View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0157_low_9 (Length: 463)

Name: NF0157_low_9
Description: NF0157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0157_low_9
NF0157_low_9
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (5-443)||(3470-3910)
scaffold0292 (5-443)||(343-782)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (5-443)||(20536208-20536648)
chr8 (5-443)||(18818091-18818530)
chr8 (5-443)||(18878918-18879352)
chr8 (5-443)||(22626736-22627175)
chr8 (5-443)||(21923609-21924049)
chr8 (5-443)||(23406379-23406821)
chr8 (5-442)||(28648725-28649164)
chr8 (5-443)||(21918691-21919121)
chr8 (5-442)||(23648554-23648993)
chr8 (6-446)||(6759255-6759696)
chr8 (6-443)||(16092023-16092463)
chr8 (5-443)||(31971257-31971684)
chr8 (5-443)||(7372778-7373189)
chr8 (8-443)||(22875065-22875502)
chr8 (8-443)||(16199342-16199765)
chr8 (121-443)||(45130796-45131117)
chr8 (5-321)||(25362832-25363138)
chr8 (5-207)||(41598421-41598624)
chr8 (278-440)||(4483281-4483442)
chr8 (278-440)||(14409444-14409606)
chr8 (278-440)||(1484402-1484564)
chr8 (278-440)||(5853292-5853454)
chr8 (278-436)||(16413316-16413474)
chr8 (278-440)||(20403227-20403389)
chr8 (278-440)||(22001753-22001915)
chr8 (278-440)||(41598188-41598350)
chr8 (269-443)||(21389399-21389571)
chr8 (269-443)||(21395929-21396101)
chr8 (269-443)||(21778725-21778897)
chr8 (269-443)||(21790422-21790594)
chr8 (5-130)||(5865958-5866082)
chr8 (5-130)||(17141229-17141353)
chr8 (278-440)||(4542373-4542535)
chr8 (278-440)||(15203231-15203393)
chr8 (278-440)||(20046195-20046357)
chr8 (261-441)||(18678039-18678221)
chr8 (5-130)||(21491308-21491432)
chr8 (8-130)||(21249697-21249818)
chr8 (8-130)||(21255535-21255656)
chr8 (261-441)||(32121734-32121916)
chr8 (278-440)||(19896265-19896430)
chr8 (345-436)||(45290762-45290853)
chr8 (345-446)||(19937073-19937174)
chr8 (321-443)||(6520368-6520491)
chr8 (278-440)||(14823774-14823935)
chr8 (345-427)||(15070571-15070653)
chr8 (346-443)||(17140916-17141014)
chr8 (318-440)||(26219717-26219838)
chr8 (318-443)||(38855246-38855372)
chr8 (347-443)||(21490995-21491092)
chr8 (278-440)||(25484275-25484430)
chr8 (278-442)||(26223917-26224081)
chr8 (346-443)||(5866297-5866395)
chr8 (272-424)||(20498581-20498734)
chr8 (318-440)||(26225288-26225409)
chr8 (272-443)||(17612059-17612231)
chr8 (272-436)||(13508034-13508199)
chr8 (295-424)||(19801399-19801527)
chr8 (325-439)||(21285601-21285716)
chr8 (373-439)||(23760893-23760961)
chr8 (368-428)||(983450-983512)
chr8 (272-436)||(13597566-13597731)
chr8 (397-443)||(21249384-21249430)
chr8 (397-443)||(21255222-21255268)
chr8 (5-59)||(45130712-45130766)
chr8 (5-62)||(21674088-21674145)
chr8 (368-439)||(26355742-26355815)
chr8 (5-130)||(26355379-26355504)
chr8 (374-424)||(24353039-24353091)
chr8 (374-424)||(37116366-37116418)
chr8 (367-424)||(19154930-19154989)
chr8 (374-424)||(17267044-17267096)
chr8 (376-424)||(20502154-20502203)
chr8 (374-422)||(22525579-22525628)
chr8 (273-416)||(23776785-23776929)
chr8 (377-424)||(28397569-28397617)
chr8 (318-431)||(21673716-21673830)
chr8 (374-420)||(22963464-22963511)
chr8 (5-59)||(19801108-19801162)
chr8 (21-130)||(39834147-39834256)
chr8 (374-424)||(17439557-17439609)
chr8 (376-424)||(22995862-22995911)
chr8 (381-416)||(20533467-20533503)
chr8 (78-130)||(22010435-22010487)
chr8 (82-130)||(30643051-30643099)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (5-443)||(9509189-9509629)
chr7 (5-443)||(12698831-12699272)
chr7 (5-443)||(38227481-38227920)
chr7 (5-440)||(3564045-3564482)
chr7 (85-443)||(26211995-26212355)
chr7 (5-443)||(16385939-16386369)
chr7 (96-443)||(10589039-10589386)
chr7 (5-441)||(40443393-40443817)
chr7 (5-443)||(27847525-27847951)
chr7 (5-428)||(15143718-15144143)
chr7 (242-440)||(18456333-18456530)
chr7 (5-207)||(44116742-44116944)
chr7 (278-443)||(13647325-13647491)
chr7 (272-440)||(16213684-16213852)
chr7 (325-440)||(48273392-48273508)
chr7 (278-440)||(456321-456483)
chr7 (278-440)||(11972496-11972658)
chr7 (278-440)||(14949122-14949284)
chr7 (278-440)||(15376713-15376875)
chr7 (278-440)||(16232520-16232682)
chr7 (278-440)||(18640272-18640434)
chr7 (278-440)||(20385123-20385285)
chr7 (278-440)||(21189595-21189757)
chr7 (278-440)||(32125491-32125653)
chr7 (278-440)||(41522917-41523079)
chr7 (278-440)||(41525379-41525541)
chr7 (278-439)||(11393287-11393448)
chr7 (278-443)||(18430709-18430874)
chr7 (295-436)||(24275175-24275316)
chr7 (5-130)||(28504982-28505106)
chr7 (298-440)||(16410059-16410201)
chr7 (278-440)||(24702238-24702400)
chr7 (278-440)||(27216860-27217022)
chr7 (5-130)||(18302494-18302618)
chr7 (5-126)||(39267327-39267447)
chr7 (272-443)||(2280068-2280238)
chr7 (278-440)||(44116509-44116671)
chr7 (5-126)||(15754568-15754689)
chr7 (5-130)||(34201099-34201223)
chr7 (5-130)||(2831987-2832110)
chr7 (278-440)||(3386333-3386495)
chr7 (5-135)||(17061641-17061771)
chr7 (5-130)||(9751231-9751355)
chr7 (275-439)||(14932685-14932851)
chr7 (275-439)||(15356120-15356286)
chr7 (275-439)||(15360234-15360400)
chr7 (313-440)||(13869346-13869474)
chr7 (278-440)||(24704688-24704847)
chr7 (278-440)||(17061915-17062077)
chr7 (278-436)||(38898376-38898535)
chr7 (346-443)||(28505321-28505419)
chr7 (346-443)||(34200786-34200884)
chr7 (347-440)||(13831373-13831466)
chr7 (368-443)||(67745-67822)
chr7 (278-440)||(20110556-20110708)
chr7 (5-131)||(12756398-12756523)
chr7 (345-443)||(22072913-22073013)
chr7 (346-443)||(16495402-16495500)
chr7 (347-443)||(11996051-11996148)
chr7 (368-439)||(811175-811248)
chr7 (311-395)||(2530126-2530208)
chr7 (269-416)||(15211484-15211632)
chr7 (368-439)||(44014182-44014255)
chr7 (321-439)||(16219715-16219834)
chr7 (373-439)||(18005650-18005718)
chr7 (373-443)||(47831807-47831879)
chr7 (5-131)||(810810-810936)
chr7 (355-437)||(18154873-18154956)
chr7 (5-130)||(44014489-44014614)
chr7 (367-428)||(1868038-1868101)
chr7 (367-428)||(12901338-12901401)
chr7 (278-378)||(26355983-26356083)
chr7 (278-378)||(26358435-26358535)
chr7 (278-424)||(12756671-12756817)
chr7 (397-443)||(15754962-15755008)
chr7 (272-443)||(19486693-19486865)
chr7 (374-428)||(14044761-14044817)
chr7 (374-428)||(14354791-14354847)
chr7 (273-439)||(17138013-17138177)
chr7 (5-160)||(16056613-16056768)
chr7 (56-130)||(11995762-11995835)
chr7 (273-439)||(12187019-12187183)
chr7 (95-130)||(12715162-12715197)
chr7 (374-424)||(18203831-18203882)
chr7 (89-160)||(22073201-22073272)
chr7 (5-59)||(68132-68186)
chr7 (6-131)||(12255473-12255598)
chr7 (325-428)||(16056343-16056446)
chr7 (5-59)||(26212371-26212425)
chr7 (6-59)||(16324392-16324445)
chr7 (374-424)||(20220238-20220290)
chr7 (367-417)||(48991206-48991258)
chr7 (78-130)||(18815-18867)
chr7 (377-424)||(9033400-9033448)
chr7 (374-415)||(14036282-14036325)
chr7 (374-415)||(14346312-14346355)
chr7 (367-420)||(15008542-15008597)
chr7 (377-424)||(20619399-20619447)
chr7 (377-424)||(42461968-42462016)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (5-443)||(13442274-13442714)
chr3 (5-443)||(17487856-17488297)
chr3 (5-439)||(14576514-14576949)
chr3 (5-443)||(20698128-20698556)
chr3 (5-443)||(17499338-17499779)
chr3 (8-443)||(26686887-26687324)
chr3 (5-430)||(14572602-14573028)
chr3 (5-443)||(18438534-18438974)
chr3 (11-443)||(23083048-23083482)
chr3 (5-443)||(25476066-25476506)
chr3 (5-443)||(14972854-14973294)
chr3 (5-443)||(11424444-11424880)
chr3 (47-443)||(43840932-43841330)
chr3 (5-440)||(40213402-40213838)
chr3 (85-443)||(12399209-12399565)
chr3 (5-428)||(30029855-30030268)
chr3 (242-440)||(24153129-24153326)
chr3 (89-425)||(42386428-42386767)
chr3 (5-138)||(17247967-17248100)
chr3 (116-321)||(16796670-16796875)
chr3 (278-440)||(29172583-29172745)
chr3 (5-130)||(12852045-12852169)
chr3 (278-440)||(7781347-7781509)
chr3 (278-440)||(9707607-9707769)
chr3 (278-440)||(17463178-17463340)
chr3 (278-440)||(17672626-17672788)
chr3 (278-440)||(34159326-34159488)
chr3 (278-440)||(45606907-45607069)
chr3 (278-440)||(55476491-55476653)
chr3 (295-440)||(28848628-28848773)
chr3 (278-440)||(8899094-8899256)
chr3 (278-440)||(16454281-16454443)
chr3 (278-440)||(38961891-38962053)
chr3 (5-130)||(12340068-12340192)
chr3 (278-440)||(13151790-13151953)
chr3 (278-440)||(13154255-13154418)
chr3 (278-441)||(13544024-13544187)
chr3 (278-440)||(6469134-6469296)
chr3 (278-440)||(10247723-10247885)
chr3 (278-436)||(12567564-12567722)
chr3 (278-440)||(17446655-17446816)
chr3 (278-440)||(50242822-50242984)
chr3 (5-130)||(14665921-14666045)
chr3 (5-130)||(14669076-14669200)
chr3 (5-130)||(14735434-14735558)
chr3 (327-440)||(55500942-55501055)
chr3 (278-438)||(16282811-16282971)
chr3 (318-440)||(36166598-36166719)
chr3 (297-443)||(43550497-43550644)
chr3 (261-441)||(46822267-46822449)
chr3 (278-438)||(41123892-41124049)
chr3 (345-440)||(12119792-12119887)
chr3 (345-440)||(15412429-15412524)
chr3 (8-130)||(13210012-13210133)
chr3 (310-440)||(15977515-15977645)
chr3 (278-424)||(53070653-53070799)
chr3 (345-440)||(8499518-8499613)
chr3 (345-440)||(44494809-44494904)
chr3 (5-131)||(53070380-53070505)
chr3 (5-74)||(14179693-14179762)
chr3 (345-440)||(10556985-10557080)
chr3 (318-429)||(21618460-21618570)
chr3 (276-441)||(12511059-12511226)
chr3 (345-440)||(17737236-17737334)
chr3 (5-131)||(49667764-49667890)
chr3 (5-100)||(4588496-4588590)
chr3 (310-440)||(27165250-27165381)
chr3 (346-443)||(13210350-13210448)
chr3 (368-439)||(12174303-12174376)
chr3 (5-131)||(12933991-12934117)
chr3 (272-443)||(24340672-24340844)
chr3 (5-131)||(32307983-32308108)
chr3 (321-443)||(14234487-14234610)
chr3 (325-439)||(15470928-15471043)
chr3 (300-440)||(53301527-53301669)
chr3 (368-436)||(32307684-32307754)
chr3 (5-127)||(49389325-49389446)
chr3 (368-439)||(16103784-16103857)
chr3 (368-439)||(49668120-49668193)
chr3 (272-424)||(52523676-52523831)
chr3 (242-321)||(14179555-14179633)
chr3 (318-439)||(16097332-16097454)
chr3 (5-131)||(1644364-1644489)
chr3 (5-126)||(9513228-9513350)
chr3 (5-126)||(9521203-9521325)
chr3 (5-130)||(16097645-16097770)
chr3 (380-440)||(28194693-28194755)
chr3 (272-443)||(37642214-37642386)
chr3 (368-439)||(9512924-9512997)
chr3 (368-439)||(9520899-9520972)
chr3 (388-440)||(45577947-45578000)
chr3 (299-425)||(23274705-23274832)
chr3 (374-422)||(13919350-13919399)
chr3 (374-424)||(22110402-22110454)
chr3 (325-424)||(37251168-37251270)
chr3 (374-424)||(43925977-43926029)
chr3 (5-65)||(16104160-16104220)
chr3 (367-424)||(12377940-12377999)
chr3 (273-439)||(856140-856304)
chr3 (368-436)||(1644718-1644787)
chr3 (376-424)||(15246037-15246086)
chr3 (7-43)||(17247203-17247239)
chr3 (376-424)||(606378-606428)
chr3 (95-130)||(15617674-15617709)
chr3 (5-51)||(43842572-43842618)
chr3 (377-422)||(9577646-9577691)
chr3 (162-207)||(12339988-12340033)
chr3 (355-439)||(15878083-15878168)
chr3 (5-53)||(324627-324675)
chr3 (78-130)||(7793103-7793155)
chr3 (67-119)||(16809725-16809777)
chr3 (376-439)||(23077530-23077594)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (5-443)||(22737861-22738300)
chr2 (5-443)||(22730914-22731355)
chr2 (5-443)||(23076442-23076880)
chr2 (5-440)||(298496-298933)
chr2 (5-443)||(23285865-23286290)
chr2 (5-443)||(23660023-23660462)
chr2 (6-443)||(22337115-22337554)
chr2 (5-443)||(23654091-23654507)
chr2 (140-443)||(23060513-23060815)
chr2 (5-443)||(37808-38235)
chr2 (11-443)||(20309108-20309528)
chr2 (8-289)||(27753730-27754012)
chr2 (5-218)||(32451610-32451824)
chr2 (278-440)||(22105412-22105575)
chr2 (278-437)||(21155060-21155219)
chr2 (278-440)||(18808943-18809105)
chr2 (278-440)||(23130862-23131024)
chr2 (278-440)||(23133329-23133491)
chr2 (278-440)||(23709532-23709694)
chr2 (278-440)||(23712013-23712175)
chr2 (278-440)||(26505379-26505541)
chr2 (278-440)||(26507857-26508019)
chr2 (278-440)||(34402522-34402684)
chr2 (278-440)||(39682313-39682475)
chr2 (295-440)||(23135590-23135735)
chr2 (5-130)||(23071644-23071768)
chr2 (278-442)||(32214921-32215085)
chr2 (278-440)||(571397-571559)
chr2 (278-440)||(6725995-6726157)
chr2 (278-440)||(24367774-24367936)
chr2 (278-440)||(24898195-24898358)
chr2 (278-440)||(24900678-24900841)
chr2 (278-440)||(24903155-24903318)
chr2 (278-440)||(24905632-24905795)
chr2 (278-440)||(24908107-24908270)
chr2 (278-440)||(32039498-32039660)
chr2 (242-443)||(23708538-23708738)
chr2 (325-443)||(23103399-23103516)
chr2 (278-440)||(28577099-28577261)
chr2 (295-440)||(45029871-45030016)
chr2 (367-443)||(8946657-8946734)
chr2 (278-438)||(43137301-43137461)
chr2 (261-436)||(25616192-25616369)
chr2 (345-440)||(24529596-24529691)
chr2 (278-440)||(38967374-38967537)
chr2 (381-443)||(23040247-23040310)
chr2 (318-438)||(28405981-28406103)
chr2 (5-129)||(22133898-22134020)
chr2 (297-424)||(7707-7835)
chr2 (272-443)||(19671830-19672001)
chr2 (362-437)||(24643034-24643109)
chr2 (368-442)||(22134251-22134326)
chr2 (346-443)||(23071972-23072070)
chr2 (368-439)||(7679589-7679662)
chr2 (318-439)||(25175854-25175976)
chr2 (273-416)||(22799076-22799220)
chr2 (374-422)||(23287384-23287433)
chr2 (367-424)||(23207296-23207355)
chr2 (375-422)||(26392403-26392451)
chr2 (345-424)||(32451950-32452031)
chr2 (5-127)||(28406297-28406419)
chr2 (273-439)||(23019656-23019823)
chr2 (368-428)||(18786947-18787009)
chr2 (5-59)||(25176228-25176282)
chr2 (374-424)||(20520243-20520295)
chr2 (367-424)||(22413181-22413240)
chr2 (78-130)||(22740716-22740768)
chr2 (5-45)||(28291983-28292023)
chr2 (377-423)||(34136960-34137007)
chr2 (89-205)||(23708383-23708500)
chr2 (374-424)||(23004767-23004819)
chr2 (374-424)||(23791292-23791344)
chr2 (374-424)||(25108906-25108958)
chr2 (91-131)||(22459327-22459367)
chr2 (355-422)||(23038048-23038116)
chr2 (377-424)||(39828047-39828095)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (5-443)||(1851-2291)
scaffold0016 (5-130)||(207200-207324)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (5-443)||(51913-52352)
scaffold0011 (5-443)||(167671-168099)
scaffold0011 (376-424)||(38204-38253)
[»] chr5 (88 HSPs)
chr5 (5-443)||(23390177-23390617)
chr5 (5-443)||(25421532-25421972)
chr5 (7-443)||(8286536-8286964)
chr5 (5-443)||(24493569-24494008)
chr5 (5-443)||(25431395-25431834)
chr5 (5-443)||(13095495-13095934)
chr5 (5-443)||(13025311-13025750)
chr5 (5-443)||(9077952-9078392)
chr5 (5-443)||(22075018-22075448)
chr5 (5-440)||(24529223-24529661)
chr5 (5-443)||(1096467-1096907)
chr5 (5-443)||(21292662-21293090)
chr5 (5-306)||(21985828-21986130)
chr5 (277-443)||(21808343-21808510)
chr5 (277-443)||(21729018-21729185)
chr5 (5-307)||(22107065-22107357)
chr5 (6-440)||(36154510-36154942)
chr5 (345-443)||(21997556-21997655)
chr5 (269-429)||(18418594-18418752)
chr5 (278-440)||(264768-264930)
chr5 (278-440)||(39363384-39363546)
chr5 (295-440)||(10732957-10733102)
chr5 (5-130)||(19660518-19660643)
chr5 (5-130)||(22119874-22119998)
chr5 (5-137)||(11580926-11581058)
chr5 (278-440)||(20909012-20909174)
chr5 (278-440)||(29329934-29330096)
chr5 (278-440)||(42245365-42245527)
chr5 (269-395)||(18356364-18356488)
chr5 (278-440)||(29345980-29346142)
chr5 (295-440)||(39245136-39245281)
chr5 (318-440)||(22412187-22412309)
chr5 (278-440)||(29348453-29348615)
chr5 (278-440)||(29350926-29351088)
chr5 (261-441)||(17517138-17517320)
chr5 (5-130)||(24767018-24767142)
chr5 (278-437)||(18319033-18319193)
chr5 (345-440)||(20902076-20902172)
chr5 (345-440)||(2154681-2154776)
chr5 (345-440)||(11581266-11581361)
chr5 (269-395)||(20910745-20910869)
chr5 (278-440)||(32027393-32027555)
chr5 (347-440)||(20918017-20918110)
chr5 (278-440)||(10775675-10775838)
chr5 (345-440)||(31061068-31061163)
chr5 (345-440)||(38619434-38619529)
chr5 (321-443)||(21502154-21502277)
chr5 (345-439)||(23064512-23064606)
chr5 (368-443)||(19660879-19660956)
chr5 (368-443)||(21329541-21329618)
chr5 (277-424)||(22144068-22144216)
chr5 (273-436)||(37723910-37724073)
chr5 (368-439)||(22959576-22959649)
chr5 (5-130)||(22959214-22959339)
chr5 (326-424)||(20026942-20027043)
chr5 (318-439)||(21565546-21565668)
chr5 (368-443)||(26012079-26012154)
chr5 (346-443)||(36314577-36314675)
chr5 (5-126)||(21565863-21565984)
chr5 (345-437)||(24067110-24067202)
chr5 (5-125)||(19669219-19669340)
chr5 (355-439)||(26704075-26704160)
chr5 (375-427)||(26732884-26732937)
chr5 (355-439)||(26973808-26973893)
chr5 (375-424)||(26740697-26740747)
chr5 (368-443)||(19668898-19668975)
chr5 (376-424)||(23469822-23469871)
chr5 (273-439)||(22032323-22032485)
chr5 (387-440)||(20806850-20806904)
chr5 (5-118)||(21871252-21871365)
chr5 (5-118)||(21875532-21875645)
chr5 (272-443)||(40725853-40726025)
chr5 (376-424)||(21328268-21328317)
chr5 (376-420)||(21731514-21731559)
chr5 (376-420)||(21809634-21809679)
chr5 (89-200)||(22144294-22144406)
chr5 (318-378)||(20766115-20766174)
chr5 (367-424)||(22178264-22178323)
chr5 (269-340)||(23572182-23572252)
chr5 (5-59)||(21329176-21329230)
chr5 (394-424)||(27989001-27989031)
chr5 (89-130)||(5888940-5888981)
chr5 (376-424)||(15796438-15796487)
chr5 (89-138)||(21501919-21501968)
chr5 (78-130)||(19472476-19472528)
chr5 (91-131)||(20026706-20026746)
chr5 (78-130)||(20805858-20805910)
chr5 (78-130)||(31342414-31342466)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (5-443)||(44052829-44053269)
chr4 (5-441)||(22636437-22636874)
chr4 (5-443)||(12902757-12903186)
chr4 (5-443)||(7088877-7089306)
chr4 (5-438)||(14038653-14039089)
chr4 (89-436)||(23374125-23374473)
chr4 (68-443)||(7893703-7894077)
chr4 (5-440)||(16377203-16377639)
chr4 (5-443)||(16239673-16240090)
chr4 (5-443)||(14052994-14053422)
chr4 (5-329)||(3096759-3097072)
chr4 (269-443)||(7798774-7798949)
chr4 (5-236)||(15091104-15091337)
chr4 (242-443)||(16270156-16270356)
chr4 (67-321)||(17047816-17048070)
chr4 (272-443)||(6899891-6900062)
chr4 (319-443)||(52873363-52873488)
chr4 (5-188)||(7798953-7799137)
chr4 (5-200)||(44928604-44928800)
chr4 (278-440)||(18215274-18215436)
chr4 (278-440)||(44928879-44929042)
chr4 (318-440)||(54798749-54798872)
chr4 (278-440)||(12307-12469)
chr4 (278-440)||(15118352-15118514)
chr4 (278-440)||(23803265-23803427)
chr4 (278-440)||(52312510-52312672)
chr4 (272-440)||(1837503-1837671)
chr4 (278-446)||(19242693-19242861)
chr4 (278-440)||(3515007-3515169)
chr4 (318-440)||(14280316-14280438)
chr4 (278-440)||(44615288-44615450)
chr4 (278-440)||(44773087-44773249)
chr4 (278-440)||(50222339-50222501)
chr4 (278-440)||(51463868-51464030)
chr4 (358-443)||(3096293-3096379)
chr4 (295-440)||(18239436-18239581)
chr4 (5-130)||(24029057-24029181)
chr4 (5-440)||(44102214-44102649)
chr4 (278-442)||(19618172-19618336)
chr4 (5-130)||(13812490-13812614)
chr4 (5-130)||(15552129-15552253)
chr4 (269-443)||(17046487-17046659)
chr4 (5-130)||(22633894-22634018)
chr4 (278-436)||(15355324-15355483)
chr4 (5-128)||(16596963-16597085)
chr4 (272-424)||(13800-13953)
chr4 (278-440)||(12610950-12611105)
chr4 (5-130)||(20156971-20157095)
chr4 (278-442)||(14970707-14970871)
chr4 (269-395)||(43256106-43256230)
chr4 (318-440)||(8574864-8574985)
chr4 (345-443)||(15367690-15367788)
chr4 (345-443)||(15370018-15370116)
chr4 (345-443)||(15371202-15371300)
chr4 (345-443)||(15373483-15373581)
chr4 (345-443)||(15402703-15402801)
chr4 (124-218)||(6190688-6190782)
chr4 (346-443)||(16223532-16223629)
chr4 (47-130)||(3332201-3332283)
chr4 (373-443)||(15551817-15551889)
chr4 (278-441)||(22353835-22353999)
chr4 (5-131)||(12774313-12774438)
chr4 (295-424)||(21815602-21815731)
chr4 (278-440)||(7641192-7641344)
chr4 (368-439)||(12774011-12774084)
chr4 (368-443)||(39706332-39706409)
chr4 (272-428)||(52243143-52243302)
chr4 (5-130)||(8846689-8846815)
chr4 (5-131)||(21814984-21815109)
chr4 (5-131)||(21815313-21815438)
chr4 (5-131)||(21818406-21818531)
chr4 (326-428)||(12288211-12288316)
chr4 (272-428)||(43198502-43198661)
chr4 (345-424)||(6190481-6190562)
chr4 (368-439)||(8846360-8846433)
chr4 (345-437)||(20149832-20149924)
chr4 (5-75)||(6190802-6190873)
chr4 (367-424)||(46640499-46640558)
chr4 (269-439)||(15121749-15121917)
chr4 (374-422)||(17333298-17333347)
chr4 (374-424)||(53082202-53082254)
chr4 (5-40)||(17046721-17046756)
chr4 (5-59)||(39705969-39706023)
chr4 (5-59)||(52242874-52242928)
chr4 (89-130)||(15099665-15099706)
chr4 (376-424)||(26045346-26045395)
chr4 (376-424)||(26050527-26050576)
chr4 (5-53)||(17047765-17047813)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (5-443)||(38761-39199)
scaffold0145 (242-443)||(32942-33142)
scaffold0145 (345-445)||(9744-9844)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (5-443)||(20360652-20361081)
chr6 (5-443)||(20637975-20638404)
chr6 (5-443)||(17287477-17287917)
chr6 (5-443)||(22779908-22780348)
chr6 (5-443)||(29060540-29060980)
chr6 (8-442)||(18409511-18409947)
chr6 (5-443)||(19303222-19303661)
chr6 (8-443)||(20593773-20594210)
chr6 (8-443)||(25629039-25629476)
chr6 (79-443)||(16920389-16920751)
chr6 (277-443)||(16496244-16496411)
chr6 (89-443)||(22831503-22831857)
chr6 (5-218)||(18821511-18821714)
chr6 (277-443)||(20076700-20076863)
chr6 (5-131)||(28496154-28496280)
chr6 (269-443)||(35245586-35245758)
chr6 (5-416)||(25611404-25611816)
chr6 (89-424)||(11185524-11185857)
chr6 (5-416)||(25603066-25603478)
chr6 (5-131)||(29808564-29808691)
chr6 (278-440)||(12742317-12742479)
chr6 (278-440)||(18334592-18334754)
chr6 (278-440)||(19005046-19005208)
chr6 (278-440)||(19858919-19859081)
chr6 (278-440)||(22782227-22782389)
chr6 (278-440)||(24422547-24422709)
chr6 (278-440)||(25754809-25754971)
chr6 (278-440)||(33861794-33861956)
chr6 (278-440)||(33864278-33864440)
chr6 (278-442)||(30676710-30676874)
chr6 (297-440)||(1595549-1595692)
chr6 (345-440)||(25656629-25656724)
chr6 (278-440)||(2291180-2291342)
chr6 (278-440)||(8055029-8055191)
chr6 (278-440)||(26924640-26924802)
chr6 (278-442)||(34963371-34963535)
chr6 (298-440)||(25688502-25688644)
chr6 (295-440)||(1540928-1541073)
chr6 (5-126)||(1561622-1561743)
chr6 (278-440)||(3852017-3852179)
chr6 (275-428)||(25644335-25644490)
chr6 (297-443)||(20109140-20109285)
chr6 (5-130)||(21939699-21939823)
chr6 (278-437)||(16448526-16448686)
chr6 (278-424)||(18456735-18456881)
chr6 (295-424)||(18461895-18462024)
chr6 (345-440)||(20556959-20557054)
chr6 (269-395)||(27415887-27416011)
chr6 (261-441)||(23992429-23992608)
chr6 (5-131)||(18457029-18457154)
chr6 (317-441)||(19847989-19848114)
chr6 (368-443)||(27333262-27333339)
chr6 (368-443)||(27394002-27394079)
chr6 (5-128)||(19652512-19652635)
chr6 (5-130)||(15894111-15894237)
chr6 (383-443)||(25714417-25714478)
chr6 (345-424)||(18821867-18821946)
chr6 (346-443)||(28496494-28496592)
chr6 (346-443)||(29808905-29809003)
chr6 (367-422)||(33443068-33443124)
chr6 (272-443)||(8227460-8227632)
chr6 (244-416)||(15041473-15041644)
chr6 (325-443)||(23019408-23019525)
chr6 (368-439)||(19652199-19652272)
chr6 (1-129)||(27332961-27333089)
chr6 (1-129)||(27393701-27393829)
chr6 (5-130)||(4667894-4668019)
chr6 (6-130)||(4185505-4185629)
chr6 (367-428)||(9098557-9098620)
chr6 (397-443)||(1561303-1561349)
chr6 (397-443)||(22080800-22080846)
chr6 (355-439)||(22432249-22432334)
chr6 (355-439)||(22438799-22438884)
chr6 (367-428)||(19668386-19668449)
chr6 (5-62)||(4189339-4189396)
chr6 (5-62)||(4674741-4674798)
chr6 (376-420)||(16493169-16493214)
chr6 (376-424)||(18453201-18453250)
chr6 (355-439)||(19873120-19873205)
chr6 (5-74)||(22334563-22334632)
chr6 (374-424)||(23076749-23076801)
chr6 (13-62)||(31155087-31155136)
chr6 (374-424)||(35008167-35008219)
chr6 (373-431)||(4185870-4185930)
chr6 (78-130)||(25641939-25641991)
chr6 (89-131)||(23019721-23019763)
chr6 (355-439)||(19862978-19863063)
chr6 (89-130)||(22080502-22080543)
chr6 (78-130)||(16741503-16741555)
chr6 (402-446)||(19008799-19008843)
chr6 (78-130)||(19790536-19790588)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (5-442)||(50209894-50210333)
chr1 (5-443)||(27250421-27250850)
chr1 (5-443)||(22532269-22532709)
chr1 (5-440)||(34509783-34510220)
chr1 (6-443)||(21026680-21027108)
chr1 (6-367)||(22354254-22354616)
chr1 (6-442)||(20135188-20135626)
chr1 (5-333)||(22355866-22356185)
chr1 (5-333)||(22357552-22357871)
chr1 (5-443)||(38801083-38801508)
chr1 (5-231)||(20846911-20847127)
chr1 (5-440)||(433012-433447)
chr1 (242-442)||(22468617-22468816)
chr1 (278-440)||(13988866-13989028)
chr1 (278-440)||(21923291-21923453)
chr1 (278-440)||(23593735-23593897)
chr1 (278-443)||(45574842-45575008)
chr1 (278-440)||(21475087-21475249)
chr1 (278-440)||(31612313-31612475)
chr1 (278-441)||(21840766-21840929)
chr1 (353-443)||(20847184-20847275)
chr1 (278-440)||(29298137-29298298)
chr1 (278-440)||(29776688-29776850)
chr1 (5-130)||(20918917-20919041)
chr1 (278-440)||(16275363-16275526)
chr1 (269-395)||(33797570-33797694)
chr1 (278-442)||(16361915-16362079)
chr1 (347-446)||(15860078-15860177)
chr1 (345-443)||(13212929-13213027)
chr1 (272-424)||(21861519-21861672)
chr1 (272-424)||(21896205-21896358)
chr1 (345-446)||(21342090-21342191)
chr1 (345-440)||(21346961-21347056)
chr1 (310-440)||(21707167-21707297)
chr1 (310-440)||(21711709-21711839)
chr1 (278-440)||(22123067-22123230)
chr1 (376-442)||(20454606-20454673)
chr1 (5-131)||(21754350-21754475)
chr1 (295-424)||(35261053-35261180)
chr1 (5-153)||(33681301-33681449)
chr1 (5-130)||(20091155-20091281)
chr1 (355-439)||(21714546-21714631)
chr1 (345-437)||(40389157-40389249)
chr1 (346-443)||(14295574-14295672)
chr1 (318-439)||(22921864-22921986)
chr1 (318-439)||(33681011-33681133)
chr1 (242-321)||(48603637-48603715)
chr1 (368-436)||(21754052-21754122)
chr1 (269-416)||(21787988-21788136)
chr1 (5-130)||(20248592-20248717)
chr1 (346-427)||(20918620-20918702)
chr1 (318-439)||(22237631-22237753)
chr1 (368-428)||(16758664-16758726)
chr1 (368-439)||(20248283-20248356)
chr1 (374-424)||(50614167-50614219)
chr1 (374-424)||(50621995-50622047)
chr1 (5-62)||(52927662-52927719)
chr1 (367-424)||(16368329-16368388)
chr1 (367-424)||(41050079-41050138)
chr1 (368-428)||(52928014-52928076)
chr1 (5-62)||(22238012-22238069)
chr1 (376-427)||(20958124-20958176)
chr1 (374-424)||(21533923-21533974)
chr1 (5-59)||(22921548-22921602)
chr1 (89-130)||(20637165-20637206)
chr1 (89-130)||(21162080-21162121)
chr1 (367-424)||(16093928-16093987)
chr1 (375-424)||(50686630-50686681)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-443)||(13211-13640)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (5-443)||(741-1169)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (5-443)||(8213-8650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (5-443)||(5802-6245)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (5-425)||(23983-24406)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (5-442)||(16896-17337)
scaffold0056 (295-424)||(79301-79430)
scaffold0056 (6-58)||(79044-79096)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (5-392)||(13144-13532)
scaffold0175 (5-129)||(34437-34560)
scaffold0175 (369-443)||(34123-34199)
scaffold0175 (388-443)||(273-329)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (5-440)||(22886-23322)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (5-436)||(25746-26179)
scaffold0122 (9-291)||(33179-33463)
scaffold0122 (318-440)||(44702-44825)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (5-443)||(8479-8915)
scaffold0639 (376-427)||(7542-7594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (6-443)||(4849-5276)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (5-443)||(39913-40351)
scaffold0080 (325-424)||(19885-19987)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (90-443)||(20910-21265)
scaffold0088 (5-59)||(21276-21330)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (86-443)||(1952-2310)
scaffold0490 (5-59)||(2327-2381)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (5-443)||(39858-40296)
scaffold0026 (127-443)||(25896-26213)
scaffold0026 (5-130)||(59184-59308)
scaffold0026 (8-115)||(26555-26662)
scaffold0026 (5-62)||(39612-39669)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (5-354)||(124675-125022)
scaffold0021 (273-442)||(174767-174936)
scaffold0021 (375-443)||(121766-121835)
scaffold0021 (6-60)||(62946-63000)
scaffold0021 (367-424)||(136412-136471)
scaffold0021 (367-424)||(145120-145179)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (5-443)||(10118-10544)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (5-443)||(16280-16721)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (5-443)||(4508-4948)
scaffold0228 (5-443)||(12090-12530)
scaffold0228 (5-443)||(22042-22482)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (77-441)||(39479-39844)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (11-443)||(15163-15584)
