View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_31 (Length: 280)

Name: NF0157_low_31
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_31
NF0157_low_31
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (10-260)||(3470-3721)
scaffold0292 (4-260)||(343-599)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (18-260)||(22731112-22731355)
chr2 (10-260)||(22738050-22738300)
chr2 (4-260)||(23076442-23076699)
chr2 (4-260)||(23285865-23286118)
chr2 (10-260)||(23060513-23060763)
chr2 (4-260)||(23654250-23654507)
chr2 (4-260)||(22337115-22337372)
chr2 (4-260)||(23660023-23660279)
chr2 (4-260)||(37980-38235)
chr2 (19-257)||(298693-298933)
chr2 (44-260)||(20309108-20309321)
chr2 (94-257)||(22105412-22105575)
chr2 (94-254)||(21155060-21155219)
chr2 (94-257)||(18808943-18809105)
chr2 (94-257)||(23130862-23131024)
chr2 (94-257)||(23133329-23133491)
chr2 (94-257)||(23709532-23709694)
chr2 (94-257)||(23712013-23712175)
chr2 (94-257)||(26505379-26505541)
chr2 (94-257)||(26507857-26508019)
chr2 (94-257)||(34402522-34402684)
chr2 (94-257)||(39682313-39682475)
chr2 (94-259)||(32214921-32215085)
chr2 (94-257)||(571397-571559)
chr2 (94-257)||(6725995-6726157)
chr2 (94-257)||(23135590-23135752)
chr2 (94-257)||(24367774-24367936)
chr2 (94-257)||(24898195-24898358)
chr2 (94-257)||(24900678-24900841)
chr2 (94-257)||(24903155-24903318)
chr2 (94-257)||(24905632-24905795)
chr2 (94-257)||(24908107-24908270)
chr2 (94-257)||(32039498-32039660)
chr2 (45-260)||(23708524-23708738)
chr2 (94-257)||(28577099-28577261)
chr2 (94-255)||(43137301-43137461)
chr2 (94-257)||(45029854-45030016)
chr2 (141-260)||(23103399-23103516)
chr2 (106-253)||(25616192-25616339)
chr2 (94-257)||(38967374-38967537)
chr2 (78-260)||(19671830-19672010)
chr2 (183-260)||(8946657-8946734)
chr2 (94-257)||(24529528-24529691)
chr2 (197-260)||(23040247-23040310)
chr2 (76-233)||(22799063-22799220)
chr2 (16-105)||(27753730-27753820)
chr2 (134-255)||(28405981-28406103)
chr2 (76-222)||(23019643-23019789)
chr2 (93-241)||(7687-7835)
chr2 (191-259)||(22134258-22134326)
chr2 (178-254)||(24643034-24643109)
chr2 (191-256)||(7679589-7679655)
chr2 (191-260)||(23072000-23072070)
chr2 (134-256)||(25175854-25175976)
chr2 (4-241)||(32451793-32452031)
chr2 (171-239)||(23038048-23038116)
chr2 (191-239)||(23287384-23287432)
chr2 (191-239)||(26392403-26392451)
chr2 (82-256)||(40622151-40622327)
chr2 (195-242)||(18786958-18787006)
chr2 (45-241)||(20520098-20520295)
chr2 (191-241)||(23207296-23207347)
chr2 (77-152)||(22459500-22459575)
chr2 (94-168)||(24642856-24642930)
chr2 (192-241)||(9241945-9241994)
chr2 (171-256)||(22740996-22741081)
chr2 (197-233)||(24655396-24655432)
chr2 (197-233)||(24869903-24869939)
chr2 (197-233)||(25961592-25961628)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (10-260)||(12698831-12699083)
chr7 (4-260)||(9509189-9509446)
chr7 (5-260)||(38227481-38227736)
chr7 (45-257)||(18456319-18456530)
chr7 (19-260)||(26211995-26212238)
chr7 (16-257)||(3564240-3564482)
chr7 (19-260)||(10589039-10589280)
chr7 (5-260)||(16386112-16386369)
chr7 (4-258)||(40443393-40443646)
chr7 (94-260)||(13647325-13647491)
chr7 (78-257)||(16213684-16213861)
chr7 (94-257)||(456321-456483)
chr7 (94-257)||(11972496-11972658)
chr7 (94-257)||(14949122-14949284)
chr7 (94-257)||(15376713-15376875)
chr7 (94-257)||(16232520-16232682)
chr7 (94-257)||(18640272-18640434)
chr7 (94-257)||(20385123-20385285)
chr7 (94-257)||(21189595-21189757)
chr7 (94-257)||(32125491-32125653)
chr7 (94-257)||(41522917-41523079)
chr7 (94-257)||(41525379-41525541)
chr7 (94-256)||(11393287-11393448)
chr7 (94-260)||(18430709-18430874)
chr7 (45-260)||(27847739-27847951)
chr7 (94-257)||(24702238-24702400)
chr7 (94-257)||(27216860-27217022)
chr7 (111-253)||(24275175-24275316)
chr7 (96-257)||(16410059-16410219)
chr7 (141-257)||(48273392-48273508)
chr7 (94-257)||(44116509-44116671)
chr7 (54-260)||(2280033-2280238)
chr7 (94-257)||(3386333-3386495)
chr7 (91-256)||(14932685-14932851)
chr7 (91-256)||(15356120-15356286)
chr7 (91-256)||(15360234-15360400)
chr7 (94-257)||(24704688-24704847)
chr7 (5-242)||(15143902-15144140)
chr7 (45-257)||(17061866-17062077)
chr7 (94-253)||(38898376-38898535)
chr7 (154-257)||(13869346-13869448)
chr7 (77-257)||(20110556-20110724)
chr7 (171-254)||(18154873-18154956)
chr7 (130-257)||(13831373-13831499)
chr7 (191-260)||(67745-67815)
chr7 (191-260)||(28505349-28505419)
chr7 (191-260)||(34200786-34200856)
chr7 (94-241)||(12756671-12756817)
chr7 (45-260)||(19486649-19486865)
chr7 (141-260)||(22072913-22073033)
chr7 (191-256)||(811182-811248)
chr7 (137-260)||(16219715-16219835)
chr7 (191-260)||(16495402-16495472)
chr7 (191-256)||(18005650-18005716)
chr7 (191-256)||(44014182-44014248)
chr7 (191-260)||(47831807-47831877)
chr7 (94-194)||(26355983-26356083)
chr7 (94-194)||(26358435-26358535)
chr7 (191-260)||(11996078-11996148)
chr7 (207-260)||(15754955-15755008)
chr7 (45-238)||(12255697-12255892)
chr7 (82-256)||(17138006-17138177)
chr7 (84-233)||(15211484-15211633)
chr7 (45-242)||(1867901-1868098)
chr7 (131-211)||(2530130-2530208)
chr7 (45-100)||(48273538-48273594)
chr7 (83-256)||(12187019-12187189)
chr7 (171-256)||(19649521-19649606)
chr7 (183-242)||(12901341-12901401)
chr7 (191-242)||(14044764-14044816)
chr7 (191-242)||(14354794-14354846)
chr7 (196-242)||(16056346-16056393)
chr7 (77-167)||(15113036-15113125)
chr7 (77-167)||(15116573-15116662)
chr7 (191-241)||(18203831-18203881)
chr7 (199-257)||(26356098-26356156)
chr7 (199-257)||(26358550-26358608)
chr7 (197-233)||(9446216-9446252)
chr7 (197-233)||(20569654-20569690)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (10-260)||(20536208-20536459)
chr8 (4-260)||(18818273-18818530)
chr8 (4-260)||(21923792-21924049)
chr8 (4-260)||(18879101-18879352)
chr8 (4-260)||(22626736-22626992)
chr8 (4-260)||(7372778-7373027)
chr8 (4-260)||(23406379-23406638)
chr8 (44-260)||(21918905-21919121)
chr8 (4-259)||(28648908-28649164)
chr8 (4-259)||(23648554-23648810)
chr8 (5-263)||(6759255-6759512)
chr8 (4-260)||(31971257-31971512)
chr8 (5-260)||(16092206-16092463)
chr8 (5-260)||(22875065-22875321)
chr8 (19-260)||(45130877-45131117)
chr8 (44-260)||(16199551-16199765)
chr8 (94-257)||(14409444-14409606)
chr8 (94-257)||(1484402-1484564)
chr8 (94-257)||(5853292-5853454)
chr8 (94-253)||(16413316-16413474)
chr8 (94-257)||(20403227-20403389)
chr8 (44-260)||(21389358-21389571)
chr8 (44-260)||(21395888-21396101)
chr8 (44-260)||(21790381-21790594)
chr8 (94-257)||(22001753-22001915)
chr8 (59-260)||(21778699-21778897)
chr8 (94-257)||(41598188-41598350)
chr8 (94-257)||(4483281-4483442)
chr8 (94-257)||(4542373-4542535)
chr8 (94-257)||(15203231-15203393)
chr8 (94-257)||(20046195-20046357)
chr8 (106-258)||(18678069-18678221)
chr8 (94-257)||(19896265-19896430)
chr8 (106-258)||(32121734-32121886)
chr8 (4-122)||(25363004-25363123)
chr8 (78-253)||(13508024-13508199)
chr8 (94-253)||(45290694-45290853)
chr8 (94-257)||(14823774-14823935)
chr8 (94-257)||(25484275-25484430)
chr8 (94-259)||(26223917-26224081)
chr8 (78-253)||(13597556-13597731)
chr8 (129-242)||(15070573-15070686)
chr8 (94-263)||(19937005-19937174)
chr8 (76-233)||(23776772-23776929)
chr8 (45-241)||(19801333-19801527)
chr8 (45-257)||(26219717-26219918)
chr8 (137-260)||(6520368-6520491)
chr8 (78-241)||(20498581-20498744)
chr8 (134-260)||(38855246-38855372)
chr8 (191-260)||(17140916-17140986)
chr8 (191-260)||(21490995-21491065)
chr8 (88-260)||(17612059-17612231)
chr8 (134-257)||(26225288-26225409)
chr8 (191-260)||(5866325-5866395)
chr8 (191-260)||(23760895-23760962)
chr8 (191-242)||(983457-983509)
chr8 (141-256)||(21285601-21285716)
chr8 (210-260)||(21249384-21249434)
chr8 (210-260)||(21255222-21255272)
chr8 (191-256)||(26355749-26355815)
chr8 (78-241)||(37116366-37116530)
chr8 (191-241)||(24353039-24353090)
chr8 (171-256)||(17353975-17354060)
chr8 (192-241)||(20502154-20502203)
chr8 (193-248)||(21673716-21673772)
chr8 (191-239)||(22525579-22525627)
chr8 (45-96)||(26222987-26223039)
chr8 (191-241)||(17267045-17267096)
chr8 (191-241)||(19154938-19154989)
chr8 (83-233)||(20465982-20466132)
chr8 (197-233)||(20533467-20533503)
chr8 (193-241)||(28397569-28397617)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-260)||(1851-2108)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (4-260)||(23390360-23390617)
chr5 (4-260)||(8286706-8286964)
chr5 (4-260)||(25421532-25421789)
chr5 (4-260)||(24493569-24493825)
chr5 (4-260)||(25431395-25431651)
chr5 (4-260)||(13025311-13025567)
chr5 (4-260)||(13095495-13095751)
chr5 (10-260)||(9077952-9078203)
chr5 (19-260)||(22075018-22075261)
chr5 (16-260)||(1096467-1096712)
chr5 (4-257)||(24529223-24529477)
chr5 (93-260)||(21808343-21808510)
chr5 (93-260)||(21729018-21729185)
chr5 (19-260)||(21292849-21293090)
chr5 (94-257)||(264768-264930)
chr5 (94-257)||(39363384-39363546)
chr5 (95-257)||(10732941-10733102)
chr5 (154-260)||(21997549-21997655)
chr5 (94-257)||(20909012-20909174)
chr5 (94-257)||(29329934-29330096)
chr5 (94-257)||(42245365-42245527)
chr5 (45-242)||(18418598-18418793)
chr5 (45-257)||(22412187-22412388)
chr5 (94-257)||(29345980-29346142)
chr5 (94-257)||(36154783-36154942)
chr5 (94-257)||(29348453-29348615)
chr5 (94-257)||(29350926-29351088)
chr5 (94-257)||(39245136-39245298)
chr5 (94-254)||(18319033-18319193)
chr5 (94-242)||(20902008-20902156)
chr5 (94-257)||(2154613-2154776)
chr5 (94-257)||(11581199-11581361)
chr5 (94-257)||(32027393-32027555)
chr5 (94-257)||(10775675-10775838)
chr5 (106-258)||(17517168-17517320)
chr5 (69-241)||(22144068-22144240)
chr5 (4-123)||(22107237-22107357)
chr5 (94-257)||(31061068-31061231)
chr5 (129-257)||(38619434-38619562)
chr5 (85-211)||(18356364-18356488)
chr5 (4-122)||(21986011-21986130)
chr5 (163-257)||(20918017-20918110)
chr5 (171-256)||(26704075-26704160)
chr5 (171-256)||(26973808-26973893)
chr5 (129-256)||(23064512-23064639)
chr5 (82-241)||(37723922-37724080)
chr5 (191-260)||(19660886-19660956)
chr5 (191-260)||(21329548-21329618)
chr5 (94-254)||(24067110-24067270)
chr5 (85-211)||(20910745-20910869)
chr5 (142-241)||(20026942-20027043)
chr5 (191-256)||(22959583-22959649)
chr5 (137-260)||(21502154-21502277)
chr5 (76-233)||(21873277-21873431)
chr5 (134-256)||(21565546-21565668)
chr5 (195-260)||(36314577-36314643)
chr5 (45-260)||(40725853-40726069)
chr5 (191-239)||(26732884-26732932)
chr5 (82-256)||(22032323-22032492)
chr5 (191-260)||(26012086-26012154)
chr5 (191-260)||(19668898-19668968)
chr5 (203-257)||(20806850-20806904)
chr5 (191-241)||(26740697-26740747)
chr5 (82-256)||(18769947-18770118)
chr5 (192-241)||(23469822-23469871)
chr5 (45-96)||(20766035-20766087)
chr5 (83-233)||(23572107-23572254)
chr5 (134-185)||(20766115-20766166)
chr5 (171-234)||(23201382-23201445)
chr5 (192-233)||(20805575-20805616)
chr5 (192-241)||(21328268-21328317)
chr5 (192-237)||(21731514-21731559)
chr5 (192-237)||(21809634-21809679)
chr5 (193-233)||(20766997-20767037)
chr5 (197-233)||(26680605-26680641)
chr5 (197-233)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-260)||(13211-13462)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (26-260)||(13442274-13442509)
chr3 (4-260)||(17487856-17488113)
chr3 (4-260)||(17499338-17499595)
chr3 (4-260)||(26686887-26687144)
chr3 (4-260)||(20698300-20698556)
chr3 (5-260)||(14972854-14973110)
chr3 (5-260)||(23083226-23083482)
chr3 (13-260)||(43840932-43841180)
chr3 (4-256)||(14576697-14576949)
chr3 (19-260)||(12399209-12399451)
chr3 (10-260)||(18438534-18438785)
chr3 (4-260)||(25476249-25476506)
chr3 (45-257)||(24153115-24153326)
chr3 (4-247)||(14572602-14572845)
chr3 (4-260)||(11424627-11424880)
chr3 (41-243)||(42386427-42386630)
chr3 (16-257)||(40213597-40213838)
chr3 (4-242)||(30029858-30030096)
chr3 (94-257)||(29172583-29172745)
chr3 (94-257)||(7781347-7781509)
chr3 (94-257)||(9707607-9707769)
chr3 (94-257)||(17463178-17463340)
chr3 (94-257)||(17672626-17672788)
chr3 (94-257)||(34159326-34159488)
chr3 (94-257)||(45606907-45607069)
chr3 (94-257)||(55476491-55476653)
chr3 (94-257)||(8899094-8899256)
chr3 (94-257)||(16454281-16454443)
chr3 (94-257)||(28848611-28848773)
chr3 (94-257)||(38961891-38962053)
chr3 (94-257)||(13151790-13151953)
chr3 (94-257)||(13154255-13154418)
chr3 (94-258)||(13544024-13544187)
chr3 (94-257)||(6469134-6469296)
chr3 (94-257)||(10247723-10247885)
chr3 (94-253)||(12567564-12567722)
chr3 (94-257)||(17446655-17446816)
chr3 (94-257)||(50242822-50242984)
chr3 (94-255)||(16282811-16282971)
chr3 (94-241)||(53070653-53070799)
chr3 (94-260)||(43550478-43550644)
chr3 (94-255)||(41123892-41124049)
chr3 (143-257)||(55500942-55501055)
chr3 (45-260)||(24340628-24340844)
chr3 (106-258)||(46822267-46822419)
chr3 (126-257)||(15977515-15977645)
chr3 (134-257)||(36166598-36166719)
chr3 (129-257)||(12119759-12119887)
chr3 (129-257)||(15412429-15412557)
chr3 (82-258)||(12511059-12511236)
chr3 (44-122)||(14179570-14179648)
chr3 (78-257)||(8499518-8499697)
chr3 (78-257)||(27165250-27165429)
chr3 (78-241)||(52523666-52523831)
chr3 (45-242)||(21618464-21618650)
chr3 (160-257)||(44494809-44494905)
chr3 (154-257)||(10556985-10557087)
chr3 (5-122)||(16796685-16796803)
chr3 (45-260)||(37642170-37642386)
chr3 (160-257)||(17737236-17737335)
chr3 (78-260)||(23274687-23274869)
chr3 (191-256)||(12174310-12174376)
chr3 (191-260)||(13210378-13210448)
chr3 (141-260)||(15470927-15471043)
chr3 (137-260)||(14234487-14234610)
chr3 (191-253)||(32307684-32307747)
chr3 (116-257)||(53301527-53301669)
chr3 (191-256)||(16103784-16103850)
chr3 (196-257)||(28194693-28194755)
chr3 (191-256)||(49668127-49668193)
chr3 (204-257)||(45577947-45578000)
chr3 (193-256)||(16097332-16097396)
chr3 (191-256)||(9512924-9512990)
chr3 (191-256)||(9520899-9520965)
chr3 (78-167)||(2051138-2051227)
chr3 (171-256)||(15878083-15878168)
chr3 (180-256)||(856140-856216)
chr3 (195-239)||(13919350-13919394)
chr3 (81-260)||(22147467-22147646)
chr3 (45-96)||(36166747-36166799)
chr3 (191-241)||(22110403-22110454)
chr3 (191-241)||(43925977-43926028)
chr3 (191-253)||(1644725-1644787)
chr3 (171-233)||(23077509-23077571)
chr3 (141-241)||(37251168-37251270)
chr3 (192-241)||(606378-606428)
chr3 (193-239)||(9577646-9577691)
chr3 (197-259)||(14665398-14665460)
chr3 (171-233)||(14878548-14878610)
chr3 (171-233)||(15051531-15051593)
chr3 (171-233)||(15060307-15060369)
chr3 (192-233)||(11298580-11298621)
chr3 (192-241)||(15246037-15246086)
chr3 (197-233)||(3389994-3390030)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (10-258)||(22636437-22636685)
chr4 (4-260)||(44052829-44053086)
chr4 (4-260)||(12902757-12903014)
chr4 (4-260)||(7088877-7089134)
chr4 (4-260)||(16239834-16240090)
chr4 (4-260)||(7893703-7893957)
chr4 (43-260)||(16270140-16270356)
chr4 (76-260)||(7798774-7798958)
chr4 (5-255)||(14038653-14038904)
chr4 (4-257)||(16377387-16377639)
chr4 (19-253)||(23374238-23374473)
chr4 (88-260)||(6899891-6900062)
chr4 (135-260)||(52873363-52873488)
chr4 (44-260)||(14053207-14053422)
chr4 (45-257)||(44928829-44929042)
chr4 (94-257)||(18215274-18215436)
chr4 (94-257)||(12307-12469)
chr4 (78-257)||(1837494-1837671)
chr4 (94-257)||(15118352-15118514)
chr4 (44-260)||(17046487-17046700)
chr4 (94-257)||(23803265-23803427)
chr4 (94-257)||(52312510-52312672)
chr4 (94-263)||(19242693-19242861)
chr4 (94-257)||(3515007-3515169)
chr4 (94-257)||(44615288-44615450)
chr4 (94-257)||(44773087-44773249)
chr4 (94-257)||(50222339-50222501)
chr4 (94-257)||(51463868-51464030)
chr4 (94-259)||(19618172-19618336)
chr4 (45-257)||(54798669-54798872)
chr4 (94-257)||(18239419-18239581)
chr4 (94-253)||(15355324-15355483)
chr4 (134-257)||(14280316-14280438)
chr4 (94-257)||(44102214-44102376)
chr4 (174-260)||(3096293-3096379)
chr4 (94-257)||(12610950-12611105)
chr4 (45-260)||(15367690-15367905)
chr4 (45-260)||(15402703-15402918)
chr4 (94-259)||(14970707-14970871)
chr4 (45-260)||(15371202-15371417)
chr4 (45-260)||(15373483-15373698)
chr4 (78-241)||(13790-13953)
chr4 (94-258)||(22353835-22353999)
chr4 (126-260)||(15370018-15370152)
chr4 (45-242)||(52243099-52243299)
chr4 (126-260)||(16223532-16223666)
chr4 (94-257)||(7641192-7641344)
chr4 (96-241)||(21815587-21815731)
chr4 (34-145)||(3096759-3096869)
chr4 (4-122)||(17047936-17048055)
chr4 (134-257)||(8574864-8574985)
chr4 (191-260)||(15551817-15551887)
chr4 (78-242)||(43198492-43198658)
chr4 (85-211)||(43256106-43256230)
chr4 (191-256)||(12774011-12774077)
chr4 (191-260)||(39706339-39706409)
chr4 (94-254)||(20149832-20149992)
chr4 (76-233)||(15093798-15093955)
chr4 (191-242)||(12288261-12288313)
chr4 (159-241)||(6190481-6190564)
chr4 (191-256)||(8846360-8846426)
chr4 (45-96)||(8574784-8574836)
chr4 (45-100)||(14280462-14280518)
chr4 (83-256)||(15121747-15121917)
chr4 (176-233)||(16348700-16348757)
chr4 (176-233)||(16356988-16357045)
chr4 (191-239)||(17333298-17333346)
chr4 (5-63)||(15091093-15091152)
chr4 (191-241)||(46640507-46640558)
chr4 (191-241)||(53082203-53082254)
chr4 (197-233)||(11250619-11250655)
chr4 (197-233)||(15353365-15353401)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (4-242)||(24165-24406)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (4-260)||(51913-52170)
scaffold0011 (4-260)||(167843-168099)
scaffold0011 (192-241)||(38204-38253)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (10-260)||(20360830-20361081)
chr6 (4-260)||(20638147-20638404)
chr6 (4-260)||(17287660-17287917)
chr6 (4-260)||(22780091-22780348)
chr6 (5-260)||(29060540-29060796)
chr6 (5-260)||(25629220-25629476)
chr6 (4-259)||(18409691-18409947)
chr6 (34-260)||(19303436-19303661)
chr6 (10-260)||(20593773-20594024)
chr6 (93-260)||(16496244-16496411)
chr6 (93-260)||(20076700-20076863)
chr6 (94-257)||(12742317-12742479)
chr6 (44-260)||(16920538-16920751)
chr6 (94-257)||(18334592-18334754)
chr6 (94-257)||(19005046-19005208)
chr6 (94-257)||(19858919-19859081)
chr6 (94-257)||(22782227-22782389)
chr6 (94-257)||(24422547-24422709)
chr6 (94-257)||(25754809-25754971)
chr6 (94-257)||(33861794-33861956)
chr6 (94-257)||(33864278-33864440)
chr6 (85-260)||(35245586-35245758)
chr6 (94-259)||(30676710-30676874)
chr6 (94-257)||(1595549-1595711)
chr6 (94-257)||(2291180-2291342)
chr6 (94-257)||(8055029-8055191)
chr6 (94-257)||(26924640-26924802)
chr6 (94-259)||(34963371-34963535)
chr6 (94-257)||(25656629-25656791)
chr6 (45-241)||(18456735-18456930)
chr6 (78-242)||(25644338-25644503)
chr6 (94-257)||(1540911-1541073)
chr6 (114-257)||(25688502-25688644)
chr6 (44-260)||(22831503-22831718)
chr6 (94-254)||(16448526-16448686)
chr6 (94-257)||(3852017-3852179)
chr6 (111-241)||(18461895-18462024)
chr6 (94-258)||(19847949-19848114)
chr6 (94-257)||(20556894-20557054)
chr6 (33-233)||(15041445-15041644)
chr6 (78-260)||(20109140-20109322)
chr6 (106-258)||(23992429-23992578)
chr6 (5-233)||(25603250-25603478)
chr6 (53-233)||(25611637-25611816)
chr6 (191-260)||(27333269-27333339)
chr6 (191-260)||(27394009-27394079)
chr6 (199-260)||(25714417-25714478)
chr6 (52-241)||(11185524-11185710)
chr6 (76-241)||(18821782-18821946)
chr6 (85-211)||(27415887-27416011)
chr6 (191-260)||(28496522-28496592)
chr6 (191-260)||(29808933-29809003)
chr6 (45-260)||(8227416-8227632)
chr6 (191-256)||(19652199-19652265)
chr6 (207-260)||(1561303-1561356)
chr6 (171-256)||(19873120-19873205)
chr6 (171-256)||(22432249-22432334)
chr6 (171-256)||(22438799-22438884)
chr6 (191-242)||(9098565-9098617)
chr6 (191-239)||(33443068-33443116)
chr6 (171-256)||(19862978-19863063)
chr6 (196-242)||(19668389-19668436)
chr6 (213-260)||(22080799-22080846)
chr6 (191-248)||(4185872-4185930)
chr6 (140-233)||(18907134-18907226)
chr6 (192-233)||(21766718-21766759)
chr6 (141-241)||(23019425-23019525)
chr6 (191-241)||(23076749-23076800)
chr6 (191-241)||(35008167-35008218)
chr6 (192-237)||(16493169-16493214)
chr6 (192-241)||(18453201-18453250)
chr6 (171-256)||(25642219-25642304)
chr6 (197-233)||(19790837-19790873)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (11-260)||(5992-6245)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (34-260)||(27250624-27250850)
chr1 (4-260)||(22532269-22532526)
chr1 (10-257)||(34509783-34510031)
chr1 (4-259)||(50210077-50210333)
chr1 (19-260)||(21026680-21026922)
chr1 (20-183)||(22354452-22354616)
chr1 (46-259)||(22468604-22468816)
chr1 (4-259)||(20135188-20135444)
chr1 (4-149)||(22356038-22356185)
chr1 (4-149)||(22357724-22357871)
chr1 (78-257)||(23593719-23593897)
chr1 (94-257)||(13988866-13989028)
chr1 (94-257)||(21923291-21923453)
chr1 (94-260)||(45574842-45575008)
chr1 (94-257)||(21475087-21475249)
chr1 (94-257)||(31612313-31612475)
chr1 (78-257)||(433012-433188)
chr1 (94-258)||(21840766-21840929)
chr1 (94-257)||(29298137-29298298)
chr1 (94-257)||(29776688-29776850)
chr1 (45-260)||(38801297-38801508)
chr1 (94-257)||(16275363-16275526)
chr1 (78-259)||(16361915-16362095)
chr1 (170-260)||(20847185-20847275)
