View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_40 (Length: 248)

Name: NF0157_low_40
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_40
NF0157_low_40
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (5-228)||(23083259-23083482)
chr3 (1-228)||(13442274-13442501)
chr3 (1-228)||(26686887-26687114)
chr3 (1-228)||(17487856-17488083)
chr3 (9-228)||(43840932-43841151)
chr3 (1-224)||(14576727-14576949)
chr3 (1-228)||(17499338-17499565)
chr3 (13-225)||(24153115-24153326)
chr3 (1-228)||(14972854-14973081)
chr3 (1-228)||(20698330-20698556)
chr3 (1-228)||(18438534-18438761)
chr3 (1-228)||(25476279-25476506)
chr3 (2-228)||(12399209-12399435)
chr3 (1-215)||(14572602-14572815)
chr3 (7-210)||(42386428-42386632)
chr3 (1-225)||(40213615-40213838)
chr3 (1-228)||(11424657-11424880)
chr3 (1-213)||(30029855-30030066)
chr3 (62-225)||(16454281-16454443)
chr3 (62-225)||(29172583-29172745)
chr3 (62-225)||(9707607-9707769)
chr3 (62-225)||(17463178-17463340)
chr3 (62-225)||(34159326-34159488)
chr3 (62-225)||(45606907-45607069)
chr3 (62-225)||(55476491-55476653)
chr3 (74-226)||(46822267-46822419)
chr3 (62-225)||(7781347-7781509)
chr3 (62-225)||(8899094-8899256)
chr3 (62-225)||(17672626-17672788)
chr3 (62-225)||(28848611-28848773)
chr3 (62-225)||(38961891-38962053)
chr3 (62-225)||(13151790-13151953)
chr3 (62-225)||(13154255-13154418)
chr3 (62-226)||(13544024-13544187)
chr3 (62-225)||(6469134-6469296)
chr3 (62-225)||(10247723-10247885)
chr3 (62-221)||(12567564-12567722)
chr3 (62-223)||(16282811-16282971)
chr3 (74-226)||(12511059-12511211)
chr3 (62-225)||(17446655-17446816)
chr3 (82-225)||(36166598-36166739)
chr3 (62-223)||(41123892-41124049)
chr3 (62-225)||(50242822-50242984)
chr3 (62-228)||(43550478-43550644)
chr3 (111-225)||(55500942-55501055)
chr3 (62-209)||(53070653-53070799)
chr3 (99-225)||(15977515-15977640)
chr3 (117-225)||(12119780-12119887)
chr3 (117-225)||(15412429-15412536)
chr3 (82-214)||(21618460-21618590)
chr3 (13-228)||(24340628-24340844)
chr3 (117-225)||(8499518-8499625)
chr3 (113-228)||(13210333-13210448)
chr3 (109-225)||(10556985-10557101)
chr3 (46-210)||(23274705-23274869)
chr3 (128-225)||(44494809-44494905)
chr3 (46-209)||(52523666-52523831)
chr3 (84-225)||(53301527-53301669)
chr3 (12-90)||(14179570-14179648)
chr3 (62-225)||(27165250-27165413)
chr3 (128-225)||(17737236-17737335)
chr3 (13-228)||(37642170-37642386)
chr3 (105-228)||(14234487-14234610)
chr3 (109-224)||(15470928-15471043)
chr3 (102-224)||(16103784-16103905)
chr3 (57-224)||(856140-856304)
chr3 (152-224)||(12174303-12174376)
chr3 (1-90)||(16796685-16796774)
chr3 (109-221)||(32307684-32307795)
chr3 (102-224)||(16097332-16097454)
chr3 (79-201)||(11298500-11298621)
chr3 (139-224)||(15878083-15878168)
chr3 (152-224)||(49668120-49668193)
chr3 (79-227)||(14665398-14665545)
chr3 (79-227)||(14668554-14668701)
chr3 (175-225)||(28194693-28194743)
chr3 (175-225)||(45577950-45578000)
chr3 (152-224)||(9512924-9512997)
chr3 (152-224)||(9520899-9520972)
chr3 (53-201)||(19725857-19726004)
chr3 (139-224)||(23408428-23408513)
chr3 (46-146)||(2051138-2051238)
chr3 (53-201)||(11862816-11862964)
chr3 (160-201)||(14878569-14878610)
chr3 (139-224)||(17525190-17525275)
chr3 (56-228)||(22147474-22147646)
chr3 (160-224)||(23077530-23077594)
chr3 (109-209)||(37251168-37251270)
chr3 (109-209)||(43925977-43926079)
chr3 (159-201)||(15051531-15051573)
chr3 (159-201)||(15060307-15060349)
chr3 (152-221)||(1644718-1644787)
chr3 (165-201)||(2897873-2897909)
chr3 (165-201)||(3403014-3403050)
chr3 (165-201)||(12172819-12172855)
chr3 (165-201)||(18383973-18384009)
chr3 (109-209)||(22110352-22110454)
chr3 (79-201)||(12496280-12496402)
chr3 (165-216)||(15482668-15482719)
chr3 (165-200)||(15617398-15617433)
chr3 (165-200)||(30065970-30066005)
chr3 (171-201)||(322615-322645)
chr3 (105-209)||(12377940-12378046)
chr3 (165-219)||(15850132-15850186)
chr3 (159-201)||(16369423-16369465)
chr3 (158-207)||(13919350-13919399)
chr3 (160-201)||(23053140-23053181)
chr3 (165-201)||(327215-327251)
chr3 (165-201)||(1982868-1982904)
chr3 (165-201)||(3389994-3390030)
chr3 (165-201)||(7793400-7793436)
chr3 (165-201)||(20461550-20461586)
chr3 (176-224)||(26196500-26196548)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (4-228)||(23076442-23076666)
chr2 (1-228)||(23060513-23060739)
chr2 (1-228)||(22731128-22731355)
chr2 (1-228)||(22738074-22738300)
chr2 (1-228)||(23285865-23286088)
chr2 (1-228)||(22337115-22337342)
chr2 (5-228)||(23660023-23660245)
chr2 (1-228)||(23654280-23654507)
chr2 (1-225)||(298708-298933)
chr2 (7-228)||(38016-38235)
chr2 (62-225)||(22105412-22105575)
chr2 (7-228)||(20309108-20309326)
chr2 (62-222)||(21155060-21155219)
chr2 (62-225)||(18808943-18809105)
chr2 (62-225)||(23130862-23131024)
chr2 (62-225)||(23133329-23133491)
chr2 (62-225)||(23709532-23709694)
chr2 (62-225)||(23712013-23712175)
chr2 (62-225)||(26505379-26505541)
chr2 (62-225)||(26507857-26508019)
chr2 (62-225)||(34402522-34402684)
chr2 (62-225)||(39682313-39682475)
chr2 (62-227)||(32214921-32215085)
chr2 (62-225)||(571397-571559)
chr2 (62-225)||(6725995-6726157)
chr2 (62-225)||(23135590-23135752)
chr2 (62-225)||(24367774-24367936)
chr2 (74-221)||(25616192-25616339)
chr2 (7-228)||(23708518-23708738)
chr2 (62-225)||(24898195-24898358)
chr2 (62-225)||(24900678-24900841)
chr2 (62-225)||(24903155-24903318)
chr2 (62-225)||(24905632-24905795)
chr2 (62-225)||(24908107-24908270)
chr2 (62-225)||(32039498-32039660)
chr2 (62-225)||(28577099-28577261)
chr2 (62-223)||(43137301-43137461)
chr2 (62-225)||(45029854-45030016)
chr2 (52-201)||(22799071-22799220)
chr2 (62-225)||(24529528-24529691)
chr2 (59-228)||(23103348-23103516)
chr2 (102-223)||(28405981-28406103)
chr2 (151-228)||(8946657-8946734)
chr2 (52-224)||(23019651-23019823)
chr2 (62-225)||(38967374-38967537)
chr2 (56-228)||(19671830-19672001)
chr2 (1-73)||(27753730-27753802)
chr2 (165-228)||(23040247-23040310)
chr2 (56-209)||(32451878-32452031)
chr2 (102-224)||(25175854-25175976)
chr2 (61-209)||(7687-7835)
chr2 (105-224)||(7679589-7679707)
chr2 (146-222)||(24643034-24643109)
chr2 (152-227)||(22134251-22134326)
chr2 (130-228)||(23071972-23072070)
chr2 (79-201)||(25963688-25963809)
chr2 (52-224)||(22740905-22741081)
chr2 (152-213)||(18786947-18787009)
chr2 (62-139)||(24642856-24642933)
chr2 (139-207)||(23038048-23038116)
chr2 (109-209)||(23207296-23207398)
chr2 (160-224)||(40622263-40622327)
chr2 (7-209)||(20520092-20520295)
chr2 (79-201)||(21916071-21916192)
chr2 (139-224)||(22758751-22758836)
chr2 (158-207)||(23287384-23287433)
chr2 (165-201)||(22811969-22812005)
chr2 (159-207)||(26392403-26392451)
chr2 (165-200)||(10101695-10101730)
chr2 (151-209)||(22413181-22413240)
chr2 (165-200)||(27379483-27379518)
chr2 (165-200)||(27383529-27383564)
chr2 (165-201)||(24655396-24655432)
chr2 (165-201)||(24735423-24735459)
chr2 (165-201)||(24869903-24869939)
chr2 (165-201)||(25961592-25961628)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-228)||(51913-52140)
scaffold0011 (1-228)||(167873-168099)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (1-228)||(18818303-18818530)
chr8 (1-228)||(20536208-20536435)
chr8 (1-228)||(21923822-21924049)
chr8 (1-228)||(23406379-23406608)
chr8 (1-228)||(7372778-7372997)
chr8 (1-227)||(28648938-28649164)
chr8 (1-228)||(22626736-22626962)
chr8 (2-227)||(23648554-23648779)
chr8 (1-228)||(21918894-21919121)
chr8 (1-228)||(18879131-18879352)
chr8 (1-228)||(16092235-16092463)
chr8 (1-231)||(6759255-6759483)
chr8 (2-228)||(22875065-22875291)
chr8 (7-228)||(31971257-31971476)
chr8 (1-228)||(45130892-45131117)
chr8 (62-225)||(14409444-14409606)
chr8 (7-228)||(16199546-16199765)
chr8 (74-226)||(18678069-18678221)
chr8 (62-225)||(1484402-1484564)
chr8 (62-225)||(5853292-5853454)
chr8 (62-221)||(16413316-16413474)
chr8 (62-225)||(20403227-20403389)
chr8 (62-225)||(22001753-22001915)
chr8 (74-226)||(32121734-32121886)
chr8 (62-225)||(41598188-41598350)
chr8 (62-225)||(4483281-4483442)
chr8 (62-225)||(4542373-4542535)
chr8 (62-225)||(15203231-15203393)
chr8 (62-225)||(20046195-20046357)
chr8 (12-228)||(21395888-21396101)
chr8 (12-228)||(21790381-21790594)
chr8 (62-225)||(19896265-19896430)
chr8 (7-228)||(21389353-21389571)
chr8 (62-225)||(14823774-14823935)
chr8 (82-225)||(26219717-26219858)
chr8 (25-228)||(21778697-21778897)
chr8 (44-201)||(23776772-23776929)
chr8 (62-227)||(26223917-26224081)
chr8 (62-221)||(45290694-45290853)
chr8 (62-209)||(19801382-19801527)
chr8 (82-225)||(26225268-26225409)
chr8 (117-231)||(19937061-19937174)
chr8 (62-225)||(25484275-25484430)
chr8 (46-221)||(13508024-13508199)
chr8 (117-212)||(15070571-15070665)
chr8 (102-228)||(38855246-38855372)
chr8 (105-228)||(6520368-6520491)
chr8 (46-221)||(13597556-13597731)
chr8 (46-209)||(20498581-20498744)
chr8 (56-228)||(17612059-17612231)
chr8 (130-228)||(17140916-17141014)
chr8 (131-228)||(21490995-21491092)
chr8 (1-90)||(25363034-25363123)
chr8 (113-228)||(5866280-5866395)
chr8 (109-224)||(21285601-21285716)
chr8 (52-201)||(20465983-20466132)
chr8 (110-213)||(983407-983512)
chr8 (157-228)||(21249384-21249457)
chr8 (157-228)||(21255222-21255295)
chr8 (157-224)||(23760893-23760961)
chr8 (102-216)||(21673716-21673830)
chr8 (79-201)||(16410226-16410347)
chr8 (79-201)||(30643264-30643385)
chr8 (139-224)||(17353975-17354060)
chr8 (152-224)||(26355742-26355815)
chr8 (79-201)||(17926678-17926799)
chr8 (109-209)||(37116366-37116468)
chr8 (25-209)||(17439423-17439609)
chr8 (109-209)||(24353039-24353140)
chr8 (139-198)||(19983119-19983178)
chr8 (165-216)||(21383659-21383710)
chr8 (160-201)||(21162111-21162152)
chr8 (160-201)||(21168784-21168825)
chr8 (165-201)||(16231524-16231560)
chr8 (160-224)||(24755714-24755778)
chr8 (13-64)||(26222987-26223039)
chr8 (165-201)||(39094982-39095018)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (1-228)||(25421532-25421759)
chr5 (1-228)||(25431395-25431621)
chr5 (1-228)||(23390390-23390617)
chr5 (1-228)||(24493569-24493795)
chr5 (1-228)||(8286736-8286964)
chr5 (1-228)||(13025311-13025537)
chr5 (1-228)||(13095495-13095721)
chr5 (1-228)||(9077952-9078179)
chr5 (1-225)||(24529223-24529447)
chr5 (1-228)||(22075018-22075246)
chr5 (1-228)||(1096467-1096694)
chr5 (61-228)||(21808343-21808510)
chr5 (61-228)||(21729018-21729185)
chr5 (13-214)||(18418594-18418793)
chr5 (13-225)||(22412187-22412388)
chr5 (1-228)||(21292864-21293090)
chr5 (62-225)||(42245365-42245527)
chr5 (62-225)||(264768-264930)
chr5 (62-225)||(20909012-20909174)
chr5 (62-225)||(39363384-39363546)
chr5 (63-225)||(10732941-10733102)
chr5 (120-228)||(21997547-21997655)
chr5 (62-225)||(29329934-29330096)
chr5 (62-225)||(36154783-36154942)
chr5 (62-225)||(2154613-2154776)
chr5 (74-226)||(17517168-17517320)
chr5 (62-225)||(29345980-29346142)
chr5 (62-225)||(32027393-32027555)
chr5 (62-225)||(11581199-11581361)
chr5 (62-225)||(29348453-29348615)
chr5 (62-225)||(29350926-29351088)
chr5 (62-225)||(39245136-39245298)
chr5 (62-225)||(20902008-20902172)
chr5 (62-222)||(18319033-18319193)
chr5 (117-225)||(31061068-31061175)
chr5 (62-225)||(10775675-10775838)
chr5 (117-225)||(38619434-38619541)
chr5 (62-225)||(20917952-20918110)
chr5 (61-209)||(22144068-22144216)
chr5 (52-201)||(21873277-21873423)
chr5 (117-224)||(23064512-23064618)
chr5 (53-179)||(18356364-18356488)
chr5 (102-224)||(21565546-21565668)
chr5 (62-222)||(24067110-24067270)
chr5 (52-221)||(37723910-37724078)
chr5 (152-228)||(19660879-19660956)
chr5 (152-228)||(21329541-21329618)
chr5 (53-179)||(20910745-20910869)
chr5 (105-228)||(21502154-21502277)
chr5 (4-124)||(21986044-21986164)
chr5 (110-209)||(20026942-20027043)
chr5 (1-91)||(22107267-22107357)
chr5 (152-224)||(22959576-22959649)
chr5 (139-224)||(26704075-26704160)
chr5 (139-224)||(26973808-26973893)
chr5 (82-162)||(20766095-20766174)
chr5 (130-228)||(36314577-36314675)
chr5 (52-224)||(22032323-22032490)
chr5 (13-228)||(40725853-40726069)
chr5 (52-224)||(18769949-18770118)
chr5 (109-228)||(26012037-26012154)
chr5 (154-224)||(23501402-23501472)
chr5 (52-224)||(23572084-23572253)
chr5 (175-228)||(19668898-19668951)
chr5 (160-201)||(20805575-20805616)
chr5 (139-224)||(23201360-23201445)
chr5 (161-201)||(20766997-20767037)
chr5 (109-209)||(22178221-22178323)
chr5 (165-216)||(23535637-23535688)
chr5 (175-225)||(20806854-20806904)
chr5 (139-224)||(14079149-14079234)
chr5 (159-212)||(26732884-26732937)
chr5 (165-201)||(21366722-21366758)
chr5 (79-227)||(24767518-24767665)
chr5 (165-216)||(18355963-18356014)
chr5 (159-209)||(26740697-26740747)
chr5 (160-201)||(23512121-23512162)
chr5 (109-179)||(29448052-29448123)
chr5 (165-201)||(17410460-17410496)
chr5 (13-64)||(20766035-20766087)
chr5 (165-201)||(26680605-26680641)
chr5 (165-201)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-228)||(38761-38987)
scaffold0145 (11-228)||(32942-33158)
scaffold0145 (62-230)||(9744-9912)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (1-228)||(12698831-12699059)
chr7 (1-228)||(9509189-9509416)
chr7 (13-225)||(18456319-18456530)
chr7 (1-228)||(38227481-38227707)
chr7 (1-225)||(3564258-3564482)
chr7 (1-228)||(26211995-26212223)
chr7 (1-228)||(10589039-10589265)
chr7 (1-228)||(16386141-16386369)
chr7 (62-228)||(13647325-13647491)
chr7 (7-226)||(40443393-40443610)
chr7 (56-225)||(16213684-16213852)
chr7 (62-225)||(456321-456483)
chr7 (62-225)||(11972496-11972658)
chr7 (62-225)||(14949122-14949284)
chr7 (62-225)||(15376713-15376875)
chr7 (62-225)||(16232520-16232682)
chr7 (62-225)||(18640272-18640434)
chr7 (62-225)||(20385123-20385285)
chr7 (62-225)||(21189595-21189757)
chr7 (62-225)||(32125491-32125653)
chr7 (62-225)||(41522917-41523079)
chr7 (62-225)||(41525379-41525541)
chr7 (62-224)||(11393287-11393448)
chr7 (59-224)||(14932685-14932851)
chr7 (59-224)||(15356120-15356286)
chr7 (59-224)||(15360234-15360400)
chr7 (62-228)||(18430709-18430874)
chr7 (13-225)||(48273392-48273594)
chr7 (62-225)||(24702238-24702400)
chr7 (62-225)||(27216860-27217022)
chr7 (79-221)||(24275175-24275316)
chr7 (1-213)||(15143931-15144143)
chr7 (64-225)||(16410059-16410219)
chr7 (62-225)||(44116509-44116671)
chr7 (62-225)||(3386333-3386495)
chr7 (22-228)||(2280033-2280238)
chr7 (62-225)||(24704688-24704847)
chr7 (117-225)||(13869346-13869453)
chr7 (62-225)||(17061915-17062077)
chr7 (13-228)||(27847739-27847951)
chr7 (62-225)||(20110556-20110708)
chr7 (62-221)||(38898376-38898535)
chr7 (99-225)||(13831373-13831498)
chr7 (109-228)||(67745-67864)
chr7 (109-228)||(22072913-22073033)
chr7 (105-224)||(811129-811248)
chr7 (62-162)||(26355983-26356083)
chr7 (62-162)||(26358435-26358535)
chr7 (113-228)||(34200786-34200901)
chr7 (62-209)||(12756671-12756817)
chr7 (51-201)||(15211484-15211634)
chr7 (130-228)||(28505321-28505419)
chr7 (102-224)||(18005650-18005772)
chr7 (139-222)||(18154873-18154956)
chr7 (13-228)||(19486649-19486865)
chr7 (113-228)||(15754893-15755008)
chr7 (105-224)||(16219715-16219834)
chr7 (113-228)||(16495402-16495517)
chr7 (105-228)||(47831807-47831930)
chr7 (99-228)||(10063810-10063939)
chr7 (131-228)||(11996051-11996148)
chr7 (52-224)||(17138008-17138177)
chr7 (115-224)||(44014182-44014291)
chr7 (7-213)||(1867895-1868101)
chr7 (98-179)||(2530129-2530208)
chr7 (52-224)||(12187019-12187188)
chr7 (52-201)||(12321686-12321835)
chr7 (109-213)||(16056343-16056446)
chr7 (139-224)||(19649521-19649606)
chr7 (165-227)||(2832499-2832561)
chr7 (7-205)||(15008398-15008597)
chr7 (46-206)||(12255730-12255892)
chr7 (139-224)||(9703263-9703348)
chr7 (165-201)||(9751812-9751848)
chr7 (158-213)||(14044761-14044817)
chr7 (158-213)||(14354791-14354847)
chr7 (160-224)||(32216601-32216665)
chr7 (165-201)||(39267957-39267993)
chr7 (151-213)||(12901338-12901401)
chr7 (165-216)||(13635519-13635570)
chr7 (165-200)||(26292416-26292451)
chr7 (165-200)||(39722287-39722322)
chr7 (171-201)||(14429906-14429936)
chr7 (165-201)||(9446216-9446252)
chr7 (165-201)||(9593366-9593402)
chr7 (165-201)||(11312668-11312704)
chr7 (165-201)||(11987232-11987268)
chr7 (165-201)||(12318147-12318183)
chr7 (165-201)||(15580711-15580747)
chr7 (165-201)||(20569654-20569690)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-228)||(13211-13438)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-228)||(8427-8650)
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (1-228)||(7893703-7893927)
chr4 (1-228)||(16239864-16240090)
chr4 (11-228)||(16270140-16270356)
chr4 (1-228)||(44052829-44053056)
chr4 (1-228)||(12902757-12902984)
chr4 (44-228)||(7798774-7798958)
chr4 (9-226)||(22636437-22636653)
chr4 (1-228)||(7088877-7089104)
chr4 (1-223)||(14038653-14038875)
chr4 (1-225)||(16377417-16377639)
chr4 (56-228)||(6899891-6900062)
chr4 (1-221)||(23374253-23374473)
chr4 (103-228)||(52873363-52873488)
chr4 (62-225)||(18215274-18215436)
chr4 (62-225)||(44928879-44929042)
chr4 (13-225)||(54798669-54798872)
chr4 (62-225)||(12307-12469)
chr4 (62-225)||(15118352-15118514)
chr4 (62-225)||(52312510-52312672)
chr4 (56-225)||(1837503-1837671)
chr4 (62-231)||(19242693-19242861)
chr4 (62-227)||(19618172-19618336)
chr4 (7-228)||(14053202-14053422)
chr4 (62-225)||(3515007-3515169)
chr4 (62-225)||(23803265-23803427)
chr4 (62-225)||(44615288-44615450)
chr4 (62-225)||(44773087-44773249)
chr4 (62-225)||(50222339-50222501)
chr4 (13-225)||(14280316-14280518)
chr4 (62-225)||(18239419-18239581)
chr4 (62-225)||(51463868-51464030)
chr4 (62-225)||(44102214-44102376)
chr4 (62-221)||(15355324-15355483)
chr4 (62-227)||(14970707-14970871)
chr4 (12-228)||(17046487-17046700)
chr4 (142-228)||(3096293-3096379)
chr4 (62-225)||(12610950-12611105)
chr4 (62-228)||(15367690-15367856)
chr4 (62-228)||(15402703-15402869)
chr4 (62-225)||(7641192-7641344)
chr4 (64-209)||(21815587-21815731)
chr4 (13-213)||(52243099-52243302)
chr4 (46-209)||(13790-13953)
chr4 (82-225)||(8574844-8574985)
chr4 (117-228)||(15370018-15370128)
chr4 (117-228)||(15371202-15371312)
chr4 (117-228)||(15373483-15373593)
chr4 (52-201)||(15093798-15093947)
chr4 (62-222)||(20149832-20149992)
chr4 (62-226)||(22353835-22353999)
chr4 (117-228)||(16223532-16223642)
chr4 (1-113)||(3096759-3096870)
chr4 (46-213)||(43198492-43198661)
chr4 (157-228)||(15551817-15551889)
chr4 (105-228)||(39706286-39706409)
chr4 (53-179)||(43256106-43256230)
chr4 (57-209)||(6190481-6190633)
chr4 (152-224)||(12774011-12774084)
chr4 (14-90)||(17047979-17048055)
chr4 (110-213)||(12288211-12288316)
chr4 (79-201)||(16356924-16357045)
chr4 (53-201)||(16488023-16488171)
chr4 (52-224)||(15121748-15121917)
chr4 (79-201)||(16348636-16348757)
chr4 (152-224)||(8846360-8846433)
chr4 (79-201)||(13812991-13813112)
chr4 (165-227)||(20157517-20157579)
chr4 (139-224)||(13569502-13569587)
chr4 (64-153)||(15464888-15464977)
chr4 (164-224)||(23843478-23843538)
chr4 (165-200)||(9556551-9556586)
chr4 (165-200)||(17810293-17810328)
chr4 (165-201)||(1951810-1951846)
chr4 (165-201)||(11250619-11250655)
chr4 (160-224)||(12570014-12570078)
chr4 (165-201)||(15353365-15353401)
chr4 (165-201)||(18222427-18222463)
chr4 (165-201)||(36134012-36134048)
chr4 (109-209)||(46640456-46640558)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-228)||(1851-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-225)||(22886-23109)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-228)||(3470-3697)
scaffold0292 (1-228)||(343-569)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (1-228)||(22532269-22532496)
chr1 (1-228)||(27250623-27250850)
chr1 (1-227)||(50210107-50210333)
chr1 (1-225)||(34509783-34510007)
chr1 (14-227)||(22468604-22468816)
chr1 (1-228)||(21026680-21026907)
chr1 (2-227)||(20135188-20135413)
chr1 (1-151)||(22354466-22354616)
chr1 (62-225)||(13988866-13989028)
chr1 (62-225)||(21923291-21923453)
chr1 (62-225)||(23593735-23593897)
chr1 (62-228)||(45574842-45575008)
chr1 (62-225)||(21475087-21475249)
chr1 (62-225)||(31612313-31612475)
chr1 (62-225)||(433012-433172)
chr1 (62-225)||(16275363-16275526)
chr1 (62-226)||(21840766-21840929)
chr1 (62-225)||(29298137-29298298)
chr1 (62-225)||(29776688-29776850)
chr1 (1-116)||(22356068-22356184)
chr1 (1-116)||(22357754-22357870)
chr1 (62-227)||(16361915-16362079)
chr1 (44-201)||(21787979-21788136)
chr1 (128-228)||(20847175-20847275)
chr1 (62-228)||(13212861-13213027)
chr1 (62-231)||(15860008-15860177)
chr1 (13-228)||(38801297-38801508)
chr1 (62-225)||(21346961-21347124)
chr1 (46-209)||(21896195-21896358)
chr1 (62-225)||(22123067-22123230)
chr1 (62-225)||(21707167-21707329)