scaffold0114 (273-439)||(7295-7459)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (77-441)||(74968-75333)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (12-440)||(339639-340065)
scaffold0003 (278-440)||(158450-158612)
scaffold0003 (269-395)||(71350-71474)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (5-443)||(13497-13924)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (5-443)||(32067-32493)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (5-443)||(4712-5141)
scaffold0358 (5-379)||(1-365)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (5-443)||(744-1170)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (86-385)||(6669-6968)
scaffold0309 (5-59)||(6985-7039)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (5-443)||(16282-16708)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (159-443)||(2987-3271)
scaffold0540 (5-148)||(694-837)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (91-443)||(1289-1639)
scaffold0106 (91-443)||(7266-7616)
scaffold0106 (376-440)||(15291-15356)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (5-443)||(32640-33077)
scaffold0120 (5-443)||(45928-46365)
scaffold0120 (5-200)||(16331-16527)
scaffold0120 (345-443)||(16113-16212)
scaffold0120 (383-443)||(17389-17450)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-443)||(51582-52008)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (5-231)||(20616-20843)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (5-385)||(643-1021)
scaffold0395 (378-443)||(4888-4954)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (5-443)||(46995-47415)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (5-218)||(51565-51779)
scaffold0034 (345-443)||(32538-32635)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (52-363)||(27911-28223)
scaffold0130 (5-57)||(28924-28976)
scaffold0130 (407-442)||(27878-27913)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (8-422)||(4545-4960)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (5-321)||(1037-1343)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (5-285)||(3640-3910)
scaffold0165 (5-285)||(7704-7974)
scaffold0165 (272-428)||(27698-27855)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (5-440)||(4823-5246)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (242-442)||(3106-3306)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (306-443)||(28414-28552)
scaffold0046 (346-443)||(11292-11390)
scaffold0046 (346-443)||(1997-2095)
scaffold0046 (397-443)||(4552-4598)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (5-236)||(11205-11426)
scaffold0235 (322-443)||(11442-11564)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (5-158)||(191-344)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (5-264)||(17689-17929)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (5-138)||(1758-1891)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (5-131)||(20426-20552)
scaffold0100 (368-439)||(23927-24000)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (39-284)||(10323-10571)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (278-440)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (278-440)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (278-440)||(94411-94573)
scaffold0023 (278-436)||(17440-17598)
scaffold0023 (295-440)||(44454-44600)
scaffold0023 (5-131)||(101709-101834)
scaffold0023 (317-439)||(100378-100501)
scaffold0023 (373-443)||(119875-119947)
scaffold0023 (374-439)||(40224-40291)
scaffold0023 (368-439)||(101503-101576)
scaffold0023 (273-439)||(38429-38596)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (295-440)||(13392-13537)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (5-130)||(2126-2250)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (278-440)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (278-440)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (278-440)||(82072-82234)
scaffold0037 (5-130)||(80013-80137)
scaffold0037 (318-428)||(22665-22776)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (278-440)||(136680-136842)
scaffold0028 (278-440)||(139149-139311)
scaffold0028 (278-440)||(144087-144249)
scaffold0028 (278-440)||(134211-134373)
scaffold0028 (278-440)||(141618-141780)
scaffold0028 (5-131)||(132967-133093)
scaffold0028 (346-441)||(62200-62296)
scaffold0028 (358-439)||(132662-132745)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (278-442)||(11286-11450)
scaffold0029 (269-340)||(12861-12931)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (278-437)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (278-441)||(10772-10935)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (5-135)||(15296-15426)
scaffold0413 (319-424)||(12587-12693)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (5-127)||(12490-12611)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (278-440)||(16784-16946)
scaffold0142 (5-135)||(17090-17220)
scaffold0142 (24-130)||(7471-7576)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (277-443)||(128751-128917)
scaffold0031 (278-424)||(20379-20524)
scaffold0031 (5-127)||(20107-20228)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (278-436)||(501088-501246)
scaffold0001 (345-440)||(85647-85742)
scaffold0001 (368-439)||(160688-160761)
scaffold0001 (5-73)||(161056-161125)
scaffold0001 (376-424)||(497445-497494)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (5-130)||(344-468)
scaffold0347 (376-424)||(8909-8957)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (5-130)||(24332-24456)
scaffold0124 (272-443)||(38205-38377)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (5-130)||(7975-8099)
scaffold0075 (272-424)||(53498-53651)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (5-126)||(28961-29081)
scaffold0218 (368-428)||(8118-8180)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (269-395)||(15362-15486)
scaffold0107 (376-424)||(36199-36248)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (278-440)||(106-268)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (8-130)||(10226-10347)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (278-440)||(40400-40562)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (278-440)||(12064-12220)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (5-130)||(9515-9639)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (297-428)||(8481-8613)
scaffold0621 (318-443)||(6535-6661)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (278-442)||(12249-12413)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (5-130)||(15974-16098)
scaffold0261 (346-440)||(15664-15759)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (278-441)||(9241-9404)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (218-381)||(3424-3588)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (278-440)||(4214-4377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (318-440)||(116430-116551)
scaffold0022 (374-424)||(129021-129072)
scaffold0022 (367-436)||(78328-78400)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (345-426)||(29946-30027)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (5-131)||(32397-32523)
scaffold0150 (346-439)||(32102-32197)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (278-440)||(161089-161252)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (5-131)||(12243-12368)
scaffold0503 (383-424)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (279-439)||(29558-29720)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (345-437)||(1348-1440)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (272-424)||(13147-13301)
scaffold0357 (272-428)||(16049-16206)
scaffold0357 (374-424)||(2680-2732)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (345-440)||(2196-2291)
scaffold0247 (90-154)||(6561-6625)
scaffold0247 (272-443)||(17976-18148)
scaffold0247 (5-53)||(6509-6557)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (8-138)||(437-567)
scaffold1984 (318-439)||(133-255)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (318-439)||(19268-19390)
scaffold0102 (5-138)||(19573-19706)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (318-439)||(14692-14814)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (300-440)||(38679-38820)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (272-443)||(11464-11636)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (368-443)||(6611-6688)
scaffold0333 (368-443)||(13991-14068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (368-443)||(6167-6244)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (5-131)||(28490-28616)
scaffold0211 (368-439)||(28813-28887)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (368-443)||(15821-15898)
scaffold0020 (377-439)||(178898-178961)
scaffold0020 (376-424)||(142600-142649)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (318-424)||(1051-1158)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (318-439)||(2801-2923)
scaffold0628 (5-131)||(2484-2609)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (5-75)||(18639-18710)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (346-443)||(1092-1190)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (318-431)||(129917-130031)
scaffold0010 (295-424)||(60687-60818)
scaffold0010 (5-130)||(130222-130347)
scaffold0010 (377-424)||(666-714)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (5-130)||(45470-45596)
scaffold0125 (368-439)||(45836-45909)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (5-131)||(1982-2108)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (5-62)||(2766-2823)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (269-439)||(26828-26996)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (355-439)||(23843-23928)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (5-130)||(7126-7251)
scaffold0556 (368-431)||(6824-6889)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (318-428)||(10536-10647)
scaffold0555 (7-126)||(897-1017)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (373-443)||(1083-1155)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (373-439)||(2694-2762)
scaffold0207 (5-58)||(2325-2378)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (367-428)||(25121-25184)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (318-431)||(5655-5769)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (275-416)||(29117-29262)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (368-439)||(1086-1159)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (273-439)||(1881-2045)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (321-443)||(12766-12889)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (5-130)||(9391-9516)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (321-439)||(12943-13062)
scaffold0138 (5-59)||(13326-13380)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (272-422)||(8008-8161)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (269-416)||(192921-193070)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (374-422)||(206575-206624)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (367-424)||(569-628)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (325-420)||(38339-38437)
scaffold0139 (355-439)||(19980-20065)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (367-428)||(103674-103737)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (367-424)||(6327-6386)
scaffold0420 (396-424)||(13812-13840)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (5-56)||(13289-13340)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (377-439)||(36454-36517)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (367-424)||(2694-2753)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (5-59)||(3318-3372)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (5-59)||(43465-43519)
scaffold0116 (5-59)||(47385-47439)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (273-416)||(16299-16442)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (376-424)||(7450-7499)
scaffold0111 (376-424)||(14569-14618)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (325-428)||(10542-10646)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (374-424)||(97024-97076)
scaffold0006 (374-424)||(106302-106354)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (355-439)||(69794-69879)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (377-424)||(3276-3324)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (273-439)||(4754-4921)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (377-424)||(30350-30398)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (374-424)||(17521-17572)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (6-45)||(10544-10583)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (272-387)||(225465-225578)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (5-59)||(12381-12435)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (376-420)||(813-858)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (376-424)||(57837-57885)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (377-424)||(957-1005)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (376-423)||(1914-1962)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (376-439)||(10575-10639)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (78-130)||(3287-3339)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (78-130)||(2137-2189)
scaffold0104 (78-130)||(9819-9871)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (367-424)||(267679-267738)


Alignment Details
Target: scaffold0292 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3470
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  3910 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 3811  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3810 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggg 3711  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3710 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatttgcattac 3612  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3611 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaac 3512  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511 taagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 782 - 343
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  782 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagaatttagaatgaaacttttggaa-tctgaactgaactcgccgc 684  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  683 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttgg 584  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  583 ggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 485  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  484 cttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaa 386  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  385 ctaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20536648 - 20536208
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  20536648 ctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccac 20536549  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  20536548 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggg 20536449  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20536448 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtc-gattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 20536350  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20536349 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaac 20536250  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536249 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 18818091 - 18818530
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18818091 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggtt-tctgacctgaactcgccac 18818189  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  18818190 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagg 18818289  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18818290 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattac 18818388  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18818389 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 18818488  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818489 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 18878918 - 18879352
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||     
T  18878918 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaa 18879017  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  18879018 gacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 18879117  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||  ||| || | |||||||| | |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18879118 atagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgagcattac 18879215  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18879216 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 18879310  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879311 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22627175 - 22626736
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22627175 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctcgaaagattgtagaatgaa-cctttggaaatctgacccgaacttgccac 22627077  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22627076 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 22626977  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |   |||||    
T  22626976 ggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatga-tgataatgatgtgatataatgttatacacatta 22626878  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22626877 cttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 22626779  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626778 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 21923609 - 21924049
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacc-tgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  21923609 ctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccac 21923708  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |    
T  21923709 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgag 21923808  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21923809 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattac 21923907  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923908 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaac 21924007  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924008 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23406821 - 23406379
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  23406821 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 23406722  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || ||    
T  23406721 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttggg 23406622  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||  |||  |||||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23406621 ataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatg-ttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattac 23406523  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatg--ttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23406522 ttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattta 23406423  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406422 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Original strand, 28648725 - 28649164
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28648725 ctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacatggaaagatttagaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacg 28648824  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28648825 gcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 28648924  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  28648925 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacacattac 28649023  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28649024 ttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaac 28649123  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649124 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 21918691 - 21919121
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||         |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  21918691 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggaagagattgaacctggaaa---------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 21918781  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  21918782 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttggg 21918881  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||  |||||||||||| || || |||| |||  || | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21918882 taagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg-ctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 21918979  T
Q  304 tgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21918980 tgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 21919079  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919080 taagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23648993 - 23648554
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaaccttt-ggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||     
T  23648993 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccat 23648895  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttt-tgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23648894 ggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 23648795  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| || | | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23648794 ggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttgtgtgcatta 23648696  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaa 400  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  23648695 cttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaa 23648596  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648595 ctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6759696 - 6759255
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759696 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacg 6759597  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | || | | |||| ||||| | ||| ||||||||| ||    
T  6759596 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggg 6759497  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  6759496 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 6759398  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
     |||||  ||   || ||| || ||||||   ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6759397 attgaattatgagtgtataattgagatgt---tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaa 6759301  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759300 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 16092023 - 16092463
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacgg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16092023 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacctgaaaagatttaaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacgg 16092122  T
Q  106 cgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || || | |  ||| ||||||| ||| ||||||||| |||    
T  16092123 cgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttgggg 16092222  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    ||  ||| |||||||| || ||||||| |||| || |  |||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  16092223 taatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattac 16092321  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    || ||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16092322 ttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaac 16092421  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092422 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31971684 - 31971257
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||  | ||||||||||||||||| ||    
T  31971684 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccg 31971595  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971594 gcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttggg 31971495  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31971494 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 31971397  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31971396 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 31971298  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971297 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7373189 - 7372778
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | || || |||||||||||||||||||    
T  7373189 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccac 7373090  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||                     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  7373089 ggcg---------------------agtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 7373011  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    || | | | ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||        |||||||    
T  7373010 gtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataa--------gcattac 7372920  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372919 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 7372820  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372819 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22875502 - 22875065
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  22875502 aacatgtttaataatgattaggaaagattgtagaacgaggttgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgccatgac 22875404  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-ggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || | | |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22875403 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 22875304  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    || ||| |||  |||||  ||||||| |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22875303 agtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22875205  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  22875204 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaact 22875106  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875105 aagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 16199342 - 16199765
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcg 107  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||          ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  16199342 aacatgtcttataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct----------agaattaaac-tgtgggattctgacctgaactcgccacagcg 16199430  T
Q  108 agcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtag 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  16199431 agcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtag 16199530  T
Q  208 cattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttga 306  Q
     ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  16199531 gattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtaatataatg-tttatgcattacttga 16199628  T
Q  307 agaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaa 404  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16199629 agaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaa 16199726  T
Q  405 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16199727 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 121 - 443
Target Start/End: Original strand, 45130796 - 45131117
Alignment:
Q  121 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  45130796 gcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaa 45130895  T
Q  221 tgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaat 319  Q
    | | || |||| |||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  45130896 taatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttga-tgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaataattgtat 45130993  T
Q  320 atttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 417  Q
    |  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45130994 acctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 45131091  T
Q  418 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  45131092 gtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 321
Target Start/End: Original strand, 25362832 - 25363138