chr1 (76-233)||(21787979-21788136)
chr1 (94-260)||(13212861-13213027)
chr1 (94-263)||(15860008-15860177)
chr1 (94-257)||(21346961-21347124)
chr1 (78-241)||(21896195-21896358)
chr1 (94-257)||(22123067-22123230)
chr1 (79-241)||(21861510-21861672)
chr1 (94-263)||(21342090-21342259)
chr1 (44-122)||(48603652-48603730)
chr1 (94-257)||(21707167-21707329)
chr1 (94-257)||(21711709-21711871)
chr1 (192-259)||(20454606-20454673)
chr1 (171-256)||(21714546-21714631)
chr1 (94-254)||(40389157-40389317)
chr1 (85-211)||(33797570-33797694)
chr1 (69-241)||(35261011-35261180)
chr1 (134-260)||(33681010-33681133)
chr1 (191-253)||(21754052-21754115)
chr1 (134-256)||(22921864-22921986)
chr1 (195-260)||(14295606-14295672)
chr1 (45-242)||(16758667-16758866)
chr1 (134-260)||(22237630-22237753)
chr1 (191-242)||(20918622-20918674)
chr1 (191-256)||(20248283-20248349)
chr1 (191-242)||(52928021-52928073)
chr1 (191-241)||(50614168-50614219)
chr1 (191-241)||(50621996-50622047)
chr1 (192-241)||(16368338-16368388)
chr1 (171-256)||(42865245-42865330)
chr1 (191-241)||(41050087-41050138)
chr1 (191-241)||(21533924-21533974)
chr1 (190-241)||(50686630-50686682)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (4-260)||(38761-39017)
scaffold0145 (43-260)||(32942-33158)
scaffold0145 (94-262)||(9744-9912)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (4-260)||(913-1169)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (4-257)||(22886-23139)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (18-260)||(8411-8650)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (10-258)||(39479-39727)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-258)||(75085-75333)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (4-260)||(3015-3271)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (5-253)||(25930-26179)
scaffold0122 (134-257)||(44702-44825)
scaffold0122 (5-123)||(33360-33479)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-260)||(8479-8732)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (5-260)||(20910-21167)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (4-260)||(39913-40169)
scaffold0080 (141-241)||(19885-19987)
scaffold0080 (158-233)||(18674-18749)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-260)||(25896-26152)
scaffold0026 (34-260)||(39858-40083)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (50-260)||(4849-5059)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (5-260)||(4508-4763)
scaffold0228 (5-260)||(12090-12345)
scaffold0228 (5-260)||(22042-22297)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (4-208)||(13144-13349)
scaffold0175 (185-260)||(34123-34199)
scaffold0175 (204-260)||(273-329)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (16-259)||(17091-17337)
scaffold0056 (94-241)||(79284-79430)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (10-260)||(16470-16721)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (44-260)||(32067-32280)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (59-259)||(3106-3306)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (44-260)||(4712-4927)
scaffold0358 (44-195)||(1-151)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (4-168)||(124677-124842)
scaffold0021 (191-260)||(121766-121835)
scaffold0021 (82-259)||(174767-174943)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (44-260)||(13497-13711)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (44-260)||(15370-15584)
scaffold0114 (83-256)||(7295-7465)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (5-260)||(32824-33077)
scaffold0120 (5-260)||(45928-46181)
scaffold0120 (49-260)||(16113-16323)
scaffold0120 (199-260)||(17389-17450)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (4-260)||(1952-2209)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (10-257)||(339820-340065)
scaffold0003 (94-257)||(158450-158612)
scaffold0003 (85-211)||(71350-71474)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (44-260)||(10331-10544)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (122-260)||(28414-28552)
scaffold0046 (191-260)||(11292-11362)
scaffold0046 (191-260)||(1997-2067)
scaffold0046 (207-260)||(4552-4605)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (50-260)||(46995-47202)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (44-260)||(1289-1502)
scaffold0106 (44-260)||(7266-7479)
scaffold0106 (192-257)||(15291-15356)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (19-260)||(16282-16521)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (34-197)||(3424-3588)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (44-260)||(957-1170)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (94-257)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (94-257)||(37821-37983)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-179)||(27911-28086)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (94-257)||(94411-94573)
scaffold0023 (94-253)||(17440-17598)
scaffold0023 (97-257)||(44454-44614)
scaffold0023 (127-256)||(100378-100507)
scaffold0023 (76-233)||(38416-38573)
scaffold0023 (191-260)||(119875-119945)
scaffold0023 (191-256)||(40225-40291)
scaffold0023 (191-256)||(101503-101569)
scaffold0023 (76-168)||(23603-23695)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (5-239)||(4545-4779)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (94-257)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (94-257)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (94-257)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (94-257)||(82072-82234)
scaffold0037 (134-242)||(22665-22773)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (94-257)||(136680-136842)
scaffold0028 (94-257)||(139149-139311)
scaffold0028 (94-257)||(144087-144249)
scaffold0028 (94-257)||(134211-134373)
scaffold0028 (94-257)||(141618-141780)
scaffold0028 (191-258)||(62200-62268)
scaffold0028 (197-256)||(132662-132722)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (19-260)||(51582-51821)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (94-259)||(11286-11450)
scaffold0029 (83-233)||(12786-12933)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (94-254)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (94-258)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (94-257)||(16784-16946)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (94-253)||(501088-501246)
scaffold0001 (54-257)||(85539-85742)
scaffold0001 (191-256)||(160688-160754)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (4-201)||(6669-6867)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (138-260)||(11442-11564)
scaffold0235 (3-76)||(11376-11450)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (94-257)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (94-257)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (94-259)||(12249-12413)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (78-242)||(8484-8650)
scaffold0621 (134-260)||(6535-6661)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (94-258)||(9241-9404)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (4-122)||(1052-1171)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (93-260)||(128751-128917)
scaffold0031 (42-241)||(20328-20524)
scaffold0031 (171-232)||(65830-65891)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (94-257)||(4214-4377)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (44-257)||(5036-5246)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (4-183)||(827-1006)
scaffold0395 (194-260)||(4888-4954)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (94-242)||(29947-30094)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (45-260)||(17932-18148)
scaffold0247 (54-257)||(2088-2291)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (94-257)||(12064-12220)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (94-257)||(161089-161252)
scaffold0007 (54-177)||(164550-164674)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (54-241)||(13147-13336)
scaffold0357 (54-242)||(16014-16203)
scaffold0357 (191-241)||(2680-2731)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (54-242)||(27663-27852)
scaffold0165 (4-101)||(3640-3738)
scaffold0165 (4-101)||(7704-7802)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (94-254)||(1280-1440)
scaffold0101 (171-256)||(8995-9080)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-100)||(10323-10419)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (78-241)||(53488-53651)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (78-260)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (78-260)||(38195-38377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (134-257)||(116430-116551)
scaffold0022 (191-241)||(129022-129072)
scaffold0022 (192-237)||(78345-78391)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (95-256)||(29558-29720)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (85-211)||(15362-15486)
scaffold0107 (192-241)||(36199-36248)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (78-257)||(38641-38820)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (134-256)||(14692-14814)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (82-234)||(26850-26999)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (78-239)||(7998-8161)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (171-256)||(23843-23928)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (45-241)||(60620-60818)
scaffold0010 (134-248)||(129917-130031)
scaffold0010 (193-241)||(666-714)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (134-241)||(1051-1158)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (78-241)||(12587-12749)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (10-81)||(17857-17929)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (134-256)||(19268-19390)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (191-260)||(6611-6681)
scaffold0333 (191-260)||(13991-14061)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (184-257)||(15664-15738)
scaffold0261 (171-256)||(1339-1424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (191-260)||(6174-6244)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (76-233)||(16286-16442)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (191-260)||(15828-15898)
scaffold0020 (193-256)||(178898-178961)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (91-233)||(29117-29262)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (134-256)||(2801-2923)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (195-260)||(1089-1155)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (191-256)||(2696-2762)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (191-260)||(1120-1190)
scaffold0184 (197-233)||(4284-4320)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (76-233)||(4741-4898)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (134-242)||(10536-10644)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (191-256)||(28820-28887)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (191-260)||(23934-24001)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (134-248)||(5655-5769)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (191-256)||(1086-1152)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (199-241)||(11982-12024)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (137-260)||(12942-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (191-256)||(45843-45909)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (89-256)||(1881-2045)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (171-256)||(36454-36539)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (153-260)||(32538-32643)
scaffold0034 (88-241)||(51833-51985)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (171-256)||(69794-69879)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (193-260)||(12766-12834)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (82-256)||(21749-21920)
scaffold0210 (82-256)||(29641-29812)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (134-256)||(133-255)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (191-241)||(6831-6882)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (184-242)||(8118-8177)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (78-185)||(225482-225588)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (171-256)||(19980-20065)
scaffold0139 (141-237)||(38339-38437)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (184-256)||(10567-10639)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (191-242)||(25124-25176)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (191-239)||(206576-206624)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (192-241)||(569-619)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (141-242)||(10545-10646)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (207-256)||(32102-32151)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (176-233)||(44104-44161)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (81-117)||(1169-1205)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (191-241)||(6335-6386)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (131-233)||(192968-193070)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (195-233)||(4999-5037)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (192-241)||(7450-7499)
scaffold0111 (192-241)||(14569-14618)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (176-233)||(1853-1910)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (171-256)||(18236-18321)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (197-233)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (193-241)||(3276-3324)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (193-241)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: scaffold0292 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3721 - 3470
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 tgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 3622  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  3621 tttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgcttta 3522  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3521 gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 343
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 500  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  499 atgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgtt 401  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  400 attgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 22731112 - 22731355
Alignment:
Q  18 ggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731112 ggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 22731211  T
Q  117 acttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731212 acttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 22731311  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22731312 actaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22738050 - 22738300
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738050 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 22738149  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  22738150 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt 22738248  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23076699 - 23076442
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagacta-atgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076699 gagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23076600  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076599 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 23076500  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076499 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23286118 - 23285865
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23286118 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 23286019  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||    
T  23286018 atgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgtt 23285923  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23285922 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23060763 - 23060513
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060763 tgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 23060665  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060664 tgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 23060565  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23060564 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 23654250 - 23654507
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23654250 gagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatata 23654349  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    
T  23654350 atgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgct 23654449  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23654450 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22337372 - 22337115
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337372 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 22337273  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||    
T  22337272 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgtt 22337173  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22337172 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23660279 - 23660023
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagactaat-gaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660279 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23660180  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  |||||||||||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  23660179 atgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgtt 23660081  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23660080 gctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 37980 - 38235
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37980 gagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatata 38079  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38080 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgtt 38177  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38178 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 298693 - 298933
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  298693 gggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcatta 298792  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttattta 216  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  298793 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttattta 298892  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  298893 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20309321 - 20309108
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  20309321 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 20309223  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20309222 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 20309126  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  20309125 tgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23135652 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708738
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagt 23708722  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     ||  |||||||||||||    
T  23708723 tga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 255  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  241 gtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |  | |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 25616241  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  25616240 tattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  19672010 ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  19671912 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  183 ttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| |||| || || ||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 260
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 22799161  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799162 catgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27753820 - 27753730
Alignment:
Q  16 ttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 105  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753820 ttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgat 255  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019789
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 23019741  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 222  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23019742 catgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 241
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  193 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 22134258 - 22134326