chr1 (62-225)||(21711709-21711871)
chr1 (117-231)||(21342090-21342203)
chr1 (62-222)||(40389157-40389317)
chr1 (7-213)||(16758664-16758872)
chr1 (47-209)||(21861510-21861672)
chr1 (12-90)||(48603652-48603730)
chr1 (102-224)||(33681011-33681133)
chr1 (139-224)||(21714546-21714631)
chr1 (53-179)||(33797570-33797694)
chr1 (160-227)||(20454606-20454673)
chr1 (102-224)||(22921864-22921986)
chr1 (109-221)||(21754052-21754163)
chr1 (113-224)||(20248283-20248394)
chr1 (113-228)||(14295557-14295672)
chr1 (102-224)||(22237631-22237753)
chr1 (115-209)||(35261086-35261180)
chr1 (79-201)||(18182093-18182214)
chr1 (139-224)||(42865245-42865330)
chr1 (113-212)||(20918620-20918719)
chr1 (165-227)||(24783150-24783212)
chr1 (109-209)||(50614117-50614219)
chr1 (109-209)||(50621945-50622047)
chr1 (151-209)||(16093928-16093987)
chr1 (109-209)||(41050036-41050138)
chr1 (175-213)||(52928038-52928076)
chr1 (175-224)||(21161720-21161769)
chr1 (165-201)||(3472980-3473016)
chr1 (164-224)||(20091533-20091593)
chr1 (165-200)||(1010744-1010779)
chr1 (165-216)||(36819359-36819410)
chr1 (109-209)||(16368287-16368388)
chr1 (160-201)||(21022654-21022695)
chr1 (165-201)||(19211888-19211924)
chr1 (165-201)||(20138104-20138140)
chr1 (165-201)||(21313148-21313184)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (1-228)||(17287690-17287917)
chr6 (1-228)||(22780121-22780348)
chr6 (1-228)||(20360854-20361081)
chr6 (1-228)||(29060540-29060767)
chr6 (1-228)||(20638177-20638404)
chr6 (1-228)||(19303435-19303661)
chr6 (1-228)||(25629249-25629476)
chr6 (1-227)||(18409721-18409947)
chr6 (1-228)||(20593773-20594000)
chr6 (61-228)||(16496244-16496411)
chr6 (61-228)||(20076700-20076863)
chr6 (62-227)||(34963371-34963535)
chr6 (62-225)||(12742317-12742479)
chr6 (62-225)||(18334592-18334754)
chr6 (62-225)||(19005046-19005208)
chr6 (62-225)||(19858919-19859081)
chr6 (62-225)||(22782227-22782389)
chr6 (62-225)||(24422547-24422709)
chr6 (62-225)||(33861794-33861956)
chr6 (62-225)||(33864278-33864440)
chr6 (62-227)||(30676710-30676874)
chr6 (62-225)||(2291180-2291342)
chr6 (62-225)||(8055029-8055191)
chr6 (62-225)||(25754809-25754971)
chr6 (62-225)||(26924640-26924802)
chr6 (62-225)||(25656629-25656791)
chr6 (62-225)||(1540911-1541073)
chr6 (62-225)||(1595549-1595711)
chr6 (2-201)||(15041446-15041644)
chr6 (82-225)||(25688502-25688644)
chr6 (62-225)||(3852017-3852179)
chr6 (62-209)||(18456735-18456881)
chr6 (74-226)||(23992429-23992578)
chr6 (53-228)||(35245586-35245758)
chr6 (62-222)||(16448526-16448686)
chr6 (62-226)||(19847949-19848114)
chr6 (62-225)||(20556894-20557054)
chr6 (46-213)||(25644335-25644503)
chr6 (79-209)||(18461895-18462024)
chr6 (7-228)||(16920533-16920751)
chr6 (1-201)||(25603279-25603478)
chr6 (56-209)||(18821795-18821946)
chr6 (46-228)||(20109140-20109322)
chr6 (21-201)||(25611637-25611816)
chr6 (7-228)||(22831503-22831723)
chr6 (113-228)||(28496477-28496592)
chr6 (113-228)||(29808888-29809003)
chr6 (13-228)||(8227416-8227632)
chr6 (152-228)||(27333262-27333339)
chr6 (152-228)||(27394002-27394079)
chr6 (79-201)||(21766718-21766839)
chr6 (139-224)||(19873120-19873205)
chr6 (139-224)||(22432249-22432334)
chr6 (139-224)||(22438799-22438884)
chr6 (167-228)||(25714417-25714478)
chr6 (113-228)||(1561303-1561418)
chr6 (53-179)||(27415887-27416011)
chr6 (139-224)||(19862978-19863063)
chr6 (109-228)||(23019408-23019525)
chr6 (109-224)||(19652199-19652313)
chr6 (55-201)||(18907134-18907280)
chr6 (151-213)||(9098557-9098620)
chr6 (110-213)||(19668386-19668491)
chr6 (52-224)||(25642128-25642304)
chr6 (151-207)||(33443068-33443124)
chr6 (181-228)||(22080799-22080846)
chr6 (175-224)||(31155465-31155514)
chr6 (157-216)||(4185870-4185930)
chr6 (20-209)||(11185524-11185710)
chr6 (165-201)||(16523441-16523477)
chr6 (164-224)||(22334954-22335014)
chr6 (165-200)||(18917316-18917351)
chr6 (165-201)||(12706710-12706746)
chr6 (160-224)||(15894491-15894555)
chr6 (165-201)||(17804217-17804253)
chr6 (165-201)||(19790837-19790873)
chr6 (165-201)||(25767218-25767254)
chr6 (165-201)||(27325668-27325704)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-228)||(39913-40139)
scaffold0080 (52-201)||(18600-18749)
scaffold0080 (109-209)||(19885-19987)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-228)||(8479-8702)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-228)||(6015-6245)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-228)||(3045-3271)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-228)||(25896-26122)
scaffold0026 (1-228)||(39858-40084)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-226)||(39479-39703)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-226)||(75109-75333)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (1-228)||(4508-4734)
scaffold0228 (1-228)||(12090-12316)
scaffold0228 (1-228)||(22042-22268)
scaffold0228 (165-216)||(18682-18733)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-210)||(24203-24406)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (1-227)||(17109-17337)
scaffold0056 (62-209)||(79284-79430)
scaffold0056 (160-224)||(14139-14203)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-173)||(13147-13319)
scaffold0175 (153-228)||(34123-34199)
scaffold0175 (175-228)||(273-326)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-221)||(25959-26179)
scaffold0122 (82-225)||(44682-44825)
scaffold0122 (1-91)||(33389-33479)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-228)||(943-1169)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-228)||(16494-16721)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (18-228)||(4849-5059)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (24-227)||(3103-3306)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (11-228)||(32863-33077)
scaffold0120 (11-228)||(45928-46142)
scaffold0120 (17-228)||(16113-16323)
scaffold0120 (167-228)||(17389-17450)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-228)||(20910-21138)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-225)||(339844-340065)
scaffold0003 (62-225)||(158450-158612)
scaffold0003 (53-179)||(71350-71474)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-228)||(32067-32285)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (7-228)||(4712-4932)
scaffold0358 (7-163)||(1-156)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (12-228)||(15370-15584)
scaffold0114 (52-224)||(7295-7464)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-228)||(1952-2179)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-228)||(13497-13716)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (2-165)||(3424-3588)
scaffold0327 (165-224)||(289-348)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (12-228)||(10331-10544)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (61-228)||(128751-128917)
scaffold0031 (62-209)||(20379-20524)
scaffold0031 (139-224)||(65830-65915)
scaffold0031 (165-201)||(53585-53621)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (98-228)||(28414-28544)
scaffold0046 (113-228)||(11292-11407)
scaffold0046 (113-228)||(1997-2112)
scaffold0046 (175-228)||(4552-4605)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (62-221)||(17440-17598)
scaffold0023 (62-225)||(94411-94573)
scaffold0023 (65-225)||(44454-44614)
scaffold0023 (52-224)||(38424-38596)
scaffold0023 (101-224)||(100378-100501)
scaffold0023 (157-228)||(119875-119947)
scaffold0023 (102-224)||(40169-40291)
scaffold0023 (52-136)||(23611-23695)
scaffold0023 (152-224)||(101503-101576)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-147)||(27911-28057)
scaffold0130 (192-227)||(27878-27913)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-138)||(124675-124812)
scaffold0021 (52-227)||(174767-174941)
scaffold0021 (159-228)||(121766-121835)
scaffold0021 (110-209)||(136370-136471)
scaffold0021 (110-209)||(145078-145179)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (62-225)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (62-225)||(37821-37983)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (9-207)||(4545-4742)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (62-227)||(11286-11450)
scaffold0029 (52-224)||(12763-12932)
scaffold0029 (165-200)||(61662-61697)
scaffold0029 (165-200)||(65578-65613)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (62-225)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (62-225)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (62-225)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (62-225)||(136680-136842)
scaffold0028 (62-225)||(139149-139311)
scaffold0028 (62-225)||(144087-144249)
scaffold0028 (62-225)||(134211-134373)
scaffold0028 (62-225)||(141618-141780)
scaffold0028 (102-226)||(62200-62321)
scaffold0028 (142-224)||(132662-132745)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-169)||(857-1021)
scaffold0395 (162-228)||(4888-4954)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-228)||(952-1170)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (62-226)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (62-225)||(16784-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (62-225)||(82072-82234)
scaffold0037 (102-213)||(22665-22776)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (62-221)||(501088-501246)
scaffold0001 (62-225)||(85579-85742)
scaffold0001 (102-224)||(160688-160809)
scaffold0001 (165-216)||(173297-173348)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-228)||(16282-16506)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (62-222)||(4300-4459)
scaffold0761 (79-201)||(6281-6402)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (62-225)||(40400-40562)
scaffold0044 (172-216)||(12909-12953)
scaffold0044 (172-216)||(19193-19237)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (63-224)||(29558-29720)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (62-227)||(12249-12413)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-228)||(46995-47202)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (62-225)||(4214-4377)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (62-226)||(9241-9404)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-169)||(6669-6837)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (62-225)||(106-268)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-228)||(1289-1507)
scaffold0106 (7-228)||(7266-7484)
scaffold0106 (160-225)||(15291-15356)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (82-225)||(116430-116571)
scaffold0022 (109-209)||(128971-129072)
scaffold0022 (165-201)||(73824-73860)
scaffold0022 (109-221)||(78328-78442)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (106-228)||(11442-11564)
scaffold0235 (1-44)||(11407-11450)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (62-211)||(29946-30094)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (62-225)||(12064-12220)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (46-213)||(8481-8650)
scaffold0621 (102-228)||(6535-6661)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (12-228)||(51582-51795)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (22-225)||(161049-161252)
scaffold0007 (62-145)||(164590-164674)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (52-201)||(16294-16442)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (59-201)||(29117-29262)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (13-228)||(17932-18148)
scaffold0247 (117-225)||(2184-2291)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (62-222)||(1280-1440)
scaffold0101 (139-224)||(8995-9080)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (52-224)||(4749-4921)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (22-209)||(13147-13336)
scaffold0357 (22-213)||(16014-16206)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (22-213)||(27663-27855)
scaffold0165 (1-69)||(3640-3708)
scaffold0165 (1-69)||(7704-7772)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-225)||(5036-5246)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (62-225)||(38657-38820)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (46-228)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (46-228)||(38195-38377)
scaffold0124 (165-201)||(42650-42686)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (102-224)||(19268-19390)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (46-207)||(7998-8161)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (53-171)||(15362-15478)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (46-209)||(53488-53651)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (102-224)||(2801-2923)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (52-224)||(23843-24018)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (56-209)||(51833-51985)
scaffold0034 (109-228)||(32538-32654)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (7-209)||(60614-60818)
scaffold0010 (102-216)||(129917-130031)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (102-224)||(14692-14814)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-90)||(1052-1141)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (113-225)||(15664-15776)
scaffold0261 (139-224)||(1339-1424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (105-228)||(6121-6244)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (102-216)||(5655-5769)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-68)||(10323-10390)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (57-224)||(1881-2045)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (152-228)||(6611-6688)
scaffold0333 (152-228)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (152-228)||(15821-15898)
scaffold0020 (161-224)||(178898-178961)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (139-224)||(69794-69879)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (102-209)||(1051-1158)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (102-213)||(10536-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (46-209)||(12587-12749)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (113-228)||(1075-1190)
scaffold0184 (165-201)||(4284-4320)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (51-201)||(192919-193070)
scaffold0017 (165-201)||(15268-15304)
scaffold0017 (165-201)||(19790-19826)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (102-224)||(133-255)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (79-201)||(920-1041)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (52-224)||(26828-26997)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (52-224)||(21751-21920)
scaffold0210 (52-224)||(29643-29812)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (79-201)||(1853-1974)
scaffold0104 (79-201)||(9536-9656)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (52-201)||(46671-46820)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (175-228)||(1102-1155)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (46-171)||(225465-225588)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (105-228)||(12766-12889)
scaffold0476 (165-201)||(5609-5645)
scaffold0476 (165-201)||(6804-6840)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (160-224)||(10575-10639)
scaffold0297 (164-224)||(15736-15796)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (157-224)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (105-224)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (109-224)||(45794-45909)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (152-224)||(28813-28887)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (161-224)||(36454-36517)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (79-201)||(44104-44225)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (52-137)||(1172-1257)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (152-224)||(1086-1159)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (152-224)||(23927-24000)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (109-209)||(6284-6386)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-49)||(17881-17929)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (110-213)||(8075-8180)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (52-201)||(17055-17205)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (53-201)||(416-564)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (152-216)||(6824-6889)
scaffold0556 (109-153)||(8090-8134)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (79-224)||(159-304)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (139-224)||(19980-20065)
scaffold0139 (109-205)||(38339-38437)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (109-213)||(10542-10646)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (139-224)||(18236-18321)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (160-224)||(6095-6159)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (109-213)||(25121-25226)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (130-224)||(32102-32197)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (79-201)||(4453-4574)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (79-201)||(2057-2178)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (167-209)||(11982-12024)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (79-201)||(6387-6508)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (160-224)||(7870-7934)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (165-201)||(1517-1553)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (79-227)||(10015-10162)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (160-224)||(14664-14728)
scaffold0081 (160-224)||(23679-23743)
scaffold0081 (160-224)||(39103-39167)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (109-209)||(267679-267781)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (110-209)||(569-669)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (165-200)||(3925-3960)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (165-200)||(5151-5186)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-36)||(20595-20630)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (165-200)||(35992-36027)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (165-216)||(228422-228473)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (163-201)||(4999-5037)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (102-171)||(2213-2281)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (79-140)||(13092-13153)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (165-198)||(8523-8556)
scaffold0111 (165-198)||(15667-15700)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (158-207)||(206575-206624)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (165-201)||(2928-2964)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (165-201)||(7328-7364)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (165-201)||(18409-18445)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (165-201)||(66465-66501)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (109-209)||(97024-97126)
scaffold0006 (109-209)||(106302-106404)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23083259 - 23083482
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23083259 tgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaata 23083358  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083359 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23083458  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23083459 ctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13442501 - 13442274
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13442501 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 13442402  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  13442401 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26687114 - 26686887
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26687114 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatgg 26687015  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  26687014 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17488083 - 17487856
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17488083 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17487984  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17487983 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43841151 - 43840932
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841151 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 43841052  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaa 43840952  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  43840951 gttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14576727 - 14576949
