View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_6 (Length: 504)

Name: NF0157_low_6
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_6
NF0157_low_6
[»] chr8 (154 HSPs)
chr8 (13-493)||(21389091-21389571)
chr8 (22-493)||(21395630-21396101)
chr8 (22-493)||(21790123-21790594)
chr8 (1-302)||(17353564-17353865)
chr8 (1-302)||(19899286-19899587)
chr8 (1-345)||(16184877-16185220)
chr8 (293-493)||(21778697-21778897)
chr8 (1-355)||(23776460-23776816)
chr8 (3-302)||(21168350-21168649)
chr8 (8-302)||(24755912-24756206)
chr8 (1-302)||(19983284-19983587)
chr8 (1-302)||(377469-377770)
chr8 (1-302)||(20465666-20465967)
chr8 (16-284)||(19976654-19976922)
chr8 (280-493)||(16199551-16199765)
chr8 (280-493)||(31971257-31971471)
chr8 (1-208)||(22010306-22010513)
chr8 (280-493)||(45130903-45131117)
chr8 (1-302)||(15602644-15602945)
chr8 (1-302)||(15611096-15611397)
chr8 (1-298)||(30642918-30643215)
chr8 (1-205)||(19259229-19259432)
chr8 (22-302)||(17926355-17926635)
chr8 (1-278)||(16409882-16410159)
chr8 (290-493)||(21918915-21919121)
chr8 (280-493)||(20536208-20536424)
chr8 (1-202)||(16860964-16861155)
chr8 (17-201)||(20856068-20856252)
chr8 (288-493)||(18879150-18879352)
chr8 (280-492)||(28648949-28649164)
chr8 (280-493)||(22626736-22626951)
chr8 (280-493)||(18818314-18818530)
chr8 (156-302)||(21161840-21161986)
chr8 (305-493)||(16092272-16092463)
chr8 (280-493)||(7372778-7372986)
chr8 (1-169)||(16411896-16412064)
chr8 (280-493)||(21923833-21924049)
chr8 (280-493)||(22875065-22875281)
chr8 (280-496)||(6759255-6759472)
chr8 (421-493)||(5866323-5866395)
chr8 (16-201)||(39094594-39094769)
chr8 (3-96)||(21161744-21161837)
chr8 (421-493)||(17140916-17140988)
chr8 (421-493)||(21490995-21491067)
chr8 (16-202)||(23834450-23834626)
chr8 (280-493)||(23406379-23406597)
chr8 (16-200)||(22113381-22113555)
chr8 (16-200)||(22134884-22135058)
chr8 (116-201)||(24433980-24434065)
chr8 (118-202)||(16231220-16231304)
chr8 (118-201)||(15538726-15538809)
chr8 (116-201)||(15532166-15532251)
chr8 (16-200)||(22166034-22166208)
chr8 (421-493)||(6520368-6520440)
chr8 (118-202)||(22028834-22028918)
chr8 (421-493)||(38855300-38855372)
chr8 (129-200)||(23846771-23846842)
chr8 (16-201)||(18619756-18619931)
chr8 (421-493)||(23760893-23760962)
chr8 (16-201)||(30308407-30308582)
chr8 (112-201)||(17828322-17828411)
chr8 (118-199)||(22045138-22045219)
chr8 (1-78)||(25362777-25362854)
chr8 (116-200)||(43252092-43252176)
chr8 (13-107)||(5865915-5866009)
chr8 (280-492)||(23648554-23648769)
chr8 (421-474)||(983455-983508)
chr8 (421-493)||(21249384-21249457)
chr8 (421-493)||(21255222-21255295)
chr8 (376-477)||(20498578-20498681)
chr8 (116-192)||(20527736-20527812)
chr8 (421-489)||(26355747-26355815)
chr8 (380-490)||(14409495-14409606)
chr8 (12-107)||(17141302-17141397)
chr8 (422-477)||(24353036-24353091)
chr8 (422-477)||(37116363-37116418)
chr8 (116-198)||(17055132-17055214)
chr8 (420-477)||(19154935-19154992)
chr8 (421-474)||(21285616-21285669)
chr8 (13-78)||(45130669-45130734)
chr8 (421-493)||(17612159-17612231)
chr8 (282-357)||(25363047-25363123)
chr8 (118-198)||(32598959-32599039)
chr8 (118-198)||(32605491-32605571)
chr8 (380-490)||(1484402-1484513)
chr8 (380-490)||(5853343-5853454)
chr8 (380-474)||(16413367-16413462)
chr8 (422-477)||(17267044-17267099)
chr8 (380-490)||(20403227-20403338)
chr8 (380-490)||(22001753-22001864)
chr8 (17-108)||(41598572-41598663)
chr8 (12-78)||(21491410-21491476)
chr8 (16-78)||(31971662-31971724)
chr8 (17-78)||(7373167-7373228)
chr8 (425-486)||(13508138-13508199)
chr8 (17-78)||(18818052-18818113)
chr8 (17-78)||(18878879-18878940)
chr8 (15-56)||(21249821-21249862)
chr8 (15-56)||(21255659-21255700)
chr8 (17-78)||(21918652-21918713)
chr8 (139-200)||(21972350-21972411)
chr8 (139-200)||(21976435-21976496)
chr8 (17-78)||(22627153-22627214)
chr8 (17-78)||(23406799-23406860)
chr8 (17-78)||(28648686-28648747)
chr8 (13-57)||(16199296-16199340)
chr8 (116-200)||(19278027-19278110)
chr8 (1-57)||(22028969-22029025)
chr8 (431-490)||(4542477-4542535)
chr8 (422-477)||(17439557-17439612)
chr8 (431-490)||(19896265-19896323)
chr8 (431-490)||(20046299-20046357)
chr8 (17-60)||(20536644-20536687)
chr8 (380-490)||(41598188-41598299)
chr8 (424-486)||(13597669-13597731)
chr8 (393-490)||(15203295-15203393)
chr8 (16-78)||(23648971-23649033)
chr8 (440-490)||(26225359-26225409)
chr8 (17-78)||(6759675-6759736)
chr8 (17-78)||(16091983-16092044)
chr8 (425-474)||(21673723-21673772)
chr8 (17-78)||(21923570-21923631)
chr8 (376-474)||(26219733-26219831)
chr8 (440-496)||(19937118-19937174)
chr8 (1-49)||(22057768-22057816)
chr8 (1-53)||(23252400-23252452)
chr8 (380-490)||(4483281-4483391)
chr8 (440-474)||(15070574-15070608)
chr8 (243-301)||(19259451-19259509)
chr8 (394-477)||(19801447-19801530)
chr8 (440-474)||(45290807-45290841)
chr8 (16-57)||(15532300-15532341)
chr8 (16-57)||(15538860-15538901)
chr8 (17-78)||(19801069-19801130)
chr8 (16-53)||(24433890-24433927)
chr8 (17-78)||(26355340-26355401)
chr8 (16-57)||(32599090-32599131)
chr8 (16-57)||(32605622-32605663)
chr8 (17-78)||(38854893-38854954)
chr8 (17-65)||(21414869-21414917)
chr8 (1-57)||(22045270-22045326)
chr8 (145-192)||(19905783-19905830)
chr8 (374-491)||(18678102-18678221)
chr8 (12-78)||(20499078-20499144)
chr8 (424-478)||(20502154-20502207)
chr8 (440-490)||(25484380-25484430)
chr8 (29-78)||(13507663-13507712)
chr8 (29-78)||(13597195-13597244)
chr8 (16-53)||(17055042-17055079)
chr8 (16-53)||(17828236-17828273)
chr8 (17-78)||(21674123-21674184)
chr8 (16-45)||(23844567-23844596)
chr8 (422-478)||(22525573-22525628)
chr8 (147-183)||(39834146-39834182)
[»] scaffold0021 (7 HSPs)
scaffold0021 (17-492)||(174767-175243)
scaffold0021 (280-401)||(124679-124801)
scaffold0021 (423-493)||(121766-121835)
scaffold0021 (17-78)||(125000-125061)
scaffold0021 (417-477)||(136414-136474)
scaffold0021 (417-477)||(145122-145182)
scaffold0021 (18-78)||(62979-63039)
[»] chr5 (160 HSPs)
chr5 (8-486)||(37723910-37724389)
chr5 (3-489)||(22032323-22032806)
chr5 (1-489)||(18769631-18770118)
chr5 (17-302)||(26704257-26704542)
chr5 (17-302)||(26973990-26974275)
chr5 (1-302)||(23201559-23201861)
chr5 (1-302)||(23500972-23501273)
chr5 (1-301)||(14079340-14079640)
chr5 (1-299)||(23512301-23512599)
chr5 (70-395)||(23572178-23572502)
chr5 (1-302)||(21366293-21366594)
chr5 (1-302)||(20805738-20806039)
chr5 (1-193)||(21887124-21887316)
chr5 (280-493)||(21292875-21293090)
chr5 (7-197)||(31342399-31342589)
chr5 (275-493)||(8286742-8286964)
chr5 (280-493)||(23390401-23390617)
chr5 (147-355)||(21873387-21873595)
chr5 (275-493)||(22075018-22075240)
chr5 (280-493)||(24493569-24493784)
chr5 (280-493)||(9077952-9078168)
chr5 (280-493)||(25421532-25421748)
chr5 (342-493)||(21729032-21729185)
chr5 (342-493)||(21808357-21808510)
chr5 (288-490)||(24529223-24529428)
chr5 (16-202)||(23535242-23535418)
chr5 (1-202)||(17410724-17410915)
chr5 (280-493)||(13025311-13025526)
chr5 (280-493)||(13095495-13095710)
chr5 (6-201)||(17918794-17918979)
chr5 (17-202)||(20910454-20910629)
chr5 (13-201)||(12028215-12028393)
chr5 (13-197)||(24222170-24222344)
chr5 (280-473)||(25431414-25431610)
chr5 (1-202)||(1858614-1858805)
chr5 (118-202)||(18356604-18356688)
chr5 (421-493)||(19660884-19660956)
chr5 (421-493)||(36314577-36314649)
chr5 (280-493)||(1096467-1096683)
chr5 (16-201)||(21340420-21340595)
chr5 (16-201)||(26665784-26665959)
chr5 (16-201)||(26937381-26937556)
chr5 (16-200)||(21884842-21885016)
chr5 (14-201)||(26680868-26681045)
chr5 (14-201)||(26952475-26952652)
chr5 (16-201)||(16674430-16674605)
chr5 (16-201)||(24532701-24532876)
chr5 (393-493)||(21997553-21997655)
chr5 (16-200)||(26172743-26172917)
chr5 (421-493)||(21329546-21329618)
chr5 (122-202)||(23451634-23451714)
chr5 (122-202)||(23463139-23463219)
chr5 (118-201)||(20232828-20232911)
chr5 (23-200)||(19472379-19472546)
chr5 (377-477)||(20026942-20027046)
chr5 (116-197)||(17718182-17718263)
chr5 (112-200)||(4036499-4036587)
chr5 (421-489)||(22959581-22959649)
chr5 (122-202)||(23458878-23458958)
chr5 (7-201)||(26742390-26742574)
chr5 (119-201)||(18774482-18774564)
chr5 (119-201)||(42805698-42805780)
chr5 (119-200)||(25229152-25229233)
chr5 (119-200)||(25293308-25293389)
chr5 (17-201)||(122955-123133)
chr5 (116-200)||(20296127-20296211)
chr5 (421-493)||(21502205-21502277)
chr5 (421-489)||(21565546-21565614)
chr5 (12-78)||(19660474-19660540)
chr5 (376-490)||(22412187-22412302)
chr5 (116-192)||(21295006-21295082)
chr5 (116-192)||(25535275-25535351)
chr5 (13-60)||(21292619-21292666)
chr5 (1-108)||(22760026-22760133)
chr5 (17-78)||(1096885-1096946)
chr5 (17-78)||(21871213-21871274)
chr5 (17-78)||(21875493-21875554)
chr5 (17-78)||(22075426-22075487)
chr5 (421-474)||(26012084-26012137)
chr5 (421-493)||(19668898-19668970)
chr5 (421-477)||(22144065-22144121)
chr5 (380-490)||(264819-264930)
chr5 (380-490)||(10732991-10733102)
chr5 (17-108)||(11580887-11580978)
chr5 (119-190)||(18784336-18784407)
chr5 (380-490)||(20909012-20909123)
chr5 (17-108)||(21985789-21985880)
chr5 (380-490)||(39363384-39363495)
chr5 (393-490)||(39245136-39245234)
chr5 (139-192)||(15441720-15441773)
chr5 (420-477)||(22178269-22178326)
chr5 (17-78)||(23390138-23390199)
chr5 (17-182)||(25421847-25422011)
chr5 (17-78)||(25431812-25431873)
chr5 (16-108)||(8286494-8286586)
chr5 (145-301)||(15236552-15236708)
chr5 (395-474)||(20902075-20902155)
chr5 (275-358)||(22107273-22107357)
chr5 (157-201)||(22757414-22757458)
chr5 (431-490)||(11581303-11581361)
chr5 (431-490)||(20918052-20918110)
chr5 (13-60)||(22107022-22107069)
chr5 (17-60)||(22119835-22119878)
chr5 (145-192)||(23337060-23337107)
chr5 (431-490)||(29329934-29329992)
chr5 (380-490)||(42245416-42245527)
chr5 (440-490)||(2154726-2154776)
chr5 (440-490)||(36154892-36154942)
chr5 (440-490)||(38619434-38619484)
chr5 (321-440)||(18356367-18356488)
chr5 (17-78)||(21565962-21566023)
chr5 (17-78)||(22959175-22959236)
chr5 (440-489)||(23064512-23064561)
chr5 (1-42)||(23572510-23572551)
chr5 (17-78)||(24529639-24529700)
chr5 (442-490)||(10775790-10775838)
chr5 (17-108)||(9078340-9078431)
chr5 (393-487)||(18319098-18319193)
chr5 (21-60)||(24766983-24767022)
chr5 (380-490)||(29345980-29346091)
chr5 (424-478)||(15796434-15796487)
chr5 (374-474)||(18418599-18418699)
chr5 (375-440)||(20910800-20910866)
chr5 (423-477)||(26740697-26740750)
chr5 (440-490)||(31061068-31061118)
chr5 (16-57)||(4036632-4036673)
chr5 (17-78)||(13095912-13095973)
chr5 (16-53)||(17718092-17718129)
chr5 (16-57)||(18356739-18356780)
chr5 (16-57)||(18784459-18784500)
chr5 (17-78)||(19669318-19669379)
chr5 (16-53)||(21482894-21482931)
chr5 (16-53)||(25229059-25229096)
chr5 (16-53)||(25293215-25293252)
chr5 (423-472)||(26732884-26732932)
chr5 (16-53)||(33409622-33409659)
chr5 (17-78)||(36154470-36154531)
chr5 (16-57)||(42805832-42805873)
chr5 (116-192)||(14359562-14359638)
chr5 (116-192)||(24554820-24554896)
chr5 (421-493)||(40725853-40725925)
chr5 (17-60)||(21329137-21329180)
chr5 (415-466)||(21873277-21873327)
chr5 (415-474)||(26704090-26704148)
chr5 (415-474)||(26973823-26973881)
chr5 (443-490)||(29348453-29348500)
chr5 (443-490)||(29350926-29350973)
chr5 (380-490)||(32027393-32027504)
chr5 (170-201)||(33409506-33409537)
chr5 (440-490)||(20806854-20806904)
chr5 (424-478)||(23469818-23469871)
chr5 (447-477)||(27989004-27989034)
chr5 (16-57)||(18774616-18774657)
chr5 (16-45)||(20232954-20232983)
chr5 (17-78)||(24493986-24494047)
chr5 (147-183)||(5888946-5888982)
chr5 (281-329)||(22412340-22412388)
chr5 (147-183)||(22959304-22959340)
chr5 (147-183)||(25744035-25744071)
chr5 (134-182)||(36154586-36154634)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (17-358)||(21714684-21715026)
chr1 (1-302)||(42864838-42865139)
chr1 (17-492)||(22468339-22468816)
chr1 (1-355)||(21787669-21788023)
chr1 (1-302)||(22831005-22831306)
chr1 (1-302)||(6152046-6152347)
chr1 (1-301)||(21022830-21023130)
chr1 (288-493)||(38801304-38801508)
chr1 (1-302)||(18181748-18182049)
chr1 (275-493)||(27250629-27250850)
chr1 (1-302)||(3472553-3472853)
chr1 (1-188)||(22432410-22432597)
chr1 (130-302)||(20091229-20091401)
chr1 (275-493)||(21026680-21026901)
chr1 (280-492)||(50210118-50210333)
chr1 (21-201)||(8761280-8761460)
chr1 (280-490)||(34509783-34509996)
chr1 (190-357)||(48603652-48603820)
chr1 (1-202)||(36818946-36819137)
chr1 (14-201)||(45489394-45489571)
chr1 (16-202)||(21305591-21305767)
chr1 (21-202)||(17678245-17678416)
chr1 (292-493)||(22532269-22532473)
chr1 (16-202)||(24782753-24782929)
chr1 (16-202)||(33797810-33797986)
chr1 (16-201)||(12647147-12647322)
chr1 (129-202)||(16080200-16080273)
chr1 (393-493)||(20847173-20847275)
chr1 (145-302)||(22449037-22449194)
chr1 (13-201)||(45310016-45310194)
chr1 (421-493)||(14295600-14295672)
chr1 (1-200)||(20228447-20228636)
chr1 (280-418)||(22354477-22354616)
chr1 (380-493)||(45574893-45575008)
chr1 (16-202)||(19212144-19212320)
chr1 (16-198)||(20138364-20138536)
chr1 (15-197)||(33049739-33049911)
chr1 (16-200)||(23818952-23819126)
chr1 (376-477)||(21896258-21896361)
chr1 (421-489)||(22921918-22921986)
chr1 (118-201)||(46975745-46975828)
chr1 (16-201)||(18882645-18882820)
chr1 (280-492)||(20135188-20135403)
chr1 (421-493)||(33681010-33681079)
chr1 (23-200)||(52639821-52639988)
chr1 (13-201)||(18393613-18393791)
chr1 (116-200)||(16375200-16375284)
chr1 (116-200)||(21407635-21407719)
chr1 (376-477)||(21861572-21861675)
chr1 (421-474)||(16758668-16758721)
chr1 (421-474)||(20918623-20918676)
chr1 (421-474)||(21754064-21754117)
chr1 (116-192)||(21438081-21438157)
chr1 (118-198)||(21615718-21615798)
chr1 (116-192)||(23763498-23763574)
chr1 (421-477)||(35261127-35261183)
chr1 (422-477)||(50614167-50614222)
chr1 (422-477)||(50621995-50622050)
chr1 (425-493)||(22237630-22237695)
chr1 (421-493)||(52928019-52928088)
chr1 (424-477)||(16368338-16368391)
chr1 (17-78)||(22355827-22355888)
chr1 (17-78)||(22357513-22357574)
chr1 (421-489)||(20248283-20248351)
chr1 (424-492)||(20454606-20454673)
chr1 (380-490)||(13988866-13988977)
chr1 (380-490)||(21923342-21923453)
chr1 (380-490)||(23593786-23593897)
chr1 (19-78)||(27250384-27250443)
chr1 (376-490)||(31612313-31612428)
chr1 (440-493)||(13212974-13213027)
chr1 (17-78)||(21301180-21301241)
chr1 (13-78)||(21754453-21754518)
chr1 (420-477)||(41050084-41050141)
chr1 (12-108)||(20846867-20846963)
chr1 (440-496)||(21342090-21342146)
chr1 (380-491)||(21840766-21840878)
chr1 (380-490)||(21475138-21475249)
chr1 (431-474)||(22123171-22123214)
chr1 (17-108)||(22354214-22354305)
chr1 (431-490)||(29298137-29298195)
chr1 (431-490)||(29776688-29776746)
chr1 (376-490)||(433012-433125)
chr1 (440-490)||(21346961-21347011)
chr1 (440-490)||(21707167-21707217)
chr1 (440-490)||(21711709-21711759)
chr1 (280-384)||(22356079-22356185)
chr1 (280-384)||(22357765-22357871)
chr1 (423-477)||(50686627-50686681)
chr1 (17-78)||(22532687-22532748)
chr1 (17-78)||(22921509-22921570)
chr1 (17-78)||(34510198-34510259)
chr1 (17-78)||(52927623-52927684)
chr1 (145-301)||(1010901-1011057)
chr1 (440-496)||(15860121-15860177)
chr1 (12-108)||(21027057-21027153)
chr1 (8-60)||(21162164-21162216)
chr1 (14-78)||(38801041-38801105)
chr1 (17-60)||(433443-433486)
chr1 (1-108)||(3704724-3704831)
chr1 (420-475)||(16093933-16093988)
chr1 (422-477)||(26064954-26065009)
chr1 (17-60)||(43697796-43697839)
chr1 (442-492)||(16361915-16361965)
chr1 (14-60)||(20091113-20091159)
chr1 (12-78)||(20135605-20135671)
chr1 (17-107)||(20918990-20919080)
chr1 (17-78)||(20248695-20248756)
chr1 (16-57)||(21615849-21615890)
chr1 (424-489)||(21714546-21714610)
chr1 (17-78)||(33681427-33681488)
chr1 (16-53)||(46975883-46975920)
chr1 (395-490)||(16275430-16275526)
chr1 (145-192)||(19063807-19063854)
chr1 (145-192)||(19105040-19105087)
chr1 (145-192)||(19111697-19111744)
chr1 (17-60)||(22238065-22238108)
chr1 (431-489)||(21161720-21161778)
chr1 (448-478)||(21533948-21533978)
chr1 (375-440)||(33797573-33797639)
chr1 (145-190)||(20524987-20525032)
chr1 (130-182)||(433322-433374)
chr1 (1-53)||(16080082-16080134)
chr1 (147-183)||(20637164-20637200)
chr1 (144-184)||(21162078-21162118)
chr1 (440-492)||(24783160-24783212)
[»] chr7 (173 HSPs)
chr7 (1-489)||(17137690-17138177)
chr7 (17-358)||(18154479-18154821)
chr7 (1-489)||(12187019-12187506)
chr7 (1-302)||(9703458-9703759)
chr7 (17-358)||(19649127-19649469)
chr7 (12-345)||(24054618-24054950)
chr7 (1-290)||(11880456-11880745)
chr7 (288-493)||(27847746-27847951)
chr7 (1-298)||(12321369-12321666)
chr7 (1-210)||(10508709-10508918)
chr7 (280-491)||(40443393-40443605)
chr7 (1-302)||(14430070-14430371)
chr7 (1-208)||(2760413-2760620)
chr7 (280-493)||(12698831-12699048)
chr7 (280-493)||(9509189-9509405)
chr7 (275-493)||(16386147-16386369)
chr7 (280-493)||(10589039-10589254)
chr7 (275-493)||(26211995-26212217)
chr7 (1-161)||(15211761-15211921)
chr7 (281-490)||(18456319-18456530)
chr7 (1-202)||(11312925-11313116)
chr7 (1-202)||(15580968-15581160)
chr7 (280-493)||(38227481-38227696)
chr7 (280-490)||(3564269-3564482)
chr7 (1-202)||(12318404-12318595)
chr7 (1-201)||(26292673-26292863)
chr7 (421-493)||(16495402-16495474)
chr7 (421-493)||(28505347-28505419)
chr7 (421-493)||(34200786-34200858)
chr7 (16-202)||(48593109-48593285)
chr7 (380-493)||(13647325-13647440)
chr7 (16-200)||(13149433-13149607)
chr7 (118-210)||(18803-18895)
chr7 (118-202)||(11987489-11987573)
chr7 (118-202)||(13635214-13635298)
chr7 (1-108)||(3272173-3272280)
chr7 (17-202)||(15604926-15605101)
chr7 (421-493)||(67745-67817)
chr7 (118-201)||(6801490-6801573)
chr7 (16-202)||(9593622-9593798)
chr7 (16-202)||(9644585-9644761)
chr7 (119-201)||(16438780-16438862)
chr7 (13-197)||(9445808-9445982)
chr7 (116-201)||(18557249-18557334)
chr7 (421-493)||(11996076-11996148)
chr7 (376-490)||(48273392-48273508)
chr7 (118-200)||(15728603-15728685)
chr7 (421-489)||(811180-811248)
chr7 (116-200)||(12718948-12719032)
chr7 (116-200)||(12723859-12723943)
chr7 (374-493)||(16219717-16219835)
chr7 (116-200)||(16906943-16907027)
chr7 (421-489)||(18005650-18005718)
chr7 (116-200)||(18279683-18279767)
chr7 (116-200)||(18283646-18283730)
chr7 (421-489)||(44014182-44014250)
chr7 (421-493)||(47831807-47831879)
chr7 (118-201)||(14217192-14217275)
chr7 (13-108)||(40443765-40443860)
chr7 (17-199)||(42205394-42205566)
chr7 (16-201)||(8917704-8917879)
chr7 (16-201)||(13462039-13462214)
chr7 (13-107)||(34201172-34201266)
chr7 (376-474)||(2280121-2280221)
chr7 (15-108)||(15754527-15754620)
chr7 (13-197)||(20569246-20569420)
chr7 (116-192)||(11262615-11262691)
chr7 (116-192)||(11548010-11548086)
chr7 (116-192)||(11554606-11554682)
chr7 (116-192)||(12692782-12692858)
chr7 (116-200)||(12715144-12715228)
chr7 (116-192)||(14953484-14953560)
chr7 (421-493)||(15754936-15755008)
chr7 (116-200)||(16114521-16114605)
chr7 (116-200)||(16117674-16117758)
chr7 (17-108)||(12756359-12756450)
chr7 (344-490)||(16213684-16213831)
chr7 (118-201)||(16724376-16724459)
chr7 (17-108)||(17061602-17061693)
chr7 (118-201)||(17701390-17701473)
chr7 (13-60)||(27847482-27847529)
chr7 (12-78)||(16385895-16385961)
chr7 (13-78)||(11995696-11995761)
chr7 (380-490)||(17061966-17062077)
chr7 (116-192)||(14959450-14959526)
chr7 (118-198)||(16275772-16275852)
chr7 (425-493)||(22072913-22072981)
chr7 (116-192)||(25038953-25039029)
chr7 (380-490)||(456321-456432)
chr7 (380-490)||(11972496-11972607)
chr7 (380-490)||(14949173-14949284)
chr7 (380-490)||(15376764-15376875)
chr7 (380-490)||(16232520-16232631)
chr7 (380-490)||(16410059-16410170)
chr7 (380-490)||(18640272-18640383)
chr7 (380-490)||(20385174-20385285)
chr7 (380-490)||(21189646-21189757)
chr7 (380-474)||(24275187-24275282)
chr7 (12-107)||(28504938-28505033)
chr7 (380-490)||(32125491-32125602)
chr7 (17-108)||(38227868-38227959)
chr7 (380-490)||(41522917-41523028)
chr7 (380-490)||(41525379-41525490)
chr7 (380-489)||(11393338-11393448)
chr7 (431-493)||(18430709-18430770)
chr7 (380-490)||(24704688-24704796)
chr7 (17-78)||(9509607-9509668)
chr7 (17-78)||(12699250-12699311)
chr7 (417-474)||(12901342-12901399)
chr7 (145-301)||(70537-70693)
chr7 (145-301)||(74646-74802)
chr7 (422-474)||(14044765-14044817)
chr7 (422-474)||(14354795-14354847)
chr7 (12-60)||(26212421-26212469)
chr7 (17-60)||(2831948-2831991)
chr7 (431-490)||(3386333-3386391)
chr7 (17-60)||(9751192-9751235)
chr7 (376-474)||(16056347-16056446)
chr7 (422-477)||(20220238-20220293)
chr7 (431-490)||(24702238-24702296)
chr7 (380-490)||(27216860-27216971)
chr7 (139-190)||(35151894-35151945)
chr7 (380-490)||(44116509-44116620)
chr7 (420-474)||(1868043-1868097)
chr7 (421-471)||(12255842-12255892)
chr7 (440-490)||(13869346-13869396)
chr7 (16-161)||(16583552-16583687)
chr7 (440-490)||(20110556-20110606)
chr7 (17-78)||(3564006-3564067)
chr7 (420-477)||(15008547-15008604)
chr7 (17-78)||(18006059-18006120)
chr7 (420-477)||(48991196-48991253)
chr7 (145-301)||(33285-33441)
chr7 (421-493)||(10063867-10063939)
chr7 (1-53)||(13635107-13635159)
chr7 (430-474)||(15144096-15144139)
chr7 (421-493)||(19486793-19486865)
chr7 (17-60)||(810771-810814)
chr7 (422-465)||(14036282-14036325)
chr7 (422-465)||(14346312-14346355)
chr7 (415-474)||(18154885-18154943)
chr7 (17-60)||(18302614-18302657)
chr7 (17-60)||(39267288-39267331)
chr7 (440-490)||(13831373-13831423)
chr7 (7-53)||(17701289-17701335)
chr7 (16-53)||(11043-11080)
chr7 (16-53)||(18711-18748)
chr7 (16-57)||(6801624-6801665)
chr7 (16-57)||(11987624-11987665)
chr7 (16-57)||(15728736-15728777)
chr7 (16-57)||(16275903-16275944)
chr7 (16-53)||(16724284-16724321)
chr7 (16-53)||(35152021-35152058)
chr7 (164-201)||(39722544-39722581)
chr7 (17-78)||(44014592-44014653)
chr7 (17-78)||(47832226-47832287)
chr7 (145-193)||(4318317-4318365)
chr7 (24-108)||(15143686-15143770)
chr7 (375-440)||(2530139-2530205)
chr7 (424-478)||(9177718-9177772)
chr7 (142-192)||(18531531-18531581)
chr7 (440-474)||(38898489-38898523)
chr7 (17-78)||(68164-68225)
chr7 (29-78)||(2529631-2529680)
chr7 (16-53)||(16438687-16438724)
chr7 (16-57)||(18557383-18557424)
chr7 (440-489)||(19649557-19649606)
chr7 (147-183)||(68060-68096)
chr7 (147-187)||(810900-810940)
chr7 (440-492)||(2832509-2832561)
chr7 (147-183)||(9389466-9389502)
chr7 (147-187)||(18302489-18302529)
chr7 (130-182)||(44116820-44116872)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-477)||(26840-27315)
[»] chr2 (130 HSPs)
chr2 (1-489)||(40621835-40622327)
chr2 (17-301)||(23038227-23038511)
chr2 (12-358)||(22740598-22740945)
chr2 (288-493)||(20309108-20309313)
chr2 (7-343)||(22798759-22799094)
chr2 (12-358)||(22758353-22758700)
chr2 (1-297)||(45677782-45678078)
chr2 (9-301)||(23019341-23019633)
chr2 (1-302)||(21917943-21918244)
chr2 (1-301)||(24673768-24674068)
chr2 (1-302)||(25963344-25963645)
chr2 (17-236)||(23100873-23101092)
chr2 (280-493)||(38021-38235)
chr2 (1-302)||(37524856-37525156)
chr2 (232-493)||(23103254-23103516)
chr2 (275-493)||(23285865-23286082)
chr2 (280-493)||(22731139-22731355)
chr2 (275-490)||(298714-298933)
chr2 (275-493)||(23654286-23654507)
chr2 (280-493)||(22738085-22738300)
chr2 (1-153)||(22811561-22811713)
chr2 (280-493)||(23076442-23076658)
chr2 (27-208)||(44369952-44370133)
chr2 (1-101)||(24658032-24658132)
chr2 (280-493)||(23060513-23060728)
chr2 (280-493)||(22337115-22337331)
chr2 (254-493)||(23660023-23660264)
chr2 (13-197)||(24175093-24175267)
chr2 (14-197)||(24654989-24655162)
chr2 (21-208)||(24716188-24716365)
chr2 (16-201)||(22460843-22461018)
chr2 (13-197)||(24870173-24870347)
chr2 (16-202)||(24735680-24735856)
chr2 (16-201)||(40428753-40428929)
chr2 (16-200)||(19928155-19928329)
chr2 (116-200)||(15477883-15477967)
chr2 (1-200)||(21318273-21318462)
chr2 (1-200)||(21327204-21327393)
chr2 (16-201)||(23598616-23598791)
chr2 (421-493)||(23071998-23072070)
chr2 (380-490)||(22105412-22105524)
chr2 (16-201)||(23187353-23187528)
chr2 (116-201)||(18855204-18855289)
chr2 (421-489)||(7679589-7679657)
chr2 (417-493)||(8946657-8946732)
chr2 (116-200)||(12901255-12901339)
chr2 (118-202)||(19688501-19688585)
chr2 (116-200)||(24649636-24649720)
chr2 (116-200)||(27379175-27379259)
chr2 (116-200)||(27383221-27383305)
chr2 (421-488)||(28405981-28406048)
chr2 (118-200)||(61094-61176)
chr2 (170-302)||(22811708-22811839)
chr2 (420-477)||(23207293-23207350)
chr2 (139-200)||(27602076-27602137)
chr2 (421-493)||(19671830-19671902)
chr2 (429-493)||(23040247-23040310)
chr2 (116-200)||(24628221-24628305)
chr2 (421-489)||(25175854-25175922)
chr2 (129-197)||(25961290-25961358)
chr2 (116-200)||(41530752-41530836)
chr2 (421-492)||(22134256-22134326)
chr2 (13-60)||(28291940-28291987)
chr2 (13-78)||(37765-37830)
chr2 (17-78)||(32451571-32451632)
chr2 (376-477)||(7735-7838)
chr2 (118-198)||(26125484-26125564)
chr2 (118-198)||(41667230-41667310)
chr2 (380-490)||(571397-571508)
chr2 (380-490)||(18808943-18809054)
chr2 (422-477)||(20520243-20520298)
chr2 (380-490)||(23130862-23130973)
chr2 (380-490)||(23133329-23133440)
chr2 (380-490)||(23135590-23135701)
chr2 (17-108)||(23660410-23660501)
chr2 (380-490)||(23709583-23709694)
chr2 (380-490)||(23712064-23712175)
chr2 (380-490)||(26505379-26505490)
chr2 (380-490)||(26507857-26507968)
chr2 (380-490)||(34402573-34402684)
chr2 (380-490)||(39682313-39682424)
chr2 (393-490)||(6725995-6726093)
chr2 (17-78)||(298457-298518)
chr2 (421-474)||(18786952-18787005)
chr2 (13-58)||(20309532-20309577)
chr2 (17-78)||(22133859-22133920)
chr2 (420-477)||(22413186-22413243)
chr2 (17-78)||(23286268-23286329)
chr2 (17-78)||(23654052-23654113)
chr2 (421-474)||(23708668-23708721)
chr2 (380-492)||(32214972-32215085)
chr2 (424-476)||(32451981-32452033)
chr2 (17-60)||(22737822-22737865)
chr2 (422-477)||(23004764-23004819)
chr2 (380-474)||(24367790-24367885)
chr2 (422-477)||(25108903-25108958)
chr2 (440-490)||(28577099-28577149)
chr2 (440-490)||(38967374-38967424)
chr2 (440-490)||(45029966-45030016)
chr2 (395-487)||(21155126-21155219)
chr2 (17-78)||(22730875-22730936)
chr2 (26-107)||(23071614-23071695)
chr2 (16-53)||(27263667-27263704)
chr2 (17-78)||(27753993-27754054)
chr2 (431-488)||(43137301-43137357)
chr2 (422-478)||(23287378-23287433)
chr2 (139-187)||(24503402-24503450)
chr2 (431-487)||(24643054-24643109)
chr2 (380-490)||(24898246-24898358)
chr2 (380-490)||(24900729-24900841)
chr2 (380-490)||(24903206-24903318)
chr2 (380-490)||(24905683-24905795)
chr2 (380-490)||(24908158-24908270)
chr2 (422-477)||(23791289-23791344)
chr2 (17-60)||(25176278-25176321)
chr2 (423-478)||(26392397-26392451)
chr2 (380-490)||(32039549-32039660)
chr2 (440-490)||(24529641-24529691)
chr2 (16-57)||(26125615-26125656)
chr2 (16-57)||(41667361-41667402)
chr2 (17-60)||(23076876-23076919)
chr2 (422-477)||(24697657-24697712)
chr2 (145-192)||(27197172-27197219)
chr2 (20-54)||(22337557-22337591)
chr2 (170-200)||(27263552-27263582)
chr2 (16-57)||(61227-61268)
chr2 (145-201)||(10101417-10101473)
chr2 (1-53)||(10327273-10327325)
chr2 (17-45)||(18855115-18855143)
chr2 (147-183)||(31756231-31756267)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-489)||(21433-21920)
scaffold0210 (1-489)||(29325-29812)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (17-358)||(36592-36934)
scaffold0131 (440-489)||(36454-36503)
[»] chr4 (159 HSPs)
chr4 (1-407)||(15121430-15121834)
chr4 (1-302)||(13569703-13570004)
chr4 (1-355)||(15093911-15094265)
chr4 (280-493)||(17046487-17046700)
chr4 (1-302)||(44675823-44676124)
chr4 (1-302)||(23843669-23843971)
chr4 (1-302)||(12570212-12570513)
chr4 (1-302)||(16356580-16356881)
chr4 (10-302)||(15124790-15125081)
chr4 (280-493)||(14053207-14053422)
chr4 (1-301)||(16487705-16488005)
chr4 (275-493)||(12902757-12902978)
chr4 (275-493)||(7088877-7089098)
chr4 (280-491)||(22636437-22636650)
chr4 (280-493)||(44052829-44053045)
chr4 (1-202)||(36133600-36133791)
chr4 (275-486)||(23374259-23374473)
chr4 (280-490)||(16377428-16377639)
chr4 (288-493)||(16270149-16270356)
chr4 (312-493)||(7798774-7798958)
chr4 (1-124)||(16348319-16348442)
chr4 (13-201)||(11250211-11250389)
chr4 (281-488)||(14038653-14038863)
chr4 (16-193)||(16243053-16243220)
chr4 (280-493)||(16239875-16240090)
chr4 (1-200)||(2015057-2015246)
chr4 (14-201)||(15352957-15353134)
chr4 (421-493)||(15551817-15551889)
chr4 (324-493)||(6899891-6900062)
chr4 (280-493)||(7893703-7893916)
chr4 (13-197)||(16351498-16351672)
chr4 (13-197)||(25555798-25555972)
chr4 (417-493)||(3096293-3096368)
chr4 (116-200)||(9556809-9556893)
chr4 (374-493)||(52873367-52873488)
chr4 (16-202)||(1951414-1951590)
chr4 (16-201)||(18237170-18237345)
chr4 (16-201)||(26243318-26243493)
chr4 (16-200)||(18222031-18222205)
chr4 (118-199)||(19757346-19757427)
chr4 (118-199)||(19782379-19782460)
chr4 (116-201)||(45938425-45938510)
chr4 (118-201)||(17152232-17152315)
chr4 (118-201)||(23139548-23139631)
chr4 (129-199)||(16678345-16678415)
chr4 (112-197)||(3413078-3413163)
chr4 (16-200)||(28569097-28569271)
chr4 (112-200)||(4561072-4561160)
chr4 (421-489)||(12774011-12774079)
chr4 (421-493)||(39706337-39706409)
chr4 (421-474)||(12288259-12288312)
chr4 (1-78)||(17047710-17047787)
chr4 (421-474)||(52243245-52243298)
chr4 (376-477)||(13853-13956)
chr4 (116-200)||(33742657-33742741)
chr4 (16-202)||(43255813-43255990)
chr4 (376-490)||(54798756-54798872)
chr4 (139-200)||(5756703-5756764)
chr4 (17-201)||(9530711-9530885)
chr4 (13-78)||(14052951-14053016)
chr4 (421-489)||(8846360-8846428)
chr4 (116-192)||(23838720-23838796)
chr4 (17-108)||(6190821-6190912)
chr4 (376-490)||(14280316-14280431)
chr4 (380-490)||(18215325-18215436)
chr4 (424-491)||(22353835-22353901)
chr4 (118-201)||(27534303-27534386)
chr4 (376-490)||(44928926-44929042)
chr4 (130-192)||(14685458-14685520)
chr4 (16-197)||(18602398-18602569)
chr4 (17-182)||(21814945-21815108)
chr4 (17-182)||(21815274-21815437)
chr4 (17-182)||(21818367-21818530)
chr4 (428-474)||(43198611-43198657)
chr4 (139-192)||(14679249-14679302)
chr4 (13-78)||(15552231-15552296)
chr4 (16-188)||(18608992-18609154)
chr4 (420-477)||(46640504-46640561)
chr4 (424-476)||(6190479-6190531)
chr4 (8-108)||(16597033-16597133)
chr4 (116-192)||(41385488-41385564)
chr4 (380-490)||(12358-12469)
chr4 (280-367)||(3096772-3096859)
chr4 (380-490)||(15118403-15118514)
chr4 (380-490)||(23803316-23803427)
chr4 (380-490)||(44615288-44615399)
chr4 (380-490)||(44773138-44773249)
chr4 (380-490)||(51463919-51464030)
chr4 (380-490)||(52312510-52312621)
chr4 (422-477)||(53082202-53082257)
chr4 (175-301)||(16348466-16348592)
chr4 (380-496)||(19242693-19242810)
chr4 (380-492)||(19618223-19618336)
chr4 (17-78)||(44102627-44102688)
chr4 (17-77)||(14039068-14039128)
chr4 (118-198)||(14708379-14708459)
chr4 (118-198)||(42997195-42997275)
chr4 (431-490)||(1837613-1837671)
chr4 (380-490)||(3515007-3515118)
chr4 (431-490)||(7641286-7641344)
chr4 (17-108)||(7799085-7799176)
chr4 (431-490)||(12610950-12611008)
chr4 (380-490)||(18239470-18239581)
chr4 (145-192)||(35614226-35614273)
chr4 (431-490)||(50222443-50222501)
chr4 (393-474)||(15355389-15355471)
chr4 (17-108)||(16239634-16239726)
chr4 (292-357)||(17047989-17048055)
chr4 (440-490)||(44102214-44102264)
chr4 (16-57)||(3413208-3413249)
chr4 (17-78)||(7089284-7089345)
chr4 (376-474)||(8574871-8574969)
chr4 (17-78)||(12774416-12774477)
chr4 (17-78)||(12903164-12903224)
chr4 (440-493)||(15367690-15367743)
chr4 (440-493)||(15370018-15370071)
chr4 (440-493)||(15371202-15371255)
chr4 (440-493)||(15373483-15373536)
chr4 (440-493)||(15402703-15402756)
chr4 (440-493)||(16223532-16223585)
chr4 (17-78)||(22636852-22636913)
chr4 (17-77)||(44053248-44053308)
chr4 (17-60)||(13812451-13812494)
chr4 (17-108)||(16377164-16377255)
chr4 (17-60)||(24029177-24029220)
chr4 (375-440)||(43256161-43256227)
chr4 (17-78)||(3097050-3097111)
chr4 (16-53)||(14708287-14708324)
chr4 (16-57)||(23139682-23139723)
chr4 (17-78)||(39705930-39705991)
chr4 (16-53)||(45938563-45938600)
chr4 (145-301)||(14757194-14757350)
chr4 (13-45)||(17053482-17053514)
chr4 (145-301)||(17810450-17810606)
chr4 (17-60)||(13844975-13845018)
chr4 (380-474)||(14970758-14970853)
chr4 (144-183)||(15190631-15190670)
chr4 (16-51)||(17152140-17152175)
chr4 (17-60)||(20156932-20156975)
chr4 (442-477)||(21815699-21815734)
chr4 (17-60)||(22633855-22633898)
chr4 (17-60)||(44928565-44928608)
chr4 (421-455)||(16596686-16596720)
chr4 (1-51)||(16678227-16678277)
chr4 (19-53)||(19757257-19757291)
chr4 (19-57)||(19782511-19782549)
chr4 (17-78)||(8846793-8846854)
chr4 (139-188)||(12522375-12522424)
chr4 (29-78)||(15868289-15868338)
chr4 (16-53)||(18228528-18228565)
chr4 (29-78)||(32851869-32851918)
chr4 (16-53)||(42997103-42997140)
chr4 (12-60)||(13410-13458)
chr4 (147-183)||(8846688-8846724)
chr4 (17-53)||(15091340-15091376)
chr4 (147-183)||(15099664-15099700)
chr4 (12-60)||(15099786-15099834)
chr4 (422-478)||(17333292-17333347)
chr4 (147-187)||(22633983-22634023)
[»] chr6 (162 HSPs)
chr6 (17-302)||(19863171-19863456)
chr6 (12-358)||(25641821-25642168)
chr6 (12-302)||(22432443-22432733)
chr6 (12-345)||(22438951-22439283)
chr6 (1-302)||(21739649-21739950)
chr6 (288-493)||(16920546-16920751)
chr6 (1-466)||(15041177-15041644)
chr6 (288-493)||(22831503-22831710)
chr6 (287-481)||(11185517-11185711)
chr6 (1-302)||(21834517-21834818)
chr6 (321-493)||(35245586-35245758)
chr6 (1-303)||(16523030-16523332)
chr6 (1-302)||(18907299-18907601)
chr6 (127-302)||(19873313-19873488)
chr6 (21-271)||(16924526-16924776)
chr6 (21-263)||(16964957-16965199)
chr6 (280-493)||(20360865-20361081)
chr6 (17-202)||(18180780-18180965)
chr6 (280-493)||(20638188-20638404)
chr6 (281-493)||(29060540-29060755)
chr6 (147-302)||(22334664-22334819)
chr6 (21-271)||(16929242-16929487)
chr6 (27-208)||(22059396-22059577)
chr6 (1-202)||(17804474-17804665)
chr6 (1-202)||(22429668-22429859)
chr6 (280-493)||(19303446-19303661)
chr6 (342-493)||(16496244-16496397)
chr6 (280-493)||(25629260-25629476)
chr6 (282-493)||(20593773-20593987)
chr6 (18-182)||(22405709-22405873)
chr6 (1-200)||(27567247-27567436)
chr6 (116-271)||(31164589-31164744)
chr6 (280-492)||(18409732-18409947)
chr6 (13-197)||(19790429-19790603)
chr6 (13-201)||(20907631-20907809)
chr6 (13-201)||(23657070-23657248)
chr6 (280-493)||(17287701-17287917)
chr6 (1-201)||(1644983-1645173)
chr6 (17-302)||(15894072-15894357)
chr6 (374-493)||(20076700-20076817)
chr6 (118-201)||(12706966-12707049)
chr6 (288-493)||(22780140-22780348)
chr6 (16-201)||(5616467-5616642)
chr6 (16-201)||(12496586-12496761)
chr6 (16-201)||(19663046-19663221)
chr6 (116-302)||(22863123-22863309)
chr6 (129-201)||(16741484-16741556)
chr6 (421-493)||(27333267-27333339)
chr6 (421-493)||(27394007-27394079)
chr6 (118-202)||(27415687-27415771)
chr6 (21-201)||(27553265-27553435)
chr6 (1-200)||(9481931-9482120)
chr6 (117-301)||(14472448-14472632)
chr6 (7-202)||(25766812-25766997)
chr6 (421-493)||(28496520-28496592)
chr6 (421-493)||(29808931-29809003)
chr6 (118-200)||(1587476-1587558)
chr6 (16-197)||(22592457-22592628)
chr6 (116-200)||(8244140-8244224)
chr6 (116-200)||(11567142-11567226)
chr6 (118-198)||(21702568-21702648)
chr6 (116-200)||(23395348-23395432)
chr6 (13-108)||(1561691-1561786)
chr6 (17-108)||(18821472-18821563)
chr6 (118-201)||(18955508-18955591)
chr6 (344-490)||(22782227-22782374)
chr6 (393-490)||(25656629-25656727)
chr6 (421-474)||(9098563-9098616)
chr6 (13-78)||(16920282-16920347)
chr6 (139-200)||(19870870-19870931)
chr6 (421-474)||(25644339-25644392)
chr6 (421-493)||(1561303-1561375)
chr6 (116-200)||(12618587-12618671)
chr6 (116-200)||(18917009-18917093)
chr6 (421-489)||(19652199-19652267)
chr6 (116-200)||(23990200-23990284)
chr6 (118-193)||(25135417-25135492)
chr6 (17-187)||(28496115-28496284)
chr6 (421-474)||(20109157-20109210)
chr6 (17-78)||(20637936-20637997)
chr6 (137-197)||(20803317-20803377)
chr6 (380-490)||(1595549-1595660)
chr6 (380-490)||(12742317-12742428)
chr6 (380-490)||(18334643-18334754)
chr6 (17-108)||(18457102-18457193)
chr6 (380-490)||(19005046-19005157)
chr6 (380-490)||(19858970-19859081)
chr6 (380-490)||(20556943-20557054)
chr6 (380-490)||(24422547-24422658)
chr6 (380-490)||(25754809-25754920)
chr6 (17-108)||(29808525-29808616)
chr6 (380-490)||(33861794-33861905)
chr6 (380-490)||(33864278-33864389)
chr6 (17-107)||(19303183-19303273)
chr6 (428-474)||(19668390-19668436)
chr6 (431-493)||(25714417-25714478)
chr6 (17-78)||(17287438-17287499)
chr6 (17-78)||(22779869-22779930)
chr6 (13-54)||(22831933-22831974)
chr6 (421-493)||(23019408-23019478)
chr6 (422-475)||(23076748-23076801)
chr6 (17-78)||(25611365-25611426)
chr6 (380-492)||(30676761-30676874)
chr6 (422-475)||(35008166-35008219)
chr6 (8-60)||(4667846-4667898)
chr6 (8-60)||(4674693-4674745)
chr6 (1-53)||(20803190-20803242)
chr6 (8-60)||(31155031-31155083)
chr6 (431-490)||(2291284-2291342)
chr6 (431-490)||(8055029-8055087)
chr6 (446-493)||(22080799-22080846)
chr6 (141-192)||(25928584-25928635)
chr6 (431-490)||(26924744-26924802)
chr6 (416-470)||(4185865-4185919)
chr6 (431-477)||(18456732-18456777)
chr6 (431-477)||(18461892-18461937)
chr6 (431-477)||(18821904-18821949)
chr6 (18-60)||(22334525-22334567)
chr6 (420-478)||(33443062-33443119)
chr6 (380-492)||(34963371-34963484)
chr6 (8-60)||(4185456-4185508)
chr6 (8-60)||(4189392-4189444)
chr6 (421-493)||(8227560-8227632)
chr6 (395-474)||(25688518-25688598)
chr6 (431-490)||(1541015-1541073)
chr6 (431-490)||(3852121-3852179)
chr6 (13-60)||(11185927-11185974)
chr6 (393-487)||(16448591-16448686)
chr6 (17-60)||(21939819-21939862)
chr6 (21-60)||(29060976-29061015)
chr6 (16-78)||(20360612-20360674)
chr6 (321-440)||(27415887-27416008)
chr6 (142-192)||(34369742-34369792)
chr6 (16-53)||(1587384-1587421)
chr6 (16-53)||(2684994-2685031)
chr6 (16-57)||(12707100-12707141)
chr6 (16-57)||(16741619-16741660)
chr6 (17-78)||(19652613-19652674)
chr6 (16-57)||(21702699-21702740)
chr6 (17-57)||(18409469-18409509)
chr6 (145-192)||(16372146-16372193)
chr6 (427-478)||(18199473-18199523)
chr6 (145-192)||(22331727-22331774)
chr6 (29-60)||(23019843-23019874)
chr6 (17-60)||(27332926-27332969)
chr6 (17-60)||(27393666-27393709)
chr6 (6-49)||(29096136-29096179)
chr6 (416-470)||(4186390-4186444)
chr6 (415-489)||(19873120-19873193)
chr6 (415-489)||(22432249-22432322)
chr6 (415-489)||(22438799-22438872)
chr6 (145-191)||(34298395-34298441)
chr6 (440-489)||(19862978-19863027)
chr6 (16-53)||(25135325-25135362)
chr6 (17-58)||(25644760-25644801)
chr6 (130-187)||(29808638-29808695)
chr6 (147-183)||(4185594-4185630)
chr6 (147-183)||(4667984-4668020)
chr6 (116-192)||(19808814-19808890)
chr6 (17-57)||(20594212-20594252)
chr6 (147-183)||(22080508-22080544)
chr6 (17-53)||(27415596-27415632)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (1-395)||(12857-13250)
scaffold0029 (139-200)||(61378-61439)
scaffold0029 (116-193)||(65271-65348)
scaffold0029 (380-473)||(11305-11399)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-489)||(1881-2368)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (17-358)||(69930-70272)
scaffold0004 (1-202)||(10222-10413)
scaffold0004 (116-192)||(58161-58237)
scaffold0004 (415-489)||(69794-69867)
[»] chr3 (192 HSPs)
chr3 (1-489)||(856140-856627)
chr3 (17-273)||(15877471-15877727)
chr3 (17-345)||(23408581-23408907)
chr3 (1-301)||(15060483-15060783)
chr3 (1-301)||(15051707-15052007)
chr3 (1-302)||(23077105-23077406)
chr3 (1-302)||(12496445-12496746)
chr3 (1-301)||(14878132-14878433)
chr3 (1-208)||(16369692-16369899)
chr3 (1-210)||(12173068-12173277)
chr3 (1-302)||(18383544-18383845)
chr3 (1-302)||(322779-323080)
chr3 (1-278)||(11298156-11298433)
chr3 (1-298)||(19725539-19725836)
chr3 (1-302)||(17524801-17525080)
chr3 (1-264)||(23052704-23052967)
chr3 (280-493)||(20698341-20698556)
chr3 (1-208)||(26190636-26190843)
chr3 (275-493)||(12399209-12399430)
chr3 (17-208)||(12037596-12037787)
chr3 (280-493)||(13442274-13442490)
chr3 (280-493)||(17487856-17488072)
chr3 (280-493)||(14972854-14973070)
chr3 (280-493)||(17499338-17499554)
chr3 (1-149)||(321641-321789)
chr3 (34-302)||(11862981-11863247)
chr3 (1-240)||(11851825-11852062)
chr3 (288-493)||(18438534-18438742)
chr3 (1-202)||(15849723-15849914)
chr3 (1-201)||(326802-326992)
chr3 (13-199)||(1982460-1982636)
chr3 (280-493)||(26686887-26687103)
chr3 (280-474)||(14576738-14576934)
chr3 (13-201)||(11594789-11594967)
chr3 (281-490)||(24153115-24153326)
chr3 (16-202)||(7792999-7793175)
chr3 (280-493)||(23083266-23083482)
chr3 (280-493)||(43840932-43841148)
chr3 (6-195)||(3402598-3402777)
chr3 (1-202)||(15482939-15483130)
chr3 (1-202)||(20461138-20461329)
chr3 (242-357)||(14179570-14179686)
chr3 (137-301)||(16909941-16910105)
chr3 (280-493)||(25476290-25476506)
chr3 (1-202)||(31097192-31097383)
chr3 (118-202)||(16797799-16797883)
chr3 (280-493)||(11424668-11424880)
chr3 (16-201)||(1598133-1598308)
chr3 (16-201)||(11300164-11300339)
chr3 (16-201)||(17242250-17242425)
chr3 (16-201)||(42326222-42326397)
chr3 (421-493)||(13210376-13210448)
chr3 (13-200)||(16697071-16697248)
chr3 (118-202)||(16808626-16808710)
chr3 (118-201)||(38814662-38814745)
chr3 (116-201)||(15941647-15941732)
chr3 (288-474)||(42386429-42386619)
chr3 (13-200)||(16690498-16690675)
chr3 (280-490)||(40213626-40213838)
chr3 (421-489)||(49668125-49668193)
chr3 (116-201)||(3833952-3834037)
chr3 (118-202)||(2897568-2897652)
chr3 (421-489)||(9512924-9512992)
chr3 (421-489)||(9520899-9520967)
chr3 (15-197)||(11557037-11557208)
chr3 (421-489)||(12174308-12174376)
chr3 (116-192)||(20723288-20723364)
chr3 (118-200)||(11855015-11855097)
chr3 (280-474)||(14572608-14572804)
chr3 (421-493)||(15470927-15470996)
chr3 (421-474)||(32307696-32307749)
chr3 (116-200)||(7109981-7110065)
chr3 (116-200)||(7113916-7114000)
chr3 (116-200)||(22337002-22337086)
chr3 (116-200)||(27409386-27409470)
chr3 (421-477)||(52523778-52523834)
chr3 (428-490)||(28194693-28194755)
chr3 (380-493)||(43550529-43550644)
chr3 (17-182)||(53070341-53070504)
chr3 (13-78)||(14179740-14179805)
chr3 (421-490)||(27165250-27165319)
chr3 (376-490)||(36166598-36166712)
chr3 (421-493)||(14234487-14234559)
chr3 (425-489)||(16097332-16097396)
chr3 (421-489)||(16103784-16103852)
chr3 (116-200)||(22321947-22322031)
chr3 (116-192)||(24188064-24188140)
chr3 (380-490)||(9707658-9707769)
chr3 (17-108)||(11424405-11424496)
chr3 (380-490)||(17672626-17672737)
chr3 (422-477)||(22110402-22110457)
chr3 (380-490)||(29172634-29172745)
chr3 (422-477)||(43925974-43926029)
chr3 (12-78)||(12399613-12399679)
chr3 (420-489)||(37251216-37251283)
chr3 (139-200)||(15617656-15617717)
chr3 (421-490)||(53301600-53301669)
chr3 (116-201)||(55149256-55149341)
chr3 (378-490)||(55500942-55501055)
chr3 (13-57)||(13209966-13210010)
chr3 (16-182)||(14572903-14573068)
chr3 (1-57)||(17674202-17674258)
chr3 (421-493)||(24340772-24340844)
chr3 (17-108)||(3389600-3389691)
chr3 (380-490)||(6469185-6469296)
chr3 (380-490)||(7781398-7781509)
chr3 (380-490)||(17463178-17463289)
chr3 (380-490)||(28848662-28848773)
chr3 (380-490)||(34159326-34159437)
chr3 (380-490)||(45606958-45607069)
chr3 (380-490)||(55476491-55476602)
chr3 (12-78)||(20698084-20698150)
chr3 (424-477)||(606378-606431)
chr3 (17-78)||(14973272-14973333)
chr3 (17-78)||(18438952-18439013)
chr3 (376-474)||(21618465-21618563)
chr3 (139-200)||(28950007-28950068)
chr3 (420-476)||(12377938-12377994)
chr3 (429-477)||(53070755-53070802)
chr3 (17-60)||(4588457-4588500)
chr3 (380-490)||(8899094-8899205)
chr3 (19-78)||(9513328-9513387)
chr3 (19-78)||(9521303-9521362)
chr3 (17-60)||(12340188-12340231)
chr3 (431-490)||(15977515-15977573)
chr3 (380-490)||(16454332-16454443)
chr3 (13-60)||(16809821-16809868)
chr3 (6-172)||(16862823-16862979)
chr3 (17-108)||(17247928-17248019)
chr3 (431-490)||(17737236-17737294)
chr3 (17-60)||(32308104-32308147)
chr3 (380-474)||(38961942-38962037)
chr3 (142-192)||(839533-839583)
chr3 (440-490)||(8499518-8499568)
chr3 (440-490)||(10556985-10557035)
chr3 (393-490)||(12119789-12119887)
chr3 (440-490)||(15412429-15412479)
chr3 (440-490)||(45577950-45578000)
chr3 (17-78)||(12933952-12934013)
chr3 (431-488)||(16282915-16282971)
chr3 (17-58)||(23083003-23083044)
chr3 (421-474)||(23274706-23274759)
chr3 (17-78)||(26687305-26687366)
chr3 (147-192)||(28350935-28350980)
chr3 (17-78)||(40213363-40213424)
chr3 (17-78)||(49389286-49389347)
chr3 (380-490)||(13151841-13151953)
chr3 (380-490)||(13154306-13154418)
chr3 (431-491)||(13544024-13544083)
chr3 (18-78)||(30030246-30030306)
chr3 (421-493)||(37642314-37642386)
chr3 (440-488)||(41123892-41123940)
chr3 (380-490)||(10247774-10247885)
chr3 (431-474)||(12567576-12567618)
chr3 (17-60)||(14576475-14576518)
chr3 (380-490)||(17446706-17446816)
chr3 (431-474)||(50242838-50242880)
chr3 (17-59)||(43842615-43842657)
chr3 (440-490)||(44494809-44494859)
chr3 (17-78)||(12171759-12171820)
chr3 (16-53)||(15941557-15941594)
chr3 (17-78)||(16104198-16104259)
chr3 (16-53)||(16797707-16797744)
chr3 (17-78)||(17247162-17247223)
chr3 (17-78)||(17499757-17499818)
chr3 (17-78)||(25476027-25476088)
chr3 (16-57)||(38814796-38814837)
chr3 (157-201)||(3389719-3389763)
chr3 (145-301)||(11070249-11070405)
chr3 (147-187)||(13210098-13210138)
chr3 (422-478)||(13919344-13919399)
chr3 (282-357)||(16796685-16796761)
chr3 (18-78)||(17488275-17488335)
chr3 (145-301)||(30066127-30066283)
chr3 (17-60)||(1644325-1644368)
chr3 (17-60)||(14666041-14666084)
chr3 (17-60)||(14669196-14669239)
chr3 (17-60)||(14735554-14735597)
chr3 (17-60)||(15471360-15471403)
chr3 (415-489)||(15878095-15878168)
chr3 (16-57)||(3834086-3834127)
chr3 (139-184)||(7986001-7986046)
chr3 (145-298)||(11165301-11165454)
chr3 (29-78)||(14501617-14501666)
chr3 (424-489)||(23077530-23077594)
chr3 (29-78)||(23275159-23275208)
chr3 (17-78)||(49667726-49667786)
chr3 (12-60)||(1465046-1465094)
chr3 (147-183)||(11424534-11424570)
chr3 (440-492)||(14665398-14665450)
chr3 (440-492)||(14668554-14668606)
chr3 (130-182)||(17248040-17248092)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (12-358)||(20117-20464)
scaffold0139 (420-470)||(38339-38389)
scaffold0139 (440-489)||(19980-20029)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (7-302)||(8590-8885)
scaffold0101 (440-487)||(1393-1440)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (17-302)||(48103-48388)
scaffold0102 (421-489)||(19268-19336)
scaffold0102 (12-78)||(19684-19750)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (1-489)||(7295-7782)
scaffold0114 (280-493)||(15370-15584)
scaffold0114 (13-60)||(32914-32961)
scaffold0114 (13-78)||(15114-15179)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (288-493)||(16282-16487)
scaffold0351 (17-78)||(16686-16747)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (17-302)||(1531-1816)
scaffold0261 (417-490)||(15664-15737)
scaffold0261 (12-107)||(16047-16142)
[»] scaffold0106 (6 HSPs)
scaffold0106 (288-493)||(1289-1494)
scaffold0106 (288-493)||(7266-7471)
scaffold0106 (13-60)||(16083-16130)
scaffold0106 (424-490)||(15291-15356)
scaffold0106 (13-60)||(1711-1758)
scaffold0106 (13-60)||(7688-7735)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (12-297)||(65431-65716)
scaffold0031 (1-202)||(53842-54033)
scaffold0031 (380-477)||(20430-20527)
scaffold0031 (18-72)||(20069-20123)
scaffold0031 (439-493)||(128751-128805)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (13-302)||(18431-18720)
scaffold0043 (118-200)||(76916-76998)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-355)||(15976-16330)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (1-302)||(6294-6595)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-252)||(15642-15893)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-302)||(6705-7006)
[»] scaffold0042 (8 HSPs)
scaffold0042 (1-302)||(34537-34838)
scaffold0042 (6-226)||(41185-41405)
scaffold0042 (280-474)||(24206-24405)
scaffold0042 (118-201)||(64131-64214)
scaffold0042 (118-201)||(76015-76098)
scaffold0042 (17-78)||(23944-24005)
scaffold0042 (16-57)||(64265-64306)
scaffold0042 (16-53)||(76153-76190)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (288-493)||(51582-51787)
scaffold0032 (13-60)||(52004-52051)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (288-493)||(965-1170)
scaffold0598 (13-78)||(701-766)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-302)||(18080-18381)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-302)||(14863-15163)
scaffold0081 (1-302)||(23878-24181)
scaffold0081 (1-302)||(39302-39605)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (1-302)||(18283-18584)
scaffold0080 (280-493)||(39913-40128)
scaffold0080 (420-477)||(19933-19990)
scaffold0080 (17-78)||(40329-40390)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (280-490)||(5036-5246)
scaffold0718 (13-78)||(4780-4845)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-302)||(46354-46655)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (1-302)||(15306-15597)
scaffold0297 (1-106)||(10448-10553)
scaffold0297 (424-489)||(10575-10639)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (45-302)||(3933-4189)
scaffold0149 (45-302)||(8364-8620)
scaffold0149 (395-474)||(29948-30028)
[»] scaffold0023 (11 HSPs)
scaffold0023 (1-302)||(23294-23594)
scaffold0023 (1-302)||(38127-38407)
scaffold0023 (421-493)||(119875-119947)
scaffold0023 (421-489)||(100378-100446)
scaffold0023 (422-489)||(40224-40291)
scaffold0023 (376-490)||(44454-44570)
scaffold0023 (421-489)||(101503-101571)
scaffold0023 (380-490)||(94411-94522)
scaffold0023 (380-474)||(17491-17586)
scaffold0023 (17-60)||(39651-39694)
scaffold0023 (17-78)||(101812-101873)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (280-493)||(10331-10544)
scaffold0456 (13-78)||(10075-10140)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-302)||(3030-3331)
scaffold0158 (1-302)||(6696-6997)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (288-493)||(46995-47200)
scaffold0064 (1-120)||(64290-64409)
scaffold0064 (13-78)||(47393-47458)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (26-302)||(32626-32901)
scaffold0111 (118-200)||(8778-8860)
[»] scaffold0198 (3 HSPs)
scaffold0198 (17-188)||(26706-26877)
scaffold0198 (243-343)||(23995-24094)
scaffold0198 (424-489)||(23843-23907)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (280-493)||(32067-32280)
scaffold0113 (13-60)||(32489-32536)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (280-493)||(13497-13711)
scaffold0427 (13-78)||(13902-13967)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-302)||(6043-6344)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-302)||(1681-1982)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (1-302)||(13704-14005)
scaffold0056 (280-492)||(17120-17337)
scaffold0056 (20-78)||(79007-79065)
scaffold0056 (16-108)||(16856-16948)
scaffold0056 (431-477)||(79388-79433)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-301)||(582-882)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (1-302)||(348-649)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (17-301)||(5952-6236)
scaffold0761 (431-487)||(4300-4355)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (1-302)||(875-1155)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (9-298)||(4622-4911)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-302)||(4560-4861)
[»] scaffold0358 (4 HSPs)
scaffold0358 (288-493)||(4712-4919)
scaffold0358 (288-418)||(13-143)
scaffold0358 (17-78)||(343-404)
scaffold0358 (17-78)||(5119-5180)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-302)||(1711-2012)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (1-302)||(21196-21497)
scaffold0037 (421-493)||(22719-22788)
scaffold0037 (380-490)||(82072-82183)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (8-195)||(190915-191102)
scaffold0017 (8-202)||(192618-192812)
scaffold0017 (16-200)||(56376-56550)
scaffold0017 (13-106)||(14963-15056)
scaffold0017 (13-106)||(19485-19578)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-302)||(1084-1385)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (1-203)||(5872-6074)
scaffold0476 (1-203)||(7067-7269)
scaffold0476 (425-493)||(12766-12834)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-298)||(2021-2317)
scaffold0104 (1-298)||(9703-9999)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (17-171)||(178974-179128)
scaffold0020 (421-493)||(15826-15898)
scaffold0020 (440-474)||(178913-178947)
scaffold0020 (17-57)||(15472-15512)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-202)||(16748-16949)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (1-202)||(30372-30573)
scaffold0008 (422-489)||(14747-14814)
scaffold0008 (118-198)||(2157-2237)
scaffold0008 (16-57)||(2288-2329)
[»] scaffold1842 (2 HSPs)
scaffold1842 (275-493)||(949-1169)
scaffold1842 (17-78)||(702-763)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (288-493)||(4849-5057)
scaffold0403 (12-78)||(5255-5321)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (1-203)||(566-758)
scaffold0327 (280-418)||(3434-3574)
[»] scaffold0193 (4 HSPs)
scaffold0193 (280-493)||(13211-13427)
scaffold0193 (118-198)||(9701-9781)
scaffold0193 (17-78)||(13618-13679)
scaffold0193 (16-57)||(9832-9873)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (275-493)||(167879-168099)
scaffold0011 (280-493)||(51913-52129)
scaffold0011 (17-78)||(167632-167693)
scaffold0011 (17-78)||(52330-52391)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (288-493)||(1952-2160)
scaffold0490 (13-60)||(2377-2424)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (280-493)||(3470-3686)
scaffold0292 (280-493)||(343-558)
scaffold0292 (17-106)||(732-821)
scaffold0292 (17-78)||(3888-3949)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (280-493)||(1851-2067)
scaffold0016 (17-78)||(2269-2330)
scaffold0016 (16-60)||(207160-207204)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (280-493)||(6026-6245)
scaffold0647 (16-78)||(5762-5824)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (17-302)||(18945-19220)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (280-493)||(3056-3271)
scaffold0540 (17-78)||(655-716)
[»] scaffold0555 (4 HSPs)
scaffold0555 (130-302)||(773-945)
scaffold0555 (421-493)||(10590-10659)
scaffold0555 (13-55)||(1020-1062)
scaffold0555 (17-78)||(10210-10271)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (280-493)||(38761-38976)
scaffold0145 (288-493)||(32942-33149)
scaffold0145 (431-495)||(9744-9807)
scaffold0145 (17-108)||(39147-39238)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-208)||(1127-1324)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (280-491)||(39479-39692)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (280-491)||(75120-75333)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (292-492)||(3103-3306)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (6-201)||(35153-35338)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (280-486)||(25970-26179)
scaffold0122 (376-490)||(44709-44825)
scaffold0122 (16-78)||(25706-25768)
scaffold0122 (17-58)||(33136-33177)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (1-202)||(2079-2269)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (1-202)||(608-799)
scaffold0483 (255-299)||(511-555)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (1-202)||(45395-45586)
scaffold0109 (118-201)||(7222-7305)
scaffold0109 (118-200)||(11047-11129)
scaffold0109 (139-200)||(38585-38646)
scaffold0109 (16-53)||(10955-10992)
scaffold0109 (16-53)||(38472-38509)
scaffold0109 (16-53)||(7468-7505)
scaffold0109 (255-299)||(45298-45342)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (280-493)||(8438-8650)
scaffold0121 (17-78)||(8175-8235)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (275-493)||(20910-21132)
scaffold0088 (12-78)||(21308-21374)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (16-202)||(66068-66244)
scaffold0036 (16-160)||(71209-71343)
[»] scaffold0003 (10 HSPs)
scaffold0003 (280-490)||(339855-340065)
scaffold0003 (118-202)||(96883-96967)
scaffold0003 (16-201)||(139988-140163)
scaffold0003 (118-202)||(71590-71674)
scaffold0003 (129-197)||(413806-413874)
scaffold0003 (380-490)||(158501-158612)
scaffold0003 (17-60)||(339593-339636)
scaffold0003 (375-440)||(71353-71419)
scaffold0003 (17-57)||(71725-71765)
scaffold0003 (130-182)||(339705-339757)
[»] scaffold0228 (7 HSPs)
scaffold0228 (7-202)||(18276-18461)
scaffold0228 (280-493)||(4508-4723)
scaffold0228 (280-493)||(12090-12305)
scaffold0228 (280-493)||(22042-22257)
scaffold0228 (17-108)||(4896-4987)
scaffold0228 (17-108)||(12478-12569)
scaffold0228 (17-108)||(22430-22521)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (280-493)||(16505-16721)
scaffold0217 (17-108)||(16241-16332)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (1-124)||(44419-44542)
scaffold0079 (175-301)||(44269-44395)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (1-202)||(19465-19656)
scaffold0044 (118-202)||(13181-13265)
scaffold0044 (139-198)||(62541-62600)
scaffold0044 (431-490)||(40400-40458)
scaffold0044 (16-53)||(62676-62713)
scaffold0044 (1-53)||(13320-13372)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (280-493)||(25896-26111)
scaffold0026 (280-493)||(39858-40073)
scaffold0026 (17-78)||(40274-40335)
scaffold0026 (17-60)||(39573-39616)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (288-490)||(22886-23090)