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  25362832 ctgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 25362921  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25362922 gcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttggg 25363021  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25363022 tagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtggtataatgttttatgcattact 25363120  T
Q  304 tgaagaatatttgaatat 321  Q
    |||  | |||||||||||    
T  25363121 tgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41598624 - 41598421
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  41598624 ctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgccat 41598526  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| ||||| || ||||   |||||||| ||||||| |||||||||     
T  41598525 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttg 41598427  T
Q  202 gggtag 207  Q
    ||||||    
T  41598426 gggtag 41598421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 gt-tgtgttgctgttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Original strand, 21389399 - 21389571
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||       
T  21389399 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--- 21389494  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21389495 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Original strand, 21395929 - 21396101
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||     
T  21395929 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt- 21396026  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21396027 --gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Original strand, 21778725 - 21778897
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||       
T  21778725 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--- 21778820  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21778821 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Original strand, 21790422 - 21790594
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||     
T  21790422 tgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt- 21790519  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21790520 --gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 5865958 - 5866082
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  5865958 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 5866056  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5866057 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17141353 - 17141229
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||| |||| |||||||||| |    
T  17141353 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatcagacc-gaactcgccatg 17141255  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17141254 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 18678039 - 18678221
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18678039 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 18678138  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678139 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21491432 - 21491308
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |  |||||||||  |||| |||| |    
T  21491432 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-aaacttgccatg 21491334  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491333 gcgagtagaggctcttgcctcgcgag 21491308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21249818 - 21249697
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  21249818 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaaagacttggaatgaaa-atttggagaatctgacc-gaactcgccatggc 21249721  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  21249720 gagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21255656 - 21255535
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  21255656 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttggaatgaaa-atttggagaatctgacc-gaactcgccatggc 21255559  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  21255558 gagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32121916 - 32121734
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  32121916 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 32121817  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121816 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 374  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  375 actgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 436
Target Start/End: Original strand, 45290762 - 45290853
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290762 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 446
Target Start/End: Original strand, 19937073 - 19937174
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19937073 tgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagt 19937171  T
Q  444 cca 446  Q
    |||    
T  19937172 cca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15070653 - 15070571
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070653 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 443
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  347 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
           | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | ||||||| || ||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||  ||||     
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-atttta 20498636  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498635 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 436
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508199
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 13508132  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508133 catattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 19801399 - 19801527
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  19801399 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgt 19801496  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801497 tatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  423 agttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 439
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983512
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 436
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597731
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 13597664  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
     || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597665 cattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21249430 - 21249384
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249430 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21255268 - 21255222
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255268 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 45130712 - 45130766
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130712 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 45130766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21674145 - 21674088
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  21674145 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaaga 21674088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 26355379 - 26355504
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||  |||   ||||||||| ||||     
T  26355379 ctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacctggaaagactttagaatg-aatttttgtgaattgtacctgaacttgccat 26355477  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26355478 ggcgagtagaggctctcgcctcacgag 26355504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154989
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 416
Target Start/End: Original strand, 23776785 - 23776929
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | ||||||||| | |||    
T  23776785 tatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttg 23776883  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |   ||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23776884 tgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  416 cggtctaagttgatga 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 420
Target Start/End: Original strand, 22963464 - 22963511
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  22963464 tactgcctatgttgctgttgtatattaattaagttgcatgagtcggtc 22963511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 19801108 - 19801162
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  19801108 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacctggaa 19801162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39834256 - 39834147
Alignment:
Q  21 atgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa-agacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctct 119  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  | |   |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39834256 atgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatc-tttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctct 39834158  T
Q  120 tgcctcgcgag 130  Q
     ||||||||||    
T  39834157 cgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439609
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22995911 - 22995862
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22995911 ctgcctatgttgctgttgtctagtaattaagctgtatgagtcggtctaag 22995862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 416
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  381 tatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtc 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 22010435 - 22010487
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22010435 ttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22010487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 30643051 - 30643099
Alignment:
Q  82 aaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30643051 aaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 30643099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9509629 - 9509189
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  9509629 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 9509530  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  9509529 ggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttggg 9509430  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9509429 atagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattac 9509331  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9509330 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaac 9509231  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509230 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12699272 - 12698831
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | |||||||||   ||| | |||||||||||||||||||    
T  12699272 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaaagattgttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccac 12699173  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  12699172 ggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggg 12699073  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12699072 gtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 12698974  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12698973 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 12698874  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698873 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38227920 - 38227481
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  38227920 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacg 38227821  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  38227820 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggg 38227721  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| | ||| |||||     
T  38227720 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatg-ttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaa 38227622  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38227621 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaac 38227523  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227522 taagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 3564045 - 3564482
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564045 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 3564143  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |    
T  3564144 agcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttgg 3564243  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  3564244 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatctaatgttatacgcatta 3564342  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564343 cttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 3564442  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564443 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26212355 - 26211995
Alignment:
Q  85 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagtt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  26212355 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagtt 26212257  T
Q  184 gttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtga 282  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||    
T  26212256 gttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattataatgtga 26212158  T
Q  283 tataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta 382  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26212157 tataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgccta 26212058  T
Q  383 tgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212057 tgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 16385939 - 16386369
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16385939 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacg 16386028  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16386029 gcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttggg 16386128  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  ||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16386129 taacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtaatataatgttttatgcattact 16386227  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||    
T  16386228 tgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaac 16386327  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386328 taagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 96 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  96 ctcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  196 acctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttg 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttg-ctgattatgatgtgatataatg-ttta 10589189  T
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10589188 tgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgt 10589089  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589088 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40443817 - 40443393
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    |||       || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40443817 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaa----tta-------acttgtgggattctgacctgaactcgccacg 40443729  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  40443728 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttggg 40443629  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40443628 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 40443531  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40443530 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaac 40443433  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443432 taagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 27847525 - 27847951
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | | ||||||||||||||||||    
T  27847525 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttatgggattttgacctgaactcgccacg 27847614  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  27847615 gcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttggg 27847714  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||| | ||  |||  ||| || | ||||||||  |||||| | ||| ||  |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  27847715 taggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgtgataatg-tttatgcattact 27847812  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  27847813 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaac 27847909  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27847910 taagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 428
Target Start/End: Original strand, 15143718 - 15144143
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| | ||||  | ||||||||| ||||||||     
T  15143718 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaa-cttttgtgattctgacctgtactcgccat 15143816  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  |    
T  15143817 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcgg 15143916  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||   ||| || | | |||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  15143917 ggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttga-cattgattatgatgtgatatgatgttatacgcatt 15144015  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||| ||  ||   || ||| || |||||||| ||  |||||  ||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||| |||    
T  15144016 acttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttattta 15144114  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144115 actaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 440
Target Start/End: Original strand, 18456333 - 18456530
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18456333 tgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgc 18456431  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18456432 atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44116944 - 44116742
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  44116944 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccggaaagatttagaatgaaa-ctttgggaatctgacctgaactcgccatg 44116846  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  | || | ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  44116845 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgactcagttacagaacg-ctagtttaggattttgcgatctttattgcacgagtcgttgagggttgaaccttgg 44116747  T
Q  203 ggtag 207  Q
    |||||    
T  44116746 ggtag 44116742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 272 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaa 423  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  424 gttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 28504982 - 28505106
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  28504982 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 28505080  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28505081 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  298 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta- 396  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18302618 - 18302494
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  18302618 ctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggataatctga-ctgaactcgccat 18302521  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18302520 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 39267327 - 39267447
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  39267327 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 39267424  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  39267425 ggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280238
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| |||||||||||| || | || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttg 2280166  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280167 catactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 15754568 - 15754689
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  15754568 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaaaaacttagaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccac 15754666  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  15754667 ggcgagcataggctctcgcctcg 15754689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34201223 - 34201099
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||     
T  34201223 ctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatgagattgaacctgtaaagacttagaatgaaa-atttggagaatctga-ctgaactcgccat 34201126  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34201125 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 2831987 - 2832110
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||     
T  2831987 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagacttagaatgaa--ctttggagaatctga-ctgaactcaccat 2832083  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2832084 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 17061641 - 17061771
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |     
T  17061641 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattttagaat-aaaactttgagaatctgacctgaactcgcgat 17061739  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacc 135  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17061740 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17061771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 9751231 - 9751355
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||     
T  9751231 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgaggttgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatttga-ctgaactcgccat 9751328  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9751329 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 439
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg-aattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
      || |||||| | || |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 439
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg-aattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
      || |||||| | || |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 439
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg-aattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgta 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
      || |||||| | || |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  313 tttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgca 410  Q
    |||||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 13869376  T
Q  411 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13869375 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatact 17062013  T
Q  378 gcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17062014 gctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    ||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  347 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67745
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 12756398 - 12756523
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     | |||||| ||| ||| | || ||||||||||||| ||| |    
T  12756398 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattatttaagaatg-aactttttggaagctgacctgaactcaccatg 12756496  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12756497 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22073013 - 22072913
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22073013 tgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  22072913 t 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 443
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  347 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 811175 - 811248
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  811175 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 395
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530208
Alignment:
Q  311 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15211632 - 15211484
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||     
T  15211632 tgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttg 15211534  T
Q  369 ttgt-atactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15211533 ttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 439
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 810810 - 810936
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaag-acttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||   ||  ||| | | ||||||||||||||     
T  810810 ctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacctggaaagaatttagaatgaatttttgtgaactgt-acctgaactcgccat 810908  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  810909 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 437
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44014614 - 44014489
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||  | |   ||||||||||||||     
T  44014614 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg-aatttttgttagttgcacctgaactcgccat 44014516  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  44014515 ggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 1868038 - 1868101
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868038 ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 424
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Original strand, 15754962 - 15755008
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15754962 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 19486693 - 19486865
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19486693 ttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 19486791  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtt--attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  19486792 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Original strand, 17138013 - 17138177
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgct-gtttttg 371  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| || || ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  17138013 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 17138108  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17138109 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16056768 - 16056613
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa-agacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||| |   ||||| |||   ||||||||||||||     
T  16056768 ctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatt-tttgggaattacacctgaactcgccat 16056670  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtt 160  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||    
T  16056669 agcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttaggtt 16056613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Original strand, 11995762 - 11995835
Alignment:
Q  56 ggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11995762 ggaaagacttagaatgaaaa-tttggagaatctgac-tgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12187183 - 12187019
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgct-gtttttg 371  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| || || ||| |||||  |||| | ||  |||    
T  12187183 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgtaattg 12187088  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  12187087 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12715197 - 12715162
Alignment:
Q  95 actcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12715197 actcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 12715162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073201
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtt 160  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttgttaggtt 22073201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 68186 - 68132
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  68186 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 68132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Original strand, 12255473 - 12255598
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa-agacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||  | |||||| ||  ||||| | |   ||||||||||||||      
T  12255473 tgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatg-aatttttgggagttacacctgaactcgccata 12255571  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12255572 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12255598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  423 agttga 428  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26212425 - 26212371
