 (29-234)||(19303454-19303661)
chr6 (29-234)||(20593773-20593981)
chr6 (29-234)||(25629268-25629476)
chr6 (29-233)||(18409740-18409947)
chr6 (115-234)||(20076700-20076817)
chr6 (33-234)||(17287713-17287917)
chr6 (29-234)||(22780140-22780348)
chr6 (162-234)||(27333267-27333339)
chr6 (162-234)||(27394007-27394079)
chr6 (162-234)||(28496520-28496592)
chr6 (162-234)||(29808931-29809003)
chr6 (134-231)||(25656629-25656727)
chr6 (121-231)||(22782227-22782338)
chr6 (117-215)||(25644339-25644440)
chr6 (162-215)||(9098563-9098616)
chr6 (117-215)||(20109157-20109257)
chr6 (162-234)||(1561303-1561375)
chr6 (162-230)||(19652199-19652267)
chr6 (121-231)||(1595549-1595660)
chr6 (121-231)||(12742317-12742428)
chr6 (121-231)||(18334643-18334754)
chr6 (121-231)||(19005046-19005157)
chr6 (121-231)||(19858970-19859081)
chr6 (121-231)||(24422547-24422658)
chr6 (121-231)||(25754809-25754920)
chr6 (121-231)||(33861794-33861905)
chr6 (121-231)||(33864278-33864389)
chr6 (117-234)||(23019408-23019525)
chr6 (121-233)||(30676761-30676874)
chr6 (121-231)||(2291231-2291342)
chr6 (121-231)||(8055029-8055140)
chr6 (121-231)||(26924691-26924802)
chr6 (121-218)||(18456732-18456830)
chr6 (121-218)||(18461892-18461990)
chr6 (169-215)||(19668390-19668436)
chr6 (172-234)||(25714417-25714478)
chr6 (121-211)||(4185827-4185919)
chr6 (163-216)||(23076748-23076801)
chr6 (121-233)||(34963371-34963484)
chr6 (163-216)||(35008166-35008219)
chr6 (136-215)||(25688518-25688598)
chr6 (121-231)||(1540962-1541073)
chr6 (134-228)||(16448591-16448686)
chr6 (121-231)||(20556943-20557054)
chr6 (187-234)||(22080799-22080846)
chr6 (172-218)||(18821904-18821949)
chr6 (116-181)||(27415942-27416008)
chr6 (161-219)||(33443062-33443119)
chr6 (162-234)||(8227560-8227632)
chr6 (172-231)||(3852121-3852179)
chr6 (121-211)||(4186390-4186482)
chr6 (168-219)||(18199473-18199523)
chr6 (1-43)||(19863171-19863213)
chr6 (156-230)||(19873120-19873193)
chr6 (1-43)||(19873313-19873355)
chr6 (156-230)||(22432249-22432322)
chr6 (156-230)||(22438799-22438872)
chr6 (181-230)||(19862978-19863027)
chr6 (1-86)||(22438951-22439035)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (29-231)||(5044-5246)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (29-234)||(38801304-38801508)
chr1 (16-234)||(27250629-27250850)
chr1 (16-234)||(21026680-21026901)
chr1 (29-233)||(50210126-50210333)
chr1 (29-231)||(34509783-34509988)
chr1 (33-234)||(22532269-22532473)
chr1 (134-234)||(20847173-20847275)
chr1 (121-234)||(45574893-45575008)
chr1 (162-234)||(14295600-14295672)
chr1 (117-218)||(21896258-21896361)
chr1 (29-159)||(22354485-22354616)
chr1 (117-218)||(21861572-21861675)
chr1 (162-230)||(22921918-22921986)
chr1 (7-98)||(48603652-48603744)
chr1 (162-234)||(33681010-33681079)
chr1 (85-218)||(35261051-35261183)
chr1 (29-233)||(20135188-20135395)
chr1 (117-234)||(22237630-22237746)
chr1 (162-215)||(16758668-16758721)
chr1 (162-215)||(20918623-20918676)
chr1 (162-215)||(21754064-21754117)
chr1 (121-231)||(13988866-13988977)
chr1 (121-231)||(21923342-21923453)
chr1 (121-231)||(23593786-23593897)
chr1 (117-231)||(31612313-31612428)
chr1 (163-218)||(50614167-50614222)
chr1 (163-218)||(50621995-50622050)
chr1 (162-234)||(52928019-52928088)
chr1 (165-218)||(16368338-16368391)
chr1 (162-230)||(20248283-20248351)
chr1 (165-233)||(20454606-20454673)
chr1 (121-232)||(21840766-21840878)
chr1 (121-231)||(21475138-21475249)
chr1 (115-233)||(22468696-22468816)
chr1 (117-231)||(433012-433125)
chr1 (134-215)||(22123131-22123214)
chr1 (181-234)||(13212974-13213027)
chr1 (161-218)||(41050084-41050141)
chr1 (181-237)||(21342090-21342146)
chr1 (172-231)||(29298137-29298195)
chr1 (172-231)||(29776688-29776746)
chr1 (181-231)||(21346961-21347011)
chr1 (181-231)||(21707167-21707217)
chr1 (181-231)||(21711709-21711759)
chr1 (164-218)||(50686627-50686681)
chr1 (1-99)||(21714684-21714783)
chr1 (181-237)||(15860121-15860177)
chr1 (136-231)||(16275430-16275526)
chr1 (161-216)||(16093933-16093988)
chr1 (163-218)||(26064954-26065009)
chr1 (183-233)||(16361915-16361965)
chr1 (156-230)||(21714546-21714619)
chr1 (116-181)||(33797573-33797639)
chr1 (29-108)||(22356087-22356168)
chr1 (29-108)||(22357773-22357854)
chr1 (172-230)||(21161720-21161778)
chr1 (189-219)||(21533948-21533978)
chr1 (181-233)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (29-234)||(46995-47200)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (29-234)||(10339-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (29-234)||(32067-32272)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (29-234)||(13497-13703)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (29-234)||(15378-15584)
scaffold0114 (1-230)||(7295-7523)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (29-234)||(4712-4919)
scaffold0358 (29-159)||(13-143)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-233)||(174767-175000)
scaffold0021 (164-234)||(121766-121835)
scaffold0021 (29-142)||(124679-124793)
scaffold0021 (158-218)||(136414-136474)
scaffold0021 (158-218)||(145122-145182)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (29-234)||(21292883-21293090)
chr5 (4-227)||(37723910-37724134)
chr5 (34-234)||(8286760-8286964)
chr5 (29-234)||(23390409-23390617)
chr5 (16-234)||(22075018-22075240)
chr5 (29-234)||(24493569-24493776)
chr5 (115-234)||(21729064-21729185)
chr5 (115-234)||(21808389-21808510)
chr5 (29-231)||(24529223-24529428)
chr5 (29-234)||(9077952-9078160)
chr5 (29-234)||(25421532-25421740)
chr5 (1-230)||(22032323-22032549)
chr5 (1-230)||(18769890-18770118)
chr5 (29-234)||(13025311-13025518)
chr5 (29-234)||(13095495-13095702)
chr5 (162-234)||(19660884-19660956)
chr5 (162-234)||(36314577-36314649)
chr5 (29-214)||(25431414-25431602)
chr5 (134-234)||(21997553-21997655)
chr5 (36-234)||(1096467-1096668)
chr5 (118-234)||(21329500-21329618)
chr5 (1-136)||(23572178-23572312)
chr5 (118-218)||(20026942-20027046)
chr5 (162-230)||(22959581-22959649)
chr5 (115-234)||(21502156-21502277)
chr5 (119-230)||(21565546-21565659)
chr5 (117-231)||(22412187-22412302)
chr5 (121-231)||(264819-264930)
chr5 (121-231)||(10732991-10733102)
chr5 (121-231)||(20909012-20909123)
chr5 (121-231)||(39363384-39363495)
chr5 (134-231)||(39245136-39245234)
chr5 (162-215)||(26012084-26012137)
chr5 (162-234)||(19668898-19668970)
chr5 (136-215)||(20902075-20902155)
chr5 (162-218)||(22144065-22144121)
chr5 (121-231)||(29329934-29330045)
chr5 (121-231)||(42245416-42245527)
chr5 (134-231)||(11581263-11581361)
chr5 (121-231)||(36154834-36154942)
chr5 (161-218)||(22178269-22178326)
chr5 (136-231)||(2154680-2154776)
chr5 (134-228)||(18319098-18319193)
chr5 (172-231)||(20918052-20918110)
chr5 (121-231)||(29345980-29346091)
chr5 (134-231)||(10775740-10775838)
chr5 (116-181)||(18356367-18356433)
chr5 (115-215)||(18418599-18418699)
chr5 (116-181)||(20910800-20910866)
chr5 (134-231)||(31061068-31061166)
chr5 (181-231)||(38619434-38619484)
chr5 (181-230)||(23064512-23064561)
chr5 (16-99)||(22107273-22107357)
chr5 (1-207)||(21873277-21873482)
chr5 (121-231)||(29348453-29348564)
chr5 (121-231)||(29350926-29351037)
chr5 (121-231)||(32027393-32027504)
chr5 (165-219)||(15796434-15796487)
chr5 (1-43)||(23501231-23501273)
chr5 (164-218)||(26740697-26740750)
chr5 (164-213)||(26732884-26732932)
chr5 (162-234)||(40725853-40725925)
chr5 (156-215)||(26704090-26704148)
chr5 (156-215)||(26973823-26973881)
chr5 (181-231)||(20806854-20806904)
chr5 (165-219)||(23469818-23469871)
chr5 (188-218)||(27989004-27989034)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (29-234)||(20698349-20698556)
chr3 (29-234)||(12399209-12399417)
chr3 (29-234)||(13442274-13442482)
chr3 (29-234)||(17487856-17488064)
chr3 (29-234)||(14972854-14973062)
chr3 (29-234)||(17499338-17499546)
chr3 (29-234)||(18438534-18438742)
chr3 (29-234)||(26686887-26687095)
chr3 (29-215)||(14576746-14576934)
chr3 (30-234)||(23083275-23083482)
chr3 (29-231)||(24153122-24153326)
chr3 (29-234)||(43840932-43841140)
chr3 (30-234)||(25476299-25476506)
chr3 (1-230)||(856140-856368)
chr3 (162-234)||(13210376-13210448)
chr3 (29-234)||(11424676-11424880)
chr3 (29-215)||(42386429-42386619)
chr3 (162-230)||(49668125-49668193)
chr3 (117-234)||(15470927-15471043)
chr3 (162-230)||(9512924-9512992)
chr3 (162-230)||(9520899-9520967)
chr3 (162-230)||(12174308-12174376)
chr3 (7-98)||(14179570-14179662)
chr3 (29-231)||(40213634-40213838)
chr3 (136-215)||(14572608-14572688)
chr3 (121-234)||(43550529-43550644)
chr3 (162-215)||(32307696-32307749)
chr3 (117-231)||(36166598-36166712)
chr3 (162-218)||(52523778-52523834)
chr3 (121-231)||(9707658-9707769)
chr3 (118-234)||(14234487-14234605)
chr3 (121-231)||(17672626-17672737)
chr3 (121-231)||(29172634-29172745)
chr3 (169-231)||(28194693-28194755)
chr3 (162-231)||(27165250-27165319)
chr3 (119-231)||(55500942-55501055)
chr3 (166-230)||(16097332-16097396)
chr3 (162-230)||(16103784-16103852)
chr3 (121-231)||(6469185-6469296)
chr3 (121-231)||(7781398-7781509)
chr3 (121-231)||(17463178-17463289)
chr3 (163-218)||(22110402-22110457)
chr3 (138-234)||(24340746-24340844)
chr3 (121-231)||(28848662-28848773)
chr3 (121-231)||(34159326-34159437)
chr3 (163-218)||(43925974-43926029)
chr3 (121-231)||(45606958-45607069)
chr3 (121-231)||(55476491-55476602)
chr3 (161-230)||(37251216-37251283)
chr3 (117-215)||(21618465-21618563)
chr3 (162-231)||(53301600-53301669)
chr3 (121-231)||(8899094-8899205)
chr3 (121-231)||(16454332-16454443)
chr3 (121-215)||(38961942-38962037)
chr3 (134-231)||(12119789-12119887)
chr3 (134-231)||(15412429-15412527)
chr3 (121-218)||(53070704-53070802)
chr3 (165-218)||(606378-606431)
chr3 (161-217)||(12377938-12377994)
chr3 (121-231)||(13151841-13151953)
chr3 (121-231)||(13154306-13154418)
chr3 (121-232)||(13544024-13544136)
chr3 (134-231)||(17737236-17737337)
chr3 (121-231)||(10247774-10247885)
chr3 (121-215)||(12567576-12567671)
chr3 (172-231)||(15977515-15977573)
chr3 (139-229)||(16282880-16282971)
chr3 (121-231)||(17446706-17446816)
chr3 (121-215)||(50242838-50242933)
chr3 (181-231)||(8499518-8499568)
chr3 (181-231)||(10556985-10557035)
chr3 (134-231)||(44494809-44494907)
chr3 (181-231)||(45577950-45578000)
chr3 (162-215)||(23274706-23274759)
chr3 (162-234)||(37642314-37642386)
chr3 (181-229)||(41123892-41123940)
chr3 (163-219)||(13919344-13919399)
chr3 (156-230)||(15878095-15878168)
chr3 (29-98)||(16796685-16796755)
chr3 (115-232)||(46822267-46822386)
chr3 (165-230)||(23077530-23077594)
chr3 (181-233)||(14665398-14665450)
chr3 (181-233)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (29-234)||(4849-5057)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (16-234)||(949-1169)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (29-234)||(13211-13419)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-234)||(167879-168099)
scaffold0011 (29-234)||(51913-52121)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (29-234)||(1952-2160)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (29-234)||(3470-3678)
scaffold0292 (36-234)||(343-543)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (29-234)||(1851-2059)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (34-234)||(6039-6245)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (33-234)||(3068-3271)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (29-215)||(24214-24405)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (33-233)||(3103-3306)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (29-234)||(32942-33149)
scaffold0145 (29-234)||(38761-38968)
scaffold0145 (136-236)||(9744-9845)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-218)||(26840-27056)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (29-232)||(39479-39684)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (29-232)||(75128-75333)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (29-233)||(17128-17337)
scaffold0056 (172-218)||(79388-79433)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (29-227)||(25978-26179)
scaffold0122 (117-231)||(44709-44825)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (21-231)||(22886-23098)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (29-234)||(8446-8650)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (16-234)||(20910-21132)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-230)||(1881-2109)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (29-231)||(339863-340065)
scaffold0003 (121-231)||(158501-158612)
scaffold0003 (116-181)||(71353-71419)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (32-234)||(16516-16721)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-230)||(21692-21920)
scaffold0210 (1-230)||(29584-29812)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (59-234)||(32901-33077)
scaffold0120 (59-234)||(45928-46104)
scaffold0120 (52-234)||(16113-16298)
scaffold0120 (172-234)||(17389-17450)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-136)||(12857-12991)
scaffold0029 (121-214)||(11305-11399)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (114-234)||(28414-28536)
scaffold0046 (162-234)||(11292-11364)
scaffold0046 (162-234)||(1997-2069)
scaffold0046 (178-234)||(4552-4608)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (29-234)||(25896-26103)
scaffold0026 (29-234)||(39858-40065)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (162-234)||(1118-1190)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (162-234)||(119875-119947)
scaffold0023 (117-230)||(100378-100493)
scaffold0023 (117-231)||(44454-44570)
scaffold0023 (163-230)||(40224-40291)
scaffold0023 (121-231)||(94411-94522)