scaffold0231 (17-78)||(23300-23361)
[»] scaffold0120 (8 HSPs)
scaffold0120 (318-493)||(32901-33077)
scaffold0120 (318-493)||(45928-46104)
scaffold0120 (1-201)||(19655-19845)
scaffold0120 (311-493)||(16113-16298)
scaffold0120 (431-493)||(17389-17450)
scaffold0120 (17-78)||(32601-32662)
scaffold0120 (17-78)||(46343-46404)
scaffold0120 (17-78)||(16505-16565)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (17-202)||(15072-15247)
scaffold0107 (375-440)||(15417-15483)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (1-202)||(173567-173758)
scaffold0001 (6-201)||(422173-422359)
scaffold0001 (421-489)||(160688-160756)
scaffold0001 (440-490)||(85692-85742)
scaffold0001 (17-78)||(161103-161164)
scaffold0001 (431-474)||(501100-501142)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (16-200)||(18633-18807)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (13-201)||(3874-4052)
scaffold0184 (421-493)||(1118-1190)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (6-201)||(2078-2263)
scaffold0439 (6-201)||(9938-10123)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (421-493)||(11292-11364)
scaffold0046 (364-493)||(28414-28545)
scaffold0046 (421-493)||(1997-2069)
scaffold0046 (437-493)||(4552-4608)
scaffold0046 (12-59)||(14914-14961)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (118-202)||(228118-228202)
[»] scaffold1461 (2 HSPs)
scaffold1461 (118-201)||(207-290)
scaffold1461 (16-57)||(341-382)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (16-197)||(635-806)
[»] scaffold0070 (3 HSPs)
scaffold0070 (16-201)||(10181-10356)
scaffold0070 (311-472)||(4545-4709)
scaffold0070 (22-57)||(4962-4997)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (116-202)||(2416-2502)
scaffold0013 (139-192)||(9627-9680)
scaffold0013 (1-43)||(2311-2353)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (16-201)||(23494-23669)
scaffold0010 (417-477)||(60761-60821)
scaffold0010 (116-192)||(242344-242420)
scaffold0010 (421-474)||(129924-129977)
scaffold0010 (17-60)||(130343-130386)
[»] scaffold0175 (5 HSPs)
scaffold0175 (416-493)||(34123-34200)
scaffold0175 (275-443)||(13141-13313)
scaffold0175 (13-107)||(34509-34603)
scaffold0175 (17-60)||(13528-13571)
scaffold0175 (440-493)||(273-326)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (86-202)||(15374-15490)
scaffold0346 (12-53)||(17361-17402)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (17-88)||(36034-36105)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (118-201)||(24713-24796)
scaffold0012 (16-53)||(24621-24658)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (112-202)||(3269-3359)
scaffold0168 (16-45)||(3183-3212)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (116-201)||(11658-11743)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (129-202)||(13243-13316)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (376-477)||(1048-1151)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (421-493)||(6535-6607)
scaffold0621 (376-474)||(8485-8585)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-201)||(6913-7098)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (378-493)||(11447-11564)
scaffold0235 (21-78)||(11170-11227)
scaffold0235 (29-78)||(14057-14106)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (288-433)||(6669-6818)
scaffold0309 (14-60)||(7035-7081)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (118-200)||(9613-9695)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (421-489)||(2855-2923)
scaffold0628 (17-78)||(2445-2506)
scaffold0628 (147-187)||(2573-2613)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (421-493)||(6611-6683)
scaffold0333 (421-493)||(13991-14063)
scaffold0333 (17-57)||(7052-7092)
scaffold0333 (17-57)||(14432-14472)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (421-493)||(6172-6244)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (1-60)||(1339-1398)
scaffold0484 (282-357)||(1052-1128)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (280-493)||(8479-8691)
scaffold0639 (17-60)||(8911-8954)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (421-493)||(23932-24001)
scaffold0100 (17-78)||(20530-20591)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (116-201)||(36583-36668)
scaffold0132 (17-57)||(36717-36757)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (13-201)||(191966-192144)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (421-477)||(6828-6884)
scaffold0556 (17-78)||(7229-7290)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (421-493)||(1083-1155)
scaffold0530 (18-78)||(671-731)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (376-477)||(12584-12687)
scaffold0413 (17-78)||(15257-15318)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (116-200)||(4844-4928)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (421-489)||(2694-2762)
scaffold0207 (17-78)||(2286-2347)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (118-201)||(8849-8932)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (1-60)||(3906-3965)
scaffold0165 (1-60)||(7970-8029)
scaffold0165 (421-474)||(27798-27851)
scaffold0165 (282-329)||(3648-3695)
scaffold0165 (282-329)||(7712-7759)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (118-201)||(5745-5828)
scaffold0130 (280-414)||(27911-28046)
scaffold0130 (17-109)||(28923-29015)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (421-474)||(1101-1154)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (421-474)||(5662-5715)
scaffold0278 (17-60)||(6029-6072)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (417-474)||(8119-8176)
scaffold0218 (12-78)||(28917-28983)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (377-493)||(12942-13057)
scaffold0138 (130-192)||(29964-30026)
scaffold0138 (17-60)||(13376-13419)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (376-477)||(13144-13247)
scaffold0357 (422-477)||(2677-2732)
scaffold0357 (421-474)||(16149-16202)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (421-489)||(45841-45909)
scaffold0125 (12-78)||(45426-45492)
scaffold0125 (147-183)||(45561-45597)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (116-200)||(58461-58545)
scaffold0028 (429-489)||(132662-132722)
scaffold0028 (421-474)||(62217-62270)
scaffold0028 (380-490)||(136680-136791)
scaffold0028 (380-490)||(139149-139260)
scaffold0028 (380-490)||(144087-144198)
scaffold0028 (380-490)||(134211-134322)
scaffold0028 (380-490)||(141618-141729)
scaffold0028 (17-78)||(133071-133132)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (13-60)||(10910-10957)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (17-108)||(17168-17259)
scaffold0142 (431-490)||(16784-16842)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (17-108)||(51526-51617)
scaffold0034 (421-474)||(32555-32608)
scaffold0034 (118-198)||(16408-16488)
scaffold0034 (424-476)||(51936-51987)
scaffold0034 (16-53)||(16316-16353)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (422-477)||(129021-129075)
scaffold0022 (376-490)||(116430-116544)
scaffold0022 (424-477)||(78338-78391)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (16-193)||(18013-18180)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (420-474)||(25125-25179)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (424-477)||(566-619)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (17-78)||(2727-2788)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (420-477)||(6332-6389)
scaffold0420 (427-477)||(13793-13843)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (17-78)||(13250-13311)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (421-490)||(38751-38820)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (421-489)||(133-201)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (421-493)||(11464-11536)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (429-489)||(32102-32162)
scaffold0150 (12-78)||(32501-32567)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (421-493)||(38305-38377)
scaffold0124 (15-60)||(24291-24336)
scaffold0124 (242-302)||(42810-42870)
scaffold0124 (147-187)||(24421-24461)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (376-477)||(53551-53654)
scaffold0075 (17-60)||(7936-7979)
scaffold0075 (12-60)||(53108-53156)
[»] scaffold0546 (4 HSPs)
scaffold0546 (118-201)||(6002-6085)
scaffold0546 (118-200)||(2178-2260)
scaffold0546 (16-57)||(2311-2352)
scaffold0546 (16-53)||(5802-5839)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (380-490)||(13392-13503)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (426-493)||(4888-4954)
scaffold0395 (17-78)||(604-665)
scaffold0395 (293-433)||(881-1021)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (139-198)||(15618-15677)
scaffold0371 (16-57)||(15755-15796)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (380-490)||(20747-20858)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (12-107)||(2082-2177)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (380-490)||(37821-37932)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (17-78)||(17650-17711)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (17-78)||(20821-20882)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (139-192)||(10464-10517)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (139-192)||(14306-14359)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (17-78)||(28451-28512)
scaffold0211 (421-489)||(28818-28887)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (420-477)||(2691-2748)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (421-474)||(10546-10599)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (8-60)||(9512-9564)
scaffold0475 (147-183)||(9390-9426)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (380-491)||(10772-10884)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (429-493)||(18084-18148)
scaffold0247 (440-474)||(2241-2275)
scaffold0247 (17-78)||(6470-6531)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (13-108)||(1798-1893)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (380-474)||(4710-4805)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (17-108)||(12316-12407)
scaffold0503 (431-477)||(11979-12024)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (380-490)||(13947-14058)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (422-477)||(97021-97076)
scaffold0006 (422-477)||(106299-106354)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (17-78)||(3350-3411)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (374-477)||(8059-8166)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (17-78)||(18600-18661)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (420-477)||(267676-267733)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (8-108)||(1711-1810)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (431-491)||(9241-9300)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (17-57)||(10349-10389)
scaffold0192 (147-187)||(10221-10261)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (17-57)||(10597-10637)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (431-490)||(106-164)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (17-60)||(12451-12494)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (21-60)||(9480-9519)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (393-490)||(4214-4312)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (420-474)||(103679-103733)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (444-490)||(161206-161252)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (13-78)||(1939-2004)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (17-78)||(322-383)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (431-492)||(12353-12413)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (16-53)||(9345-9382)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (16-53)||(12169-12206)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (17-78)||(10562-10623)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (17-53)||(1098-1134)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-53)||(6432-6484)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (1-45)||(11438-11482)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (446-490)||(12064-12108)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (22-65)||(2284-2327)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (244-299)||(7662-7717)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (259-302)||(4690-4733)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (142-192)||(36994-37044)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (422-472)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (448-477)||(1874-1903)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (18-59)||(9081-9122)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (139-188)||(24741-24790)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (27-60)||(43436-43469)
scaffold0116 (27-60)||(47356-47389)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (145-201)||(3648-3704)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 154)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 493
Target Start/End: Original strand, 21389091 - 21389571
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389091 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggttta 21389190  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389191 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggtgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 21389290  T
Q  213 atgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatat 312  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21389291 atgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatat 21389390  T
Q  313 gttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21389391 gttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcat 21389490  T
Q  413 gctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389491 gctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 493
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21396101
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21395729  T
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395730 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21395829  T
Q  222 gtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgtt 321  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21395830 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttatt 21395929  T
Q  322 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgta 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21395930 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgta 21396029  T
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396030 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 493
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790594
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21790222  T
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790223 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21790322  T
Q  222 gtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgtt 321  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21790323 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttatt 21790422  T
Q  322 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgta 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21790423 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgta 21790522  T
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790523 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17353564 - 17353865
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17353564 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataactttgaacgagatt 17353663  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17353664 gaacctagtttaacctagaacagcttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcagaactgagtg 17353763  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17353764 caagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 17353863  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  17353864 tg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19899587 - 19899286
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19899587 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagatt 19899488  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899487 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 19899388  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19899387 caagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagc 19899288  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  19899287 tg 19899286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16185220 - 16184877
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16185220 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 16185121  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||||   |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16185120 gaacctggtttggcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 16185021  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   ||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16185020 caagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 16184921  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 345  Q
    || ||| || |||||  |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  16184920 tg-atatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgttta 16184877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 293 - 493
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  293 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  393 atttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  493 t 493  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 23776460 - 23776816
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctt-agatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776460 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattaaatgataacttagaatgagat 23776559  T
Q  100 tgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23776560 tgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgctatcgcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagt 23776659  T
Q  200 gcaagtgaggaaaatgcg-atctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    |||||  |||| | |||| |||||||||  || ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23776660 gcaagctaggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaa 23776759  T
Q  299 gctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 355  Q
    ||||  || || |||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  23776760 gctg-ttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattactt 23776816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 21168350 - 21168649
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21168350 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatgagattga 21168449  T
Q  103 acctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21168450 acctggtttagctttgaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcctgatctgagtgca 21168549  T
Q  203 agtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||   |||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21168550 agtgaggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21168649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24756206 - 24755912
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24756206 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatattaaataaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 24756107  T
Q  108 gttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 207  Q
    ||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756106 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 24756007  T
Q  208 ggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    | |   ||||| |||||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  24756006 gaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctg 24755912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19983587 - 19983284
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgaga 98  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19983587 atgtagaattctgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatggga 19983488  T
Q  99 ttgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19983487 ttgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctgactagtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgag 19983388  T
Q  199 tgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||  || ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19983387 tgcaaatgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaa 19983288  T
Q  299 gctg 302  Q
    ||||    
T  19983287 gctg 19983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 377770 - 377469
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  377770 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttgttaaagattaaattataacttagaatgagatt 377671  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  377670 gaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccagaactgagtg 377571  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    | | |||| |    | |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  377570 ctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 377471  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  377470 tg 377469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 20465666 - 20465967
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20465666 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgttaattaaagattagatgatgacttagaacgagatt 20465765  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465766 gaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 20465865  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |    | | |||||||    ||| |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20465866 caagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagc 20465965  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  20465966 tg 20465967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19976922 - 19976654
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  19976922 ttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgggattgaacctggtttagct 19976823  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 215  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19976822 tagaacaacattagttgggaatctgactagtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttg 19976723  T
Q  216 cgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaa 284  Q
    |||||||||||  || ||||||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19976722 cgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaa 19976654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 16199551 - 16199765
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16199551 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 16199650  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199651 gtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 16199750  T
Q  479 tgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||    
T  16199751 tgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31971471 - 31971257
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31971471 gttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 31971372  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31971371 gttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||    
T  31971272 ttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 22010306 - 22010513
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  22010306 atgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttagaacgagatt 22010405  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010406 gaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 22010505  T
Q  201 caagtgag 208  Q
    ||| ||||    
T  22010506 caattgag 22010513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 45130903 - 45131117
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  45130903 gttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 45131002  T
Q  380 gttgatgaa-ttgaatttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131003 gttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 45131101  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||    
T  45131102 ttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 15602644 - 15602945
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||  |||||    
T  15602644 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacaagatt 15602743  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15602744 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttaatg 15602843  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15602844 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 15602943  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  15602944 tg 15602945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 15611096 - 15611397
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||  |||||    
T  15611096 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacaagatt 15611195  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15611196 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttaatg 15611295  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15611296 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 15611395  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  15611396 tg 15611397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 30642918 - 30643215
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  30642918 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 30643017  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30643018 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgaatg 30643117  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  |  | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  30643118 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaa 30643215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19259229 - 19259432
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19259229 atgttgaattcttgaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatgacttagaatgagatt 19259327  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
     ||||||||| | |||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19259328 aaacctggtttagcttagaacaaccttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 19259427  T
Q  201 caagt 205  Q
    |||||    
T  19259428 caagt 19259432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926635
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtttatcttagaac 17926454  T
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 221  Q
    |||    ||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |   ||||||||    
T  17926455 aacttaagttggaattatggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactcccagaactgaatgcaaattagtatgttgcgatct 17926554  T
Q  222 gtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    || ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17926555 gtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctg 17926635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 16409882 - 16410159
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  16409882 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 16409981  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||    
T  16409982 gaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcttggcgagcaccttcagaactgaatg 16410081  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaga 278  Q
    ||| | ||||   |||||||||||||  |  | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  16410082 caaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 16410159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 290 - 493
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  290 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatacataagatgttgatgaa 388  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  389 ttgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 485  Q
    ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  486 gatgatgt 493  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536208
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20536226  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  20536225 tgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16860964 - 16861155
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  16860964 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagatt 16861063  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||          ||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16861064 gaacctg----------gaataaccatttttggaattcttgcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 16861153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 20856068 - 20856252
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | ||||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||| | |||    
T  20856068 ttttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtccattaaagattagatgatgatttaaaacaagattgaacctggtttagctt 20856167  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856168 agaacaaccttagttgcaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 20856252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879352
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 486  Q
    ||||| | ||||||| ||||||   || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  487 atgatgt 493  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649164
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||  |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28649147  T
Q  476 tgttgaagatgatgatg 492  Q
    || ||||||||||||||    
T  28649148 tgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818530
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18818512  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  18818513 tgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 21161840 - 21161986
Alignment:
Q  156 ggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgg 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  21161840 ggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggacctttgg 21161939  T
Q  256 gtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||   ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21161940 gtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21161986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 305 - 493
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092463
Alignment:
Q  305 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  404 ttatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    | || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 16411896 - 16412064
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||  ||| || |||||    
T  16411896 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtaggatcagatt 16411995  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgct 169  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16411996 gaacctagtttagcttagaacaaccttaggtggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgct 16412064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 21923833 - 21924049
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21923833 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 21923932  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| || ||| |||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21923933 tgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21924031  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  21924032 tgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759255
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  ||||||  | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||    ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6759277  T
Q  475 atgttgaagatgatgatgtcca 496  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  6759276 ttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 39094594 - 39094769
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |            
T  39094594 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacgagattgaacccga------- 39094686  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094687 ---aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 39094769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 21161744 - 21161837
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatga 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21161744 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatga 21161837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17140988 - 17140916
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140988 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23834626 - 23834450
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||||           
T  23834626 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg------- 23834534  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834533 ---aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgcgatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 23834450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  379 tgtt--gatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    || |  | ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  474 gatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 22113381 - 22113555
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  22113381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 22113473  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22113474 ---aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22113555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 22134884 - 22135058
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  22134884 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 22134976  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134977 ---aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 24433980 - 24434065
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24433980 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24434065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 16231220 - 16231304
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231220 gaacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16231304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15538809 - 15538726
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538809 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15538726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15532251 - 15532166
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532251 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatgccgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15532166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 22166034 - 22166208
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  22166034 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 22166126  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22166127 ---aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgagtg 22166208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6520440 - 6520368
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520440 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22028918 - 22028834
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22028918 gaacaaccttagttgggaatctggctagtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 22028834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 23846771 - 23846842
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23846771 gttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18619931 - 18619756
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||             
T  18619931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct--------- 18619841  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
     ||||||||| |  |||| | ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619840 -agaacaaccttacttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18619756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 30308407 - 30308582
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  30308407 tttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 30308499  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308500 ---aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 30308582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 17828322 - 17828411
Alignment:
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||||||| || | ||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828322 aacttagaacatccttagttgttattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17828411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22045219 - 22045138
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22045219 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagacctgagt 22045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 25362777 - 25362854
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  25362777 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgatta 25362854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43252176 - 43252092
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43252176 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 43252092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 5865915 - 5866009
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  5865915 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 5866009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648554
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| || |||| |  |||||| |||||| ||   || |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23648571  T
Q  476 tgttgaagatgatgatg 492  Q
    || | |||||| |||||    
T  23648570 tgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249384
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255222
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20527812 - 20527736
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20527812 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 20527736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17141397 - 17141302
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  17141397 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17141302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 17055132 - 17055214
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||||| | ||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17055132 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtagtcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 17055214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21285669 - 21285616
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285669 atactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaag 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 45130669 - 45130734
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  45130669 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 45130734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 357
Target Start/End: Original strand, 25363047 - 25363123
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 357  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363047 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32599039 - 32598959
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32599039 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32598959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32605571 - 32605491
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32605571 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32605491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41598663 - 41598572
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  41598663 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 41598572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21491476 - 21491410
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21491476 tgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21491410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31971724 - 31971662
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||    
T  31971724 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgatta 31971662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7373228 - 7373167
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  7373228 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 7373167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 486
Target Start/End: Original strand, 13508138 - 13508199
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 486  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508138 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 18818052 - 18818113
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  18818052 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18818113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 18878879 - 18878940
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  18878879 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18878940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21249862 - 21249821
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249862 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 21249821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21255700 - 21255659
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255700 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 21255659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21918652 - 21918713
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21918652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21918713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 21972350 - 21972411
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21972350 tggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21972411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 21976435 - 21976496
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21976435 tggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21976496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22627214 - 22627153
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22627214 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22627153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23406860 - 23406799
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23406860 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 23406799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 28648686 - 28648747
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  28648686 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 28648747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 16199296 - 16199340
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16199296 gtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgcct 16199340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 19278027 - 19278110
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19278027 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtact-gccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 19278110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22029025 - 22028969
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22029025 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacct 22028969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 20046299 - 20046357
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046299 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20536687 - 20536644
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536687 ttttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 20536644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598188
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 486
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 486  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203393
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23649033 - 23648971
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  23649033 tttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgatta 23648971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6759736 - 6759675
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  6759736 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgatta 6759675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 16091983 - 16092044
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  16091983 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgatta 16092044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21923570 - 21923631
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  21923570 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 21923631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| || ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 496
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22057816 - 22057768
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 49  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057816 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 23252400 - 23252452
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23252400 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4483391 - 4483281
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4483295  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  4483294 gattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070574
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 301
Target Start/End: Original strand, 19259451 - 19259509
Alignment:
Q  243 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  19259451 gatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagct 19259509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 477
Target Start/End: Original strand, 19801447 - 19801530
Alignment:
Q  394 tttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801447 tttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 474
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290841
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15532341 - 15532300
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15532341 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15532300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15538901 - 15538860
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15538901 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15538860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 19801069 - 19801130
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  19801069 ttttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 19801130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 24433890 - 24433927
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24433890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 26355340 - 26355401
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  26355340 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 26355401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32599131 - 32599090
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32599131 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 32599090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32605663 - 32605622
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32605663 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 32605622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 38854893 - 38854954
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  38854893 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 38854954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 21414869 - 21414917
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgc 65  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21414869 tttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgc 21414917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22045326 - 22045270
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22045326 atgtcgaattctgagtttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 22045270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19905830 - 19905783
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19905830 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19905783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 491
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||| | ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgat 491  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20499144 - 20499078
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20499144 tgtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgatta 20499078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 478
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507712
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 13507712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597244
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 13597244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 17055042 - 17055079
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17055042 tttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagt 17055079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 17828236 - 17828273
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17828236 tttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17828273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21674184 - 21674123
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21674184 ttttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21674123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 45
Target Start/End: Original strand, 23844567 - 23844596
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844567 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 23844596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39834182 - 39834146
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39834182 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 39834146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 175243 - 174767
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  175243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattagagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 175144  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  175143 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccattgcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgc 175044  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || || |||||     
T  175043 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgtta 174945  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc 414  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  174944 gtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgc 174845  T
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174844 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124679
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatat 401  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  423 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 125061 - 125000
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  125061 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 125000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 477
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 477
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 63039 - 62979
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  63039 tttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgatta 62979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 160)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37724389 - 37723910
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724389 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 37724290  T
Q  108 gttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 207  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724289 gtttaacttagaacaacatttgttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 37724190  T
Q  208 ggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataa 307  Q
    ||| | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |      
T  37724189 ggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-tttt 37724091  T
Q  308 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataatt 405  Q
    || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37724090 gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatc 37723991  T
Q  406 atgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 486  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723990 atgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22032806 - 22032323
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032806 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattga 22032707  T
Q  103 acctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032706 acctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 22032607  T
Q  203 agtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||| |   || ||| |||||    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22032606 agtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 22032507  T
Q  303 aataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatata 402  Q
     ||| || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22032506 -atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtata 22032409  T
Q  403 attatgccatgct--gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||  |||| |   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032408 attat--catgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Original strand, 18769631 - 18770118
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769631 atgttgaattctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 18769730  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18769731 gaacctggtttagcttagaacaattttagttaggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcgtcgcgagcacttccagaactgagcg 18769830  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |    | |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18769831 caagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 18769930  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || ||| || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18769931 tg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 18770028  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18770029 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26704542 - 26704257
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26704542 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26704443  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26704442 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgt 26704343  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26704342 gatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26704257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26974275 - 26973990
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26974275 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26974176  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26974175 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgt 26974076  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26974075 gatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26973990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23201861 - 23201559
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23201861 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttataatgagatt 23201762  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23201761 gaacctggtttagcttataacaacattagttgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttagaactgagtg 23201662  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggaccctt-gggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23201661 caagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacctatagaagaagttaactgcaatctgtgaag 23201562  T
Q  300 ctg 302  Q
    |||    
T  23201561 ctg 23201559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 23500972 - 23501273
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  23500972 atgtagaattctgtattcctaacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaatattaaatgatagcttagaccgagatt 23501071  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23501072 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtg 23501171  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
     ||||||| |   ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23501172 aaagtgagaatgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagc 23501271  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  23501272 tg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14079640 - 14079340
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14079640 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaatatgttaattaatgatttaatgataacttagaatgagatt 14079541  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14079540 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtg 14079441  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  14079440 caagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagc 14079341  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  14079340 t 14079340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23512599 - 23512301