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26212425 ctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 26212371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16324445 - 16324392
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||    
T  16324445 tgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacctggaa 16324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220290
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48991258 - 48991206
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcg 417  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  48991258 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 18815 - 18867
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18815 ttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Original strand, 9033400 - 9033448
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9033400 tgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 9033448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 420
Target Start/End: Original strand, 15008542 - 15008597
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  15008542 ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20619447 - 20619399
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20619447 tgcctatgttgttgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 20619399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42462016 - 42461968
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  42462016 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagatgcatgtgtcggtctaag 42461968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13442714 - 13442274
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||| |||||    
T  13442714 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaacttgccac 13442615  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  13442614 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 13442515  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     |  |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13442514 atgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 13442416  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13442415 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaac 13442316  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442315 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17488297 - 17487856
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | | | | ||||||||||| |||||||    
T  17488297 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccac 17488198  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  17488197 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgg 17488098  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17488097 gatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcatta 17487999  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  17487998 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaa 17487899  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487898 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 439
Target Start/End: Original strand, 14576514 - 14576949
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576514 ctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacg 14576613  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14576614 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 14576713  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14576714 gtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattac 14576812  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14576813 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaac 14576911  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14576912 taagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 20698128 - 20698556
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20698128 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 20698217  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  20698218 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttgga 20698317  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20698318 tagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaag-ttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 20698415  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698416 tgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 20698515  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698516 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17499779 - 17499338
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | | | | ||||||||||| |||||||    
T  17499779 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccac 17499680  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    || ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  17499679 ggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgg 17499580  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattatta-tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  17499579 gatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgt-tgattttgatgtgatataatgttatatgcatta 17499481  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  17499480 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaa 17499381  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499380 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26687324 - 26686887
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26687324 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc 26687225  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggta 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||| |||||| || |||||    
T  26687224 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggta 26687125  T
Q  207 gcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttg 305  Q
    | |||  |||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26687124 gtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 26687026  T
Q  306 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaa 404  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26687025 aagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 26686926  T
Q  405 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686925 gctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14573028 - 14572602
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14573028 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatg 14572929  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14572928 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 14572829  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||| |||||||||| | || |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14572828 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatg-ttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattat 14572730  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14572729 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaac 14572631  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572630 taagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18438974 - 18438534
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  18438974 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacg 18438875  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18438874 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggg 18438775  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18438774 gtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattac 18438676  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||   ||   || |||   ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18438675 ttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 18438576  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438575 taagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 23083048 - 23083482
Alignment:
Q  11 atgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacc-tgaactcgccacggcgag 109  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23083048 atgtctaatagtgattaggacaaaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgag 23083147  T
Q  110 cagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagca 209  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |    
T  23083148 tagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagta 23083247  T
Q  210 ttaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 308  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||  || | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23083248 ttaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaag 23083346  T
Q  309 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagct 407  Q
     | | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23083347 taaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct 23083446  T
Q  408 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083447 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 25476066 - 25476506
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25476066 ctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaa-tctgacctgaactcgccac 25476164  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||      
T  25476165 gacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttga 25476264  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  25476265 ggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatga-tgataatgatgtgatataatgttatgcgcatta 25476363  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttattaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  25476364 cttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaa 25476463  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476464 ctaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14973294 - 14972854
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14973294 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaaccagaaaagattttagaaagaa-cttttggaattctgacctgaactcgccac 14973196  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  | | | |||| ||||| | ||| ||||||||| |    
T  14973195 ggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttgg 14973096  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14973095 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcatta 14972997  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972996 cttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaa 14972897  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972896 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 11424444 - 11424880
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11424444 ctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacg 11424543  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  11424544 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 11424643  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||| || | || | |||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  11424644 gtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaag-ttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattac 11424742  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11424743 ttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 11424838  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424839 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43841330 - 43840932
Alignment:
Q  47 attgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacaga 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43841330 attgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacaga 43841231  T
Q  146 gtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatga 244  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||  || || |||||| |||  ||||||| || ||||||| |||| || | |||    
T  43841230 gtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtga 43841131  T
Q  245 agctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaag 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||     
T  43841130 agctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaat 43841032  T
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43841031 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 40213402 - 40213838
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40213402 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaa-cttttgggaatctaacctgaactcgccac 40213500  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |    
T  40213501 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttgg 40213600  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  40213601 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 40213699  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||| |  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  40213700 cttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaa 40213798  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213799 ctaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12399565 - 12399209
Alignment:
Q  85 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12399565 tctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag--tgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttg 12399469  T
Q  185 ttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgat 283  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| || | ||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  12399468 ttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgat 12399370  T
Q  284 ataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 383  Q
    ||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12399369 ataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctat 12399270  T
Q  384 gttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399269 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30030268 - 30029855
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacc-tttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||          ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||     
T  30030268 ctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtgggatgagattgaacctggaa----------tgaaacagtttggaattctgacct-aactcgccat 30030180  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30030179 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccagaa-cagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttg 30030081  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||   ||| || | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30030080 ggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgac-attgattatgatgtgatataatgttgtgtacatta 30029982  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aa 400  Q
    |||||||  |  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  30029981 cttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaa 30029883  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029882 ctaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 440
Target Start/End: Original strand, 24153129 - 24153326
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24153129 tgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgc 24153227  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24153228 atttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42386767 - 42386428
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt-agg-ttttgtgacctttattgcacgagttgtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||   |||||  | |||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  42386767 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgtt 42386669  T
Q  187 gagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgata 284  Q
    | || ||||||||| |||||| |||  |||||  | | ||||||| | || || | ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  42386668 gtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgt-tgattatgatgtgata 42386570  T
Q  285 taatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 384  Q
    ||||||| | |||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386569 taatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 42386470  T
Q  385 ttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386469 ttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 17247967 - 17248100
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  17247967 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgccat 17248065  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccag 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17248066 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17248100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796670
Alignment:
Q  116 ctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaaga 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  216 cttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 314  Q
    ||||||||||| | || |||| || | ||||| |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttg-tttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt 16796677  T
Q  315 tgaatat 321  Q
    |||||||    
T  16796676 tgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 12852045 - 12852169
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |    
T  12852045 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagacttagaatgaaacttttgataatctga-ctgaactcgccatg 12852143  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12852144 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 28848628 - 28848773
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28848628 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 28848726  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848727 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12340192 - 12340068
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||     
T  12340192 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatct-aactgaactcgccat 12340095  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12340094 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| ||| || || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14666045 - 14665921
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |     
T  14666045 ctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgcaat 14665948  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14665947 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14669200 - 14669076
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  14669200 ctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 14669103  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  14669102 ggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14735558 - 14735434
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |     
T  14735558 ctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgcaat 14735461  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14735460 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  327 atgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  426 tgatgaagatgatga 440  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  297 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 396  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  397 -ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 46822449 - 46822267
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  46822449 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 46822350  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822349 ttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    |  | ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g-ttgtgttgttgttat--ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 12119792 - 12119887
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119792 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15412524 - 15412429
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15412524 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 13210012 - 13210133
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacct-ttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| |||||||||| |||    
T  13210012 aacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaaactcttgagaatgtgacc-gaactcgccatggc 13210109  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||    
T  13210110 gagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctg 408  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 424
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8499613 - 8499518
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8499613 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44494904 - 44494809
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44494904 tgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 53070380 - 53070505
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | |||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| |    
T  53070380 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatg-aactttttggaagctgacctgaactcgccatg 53070478  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53070479 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 53070505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14179762 - 14179693
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaa 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14179762 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaaagacttagaatgaaa 14179693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10557080 - 10556985
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10557080 tgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  417 ggtctaagttgat 429  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12511226 - 12511059
Alignment:
Q  276 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 374  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||  ||||     
T  12511226 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaa 12511127  T
Q  375 actgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511126 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17737334 - 17737236
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737334 tgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 49667764 - 49667890
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  49667764 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaatattgtgaa--ctgaacctgaactcgcca 49667861  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49667862 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 4588496 - 4588590
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgc 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4588496 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgtaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgc 4588590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27165381 - 27165250
Alignment:
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagct 407  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  27165381 atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagct 27165283  T
Q  408 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165282 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 12933991 - 12934117
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  12933991 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 12934088  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12934089 tggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340844
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 24340770  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  24340771 catactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32308108 - 32307983
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctga-cctgaactcgcca 102  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||    
T  32308108 ctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagactttagaatgaat--tttgggaa-ctgaacctgaactcgcca 32308012  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32308011 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  423 agttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  300 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 397  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  398 t-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 49389325 - 49389446
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  49389325 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactttagaatgaa---ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 49389421  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgc 127  Q
     |||||||||||| ||| |||||||    
T  49389422 tggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103784
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttt 369  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| |||||  |||||||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt 52523775  T
Q  370 tgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52523776 -gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14179633 - 14179555
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 321  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  14179633 tgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 1644364 - 1644489
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctga-cctgaactcgcca 102  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| |  | |||| |||||||||||||    
T  1644364 ctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgagaagactttagaatgaa---ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 1644460  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1644461 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9513350 - 9513228
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  ||||  ||    |||||||||| |||     
T  9513350 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccat 9513251  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  9513250 ggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9521325 - 9521203
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  ||||  ||    |||||||||| |||     
T  9521325 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccat 9521226  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  9521225 ggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16097770 - 16097645
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||  |||  |||||||||||||||     
T  16097770 ctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatg-aatttttgtgaattggacctgaactcgccat 16097672  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  16097671 ggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  380 ctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642386
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| || |||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 37642312  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||| |   | | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  37642313 catactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  388 ctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  299 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt-a 396  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  421 taag 424  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925977
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16104220 - 16104160
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt 65  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||    
T  16104220 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctgggaagactt 16104160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12377999 - 12377940
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12377999 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgct-gtttttg 371  Q
    ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| || || ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgttta-tgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Original strand, 17247203 - 17247239
Alignment:
Q  7 gaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaat 43  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17247203 gaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaat 17247239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15617709 - 15617674
Alignment:
Q  95 actcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15617709 actcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 15617674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 43842618 - 43842572
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattga 51  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43842618 ctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgttattaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgtatataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12340033 - 12339988
Alignment:
Q  162 tgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtag 207  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12340033 tgtgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtag 12339988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 324675 - 324627
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaac 53  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  324675 ctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 7793103 - 7793155
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7793103 ttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 7793155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16809777 - 16809725
Alignment:
Q  67 gaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctct 119  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16809777 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctct 16809725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 439
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 22737861 - 22738300
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||    
T  22737861 ctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccac 22737960  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22737961 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggg 22738060  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22738061 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 22738159  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  22738160 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaac 22738258  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738259 taagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 22730914 - 22731355
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  22730914 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 22731013  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22731014 ggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttggg 22731113  T
Q  204 g-tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22731114 ggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22731212  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22731213 cttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaa 22731312  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731313 ctaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23076880 - 23076442
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23076880 ctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaac-tttggaattctgacctgaactcgccacg 23076782  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  23076781 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgggg 23076682  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||  || || |||| ||||||| |||| || | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23076681 tagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 23076583  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23076582 tgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23076483  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076482 aagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 298496 - 298933
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  298496 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 298595  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  298596 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggg 298695  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| || | ||||||||| |||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  298696 tagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttg-ttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 298794  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  298795 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 298894  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298895 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23286290 - 23285865
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||          |||||  | ||  | | ||||||||||||||||||    
T  23286290 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacatggaa----------tgaaaattgtgagattatgacctgaactcgccacg 23286201  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23286200 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttggg 23286101  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23286100 tagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23286002  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23286001 tgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23285906  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285905 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23660462 - 23660023
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23660462 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaa-tctgacctgaactcgccac 23660364  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  23660363 ggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttgg 23660264  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||| | || | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  23660263 ggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 23660165  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaa 400  Q
    |||||   ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23660164 cttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaa 23660066  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660065 ctaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22337554 - 22337115
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacgg 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  22337554 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacgg 22337455  T
Q  106 cgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  22337454 cgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggag 22337355  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22337354 tagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22337256  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22337255 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaact 22337156  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337155 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 23654091 - 23654507
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | ||||  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  23654091 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaactgttgggattctgacttgaactcgccacg 23654180  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23654181 gcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttggg 23654267  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23654268 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-taattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23654366  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  23654367 tgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaact 23654466  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654467 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 140 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  140 aacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| ||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  240 tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 339  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  340 gcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  23060517 gatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 37808 - 38235
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||  | ||| ||||||||||||||||    
T  37808 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacg 37897  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37898 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttggg 37997  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||||||| |||||  | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37998 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 38095  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38096 tgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 38194  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38195 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20309528 - 20309108
Alignment:
Q  11 atgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagc 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20309528 atgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagc 20309439  T
Q  111 agaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||    
T  20309438 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggat 20309339  T
Q  211 taagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga 309  Q
    ||||||||||  | || ||||  ||| || | ||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20309338 taagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgttataatgttta-tgcattacttgaaga 20309241  T
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgtta-ttaactaagct 407  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20309240 atatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagct 20309144  T
Q  408 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20309143 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27754012 - 27753730
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27754012 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc 27753913  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggta 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||    
T  27753912 gagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggata 27753813  T
Q  207 gcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatg 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27753812 gcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 32451610 - 32451824
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  32451610 ctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 32451709  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  32451710 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggg 32451809  T
Q  204 gtagcattaagactt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  32451810 gtagcattaagactt 32451824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23135735 - 23135590
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23135735 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 23135637  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135636 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 23071644 - 23071768
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  23071644 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 23071742  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23071743 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 443
Target Start/End: Original strand, 23708538 - 23708738
Alignment:
Q  242 tgaagctgtt-taagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 340  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  23708538 tgaagctgttataagatgaattgatgt-tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttg 23708636  T
Q  341 caagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23708637 caattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgat 23708733  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  23708734 gatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 325 - 443
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaa 423  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  424 gttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 45029871 - 45030016
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||||||    
T  45029871 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgttgt 45029969  T
Q  395 tatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029970 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25616369 - 25616192
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  25616369 ttgatgattgaataagatgtgatacattgattatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtc 25616270  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25616269 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 24529596 - 24529691
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529596 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||  | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 443
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  381 tatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Original strand, 22133898 - 22134020
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||   ||| |  | |||| ||||||||||||     
T  22133898 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagactttagaatgaa---ttttgtgaactgaactgaactcgccat 22133994  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcga 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22133995 ggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  297 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt--gt 394  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  395 tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  362 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 442
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679589
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 416
Target Start/End: Original strand, 22799076 - 22799220
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  22799076 tatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttg 22799174  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |   ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22799175 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23207355 - 23207296
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207355 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  375 actgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 424
Target Start/End: Original strand, 32451950 - 32452031
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451950 tgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28406419 - 28406297
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  28406419 ctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaataaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 28406322  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgc 127  Q
     |||||| ||||||||| |||||||    
T  28406321 tggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Original strand, 23019656 - 23019823
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  23019656 tatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttg 23019754  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |   ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23019755 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 25176282 - 25176228
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||    
T  25176282 ctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacctggaa 25176228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520295
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 22740716 - 22740768
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22740716 ttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Original strand, 28291983 - 28292023
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatga 45  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28291983 ctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtagaatga 28292023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34137007 - 34136960
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaa 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34137007 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaa 34136960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708500
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgtt 186  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| || |||| ||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  187 gagaattgaacctttgggt 205  Q
    || | ||||||||| ||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggt 23708500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004767
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791292
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 131
Target Start/End: Original strand, 22459327 - 22459367
Alignment:
Q  91 ctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22459327 ctgaactcgccatagcgagtagaggctcttgcctcgcgagt 22459367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Original strand, 39828047 - 39828095
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  39828047 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaag 39828095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 1851
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||     
T  2291 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccat 2192  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  2191 ggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 2092  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2091 atagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 1993  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1992 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaac 1893  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1892 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 207200 - 207324
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  207200 ctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 207297  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  207298 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52352 - 51913
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  52352 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 52253  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  52252 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgaccttg-ttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 52154  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  52153 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgta-gattatgttgtgatataatgttatgtgcattac 52055  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52054 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaac 51955  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51954 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 167671 - 168099
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||          ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  167671 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct----------agattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 167760  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  167761 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttggg 167860  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  167861 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgtt-ttggttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 167958  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  167959 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 168058  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168059 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 88)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 23390177 - 23390617
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||     
T  23390177 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccat 23390276  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  23390277 ggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 23390376  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23390377 atagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 23390475  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23390476 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaac 23390575  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390576 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25421972 - 25421532
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25421972 ctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacg 25421873  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25421872 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 25421773  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25421772 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 25421674  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25421673 ttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaac 25421574  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421573 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Original strand, 8286536 - 8286964
Alignment:
Q  7 gaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||| |||| |||| |||    
T  8286536 gaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctaaactagccatggc 8286625  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggta 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286626 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggta 8286725  T
Q  207 gcattaagacttaatgaagatgttatttattatta--tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8286726 gtattaagacttaatgaagatgttaatta-tattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 8286823  T
Q  305 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286824 gaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 8286923  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286924 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24494008 - 24493569
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24494008 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacg 24493909  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24493908 gcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 24493809  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| |||| || | ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24493808 gtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcac 24493710  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493709 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaac 24493611  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493610 caagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25431834 - 25431395
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25431834 ctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacg 25431735  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  25431734 gcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgag 25431635  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25431634 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 25431536  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25431535 ttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 25431436  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431435 taagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13095934 - 13095495
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||     
T  13095934 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaca 13095835  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  13095834 gcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggg 13095735  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||     
T  13095734 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatg-ttgattacgatgtgatataatgttatgtacattat 13095636  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095635 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaac 13095537  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095536 tatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13025750 - 13025311
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||     
T  13025750 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaca 13025651  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  13025650 gcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggg 13025551  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||     
T  13025550 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatg-ttgattacgatgtgatataatgttatgtacattat 13025452  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025451 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaac 13025353  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025352 tatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9078392 - 9077952
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9078392 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacg 9078293  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||||| ||  ||||||||| ||    
T  9078292 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggg 9078193  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  9078192 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattac 9078094  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||   ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9078093 ttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 9077994  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077993 taagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22075448 - 22075018
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||          |||||| | ||    ||||||||||||||||||||    
T  22075448 ctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgaaaatgaacctggaa----------tgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacg 22075359  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22075358 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgg 22075260  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22075259 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattac 22075161  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22075160 ttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaac 22075061  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075060 taagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24529661 - 24529223
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24529661 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccac 24529562  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |    
T  24529561 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttgg 24529462  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| | ||||||||| |||||||  ||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  24529461 ggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgatgtgatataatgttataagcatta 24529363  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24529362 cttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaa 24529263  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529262 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1096907 - 1096467
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1096907 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagattgcagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 1096809  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-gttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||| || || | | |||| ||||||| | | ||| ||||| |    
T  1096808 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttgg 1096709  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1096708 ggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcatta 1096610  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  1096609 cttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaa 1096510  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096509 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 21292662 - 21293090
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21292662 ctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacg 21292751  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| ||| |||||    
T  21292752 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttggg 21292851  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||| | || |||| |||| || | ||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21292852 taggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 21292949  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaag--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aa 400  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21292950 tgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaa 21293047  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293048 ctaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Original strand, 21985828 - 21986130
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21985828 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacg 21985927  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21985928 gcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 21986027  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||  ||| | || ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  21986028 gtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattac 21986126  T