scaffold0023 (162-230)||(101503-101571)
scaffold0023 (121-215)||(17491-17586)
scaffold0023 (1-43)||(38365-38407)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (29-234)||(4508-4715)
scaffold0228 (29-234)||(12090-12297)
scaffold0228 (29-234)||(22042-22249)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (157-234)||(34123-34200)
scaffold0175 (16-184)||(13141-13313)
scaffold0175 (181-234)||(273-326)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (117-218)||(1048-1151)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (119-234)||(11447-11564)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-174)||(6669-6826)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (30-234)||(8479-8682)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (117-215)||(8485-8585)
scaffold0621 (162-234)||(6535-6607)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (29-234)||(39913-40120)
scaffold0080 (117-218)||(19885-19990)
scaffold0080 (1-43)||(18542-18584)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (117-230)||(2808-2923)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (158-231)||(15664-15737)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (117-218)||(12584-12687)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (162-234)||(6611-6683)
scaffold0333 (162-234)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (162-234)||(6172-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (162-230)||(19268-19336)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (162-234)||(15826-15898)
scaffold0020 (181-215)||(178913-178947)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (117-234)||(10543-10659)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (162-234)||(23932-24001)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (118-234)||(12942-13057)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (162-218)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (162-234)||(1083-1155)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (117-218)||(13144-13247)
scaffold0357 (163-218)||(2677-2732)
scaffold0357 (162-215)||(16149-16202)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (162-230)||(2694-2762)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (162-230)||(160688-160756)
scaffold0001 (134-231)||(85644-85742)
scaffold0001 (121-215)||(501100-501195)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (163-230)||(14747-14814)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (117-234)||(22672-22788)
scaffold0037 (121-231)||(82072-82183)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (162-215)||(1101-1154)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (162-215)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (158-215)||(8119-8176)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (117-231)||(38704-38820)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (117-231)||(116430-116544)
scaffold0022 (163-218)||(129021-129075)
scaffold0022 (165-218)||(78338-78391)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (117-215)||(129924-130024)
scaffold0010 (158-218)||(60761-60821)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (162-230)||(45841-45909)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (117-218)||(53551-53654)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (170-230)||(132662-132722)
scaffold0028 (121-231)||(136680-136791)
scaffold0028 (121-231)||(139149-139260)
scaffold0028 (121-231)||(144087-144198)
scaffold0028 (162-215)||(62217-62270)
scaffold0028 (121-231)||(134211-134322)
scaffold0028 (121-231)||(141618-141729)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (118-234)||(12766-12884)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (121-231)||(13392-13503)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (121-231)||(20747-20858)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (121-231)||(37821-37932)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (161-215)||(25125-25179)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (165-218)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (161-218)||(6332-6389)
scaffold0420 (168-218)||(13793-13843)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (117-215)||(10546-10646)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (162-215)||(32555-32608)
scaffold0034 (165-217)||(51936-51987)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (162-230)||(133-201)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (162-234)||(11464-11536)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (121-232)||(10772-10884)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (170-230)||(32102-32162)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (162-234)||(38305-38377)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (121-218)||(20430-20527)
scaffold0031 (115-234)||(128751-128871)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (121-215)||(4710-4805)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (167-234)||(4888-4954)
scaffold0395 (34-174)||(881-1021)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (138-234)||(18050-18148)
scaffold0247 (181-215)||(2241-2275)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (121-231)||(13947-14058)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (121-231)||(16784-16895)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (52-213)||(4545-4709)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (161-211)||(38339-38389)
scaffold0139 (1-99)||(20117-20216)
scaffold0139 (181-230)||(19980-20029)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (115-218)||(8059-8166)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (162-230)||(28818-28887)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (117-215)||(27751-27851)
scaffold0165 (29-70)||(3648-3689)
scaffold0165 (29-70)||(7712-7753)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (161-218)||(2691-2748)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (136-215)||(29948-30028)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (33-155)||(27911-28034)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (121-231)||(40400-40511)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (163-218)||(97021-97076)
scaffold0006 (163-218)||(106299-106354)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (134-231)||(4214-4312)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (172-218)||(11979-12024)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (29-98)||(1052-1122)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (46-159)||(3460-3574)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (116-181)||(15417-15483)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (136-228)||(4300-4393)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (121-233)||(12300-12413)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (161-218)||(267676-267733)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (172-232)||(9241-9300)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (117-231)||(161136-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (172-231)||(106-164)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (1-84)||(23995-24077)
scaffold0198 (156-230)||(23843-23916)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (1-43)||(8843-8885)
scaffold0101 (181-228)||(1393-1440)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (161-215)||(103679-103733)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (121-231)||(12064-12169)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (181-230)||(36454-36503)
scaffold0131 (1-99)||(36592-36691)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-99)||(69930-70029)
scaffold0004 (156-230)||(69794-69867)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (1-43)||(15555-15597)
scaffold0297 (165-230)||(10575-10639)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (163-213)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (189-218)||(1874-1903)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21395868 - 21396101
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395868 taatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 21395967  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21395968 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 21396067  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396068 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21790361 - 21790594
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790361 taatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 21790460  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21790461 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 21790560  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790561 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21389338 - 21389571
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389338 taatgagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 21389437  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21389438 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 21389537  T
Q  201 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389538 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattga 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 16199559 - 16199765
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  16199559 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatga 16199658  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199659 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16199758  T
Q  228 atgatgt 234  Q
    |||||||    
T  16199759 atgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31971463 - 31971257
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31971463 taatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 31971364  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31971363 attggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 31971265  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  31971264 gatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 45130911 - 45131117
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  45130911 taatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 45131010  T
Q  129 a-ttgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131011 atttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 45131109  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  45131110 gatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  31 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatgcataagatgttgatgaa 129  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  130 ttgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20536416 - 20536208
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  20536416 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20536317  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20536316 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 20536218  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  20536217 atgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879352
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||| | ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  228 atgatgt 234  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 28648957 - 28649164
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||   |||||||||| ||    
T  28648957 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttg 28649056  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28649057 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 28649155  T
Q  225 atgatgatg 233  Q
    |||||||||    
T  28649156 atgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22626943 - 22626736
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  22626943 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22626844  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22626843 atttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  22626744 tgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 18818322 - 18818530
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  18818322 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 18818421  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18818422 acttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18818520  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  18818521 atgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092463
Alignment:
Q  46 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  145 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7372978 - 7372778
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || |||    
T  7372978 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttga 7372886  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7372885 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  7372786 tgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  219 ttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21924049
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  21923841 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 21923940  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21923941 acttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21924039  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  21924040 atgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22875273 - 22875065
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 126  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| |    
T  22875273 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgtt 22875174  T