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  23512599 atgttgaattctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 23512500  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23512499 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 23512400  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    || || ||||   |||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  23512399 catgttaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgacctatataagaagtttactgcaatctttgaag 23512301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23572502 - 23572178
Alignment:
Q  70 taaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgct 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  23572502 taaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactccccatggcgagcagatgct 23572403  T
Q  170 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacc 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||  ||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23572402 ctcgcctcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacc 23572303  T
Q  270 tatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgta 369  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||| || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  23572302 tatataagaagttaactgcaatttgtgaagttg-atatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgta 23572204  T
Q  370 tacataagatgttgatgaattgaatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23572203 tacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21366293 - 21366594
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  21366293 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 21366392  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21366393 gaacctgatttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 21366492  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  21366493 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagc 21366592  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  21366593 tg 21366594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20806039 - 20805738
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  20806039 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 20805940  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20805939 gaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgaatg 20805840  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| | ||||   |||||||||||||  |  | |||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  20805839 caaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggc 20805740  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  20805739 tg 20805738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21887316 - 21887124
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21887316 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagaat 21887217  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
    ||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21887216 gaacctgctttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaa 21887124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 21292875 - 21293090
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21292875 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 21292974  T
Q  380 gttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21292975 gttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 21293073  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||    
T  21293074 gttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31342589 - 31342399
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31342589 aattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttatagaagattaaatgataacctagaatgagattgaacct 31342490  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    || | | |||||||||||| | |||||  ||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31342489 ggcttagcttagaacaaccttagttggagatctgggctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 31342399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 8286742 - 8286964
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||      
T  8286742 aagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatt 8286841  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 469  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286842 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8286940  T
Q  470 ctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  8286941 ctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390617
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23390599  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  23390600 tgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21873595 - 21873387
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatg 246  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  21873595 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatg 21873496  T
Q  247 gacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-ta 345  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| |     
T  21873495 aacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatg 21873397  T
Q  346 tgcattactt 355  Q
    ||||||||||    
T  21873396 tgcattactt 21873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075018
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||      
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  471 taagatgttgaag-atgatgatgt 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  22075041 taagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24493784 - 24493569
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  24493784 gttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaaga 24493685  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24493684 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 24493586  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  24493585 gatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077952
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagt 9077970  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  9077969 tgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421532
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25421550  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  25421549 tgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 493
Target Start/End: Original strand, 21729032 - 21729185
Alignment:
Q  342 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctg 438  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21729032 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21729131  T
Q  439 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729132 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 493
Target Start/End: Original strand, 21808357 - 21808510
Alignment:
Q  342 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctg 438  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21808357 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21808456  T
Q  439 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808457 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529223
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  484 atgatga 490  Q
    |||||||    
T  24529229 atgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 23535242 - 23535418
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||           
T  23535242 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctgg------- 23535334  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535335 ---aacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 23535418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17410915 - 17410724
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||  || ||  || ||||||||| ||||| | ||||||  |||||    
T  17410915 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgccttggagtacctttaggtgtctactaaagattagatgatgatttagaacaagatt 17410816  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410815 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 17410726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13025526 - 13025311
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  13025526 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13025427  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13025426 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13025328  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  13025327 gatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13095710 - 13095495
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  13095710 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13095611  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13095610 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13095512  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  13095511 gatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 17918794 - 17918979
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||| |    
T  17918794 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaaac 17918893  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918894 tgg----------aacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17918979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 20910454 - 20910629
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||            
T  20910454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg-------- 20910545  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910546 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 20910629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 12028215 - 12028393
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  12028215 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 12028310  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028311 ------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12028393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24222344 - 24222170
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  24222344 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 24222249  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222248 ------aacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24222170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| | |  |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1858614 - 1858805
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  | | ||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
T  1858614 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatattcactaaagattagaagatgacttagaacaagatt 1858713  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858714 gaacctgg----------aataaccaatgttggaattctggattgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 1858803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18356688 - 18356604
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356688 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 18356604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |||| |   ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 21340420 - 21340595
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  21340420 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 21340512  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340513 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 21340595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 26665784 - 26665959
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  26665784 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 26665876  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665877 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26665959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 26937381 - 26937556
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  26937381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 26937473  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937474 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26937556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 21884842 - 21885016
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  21884842 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 21884934  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21884935 ---aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21885016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26681045 - 26680868
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||         
T  26681045 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagaatgaacctgg----- 26680951  T
Q  114 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
         ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680950 -----aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26680868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26952652 - 26952475
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||||         
T  26952652 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagaatgaacctgg----- 26952558  T
Q  114 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
         ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952557 -----aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26952475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16674605 - 16674430
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  16674605 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 16674513  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674512 ---aacaaccttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16674430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 24532701 - 24532876
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | |||||| ||||||||||||||           
T  24532701 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 24532793  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24532794 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttagaactgagtgc 24532876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 493
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  490 atgt 493  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26172917 - 26172743
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  26172917 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 26172825  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26172824 ---aacaaccttagtagggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 26172743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 21329546 - 21329618
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329546 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23451714 - 23451634
Alignment:
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23451714 aaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgca 23451634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23463219 - 23463139
Alignment:
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23463219 aaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgca 23463139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20232911 - 20232828
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232911 gaacaaccttagttaggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 20232828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Original strand, 19472379 - 19472546
Alignment:
Q  23 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||          ||||||    
T  19472379 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct----------agaaca 19472468  T
Q  123 accattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19472469 accttagttggaaagctggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19472546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 377 - 477
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  377 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg--ctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  473 agatg 477  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 17718182 - 17718263
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718182 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 17718263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4036587 - 4036499
Alignment:
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036587 aacttggaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagttgatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 4036499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23458958 - 23458878
Alignment:
Q  122 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23458958 aaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcaagaactgagtgca 23458878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 26742390 - 26742574
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| || || | |||||| |||||||| |||    
T  26742390 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagataatgatttagaacgagattgagcct 26742489  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||          ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26742490 gg----------aacaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgaccattttcagaactgagtgc 26742574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18774564 - 18774482
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18774564 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgggtgc 18774482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42805780 - 42805698
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805780 aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 42805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 25229152 - 25229233
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229152 aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25229233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 25293308 - 25293389
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293308 aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 122955 - 123133
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagat----gcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| ||   ||||| ||||||||||||| | |||   ||||||  |||||||||||||        
T  122955 ttttgacttttgagttgaaccttagatagatgcctttgagtacccttagatgtttaataaagattagaggatgttttagaacaagattgaacctgg---- 123050  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  123051 ------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 123133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20296211 - 20296127
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20296211 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 20296127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21565614 - 21565546
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565614 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 19660474 - 19660540
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  19660474 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 19660540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  474 gatgttgaagatgatga 490  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 21295006 - 21295082
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21295006 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21295082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25535351 - 25535275
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25535351 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25535275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 21292619 - 21292666
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292619 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 21292666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22760133 - 22760026
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  22760133 atgttgatttccgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 22760034  T
Q  101 gaacctgg 108  Q
    ||||||||    
T  22760033 gaacctgg 22760026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1096946 - 1096885
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  1096946 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 1096885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21871213 - 21871274
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  21871213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgatta 21871274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21875493 - 21875554
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  21875493 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgatta 21875554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22075487 - 22075426
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22075487 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 11580887 - 11580978
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  11580887 ttttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 11580978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18784407 - 18784336
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 190  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18784407 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacgtcca 18784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909012
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  20909025 gattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 21985789 - 21985880
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  21985789 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 21985880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245136
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 15441720 - 15441773
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15441720 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 15441773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23390138 - 23390199
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23390138 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 23390199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25422011 - 25421847
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||    | ||||||| ||||||||| ||||||    | ||    
T  25422011 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttaggatgagattggacctggaaagattt 25421912  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||  |  | | | || |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25421911 agaatga-aactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25421847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25431873 - 25431812
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  25431873 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgatta 25431812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 8286494 - 8286586
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  8286494 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 8286586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 15236552 - 15236708
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  15236552 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 15236651  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  15236652 tggaacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 15236708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  395 ttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 358
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 358  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22757458 - 22757414
Alignment:
Q  157 gcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757458 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22757414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 11581303 - 11581361
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581303 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 22107022 - 22107069
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22107022 gtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaa 22107069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 22119835 - 22119878
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22119835 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 22119878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Original strand, 23337060 - 23337107
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23337060 gtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23337107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29329992 - 29329934
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329992 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245527
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  42245514 gattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  321 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt- 418  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||     
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  419 gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21566023 - 21565962
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21566023 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21565962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22959175 - 22959236
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22959175 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22959236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 23572551 - 23572510
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 42  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572551 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24529700 - 24529639
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||    
T  24529700 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgatta 24529639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 490
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  442 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9078431 - 9078340
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  9078431 ttttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctgg 9078340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 487
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319193
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 24766983 - 24767022
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24766983 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 24767022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29346091 - 29345980
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29346091 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29345994  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  29345993 gattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  472 aag 474  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 477
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  423 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4036673 - 4036632
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4036673 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 4036632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13095973 - 13095912
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||||    
T  13095973 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgatta 13095912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 17718092 - 17718129
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17718092 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17718129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18356780 - 18356739
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18356780 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18356739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18784500 - 18784459
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18784500 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18784459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19669379 - 19669318
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  19669379 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 19669318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21482931 - 21482894
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21482931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 25229059 - 25229096
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25229059 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 25293215 - 25293252
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25293215 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 423 - 472
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  423 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33409659 - 33409622
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33409659 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33409622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 36154470 - 36154531
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  36154470 ttttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgatta 36154531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42805873 - 42805832
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42805873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 42805832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 14359562 - 14359638
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||| ||||| || || |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14359562 tagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24554896 - 24554820
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  24554896 tagaacaacattagttgggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccaga 24554820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 40725925 - 40725853
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 21329137 - 21329180
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329137 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21329180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 466  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26704148 - 26704090
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704148 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26973881 - 26973823
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973881 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  443 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  443 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32027504 - 32027393
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  32027504 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 32027407  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  32027406 gattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33409537 - 33409506
Alignment:
Q  170 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409537 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 33409506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 477
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  447 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18774657 - 18774616
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  18774657 tttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagtacct 18774616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 20232983 - 20232954
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232983 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 20232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24494047 - 24493986
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||||    
T  24494047 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgatta 24493986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 5888946 - 5888982
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5888946 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 5888982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412340
Alignment:
Q  281 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 329  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 22959304 - 22959340
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22959304 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22959340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25744071 - 25744035
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25744071 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 25744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Original strand, 36154586 - 36154634
Alignment:
Q  134 gaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36154586 gaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 36154634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21715026 - 21714684
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21715026 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 21714927  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714926 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 21714827  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||     
T  21714826 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtta 21714728  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21714727 gtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 42864838 - 42865139
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42864838 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagatt 42864937  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42864938 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 42865037  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  42865038 caagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 42865137  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  42865138 tg 42865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468816
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaaagagattgaaccaggtttaactt 22468438  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  22468439 agaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgacatgaagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgc 22468538  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||| ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  | ||||| |||||||||||||||  |||||| || ||    
T  22468539 gatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctg 22468638  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc- 414  Q
     || | ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| || ||| |||||     
T  22468639 atg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgct 22468737  T
Q  415 --tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
      |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  22468738 gttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 21787669 - 21788023
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21787669 atgttgaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagattatatgataacttagaatgagatt 21787768  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21787769 gaacctggtttagcttataacaacattagttgggaatctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtg 21787868  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||  || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||    
T  21787869 caagtgagaaatttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaacctatataagaagttaactgcaatctatgcagc 21787968  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 355  Q
    ||  || || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  21787969 tg-ttatgaaatgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt 21788023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 22831005 - 22831306
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22831005 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 22831104  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831105 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctgaactgagtg 22831204  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||| |   |||||||||||||  |||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22831205 caattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 22831304  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  22831305 tg 22831306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6152347 - 6152046
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6152347 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaataggatt 6152248  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6152247 gaacctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 6152148  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    || || ||||   |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  6152147 catgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 6152048  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  6152047 tg 6152046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21023130 - 21022830
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21023130 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgccaaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagatt 21023031  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21023030 gaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactcagta 21022931  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    | |||||| |    | |||||||||    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21022930 ctagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 21022831  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  21022830 t 21022830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801508
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  38801503 tgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 18181748 - 18182049
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||| | ||||    
T  18181748 atgtcgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattagatgatgacttagaacgggatt 18181847  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18181848 gaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaactgagtg 18181947  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||  || | |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||||||    
T  18181948 caagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagc 18182047  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  18182048 tg 18182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250850
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 3472553 - 3472853
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  3472553 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgctataagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 3472652  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3472653 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 3472752  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||   ||||   |||||||||| ||  |  |  ||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3472753 caaaataggatgttgcgatctgtttcgcacaaactgattagggttggactcttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaatgggaatctgtgaagc 3472851  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  3472852 tg 3472853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 22432410 - 22432597
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  22432410 atgttgaattaagtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagatt 22432509  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttc 188  Q
    ||| |||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432510 gaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcctgtcctcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttc 22432597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Original strand, 20091229 - 20091401
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcata 229  Q
    |||||| |||| | || |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  |    
T  20091229 ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 20091328  T
Q  230 tgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20091329 taatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 20091401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026680
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  21026702 taagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210333
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 50210316  T
Q  476 tgttgaagatgatgatg 492  Q
    || ||||||||||||||    
T  50210317 tgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 8761280 - 8761460
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  || ||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||| | | |||||||    
T  8761280 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagacgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggattagcttagaa 8761379  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||  | ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8761380 caactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgaacacttccagaactgagtgc 8761460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509783
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34509798  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || ||||||||||||    
T  34509797 tgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48603820 - 48603652
Alignment:
Q  190 agaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgta 289  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  48603820 agaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattata 48603721  T
Q  290 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 357  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603720 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36818946 - 36819137
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||| || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  36818946 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctattaaagattagaggatgatttagaacaagatt 36819045  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819046 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 36819135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 45489394 - 45489571
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||         
T  45489394 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----- 45489488  T
Q  114 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
         ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489489 -----aacaaccttagttggaaatctggcgagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 45489571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21305767 - 21305591
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || || ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  21305767 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg------- 21305675  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21305674 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 21305591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 17678245 - 17678416
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||||||||          ||    
T  17678245 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagatgatgatttagaacaagatggaacctgg----------aa 17678334  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678335 taaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 17678416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  292 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 390  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  391 gaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    | | | ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 24782753 - 24782929
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  24782753 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattagaggatgagttagaacaagattgaacctgg------- 24782845  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24782846 ---aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgca 24782929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33797986 - 33797810
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | ||||||  |||||||||||||           
T  33797986 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg------- 33797894  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797893 ---aacaaccttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 33797810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12647322 - 12647147
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | |||||| |||||||||| |||           
T  12647322 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttgg------- 12647230  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647229 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 16080200 - 16080273
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080200 gttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16080273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 493
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||| ||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  490 atgt 493  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 302
Target Start/End: Original strand, 22449037 - 22449194
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   || |||||| ||    ||| |||||||   |    
T  22449037 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaa 22449136  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22449137 tggacccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 22449194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 45310016 - 45310194
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  45310016 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 45310111  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45310112 ------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 45310194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20228447 - 20228636
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||  || ||| || ||  |||||||  || | |||||||||||||    
T  20228447 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtatctttaggtgcctactattgattaaagaatgatttagaatgagatt 20228546  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20228547 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtg 20228636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 418
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354616
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt 418  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 493
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19212320 - 19212144
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  19212320 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaattagaacgagattgaacctgg------- 19212228  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19212227 ---aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgca 19212144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20138536 - 20138364
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| | ||| | ||||||||||||||||||              
T  20138536 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaaccc--------- 20138446  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
     ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20138445 -agaacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 20138364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 33049739 - 33049911
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaac 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||          
T  33049739 attttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacccttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaataagattgaacctgg------ 33049832  T
Q  115 ttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
        ||||||| | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049833 ----aacaaccttagttggaaatctggcaagtaatcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 33049911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 23818952 - 23819126
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  23818952 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 23819044  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||| ||| | || || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819045 ---aacgaccttagtaggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 23819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 46975828 - 46975745
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975828 gaacaaccttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 46975745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18882820 - 18882645
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  18882820 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 18882728  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18882727 ---aacaaccttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttcaagaactgagtgc 18882645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcc---atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| |||||| |   ||| |||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  476 tgttgaagatgatgatg 492  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52639988 - 52639821
Alignment:
Q  23 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaaca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||          ||||||    
T  52639988 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct----------agaaca 52639899  T
Q  123 accattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52639898 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 52639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 18393613 - 18393791
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||         
T  18393613 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg----- 18393707  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
         |||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18393708 -----gaacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcgagcacttatagaacggagtgc 18393791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 16375200 - 16375284
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16375200 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21407719 - 21407635
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21407719 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21407635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21438157 - 21438081
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21438157 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21438081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21615798 - 21615718
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21615798 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21615718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23763574 - 23763498
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23763574 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23763498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 477
Target Start/End: Original strand, 35261127 - 35261183
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261127 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 425 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 477
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22355827 - 22355888
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22355827 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22355888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22357513 - 22357574
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22357513 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22357574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 492
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 27250384 - 27250443
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  27250384 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 27250443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21301180 - 21301241
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21301180 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21301241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21754518 - 21754453
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21754518 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21754453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 20846867 - 20846963
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  | | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  20846867 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctgg 20846963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  477 gttgaagatgatgat 491  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475249
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  21475236 gattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 474
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123214
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 22354214 - 22354305
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22354214 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatgagattgaacctgg 22354305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776688
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| | || ||||   ||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 384
Target Start/End: Original strand, 22356079 - 22356185
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  22356079 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22356178  T
Q  378 atgttga 384  Q
    |||||||    
T  22356179 atgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 384
Target Start/End: Original strand, 22357765 - 22357871
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  22357765 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22357864  T
Q  378 atgttga 384  Q
    |||||||    
T  22357865 atgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  423 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22532748 - 22532687
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22532748 ttttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22532687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22921509 - 22921570
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22921509 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22921570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34510259 - 34510198
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  34510259 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 34510198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 52927623 - 52927684
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  52927623 ttttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 52927684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1011057 - 1010901
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  1011057 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 1010958  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  1010957 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 1010901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 496
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21027153 - 21027057
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||  | | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  21027153 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctgg 21027057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162164
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaa 21162164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 38801041 - 38801105
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  38801041 tatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 38801105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 433486 - 433443
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  433486 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaa 433443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 3704724 - 3704831
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  3704724 atgttgaatttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagatt 3704823  T
Q  101 gaacctgg 108  Q
    ||||||||    
T  3704824 gaacctgg 3704831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 475
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 43697839 - 43697796
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43697839 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 43697796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  442 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 20091113 - 20091159
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20091113 tatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaa 20091159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20135671 - 20135605
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  20135671 tgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgatta 20135605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20919080 - 20918990
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  20919080 ttttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 20918990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20248756 - 20248695
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20248756 ttttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 20248695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21615890 - 21615849