Q  303 ttga 306  Q
    ||||    
T  21986127 ttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 22107065 - 22107357
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||          | |||| | ||| | |||||||||||||| ||| |    
T  22107065 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctgaaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatg 22107154  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  22107155 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgag 22107254  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  22107255 tagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatatattatgcattact 22107353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 36154510 - 36154942
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  36154510 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctggatagattttagaataaaac-tttgagaatctgacctgaactcgccatg 36154608  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt-agg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| || |||||| ||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  36154609 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgg 36154707  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattattat----gaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgc 297  Q
    |||||  ||| || | | |  | || ||||| || || ||    ||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||  |||||||||||  | | |||    
T  36154708 ggtag--ttatgaat-attatatatattattaatgatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatga-tg-ttatattgtgatataattgtatatgc 36154802  T
Q  298 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 397  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |  |    
T  36154803 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttat--t 36154899  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154900 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Original strand, 21997556 - 21997655
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997556 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18418752 - 18418594
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  18418752 tgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--t 18418657  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgttgtta--ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418656 ttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 10732957 - 10733102
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10732957 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 10733055  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733056 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 19660518 - 19660643
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  19660518 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatgagattaaacctggaaagacttagaatgaaaactttggagaatctaacc-gaactcgccat 19660616  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19660617 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 22119874 - 22119998
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  22119874 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 22119971  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22119972 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 11580926 - 11581058
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  11580926 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattttagaataaaac-tttgagaatctgacctgaactcgccat 11581024  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgaccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11581025 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 11581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39245281 - 39245136
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  || |||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39245281 tgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 39245183  T
Q  395 tatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412187
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 17517138 - 17517320
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  17517138 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtc 17517237  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517238 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 24767018 - 24767142
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  24767018 ctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgtcat 24767115  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24767116 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    || || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 20902076 - 20902172
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902076 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 2154681 - 2154776
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154681 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 11581266 - 11581361
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581266 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 440
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  347 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31061163 - 31061068
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061163 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38619529 - 38619434
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38619529 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    ||||||||| |||||| |||||   |||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23064606 - 23064512
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064606 tgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144068
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 22144118  T
Q  377 tgcctatgttgctgt-tgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 37724073 - 37723910
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||||||  |  |||||| || |||||||||||||   |    
T  37724073 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 37723977  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgt-tgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37723976 tatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 22959214 - 22959339
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  22959214 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgcca 22959311  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22959312 tggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 424
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  326 gatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtct 421  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  422 aag 424  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| | |||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012154
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21565984 - 21565863
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  || |  |||   ||||||||||||||     
T  21565984 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg-aattttcgtgaattgtacctgaactcgccat 21565886  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21565885 ggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24067202 - 24067110
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067202 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19669340 - 19669219
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||  |||   ||||||||||||||     
T  19669340 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgtggaaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccat 19669241  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctc 125  Q
    |||| | ||||||||| |||||    
T  19669240 ggcgtgtagaggctctcgcctc 19669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 427
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  375 actgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 424
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  375 actgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22032485 - 22032323
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgt 372  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| || || ||| |||||  |||| | | |||||    
T  22032485 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat-tgtttgt 22032391  T
Q  373 atactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22032390 aatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  387 gctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 21871252 - 21871365
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | | |||||  || ||||  | ||||||||| ||||||||     
T  21871252 ctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaaagattatggaatg-gacttttgtgattctgacctgtactcgccat 21871350  T
Q  104 ggcgagcagaggctc 118  Q
    |||||| ||||||||    
T  21871351 ggcgagtagaggctc 21871365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 21875532 - 21875645
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | | |||||  || ||||  | ||||||||| ||||||||     
T  21875532 ctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaaagattatggaatg-gacttttgtgattctgacctgtactcgccat 21875630  T
Q  104 ggcgagcagaggctc 118  Q
    |||||| ||||||||    
T  21875631 ggcgagtagaggctc 21875645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725853
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgcttt-g 40725927  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtt--attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||| ||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  40725926 catactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 420
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 420
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22144406 - 22144294
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgtt 186  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| || |||| ||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  22144406 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 22144308  T
Q  187 gagaattgaacctt 200  Q
    |||| |||||||||    
T  22144307 gagagttgaacctt 22144294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 378  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 22178264 - 22178323
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572182
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 340  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 23572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 21329176 - 21329230
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  21329176 ctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaa 21329230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 424
Target Start/End: Original strand, 27989001 - 27989031
Alignment:
Q  394 ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989001 ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27989031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796438
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttg-ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccag 138  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 19472476 - 19472528
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19472476 ttggaaagctggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 131
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  91 ctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20805910 - 20805858
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20805910 ttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20805858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31342466 - 31342414
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31342466 ttggagatctgggctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44053269 - 44052829
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  44053269 ctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtaggatgagattgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 44053170  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  44053169 ggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 44053070  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44053069 atagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgagcattac 44052971  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44052970 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaac 44052871  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052870 tgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22636874 - 22636437
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||    
T  22636874 ctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccac 22636775  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22636774 ggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggg 22636675  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22636674 gtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctg-ttaagatgtgttgatgtc-gattatgatgtgatataatgttatatgcattac 22636577  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22636576 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaac 22636477  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636476 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12903186 - 12902757
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  12903186 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 12903097  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12903096 gcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttggg 12902997  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902996 taggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 12902898  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12902897 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12902798  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902797 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7089306 - 7088877
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  7089306 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttatgggattctgacctgaactcgccatg 7089217  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  7089216 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgag 7089117  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7089116 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttg-ctaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 7089018  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7089017 tgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 7088918  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088917 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14039089 - 14038653
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14039089 ctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccac 14038990  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||| | ||| ||||||||| |    
T  14038989 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttgg 14038890  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| || | ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14038889 ggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 14038791  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  14038790 cttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaa 14038691  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14038690 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 89 - 436
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  189 gaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataa 287  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || | ||||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttg-ttgattatgatgtgatataa 23374323  T
Q  288 tgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 387  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23374324 tgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttg 23374423  T
Q  388 ctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23374424 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 68 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7894077 - 7893703
Alignment:
Q  68 aatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gtga 166  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||    
T  7894077 aatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcga 7893978  T
Q  167 cctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgat 265  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||      
T  7893977 cctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg-- 7893880  T
Q  266 gactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctg 365  Q
      ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7893879 --ctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 7893782  T
Q  366 tttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893781 tttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 16377203 - 16377639
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377203 ctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaatgatcgtagaatgaa-cttttgggaatctgacctgaactcgccac 16377301  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgt-tgagaattgaaccttt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||     
T  16377302 ggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttg 16377401  T
Q  202 gggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  16377402 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 16377500  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16377501 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttattta 16377598  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377599 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 16239673 - 16240090
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaa-tgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||        
T  16239673 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtggat-tctaacctgaactcg---- 16239767  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |    
T  16239768 ------------------cctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttgg 16239849  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  16239850 ggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatatgatataatgttatttgcatta 16239948  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16239949 cttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaa 16240047  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240048 ttaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 14052994 - 14053422
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||          | |||| | ||| | |||||||||||||| ||| |    
T  14052994 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacttggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatg 14053083  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  14053084 gcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttggg 14053183  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | |||||| || |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14053184 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 14053281  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaag-atgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||    
T  14053282 tgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaa 14053379  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14053380 ctaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3097072 - 3096759
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  3097072 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaag 3096983  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3096982 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttggg 3096883  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| || || ||||||||| || |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  3096882 taggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ctgattatgatgagatacaatg-tttatgcattact 3096785  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096784 tgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7798949 - 7798774
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798949 tgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 7798850  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798849 ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15091337 - 15091104
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15091337 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccac 15091238  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||  | ||| ||||||||| |    
T  15091237 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttgg 15091138  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttat 236  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15091137 ggtagtattgagacttaatgaagatgttaattat 15091104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 242 - 443
Target Start/End: Original strand, 16270156 - 16270356
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  16270156 tgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgc 16270254  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16270255 atttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatga 16270353  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  16270354 tgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 321
Target Start/End: Original strand, 17047816 - 17048070
Alignment:
Q  67 gaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtga 166  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||    
T  17047816 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcga 17047915  T
Q  167 cctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgat 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||  |  | |||||||||||||||||| ||| |    
T  17047916 cctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgtt 17048015  T
Q  266 gactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 321  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17048016 g-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||  ||| || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 443
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  319 tatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 417  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  418 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7799137 - 7798953
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| | | | | |||||||||||||||||||    
T  7799137 ctgaacatgactaataatgattaggacataatgtaggatgagattgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccac 7799038  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttga 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  7799037 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 44928604 - 44928800
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||     
T  44928604 ctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttgggaatctgaccagaactcgccat 44928702  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  44928703 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacctt 44928800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||  ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798872
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtc 54798848  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  54798849 ggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 272 - 440
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 446  Q
    |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  378 gcctatgttgctgttg-ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  358 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 18239436 - 18239581
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  18239436 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgt 18239534  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239535 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24029181 - 24029057
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  24029181 ctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 24029084  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24029083 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44102649 - 44102214
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  44102649 ctgagcatgtttaataatgattatgaa-gaatgtaggatgagattgaacctggatagattttagaataaaac-tttgagaatctgacctgaactcgccat 44102552  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt-agg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||| |||||||||     
T  44102551 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat-acttgtttaggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaaccttg 44102453  T
Q  202 gggtagc-attaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgca 298  Q
    || |||  || || | |  ||  | || ||| | || || | |||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||  |||||||||||  | | ||||    
T  44102452 ggatagttatgaatattatatata-atattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatga-tg-ttatattgtgatataattgtatatgca 44102356  T
Q  299 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 398  Q
    |||||||||  |||| |||||| || ||| |||| | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||    
T  44102355 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgttgttatt 44102257  T
Q  399 -aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102256 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 13812490 - 13812614
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||     
T  13812490 ctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctaaactcgccat 13812587  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13812588 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15552253 - 15552129
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15552253 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagacttagaatcaaa-atttggagaatctgacc-gaactcgccac 15552156  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||    
T  15552155 ggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17046659 - 17046487
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||     
T  17046659 tgattaagatgtgttataatgttta-tacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttc 17046561  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |   ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17046560 t---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 22633894 - 22634018
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||     
T  22633894 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggataatcaga-ttgaactcgccat 22633991  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22633992 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16597085 - 16596963
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  16597085 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 16596987  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcg 128  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  16596986 gcgagtagaggttctcgccccgcg 16596963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13953
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || |||||    
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 13898  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13899 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 20156971 - 20157095
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||     
T  20156971 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaggcttagaatgaaa-ctttgaagaatatga-ctgaactcgccat 20157068  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20157069 ggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15367788 - 15367690
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367788 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15370116 - 15370018
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370116 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15371300 - 15371202
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371300 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15373581 - 15373483
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373581 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15402801 - 15402703
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402801 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190688
Alignment:
Q  124 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagactt 218  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagactt 6190688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16223629 - 16223532