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14576727 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattg 14576826  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14576827 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagt 14576925  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  14576926 cggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17499565 - 17499338
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17499565 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17499466  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17499465 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14973081 - 14972854
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  14973081 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 14972982  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14972981 tatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20698330 - 20698556
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  20698330 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 20698428  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20698429 aatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20698528  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698529 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18438761 - 18438534
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||    
T  18438761 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatg 18438662  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  18438661 tataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 18438562  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438561 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25476279 - 25476506
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  25476279 ttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatg 25476378  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  25476379 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagt 25476478  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476479 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12399435 - 12399209
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    || ||||    
T  12399435 taatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttga 12399336  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 12399236  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399235 ggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14572815 - 14572602
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  14572815 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattg 14572716  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14572715 aatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14572617  T
Q  201 cggtctaagttgatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  14572616 cggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42386632 - 42386428
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||    
T  42386632 atgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatat 42386533  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42386532 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtc 42386433  T
Q  206 taagt 210  Q
    |||||    
T  42386432 taagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 40213615 - 40213838
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | ||    
T  40213615 ttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatg 40213714  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  40213715 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagt 40213813  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  40213814 cggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11424657 - 11424880
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  11424657 ttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 11424756  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11424757 cataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11424852  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424853 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30030066 - 30029855
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  30030066 ttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattg 30029967  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30029966 aatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T
Q  201 cggtctaagttga 213  Q
    | |||||||||||    
T  30029867 cagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822267
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 46822320  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822319 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  ||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12511211 - 12511059
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  12511211 ttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 12511112  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511111 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |  | |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g-ttgtgttg---ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15977640 - 15977515
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15977640 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 15977542  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977541 gtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119887
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12119878  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  12119879 agatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412429
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  15412437 agatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||| |||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10557101 - 10556985
Alignment:
Q  109 agatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10557101 agatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10557003  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10557002 agttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23274869 - 23274705
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  23274869 ttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 23274770  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274769 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  146 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  84 tacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt-tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttat 181  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||| || |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27165413 - 27165250
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||| ||||| || ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||    
T  27165413 tgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatact 27165315  T
Q  162 gcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165314 gtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgcta-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16103905 - 16103784
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  16103905 atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagt 16103808  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16103807 cggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 155  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgtt-tatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16796774 - 16796685
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16796774 ttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32307795 - 32307684
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32307795 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32307698  T
Q  208 agttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  32307697 agttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 11298500 - 11298621
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  11298500 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 11298598  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11298599 tatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14665545 - 14665398
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | | || || |||||  |||   |||  ||||||||||||||    
T  14665545 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattttaaagttatactgttgatgtgatctgattatgttgctattgt 14665447  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665446 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14668701 - 14668554
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || |||||  |||   |||  |||| |||||||||    
T  14668701 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 14668603  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668602 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 19725857 - 19726004
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19725857 tgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gtcatgctgtt 19725954  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
      |||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725955 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  146 g 146  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11862964 - 11862816
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||  | ||    
T  11862964 tgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttataatatt 11862866  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    || ||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862865 ttggtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11862816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878610
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 17525190 - 17525275
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  17525190 atgtcatactgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147646
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 22147572  T
Q  156 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||| ||||| |||||| ||  |||  |||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  22147573 cataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051531
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060307
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 2897873 - 2897909
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897873 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 2897909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 3403014 - 3403050
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3403014 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 3403050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12172855 - 12172819
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172855 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 12172819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 18383973 - 18384009
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383973 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18384009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 22110352 - 22110454
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  22110352 agatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22110450  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  22110451 taag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12496402 - 12496280
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgata-ttattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||| |||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| |||    
T  12496402 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtagaaatg-aattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttg 12496304  T
Q  178 ttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12496303 ttatttaactaagttgcatgagtc 12496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15482719 - 15482668
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15482719 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 15482668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15617433 - 15617398
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617433 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30066005 - 30065970
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066005 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 322645 - 322615
Alignment:
Q  171 gctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322645 gctattgttatttaactaagttgcatgagtc 322615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctattgttat-ttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| |||||||||||||||||| ||  | | ||||||||| || ||||||||    
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  203 gtctaag 209  Q
    |||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 15850132 - 15850186
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  15850132 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagactgaataagttgatgaaga 15850186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16369465 - 16369423
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16369465 actgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtc 16369423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 23053140 - 23053181
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23053140 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 23053181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 327215 - 327251
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  327215 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 327251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 1982868 - 1982904
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1982868 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 1982904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 7793400 - 7793436
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7793400 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 7793436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 20461550 - 20461586
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20461550 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 20461586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  176 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23076666 - 23076442
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076666 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23076567  T
Q  104 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076566 atttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  23076466 tctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23060739 - 23060513
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060739 ttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt 23060641  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23060640 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22731128 - 22731355
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22731128 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22731227  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22731228 aatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22738074 - 22738300
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22738074 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22738173  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  22738174 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagt 22738272  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738273 cggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23286088 - 23285865
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||    
T  23286088 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttg 23285989  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23285988 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23285893  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285892 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22337342 - 22337115
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22337342 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22337243  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22337242 tatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23660245 - 23660023
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||    
T  23660245 tgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaata 23660146  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  23660145 tttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggt 23660047  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23660046 ctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23654280 - 23654507
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||    
T  23654280 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttg 23654379  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||    
T  23654380 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 298708 - 298933
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  298708 ttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 298807  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  298808 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 298907  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  298908 tcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 38016 - 38235
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  38016 atgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 38114  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38115 taagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 38213  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  38214 aagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20309326 - 20309108
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  20309326 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 20309228  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20309227 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20309131  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  20309130 taagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 25616240  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25616239 attgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 23708518 - 23708738
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  23708518 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgt 23708617  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggt 204  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23708618 ttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggt 23708716  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  23708717 ctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata-t 43137363  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137362 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 22799071 - 22799220
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| ||||    
T  22799071 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgtt 22799170  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799171 gttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529628 tg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103516
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 23019651 - 23019823
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| ||||    
T  23019651 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgtt 23019750  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23019751 gttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || |||||    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 19671904  T
Q  156 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27753802 - 27753730
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27753802 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 32451878 - 32452031
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  32451878 ttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctattttt 32451975  T
Q  155 gtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32451976 gaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  161 tgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679589
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |    
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7679609 tctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 227