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21615890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 21615849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714546
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714610 ctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33681488 - 33681427
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||| |||||    
T  33681488 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgatta 33681427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 46975920 - 46975883
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975920 ttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46975883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 490
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  395 ttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19063854 - 19063807
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19063854 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19105087 - 19105040
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19105087 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19105040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19111744 - 19111697
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19111744 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19111697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22238108 - 22238065
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  22238108 ttttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaa 22238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 478
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  448 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 190
Target Start/End: Original strand, 20524987 - 20525032
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 190  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20524987 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttcca 20525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 433374 - 433322
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  433374 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 433322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 16080082 - 16080134
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  16080082 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattggatgcctttgagt 16080134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20637200 - 20637164
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20637200 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 20637164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21162118 - 21162078
Alignment:
Q  144 tgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagca 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21162118 tgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 21162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 173)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Original strand, 17137690 - 17138177
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17137690 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagatt 17137789  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137790 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 17137889  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   || |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17137890 caagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 17137989  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || ||| || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17137990 tg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 17138087  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17138088 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 18154479 - 18154821
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  18154479 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacttggtttaacct 18154578  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18154579 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggaaatgc 18154678  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || || |||||     
T  18154679 gatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctg-ttatgagatgtta 18154777  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
     |||||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  18154778 atgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaa 18154821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12187506 - 12187019
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187506 atgttgaattctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 12187407  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187406 gaacctgatttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 12187307  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| | |  | ||| | |||    ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12187306 caagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 12187207  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || |||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12187206 tg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 12187109  T
Q  401 taattatgccatgct----gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  |||| |     |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187108 taattat--catgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9703759 - 9703458
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703759 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 9703660  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703659 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 9703560  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9703559 caagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 9703460  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  9703459 tg 9703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Original strand, 19649127 - 19649469
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19649127 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaatattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 19649226  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||    
T  19649227 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgc 19649326  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |  ||||  |||||     
T  19649327 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagcag-ttaagtgatgtta 19649425  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  19649426 gtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 19649469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24054950 - 24054618
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  24054950 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 24054851  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  24054850 aacctagaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtcttgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaat 24054751  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    | |||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  || || |    
T  24054750 attgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaga 24054652  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 345  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24054651 tgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11880745 - 11880456
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11880745 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagatt 11880646  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11880645 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtg 11880546  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaa 290  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11880545 caagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgtaa 11880456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847951
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  27847946 tgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 12321369 - 12321666
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12321369 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacctagaatgagatt 12321468  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321469 gaacctgatttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 12321568  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    ||| |||| |    ||||||||||||  |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  12321569 caaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 12321666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10508709 - 10508918
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508709 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 10508808  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508809 gaacctgatttaacttataacaacattagttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 10508908  T
Q  201 caagtgagga 210  Q
    ||||||||||    
T  10508909 caagtgagga 10508918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 280 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 40443605 - 40443393
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40443605 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 40443506  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443505 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgt 40443406  T
Q  479 tgaagatgatgat 491  Q
    |||||||||||||    
T  40443405 tgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14430371 - 14430070
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  14430371 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttgagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 14430272  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14430271 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 14430172  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14430171 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagc 14430072  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  14430071 tg 14430070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2760620 - 2760413
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  2760620 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttagaacgagatt 2760521  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||| |||||||    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760520 gaacctggtttagcttcgaacaactggagttggaaatatggcttgtactcgtcatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 2760421  T
Q  201 caagtgag 208  Q
    ||| ||||    
T  2760420 caattgag 2760413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  475 atgttgaagatgatgatgt 493  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509189
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9509207  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  9509206 tgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 16386147 - 16386369
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||      
T  16386147 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatt 16386246  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386247 taagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16386346  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16386347 taagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10589254 - 10589039
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |   |||||    
T  10589254 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagat 10589155  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 10589056  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    || ||||||||||||||    
T  10589055 gtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26211995
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||      
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  471 taagatgttgaag-atgatgatgt 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26212018 taagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15211921 - 15211761
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15211921 atgttgaattctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgattaaatgataacttagaatgagatt 15211822  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgag 161  Q
    |||||||||| | || |||  |||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  15211821 gaacctggtttagctcagattaactttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgag 15211761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 490
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  281 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  478 ttgaagatgatga 490  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11313116 - 11312925
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | || |||  |||||    
T  11313116 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgattttgaaaaagatt 11313017  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11313016 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgggagcacttccagaactgagtg 11312927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15581160 - 15580968
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | |||   ||||||  |||||    
T  15581160 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgttttagaacaagatt 15581061  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15581060 gaacctgga---------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtg 15580970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38227696 - 38227481
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  38227696 gttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaaga 38227597  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38227596 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagta 38227498  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  38227497 gatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564482
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 3564467  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || ||||||||||||    
T  3564468 tgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12318595 - 12318404
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || || ||| ||||||||| | | | | ||||||  || ||    
T  12318595 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaagattagagggtgatttagaacaaggtt 12318496  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318495 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 12318406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26292863 - 26292673
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||    
T  26292863 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagatt 26292764  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26292763 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtg 26292674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 48593109 - 48593285
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||  || ||| || ||||||||| |  || | ||||||  |||||||||||||           
T  48593109 tttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg------- 48593201  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593202 ---aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 48593285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13149607 - 13149433
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  13149607 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 13149515  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13149514 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 13149433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Original strand, 18803 - 18895
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagga 210  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18803 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgctattgagga 18895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11987573 - 11987489
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11987573 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 11987489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 13635214 - 13635298
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635214 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 13635298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3272280 - 3272173
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  3272280 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagaggatgatttagaacaagatt 3272181  T
Q  101 gaacctgg 108  Q
    ||||||||    
T  3272180 gaacctgg 3272173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15605101
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||| |||| |||| | ||| | ||||||  |||||||||||||            
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaatattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 15605017  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
      ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15605018 --aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgtgaccacttctagaactgagtgca 15605101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6801573 - 6801490
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801573 gaacaaccttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6801490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9593798 - 9593622
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  9593798 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 9593706  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593705 ---aacgaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9593622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9644761 - 9644585
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  9644761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 9644669  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9644668 ---aacgaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9644585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 16438780 - 16438862
Alignment:
Q  119 aacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16438780 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgc 16438862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 9445808 - 9445982
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| ||| ||||||||| | | | | ||||||  |||||||||||||        
T  9445808 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagtagctttagatgtttactaaagattagaggttgatttagaacaagattgaacctgg---- 9445903  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||||| | ||||| |||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9445904 ------aacaaccttagttggaaatctggaaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 9445982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18557334 - 18557249
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18557334 tagaacaaccgtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 18557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15728685 - 15728603
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15728685 gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15728603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12719032 - 12718948
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12719032 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12718948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12723943 - 12723859
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12723943 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12723859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 493
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  472 aagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 16906943 - 16907027
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16906943 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18279767 - 18279683
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18279767 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18279683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18283730 - 18283646
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18283730 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18283646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14217275 - 14217192
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14217275 gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 14217192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40443860 - 40443765
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | || |||| ||||||||||||||||    
T  40443860 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctgg 40443765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42205566 - 42205394
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||             
T  42205566 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttttctatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg--------- 42205476  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
     |||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42205475 -gaacaaccatagttggaattctggcaagtacgcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcggacacttccagaactgagt 42205394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8917879 - 8917704
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  8917879 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 8917787  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||| ||| | || || | |||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917786 ---aacgaccttagtaggaattctggcttgtactcgcaatggcgagctgatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 8917704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13462214 - 13462039
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||  |  || | |||||| ||||||||||| ||           
T  13462214 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattggagaatgatttagaacgagattgaacccgg------- 13462122  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||| ||| | ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462121 ---aactaccttagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 13462039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34201266 - 34201172
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| ||   | || ||||||||||||||||||||    
T  34201266 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatgagattgaacctg 34201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  474 g 474  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 15754527 - 15754620
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  15754527 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctgg 15754620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 20569246 - 20569420
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  20569246 gtattttgaacttttgagttgaacttttgatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattataggatgatttagaactagattgaacctgg---- 20569341  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20569342 ------aacaaccttagttgaaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactga 20569420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11262691 - 11262615
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11262691 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11262615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 11548010 - 11548086
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11548010 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11548086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 11554606 - 11554682
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11554606 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11554682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12692858 - 12692782
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692858 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 12692782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12715228 - 12715144
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12715228 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12715144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14953560 - 14953484
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14953560 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14953484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16114605 - 16114521
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16114605 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16114521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16117758 - 16117674
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16117758 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16117674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 12756359 - 12756450
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  12756359 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12756450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16213831 - 16213684
Alignment:
Q  344 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    |||||||||||||||  || | || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  16213831 tatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16213733  T
Q  441 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213732 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16724376 - 16724459
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16724376 gaacaaccttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 16724459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 17061602 - 17061693
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  17061602 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17061693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 17701390 - 17701473
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17701390 gaacaaccttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 17701473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 27847482 - 27847529
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847482 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 27847529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 16385895 - 16385961
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  16385895 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 16385961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 11995696 - 11995761
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  11995696 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 11995761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  478 ttgaagatgatga 490  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14959526 - 14959450
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14959526 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcaga 14959450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16275852 - 16275772
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16275852 gaacaaccttagttgggaagttggcttgtacttgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 16275772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 25038953 - 25039029
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25038953 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25039029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 28504938 - 28505033
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  28504938 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 28505033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38227959 - 38227868
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  38227959 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 38227868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 489
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  477 gttgaagatgatg 489  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18430770 - 18430709
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430770 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 479  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| | || | ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  480 gaagatgatga 490  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9509668 - 9509607
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  9509668 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 9509607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12699311 - 12699250
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12699311 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12699250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 70537 - 70693
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  70537 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 70636  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  70637 tggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 70693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 74646 - 74802
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  74646 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 74745  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  74746 tggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 74802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26212469 - 26212421
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26212469 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 26212421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 2831948 - 2831991
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2831948 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 2831991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 9751192 - 9751235
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9751192 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 9751235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24702296 - 24702238
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702296 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216860
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  27216873 gattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35151945 - 35151894
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 190  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151945 tggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 35151894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 471
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16583687 - 16583552
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| |  || | ||||||  ||||||||||||            
T  16583687 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctg-------- 16583596  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgag 161  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16583595 --gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgag 16583552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 3564006 - 3564067
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  3564006 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 3564067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18006120 - 18006059
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  18006120 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18006059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33441 - 33285
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | || || |||||   |    
T  33441 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgtttggattaggaa 33342  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  33341 tggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 33285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 10063867 - 10063939
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063867 ataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13635107 - 13635159
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13635107 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 474
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  430 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 810771 - 810814
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  810771 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaa 810814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Original strand, 18154885 - 18154943
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154885 tgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18302657 - 18302614
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18302657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaa 18302614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 39267288 - 39267331
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39267288 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaa 39267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 17701289 - 17701335
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17701289 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11080
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11043 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18748
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18711 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6801665 - 6801624
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6801665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 6801624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11987665 - 11987624
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11987665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 11987624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15728777 - 15728736
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15728777 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15728736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16275944 - 16275903
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16275944 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 16275903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16724284 - 16724321
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16724284 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35152058 - 35152021
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35152058 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39722581 - 39722544
Alignment:
Q  164 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39722581 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 39722544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44014653 - 44014592
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  44014653 ttttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 44014592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47832287 - 47832226
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  47832287 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 47832226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Original strand, 4318317 - 4318365
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4318317 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaa 4318365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 15143686 - 15143770
Alignment:
Q  24 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    | |  |||||||||||||||||||||    
T  15143686 ttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctgg 15143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 478
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18531581 - 18531531
Alignment:
Q  142 cttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  18531581 cttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaga 18531531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 474
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 68225 - 68164
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  68225 ttttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgatta 68164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529680
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 2529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16438687 - 16438724
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16438687 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16438724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18557424 - 18557383
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  18557424 tttttgacttttgagttgaaccttagaggcctttgagtacct 18557383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 68096 - 68060
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  68096 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 68060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 810900 - 810940
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  810900 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 810940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 9389466 - 9389502
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9389466 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9389502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18302529 - 18302489
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18302529 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 18302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44116872 - 44116820
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44116872 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44116820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27315 - 26840
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27315 atgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattaaatgataacttagaacgagatt 27216  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
     ||||||||  | |||||||||||  | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27215 taacctggtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcaagcatttccagaactgagtg 27116  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||  ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27115 caagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 27016  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    ||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27015 tg-ttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgata 26918  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26917 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 130)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Original strand, 40621835 - 40622327
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40621835 atgttgaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaggatgcatattaaagattaaatgataacttagaacgagatt 40621934  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621935 gaacctggtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 40622034  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||  ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40622035 caagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 40622134  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-----tgtatacataagatgttgatgaattgaatt 395  Q
    ||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40622135 tg-ttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttgatgaattgaa-t 40622232  T
Q  396 tgatataattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||  ||    || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  40622233 tgatataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23038511 - 23038227
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  23038511 ttttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaagct 23038412  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23038411 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtacccgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgc 23038312  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  23038311 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 22740598 - 22740945
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  22740598 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 22740697  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22740698 aacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 22740797  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || || |    
T  22740798 attgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgaga 22740896  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309108
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  20309113 tgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 22798759 - 22799094
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22798759 aattctatacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaacgagattgaacct 22798858  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 206  Q
    |||| | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22798859 ggtttagcttagaacagctttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagtt 22798958  T
Q  207 aggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaata 306  Q
    |||| | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||    
T  22798959 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-tta 22799057  T
Q  307 agatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 343  Q
     || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22799058 tgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtt 22799094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 22758353 - 22758700
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  || || ||||| |||     
T  22758353 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattacatgataacttagaacaagcttcaacctagttt 22758452  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22758453 aacctagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcactttcagaactgagtgcaagtgaggat 22758552  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  || || |    
T  22758553 attgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctg-ttatgaga 22758651  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22758700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 45677782 - 45678078
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  45677782 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 45677881  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45677882 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtg 45677981  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtga 297  Q
    ||| |||| |   || ||||||||||  |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  45677982 caattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 23019341 - 23019633
Alignment:
Q  9 ttctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23019341 ttctgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctgg 23019440  T
Q  109 ttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
    |  |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23019441 tctaggttagaacaactttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtcag 23019540  T
Q  209 gaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    || | |||||||||||||  || |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  23019541 gatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgtgaagct 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21917943 - 21918244
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  21917943 atgttgaattctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaactagatt 21918042  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21918043 gaacctggtttagctttgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 21918142  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21918143 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 21918242  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  21918243 tg 21918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24674068 - 24673768
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24674068 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgccttaagatgtttattgaagattaaatgataacctagaatgagatt 24673969  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24673968 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccacaactgaatg 24673869  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||  || | |||||||  | ||||| |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  24673868 caagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagc 24673769  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  24673768 t 24673768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 25963344 - 25963645
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  25963344 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 25963443  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25963444 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatg 25963543  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25963544 caagttagtatgttgcgatctgtttctcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagc 25963643  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  25963644 tg 25963645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 23100873 - 23101092
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23100873 ttttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaagatgcttattaaaaattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 23100972  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23100973 agaacaaccactgttgggaatctagcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggataatgc 23101072  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttg 236  Q
    ||||| ||||  ||||||||    
T  23101073 gatctatgtcgcatgatttg 23101092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 38021 - 38235
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38021 gttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 38120  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38121 gatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||    
T  38220 ttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37525156 - 37524856
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  37525156 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 37525057  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37525056 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 37524957  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||| || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  37524956 caagttagtatgttgcgatctgtttcacataagttgattaaggttggacccttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaattgaagtctgtgaagc 37524858  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  37524857 tg 37524856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 232 - 493
Target Start/End: Original strand, 23103254 - 23103516
Alignment:
Q  232 atttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaag 331  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| |    
T  23103254 atttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatg 23103352  T
Q  332 tgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcc 428  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||||  |||  || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23103353 tgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcc 23103452  T
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103453 tatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285865
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||      
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  474 gatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731355
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 490
Target Start/End: Original strand, 298714 - 298933
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  298714 aagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 298813  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298814 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298913  T
Q  471 taagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  298914 taagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654507
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||      
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738300
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22738282  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || | |||||||||||||    
T  22738283 tgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 22811561 - 22811713
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  22811561 atgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 22811660  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgcc 153  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  22811661 gaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgcc 22811713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    | ||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
     | |||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44370133
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaacca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||      
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 44370051  T
Q  127 ttgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
    | | | | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44370052 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 44370133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24658132 - 24658032
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24658132 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagatt 24658033  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  24658032 g 24658032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060513
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23060531  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  23060530 tgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22337331 - 22337115
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  22337331 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22337232  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337231 tgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22337133  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  22337132 tgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23660264 - 23660023
Alignment:
Q  254 gggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcatta 352  Q
    |||||||| |||||| |||  | || ||||||| |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  23660264 gggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 23660165  T
Q  353 cttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaa 450  Q
    |||||   ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23660164 cttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaa 23660066  T
Q  451 ctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23660065 ctaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24175267 - 24175093
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  24175267 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 24175172  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24175171 ------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24175093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 24654989 - 24655162
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||  || ||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||         
T  24654989 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttcgttgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctgg----- 24655083  T
Q  114 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
         ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24655084 -----aacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24655162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 24716188 - 24716365
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||          ||    
T  24716188 gacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgacttaaaacgagattgaacctgg----------aa 24716277  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  24716278 taaccaatgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagagccgagtgcaattgag 24716365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 22460843 - 22461018
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  22460843 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 22460935  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22460936 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22461018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24870347 - 24870173
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||          
T  24870347 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacct------ 24870254  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
        ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24870253 ----agaacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcatgagcacttccagaactga 24870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24735856 - 24735680
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||| ||  |||||||||||||           
T  24735856 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttcagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttataacaagattgaacctgg------- 24735764  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24735763 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgattgca 24735680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40428929 - 40428753
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |            
T  40428929 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacgagattgaacccg-------- 40428838  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccag-aactgagtgc 201  Q
      |||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428837 --gaacaaccttagttggaaatctggcaagtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaactgagtgc 40428753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 19928155 - 19928329
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  19928155 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 19928247  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19928248 ---aacaaccttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19928329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15477967 - 15477883
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15477967 tagaacaatcttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15477883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21318273 - 21318462
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||  ||||     
T  21318273 atgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcagtaaagattagaggatgacttagaacaagatg 21318372  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||          |||||||| | ||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21318373 gaacctg----------gaacaaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccagaactaagtg 21318462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21327204 - 21327393
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||  ||||     
T  21327204 atgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagatg 21327303  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||| ||| | ||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21327304 gaacctgg----------aacgaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccagaactgagtg 21327393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23598791 - 23598616
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||             
T  23598791 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagaaaatgatttagaacgagattgaacct--------- 23598701  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
     ||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598700 -agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23598616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23187528 - 23187353
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||             
T  23187528 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagtaaatgatttagaacgagattgaacct--------- 23187438  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
     ||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23187437 -agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23187353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 18855204 - 18855289
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18855204 tagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgc 18855289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 12901255 - 12901339
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12901255 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 19688501 - 19688585
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19688501 gaacaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatgacaagcagatgctctcgcatcgcgagcacttccagaactgagtgca 19688585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24649720 - 24649636
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24649720 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 24649636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 27379175 - 27379259
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27379175 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27379259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 27383221 - 27383305
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383221 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27383305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 61176 - 61094