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223629 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3332283 - 3332201
Alignment:
Q  47 attgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3332283 attgaacctggaaagacttagaatgaaac-tttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttattaac-taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12774438 - 12774313
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  12774438 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacctggagagacgttagaatgaa---ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 12774342  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12774341 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 21815602 - 21815731
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||    
T  21815602 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgt 21815700  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815701 tatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706409
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 428
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243302
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttt 369  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||  ||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-att 52243241  T
Q  370 tgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243242 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8846815 - 8846689
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||   ||||  | |   |||| |||||||||     
T  8846815 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaattttttgtgagttgcaccttaactcgccat 8846716  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8846715 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 21814984 - 21815109
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||   | | |||||| ||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  21814984 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaattaagaatg-aactttttggaagctgacttgaactcgccatg 21815082  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21815083 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 21815313 - 21815438
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||   | | ||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  21815313 ctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaattaagaatgaactttttggaag-ctgacctgaactcgccatg 21815411  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21815412 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 21818406 - 21818531
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||   | | |||||| ||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  21818406 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaattaagaatg-aactttttggaagctgacttgaactcgccatg 21818504  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21818505 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 428
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  326 gatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtct 421  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  422 aagttga 428  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 428
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198661
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-tttt 370  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||  |||| |||||   | ||||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  371 gtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    | ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 6190562 - 6190481
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190562 tgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20149924 - 20149832
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149924 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 6190873 - 6190802
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaac 75  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6190873 ctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaac 6190802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 46640499 - 46640558
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640499 ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 439
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121917
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg-ctgtt 367  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||  | ||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattatt 15121844  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
     |||||  ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15121845 gttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17046756 - 17046721
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtag 40  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17046756 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17046721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 39705969 - 39706023
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||    
T  39705969 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacctggaa 39706023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 52242874 - 52242928
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  52242874 ctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaa 52242928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 26045346 - 26045395
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26045346 ctgcctattttgctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaag 26045395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 26050527 - 26050576
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26050527 ctgcctattttgctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaag 26050576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 17047765 - 17047813
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaac 53  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  17047765 ctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac 17047813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 39199 - 38761
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  39199 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttgaatgaaacttgtggat-tctgacctgaactcgccacg 39101  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39100 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 39001  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39000 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 38902  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  38901 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaat 38803  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38802 taagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 242 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33142 - 32942
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  33142 tgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgc 33044  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33043 atttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatga 32945  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  32944 tgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9844 - 9744
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9844 tgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagt 9746  T
Q  444 cc 445  Q
    ||    
T  9745 cc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 20360652 - 20361081
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  20360652 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 20360741  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20360742 gcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttggg 20360841  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20360842 tagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 20360940  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20360941 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaact 20361040  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361041 aagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 20637975 - 20638404
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20637975 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 20638064  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||     
T  20638065 gcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggga 20638164  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20638165 taacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataacgttttatgcattact 20638263  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20638264 tgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 20638363  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638364 aagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 17287477 - 17287917
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||    
T  17287477 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgtacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccac 17287576  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17287577 ggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggg 17287676  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||    
T  17287677 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttga-ggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattac 17287775  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17287776 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaac 17287875  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287876 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 22779908 - 22780348
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||    
T  22779908 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccac 22780007  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| ||    
T  22780008 ggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggg 22780107  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||| | || || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  22780108 gtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattac 22780206  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22780207 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaac 22780306  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780307 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29060980 - 29060540
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29060980 ctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 29060882  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| |    
T  29060881 gacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttgg 29060782  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29060781 ggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgagatataatgttatgtgcatta 29060683  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29060682 cttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 29060583  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060582 ctaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 442
Target Start/End: Original strand, 18409511 - 18409947
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcg 107  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18409511 aacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcg 18409610  T
Q  108 agcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggta 206  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  18409611 agcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggta 18409710  T
Q  207 gcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttg 305  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  18409711 gtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttg 18409809  T
Q  306 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaa 404  Q
    ||  ||   || ||  || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  18409810 aattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactga 18409909  T
Q  405 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409910 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 19303222 - 19303661
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303222 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacg 19303321  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||| | ||| ||||||||| ||    
T  19303322 gcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggg 19303421  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19303422 gtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtacattac 19303520  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||    
T  19303521 ttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaac 19303619  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303620 taagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20594210 - 20593773
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594210 aacatgtctaaatatgattagggaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaat-aaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggc 20594112  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  20594111 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggt 20594012  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 304  Q
    || ||| |||||||||||  ||| || |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  20594011 agtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatatattgttatacgcattactt 20593913  T
Q  305 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaacta 403  Q
    ||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||     
T  20593912 gatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactg 20593813  T
Q  404 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593812 agctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 25629039 - 25629476
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||  | | ||||||| |||||||  |||    
T  25629039 aacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaaatattttagaat-aaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggc 25629137  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  25629138 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggt 25629237  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 304  Q
    || ||| ||||||||||| | ||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25629238 agtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 25629336  T
Q  305 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaacta 403  Q
    |||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||    
T  25629337 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaacta 25629436  T
Q  404 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629437 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 443
Target Start/End: Original strand, 16920389 - 16920751
Alignment:
Q  79 tggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcac 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  16920389 tggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcac 16920488  T
Q  179 gagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatga 277  Q
    || || | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||  ||| || ||||||||||  ||||||   ||| ||  |||||||||    
T  16920489 gatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttg-ttgattatga 16920587  T
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |  ||||||  |||||||||| ||   |||||||||    
T  16920588 tgtggtataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatact 16920683  T
Q  378 gcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920684 gcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22831857 - 22831503
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||| | || ||    
T  22831857 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcga 22831758  T
Q  189 gaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataa 287  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||| |  | || ||||  ||| || | ||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  22831757 gagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataa 22831659  T
Q  288 tgttttgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 385  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||    
T  22831658 tg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgt 22831563  T
Q  386 tgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22831562 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 18821511 - 18821714
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  18821511 ctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 18821600  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  18821601 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggg 18821700  T
Q  205 tagcattaagactt 218  Q
    ||||||||||||||    
T  18821701 tagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 28496154 - 28496280
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  28496154 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatg 28496253  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28496254 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttt 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 416
Target Start/End: Original strand, 25611404 - 25611816
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaac--ctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25611404 ctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgagattggacctggaaagacttagaatgaaacaacttaggat-tctgacctgaactcgcca 25611502  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||  |  |   |||||||||  |||| |||  ||| || || | | ||| |||||  | ||| |||||||||||    
T  25611503 tggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttacttagagttgaacctttg 25611602  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||    |  || |||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||| | | |||||    
T  25611603 ggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttag-tcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacatta 25611701  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaa 400  Q
    |||||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  25611702 cttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaa 25611800  T
Q  401 ctaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||  |||||||||    
T  25611801 ctaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11185857 - 11185524
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||| ||    
T  11185857 acctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcga 11185758  T
Q  189 gaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataa 287  Q
    | || | ||| |||||||| |||||||||||||   || ||||    | || | ||||| ||  |||||| | ||| || |||||||||| ||| |||||    
T  11185757 ggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttg-ctgattatgaagtgttataa 11185659  T
Q  288 tgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 387  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||| |||   |||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||   |||| ||||| |||||  ||||||    
T  11185658 ag-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttg 11185563  T
Q  388 ctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185562 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 416
Target Start/End: Original strand, 25603066 - 25603478
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaac--ctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||||| |||    
T  25603066 ctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatgatgagattggacctggaaagacttagaatgaaacaacttaggat-tctgacttgaactcacca 25603164  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||  |  |   |||||||||  |||| |||  ||| || || | | ||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  25603165 tggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttg 25603264  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||   ||  || | |||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||| | | |||||    
T  25603265 ggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttag-tcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacatta 25603363  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaa 400  Q
    |||||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  25603364 cttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaa 25603462  T
Q  401 ctaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||  |||||||||    
T  25603463 ctaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 29808564 - 29808691
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga--cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808564 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaa-ctttgggaatctgacctgaactcgcca 29808662  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29808663 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  297 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 396  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  397 -ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25656724 - 25656629
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656724 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  298 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta- 396  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 1540928 - 1541073
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1540928 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 1541026  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541027 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1561743 - 1561622
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  1561743 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaaaaacttagaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccac 1561645  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  1561644 ggcgagcataggctctcgcctcg 1561622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttattaa-ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25644490 - 25644335
Alignment:
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 374  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  25644490 tgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcat 25644391  T
Q  375 actgcctatgttgctgt-tgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644390 actgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  297 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--t 394  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||   |    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  395 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21939823 - 21939699
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  21939823 ctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcctggaaagacttagaat-aaaactttggagaatctga-ctgaactcgccat 21939726  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21939725 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    || || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456781 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 20556959 - 20557054
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556959 tgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23992608 - 23992429
Alignment:
Q  261 ttgatgactgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtc 359  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||    
T  23992608 ttgatgattgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtc 23992512  T
Q  360 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattaa-ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
     |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  23992511 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18457154 - 18457029
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | |||||| ||| ||| | || |||||||||||| |||| |    
T  18457154 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatg-aactttttggaagctgacctgaactagccatg 18457056  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18457055 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 18457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 441
Target Start/End: Original strand, 19847989 - 19848114
Alignment:
Q  317 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  19847989 aatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848089 cagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19652635 - 19652512
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||  |||   ||||||||||||||     
T  19652635 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacctggaaagactttagaatg-aatttttgtgaattgtacctgaactcgccat 19652537  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcg 128  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  19652536 ggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 15894111 - 15894237
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaa-cctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||     
T  15894111 ctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctggaaagacttagaatgaaagaacttgggattctgacctgaactcgccat 15894210  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15894211 ggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  383 tgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 424
Target Start/End: Original strand, 18821867 - 18821946
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18821867 tgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227632
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 8227558  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtt--attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||| ||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8227559 catactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 416
Target Start/End: Original strand, 15041473 - 15041644
Alignment:
Q  244 aagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat-ttgaatatttaagatgttgatgaattgca 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| || | |||||| | ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15041473 aagctgtttaagatgtgttgatga-taattaagatttggtttaatgtat-gtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattgaattgca 15041569  T
Q  343 agtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15041570 tttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  423 agttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || |||  |||||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 27332961 - 27333089
Alignment:
Q  1 gtggctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcg 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||  ||||  | |   |||||||||||    
T  27332961 gtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattttagaatg-aagttttgtgagttgcacctgaactcg 27333059  T
Q  100 ccacggcgagcagaggctcttgcctcgcga 129  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  27333060 ccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 27393701 - 27393829
Alignment:
Q  1 gtggctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcg 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||  ||||  | |   |||||||||||    
T  27393701 gtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattttagaatg-aagttttgtgagttgcacctgaactcg 27393799  T
Q  100 ccacggcgagcagaggctcttgcctcgcga 129  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  27393800 ccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 4667894 - 4668019
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  4667894 ctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagtttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgcca 4667991  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4667992 tggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 130
Target Start/End: Original strand, 4185505 - 4185629
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgccac 103  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||     
T  4185505 tgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctggaaagagtttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgccat 4185602  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4185603 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1561349 - 1561303
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1561349 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Original strand, 22080800 - 22080846
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080800 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19668449 - 19668386