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  22134258 actgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7679655 - 7679589
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7679655 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 23072000 - 23072070
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    | |||||||| ||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 32451793 - 32452031
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact--aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||||| ||| | |||||||||| | |   |||| ||||||||| |||||||||||    
T  32451793 gagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaat-atgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgggatgttaatgttgatttatgatgtgata 32451890  T
Q  101 taatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat 199  Q
    | |||| ||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  32451891 ttatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctat 32451988  T
Q  200 gttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451989 gttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23287432 - 23287384
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287432 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 40622151 - 40622327
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-----tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtca 176  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |     ||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||    
T  40622151 tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--ca 40622246  T
Q  177 tgct-gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    || | ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  40622247 tgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Original strand, 18786958 - 18787006
Alignment:
Q  195 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786958 cctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18787006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Original strand, 20520098 - 20520295
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| ||| | ||| |||    
T  20520098 ttaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgaga 20520196  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20520197 tgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgttttatgta--ctgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 20520293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23207347 - 23207296
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207347 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Original strand, 22459500 - 22459575
Alignment:
Q  77 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 152  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22459500 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatga 22459575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 168
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642930
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 24642930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 22740996 - 22741081
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22740996 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12699083 - 12698831
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699083 tgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 12698984  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12698983 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgt 12698884  T
Q  208 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12698883 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9509446 - 9509189
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509446 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 9509347  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9509346 gtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgtt 9509247  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9509246 actgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38227736 - 38227481
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38227736 agagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataa 38227637  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    || ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38227636 tgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttg 38227538  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227537 ctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 244  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  245 atgaagatgatga 257  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26212238 - 26211995
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  26212238 gggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcatta 26212139  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26212138 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 26212039  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atgatgatgt 260  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  26212038 ctaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 3564240 - 3564482
Alignment:
Q  16 ttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgca 114  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  3564240 ttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgca 3564339  T
Q  115 ttacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatt 214  Q
    |||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564340 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 3564439  T
Q  215 taactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564440 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10589280 - 10589039
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  10589280 gggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattg 10589182  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10589181 cttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaa 10589082  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  10589081 ctaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 16386112 - 16386369
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| || |||||  ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16386112 agagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataa 16386211  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||| | ||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16386212 tgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcg 16386311  T
Q  204 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16386312 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40443646 - 40443393
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||||||||||  | |||||| ||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  40443646 gagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatata 40443547  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| ||||||    
T  40443546 atgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgtt 40443450  T
Q  203 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  40443449 gctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 27847739 - 27847951
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  ||||||    
T  27847739 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 27847837  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  111 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 210  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  211 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  96 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 195  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  196 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  241 gtcgatgaagatgatga 257  Q
    || ||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44116571 gc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  54 atctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 152  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  153 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 251  Q
     ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  252 tgatgatgt 260  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  91 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  190 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  91 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  190 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  91 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  190 aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    | || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||| |||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Original strand, 15143902 - 15144140
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  15143902 agagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatg 15144001  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||  || || ||||||| ||| | ||||   |||||    
T  15144002 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgtt 15144100  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144101 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 15144140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || |||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  243 cgatgaagatgatga 257  Q
     ||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13869448 - 13869346
Alignment:
Q  154 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13869448 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T
Q  254 atga 257  Q
    ||||    
T  13869349 atga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  77 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtca 176  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  177 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 254
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  130 gtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 229  Q
    ||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  230 agtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 67815 - 67745
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  67815 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 28505349 - 28505419
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28505349 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34200856 - 34200786
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34200856 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486865
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  19486848 cgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  240 agtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 811182 - 811248
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  811182 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219835
Alignment:
Q  137 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  236 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  16219814 tctaagt---tgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16495472 - 16495402
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18005716 - 18005650
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18005716 actgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44014248 - 44014182
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44014248 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47831877 - 47831807
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47831877 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  194 g 194  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  194 g 194  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 11996078 - 11996148
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11996078 actgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  207 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 12255697 - 12255892
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  12255697 ttaatgatgatctatgaagttgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgaga 12255795  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 238  Q
    |||||  ||||| || ||||||||  ||| |||||  |   |||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255796 tgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 180  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  84 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||  |   |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  184 tttgtaaa-ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
     |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Original strand, 1867901 - 1868098
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||| ||||    
T  1867901 ttaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagat 1867999  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| | | ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868000 gttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 211
Target Start/End: Original strand, 2530130 - 2530208
Alignment:
Q  131 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||   |||||||||||||||||||    
T  2530130 tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273538
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 181  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | |    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattg 12187094  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  12187093 taattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901341
Alignment:
Q  183 ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagt 12901341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14044816 - 14044764
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044816 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14044764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14354846 - 14354794
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354846 actgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14354794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16056393 - 16056346
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16056393 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagt 16056346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113036
Alignment:
Q  77 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 167  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15116662 - 15116573
Alignment:
Q  77 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 167  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |  |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15116662 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattga-gatgttgatgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18203881 - 18203831
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203881 actgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 257
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  199 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 257
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  199 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20536459 - 20536208
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536459 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgtta 20536360  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20536359 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt 20536260  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20536259 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 18818273 - 18818530
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18818273 gagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 18818372  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18818373 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 18818472  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18818473 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 21923792 - 21924049
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  21923792 gagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaata 21923891  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21923892 aggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgtt 21923991  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923992 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 18879101 - 18879352
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18879101 gagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatata 18879199  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||| ||||||||||||    
T  18879200 atgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgtt 18879294  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18879295 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22626992 - 22626736
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22626992 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 22626893  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||   |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  22626892 atgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 22626794  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22626793 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7373027 - 7372778
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7373027 gagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 7372928  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |        ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7372927 a--------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 7372836  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7372835 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23406638 - 23406379
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23406638 gagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatata 23406539  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23406538 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatg 23406439  T
Q  201 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23406438 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 21918905 - 21919121
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaag 142  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21918905 gttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaag 21919003  T
Q  143 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919004 atgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21919103  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  21919104 tgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 28648908 - 28649164
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28648908 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 28649007  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||   |||||||||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28649008 atgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgtt 28649107  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649108 gcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23648810 - 23648554
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagac-taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648810 gagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23648711  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  23648710 atgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgtt 23648611  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  23648610 gctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6759512 - 6759255
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759512 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 6759413  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  |||||| |||||  ||  ||| ||| || |||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  6759412 atgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgtt 6759316  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759315 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31971512 - 31971257
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31971512 gagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatata 31971413  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31971412 atgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgtt 31971315  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31971314 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 16092206 - 16092463
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092206 agagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 16092305  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16092306 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgtt 16092405  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16092406 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22875321 - 22875065