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61176 gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctcccgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 61094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 302
Target Start/End: Original strand, 22811708 - 22811839
Alignment:
Q  170 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgt-catatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||  | |||||||  | |||||| || |||||||||| |||    
T  22811708 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgttttcata--aattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgac 22811805  T
Q  269 ctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22811806 ctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctg 22811839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27602137 - 27602076
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27602137 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27602076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 493
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 24628221 - 24628305
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24628221 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 24628305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 25961290 - 25961358
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961290 gttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 25961358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 41530752 - 41530836
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41530752 tagaacaaccttagttggaaagttggcatgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 41530836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 421 - 492
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 28291940 - 28291987
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28291940 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 28291987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 37765 - 37830
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  37765 gtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 37830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 32451571 - 32451632
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  32451571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgatta 32451632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26125564 - 26125484
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26125564 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 26125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41667310 - 41667230
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41667310 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 41667230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23660501 - 23660410
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  23660501 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 23660410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725995
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 298457 - 298518
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  298457 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 298518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20309577 - 20309532
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20309577 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctg 20309532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22133859 - 22133920
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22133859 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22133920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23286329 - 23286268
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  23286329 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 23286268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23654052 - 23654113
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||    
T  23654052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgatta 23654113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 23708668 - 23708721
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 492
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  477 gttgaagatgatgatg 492  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 476
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 22737822 - 22737865
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22737822 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 22737865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367790
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 487
Target Start/End: Original strand, 21155126 - 21155219
Alignment:
Q  395 ttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155126 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22730875 - 22730936
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22730875 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071695
Alignment:
Q  26 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 23071695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27263704 - 27263667
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263704 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 27263667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27754054 - 27753993
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||    
T  27754054 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgatta 27753993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24503450 - 24503402
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24503450 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactt 24503402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898358
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  24898344 tgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900841
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  24900827 tgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903318
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  24903304 tgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905795
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  24905781 tgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908270
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  24908256 tgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25176321 - 25176278
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25176321 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 25176278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  423 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 32039549 - 32039660
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32039549 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagtt 32039646  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  32039647 gattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529691
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26125656 - 26125615
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26125656 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 26125615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41667402 - 41667361
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41667402 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 41667361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23076919 - 23076876
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23076919 ttttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 23076876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27197219 - 27197172
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27197219 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 27197172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22337591 - 22337557
Alignment:
Q  20 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 54  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22337591 tgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 22337557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27263582 - 27263552
Alignment:
Q  170 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263582 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 27263552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 61268 - 61227
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  61268 tttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacct 61227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 10101417 - 10101473
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10101417 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 10101473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10327325 - 10327273
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  10327325 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttccattcttttgagt 10327273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 45
Target Start/End: Original strand, 18855115 - 18855143
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855115 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 18855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31756267 - 31756231
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31756267 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 31756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Original strand, 21433 - 21920
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21433 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttagaacgagatt 21532  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| |||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533 gaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 21632  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   || |||||||||    ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21633 caagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 21732  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    ||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21733 tg-ttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 21830  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  21831 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Original strand, 29325 - 29812
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29325 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttagaacgagatt 29424  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| |||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29425 gaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 29524  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   || |||||||||    ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  29525 caagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 29624  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    ||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29625 tg-ttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 29722  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  29723 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36934 - 36592
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggtttaactt 36835  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36834 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaaatac 36735  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||     
T  36734 gatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtta 36636  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36635 gtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 159)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 15121430 - 15121834
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15121430 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 15121529  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15121530 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15121629  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   |||||||||||||  || | ||| ||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  15121630 caagtgagaactttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggc 15121729  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || ||| || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15121730 tg-atatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgata 15121827  T
Q  401 taattat 407  Q
    |||||||    
T  15121828 taattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13570004 - 13569703
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13570004 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 13569905  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569904 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 13569805  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13569804 caagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 13569705  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  13569704 tg 13569703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15094265 - 15093911
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15094265 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttggaatgagatt 15094166  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15094165 gaacctggtatagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtg 15094066  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15094065 caagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctctgaagc 15093966  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 355  Q
    ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15093965 tg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 15093911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 17046601  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046600 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 17046501  T
Q  480 gaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||    
T  17046500 gaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44676124 - 44675823
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44676124 atgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagatt 44676025  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44676024 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactccccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtg 44675925  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  44675924 caagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagc 44675825  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  44675824 tg 44675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23843971 - 23843669
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23843971 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgattaaatgataacttggaatgagatt 23843872  T
Q  101 -gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
     |||||||||| | |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843871 tgaacctggtttagcttagaacaacattagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 23843772  T
Q  200 gcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    |||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23843771 gcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaag 23843672  T
Q  300 ctg 302  Q
    |||    
T  23843671 ctg 23843669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12570513 - 12570212
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  12570513 atgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 12570414  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570413 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 12570314  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   ||||| |||||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  12570313 caagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagc 12570214  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  12570213 tg 12570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16356580 - 16356881
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  16356580 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 16356679  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16356680 gaacctggtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 16356779  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16356780 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 16356879  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  16356880 tg 16356881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 15124790 - 15125081
Alignment:
Q  10 tctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggt 109  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15124790 tctgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggt 15124889  T
Q  110 tcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagg 209  Q
    | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15124890 ttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagg 15124989  T
Q  210 aaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    | | | |||| ||||||  || ||||| ||| || ||||||| |||||||||| | ||||| | ||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  15124990 atatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacctttttaa-atgttaactgcaatctgtgaagctg 15125081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 14053207 - 14053422
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag-a 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  14053207 gttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaa 14053306  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14053307 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatg 14053406  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||    
T  14053407 ttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16487705 - 16488005
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  16487705 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 16487804  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | |||||||| ||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16487805 gaacctgttttagcttagaaccactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 16487904  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | ||||||   ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16487905 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagc 16488004  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16488005 t 16488005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902757
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088877
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 280 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  476 tgttgaagatgatgat 491  Q
    || |||||||||||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 44053045 - 44052829
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  44053045 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 44052946  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  44052945 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagt 44052847  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  44052846 tgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36133600 - 36133791
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| |  ||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
T  36133600 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctgctaaagattagaggatgacttagaacaagatt 36133699  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133700 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 36133789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 486
Target Start/End: Original strand, 23374259 - 23374473
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  23374259 aagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 23374358  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23374359 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttc 23374457  T
Q  471 taagatgttgaagatg 486  Q
    |||| |||||||||||    
T  23374458 taagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377639
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  478 ttgaagatgatga 490  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 484  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  485 tgatgatgt 493  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 312 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcc 410  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  411 atgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 16348319 - 16348442
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  16348319 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 16348418  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaac 124  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  16348419 gaacctggtttagcttagaacaac 16348442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 11250211 - 11250389
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  11250211 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 11250306  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250307 ------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 11250389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  281 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  477 gttgaagatgat 488  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 16243053 - 16243220
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| |||||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||             
T  16243053 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct--------- 16243143  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16243144 -agaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 16243220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 16239875 - 16240090
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| |||  |||||    
T  16239875 gttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaaga 16239974  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  16239975 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagtt 16240073  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  16240074 gatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2015246 - 2015057
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||    
T  2015246 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagatt 2015147  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2015146 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 2015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 15352957 - 15353134
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |   || ||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||||||         
T  15352957 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttagttatgtattaaagatttgaggatgacttagaacaagattgaacctgg----- 15353051  T
Q  114 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
         ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353052 -----aacaaccatagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15353134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  324 ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gt 420  Q
    |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7893916 - 7893703
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  7893916 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 7893820  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7893819 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagt 7893721  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  7893720 tgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 16351498 - 16351672
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  16351498 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 16351593  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          || |||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351594 ------aataaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 16351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25555972 - 25555798
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||        
T  25555972 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctgg---- 25555877  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25555876 ------aacaatcatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaactga 25555798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9556893 - 9556809
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9556893 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9556809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 374 - 493
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 1951414 - 1951590
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  1951414 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 1951506  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1951507 ---aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgca 1951590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18237345 - 18237170
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  18237345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 18237253  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237252 ---aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18237170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 26243318 - 26243493
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  26243318 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaattagaacgagattgaacctgg------- 26243410  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26243411 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgc 26243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 18222031 - 18222205
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  18222031 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 18222123  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18222124 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18222205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 19757346 - 19757427
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757346 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19757427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19782460 - 19782379
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782460 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19782379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45938510 - 45938425
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45938510 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgc 45938425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 17152232 - 17152315
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152232 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17152315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23139631 - 23139548
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139631 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23139548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Original strand, 16678345 - 16678415
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16678345 gttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagt 16678415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3413163 - 3413078
Alignment:
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413163 aacttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 3413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 28569097 - 28569271
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||           
T  28569097 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg------- 28569189  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28569190 ---aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgtgagcacttccagaattgagtg 28569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Original strand, 4561072 - 4561160
Alignment:
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4561072 aacttagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4561160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 17047710 - 17047787
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17047710 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgatta 17047787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33742741 - 33742657
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33742741 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 33742657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 43255813 - 43255990
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||             
T  43255813 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct--------- 43255903  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatct-ggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
     ||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43255904 -agaacaaccttagttggaaagattggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgca 43255990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 5756703 - 5756764
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5756703 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 5756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9530885 - 9530711
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| |||||||||||          |    
T  9530885 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgatttagaacgagattgaacc----------t 9530796  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530795 agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagatgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 9530711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 14052951 - 14053016
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  14052951 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgatta 14053016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23838796 - 23838720
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23838796 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23838720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6190912 - 6190821
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   || ||  ||| ||||||||||||||||    
T  6190912 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 6190821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 491  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27534386 - 27534303
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27534386 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 27534303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14685520 - 14685458
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14685520 ttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602569
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  ||   |||||| |||||||||| |             
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgttttagaacgagattgaacat--------- 18602488  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
     ||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18602489 -agaacaaccttggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactga 18602569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 21814945 - 21815108
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    | || ||||||||| | ||||||||| | || |     
T  21814945 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815044  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||  |  | | || |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815045 agaatga--actttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 21815274 - 21815437
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    |||| ||||||||| | ||||||||| | || |     
T  21815274 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815373  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||  |  | | || |||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815374 agaatga--actttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 21818367 - 21818530
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    | || ||||||||| | ||||||||| | || |     
T  21818367 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21818466  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||  |  | | || |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21818467 agaatga--actttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 474
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  428 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14679302 - 14679249
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14679302 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14679249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15552296 - 15552231
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15552296 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 15552231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609154
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  ||   |||||| ||||||||||          |    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgttttagaacgagattgaac----------t 18609081  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttc 188  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  18609082 tagaacaaccttggttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctggtgctctcgcctcgcgagcacttc 18609154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16597133 - 16597033
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  16597133 attctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16597034  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  16597033 g 16597033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 41385488 - 41385564
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41385488 tagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 41385564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3096859 - 3096772
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 367  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096859 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Original strand, 16348466 - 16348592
Alignment:
Q  175 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  16348466 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 16348565  T
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||    
T  16348566 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 16348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242693
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  477 gttgaagatgatgatgtcca 496  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19242712 gattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 492
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  477 gttgaagatgatgatg 492  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44102688 - 44102627
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  44102688 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgatta 44102627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14039128 - 14039068
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatt 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  14039128 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatt 14039068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 14708379 - 14708459
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  14708379 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcatttcctgaattgag 14708459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 42997195 - 42997275
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42997195 gaacaaccttagttggaaagttggctcgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 42997275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 1837613 - 1837671
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837613 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||   ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 7799176 - 7799085
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7799176 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtaggatgagattgaacctgg 7799085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239581
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  18239568 gattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35614273 - 35614226
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35614273 gtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 35614226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 50222443 - 50222501
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222443 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 474
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355471
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 16239634 - 16239726
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta--aatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  || || ||  ||||||||||||||||||||    
T  16239634 ttttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga-aatgtagaatgagattgaacctgg 16239726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 357
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  292 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 357  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3413249 - 3413208
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3413249 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacct 3413208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7089345 - 7089284
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  7089345 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 7089284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12774477 - 12774416
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12774477 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12774416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12903224 - 12903164
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12903224 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12903164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22636913 - 22636852
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  22636913 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgatta 22636852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 44053308 - 44053248
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatt 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||    
T  44053308 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatt 44053248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 13812451 - 13812494
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13812451 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaa 13812494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 16377164 - 16377255
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||| |||||    ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16377164 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctgg 16377255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24029220 - 24029177
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24029220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaa 24029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttg-tatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3097111 - 3097050
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  3097111 ttttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 3097050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 14708287 - 14708324
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14708287 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23139723 - 23139682
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23139723 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23139682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 39705930 - 39705991
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  39705930 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 39705991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45938600 - 45938563
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45938600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 45938563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 14757194 - 14757350
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  14757194 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgccttgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaagttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 14757293  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  14757294 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 14757350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 17053514 - 17053482
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053514 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17810606 - 17810450
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||| | |||||   |    
T  17810606 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 17810507  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  17810506 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 17810450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13845018 - 13844975
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13845018 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaa 13844975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970853
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15190670 - 15190631
Alignment:
Q  144 tgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15190670 tgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15190631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 17152140 - 17152175
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17152140 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttga 17152175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 20156932 - 20156975
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  20156932 ttttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaa 20156975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  442 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 22633855 - 22633898
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22633855 ttttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaa 22633898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 44928565 - 44928608
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  44928565 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaa 44928608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 455  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 16678227 - 16678277
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 51  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16678227 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaatcttagattcttttga 16678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757291
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19757291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782511
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 19782511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8846854 - 8846793
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||  |||||| |||||    
T  8846854 ttttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgatta 8846793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12522424 - 12522375
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttc 188  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12522424 tggcttgtactcgccatggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttc 12522375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868338
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 15868338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18228528 - 18228565
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18228528 tttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851869
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 32851869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 42997103 - 42997140
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42997103 tttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagt 42997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13458
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13410 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaa 13458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8846724 - 8846688
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8846724 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 8846688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15091376 - 15091340
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15091376 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagt 15091340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15099700 - 15099664
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15099700 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15099664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15099834 - 15099786
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15099834 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 15099786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 22633983 - 22634023
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22633983 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 22634023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 162)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19863171
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaaccttgtttaacct 19863357  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  19863356 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgc 19863257  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19863256 gatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 25641821 - 25642168
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  25641821 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 25641920  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25641921 aacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 25642020  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    | ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || || |    
T  25642021 attgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgaga 25642119  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 25642168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22432733 - 22432443
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  22432733 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 22432634  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  22432633 aaccttgaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagtat 22432534  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22432533 attgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctg 22432443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22439283 - 22438951
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  22439283 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagcttaaatgataacttataacgagattgaacctagttt 22439184  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  22439183 aacctagaacaacttttgtagggaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaat 22439084  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    | |||||||||||||  || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |    
T  22439083 attgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaga 22438985  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 345  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22438984 tgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21739649 - 21739950
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  21739649 atgttgaattctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattagatgatgacttagagtgagatt 21739748  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21739749 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagta 21739848  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||| |   |||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21739849 caattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 21739948  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  21739949 tg 21739950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920751
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 15041177 - 15041644
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15041177 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttagaatgagatt 15041276  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15041277 gaacctggattaacctagaacaactattgttgggaatctgacttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcaaccacttccagaattgagtg 15041376  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||   || ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   | || ||||  |  ||||||| ||||    
T  15041377 caagtgagtttaacgcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagc 15041476  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgt-ttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgat 399  Q
    ||  |||||| ||||| || | |||| ||  || | |||||| | ||||||||||| ||| | | ||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  15041477 tgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttg-agattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgat 15041575  T
Q  400 ataattatgccatgctgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 466  Q
    || || ||| |||||||||||    || ||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041576 attataatgtcatgctgttgttgtgat-ctgcctatgctact-attgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831503
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgat 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  386 gaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 485  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 22831511  T
Q  486 gatgatgt 493  Q
    ||||||||    
T  22831510 gatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 287 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185517
Alignment:
Q  287 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 481  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21834517 - 21834818
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  21834517 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 21834616  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | |||||||||||  | ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21834617 gaacctgatttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtaatcaccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 21834716  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | |||||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21834717 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 21834816  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  21834817 tg 21834818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 321 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  321 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt 420  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 16523030 - 16523332
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || || | |||||| ||||||    
T  16523030 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattagataatgatttagaacgagatt 16523129  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| |||||| | |||||||||||    ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16523130 gaatctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 16523229  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  16523230 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagc 16523329  T
Q  301 tga 303  Q
    |||    
T  16523330 tga 16523332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18907601 - 18907299
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataact-tagaatgagat 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  || |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18907601 atgtcgaattctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtaccttcagatgtgtattaaagattaactgataaccctagaatgagat 18907502  T
Q  100 tgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
    ||||||||| | | |||||||||||  | ||||| |||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18907501 tgaacctggcttagcttagaacaactttagttggaaatctggcttgatttcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacagagt 18907402  T
Q  200 gcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    |||| |||| |   |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||    
T  18907401 gcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaag 18907302  T
Q  300 ctg 302  Q
    |||    
T  18907301 ctg 18907299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19873488 - 19873313
Alignment:
Q  127 ttgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtc 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19873488 ttgtagggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtc 19873389  T
Q  227 atatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
      || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19873388 gcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 16924526 - 16924776
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |  |||||| |||||| | ||| |||||    
T  16924526 gactttttagttgaaccttagatgcctttgagttcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttaggacaagattggacctggattaacctagaa 16924625  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 220  Q
     || || |||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  16924626 taatcaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagtttaatgcgatc 16924725  T
Q  221 tgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagaccta 271  Q
    ||||||  ||| ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16924726 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16965199
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaagatgcttaataaagaattgaagataacttaggacgagattggacctggattaacctagaa 16965056  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 220  Q
    ||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||    
T  16965057 caatcaatgttggaagtctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaacttagtgcaagtgagtttaatgtgatc 16965156  T
Q  221 tgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaat 263  Q
    ||||||  ||| ||||||||    ||||||| |||||||||||    
T  16965157 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaat 16965199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 20360865 - 20361081
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  20360865 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20360964  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20360965 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagt 20361063  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||| ||||||||||    
T  20361064 tgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18180965 - 18180780
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  18180965 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgatttagaatgagagtgaacctggtttagcat 18180866  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180865 agaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgca 18180780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 20638188 - 20638404
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  20638188 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaaga 20638287  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20638288 tgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 20638386  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  20638387 tgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  281 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 302
Target Start/End: Original strand, 22334664 - 22334819
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatg 246  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| || ||    
T  22334664 actcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttg 22334763  T
Q  247 gacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22334764 gacccctgggtagcaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtaaagctg 22334819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 16929242 - 16929487
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  16929242 gacttttgagttaaaccttagatgcctt-gagtgcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttgggatgagattggacctggattaacctagaa 16929340  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 220  Q
    |||  | |||||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    |||   |||||||||    
T  16929341 caattaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttgaaaactgagtgc----gagtttaatgcgatc 16929436  T
Q  221 tgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagaccta 271  Q
    ||||||  ||| ||||||||    ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16929437 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctcggtagtaatgataccta 16929487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059577
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaacca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||      
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 22059495  T
Q  127 ttgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
    | | | | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22059496 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 22059577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17804665 - 17804474
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  17804665 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 17804566  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804565 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 17804476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 22429668 - 22429859