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 25963688 - 25963809
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  25963688 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 25963786  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25963787 tattgaactaagttgcatgagtc 25963809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 22740905 - 22741081
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg---- 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||  ||   ||||||||  |||||| |||        
T  22740905 ttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttt--attgatatcgttatgtgatgtcat 22741002  T
Q  147 -ctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22741003 actgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatta 139  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 40622263 - 40622327
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  40622263 ctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20520092 - 20520295
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||| | | | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| | |    
T  20520092 atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgt 20520190  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||| ||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||    
T  20520191 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 20520288  T
Q  203 gtctaag 209  Q
    |||||||    
T  20520289 gtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 21916071 - 21916192
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||| || ||||   |||  ||||||| | ||||    
T  21916071 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgtttttgt 21916169  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21916170 tatttaactaagttgcatgagtc 21916192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 22758751 - 22758836
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22758751 atgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaactagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22758836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 22811969 - 22812005
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811969 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22812005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 10101695 - 10101730
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101695 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 27379483 - 27379518
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379483 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 27383529 - 27383564
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383529 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24735459 - 24735423
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24735459 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 24735423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52140 - 51913
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52140 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 52041  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52040 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 167873 - 168099
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  167873 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 167971  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  167972 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18818303 - 18818530
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818303 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 18818402  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18818403 aatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20536435 - 20536208
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20536435 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 20536336  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20536335 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21923822 - 21924049
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923822 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattg 21923921  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21923922 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23406608 - 23406379
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406608 ttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23406509  T
Q  101 aatatttaagatgtt--gttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23406508 aatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23406409  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406408 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7372997 - 7372778
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  7372997 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattg 7372906  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7372905 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28648938 - 28649164
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||    
T  28648938 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 28649037  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28649038 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 28649137  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28649138 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22626962 - 22626736
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22626962 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattg 22626863  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22626862 aatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22626764  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626763 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23648779 - 23648554
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  23648779 taatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattga 23648680  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23648679 atatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
     |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648579 agtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21918894 - 21919121
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt- 99  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||     
T  21918894 ttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattattt 21918992  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21918993 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21919092  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919093 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18879131 - 18879352
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  18879131 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 18879229  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18879230 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18879324  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879325 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16092235 - 16092463
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  16092235 ttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaat 16092334  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16092335 gtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16092434  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092435 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6759483 - 6759255
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |    
T  6759483 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagt 6759384  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    | ||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6759383 gtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 6759287  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759286 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22875291 - 22875065
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22875291 taatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22875192  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  22875191 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875092 cggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31971476 - 31971257
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  31971476 atgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 31971378  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971377 taagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 31971279  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  31971278 aagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45130892 - 45131117
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgactt-gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
     |||  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 16199546 - 16199765
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  16199546 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 16199644  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16199645 taagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16199742  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  16199743 taagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678221
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 18678168  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678169 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121734
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 32121787  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121786 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| | |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 124  Q
    ||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  125 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  224 gatgt 228  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||| | ||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || | ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 19801382 - 19801527
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19801382 tgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 19801480  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801481 g-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| ||| |||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937174
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 19937159  T
Q  217 agatgatgatgtcca 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  19937160 agatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
           | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || || || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508124 gatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  156 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  131 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 25363034 - 25363123
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25363034 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 20465983 - 20466132
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||    
T  20465983 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttgt 20466081  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    | ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466082 tgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249384
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctattgtt--atttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255222
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctattgtt--atttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  201 cggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 16410226 - 16410347
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  16410226 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16410324  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16410325 tatttcactaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 30643264 - 30643385
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||||||||    
T  30643264 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 30643362  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30643363 tatttaactaagttgcatgagtc 30643385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 17926678 - 17926799
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | |  | |||||||| || |   ||||||||| | |||||||    
T  17926678 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgt 17926776  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17926777 tatttaactaagttgcatgagtc 17926799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37116468 - 37116366
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  37116468 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 37116370  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  37116369 taag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439609
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 123  Q
    |||||||||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  124 gcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||| |  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24353140 - 24353039
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24353140 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 24353043  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  24353042 taag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19983178 - 19983119
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983178 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 19983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21383710 - 21383659
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  21383710 tatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatga 21383659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 21162111 - 21162152
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21162111 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtc 21162152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 21168784 - 21168825
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168784 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtc 21168825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 16231524 - 16231560
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231524 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 16231560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24755778 - 24755714
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  24755778 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 24755714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaatatgtgttgatattgattatgatgt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 39094982 - 39095018
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39094982 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 39095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25421759 - 25421532
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421759 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25421660  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  25421659 aatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25431621 - 25431395
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431621 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25431522  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25431521 aacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagt 25431422  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431421 cggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23390390 - 23390617
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23390390 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 23390489  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23390490 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24493795 - 24493569
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24493795 ttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattg 24493696  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24493695 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493596 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8286736 - 8286964
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  8286736 ttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 8286835  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8286836 attatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 8286935  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286936 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13025537 - 13025311
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13025537 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13025438  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13025437 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13025339  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025338 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13095721 - 13095495
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13095721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13095622  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13095621 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13095523  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095522 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9078179 - 9077952
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  9078179 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatg 9078080  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  9078079 tataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggt 9077980  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077979 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24529447 - 24529223
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  24529447 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 24529348  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  24529347 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 24529248  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24529247 cggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22075246 - 22075018
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  22075246 ttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 22075147  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  22075146 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  201 cggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1096694 - 1096467
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  1096694 ttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 1096595  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1096594 tatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtta-tttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21292864 - 21293090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  21292864 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 21292962  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaat--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
     |||  |||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21292963 tatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21293060  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293061 atcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  63 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 162  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  163 cctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  220 tgatgatgt 228  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 g-ctgtgttg---ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517320
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 17517267  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517268 attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581299 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245198 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 225  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902108 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061068
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 31061077  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  31061076 agatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619434
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  38619442 agatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatact 20918047  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918048 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144068
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 22144118  T