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagac-taatgaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875321 agagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22875222  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  22875221 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgtt 22875123  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22875122 gctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Original strand, 45130877 - 45131117
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45130877 gggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcatta 45130975  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaatt-gcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 216  Q
    |||||||||||  || |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45130976 cttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttattta 45131073  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  45131074 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 16199551 - 16199765
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  16199551 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 16199649  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16199650 tgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16199747  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  16199748 tgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21389456  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21389457 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21389553  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  21389554 tgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 260
Target Start/End: Original strand, 21778699 - 21778897
Alignment:
Q  59 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 158  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |    
T  21778699 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaa 21778797  T
Q  159 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21778798 tttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 21778894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678221
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 18678167  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  18678168 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactat---gtcatgctgtttttgtaa 190  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||     
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121734
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 32121788  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  32121787 tattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 25363004 - 25363123
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25363004 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtata 25363103  T
Q  103 atgttatgtgcattacttga 122  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  25363104 atgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 253
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    | |||| | | | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508124 gatgttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || ||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 253
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    | || ||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15070686 - 15070573
Alignment:
Q  129 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 227  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15070686 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15070588  T
Q  228 tgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||||||||    
T  15070587 tgagtcggtctaagt 15070573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 19937005 - 19937174
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    ||||||||||   ||||||||||  |||||  || ||||| || || ||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19937005 tgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatac 19937104  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 263  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  19937105 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 23776870  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23776871 catgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 19801431  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     |||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801432 cgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219717
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 26219829  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26219828 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26219731  T
Q  244 gatgaagatgatga 257  Q
    ||| | ||||||||    
T  26219730 gattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  137 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  236 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||  ||||  | |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17140986 - 17140916
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17140986 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21491065 - 21490995
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21491065 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 260
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  88 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 187  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  188 taaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 5866325 - 5866395
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  5866325 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 23760895 - 23760962
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23760895 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 983457 - 983509
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983457 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  240 agtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| ||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  210 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  210 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 26355749 - 26355815
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26355749 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| ||| | ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  178 g--ctgtttt-tgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116431 gaactgttttatgta--ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24353090 - 24353039
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353090 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673716
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22525627 - 22525579
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525627 actgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 96  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 17267045 - 17267096
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267045 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 19154938 - 19154989
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154938 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 181  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||  | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    || |||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2108 - 1851
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108 gagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 2009  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  2008 atgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgtt 1909  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1908 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 23390360 - 23390617
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390360 gagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23390459  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  23390460 atgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgtt 23390559  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23390560 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 8286706 - 8286964
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286706 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 8286805  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg-tttttgtaaactgcctatgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8286806 atgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgt 8286905  T
Q  202 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8286906 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25421789 - 25421532
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25421789 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25421690  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25421689 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25421590  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421589 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24493825 - 24493569
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24493825 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 24493726  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24493725 atgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 24493627  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24493626 gctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25431651 - 25431395
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25431651 gagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25431552  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25431551 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25431452  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25431451 gctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13025567 - 13025311
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13025567 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13025468  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13025467 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 13025369  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13025368 gctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13095751 - 13095495
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13095751 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13095652  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13095651 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 13095553  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13095552 gctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9078203 - 9077952
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078203 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 9078104  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |  |||||||||||   ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9078103 tacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt 9078004  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9078003 gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22075261 - 22075018
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22075261 gggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcatta 22075162  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22075161 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaa 22075062  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaag-atgatgatgt 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22075061 ctaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1096712 - 1096467
Alignment:
Q  16 ttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgca 114  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1096712 ttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgca 1096613  T
Q  115 ttacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatt 214  Q
    |||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1096612 ttacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatt 1096513  T
Q  215 taactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1096512 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24529477 - 24529223
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529477 gagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatata 24529378  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24529377 atgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 24529278  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529277 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Original strand, 21292849 - 21293090
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21292849 gggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcatta 21292947  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaat--tgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattt 215  Q
    |||||||||||  || |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21292948 cttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttattt 21293045  T
Q  216 aactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21293046 aactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  95 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactg 194  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  195 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 260
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997655
Alignment:
Q  154 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  254 atgatgt 260  Q
    |||||||    
T  21997649 atgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418598
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 244  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  245 atgaagatgatga 257  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||  || |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902156
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902108 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20902156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11581299 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517320
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 17517266  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  17517267 tattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22144240 - 22144068
Alignment:
Q  69 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22144240 taagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattg 22144141  T
Q  169 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144140 ttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 22107237 - 22107357
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22107237 gagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatata 22107336  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaa 123  Q
    || |  | |||||||||||||    
T  22107337 atatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||  || |||||||| || | | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31061131 tac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38619562 - 38619434
Alignment:
Q  129 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 227  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38619562 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 38619464  T
Q  228 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38619463 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  185 ttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 21986011 - 21986130
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagacta-atgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  21986011 gagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaa 21986110  T
Q  103 atgttatgtgcattacttga 122  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  21986111 atgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 257
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  163 atattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23064639 - 23064512
Alignment:
Q  129 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 227  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23064639 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgca 23064541  T
Q  228 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23064540 tgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37724080 - 37723922
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||||||  | ||||||| |  ||||||||||    
T  37724080 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgct 37723981  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723980 gtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 19660886 - 19660956
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19660886 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 21329548 - 21329618
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21329548 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  24067170 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  142 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 238  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  239 aag 241  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 22959583 - 22959649
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22959583 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  137 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 235  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| |||   | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  236 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21873431 - 21873277
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  |||||||||   |||| ||  ||||||||||  | ||    
T  21873431 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatggttaagatgt---tgaaatgagattgatattatgaagt 21873336  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873335 catgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36314643 - 36314577
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36314643 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctg 181  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat- 22032398  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 26012086 - 26012154
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26012086 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19668968 - 19668898
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19668968 actgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 180  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 18770042  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 96  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572107
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 181  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 23572159  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23572158 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 23572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766166
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttt 185  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20766166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201382
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 234  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcg 23201382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 237
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 237
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13211
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462 tgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 13363  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13362 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13263  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13262 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13442509 - 13442274
Alignment:
Q  26 attaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442509 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 13442410  T
Q  125 aatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13442409 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagct 13442310  T
Q  225 gcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13442309 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17488113 - 17487856
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488113 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 17488014  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  17488013 atgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatttt 17487914  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17487913 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17499595 - 17499338
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17499595 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatata 17499496  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  17499495 atgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatttt 17499396  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17499395 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26687144 - 26686887