Q  127 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22875173 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaag 22875075  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  22875074 atgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6759464 - 6759255
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 126  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  |||||   | |||||||||     
T  6759464 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac 6759365  T
Q  127 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 223  Q
       ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6759364 ---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6759269  T
Q  224 gatgatgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||    
T  6759268 gatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23406479 - 23406379
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23406479 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 23406381  T
Q  233 gt 234  Q
    ||    
T  23406380 gt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249384
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255222
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23648761 - 23648554
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||   |||||||||| ||    
T  23648761 taatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttg 23648662  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtca---tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
     |||| |  |||||| |||||||||   || |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||    
T  23648661 tattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 23648563  T
Q  225 atgatgatg 233  Q
    ||| |||||    
T  23648562 atgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  138 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046357
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20046344 gattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598188
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203393
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Original strand, 25363053 - 25363123
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363053 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 26225295 - 26225409
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225295 agatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26225392  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  26225393 gttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4483391 - 4483281
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4483295  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  4483294 gattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15070656 - 15070574
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070656 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 17353823 - 17353865
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17353823 taatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 19801447 - 19801530
Alignment:
Q  135 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801447 tttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 45290759 - 45290841
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290759 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16282
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  16287 tgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1289
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  1294 tgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7266
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  7271 tgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309108
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  20309113 tgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 38029 - 38235
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38029 taatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatga 38128  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38129 atcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 38227  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  38228 gatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285865
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||       
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 23103282 - 23103516
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  23103282 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatgtgatataatgtttaattgcatgacttga 23103380  T
Q  99 agaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 197  Q
    |  |||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23103381 attatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagc 23103479  T
Q  198 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103480 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 22731147 - 22731355
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||||||||    
T  22731147 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatg 22731246  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22731247 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaag 22731345  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  22731346 atgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 298727 - 298933
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  298727 taatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 298826  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  298827 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 298926  T
Q  225 atgatga 231  Q
    |||||||    
T  298927 atgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654507
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||       
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 22738093 - 22738300
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22738093 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22738192  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22738193 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaag 22738290  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  22738291 atgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23076650 - 23076442
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||| ||| ||    
T  23076650 taatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttg 23076551  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  23076550 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaag 23076452  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  23076451 atgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060513
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 132  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||   |||||||||| ||| |||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 23060617  T
Q  133 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23060616 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  230 gatgt 234  Q
    |||||    
T  23060517 gatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22337323 - 22337115
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  22337323 taatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22337224  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22337223 tcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22337125  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  22337124 atgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23660230 - 23660023
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||| ||   |||||||||| ||    
T  23660230 taatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttg 23660131  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  23660130 atttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  23660031 tgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40622094 - 40622327
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40622094 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 40622192  T
Q  101 aatgtt-----tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 193  Q
    ||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||| |||     
T  40622193 aatatttgtactgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaacc 40622290  T
Q  194 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  40622291 aagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725995
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Original strand, 23708589 - 23708721
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 182  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||  | |||||| ||||| ||| | |||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  23708589 tatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatct 23708688  T
Q  183 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708689 gttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  218 gttgaagatgatgatg 233  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367790
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 21155126 - 21155219
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155126 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898358
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  24898344 tgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900841
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  24900827 tgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903318
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  24903304 tgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905795
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  24905781 tgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908270
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  24908256 tgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 32039549 - 32039660
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32039549 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagtt 32039646  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  32039647 gattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 23038265 - 23038227
Alignment:
Q  4 tgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 42  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23038265 tgagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 23019592 - 23019633
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 42  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23019592 taatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgtgaagct 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  212 taag 215  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847951
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  27847946 tgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40443597 - 40443393
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40443597 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 40443498  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40443497 attgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatg 40443398  T
Q  228 atgat 232  Q
    |||||    
T  40443397 atgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12699040 - 12698831
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  12699040 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 12698941  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 223  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12698940 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 12698842  T
Q  224 gatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||    
T  12698841 gatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9509397 - 9509189
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  9509397 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 9509298  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9509297 aattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 9509199  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  9509198 atgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 16386160 - 16386369
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||   |||||||||||||    
T  16386160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatg 16386259  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    || |  | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386260 aaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 16386359  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  16386360 atgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10589246 - 10589039
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |     ||||||||| |||    
T  10589246 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttga 10589147  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  10589146 attgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaaga 10589048  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  10589047 tgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26211995
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  212 taagatgttgaag-atgatgatgt 234  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26212018 taagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 18456326 - 18456530
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  18456326 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 18456425  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18456426 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18456524  T
Q  226 tgatga 231  Q
    ||||||    
T  18456525 tgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17137949 - 17138177