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  22429668 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 22429767  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429768 gaacctgg----------aacaaccttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 22429857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgaga 19303545  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303546 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 19303644  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  19303645 gatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16496397 - 16496244
Alignment:
Q  342 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctg 438  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16496397 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 16496298  T
Q  439 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496297 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||   ||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 282 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 380  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  381 ttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
     |||||||||||||||    
T  20593788 atgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405873
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||| ||| | ||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgccttgagatgtttaataaagattggatgatgatttagaacgagattgaaccttgtttagctta 22405808  T
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    |||||||    | ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22405809 gaacaacttgagatggaaatctgggttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgag 22405873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 27567247 - 27567436
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  27567247 atgttgatttttgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 27567346  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27567347 gaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 27567436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 271
Target Start/End: Original strand, 31164589 - 31164744
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 215  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  31164589 tagaacaacctttattgggaacctggcttgtactcgccatggtgagcatatgcccttgcctcgcgagtacttccagaattgagtgcaagtgagtttaatg 31164688  T
Q  216 cgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagaccta 271  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31164689 cgacctgtgtcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409947
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || ||   | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagt 18409930  T
Q  476 tgttgaagatgatgatg 492  Q
    || ||||||||||||||    
T  18409931 tgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 19790429 - 19790603
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||        
T  19790429 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctgg---- 19790524  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
          ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19790525 ------aacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactga 19790603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 20907631 - 20907809
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||  || || |||||| | ||| ||||||||  |||||||||||          
T  20907631 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatacctttagatgtgtattatagattagaggatgacttagaacaagattgaacct------ 20907724  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
        ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20907725 ----agaacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaactgagtgc 20907809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 23657070 - 23657248
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||  || | ||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||        
T  23657070 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctacttaagattagatgatgatttagaacaagattgaacctgg---- 23657165  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657166 ------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23657248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1645173 - 1644983
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||    
T  1645173 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagatt 1645074  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1645073 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtg 1644984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 15894072 - 15894357
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  |||||   |  ||  ||  ||||||||| ||||||    ||||    
T  15894072 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctggaaagactt 15894171  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||  |      |||||| |||| | || |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  15894172 agaatgaaagaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgc 15894271  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |  |||||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||    
T  15894272 gtcctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctg 15894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 374 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  472 aagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12707049 - 12706966
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12707049 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12706966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    | ||| | ||||||| |||||| || ||||||   ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  484 atgatgatgt 493  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 5616467 - 5616642
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||||           
T  5616467 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 5616559  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616560 ---aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5616642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12496761 - 12496586
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  12496761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaattagaacgagattgaacctgg------- 12496669  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12496668 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 12496586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19663221 - 19663046
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  19663221 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 19663129  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19663128 ---aacaacctttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgc 19663046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22863309 - 22863123
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 215  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||  ||    
T  22863309 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttg 22863210  T
Q  216 cgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
     || ||| ||| | ||||| |||||   ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  22863209 agacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctg 22863123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16741556 - 16741484
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741556 gttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16741484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 27415687 - 27415771
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27415687 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 27415771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 27553265 - 27553435
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||          ||    
T  27553265 gacttttgagttgaaccttggatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 27553354  T
Q  121 caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||| | ||||| ||||||||  |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27553355 caaccttagttggaaatctggcaagtacacaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 27553435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 9481931 - 9482120
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||    
T  9481931 atgtcgaattctgagtttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagatt 9482030  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9482031 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaacctggcttgtacttgccatgacgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9482120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14472632 - 14472448
Alignment:
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  ||     
T  14472632 agaacaaccttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttga 14472533  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    || ||| ||| | ||| | |||||   ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  14472532 gacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 14472448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 25766812 - 25766997
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   || ||  || ||||||||| | |||   ||||||| |||||||||||    
T  25766812 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccattaggtgtctactaaagattagaggatgttttagaataagattgaacct 25766911  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    ||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||    
T  25766912 gg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagccattctagaactgattgca 25766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 1587476 - 1587558
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587476 gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 1587558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 22592457 - 22592628
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||| |||||   ||| | |||||| ||||||| ||||||           
T  22592457 tttttgacatttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattaggggatgatttagaacgagattgtacctgg------- 22592549  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
       ||||||| | ||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22592550 ---aacaaccttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 22592628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8244224 - 8244140
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8244224 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8244140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11567226 - 11567142
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11567226 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 11567142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21702648 - 21702568
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702648 gaacaaccttagttggaaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21702568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23395432 - 23395348
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23395432 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1561786 - 1561691
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  1561786 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctgg 1561691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821563
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   || ||  ||| ||||||||||||||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 18821563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 18955508 - 18955591
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18955508 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctcgaattgagtgc 18955591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22782374 - 22782227
Alignment:
Q  344 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  22782374 tatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 22782276  T
Q  441 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 16920282 - 16920347
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  16920282 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgatta 16920347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19870931 - 19870870
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870931 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19870870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25644392 - 25644339
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644392 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 12618587 - 12618671
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12618587 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 18917009 - 18917093
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18917009 tagaacaaccttagttggaaatttggcttgtactcgccacggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 18917093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23990284 - 23990200
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23990284 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23990200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 25135417 - 25135492
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135417 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 25135492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 28496115 - 28496284
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||    ||||    
T  28496115 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagactt 28496214  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    ||||  |  | | ||| ||||||| | || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28496215 agaatga-aacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 28496284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20109210 - 20109157
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109210 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 20637936 - 20637997
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20637936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 20637997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 20803317 - 20803377
Alignment:
Q  137 tctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20803317 tctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccataactga 20803377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18457193 - 18457102
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  18457193 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 18457102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  20557041 gattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 29808525 - 29808616
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||    
T  29808525 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 29808616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 19303183 - 19303273
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  19303183 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 19303273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  428 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 17287438 - 17287499
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17287438 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 17287499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 22779869 - 22779930
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  22779869 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 22779930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22831974 - 22831933
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831974 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 22831933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23019478 - 23019408
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23019478 atactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 25611365 - 25611426
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  25611365 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 25611426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 492
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  477 gttgaagatgatgatg 492  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4667898
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaa 4667898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4674745
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaa 4674745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20803190 - 20803242
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20803190 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 31155031 - 31155083
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31155031 attctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaa 31155083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 2291284 - 2291342
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291284 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8055087 - 8055029
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055087 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 493
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  446 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25928635 - 25928584
Alignment:
Q  141 gcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25928635 gcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 26924744 - 26924802
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924744 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 470
Target Start/End: Original strand, 4185865 - 4185919
Alignment:
Q  416 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185865 gttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18456777 - 18456732
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456777 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461892
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 22334525 - 22334567
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22334525 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 22334567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963371
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  477 gttgaagatgatgatg 492  Q
    | | |||||| |||||    
T  34963386 gattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185508
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaa 4185508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189392
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaa 4189392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 8227560 - 8227632
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  395 ttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 1541015 - 1541073
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541015 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11185974 - 11185927
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11185974 gtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 11185927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 487
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448686
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21939862 - 21939819
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21939862 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaa 21939819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29061015 - 29060976
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29061015 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 29060976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 20360612 - 20360674
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20360612 tttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 20360674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  321 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatg-tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt 418  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  419 -gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Original strand, 34369742 - 34369792
Alignment:
Q  142 cttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34369742 cttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccaga 34369792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 1587384 - 1587421
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1587384 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 2684994 - 2685031
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2684994 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2685031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12707141 - 12707100
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12707141 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 12707100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16741660 - 16741619
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16741660 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 16741619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19652674 - 19652613
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  19652674 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 19652613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21702740 - 21702699
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21702740 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 21702699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 18409469 - 18409509
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409469 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 18409509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16372193 - 16372146
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16372193 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 16372146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 478
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  427 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22331774 - 22331727
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22331774 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 22331727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23019874 - 23019843
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019874 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 23019843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27332969
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaa 27332969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393709
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaa 27393709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 49
Target Start/End: Original strand, 29096136 - 29096179
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 49  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29096136 gaattttgtaattttgacttctgagttgaaccttagatgctttt 29096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4186444 - 4186390
Alignment:
Q  416 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186444 gttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19873193 - 19873120
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873193 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22432322 - 22432249
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432322 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22438872 - 22438799
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438872 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 191
Target Start/End: Original strand, 34298395 - 34298441
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 191  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  34298395 gtactcgccatggcgagtagataatctcgcctcgcaagcacttccag 34298441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 25135325 - 25135362
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25135325 tttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagt 25135362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25644801 - 25644760
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 58  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25644801 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 25644760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Original strand, 29808638 - 29808695
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  29808638 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 29808695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 4185594 - 4185630
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4185594 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4185630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 4667984 - 4668020
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4667984 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4668020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19808890 - 19808814
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||| ||||| || || |||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  19808890 tagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccaga 19808814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20594252 - 20594212
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20594252 tttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 20594212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 22080508 - 22080544
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22080508 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22080544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 27415596 - 27415632
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27415596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13250 - 12857
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13250 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacatagaatgagatt 13151  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150 gaacctggtttagcttagaataactttagttgggattatggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 13051  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||| |   || ||| || ||    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  13050 caaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagc 12951  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatt 395  Q
    | |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12950 t-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 61378 - 61439
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  61378 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 61439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 193
Target Start/End: Original strand, 65271 - 65348
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
    |||||||||| | ||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65271 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtattcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 65348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 2368 - 1881
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  2368 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgagaacctagactgagatt 2269  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2268 gaacctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcgagaactgagtg 2169  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   |  |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2168 caagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 2069  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || ||| || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2068 tg-atatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggta 1971  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1970 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 69930
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttaacct 70173  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  70172 agaacagcctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 70073  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||     
T  70072 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtta 69974  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  69973 gtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10222 - 10413
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  10222 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 10321  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10322 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaaatgagtg 10411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 58161 - 58237
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58161 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 58237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 69867 - 69794
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69867 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 192)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 856627 - 856140
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  856627 atgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 856528  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | ||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  856527 gaacctgttttagcttagaacaattttagttggtattctggcttgtactcgctttggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 856428  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   || |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  856427 caagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 856328  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    |  ||| || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  856327 t-tatatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggta 856230  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856229 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877727
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaggacgagattgaacctggtttaacct 15877570  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15877571 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 15877670  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctata 273  Q
    |||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877671 gatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23408907 - 23408581
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23408907 ttttgacttttgagttgaaccttagata-ttatgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 23408809  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  23408808 agaacaaccattgttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgcaagtgaggatattgc 23408709  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 316  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||     
T  23408708 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctattttagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtta 23408610  T
Q  317 ttgttgattatgaagtgttataatgttta 345  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23408609 gtgttgaatatgatgtgatataatgttta 23408581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15060783 - 15060483
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060783 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 15060684  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15060683 gaacctggtttagcttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaggactgattg 15060584  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  15060583 caagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagc 15060484  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  15060483 t 15060483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15052007 - 15051707
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15052007 atgttgaattctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaattataacttagaatgagatt 15051908  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | | |||||||||||| | || || | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  15051907 gaacctggattagcttagaacaaccttagtcggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaggactgaatg 15051808  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   || ||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  15051807 caagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagc 15051708  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  15051707 t 15051707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 23077105 - 23077406
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||  ||| |||||||    
T  23077105 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacacagagtgagatt 23077204  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||| ||| | |||||||||||    ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  23077205 gaacctagtttagcttagaacaacttaggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgattt 23077304  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| ||||||   |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||    
T  23077305 caattgaggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatatgagaagtttactgtaatttgtgaagc 23077404  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  23077405 tg 23077406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12496746 - 12496445
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  12496746 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 12496647  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12496646 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 12496547  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  12496546 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagc 12496447  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  12496446 tg 12496445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 14878132 - 14878433
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  14878132 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 14878231  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14878232 gaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgagagcacttccagaaccgagtg 14878331  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatgga-cccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    | | |||||| | |||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14878332 cgattgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgacttatataagaagttaactgcaatctgtgaag 14878431  T
Q  300 ct 301  Q
    ||    
T  14878432 ct 14878433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16369899 - 16369692
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16369899 atgttgaattctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaataagatt 16369800  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369799 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 16369700  T
Q  201 caagtgag 208  Q
    ||||||||    
T  16369699 caagtgag 16369692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12173277 - 12173068
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12173277 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagatt 12173178  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12173177 gaacctggtttagcttagaacaactttagttggtattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 12173078  T
Q  201 caagtgagga 210  Q
    ||||| ||||    
T  12173077 caagttagga 12173068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 18383544 - 18383845
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  18383544 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 18383643  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18383644 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaactgaatg 18383743  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||    
T  18383744 caagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagc 18383843  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  18383844 tg 18383845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 323080 - 322779
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  323080 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcgttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 322981  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  322980 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaaatg 322881  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||| | ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |   |||||||||||    
T  322880 caagttagtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagc 322781  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  322780 tg 322779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 11298156 - 11298433
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| | | ||||||  |||||    
T  11298156 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgctgatttagaacaagatt 11298255  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11298256 gaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatg 11298355  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaga 278  Q
    ||| | || |   |||||||||| ||  || |||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  11298356 caatttagtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 11298433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 19725539 - 19725836
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||    
T  19725539 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattagatgatgatctagaacgagatt 19725638  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19725639 gaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaata 19725738  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  19725739 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaa 19725836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17524801 - 17525080
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17524801 atgtagaattcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataaattagaatgagatt 17524900  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||  | || ||||||||||||||||                      || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17524901 gaacctggtttagtttaaaacaacattagtagggaatctggcttgta----------------------cttgcctcgcgagcacttccaaaactgagtg 17524978  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17524979 caagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 17525078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 23052704 - 23052967
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||   |||||||||||||||    
T  23052704 atgttgaattttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgatgatgcatattaaatattagatggagacttagaatgagatt 23052803  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||| || ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  23052804 gaaactagttaagcttagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcagaattgaatg 23052903  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatg 264  Q
    ||||||||||   | ||| |||||||  || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23052904 caagtgaggatgttacgacctgtgtcgcataacttgattagagatggacccctgggtagtaatg 23052967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 20698341 - 20698556
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  20698341 gttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagat 20698440  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20698441 gttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20698539  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  20698540 gatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 26190636 - 26190843
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||| | ||||||||  |||||    
T  26190636 atgttgaattatgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagataagatgctgacttagaacaagatt 26190735  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||| ||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190736 gaacctggtttagcttataacaacttgagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 26190835  T
Q  201 caagtgag 208  Q
    ||| ||||    
T  26190836 caattgag 26190843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12399430 - 12399209
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| |||      
T  12399430 aagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatt 12399331  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399330 taagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12399232  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12399231 taagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 12037596 - 12037787
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12037596 ttttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttagaatgagattgaacctggttaagctt 12037695  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
     |||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12037696 tgaacaacattagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagccgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgag 12037787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13442490 - 13442274
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  13442490 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13442391  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13442390 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13442292  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  13442291 tgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17488072 - 17487856
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  17488072 gttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17487973  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17487972 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17487874  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  17487873 tgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972854
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| || |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14972872  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  14972871 tgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17499554 - 17499338
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  17499554 gttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17499455  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499454 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17499356  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  17499355 tgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 321641 - 321789
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  321641 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaaggttaaatgataacttagaatgagatt 321740  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtact 149  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  321741 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagcctgtact 321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11863247 - 11862981
Alignment:
Q  34 aaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  | |||||    
T  11863247 aaccttagatgcttttgagtgccttaagatt-ttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtt-agcttagaactactttagttgg 11863150  T
Q  134 gaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgat 233  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| |     
T  11863149 aattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtaagtacttccaaaattgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaa 11863050  T
Q  234 ttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||||    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11863049 ttgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctg 11862981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11852062 - 11851825
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  11852062 atgttgaatttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatt-ttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 11851964  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  11851963 gaacctggtt-agcttataacaactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgtaagcacttccagaactaagtg 11851865  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgatta 240  Q
    ||||| ||||   |||||||||| || ||| | |||||||    
T  11851864 caagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaattgatta 11851825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438534
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||| | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  484 atgatgatgt 493  Q
    ||||||||||    
T  18438543 atgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15849723 - 15849914
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||| ||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  15849723 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaagatt 15849822  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15849823 gaacctgg----------aacaaccttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15849912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 326802 - 326992
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  326802 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 326901  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  326902 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 326991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 1982460 - 1982636
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  1982460 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 1982555  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 199  Q
          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982556 ------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 1982636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 474
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576934
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 11594789 - 11594967
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  11594789 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 11594884  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594885 ------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 11594967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 490
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  281 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  478 ttgaagatgatga 490  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 7792999 - 7793175
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  7792999 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg------- 7793091  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793092 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 7793175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083482
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| |||  |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23083464  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  23083465 tgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 3402598 - 3402777
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  || ||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||    
T  3402598 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacc 3402697  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 195  Q
    ||          |||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402698 tg----------gaacaaccgtagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 3402777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15483130 - 15482939
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| |  || | ||||||  |||||    
T  15483130 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagatt 15483031  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15483030 gaacctgg----------aacaaccttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15482941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20461138 - 20461329
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||| | | ||| | ||||||  |||||    
T  20461138 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagatcagaggatgatttagaacaagatt 20461237  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461238 gaacctgg----------aacaaccttagttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 20461327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14179686 - 14179570
Alignment:
Q  242 agatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg 341  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14179686 agatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg 14179587  T
Q  342 -tttatgcattacttga 357  Q
     ||||||||||||||||    
T  14179586 ttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16910105 - 16909941
Alignment:
Q  137 tctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttg 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |      |||||||||    ||| |||    
T  16910105 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattg 16910006  T
Q  237 attatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  16910005 attagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagct 16909941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 25476389  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25476390 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagt 25476488  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  25476489 tgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 31097192 - 31097383
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||||||||| |  || | ||||||  |||||    
T  31097192 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatttagaacaagatt 31097291  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097292 gaacctgg----------aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctaccgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 31097381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 16797799 - 16797883
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16797799 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16797883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||||||   |||   |||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 1598133 - 1598308
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||             
T  1598133 tttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacct--------- 1598223  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598224 -agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 1598308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 11300164 - 11300339
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||||           
T  11300164 tttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg------- 11300256  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11300257 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 11300339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17242425 - 17242250
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  17242425 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 17242333  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242332 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17242250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42326397 - 42326222
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  42326397 ttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagtacctttcgatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg------- 42326305  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42326304 ---aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 42326222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16697248 - 16697071
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || |||  |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||        
T  16697248 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacaattagaggatgatttagaatgagactgaacctgg---- 16697153  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
          ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16697152 ------aacaaccttagttggaaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaagtgagtg 16697071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 16808626 - 16808710
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16808626 gaacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38814745 - 38814662
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814745 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 38814662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 15941647 - 15941732
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941647 tagaacaaccgtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15941732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386429
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 385  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || |||  | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  386 gaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    || ||| |||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16690675 - 16690498
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||| |||||   ||| | ||||||||||| |||||||||        
T  16690675 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacgattaggggatgatttagaatgagactgaacctgg---- 16690580  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
          ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16690579 ------aacaaccttagttggaaagctggcttttactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaagtgagtg 16690498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213838
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  ||||||  | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 40213823  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  40213824 tgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3834037 - 3833952
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3834037 tagaacaaccttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 3833952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 2897568 - 2897652
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2897568 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgacatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgca 2897652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Original strand, 11557037 - 11557208
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaac 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||           
T  11557037 attttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacccatagatgtttattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg------- 11557129  T
Q  115 ttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
        | ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11557130 ----agcaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 11557208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20723364 - 20723288
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20723364 tagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20723288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11855097 - 11855015
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11855097 gaacaaccatagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcaaatccagaactgagtg 11855015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14572804 - 14572608
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg-cattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||  ||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  14572804 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaaga 14572705  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||| ||| |   | ||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572704 tgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15470996 - 15470927
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470996 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7110065 - 7109981
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7110065 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7109981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7114000 - 7113916
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7114000 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7113916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22337086 - 22337002
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22337086 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22337002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 27409386 - 27409470
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27409386 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27409470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 477
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  428 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 493
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 53070341 - 53070504
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||| | || |     
T  53070341 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 53070440  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||  |  | | || |||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53070441 agaatga--actttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 53070504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14179805 - 14179740
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  14179805 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 14179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  474 gatgttgaagatgatga 490  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14234559 - 14234487