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26687144 gagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 26687045  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26687044 atgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 26686945  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26686944 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 20698300 - 20698556
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20698300 gagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatata 20698399  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20698400 atgtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 20698498  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20698499 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14973110 - 14972854
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973110 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14973011  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||||| |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14973010 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttg 14972911  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14972910 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 23083226 - 23083482
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagactaa-tgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23083226 agagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataa 23083325  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23083326 tgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttg 23083425  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083426 ctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43841180 - 43840932
Alignment:
Q  13 actttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgt 111  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841180 actttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgt 43841081  T
Q  112 gcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  43841080 gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgtt 43840981  T
Q  212 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  43840980 atttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 14576697 - 14576949
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14576697 gagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 14576796  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||    
T  14576797 atgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgtt 14576895  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14576896 gctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12399451 - 12399209
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagac-taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  12399451 gggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcatta 12399352  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12399351 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 12399252  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12399251 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18438785 - 18438534
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438785 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 18438686  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438685 tatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 18438586  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18438585 gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 25476249 - 25476506
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25476249 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 25476348  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  25476349 atgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgtt 25476448  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25476449 gctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 244  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  245 atgaagatgatga 257  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14572845 - 14572602
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  14572845 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatata 14572746  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  14572745 atgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgtt 14572647  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14572646 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 11424627 - 11424880
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11424627 gagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatata 11424726  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11424727 atgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgtt 11424822  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11424823 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42386630 - 42386427
Alignment:
Q  41 gatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattt 139  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||   |||||||||    
T  42386630 gatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatattt 42386531  T
Q  140 aagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42386530 gagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtcta 42386431  T
Q  240 agtc 243  Q
    ||||    
T  42386430 agtc 42386427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 40213597 - 40213838
Alignment:
Q  16 ttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgca 114  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40213597 ttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 40213696  T
Q  115 ttacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatt 214  Q
    ||||||| |  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  40213697 ttacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatt 40213795  T
Q  215 taactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40213796 taactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30030096 - 30029858
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||  |||||||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30030096 gagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatata 30029997  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |    
T  30029996 atgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgct 30029898  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30029897 gctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagt 30029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28848711 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 255  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 255  Q
    |    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  143 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  243 cgatgaagatgatga 257  Q
     ||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822267
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||  ||||| ||||||||| |||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgc 46822321  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  46822320 tattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  126 atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 225  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  226 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 12119759 - 12119887
Alignment:
Q  129 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 227  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12119759 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgca 12119857  T
Q  228 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12119858 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15412557 - 15412429
Alignment:
Q  129 tgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 227  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412557 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15412459  T
Q  228 tgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15412458 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12511236 - 12511059
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgc 179  Q
    |||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  12511236 tgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  180 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8499697 - 8499518
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtca 176  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  |  || |||||||| || |||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  8499697 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 8499598  T
Q  177 tgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8499597 tgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | |||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  178 g--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |  ||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618464
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 21618561  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618560 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21618464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  160 ttgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  154 ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  254 atga 257  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16796803 - 16796685
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16796803 agagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataa 16796704  T
Q  104 tgttatgtgcattacttga 122  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  16796703 tgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  160 ttgatattactatgtcatgctgtttttgta--aactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23274869 - 23274687
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| | | |||||||||  |||||||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||    
T  23274869 ttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 23274770  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||    
T  23274769 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgatgt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 12174310 - 12174376
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12174310 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 13210378 - 13210448
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13210378 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  240 agtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  15470944 agt---tgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  137 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  236 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32307747 - 32307684
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32307747 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 257
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  116 tacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttat 213  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  214 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16103850 - 16103784
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16103850 actgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 49668127 - 49668193
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  49668127 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9512990 - 9512924
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9512990 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9520965 - 9520899
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9520965 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 167
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051227
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 167  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 856140
Alignment:
Q  180 tgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13919394 - 13919350
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919394 cctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 260
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  81 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 180  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| |    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | ||||| | || ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22147567 g-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 22110403 - 22110454
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110403 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43926028 - 43925977
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926028 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 1644725 - 1644787
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1644725 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 23077509 - 23077571
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077509 atgtcataatgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  238 taag 241  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 14878548 - 14878610
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||  |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878548 atgtcataatgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15051593 - 15051531
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15051593 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15060369 - 15060307
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15060369 atgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22636685 - 22636437
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636685 tgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgtta 22636587  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22636586 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt 22636487  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22636486 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44053086 - 44052829
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44053086 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatata 44052987  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44052986 atgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 44052887  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44052886 gatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12903014 - 12902757
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12903014 gagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 12902915  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12902914 atgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 12902815  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12902814 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7089134 - 7088877
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  7089134 gagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatata 7089035  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7089034 atgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 7088935  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7088934 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 16239834 - 16240090
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16239834 gagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatata 16239933  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  16239934 atgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatttt 16240032  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16240033 gctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7893957 - 7893703
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||    
T  7893957 gagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaata 7893861  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893860 atggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 7893761  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7893760 gctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  43 tgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 142  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  143 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     |||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14038904 - 14038653
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038904 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14038805  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | |||||    
T  14038804 tgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttg 14038705  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14038704 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 16377387 - 16377639
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16377387 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 16377486  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16377487 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgtt 16377584  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16377585 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 23374238 - 23374473
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23374238 gggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcatta 23374337  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23374338 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 23374437  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  23374438 ctaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  88 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  188 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  135 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 234  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  235 gtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 14053207 - 14053422
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag- 142  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||   ||||     
T  14053207 gttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgcataaga 14053305  T
Q  143 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T
Q  242 tcgatgaagatgatgatgt 260  Q
      | |||||||||||||||    
T  14053404 atgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  244 gatgaagatgatga 257  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 17046602  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |   | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17046601 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 17046505  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  17046504 tgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 263  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||||  ||   || |||||| |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  244 gatgaagatgatga 257  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18239519 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44102276 ac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  174 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  144 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  144 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
     |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371202
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15371319  T
Q  144 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
      ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371318 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15371219 cgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373483
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15373600  T
Q  144 tgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
      ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373599 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15373500 cgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |  || ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15370152 - 15370018
Alignment:
Q  126 atatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 224  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15370152 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 15370054  T
Q  225 gcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15370053 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243299
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    ||||| |||||| || ||||||||  ||| |||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  241 gt 242  Q
    ||    
T  52243298 gt 52243299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16223666 - 16223532
Alignment:
Q  126 atatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 224  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16223666 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 16223568  T
Q  225 gcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16223567 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  96 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 195  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  196 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3096869 - 3096759