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17137949 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 17138047  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |    
T  17138048 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagtt 17138145  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17138146 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12187247 - 12187019
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12187247 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 12187149  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct----gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 196  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |     |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  12187148 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaag 12187053  T
Q  197 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
     ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187052 ttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38227671 - 38227481
Alignment:
Q  46 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 144  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  38227671 taagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatta 38227572  T
Q  145 ttatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227571 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Original strand, 3564294 - 3564482
Alignment:
Q  46 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  3564294 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatatta 3564393  T
Q  145 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3564394 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16213801 - 16213684
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213801 taagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T
Q  212 taagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  16213703 taagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  219 ttgaagatgatga 231  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  218 gttgaagatgatg 230  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18430827 - 18430709
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430827 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  214 agatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || || | |||||||||||||    
T  18430729 agttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  214 agatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    || || | |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 220  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  221 gaagatgatga 231  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702238
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  24702251 gattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216860
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  27216873 gattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13869444 - 13869346
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  13869444 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  138 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  171 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Original strand, 18154885 - 18154943
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154885 tgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898523
Alignment:
Q  117 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  213 aag 215  Q
    |||    
T  38898521 aag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 18154722 - 18154821
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  18154722 taatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttga 18154820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24054702 - 24054618
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24054702 taatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17046692 - 17046487
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17046692 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 17046593  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046592 attgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 17046493  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  17046492 tgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 14053215 - 14053422
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag-atgttgatg 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14053215 taatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatg 14053314  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14053315 aattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagat 14053414  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  14053415 gatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902757
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088877
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22636642 - 22636437
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22636642 taatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22636544  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22636543 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22636445  T
Q  225 atgatgat 232  Q
    ||||||||    
T  22636444 atgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44053037 - 44052829
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  44053037 taatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 44052938  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  44052937 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaag 44052839  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  44052838 atgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Original strand, 23374272 - 23374473
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  23374272 taatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 23374371  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23374372 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaag 23374470  T
Q  225 atg 227  Q
    |||    
T  23374471 atg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 16377436 - 16377639
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  16377436 taatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 16377535  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16377536 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T
Q  227 gatga 231  Q
     ||||    
T  16377635 aatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  53 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 151  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  152 atgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 15121689 - 15121834
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15121689 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 15121787  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 148  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121788 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 16239883 - 16240090
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  16239883 taatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttg 16239982  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  16239983 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 16240081  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  16240082 tgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14038856 - 14038653
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  14038856 taatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 14038757  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  14038756 acttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 14038658  T
Q  225 atgat 229  Q
    |||||    
T  14038657 atgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7893908 - 7893703
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  7893908 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 7893812  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  7893811 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaag 7893713  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  7893712 atgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6900011 - 6899891
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6900011 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtct 6899913  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  6899912 aagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 215
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288312
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  214 ag 215  Q
    ||    
T  12288311 ag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242693
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  218 gttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19242712 gattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  218 gttgaagatgatgatg 233  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 1837560 - 1837671
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1837560 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1837657  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  1837658 gattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239581
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  18239568 gattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 50222390 - 50222501
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222390 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50222487  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  50222488 gattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355471
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15367791 - 15367690
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15367791 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15367694  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  15367693 atgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15370119 - 15370018
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15370119 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15370022  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  15370021 atgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15371303 - 15371202
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15371303 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15371206  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  15371205 atgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15373584 - 15373483
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15373584 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15373487  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  15373486 atgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15402804 - 15402703
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15402804 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15402707  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  15402706 atgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3096851 - 3096772
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 108  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096851 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970853
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  183 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51582
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatga 51588  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  51587 tgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 965 - 1170
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  1165 tgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920751
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831503
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat--aagatgttgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  127 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 22831511  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  22831510 gatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185517
Alignment:
Q  28 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  62 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt 161  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 20360873 - 20361081
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  20360873 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20360972  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||     
T  20360973 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaa 20361071  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  20361072 atgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 20638196 - 20638404
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||     
T  20638196 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgata 20638295  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20638296 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaag 20638394  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  20638395 atgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29060748 - 29060540
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  29060748 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 29060649  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29060648 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaag 29060550  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  29060549 atgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496244
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16496266 taagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 19303454 - 19303661