Q  161 tgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21873423 - 21873277
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||   |  ||  ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21873423 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---aaatgagattgatattatgaagtcatgctgat 21873327  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21873326 gttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064512
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23064520  T
Q  217 agatgatg 224  Q
    ||||||||    
T  23064519 agatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37724078 - 37723910
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||||    
T  37724078 ttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgt 37723979  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37723978 t---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 21986044 - 21986164
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 103  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||    
T  21986044 atgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttat 21986143  T
Q  104 atttaagatgttgttgacttg 124  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  21986144 aatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22107267 - 22107357
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 91  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22107267 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766174
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 162  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22032490 - 22032323
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | |     
T  22032490 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat-tg 22032396  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22032395 tttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| |||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 18769949 - 18770118
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  18769949 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 18770044  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18770045 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 26012037 - 26012154
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26012037 agatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26012135  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  26012136 agttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 23501402 - 23501472
Alignment:
Q  154 tgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501402 tgtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23572253 - 23572084
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  23572253 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 23572158  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||   ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23572157 tgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668898
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201360
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 22178221 - 22178323
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22178221 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22178319  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  22178320 taag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 23535637 - 23535688
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23535637 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 23535688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14079234 - 14079149
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||| |||| |||||||||    
T  14079234 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 21366722 - 21366758
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366722 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21366758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 24767518 - 24767665
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || || ||  |||   |||  |||| |||||||||    
T  24767518 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgt 24767616  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  24767617 tatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 24767665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18356014 - 18355963
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  18356014 tatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatga 18355963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23512162 - 23512121
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23512162 ctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtc 23512121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17410496 - 17410460
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17410496 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 17410460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaatatgtgttgatattgattatgatgt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38987 - 38761
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38987 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 38888  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  38887 aatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgact 38789  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38788 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 230  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12699059 - 12698831
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12699059 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 12698960  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12698959 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9509416 - 9509189
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9509416 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttg 9509317  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  9509316 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38227707 - 38227481
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38227707 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattg 38227608  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38227607 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 38227509  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227508 cggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3564258 - 3564482
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  3564258 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatg 3564357  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3564358 tataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3564458 cggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26212223 - 26211995
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  26212223 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 26212124  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26212123 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  201 cggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10589265 - 10589039
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||    
T  10589265 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaatatttg 10589167  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10589166 aacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10589067  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589066 cgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16386141 - 16386369
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    |  |||    
T  16386141 ttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttg 16386240  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||    
T  16386241 aatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16386340  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386341 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40443610 - 40443393
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  40443610 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 40443512  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40443511 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40443414  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  40443413 taagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || ||||| | ||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatattga-ga 48273506  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15143931 - 15144143
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  15143931 ttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaat 15144030  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15144031 gtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15144129  T
Q  200 tcggtctaagttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  15144130 tcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  220 tgatgatgt 228  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869346
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  13869354 agatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatact 17062013  T
Q  162 gcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17062014 gctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 27847739 - 27847951
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  27847739 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 27847837  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
             ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67745
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  67765 agttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811248
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15211634 - 15211484
Alignment:
Q  51 attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||| | |||||||| || |||||||| ||| ||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  15211634 attgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 15211536  T
Q  151 ttttgt-atactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    | |||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211535 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005650
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 222
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486865
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19486848 cgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831807
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 10063810 - 10063939
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10063810 tgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatg 10063908  T
Q  198 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| |||||||| | ||||| || ||||||    
T  10063909 agtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 228
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  131 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 17138008 - 17138177
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  17138008 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 17138103  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17138104 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  214 tgaagatgatg 224  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtt 1867993  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1867994 tgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  204 tctaagttga 213  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 179
Target Start/End: Original strand, 2530129 - 2530208
Alignment:
Q  98 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  2530129 ttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12187188 - 12187019
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  12187188 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 12187093  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  12187092 aattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 12321686 - 12321835
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||    
T  12321686 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgt 12321784  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    | ||||   |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12321785 tgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtc 12321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008597
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  || || |    
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 15008496  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    || || ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 15008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||| || || || |||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  146 g-ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |  |   |||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9703348 - 9703263
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  9703348 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 9703263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 9751812 - 9751848
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751812 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 9751848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 32216601 - 32216665
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  32216601 ctgcctatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 32216665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 39267957 - 39267993
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267957 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 39267993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 13635519 - 13635570
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  13635519 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 13635570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26292451 - 26292416
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292451 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39722322 - 39722287
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722322 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14429936 - 14429906
Alignment:
Q  171 gctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14429936 gctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14429906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9593402 - 9593366
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593402 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 9593366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11312704 - 11312668
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11312704 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 11312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11987268 - 11987232
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11987268 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 11987232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12318183 - 12318147
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12318183 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 12318147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15580747 - 15580711
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15580747 tatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtc 15580711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13211
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  13438 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 13339  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13338 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8427 - 8650
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8427 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 8526  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  8527 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagt 8622  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8623 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7893927 - 7893703
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7893927 ttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgct---gattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattg 7893831  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7893830 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16239864 - 16240090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44053056 - 44052829
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  44053056 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 44052957  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  44052956 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12902984 - 12902757
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  12902984 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 12902885  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12902884 aatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22636653 - 22636437
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22636653 gatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattta 22636555  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22636455  T
Q  209 gttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22636454 gttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7089104 - 7088877
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  7089104 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 7089005  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7089004 aatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7088905  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088904 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14038875 - 14038653
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  14038875 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatg 14038776  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14038775 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14038675 cagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16377417 - 16377639
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  16377417 ttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16377516  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16377517 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16377615 cggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23374253 - 23374473
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  23374253 ttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 23374352  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23374353 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  103 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  203 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || |||||| |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    |  | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 14053202 - 14053422
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||       
T  14053202 atgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgca 14053300  T
Q  107 taaga-tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 204  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14053301 taagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 14053398  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  14053399 ctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | |  |||||| |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102276 -actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 17046602  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  17046601 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 17046505  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  17046504 tgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  142 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367690
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367756 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402703
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402769 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||          
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg------ 7641285  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
         ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641286 -----tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
     | ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  209 gttga 213  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370018
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15370030  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||| ||||||    