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234559 atactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22322031 - 22321947
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22322031 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 22321947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24188140 - 24188064
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24188140 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 24188064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 11424405 - 11424496
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11424405 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctgg 11424496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12399679 - 12399613
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12399679 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12399613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 489
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15617717 - 15617656
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617717 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15617656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 490
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55149341 - 55149256
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||  | ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  55149341 tagaacaacattagttgggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 55149256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  475 atgttgaagatgatga 490  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 13209966 - 13210010
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13209966 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 13210010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14573068 - 14572903
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    |||    
T  14573068 tttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagact 14572969  T
Q  116 tagaa-caaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    |||||  || | |  |||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14572968 tagaatgaaacct--ttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17674202 - 17674258
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674202 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 24340772 - 24340844
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389691
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  || ||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacatagaacaagattgaacctgg 3389691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 20698084 - 20698150
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  20698084 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 20698150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 477
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14973333 - 14973272
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  14973333 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 14973272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18439013 - 18438952
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  18439013 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18438952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28950068 - 28950007
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  28950068 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgtgagcacttccagaattgagtg 28950007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 477
Target Start/End: Original strand, 53070755 - 53070802
Alignment:
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070755 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588500
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 4588500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899094
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  8899107 gattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9513387 - 9513328
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  9513387 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 9513328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9521362 - 9521303
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  9521362 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 9521303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12340231 - 12340188
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12340231 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 12340188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454443
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  16454430 gattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16809868 - 16809821
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16809868 gtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaa 16809821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 16862823 - 16862979
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||| ||||| |  || | ||||||||||||||||||    
T  16862823 gaattctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacc 16862922  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctc 172  Q
    ||          |||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16862923 tg----------gaacaaccttagttggggatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 16862979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 17247928 - 17248019
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  17247928 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17248019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32308147 - 32308104
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32308147 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 32308104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962037
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 839583 - 839533
Alignment:
Q  142 cttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  839583 cttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 839533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119887
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 12933952 - 12934013
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12933952 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12934013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 488
Target Start/End: Original strand, 16282915 - 16282971
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282915 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Original strand, 23083003 - 23083044
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 58  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083003 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctg 23083044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26687366 - 26687305
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||    
T  26687366 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgatta 26687305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 192
Target Start/End: Original strand, 28350935 - 28350980
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28350935 actcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 28350980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 40213363 - 40213424
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  40213363 ttttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 40213424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 49389286 - 49389347
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  49389286 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 49389347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151953
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  13151939 tgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154418
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  476 tgttgaagatgatga 490  Q
    || | ||||||||||    
T  13154404 tgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 13544083 - 13544024
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 491  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544083 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30030306 - 30030246
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  30030306 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 30030246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 10247774 - 10247885
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10247774 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 10247871  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  10247872 gattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12567618 - 12567576
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567618 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 14576475 - 14576518
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14576475 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaa 14576518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446816
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  17446803 gattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 50242880 - 50242838
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242880 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 43842657 - 43842615
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 59  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43842657 ttttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctga 43842615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 12171759 - 12171820
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  12171759 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 12171820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 15941557 - 15941594
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15941557 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15941594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16104259 - 16104198
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  16104259 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 16104198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16797707 - 16797744
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16797707 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 17247162 - 17247223
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| |||||    
T  17247162 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgatta 17247223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17499818 - 17499757
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17499818 ttttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 17499757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 25476027 - 25476088
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||| |||||    
T  25476027 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgatta 25476088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38814837 - 38814796
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38814837 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 38814796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 3389719 - 3389763
Alignment:
Q  157 gcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3389719 gcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaactaagtgc 3389763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11070405 - 11070249
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||   |||||||  || || ||| ||| | ||||| |||||   |    
T  11070405 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattaagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 11070306  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  11070305 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 11070249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 13210098 - 13210138
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13210098 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcactt 13210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16796761 - 16796685
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 357  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796761 taattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17488335 - 17488275
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17488335 tttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 17488275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30066283 - 30066127
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||| | |||||   |    
T  30066283 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 30066184  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  30066183 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 30066127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 1644325 - 1644368
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  1644325 ttttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaa 1644368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14666084 - 14666041
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14666084 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaa 14666041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14669239 - 14669196
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14669239 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaa 14669196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14735597 - 14735554
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14735597 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaa 14735554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15471403 - 15471360
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15471403 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaa 15471360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Original strand, 15878095 - 15878168
Alignment:
Q  415 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878095 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3834127 - 3834086
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  3834127 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 3834086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7986046 - 7986001
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagca 184  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7986046 tggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagca 7986001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 11165301 - 11165454
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||| | ||| | |||||   |    
T  11165301 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 11165400  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||    
T  11165401 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaa 11165454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501617
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 14501617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 489
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275159
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 23275159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 49667726 - 49667786
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||||    
T  49667726 ttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgatta 49667786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 1465046 - 1465094
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1465046 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 1465094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 11424534 - 11424570
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11424534 actcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 11424570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Original strand, 17248040 - 17248092
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17248040 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17248092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20464 - 20117
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20464 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttt 20365  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20364 aacctagaacaacctttgttgggaatctgagttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 20265  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagata 311  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  || || |    
T  20264 aatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgaga 20166  T
Q  312 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 358  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20165 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 20117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 302
Target Start/End: Original strand, 8590 - 8885
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8590 aattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacct 8689  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 206  Q
     ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8690 agtttaacctagaacaacatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 8789  T
Q  207 aggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||| | ||||| |||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8790 aggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 487
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 48103 - 48388
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  48103 ttttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 48202  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||    
T  48203 agaacaaccattgttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgc 48302  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  48303 gatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaaatgcaatatgtgaagctg 48388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19750 - 19684
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  19750 tgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 19684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7782 - 7295
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7782 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagactgagatt 7683  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||| ||||||   | ||||||| ||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7682 gaacctggtttagcttggaacaattttagttgggattctggcttggactcgccgtggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtg 7583  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |    | ||| ||| |    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  7582 caagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaac 7483  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgata 400  Q
    || ||| || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7482 tg-atatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-ta 7385  T
Q  401 taattatgcca----tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||  ||    || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7384 taattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagat 15469  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15470 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||    
T  15569 ttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 32914 - 32961
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32914 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaa 32961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15179
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||    
T  15114 gtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgatta 15179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16282
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  16287 tgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16747 - 16686
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  16747 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 16686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1816 - 1531
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |    
T  1816 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagattaaaggataacttagaaagacattgaacctggttaaacct 1717  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1716 agaacaacctttgttgggagtctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 1617  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1616 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttaaatgcaatctacgaagctg 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16142 - 16047
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  16142 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1289
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  1294 tgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7266
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  7271 tgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16130 - 16083
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16130 gtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 490
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1711
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1758 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaa 1711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7735 - 7688
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7735 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaa 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 297
Target Start/End: Original strand, 65431 - 65716
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  65431 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatatttattaaagattaaatgataacttagaacaagattgaacctggttt 65530  T
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 211  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  65531 aacctagaacaacctttgttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 65630  T
Q  212 aatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtga 297  Q
    | |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  65631 attgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtga 65716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54033 - 53842
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||    
T  54033 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagatt 53934  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53933 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 53844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 477
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Original strand, 20069 - 20123
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataa 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  20069 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataa 20123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  439 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18720 - 18431
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18720 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 18621  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 212  Q
     ||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18620 gcttagaacatcattagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcacgagcgcttccagaactgagtgcaagtgaggata 18521  T
Q  213 atgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
     |||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18520 ttgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 76916 - 76998
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  76916 gaacaaccttcgttgggaagctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 76998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 15976 - 16330
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15976 atgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatagtttagaatgagatt 16075  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||| |||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16076 gaaccaggtttagcttagaacaacattggtagggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgccctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16175  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||    |||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16176 caagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 16275  T
Q  301 tgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 355  Q
    ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16276 tg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6595 - 6294
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595 atgttgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagttcctaaatttgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 6496  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6495 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgtgtg 6396  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || ||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  6395 caagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagc 6296  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  6295 tg 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15893 - 15642
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 15794  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15793 gaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15694  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggaccct 252  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  15693 caagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 6705 - 7006
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  6705 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagataataaataaagattagatgatgacttagagtgagatt 6804  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6805 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 6904  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||| |   |||||||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6905 caattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 7004  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  7005 tg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 8)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 34537 - 34838
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  34537 atgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagattttttttaaagattagatgatgacttagagtgagatt 34636  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34637 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 34736  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  34737 caagtgagaacattgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagc 34836  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  34837 tg 34838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 41185 - 41405
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41185 gaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacc 41284  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagt 205  Q
    | ||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41285 tagtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcacctcgtgagcacttttagaactgagtgcaagt 41384  T
Q  206 gaggaaaatgcgatctgtgtc 226  Q
    ||| |   |||||||||||||    
T  41385 gagaactttgcgatctgtgtc 41405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 474
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 64214 - 64131
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64214 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 64131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 76098 - 76015
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76098 gaacaaccttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 76015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23944 - 24005
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23944 ttttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 24005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64265
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  64306 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 64265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 76190 - 76153
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  76190 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 76153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51582
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatga 51588  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  51587 tgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 52051 - 52004
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52051 gtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaa 52004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Original strand, 965 - 1170
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  1165 tgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 701 - 766
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  701 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgatta 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 18080 - 18381
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  18080 atgtagaattctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaataatttaatgataacttagaatgaaatt 18179  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180 gaacctggtttagcttagaataacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 18279  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18280 caagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagc 18379  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  18380 tg 18381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15163 - 14863
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  15163 atgttgaattctattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagataagatgataacttagac-gagatt 15065  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064 gaacctggtttagcttagaacaactttagatgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 14965  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||  || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  14964 ccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagc 14865  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  14864 tg 14863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24181 - 23878
Alignment:
Q  1 atgttgaattctg---tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgag 97  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  24181 atgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttag-acgag 24083  T
Q  98 attgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24082 attgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 23983  T
Q  198 gtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtga 297  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||  || ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  23982 gtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtga 23883  T
Q  298 agctg 302  Q
    |||||    
T  23882 agctg 23878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39605 - 39302
Alignment:
Q  1 atgttgaattctg---tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgag 97  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  39605 atgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttag-acgag 39507  T
Q  98 attgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39506 attgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 39407  T
Q  198 gtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtga 297  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||  || ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  39406 gtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtga 39307  T
Q  298 agctg 302  Q
    |||||    
T  39306 agctg 39302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 18283 - 18584
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283 atgtcgaattctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 18382  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 18482  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |    | | |||||||    | | ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18483 caagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 18582  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  18583 tg 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39913
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   |||  |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||  |||  || ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagtt 39930  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  39929 gatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40329
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  40390 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgatta 40329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 5135  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 5235  T
Q  480 gaagatgatga 490  Q
    |||||||||||    
T  5236 gaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 4780 - 4845
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  4780 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 4845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 46354 - 46655
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  46354 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 46453  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| ||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46454 gaacttggtttagcttagaacaactttagttaggaatctggcttgtactcgccatggtgaccaaatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgagtg 46553  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||  || | |||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46554 caagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 46653  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  46654 tg 46655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15597
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15306 atgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagattaaatgataacttagaacgagatt 15405  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||          ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  15406 gaacct----------agaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgatcacttctagaacttagtg 15495  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | || ||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15496 caagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagc 15595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10553
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10448 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagattaaatgaaaacttagaacgagatt 10547  T
Q  101 gaacct 106  Q
    ||||||    
T  10548 gaacct 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 489
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3933
Alignment:
Q  45 cttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggctt 144  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  4189 cttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagctt 4090  T
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||  || ||||||||| |||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagaga 3991  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3990 tggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctg 3933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8364
Alignment:
Q  45 cttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggctt 144  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  8620 cttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagctt 8521  T
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattataga 244  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||  || ||||||||| |||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagaga 8422  T
Q  245 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8421 tggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctg 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  395 ttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 11)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 23294 - 23594
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  23294 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatagatattttttagtacctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 23393  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23394 gaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgttctcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtg 23493  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   |||||||| ||||  || |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23494 caagtgagaactttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgacctata-aagaagttagttgcaatctgtgaagc 23592  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  23593 tg 23594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 38127 - 38407
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  38127 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagtacctaaagatgtttattaaagattacatgatgacttagagtgagatt 38226  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| | ||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||                     |||||||||||||||| ||||    
T  38227 gaacatagtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggc---------------------gagcacttccagaactaagtg 38305  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   |||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38306 caagtgagaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagc 38405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 100446 - 100378
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100446 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 489
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  472 aagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17586
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 39651 - 39694
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  39651 ttttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaa 39694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 101873 - 101812
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  101873 tttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 101812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagat 10430  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 479  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10431 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgtt 10530  T
Q  480 gaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||    
T  10531 gaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10140
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  10075 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 10140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3030
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3331 atgttgaatcctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctagaatgagatt 3232  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    | |||||||| | |||||||||||    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3231 gcacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 3132  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||  ||||   || ||||||||||  || | |||||||  | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  3131 caagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 3032  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  3031 tg 3030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6997 - 6696
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6997 atgttgaattttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctagaatgagatt 6898  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    | |||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6897 gcacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 6798  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||  ||||   || ||||||||||  || | |||||||  | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  6797 caagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 6698  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  6697 tg 6696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  488 tgatgt 493  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 64290 - 64409
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  64290 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacatagaatgagatt 64389  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaa 120  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  64390 gaacctggtttagcttagaa 64409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47458 - 47393
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  47458 gtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgatta 47393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32626
Alignment:
Q  26 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaacc 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||     
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttagcttagaacaaca 32802  T
Q  126 attgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgt 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  32801 ttagttgggaatctggcttgtactcgacatgttgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatcgcgatctgtgt 32702  T
Q  226 catatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |  || ||||| ||| || ||||||| |||||||||| | ||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  32701 cgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct-tttaaaatgttaattgcaatctgtgaagctg 32626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8860 - 8778
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8860 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26877 - 26706
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26778  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26777 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 26706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23995
Alignment:
Q  243 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgt 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23907 - 23843
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23907 ctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32280 - 32067
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32280 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 32181  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 478  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32180 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 32082  T
Q  479 tgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||    
T  32081 tgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32489
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32536 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 32489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13711 - 13497
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13711 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 13612  T
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13611 gttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T
Q  478 ttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| |||||||||    
T  13512 ttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13902
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  13967 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 13902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 6043 - 6344
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6043 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttcagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 6142  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| ||||| | |||||||||||    ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6143 gaacttggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 6242  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| |||| | |||||| ||| ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  6243 caagttaggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagc 6342  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  6343 tg 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1681
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  1982 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 1883  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1882 gaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 1783  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| || |   |||||||||| |   || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  1782 caagttagtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagc 1683  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  1682 tg 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 13704 - 14005
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  13704 atgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttatagtgagatt 13803  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804 gaacctggtttagcttagaccaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 13903  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||| |   ||||| |||||||  || | ||  ||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  13904 caagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagc 14003  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  14004 tg 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17337
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17318  T
Q  474 gatgttgaagatgatgatg 492  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17319 gttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Original strand, 79007 - 79065
Alignment:
Q  20 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  79007 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgatta 79065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 16856 - 16948
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  16856 tttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 16948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 882 - 582
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  882 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctaatgatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 783  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| |  ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  782 gaacctggtttagtttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 683  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | ||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  682 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagc 583  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  582 t 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 348
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||| | ||| |||||||| ||||||    
T  649 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaatggttagacgatgacttagaacgagatt 550  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  549 gaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctctcctcgcaagcacttctagaactgagtg 450  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| |||| | |  ||||||||||  || | |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||    
T  449 caagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagc 350  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  349 tg 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 5952 - 6236
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  5952 ttttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttagattgagattgaacctggttaagctt 6051  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||    
T  6052 agaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtgaggatgttgc 6151  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    ||  ||||||  || | ||||||| |||||||||| |  ||||||||| || |||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  6152 gacttgtgtcgcataacttgattagagatggacccctaagtagtaatgtgatctatttaggatgttaaatgcaatctgtgaagct 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4300
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4355 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 875 - 1155
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  875 atgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagatt 974  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||| ||| | |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||                     |||||||||||||||||||||    
T  975 gaacctagtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggc---------------------gagcacttccagaactgagtg 1053  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  1054 caagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatcagtgaagc 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4911 - 4622
Alignment:
Q  9 ttctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4911 ttctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctgg 4812  T
Q  109 ttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 208  Q
    || | |||||||||||  |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4811 tttagcttagaacaactttatttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagttcaagtgag 4712  T
Q  209 gaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
     |   || || ||||||  | ||| |||||||   ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4711 aatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaa 4622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4861
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  4560 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagatt 4659  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||| |||| | |||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4660 gaaccgggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgtcatggtgagaagatgctctcgcctcgcgagcatttccaaaaccgagtg 4759  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||||| | |||||| ||||||  || ||||||| | || ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  4760 caattgaggacattgcgatttgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgacctatataagaagtttactgcaatctgtgaagc 4859  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  4860 tg 4861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4712
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 484  Q
    |||| | ||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  485 tgatgatgt 493  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  388 attgaatttgatataattatgccatgctgtt 418  Q
    |||| | ||||| || ||||| |||||||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 343
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  404 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 5180 - 5119
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  5180 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 5119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 1711 - 2012
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  1711 atgtcgaattttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 1810  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1811 gaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 1910  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| |||| |   || ||||||||||  |||| | |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| || ||| ||||||||    
T  1911 caaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagc 2010  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  2011 tg 2012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 21196 - 21497
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21196 atgtcgaattctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtaggatgagatt 21295  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21296 gaacctggtttagcttagagcaaccttagttggaattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 21395  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||  || | |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  21396 caagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagc 21495  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  21496 tg 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 22719 - 22788
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22719 atactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 190915 - 191102
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  190915 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 191014  T
Q  108 gttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 195  Q
    ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  191015 gtttaacctagaacaaaatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 191102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 192618 - 192812
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  192618 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagattgagattgaacctg 192717  T
Q  108 gttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  192718 gtttaacctagaacaaactttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagatctaagtgca 192812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 56550 - 56376
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||           
T  56550 tttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacctgg------- 56458  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56457 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 56376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 14963 - 15056
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||    
T  14963 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaaagacttagaacgagattgaacct 15056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 19485 - 19578
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||    
T  19485 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaaagacttagaacgagattgaacct 19578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1084
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  1385 atgtcgaattctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattagatgatgatttagaatgagatt 1286  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||| || | |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1285 gaacctgatttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctagaactgaatg 1186  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagc 300  Q
    ||| | ||||   |||||||||||||  |  | |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  1185 caaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggc 1086  T
Q  301 tg 302  Q
    ||    
T  1085 tg 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6074 - 5872
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  6074 atgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagatt 5975  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5974 gaacctggtttagcttcgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatg 5875  T
Q  201 caa 203  Q
    |||    
T  5874 caa 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7269 - 7067
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  7269 atgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagatt 7170  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||| |||||||  | ||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7169 gaacctggtttagctttgaacaactttagttgtaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatg 7070  T
Q  201 caa 203  Q
    |||    
T  7069 caa 7067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  425 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 2021
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||    
T  2317 atgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaaacgagatt 2219  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  2218 gaacctggtttatcttagaacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaata 2119  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    |||||  |||   |||||||||| ||  |  | ||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||    
T  2118 caagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaa 2021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9999 - 9703
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||    
T  9999 atgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaaacgagatt 9901  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  9900 gaacctggtttatcttagaacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaata 9801  T
Q  201 caagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 298  Q
    |||||  |||   |||||||||| ||  |  | ||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||    
T  9800 caagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaa 9703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 179128 - 178974
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  179128 ttttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaataagattgaacctggtttaactt 179029  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  179028 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggctagcagatgctct 178974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 15472 - 15512
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15472 ttttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16748 - 16949
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||  |||||    