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  19303454 taatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 19303553  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19303554 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  19303653 tgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20593981 - 20593773
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| ||||||   | |||||||| ||    
T  20593981 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttg 20593882  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||    
T  20593881 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaag 20593783  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  20593782 atgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 25629268 - 25629476
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  25629268 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 25629367  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25629368 acttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25629466  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  25629467 atgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 18409740 - 18409947
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || |||  | |||||||| ||    
T  18409740 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttg 18409839  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18409840 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18409938  T
Q  225 atgatgatg 233  Q
    |||||||||    
T  18409939 atgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 17287713 - 17287917
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||    
T  17287713 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  132 gaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17287911  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  17287912 tgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782227
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  22782240 gattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  214 ag 215  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109157
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20109158  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  20109157 g 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  218 gttgaagatgatgatg 233  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291342
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  2291329 gattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8055140 - 8055029
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055140 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8055043  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  8055042 gattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 26924691 - 26924802
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924691 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26924788  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  26924789 gattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18456830 - 18456732
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456830 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18461990 - 18461892
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461990 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18461893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963371
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  218 gttgaagatgatgatg 233  Q
    | | |||||| |||||    
T  34963386 gattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 1540962 - 1541073
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1540962 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 1541059  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  1541060 gattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448686
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20557041 gattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  187 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 8227560 - 8227632
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  168 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19863213 - 19863171
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19863213 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19873193 - 19873120
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873193 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19873355 - 19873313
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19873355 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22432322 - 22432249
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432322 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22438872 - 22438799
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438872 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22439035 - 22438951
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22439035 taatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 5044 - 5246
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5044 taatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 5143  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 5243  T
Q  229 tga 231  Q
    |||    
T  5244 tga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801508
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  38801503 tgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250850
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026680
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  21026702 taagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 50210126 - 50210333
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  50210126 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 50210225  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50210226 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 50210324  T
Q  225 atgatgatg 233  Q
    |||||||||    
T  50210325 atgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34509988 - 34509783
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||    
T  34509988 taatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 34509889  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34509888 acttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 34509790  T
Q  225 atgatga 231  Q
    |||||||    
T  34509789 atgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || ||   |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  132 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 22354485 - 22354616
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22354485 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22354584  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 159  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22354585 aattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 48603744 - 48603652
Alignment:
Q  7 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603744 gacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 35261051 - 35261183
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 182  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||||||||||   ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  35261051 tatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgttt 35261147  T
Q  183 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261148 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20135395 - 20135188
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| || | |||||||||| ||    
T  20135395 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttg 20135296  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtc---atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||   ||| |||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||    
T  20135295 aattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 20135197  T
Q  225 atgatgatg 233  Q
    ||| |||||    
T  20135196 atgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 233
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  218 gttgaagatgatgat 232  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475249
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  21475236 gattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 22468696 - 22468816
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22468696 taagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 22468794  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||| || | |||||| |||||    
T  22468795 taagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123214
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776688
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21714783 - 21714684
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21714783 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 21714685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  183 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21714619 - 21714546
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714619 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 22356087 - 22356168
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 108  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22356087 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 22357773 - 22357854
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 108  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22357773 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  189 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 10339 - 10544
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  10339 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttga 10438  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10439 attgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 10538  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  10539 tgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32272 - 32067
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  32272 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 32173  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32172 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 32074  T
Q  228 atgatgt 234  Q
    |||||||    
T  32073 atgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13497
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13703 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 13604  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    || ||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13603 atcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagtt 13505  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  13504 gatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 15378 - 15584
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15378 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatga 15477  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15478 attgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagat 15576  T
Q  227 gatgatgt 234  Q
    ||||||||    
T  15577 gatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7523 - 7295
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| || || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7523 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaactga-tatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 7425  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |    
T  7424 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagtt 7327  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7326 gcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4712
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt 159  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 175000 - 174767
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  175000 taatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttga 174902  T
Q  99 agaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    |  |||  || |||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174901 attatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 174802  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174801 gcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 124793 - 124679
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| | |||||||    
T  124793 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatg 124694  T
Q  128 aattgaatttgatat 142  Q
    ||||| | |||||||    
T  124693 aattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 21292883 - 21293090
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  21292883 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 21292982  T
Q  129 a-ttgaat-ttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21292983 atttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 21293081  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  21293082 tgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37724134 - 37723910
Alignment:
Q  4 tgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||      
T  37724134 tgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt 37724036  T
Q  102 atgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 201  Q
    |||  || |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37724035 atgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgca 37723936  T
Q  202 tgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  37723935 tgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286964
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 132  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  8286760 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattg 8286859  T