Alignment:
Q  34 taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtga 133  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  3096869 taatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttga 3096771  T
Q  134 atatttaagatg 145  Q
    ||||||| ||||    
T  3096770 atatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 17047936 - 17048055
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17047936 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 17048035  T
Q  103 atgttatgtgcattacttga 122  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  17048036 atgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15551887 - 15551817
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15551887 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198658
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||   ||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  178 gctgt-ttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |   | ||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 43198658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12774077 - 12774011
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12774077 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 39706339 - 39706409
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39706339 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  |||| ||||||  ||| || |||||||||||  | ||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattat-tgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagt 15093857  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||| | ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15093856 catgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 12288261 - 12288313
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288261 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 12288313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190481
Alignment:
Q  159 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8846426 - 8846360
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8846426 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280462
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 14280462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 181  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |     
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgatta 15121842  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    || |||||| ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 16348700 - 16348757
Alignment:
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348700 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 16356988 - 16357045
Alignment:
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16356988 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17333346 - 17333298
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333346 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15091152 - 15091093
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaag 63  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15091152 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 46640507 - 46640558
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640507 actgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 53082203 - 53082254
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082203 actgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 24165 - 24406
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagactaat-gaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttga-ttatgatgtgatat 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24165 gagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatat 24264  T
Q  102 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgt-ttttgtaaactgcctatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24265 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatg 24364  T
Q  201 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24365 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51913
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52170 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatata 52071  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52070 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgtt 51971  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51970 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 167843 - 168099
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  167843 gagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatata 167942  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  167943 atgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgtt 168041  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  168042 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 20360830 - 20361081
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20360830 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtta 20360929  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20360930 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt 20361029  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  20361030 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 20638147 - 20638404
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638147 gagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 20638246  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20638247 acgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 20638346  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20638347 gttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 17287660 - 17287917
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  17287660 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacata 17287759  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  17287760 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgtt 17287859  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17287860 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 22780091 - 22780348
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22780091 gagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 22780190  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22780191 atgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtt 22780290  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22780291 tttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29060796 - 29060540
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29060796 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataa 29060697  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29060696 tgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttg 29060597  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29060596 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 25629220 - 25629476
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629220 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 25629319  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||     
T  25629320 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttc 25629419  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25629420 ctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 18409691 - 18409947
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409691 gagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 18409790  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| || |||| |||||  ||   || ||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  18409791 atgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgtt 18409890  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409891 gctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 19303436 - 19303661
Alignment:
Q  34 taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtga 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   ||     
T  19303436 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgt 19303535  T
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20594024 - 20593773
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594024 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgtta 20593925  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |  |||||||||||   ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  20593924 tacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtt 20593825  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20593824 tttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 16920538 - 16920751
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  16920538 gttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 16920636  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||| | | |||||||   ||||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16920637 tgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaaga 16920733  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  16920734 tgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  185 ttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||  | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25644503 - 25644338
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| || || ||||||||  ||| |||     
T  25644503 ttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcac 25644404  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644403 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1541011 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  114 attacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttat 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  214 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22831718 - 22831503
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaat--atttaa 141  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||  || |||    
T  22831718 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaa 22831620  T
Q  142 gatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22831619 gatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctac 22831523  T
Q  241 gtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
       | |||||||||||||||    
T  22831522 tatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  111 tgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgt 210  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  211 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||  ||||| |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||   || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 15041445 - 15041644
Alignment:
Q  33 ctaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgt- 131  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||||||||||| || | | |     
T  15041445 ctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttga-gattttatt 15041542  T
Q  132 gaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 231  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15041543 gaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgag 15041642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992429
Alignment:
Q  106 ttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgc 204  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgc 23992483  T
Q  205 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  23992482 tattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 25603250 - 25603478
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| || ||||||  |||||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| |    
T  25603250 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatga 25603349  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||    
T  25603350 tgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctg 25603448  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603449 ctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Original strand, 25611637 - 25611816
Alignment:
Q  53 aatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |   |||||| || |||||| | |||    
T  25611637 aatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tga 25611735  T
Q  153 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||  || |||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25611736 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 27333269 - 27333339
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27333269 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 27394009 - 27394079
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27394009 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  199 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185524
Alignment:
Q  52 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg 151  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| | || |||   |||||| |||||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  152 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatg 173  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||  ||||||||  ||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatg 18821879  T
Q  174 tcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 28496522 - 28496592
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  28496522 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 29808933 - 29809003
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  29808933 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227632
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | || |    ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||| ||||||    
T  8227615 tgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19652265 - 19652199
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19652265 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  207 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 9098565 - 9098617
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33443116 - 33443068
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443116 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668389
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 19668389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  213 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 248
Target Start/End: Original strand, 4185872 - 4185930
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 248  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  4185872 actgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18907226 - 18907134
Alignment:
Q  140 aagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||  | || |||||||| |||| | |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907226 aagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  240 ag 241  Q
    ||    
T  23019426 ag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23076800 - 23076749
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076800 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35008218 - 35008167
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008218 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 25642219 - 25642304
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  25642219 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 5992 - 6245
Alignment:
Q  11 gaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttat 109  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5992 gaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttat 6091  T
Q  110 gtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgccta---tgttgctg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||| ||    
T  6092 gtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttg 6191  T
Q  207 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 27250624 - 27250850
Alignment:
Q  34 taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtga 133  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||    
T  27250624 taatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttga 27250723  T
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 27250823  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  27250824 ggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22532526 - 22532269
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532526 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22532427  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22532426 atgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 22532327  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22532326 gctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34510031 - 34509783
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34510031 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 34509932  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |  |||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34509931 taagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 34509832  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34509831 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 50210077 - 50210333
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210077 gagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 50210176  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50210177 atgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 50210276  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50210277 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21026922 - 21026680
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21026922 gggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcatta 21026823  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 217  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21026822 cttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaa 21026723  T
Q  218 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21026722 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 22354452 - 22354616
Alignment:
Q  20 ggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22354452 ggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattac 22354551  T
Q  119 ttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22354552 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  46 taattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagat 22468701  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22468702 gttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  245 atgaagatgatgatg 259  Q
    || |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20135444 - 20135188
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagac-taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20135444 gagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatata 20135345  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  20135344 atgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgct 20135245  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  20135244 gctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22356038 - 22356185
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatat 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22356038 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatat 22356137  T
Q  102 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22356138 aatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22357724 - 22357871
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatat 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22357724 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatat 22357823  T
Q  102 aatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22357824 aatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 433188 - 433012
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |    
T  433188 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 433089  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  433088 gatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 38801297 - 38801508
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagat 144  Q
    |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| ||| ||    
T  38801297 ttaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatat 38801395  T
Q  145 gttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  38801396 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagat 38801491  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||    
T  38801492 gttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    | ||||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 260
Target Start/End: Original strand, 20847185 - 20847275
Alignment:
Q  170 tatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20847185 tatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213027
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860177