T  15370029 agatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371202
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15371214  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||| ||||||    
T  15371213 agatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373483
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15373495  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||| ||||||    
T  15373494 agatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15093947 - 15093798
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||| ||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15093947 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctgtt 15093848  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     ||||   ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15093847 gttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223532
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 16223544  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||| ||||||    
T  16223543 agatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3096870 - 3096759
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  3096870 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T
Q  101 aatatttaagatg 113  Q
    |||||||| ||||    
T  3096771 aatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  146 gctgt-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |   | ||||| ||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706409
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6190633 - 6190481
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6190633 tatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttg 6190536  T
Q  156 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
     || ||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6190535 aatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 16356924 - 16357045
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  16356924 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16357022  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16357023 tatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 16488023 - 16488171
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || |||||| |    
T  16488023 tgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgct 16488121  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488122 tttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16488171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 15121748 - 15121917
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| |  |    
T  15121748 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgattat 15121843  T
Q  152 t-ttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15121844 tgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 16348636 - 16348757
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  16348636 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16348734  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16348735 tatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 13812991 - 13813112
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | ||  |  |||| | |||  |||  |||| |||||||||    
T  13812991 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgt 13813089  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13813090 tatttaactaagttgcatgagtc 13813112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 20157517 - 20157579
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||    
T  20157517 tatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13569587 - 13569502
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  13569587 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 13569502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23843538 - 23843478
Alignment:
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  23843538 ctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 23843478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9556586 - 9556551
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556586 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17810328 - 17810293
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810328 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 1951810 - 1951846
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951810 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 1951846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12570078 - 12570014
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12570078 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12570014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 18222427 - 18222463
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18222427 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 18222463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 36134012 - 36134048
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36134012 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 36134048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 46640456 - 46640558
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  46640456 agatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 46640554  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  46640555 taag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1851
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2078 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 1979  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1978 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23109 - 22886
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23109 ttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23010  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23009 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3697 - 3470
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  3697 ttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttg 3598  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  3597 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 343
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  569 ttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcg 470  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  469 aatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagt 371  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  370 cggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22532496 - 22532269
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  22532496 ttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 22532397  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22532396 aatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27250623 - 27250850
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  27250623 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 27250722  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27250723 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 50210107 - 50210333
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  50210107 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 50210206  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50210207 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50210306  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50210307 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34510007 - 34509783
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  34510007 ttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 34509908  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34509907 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34509808  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34509807 cggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  114 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  214 tgaagatgatgatg 227  Q
    | |||||| |||||    
T  22468803 ttaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21026907 - 21026680
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  21026907 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 21026808  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21026807 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20135413 - 20135188
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  20135413 taatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattga 20135314  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20135313 atacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
     |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135213 agtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22354466 - 22354616
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||    
T  22354466 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttg 22354565  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354566 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  433072 gcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||  |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22356068 - 22356184
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22356068 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgttt 22356167  T
Q  100 gaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22356168 gaatatttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22357754 - 22357870
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22357754 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgttt 22357853  T
Q  100 gaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22357854 gaatatttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361979 g-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847275
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 20847274  T
Q  228 t 228  Q
    |    
T  20847275 t 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213027
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||  |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860177
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||   ||| || |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    ||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  15860108 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 38801297 - 38801508
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||    
T  38801297 ttaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatat 38801395  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  38801396 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagat 38801491  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  38801492 gttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | |||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  162 gcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||  ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707229 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||  ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711771 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342090
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21342105  T
Q  217 agatgatgatgtcca 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  21342104 agatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16758872 - 16758664
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  16758872 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 16758773  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    |   ||||||||||  ||| | |||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16758772 tgt-gatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcg 16758675  T
Q  203 gtctaagttga 213  Q
    |||||||||||    
T  16758674 gtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  47 tgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg 146  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  147 ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21754163 - 21754052
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21754163 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21754066  T
Q  208 agttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  21754065 agttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  212 gatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295672
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 18182093 - 18182214
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  |  |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||||||||    
T  18182093 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaata-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18182191  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18182192 tatttaactaagttgcatgagtc 18182214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 16093928 - 16093987
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16093928 ttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| |||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 213
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21161769 - 21161720
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21161769 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 3472980 - 3473016
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472980 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 3473016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Original strand, 20091533 - 20091593
Alignment:
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  20091533 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 20091593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1010779 - 1010744
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010779 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 36819359 - 36819410
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  36819359 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 36819410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 16368287 - 16368388
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16368287 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 16368385  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  16368386 aag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21022695 - 21022654
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21022695 ctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 21022654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19211924 - 19211888
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19211924 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 19211888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20138140 - 20138104
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20138140 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 20138104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21313184 - 21313148
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21313184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 21313148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17287690 - 17287917
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287690 ttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 17287789  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17287790 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22780121 - 22780348
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22780121 ttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattg 22780220  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  22780221 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagt 22780320  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780321 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20360854 - 20361081
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  20360854 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 20360953  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20360954 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29060767 - 29060540
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29060767 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 29060668  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29060667 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29060568  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060567 cggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20638177 - 20638404
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||  |||    
T  20638177 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttg 20638276  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  20638277 aatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 20638376  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638377 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19303435 - 19303661
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  19303435 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatg 19303534  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  19303535 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25629249 - 25629476
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  25629249 ttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 25629348  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  25629349 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629449 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18409721 - 18409947
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| | ||    
T  18409721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatg 18409820  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18409921 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20594000 - 20593773
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||    
T  20594000 ttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattg 20593901  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||| || ||||||| |    
T  20593900 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgatt 20593801  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593800 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541011 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15041446 - 15041644
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| || | |||||| |||||||||||||||  | | |||||    
T  15041446 taatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttgagattttattga 15041544  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041545 atacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456781 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992429
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 23992482  T
Q  174 attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  23992481 attgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
      ||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25644503 - 25644335
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||     
T  25644503 ttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcac 25644404  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644403 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 16920533 - 16920751
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||  |||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  16920533 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 16920631  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| | | | |||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16920632 taagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     ||| || |||||||||||||||    
T  16920729 aaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25603279 - 25603478
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  25603279 ttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattg 25603378  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| || |||||| | ||| ||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  25603379 aataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagt 25603477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18821795 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgttttt 18821892  T
Q  155 gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821893 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 25611637 - 25611816
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||||||| || |||||| | |||    
T  25611637 aatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tga 25611735  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     ||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  25611736 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22831723 - 22831503