Q  133 aatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 8286958  T
Q  229 tgatgt 234  Q
    ||||||    
T  8286959 tgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 23390409 - 23390617
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  23390409 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 23390508  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23390509 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 23390607  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  23390608 atgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075018
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  212 taagatgttgaag-atgatgatgt 234  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  22075041 taagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24493776 - 24493569
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  24493776 taatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24493677  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24493676 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  24493577 tgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729185
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21729163 taagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 21808389 - 21808510
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808389 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21808488 taagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529223
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  225 atgatga 231  Q
    |||||||    
T  24529229 atgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9078160 - 9077952
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   | |||||||| ||    
T  9078160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttg 9078061  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  9078060 acttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaag 9077962  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  9077961 atgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25421740 - 25421532
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  25421740 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttg 25421641  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25421640 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25421542  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  25421541 atgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22032549 - 22032323
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22032549 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 22032451  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |    
T  22032450 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagtt 22032355  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032354 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18769890 - 18770118
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18769890 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 18769988  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| |    
T  18769989 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagtt 18770086  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18770087 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13025518 - 13025311
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  13025518 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13025419  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13025418 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13025320  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  13025319 tgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13095702 - 13095495
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  13095702 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13095603  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13095602 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13095504  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  13095503 tgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25431602 - 25431414
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |    |||||||||| ||    
T  25431602 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttg 25431503  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431502 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  231 atgt 234  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1096668 - 1096467
Alignment:
Q  36 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaa 134  Q
    ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| |    
T  1096668 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgca 1096569  T
Q  135 tttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |   ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  1096568 tttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttga 1096470  T
Q  232 tgt 234  Q
    |||    
T  1096469 tgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23572312 - 23572178
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23572312 taatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 23572214  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatt 136  Q
    | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572213 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  214 agatg 218  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502277
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 21502255  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| || | |||||||||||||    
T  21502256 aagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  217 tgttgaagatgatg 230  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909012
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20909025 gattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245136
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329934
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  29329947 gattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245527
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  42245514 gattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 11581263 - 11581361
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11581263 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 36154834 - 36154942
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154834 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 36154928  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  36154929 gattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319193
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29346091 - 29345980
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29346091 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29345994  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  29345993 gattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 10775740 - 10775838
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  10775740 atttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18356433 - 18356367
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18356433 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  213 aag 215  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31061166 - 31061068
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  31061166 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 99  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21873482 - 21873277
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  21873482 taatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aa 21873385  T
Q  100 ga-atgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 195  Q
    || ||  ||| |||  |||||||||||   | |||  ||||||| || | |||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21873384 gatattattgaatggttaagatgttga---aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaa 21873289  T
Q  196 gctgcatgagtc 207  Q
    | ||||||||||    
T  21873288 gttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29348564 - 29348453
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29348564 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29348467  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  29348466 gattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29351037 - 29350926
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29351037 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29350940  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  29350939 gattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32027504 - 32027393
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  32027504 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 32027407  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  32027406 gattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 23501231 - 23501273
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23501231 taatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40725925 - 40725853
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26704148 - 26704090
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704148 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26973881 - 26973823
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973881 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  188 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 20698349 - 20698556
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  20698349 taatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatga 20698448  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    |||| | ||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20698449 attgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  20698548 tgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12399417 - 12399209
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  12399417 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 12399318  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399317 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 12399219  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  12399218 atgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13442482 - 13442274
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  13442482 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13442383  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13442382 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13442284  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  13442283 atgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17488064 - 17487856
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  17488064 taatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17487965  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17487964 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17487866  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  17487865 atgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14973062 - 14972854
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||  || |||||||| ||    
T  14973062 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttg 14972963  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14972962 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 14972864  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  14972863 atgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17499546 - 17499338
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  17499546 taatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17499447  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17499446 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17499348  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  17499347 atgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438534
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||  | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  18438543 atgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26687095 - 26686887
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   ||||||| || ||    
T  26687095 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttg 26686996  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaag 26686897  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  26686896 atgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 14576746 - 14576934
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  14576746 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 14576845  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576846 acttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 23083275 - 23083482
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| ||   |||||||||| |||    
T  23083275 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttga 23083374  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23083375 cttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  23083474 tgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 24153122 - 24153326
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  24153122 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24153221  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24153222 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24153320  T
Q  226 tgatga 231  Q
    ||||||    
T  24153321 tgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43841140 - 43840932
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  43841140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 43841041  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  43841040 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaag 43840942  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    || |||||||    