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||||| || |||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 263  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  15860108 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  194 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  79 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg 178  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  179 ctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21342259 - 21342090
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  21342259 tgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21342160  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcca 263  Q
    ||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21342159 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||   ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Original strand, 35261011 - 35261180
Alignment:
Q  69 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168  Q
    |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  ||| |||||||||||||  || | ||||| ||| ||||||||||   ||||| ||||||||     
T  35261011 taagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattg 35261107  T
Q  169 ctatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
     ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261108 ttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681010
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  33681034 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21754115 - 21754052
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21754115 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 14295606 - 14295672
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  14295606 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16758866 - 16758667
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||   ||    
T  16758866 ttaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-ga 16758768  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    ||||| || |||| | ||||||||  ||| |||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16758767 tgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237630
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  22237654 cggtctaagt---tgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20918674 - 20918622
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918674 actgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20918622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20248349 - 20248283
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20248349 actgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 52928021 - 52928073
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928021 actgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52928073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 50614168 - 50614219
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614168 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 50621996 - 50622047
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621996 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368388
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 41050087 - 41050138
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050087 actgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 21533924 - 21533974
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533924 actgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50686682 - 50686630
Alignment:
Q  190 aactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686682 aactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39017 - 38761
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39017 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 38918  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38917 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 38819  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38818 gctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  43 tgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaag 142  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  143 atgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     |||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgtcc 262  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 913 - 1169
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  913 gagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatata 1012  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1013 atgtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgtt 1111  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1112 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23139 - 22886
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23139 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatata 23040  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  23039 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgtt 22941  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22940 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 8411 - 8650
Alignment:
Q  18 ggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 116  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8411 ggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcatt 8510  T
Q  117 acttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttattta 216  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||    
T  8511 acttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttattta 8606  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8607 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39727 - 39479
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727 tgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 39628  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39627 tgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt 39529  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39528 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 75085 - 75333
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75085 tgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 75184  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  75185 tgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt 75283  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  75284 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 3015 - 3271
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3015 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 3114  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  3115 atgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 3213  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3214 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Original strand, 25930 - 26179
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25930 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 26029  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||||   ||||||||||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26030 tgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 26129  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26130 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     |||||||| ||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 33360 - 33479
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33360 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 33459  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaa 123  Q
    |||||   ||||||||||||    
T  33460 tgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8479
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||    
T  8732 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----ta 8637  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8636 atgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgtt 8537  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8536 gctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21167 - 20910
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21167 agagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataa 21068  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    |||| | ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  21067 tgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttg 20968  T
Q  204 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20967 ctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40169 - 39913
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40169 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 40070  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  40069 atgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 39971  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39970 gctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  238 taag 241  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Original strand, 18674 - 18749
Alignment:
Q  158 aattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||||  | || || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18674 aattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26152 - 25896
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26152 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 26053  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  26052 atgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgtt 25954  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25953 gctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40083 - 39858
Alignment:
Q  34 taatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtga 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||    
T  40083 taatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattga 39984  T
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  50 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  150 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaa 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T
Q  250 gatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||    
T  4859 gatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4508
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 4664  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  4663 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 4564  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  4563 ctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12345 - 12090
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12345 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 12246  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  12245 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 12146  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12145 ctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22297 - 22042
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22297 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 22198  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttg 203  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  22197 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 22098  T
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22097 ctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13349 - 13144
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13349 gagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 13250  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13249 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 13150  T
Q  203 gctgtt 208  Q
    ||||||    
T  13149 gctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  185 ttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  204 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 17091 - 17337
Alignment:
Q  16 ttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgca 114  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17091 ttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgca 17190  T
Q  115 ttacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt--gtaaactgcctatgttgctgttgtta 212  Q
    |||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17191 ttacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 17290  T
Q  213 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17291 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Original strand, 79284 - 79430
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||    
T  79284 tgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatact 79383  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79384 gtcg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 16470 - 16721
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16470 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgtta 16569  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |  ||||||||||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  16570 tacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt 16669  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16670 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32280 - 32067
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  32280 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 32182  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32181 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32084  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||    
T  32083 gttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 259
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3306
Alignment:
Q  59 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgca 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| |||||| ||    
T  3106 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattaca 3205  T
Q  159 attgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3206 tttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 3305  T
Q  259 g 259  Q
    |    
T  3306 g 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4927 - 4712
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||    
T  4927 gttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataaga 4829  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    | ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4828 ttttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4729  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||    
T  4728 gttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 1
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||    
T  151 gttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataaga 53  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgc 195  Q
    | ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||    
T  52 ttttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 124842 - 124677
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124842 gagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 124743  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  124742 atgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatatta 124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13711 - 13497
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  13711 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 13613  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13612 tgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13514  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | ||||| |||||||||    
T  13513 gttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |  |||  |||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataaga 15468  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15469 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15567  T
Q  244 gatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||||||||||||    
T  15568 gttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-g 181  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | |||  |||| | |    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattg 7370  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  7369 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 32824 - 33077
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagactaat-gaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  32824 agagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttata 32921  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  32922 atgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgtt 33019  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33020 gctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46181 - 45928
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagactaat-gaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | ||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  46181 agagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttata 46084  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  46083 atgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgtt 45986  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45985 gctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  49 ttataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgtt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||   || ||| || ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  148 gatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatg 247  Q
    | ||  ||||| |||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  248 aagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  199 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2209 - 1952
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||  | |||| | ||||| | | ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2209 gagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatata 2110  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||     
T  2109 atgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtc 2010  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  2009 gctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 339820 - 340065
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339820 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 339919  T
Q  109 tgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |   |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |    
T  339920 tacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-t 340016  T
Q  209 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  340017 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat-atgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaaga 10429  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10430 tgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagt 10526  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  10527 tgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  122 aagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 221  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  222 gctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11362 - 11292
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11362 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1997
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2067 actgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  207 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  50 tataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga 149  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  150 tgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatga 248  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  249 agatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1502 - 1289
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  1502 gttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 1404  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1403 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 1307  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  1306 tgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7479 - 7266
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  7479 gttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 7381  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7380 tgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 7284  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  7283 tgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16521 - 16282
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  16521 gggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcatta 16423  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttattta 216  Q
    |||||||||| | || |||  ||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16422 cttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttattta 16326  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16325 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  34 taatgaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtg 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  133 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcct 197  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 957 - 1170