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--a 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  |    
T  22831723 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 22831625  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    | |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22831624 tctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22831528  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||   || |||||||||||||||    
T  22831527 tctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgcta-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
      |||||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgcta-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
      |||||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227632
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8227615 tgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766718
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  167 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta-taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| | || ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||  |||||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19652313 - 19652199
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19652313 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 19652216  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  19652215 agttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18907280 - 18907134
Alignment:
Q  55 attatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||| |    
T  18907280 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgt 18907182  T
Q  154 tgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||   |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18907181 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 25642128 - 25642304
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg---- 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||  ||   ||||||||  |||||| |||        
T  25642128 ttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttt--attgatatcgttatgtgatgtcat 25642225  T
Q  147 -ctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  25642226 actgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  181 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185524
Alignment:
Q  20 taatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||| ||  ||| || ||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| |||   |||||| || ||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 16523441 - 16523477
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523441 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16523477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Original strand, 22334954 - 22335014
Alignment:
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22334954 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22335014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 18917316 - 18917351
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917316 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18917351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12706746 - 12706710
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12706746 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 12706710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 15894491 - 15894555
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  15894491 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 15894555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17804253 - 17804217
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17804253 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 17804217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 25767218 - 25767254
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25767218 tatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagtc 25767254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 27325668 - 27325704
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27325668 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 27325704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40139 - 39913
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40139 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatca 40040  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40039 aatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 39941  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39940 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18749
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || || ||||    
T  18600 ttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaacg-aattgatattatgaagttattctgt 18698  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    | ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699 tgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8702 - 8479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8702 ttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttg 8607  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8606 aatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6245
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6015 ttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 6114  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctattgttatttaactaagttgcatg 197  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  6115 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 6214  T
Q  198 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6215 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3271
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  3045 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 3144  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3145 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3243  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26122 - 25896
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26122 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 26023  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26022 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 25924  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25923 cggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40084 - 39858
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40084 ttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 39985  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39984 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 39886  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39885 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39703 - 39479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  39703 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 39604  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  39603 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 39505  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39504 cggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 75109 - 75333
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  75109 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 75208  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  75209 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 75307  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  75308 cggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4508
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  4734 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 4635  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  4634 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagt 4536  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4535 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12316 - 12090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  12316 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 12217  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  12216 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagt 12118  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12117 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22268 - 22042
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22268 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22169  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  22168 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagt 22070  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22069 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 18682 - 18733
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18682 tatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtctgaataagttgatga 18733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24406
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattga-ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24203 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 24302  T
Q  108 aagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24303 aagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  207 aagt 210  Q
    ||||    
T  24403 aagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 17109 - 17337
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  17109 ttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 17208  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg--tttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17209 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 17308  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 79284 - 79430
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  79284 tgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatact 79383  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79384 gtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 14139 - 14203
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  14139 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13319 - 13147
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 13220  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13219 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25959 - 26179
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  25959 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 26058  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26059 tatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26158  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26159 cggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 33389 - 33479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33389 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 943 - 1169
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  943 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 1041  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  1042 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16494 - 16721
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  16494 ttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16593  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16594 tatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16693  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16694 cggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || ||||||| ||||||||||||    
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  118 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaa 217  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T
Q  218 gatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||    
T  4859 gatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  24 ctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  124 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  224 gatg 227  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 32863 - 33077
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatg-tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32863 tgttagttataatctgtgaagctattt--tatgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 32959  T
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32960 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 33058  T
Q  210 ttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33059 ttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46142 - 45928
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatg-tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46142 tgttagttataatctgtgaagctattt--tatgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 46046  T
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46045 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 45947  T
Q  210 ttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45946 ttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  17 ttataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | || ||| || ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  16124 agatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  167 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21138 - 20910
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | |||    
T  21138 ttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttg 21039  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||    
T  21038 aatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgag 20939  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20938 tcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 339844 - 340065
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||    
T  339844 ttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 339943  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  339944 tatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttg-ttgtgttatttaactaagctgcatgagt 340040  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  340041 cggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta-taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| | || ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgtt 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32285 - 32067
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  32285 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 32187  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32186 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 32089  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  32088 aagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4932 - 4712
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||      
T  4932 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 4834  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4833 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 4734  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  4733 aagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||      
T  156 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 58  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  57 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataaga 15468  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15469 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15567  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15568 gttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7464 - 7295
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||| ||| |||||  |||| | ||    
T  7464 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattgt 7369  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7368 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2179 - 1952
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| ||  || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||  |||    
T  2179 ttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttg 2080  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  2079 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13716 - 13497
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  13716 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 13618  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13617 taagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 13519  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  13518 aagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 165  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 289
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  348 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaaga 10429  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10430 tgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagt 10526  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  10527 tgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20478 g-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65915
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53621 - 53585
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53621 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 53585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28544 - 28414
Alignment:
Q  98 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatg 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  28544 ttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 28445  T
Q  198 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28444 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  65 gatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 163  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 38424 - 38596
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||||| ||||    
T  38424 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgtt 38523  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  38524 gttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgag 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40291
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  40268 cagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 23611 - 23695
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatta 136  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  23611 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28057 - 27911
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  28057 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 27958  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 147  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27957 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  192 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 124812 - 124675
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  124812 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 124713  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatt 138  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  124712 aatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 174941 - 174767
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  174941 ttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgt 174842  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174841 t---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4742 - 4545
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4742 gatgttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatattta 4644  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12932 - 12763
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  12932 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 12837  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||   ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12836 tgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 61662 - 61697
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61662 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 65578 - 65613
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65578 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 62321 - 62200
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||   |||| | |||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagt 62226  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||| ||||| || || |||||||||    
T  62225 cggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  142 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 857 - 1021
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||| ||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  857 ttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattg 956  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  957 aatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 952 - 1170