T  43840941 ataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 25476299 - 25476506
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| |||    
T  25476299 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttga 25476398  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  25476399 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  25476498 tgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 856368 - 856140
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  856368 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaag 856270  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  856269 attaattgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagtt 856172  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856171 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 11424676 - 11424880
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || ||   | ||||||||||     
T  11424676 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat- 11424774  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
      |||   |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11424775 --ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  11424872 tgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386429
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 126  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || ||   | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  127 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14179662 - 14179570
Alignment:
Q  7 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14179662 gacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 40213634 - 40213838
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  40213634 taatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttg 40213733  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  40213734 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaag 40213831  T
Q  225 atgatga 231  Q
    |||||||    
T  40213832 atgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572608
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  218 gttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  216 atgttgaagatgatga 231  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  138 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899094
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  8899107 gattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454443
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  16454430 gattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962037
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119887
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15412527 - 15412429
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  15412527 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070802
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151953
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  13151939 tgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154418
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  13154404 tgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544024
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  218 gttgaagatgatgat 232  Q
    | | |||||| ||||    
T  13544038 gattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgttgt------atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T
Q  228 atga 231  Q
    ||||    
T  17737239 atga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 10247774 - 10247885
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10247774 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 10247871  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  10247872 gattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567576
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  139 atataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446816
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  17446803 gattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242838
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44494907 - 44494809
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  44494907 atttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 219  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 15878095 - 15878168
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878095 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16796755 - 16796685
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 98  Q
    |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796755 taatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 230
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4849
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| || | |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  4858 atgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 949 - 1169
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 115  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13211
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  13419 taatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13320  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  13319 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 13221  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  13220 atgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168099
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 115  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52121 - 51913
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  52121 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 52022  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52021 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 51923  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  51922 atgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3678 - 3470
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  3678 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 3579  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  3578 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 3480  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  3479 atgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 343
Alignment:
Q  36 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaa 134  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||||||| ||| ||  |    
T  543 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttcca 444  T
Q  135 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  443 attgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgat 345  T
Q  233 gt 234  Q
    ||    
T  344 gt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1851
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  2059 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 1960  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1959 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 1861  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||||||||    
T  1860 atgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6245
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 132  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  133 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
     | ||||||| || |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  228 atgatgt 234  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 3068 - 3271
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||    
T  3068 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 3167  T
Q  132 gaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 229  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3168 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3266  T
Q  230 gatgt 234  Q
    |||||    
T  3267 gatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 24214 - 24405
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  24214 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat 24313  T
Q  127 gaattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24314 gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  132 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  229 tgatg 233  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38968 - 38761
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  38968 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttt 38869  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  38868 atttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  38769 tgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  233 gtcc 236  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27056 - 26840
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27056 taatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 26958  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |    
T  26957 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagat 26860  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  26859 gcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39684 - 39479
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  39684 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 39585  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39584 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T
Q  226 tgatgat 232  Q
     ||||||    
T  39485 cgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 75128 - 75333
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  75128 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 75227  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  75228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T
Q  226 tgatgat 232  Q
     ||||||    
T  75327 cgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 17128 - 17337
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  17128 taatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 17227  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 222  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17326  T
Q  223 agatgatgatg 233  Q
    |||||||||||    
T  17327 agatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26179
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | ||| |||| ||    
T  25978 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttg 26077  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26078 aattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 26176  T
Q  225 atg 227  Q
    |||    
T  26177 atg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  214 agatgttgaagatgatga 231  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23098 - 22886
Alignment:
Q  21 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  23098 gttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22999  T
Q  120 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 216  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22998 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22901  T
Q  217 tgttgaagatgatga 231  Q
    || | ||||||||||    
T  22900 tgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8650
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  8446 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 8545  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8546 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  8642 tgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20910
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||  |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  212 taagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 1881
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2109 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 2011  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |    
T  2010 aataattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagtt 1913  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1912 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 339863 - 340065
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  339863 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 339962  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  339963 acttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaaga 340059  T
Q  226 tgatga 231  Q
    ||||||    
T  340060 tgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16721
Alignment:
Q  32 tctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaat 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||| | | ||||| || ||| |    
T  16516 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgact 16615  T
Q  131 tgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 227  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16616 tccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T
Q  228 atgatgt 234  Q
    |||||||    
T  16715 atgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21692 - 21920
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21692 taatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaag 21790  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |    
T  21791 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagtt 21888  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  21889 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29584 - 29812
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29584 taatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaag 29682  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 198  Q
    | |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |    