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  957 gttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 1055  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||   ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1056 tgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 1152  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
     | |||||||||||||||    
T  1153 tgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28086 - 27911
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28086 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataa 27987  T
Q  104 tgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgc 179  Q
    |||||| |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27986 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  97 gatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt-gtaaactgc 195  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  196 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44514 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100378
Alignment:
Q  127 tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 225  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  226 catgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 38416 - 38573
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  38416 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 38514  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| |||| |||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38515 catgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 119945 - 119875
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  119945 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 40225 - 40291
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  40225 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 101569 - 101503
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  101569 actgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 23603 - 23695
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  23603 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4779 - 4545
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagactaat-gaggatgttaattataatctatgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  4779 agagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatata 4682  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgtt 202  Q
    ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  || || ||||| | ||| | |||||||||| |    
T  4681 atgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgct 4582  T
Q  203 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4581 gttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13454 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22773
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  233 cggtctaagt 242  Q
    ||||||||||    
T  22764 cggtctaagt 22773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 62268 - 62200
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  62268 actgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  197 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51821 - 51582
Alignment:
Q  19 gggtagtattaagactaatgag-gatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    |||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||     
T  51821 gggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcattt 51723  T
Q  118 cttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttattta 216  Q
    ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51722 cttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttattta 51626  T
Q  217 actaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  51625 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12786
Alignment:
Q  83 gttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ctg 181  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||||  ||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12838  T
Q  182 tttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    || |||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12837 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| || || ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatg 253  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  54 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 151  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||| |    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  152 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 251  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  252 tgatga 257  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 160754 - 160688
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  160754 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6867 - 6669
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||| | |||||  | |||| ||||||||| | ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6867 gagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatata 6768  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgt 201  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  6767 acgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 260
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  138 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  238 taagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Original strand, 11376 - 11450
Alignment:
Q  3 agagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgt 76  Q
    |||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11376 agagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatg 259  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8484
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtc 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgat 258  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1052
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1171 gagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 1072  T
Q  103 atgttatgtgcattacttga 122  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  1071 atgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  93 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |        
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 20328 - 20524
Alignment:
Q  42 atgttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatattta 140  Q
    |||||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  20328 atgttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 20425  T
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20426 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  44 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    |||||||||||| | |||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | || |||  |||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 5134  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||   ||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5135 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5231  T
Q  243 cgatgaagatgatga 257  Q
     | ||||||||||||    
T  5232 tgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 827 - 1006
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||  |||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  827 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatata 926  T
Q  103 atgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  927 atgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 260
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29947
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 29947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||| ||| ||||| || || || | | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  243 cgatgaagatgatgatgt 260  Q
    || |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2291
Alignment:
Q  54 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-g 151  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||| ||| || |    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  152 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 251  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaa 2285  T
Q  252 tgatga 257  Q
    ||||||    
T  2286 tgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | || ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  54 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttga-tg 151  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || |||||||| || ||||||||| ||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  152 aattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  54 atctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaata-tttaagatgttgatg 151  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  152 aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16203
Alignment:
Q  54 atctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 152  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  153 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
     || || ||||||||  ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2680
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2731 actgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27852
Alignment:
Q  54 atctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatga 152  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  153 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
     || || ||||||||  ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 27852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3738 - 3640
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3738 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7802 - 7704
Alignment:
Q  4 gagagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7802 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  94 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaac 192  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatga 254  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10419 - 10323
Alignment:
Q  5 agagatgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10419 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||| ||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    | |||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  234 ggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 129022 - 129072
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129022 actgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  95 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatg-aattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaact 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  194 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  85 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa-tatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgtt 211  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||  ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    | |||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttctta-ctgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26999 - 26850
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg-ct 180  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  |    
T  26999 tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgatt 26904  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 234  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26903 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  178 --gctgtttttgtaaactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
      ||||  |||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Original strand, 60620 - 60818
Alignment:
Q  45 ttaattataatctatgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaaga 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  60620 ttaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 60719  T
Q  144 tgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat--gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 240  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  60720 tgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaa 60817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  233 cggtctaagtcgatga 248  Q
    |||||||||| |||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||| | | | ||||||||  ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  233 cggtctaag 241  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |||  |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  178 gctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 17857 - 17929
Alignment:
Q  10 tgaactttggggtagtattaagact-aatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttga 81  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17857 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6611
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6681 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13991
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14061 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatga 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 6174 - 6244
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6174 actgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 16286 - 16442
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga-atatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||| |||| |  |||||||||||  | ||    
T  16286 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagt 16383  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||| |||| |||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16384 catgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 15828 - 15898
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15828 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  91 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatat--ttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattactatgtcatgctgtttttg 187  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |   |||||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  188 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    ||| || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1155
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1089 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 2696 - 2762
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2696 actgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1190
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4898
Alignment:
Q  76 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga-agaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgt 174  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  4741 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattat-tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagt 4839  T
Q  175 catgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    || |||||| |||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  4840 caagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtc 4898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10644
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  233 cggtctaagt 242  Q
    ||||||||||    
T  10635 cggtctaagt 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 28820 - 28887
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28820 actgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 23934 - 24001
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23934 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  233 cggtctaagtcgatga 248  Q
    |||||||||| |||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 1086
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1152 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  199 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12942
Alignment:
Q  137 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  236 tctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    |||||||   |||||||||||||||    
T  12963 tctaagt---tgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 45843 - 45909
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45843 actgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  89 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct-gtttttg 187  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  188 taaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36539 - 36454
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36539 atgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32538
Alignment:
Q  153 attgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaaga 251  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  252 tgatgatgt 260  Q
    |||||||||    
T  32546 tgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Original strand, 51833 - 51985
Alignment:
Q  88 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatg-ttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgttttt 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||  |||||| || ||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||    
T  51833 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctattttt 51930  T
Q  187 gtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    | |  |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51931 gaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatgatgt 260  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 21749 - 21920
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 180  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  21749 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 21844  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  21845 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Original strand, 29641 - 29812
Alignment:
Q  82 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgct- 180  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||| |     
T  29641 tgttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 29736  T
Q  181 gtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  29737 gttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  134 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  233 cggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6882 - 6831
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6882 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 242
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8177
Alignment:
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225482
Alignment:
Q  78 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatgtgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcat 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  178 gctgtttt 185  Q
    ||||||||    
T  225489 gctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatg--ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 237  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 256
Target Start/End: Original strand, 10567 - 10639
Alignment:
Q  184 tttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  10567 tttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25176 - 25124
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 242  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Original strand, 206576 - 206624
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206576 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 569
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10545
Alignment:
Q  141 agatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 239  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  240 agt 242  Q
    |||    
T  10547 agt 10545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  207 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44161 - 44104
Alignment:
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44161 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 117
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1205
Alignment:
Q  81 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcatta 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6386
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193070
Alignment:
Q  131 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattactatgtcatgctgtttttgtaaa-ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 229  Q
    |||||| || |||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  230 agtc 233  Q
    ||||    
T  193067 agtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1853
Alignment:
Q  176 atgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1910 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  171 atgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgatgaagatgatg 256  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  197 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University