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  952 atgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 1050  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1051 taagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtc 1147  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  1148 taagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16846 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  201 cggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85742
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85679 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 160809 - 160688
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  160809 atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 160712  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  160711 cggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 173348 - 173297
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  173348 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 173297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16506 - 16282
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||    
T  16506 ttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 16408  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagttgcatgag 199  Q
     |||  ||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16407 tatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgag 16311  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16310 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4359 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6402
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||||||||    
T  6281 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 6379  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6380 tatttaactaagttgcatgagtc 6402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12953 - 12909
Alignment:
Q  172 ctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12953 ctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 12909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19237 - 19193
Alignment:
Q  172 ctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  19237 ctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 19193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  63 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||| |||  ||||||||||     
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  118 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6669
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||  |||    
T  6837 ttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttg 6738  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6737 aatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1289
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  1507 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 1409  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1408 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1312  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  1311 taagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7484 - 7266
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  7484 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 7386  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7385 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7289  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7288 taagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||| |||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  182 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 73824 - 73860
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 73860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78328
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T
Q  206 taagttg-atgaagatg 221  Q
     ||| || |||||||||    
T  78344 caagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11407 - 11450
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgt 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11407 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  162 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||      | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgc------tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51795 - 51582
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  51795 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataaga 51697  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  51696 tgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 51600  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||| ||||||||||    
T  51599 tgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161252
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| || || |||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaaga 161246  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  161247 tgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 164590 - 164674
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  164590 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 16294 - 16442
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||| ||||    
T  16294 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgatgtt 16392  T
Q  152 tttgt-atactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16393 gttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat--ttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2291
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatta 2282  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    | |||||||    
T  2283 aaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    | | | ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9080
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  8995 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 4749 - 4921
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||    
T  4749 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgtt 4848  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  4849 gttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata-tttaagatgttgttg 119  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
     || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 213  Q
     || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3640
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3708 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7772 - 7704
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7772 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 5134  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| | ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5135 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5231  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  5232 tgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  162 gcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11546 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38295 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42686 - 42650
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42686 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 42650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  146 --gctgtttttgtatactgcctatgttgcta-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
      ||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15478
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttg 15478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24018 - 23843
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg----acttgcaattgatattattatgtcatgc 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||    | |||  |||| ||| || ||||||| |    
T  24018 ttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgttttatttgatattgttat-atgatgtcatac 23920  T
Q  148 tgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 51833 - 51985
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  51833 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctattttt 51930  T
Q  155 gtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    | || |||||||||| ||| || | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51931 gaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32654 - 32538
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32654 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 32557  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  32556 agttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 60614 - 60818
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  60614 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 60713  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcg 202  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  60714 ttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T
Q  203 gtctaag 209  Q
    || ||||    
T  60812 gtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctat-tgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  201 cggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1052
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1141 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6244
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  201 cggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10323
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgata 68  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10390 ttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 155  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  156 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  201 cggtctaag 209  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  201 cggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 201
Target Start/End: Original strand, 192919 - 193070
Alignment:
Q  51 attgattatgatgtgatataatgttatg-tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| ||    
T  192919 attgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatg 193017  T
Q  150 tttttgt-atactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    || |||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  193018 ttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 15268 - 15304
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15268 tatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 19790 - 19826
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19790 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 920
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  1041 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 943  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  942 tattgaactaagttgcatgagtc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26997 - 26828
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| | ||    
T  26997 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgattgt 26902  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  26901 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 21751 - 21920
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  21751 ttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 21846  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  21847 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 29643 - 29812
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  29643 ttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 29738  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  29739 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1853
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| ||| |||||    
T  1974 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgt 1876  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1875 tatttaactaagttgcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9656 - 9536
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||||||||  |||   |||  ||||||| ||||||    
T  9656 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgt 9559  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9558 tatttaactaagttgcatgagtc 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 46671 - 46820
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| | || ||||| |    
T  46671 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaagttatgctat 46769  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    | ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46770 tgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtc 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225465
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  225489 gctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5645 - 5609
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5645 tatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtc 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6840 - 6804
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6840 tatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtc 6804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  164 ctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45909
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45893 agttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctat--tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44225 - 44104
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  44225 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 44127  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44126 tatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Original strand, 1172 - 1257
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattat 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1172 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6386
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6284 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  6383 taag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17881 - 17929
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttga 49  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17881 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 17055 - 17205
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtt-gacttgcaattgatattattatgtcatgctg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||  || |||||||||||| | || ||||||    
T  17055 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatg-aattgatattatgaagttatgctg 17153  T
Q  150 tttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||  |||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17154 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtc 17205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 564 - 416
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| |||||   | |||||||||||| | || |||||| |    
T  564 tgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgct 466  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
     ||||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  465 gttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8090
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8134 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 304 - 159
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||     |||||||||||| | || ||| ||||  |||   |||  |||| |||||||||    
T  304 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 205  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  204 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18321 - 18236
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18321 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25226 - 25121
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  25226 agatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 25129  T
Q  206 taagttga 213  Q
    ||||||||    
T  25128 taagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4574 - 4453
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   |||  |||| ||| |||||    
T  4574 tgcattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgt 4476  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4475 tatttaactaagttgcatgagtc 4453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 2057 - 2178
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| | | |||||||  | |||||||||||||  || | |||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||||||||    
T  2057 tgcattacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttgaaatgga-ttgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 2155  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2156 tatttaactaagttgcatgagtc 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  167 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 6387 - 6508
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||| || ||||   || |||||| |||||||||    
T  6387 tgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgt 6485  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  6486 tatttaactatgttgcatgagtc 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 7870 - 7934
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||| |||||||||    
T  7870 ctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatg 7934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1553 - 1517
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1553 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 10015 - 10162
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || || ||  |||   |||  |||| |||||||||    
T  10015 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactattgatgtgatctgattatgctgctattgt 10113  T
Q  179 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  10114 tatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 267781 - 267679
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  267781 agatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 267683  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  267682 taag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  669 gatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 3925 - 3960
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3925 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 5151 - 5186
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5151 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 20630 - 20595
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 36  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20630 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 35992 - 36027
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35992 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 216
Target Start/End: Original strand, 228422 - 228473
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  228422 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatga 228473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  163 cctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2281
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13153 - 13092
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 140  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13153 tgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8556 - 8523
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8556 tatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 8523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15700 - 15667
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15700 tatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2964 - 2928
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2964 tatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtc 2928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 18409 - 18445
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc 18445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 66465 - 66501
Alignment:
Q  165 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  66465 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 66501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 97126 - 97024
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||  || ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  97126 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  97027 taag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 106404 - 106302
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||  || ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  106404 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  106305 taag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1109 times since January 2019
Visitors: 2244