T  29683 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagtt 29780  T
Q  199 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  29781 gcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  59 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 157  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  158 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  59 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 157  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  158 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16113
Alignment:
Q  52 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 150  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||| | | ||||| || ||  ||| ||||||||| || || |    
T  16298 atgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatat 16199  T
Q  151 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16198 cttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12991 - 12857
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12991 taatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaag 12893  T
Q  101 aatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatt 136  Q
    | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12892 attaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28414
Alignment:
Q  114 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 210  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28536 ataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28438  T
Q  211 ctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  28437 ctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  178 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26103 - 25896
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| |     
T  26103 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 26004  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  26003 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25905  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    | |||||||    
T  25904 taatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39858
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| |     
T  40065 taatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 39966  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  39965 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  39866 tgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  215 gatgttgaagatgatg 230  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  213 aagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17586
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 38365 - 38407
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38365 taatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctg 38407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4508
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  4715 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 4616  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  4615 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 4518  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||    
T  4517 atgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12297 - 12090
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  12297 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 12198  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  12197 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 12100  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||    
T  12099 atgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22249 - 22042
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  22249 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22150  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  22149 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 22052  T
Q  225 atgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||    
T  22051 atgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  157 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  16 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 114  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||       
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgt 184  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  119 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6826 - 6669
Alignment:
Q  21 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 119  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||    
T  6826 gttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaaga 6727  T
Q  120 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 174  Q
    ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  6726 tgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8682 - 8479
Alignment:
Q  30 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 128  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| |||  |||||||||| |||    
T  8682 aatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttga 8587  T
Q  129 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8586 cttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  8487 tgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40120 - 39913
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 127  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   ||   |||||||||  ||    
T  40120 taatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattg 40021  T
Q  128 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 225  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  40020 acatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T
Q  226 tgatgatgt 234  Q
    |||||||||    
T  39921 tgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19990
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgtata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  213 aagatg 218  Q
    ||||||    
T  19985 aagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 18542 - 18584
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18542 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  215 gatgttgaagatgatg 230  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 85644 - 85742
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  85644 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501100
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  215 gatgttgaagatgatgatgt 234  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  215 gatgttgaagatgatga 231  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  158 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134211
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  134224 gattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141618
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  141631 gattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  118 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  216 atgttgaagatgatgatgt 234  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  168 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  218 gttgaagatgatgat 232  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  170 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 128871 - 128751
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  || | |  |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  128871 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtct 128773  T
Q  213 aagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||  || | |||||||||||||    
T  128772 aatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  167 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  34 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 132  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||   | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  133 aatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgt 174  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  138 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 234  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 215
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13947
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  13960 gattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16784
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  52 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 150  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||   |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  151 catgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    | ||||| |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20216 - 20117
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  20216 taatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 20118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  115 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 210  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  211 ctaagatg 218  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 27751 - 27851
Alignment:
Q  117 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 214  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27751 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 27850  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  27851 g 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3648
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 70  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3689 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7753 - 7712
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 70  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7753 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28034 - 27911
Alignment:
Q  33 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 131  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||    
T  28034 ctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 27935  T
Q  132 gaatttgatataattatgtcatgc 155  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  27934 gcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40511 - 40400
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40511 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 40414  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  40413 gattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4214
Alignment:
Q  134 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1052
Alignment:
Q  29 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 98  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1122 taatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 3460 - 3574
Alignment:
Q  46 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  3460 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta 3559  T
Q  145 ttatgtcatgctgtt 159  Q
    |||||||||||||||    
T  3560 ttatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  116 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4300
Alignment:
Q  136 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4393 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 12300 - 12413
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12300 gttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 12397  T
Q  218 gttgaagatgatgatg 233  Q
    | | |||||| |||||    
T  12398 gattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 161136 - 161252
Alignment:
Q  117 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 212  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161136 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtct 161233  T
Q  213 aagatgttgaagatgatga 231  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  161234 aagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  172 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24077 - 23995
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24077 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23916 - 23843
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23916 tgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 8843 - 8885
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8843 taatgagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 215  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12169 - 12064
Alignment:
Q  121 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12169 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12078  T
Q  218 gttgaagatgatga 231  Q
    | | ||||||||||    
T  12077 gattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  181 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36691 - 36592
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  36691 taatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 36593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 70029 - 69930
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  70029 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttga 69931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 69867 - 69794
Alignment:
Q  156 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69867 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 15555 - 15597
Alignment:
Q  1 taatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15555 taatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 15597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 230
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 230  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 218
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  189 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1130 times since January 2019
Visitors: 2244