T  16748 atgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaatattagatgatgacttagaacaagatt 16847  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16848 gaacttggtttagcttagaacaaccttagttgggaatctggcatgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaaccgagtg 16947  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  16948 ca 16949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30372 - 30573
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  30372 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattagatgatgatttagaacgagatt 30471  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30472 gaacctggtttagcttagaacaactggagttggaaatctggcttatactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaactgagtg 30571  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  30572 ca 30573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 422 - 489
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2237 - 2157
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2237 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 2157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2329 - 2288
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  2329 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 2288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 949 - 1169
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 374  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  472 aagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 702 - 763
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4849
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||| |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  484 atgatgatgt 493  Q
    ||||||||||    
T  4858 atgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 5321 - 5255
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  5321 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgatta 5255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 758 - 566
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  758 atgttgaaatctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttagaacaagatt 659  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||          ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  658 gaacctg----------gaataaccattgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 418
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt 418  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13427 - 13211
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  13427 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13328  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13327 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13229  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  13228 tgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9781 - 9701
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9781 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgag 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13679 - 13618
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  13679 ttttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgatta 13618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9832
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 9832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168099
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 374  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 471  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  472 aagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 52129 - 51913
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  52129 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 52030  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52029 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 51931  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  51930 tgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 167632 - 167693
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  167632 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 167693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 52391 - 52330
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  52391 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 52330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  484 atgatgatgt 493  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2377
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2424 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 2377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3470
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 3488  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  3487 tgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc--tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 732
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||    
T  821 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3888
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  3949 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 3888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1851
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1869  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  1868 tgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2269
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  2330 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 2269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 207160 - 207204
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  207160 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 207204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 6026 - 6245
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||   ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  474 gatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    | || |||||||||||||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 5762 - 5824
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  5762 ttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 5824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 18945 - 19220
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||            
T  18945 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgttcactaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctgg-------- 19036  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 216  Q
      || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    |     
T  19037 --aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgt 19134  T
Q  217 gatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    || ||| ||    ||| |||||||   ||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19135 gacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctg 19220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3271
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3254  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  3255 gatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 655 - 716
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  655 ttttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 773
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcata 229  Q
    |||||| |||| | || |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||  |    
T  945 ttgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 846  T
Q  230 tgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  845 taatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 10590 - 10659
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10590 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 1020
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1062 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgc 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10271
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  10210 ttttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 10271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38976 - 38761
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  38976 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 38877  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  38876 tgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagtt 38778  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  38777 gatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 484  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  485 tgatgatgt 493  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9744
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 495  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39238 - 39147
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  39238 ttttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 39147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1324
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  1127 atgtcgaattctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgttgacttagaacaagatt 1226  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||| |||          || |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1227 gaacttgg----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtg 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 39692 - 39479
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  39692 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 39593  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39592 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39494  T
Q  477 gttgaagatgatgat 491  Q
    | |||||| ||||||    
T  39493 gatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 491
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75333
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  75120 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 75219  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 75318  T
Q  477 gttgaagatgatgat 491  Q
    | |||||| ||||||    
T  75319 gatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 492
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  292 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 390  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  391 gaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 487  Q
      ||||||||| |||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  488 tgatg 492  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 35153 - 35338
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||    
T  35153 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattagaggatgatttagaacaagattgaacc 35252  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253 tgg----------aacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 35338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 280 - 486
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
     |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26168  T
Q  476 tgttgaagatg 486  Q
    || ||||||||    
T  26169 tgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  473 agatgttgaagatgatga 490  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25768
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  25706 tttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 25768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Original strand, 33136 - 33177
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 58  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33136 ttttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctg 33177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2269 - 2079
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
T  2269 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcattaaagattagaggatgacttagaacaagatt 2170  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||| ||          || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2169 gaacccgg----------aataaccattgttgg-aatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 2081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 608
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
T  799 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagatt 700  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||           || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699 gaacctga----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 511
Alignment:
Q  255 ggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  555 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaag 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45586 - 45395
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| | ||| ||||||||  |||||    
T  45586 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagatt 45487  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||           || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45486 gaacctga----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 45397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7305 - 7222
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7305 gaacaaccgtagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 7222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 11047 - 11129
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11047 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 11129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 38585 - 38646
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  38585 tggcttgtactcgccatggcgagcagatcctctcgcctcgtgagcacttcaagaattgagtg 38646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 10955 - 10992
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10955 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38509
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38472 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 7505 - 7468
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7505 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45342 - 45298
Alignment:
Q  255 ggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  45342 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaag 45298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 8175 - 8235
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  8175 ttttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 8235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20910
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 470  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  471 taagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21374 - 21308
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21374 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 66068 - 66244
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  ||||| |||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  66068 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg------- 66160  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66161 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 66244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 71209 - 71343
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  ||||| |||||| | ||| | ||||||  ||||||||||||            
T  71209 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg-------- 71300  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcga 160  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  71301 --gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcga 71343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 10)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340065
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  339955 tgttgttgacttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 340051  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    |  |||||||||||    
T  340052 gacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 96967 - 96883
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96967 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 96883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 140163 - 139988
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||| ||||||||||||             
T  140163 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct--------- 140073  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
     ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140072 -agaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 139988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 71674 - 71590
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  71674 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 71590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 413806 - 413874
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  413806 gttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 413874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 339593 - 339636
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  339593 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaa 339636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 71765 - 71725
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  71765 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 71725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Original strand, 339705 - 339757
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 182  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  339705 ttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 339757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 7)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 18276 - 18461
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 106  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||  || ||||||||| |  || | ||||||  |||||||||||    
T  18276 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacct 18375  T
Q  107 ggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
              ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376 ----------agaacaaccttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 18461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4508
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 4526  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  4525 tgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12090
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 12108  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  12107 tgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22042
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 22060  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  22059 tgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4896
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||    
T  4987 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 4896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12478
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||    
T  12569 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22521 - 22430
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||    
T  22521 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 22430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16721
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    || || ||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 16703  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  16704 tgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16332
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | || |||||||||||||||||||||    
T  16241 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctgg 16332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44542 - 44419
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  44542 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttagaacgagatt 44443  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaac 124  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  44442 gaacctggtttagcttagaacaac 44419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44395 - 44269
Alignment:
Q  175 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcatatgatttgattatagatggacccttgggtagtaatgagacctatat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |   |||||||| | ||  || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  44395 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctttttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 44296  T
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagct 301  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||    
T  44295 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 44269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19656 - 19465
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  || ||  || ||||||||| |  || | ||||||  |||||    
T  19656 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagatt 19557  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19556 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 19467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13265 - 13181
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13265 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgca 13181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 62600 - 62541
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  62600 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagaattgag 62541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 40458 - 40400
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40458 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 62713 - 62676
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  62713 tttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 62676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13372 - 13320
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13372 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccatagatacctttgagt 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  477 gttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 40335 - 40274
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  40335 ttttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 40274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 39573 - 39616
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39573 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaa 39616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23090 - 22886
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  23090 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22991  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 483  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22893  T
Q  484 atgatga 490  Q
    |||||||    
T  22892 atgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23361 - 23300
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  23361 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 23300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 8)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 493
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  318 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg 416  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  417 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  318 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg 416  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  417 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19845
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||  || ||||||||| |  || | ||||||  |||||    
T  19655 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacatttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagatt 19754  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19755 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 19844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16113
Alignment:
Q  311 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgc 409  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||||| | ||||| || ||  ||| ||||||||| || ||      
T  16298 atgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatat 16199  T
Q  410 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16198 cttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 493
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 32601 - 32662
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  32601 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 32662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 46404 - 46343
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||    
T  46404 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatta 46343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16565 - 16505
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  16565 ttttgacttttgagttgatccttag-ggcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 16505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 15072 - 15247
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaactt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||            
T  15072 ttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg-------- 15163  T
Q  117 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  375 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 173758 - 173567
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagatt 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||| ||||| | ||| | ||| |||||||||    
T  173758 atgtcgaattctgagtttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatttataatgagatt 173659  T
Q  101 gaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    ||||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  173658 gaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtg 173569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 422173 - 422359
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttga-cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaac 104  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||    
T  422173 gaattttgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttaaataaagattagaggatgacttagaacaagattgaac 422272  T
Q  105 ctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  422273 ctg----------gaacaaacatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcagctcgcgagcacttccagaacagagtgc 422359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 161164 - 161103
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  161164 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 161103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 501142 - 501100
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501142 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18807 - 18633
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||||           
T  18807 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg------- 18715  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
       ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18714 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4052
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||  || ||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||||||        
T  3874 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg---- 3969  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3970 ------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 2078 - 2263
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||    
T  2078 gaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagtacaagattgaacc 2177  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2178 tgg----------aacaaccgtagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 9938 - 10123
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||  || ||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||    
T  9938 gaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagtacaagattgaacc 10037  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          ||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10038 tgg----------aacaaccgtagttggaaacttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28414
Alignment:
Q  364 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 460  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28545 tttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgca 28447  T
Q  461 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28446 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  437 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 14961 - 14914
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 59  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14961 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 228118 - 228202
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228118 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 228202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 207
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  290 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 341
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  382 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 635
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || ||  ||||| |  ||   |||||||||||||||||          |    
T  806 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgttttagaatgagattgaac----------t 717  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 197  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  716 tagaacaacctttgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10181
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  10356 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 10264  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10263 ---aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 10181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  311 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgc 409  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||| ||||||  ||||||||| || ||      
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  410 catgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    | ||||| |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4962
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4997 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 4962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 202
Target Start/End: Original strand, 2416 - 2502
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2416 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9680 - 9627
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9680 tggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 9627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2353
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 43  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2311 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 2353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23669 - 23494
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||||           
T  23669 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg------- 23577  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
       ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23576 ---aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 23494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 477
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 242420 - 242344
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  242420 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 242344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 129977 - 129924
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129977 atactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 130386 - 130343
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  130386 ttttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaa 130343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  416 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  275 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 373  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 443  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34603 - 34509
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  34603 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 34509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13528
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 13528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15490 - 15374
Alignment:
Q  86 acttagaatgagattgaacctggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcac 185  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15490 acttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcac 15391  T
Q  186 ttccagaactgagtgca 202  Q
    || ||||||||||||||    
T  15390 tttcagaactgagtgca 15374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17402
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17361 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 36034 - 36105
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataact 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36034 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataact 36105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 24713 - 24796
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 24621 - 24658
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24621 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Original strand, 3269 - 3359
Alignment:
Q  112 aacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    ||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3269 aacttggaagaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 45
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3212
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3183 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 3212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11743 - 11658
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11743 tagaacaaccttagttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 11658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 13243 - 13316
Alignment:
Q  129 gttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13243 gttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  ||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 376 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  474 g 474  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 6913 - 7098
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||||| | ||| | ||||||  ||||||||||    
T  6913 gaattttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttgctatagattagaggatgatttagaacaagattgaacc 7012  T
Q  106 tggttcaacttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||          || |||||| | ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7013 tgg----------aataaccatggatggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 493
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  378 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  475 atgttgaagatgatgatgt 493  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11227
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 11227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14057
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgatta 14057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6669
Alignment:
Q  288 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 386  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  6818 taatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 6719  T
Q  387 aattgaatttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 433  Q
    |||||   ||||||| |||||| |||| ||   |||||||||||||||||    
T  6718 aattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7081 - 7035
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7081 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 7035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9695 - 9613
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9695 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 2855 - 2923
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2855 atactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2506
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||    
T  2445 ttttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgatta 2506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 2573 - 2613
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2573 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 2613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 7052
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14472 - 14432
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14472 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 14432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1398 - 1339
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1398 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1052
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 357  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1128 taattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8479
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| ||   |||||    
T  8691 gttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaaga 8596  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 475  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8595 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 8497  T
Q  476 tgttgaagatgatgatgt 493  Q
    || |||||||||||||||    
T  8496 tgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8911
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8954 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 8911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20591 - 20530
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20591 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 20530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36668 - 36583
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    ||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36668 tagaacaacctaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgc 36583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 36757 - 36717
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36757 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 36717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 191966 - 192144
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||  || ||||||||| |  || ||||||||  |||||||||||||        
T  191966 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaatgacttagaacaagattgaacctgg---- 192061  T
Q  113 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
          |||||||| | |||| | |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  192062 ------aacaaccagtattggaattctggcttgtactcgccgtggcgagctgatgctctcgcctcgtgagcacttccagaattgagtgc 192144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7290 - 7229
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  7290 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 671 - 731
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgatta 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 15257 - 15318
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  15257 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgatta 15318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 4844 - 4928
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4844 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 2286 - 2347
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  2286 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 2347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8932 - 8849
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8932 gaacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcatttccagaactgagtgc 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3965 - 3906
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3965 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaa 3906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8029 - 7970
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8029 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaa 7970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 27798 - 27851
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3648
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 329  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3695 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7712
Alignment:
Q  282 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 329  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7759 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 5745 - 5828
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5745 gaacaaccttagttggaattccggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27911
Alignment:
Q  280 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 378  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  379 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgc 414  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29015 - 28923
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggt 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||||    
T  29015 ttttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggt 28923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 6029
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6072 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaa 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 474
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  417 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 28917 - 28983
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  28917 tgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 28983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  377 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||  |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  475 atgttgaagatgatgatgt 493  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 192
Target Start/End: Original strand, 29964 - 30026
Alignment:
Q  130 ttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29964 ttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 30026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13376
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13419 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 13376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 45426 - 45492
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  45426 tgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgatta 45492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 45561 - 45597
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45561 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 45597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 58461 - 58545
Alignment:
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  58461 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 58545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134211
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  134224 gattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141618
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  141631 gattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 133132 - 133071
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  133132 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 133071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 10910 - 10957
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 10957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17259 - 17168
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  17259 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16842 - 16784
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16842 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 51526 - 51617
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   || ||  ||| ||||||||||||||||    
T  51526 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 51617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Original strand, 16408 - 16488
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16408 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcaagcacttccagaattgag 16488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 476
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16316 - 16353
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16316 tttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 16353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  474 gatgttgaagatgatga 490  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 18013 - 18180
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttcaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||  |||||    || | |||||| ||||||||||||||           
T  18013 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg------- 18105  T
Q  116 tagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 193  Q
       ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18106 ---aacaaccttagttaggaatctggcttgtactcgctatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaa 18180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  424 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2788
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  2727 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 2788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 477
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  427 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 13250 - 13311
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  13250 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 13311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 490
Target Start/End: Original strand, 38751 - 38820
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  38751 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32567 - 32501
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  32567 tgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 32501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 493
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 24291 - 24336
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  24291 atttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaa 24336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42870 - 42810
Alignment:
Q  242 agatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  42870 agatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 42810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 24421 - 24461
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24421 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 24461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  376 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 473  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  474 gatg 477  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 7936 - 7979
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 7979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 53108 - 53156
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53108 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaa 53156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6085
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 gaacaaccgtagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2260 - 2178
Alignment:
Q  118 gaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 200  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2260 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2311
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2352 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 2311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 5802 - 5839
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5802 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 493
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  426 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 604 - 665
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  604 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 433
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  293 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 391  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  392 aatttgatataattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 433  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15677 - 15618
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 198  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15677 tggcttgtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15755
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15796 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2177
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  2082 tgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 2177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 17650 - 17711
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17650 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 17711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20882 - 20821
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20882 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 20821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10517 - 10464
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10517 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Original strand, 14306 - 14359
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14306 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28512
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  28451 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 28512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10546
Alignment:
Q  421 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10599 atactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9512
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaa 9512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9426 - 9390
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 183  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9426 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  477 gttgaagatgatgat 491  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 493
Target Start/End: Original strand, 18084 - 18148
Alignment:
Q  429 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18084 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 474
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  440 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 6470 - 6531
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||| |||||    
T  6470 ttttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgatta 6531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1893 - 1798
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||| ||||||||| | ||  | ||||||  |||||||||||||    
T  1893 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttattaaagattagaggaggatttagaacaagattgaacctgg 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12316
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctgg 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||    
T  12407 ttttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13947
Alignment:
Q  380 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 476  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  477 gttgaagatgatga 490  Q
    | | ||||||||||    
T  13960 gattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3350
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  3411 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 3350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 477
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  374 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 469  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  ||||  |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  470 ctaagatg 477  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18661
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  18600 ttttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1810
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  1711 attctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 1809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 491  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 10349
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10389 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 10349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10261 - 10221
Alignment:
Q  147 actcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcactt 187  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10261 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 10221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10637 - 10597
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10637 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 10597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 12451 - 12494
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12451 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 12494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9519
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9480 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaa 9519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4214
Alignment:
Q  393 atttgatataattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 489  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  420 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 474  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  444 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 1939 - 2004
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||| |||||    
T  1939 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgatta 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 322
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  383 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 492
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12413
Alignment:
Q  431 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12353 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 9345 - 9382
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12206 - 12169
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12206 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10562
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 78  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||    
T  10623 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgatta 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1134
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1098 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 6484 - 6432
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6484 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgcctttgagt 6432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 11438 - 11482
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 45  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11438 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  446 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2284
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgc 65  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2327 actttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgc 2284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7717 - 7662
Alignment:
Q  244 atggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 299  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7717 atggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaag 7662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Original strand, 4690 - 4733
Alignment:
Q  259 gtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4690 gtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37044 - 36994
Alignment:
Q  142 cttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37044 cttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 472
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  422 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 472  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 477
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  448 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Original strand, 9081 - 9122
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 59  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9081 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Original strand, 24741 - 24790
Alignment:
Q  139 tggcttgtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttc 188  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24741 tggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttc 24790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43469
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 43469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47389
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 47389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3704
Alignment:
Q  145 gtactcgccaaggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 201  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3648 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 981 times since January 2019
Visitors: 2242