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668449 ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4189396 - 4189339
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4189396 ctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaaga 4189339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 4674741 - 4674798
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4674741 ctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaaga 4674798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 22334563 - 22334632
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaa 74  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22334563 ctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctggaaatacttagaatgaaa 22334632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 31155087 - 31155136
Alignment:
Q  13 gtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155087 gtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaaga 31155136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgt-tgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 25641939 - 25641991
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25641939 ttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23019763 - 23019721
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23019763 acctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagt 23019721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Original strand, 22080502 - 22080543
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22080502 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16741555 - 16741503
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16741555 ttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16741503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 19790536 - 19790588
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| |  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19790536 ttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 19790588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Original strand, 50209894 - 50210333
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50209894 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacg 50209993  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50209994 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgg 50210093  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  50210094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattac 50210192  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50210193 ttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 50210292  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210293 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 27250421 - 27250850
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||          |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  27250421 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgggattgaacctggaa----------tgaaacctgtgggattctgacctgaactcgccacg 27250510  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27250511 tcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttggg 27250610  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27250611 tagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 27250709  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27250710 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 27250809  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250810 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22532709 - 22532269
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22532709 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaggattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacttgaactcgccac 22532611  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  22532610 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttga 22532511  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22532510 ggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22532412  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22532411 cttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 22532312  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532311 ctaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34510220 - 34509783
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34510220 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 34510122  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  34510121 ggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttgg 34510022  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  34510021 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgaatatgatgtgatataatgttataagcatta 34509923  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    |||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34509922 cttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 34509823  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509822 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21027108 - 21026680
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacgg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||    |||||||| ||||||||||||    
T  21027108 tgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacgg 21027019  T
Q  106 cgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21027018 cgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggt 21026919  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026918 agcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 21026820  T
Q  305 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaacta 403  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21026819 gagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaacta 21026720  T
Q  404 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026719 agctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 367
Target Start/End: Original strand, 22354254 - 22354616
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22354254 tgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 22354353  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22354354 gcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttagg 22354453  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  22354454 tagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatacattact 22354552  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22354553 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20135626 - 20135188
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaaccttt-ggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |    
T  20135626 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatg 20135528  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttt-tgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20135527 gcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagg 20135428  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| | |||||| |||||| | ||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  20135427 gtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tcattatgatatgatataatgttgtatgcattac 20135329  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt-attaac 401  Q
    ||||||  |  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| |||||  |||||    
T  20135328 ttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaac 20135229  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135228 taagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 22355866 - 22356185
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||  | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22355866 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacg 22355955  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22355956 gcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 22356054  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22356055 atagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 22356154  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 333  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22356155 ttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 22357552 - 22357871
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||  | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22357552 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacg 22357641  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22357642 gcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 22357740  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22357741 atagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 22357840  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 333  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22357841 ttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 38801083 - 38801508
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||          |  ||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  38801083 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgaacctggaa----------ttgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 38801172  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||| |||||    
T  38801173 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttggg 38801272  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||| | ||  |||  ||| | || ||||||||  |||||| | ||| ||  |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38801273 taggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattacgatgtgttataatg-tttatgcattact 38801370  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38801371 tgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaac 38801467  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801468 taagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 20846911 - 20847127
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||    | ||||||||||||||||||    
T  20846911 ctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacg 20847000  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20847001 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggg 20847100  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgtta 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20847101 tagcattaagacttaatgaagaggtta 20847127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 433447 - 433012
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  433447 ctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgccat 433349  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg-ttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || | || |||| ||||| ||||| || |||| | |||||||| ||||||| |||||||||     
T  433348 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgcaaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttg 433250  T
Q  202 gggtagc-attaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgca 298  Q
    ||||||| || || | |||   |  || ||| | || || | | |||||| |||| ||||  ||||||  || ||||  |||||||||||  | | ||||    
T  433249 gggtagctatgaata-ttataaataatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatg-ttgtttatattgtgatataattgtatatgca 433152  T
Q  299 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 398  Q
    |||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||    
T  433151 ttacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgttat--tt 433054  T
Q  399 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  433053 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 22468617 - 22468816
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22468617 tgaagctgtttaagatgtgctgatg--taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgc 22468714  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  22468715 aattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 22468814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 443
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Original strand, 20847184 - 20847275
Alignment:
Q  353 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20847184 ttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20919041 - 20918917
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||||||||||||     
T  20919041 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatttaa-atttggagaatctga-ctgaactcgccat 20918944  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918943 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||   ||| |||||| || ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || |||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 446
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  347 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 445  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcc 15860176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Original strand, 13212929 - 13213027
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212929 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21861617  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861618 catactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Original strand, 21896205 - 21896358
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21896205 ttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 21896303  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896304 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21342191 - 21342090
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21342191 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagt 21342093  T
Q  444 cca 446  Q
    |||    
T  21342092 cca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21347056 - 21346961
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347056 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21707297 - 21707167
Alignment:
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctg 408  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21707297 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21707199  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707198 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21711839 - 21711709
Alignment:
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctg 408  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21711839 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21711741  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711740 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || |||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  378 gcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 442
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21754475 - 21754350
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  21754475 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacctgggaagactttagaatgaa---ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 21754379  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21754378 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 35261053 - 35261180
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg- 393  Q
    |||||||||||||  || | ||||| ||| ||||||||||   |||||  ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  35261053 tgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttg 35261148  T
Q  394 -ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261149 tttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33681449 - 33681301
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||  | |   ||||||||||||||     
T  33681449 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg-aatttttgtgagttgcacctgaactcgccat 33681351  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681350 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 20091155 - 20091281
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaac-ctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||     
T  20091155 ctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccat 20091254  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||    
T  20091255 ggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40389249 - 40389157
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389249 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| ||||||||| || |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48603715 - 48603637
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 321  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  48603715 tgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754052
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 416
Target Start/End: Original strand, 21787988 - 21788136
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | |||||||||||    
T  21787988 tgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgtt 21788086  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
     ||||   ||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21788087 gttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20248717 - 20248592
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  20248717 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctggagagactttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgcca 20248620  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
     |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  20248619 tggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918620
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16758726 - 16758664
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758726 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 52927662 - 52927719
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  52927662 ctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacctggaaaga 52927719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 16368329 - 16368388
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368329 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 41050079 - 41050138
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050079 ttttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22238069 - 22238012
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  22238069 ctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctggaaaga 22238012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958124
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 22921548 - 22921602
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||    
T  22921548 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaaccaggaa 22921602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  89 acctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 16093928 - 16093987
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093928 ttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686630
Alignment:
Q  375 actgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13640 - 13211
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||          |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13640 ctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaa----------tgaaacttgtggcattctgacctgaactcgccacg 13551  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||     
T  13550 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttggga 13451  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattatta-tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13450 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 13352  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13351 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 13252  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13251 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 741 - 1169
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||          ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  741 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct----------agattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 830  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  831 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttggg 930  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  931 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgtt-ttggttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 1028  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1029 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 1128  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1129 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 8213 - 8650
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  8213 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccac 8312  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctt-tg 202  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  8313 ggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttggg 8412  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8413 ggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttatgtgcatta 8511  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattaac 401  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||    
T  8512 cttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgttat--ttaac 8608  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 5802 - 6245
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | | ||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||    
T  5802 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacctgggaagattattgaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccac 5901  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| ||    
T  5902 ggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttggg 6001  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6002 atagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 6100  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt----att 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     ||    
T  6101 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttattt 6200  T
Q  399 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 23983 - 24406
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||     
T  23983 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaca 24082  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||     
T  24083 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttggga 24182  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24183 tagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 24282  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24283 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 24382  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24383 taagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Original strand, 16896 - 17337
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16896 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacg 16995  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  16996 gagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggg 17095  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| || | | ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  17096 gtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattac 17194  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||  ||   || ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17195 ttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttattta 17294  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17295 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 79301 - 79430
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  79301 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgt 79399  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79400 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 58
Target Start/End: Original strand, 79044 - 79096
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctgga 58  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  79044 tgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13532 - 13144
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  13532 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 13433  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  13432 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggg 13333  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13332 gtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattac 13234  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 392  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233 ttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34560 - 34437
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||     
T  34560 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaa-atttggagaatctgacc-gaactcgccat 34463  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcga 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  34462 ggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  369 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  388 ctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23322 - 22886
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||||||  ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23322 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctggaaagattgtagaattgaat-tttggaattctgaactgagctcgccac 23224  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23223 agcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 23124  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23123 ggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattacgatgtgatataatgttatgtgcatta 23025  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  23024 cttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaa 22926  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22925 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 436
Target Start/End: Original strand, 25746 - 26179
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  25746 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatt-tttggaaatctgacctgaactcgccac 25844  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||  |||||||| |    
T  25845 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttgg 25944  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  25945 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttaaacgcatta 26043  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26044 cttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 26143  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 291
Target Start/End: Original strand, 33179 - 33463
Alignment:
Q  9 acatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33179 acatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcg 33278  T
Q  108 agcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggta 206  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || || | |   || ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  33279 agcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggta 33378  T
Q  207 gcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgtt 291  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33379 gtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8479
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | || |||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  8915 ctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagattgtaaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 8816  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  8815 ggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgga 8716  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    ||||||| ||||||||||    
T  8715 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatg-ttgattatgatgt----taatgttatgtgcattac 8621  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||| | | |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  8620 ttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaac 8521  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8520 caagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 427
Target Start/End: Original strand, 7542 - 7594
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  7542 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtctcggtttaagttg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5276 - 4849
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacgg 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||    |||||||||||||||||||||    
T  5276 tgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacgg 5187  T
Q  106 cgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  5186 cgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggct 5088  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 304  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||  ||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5087 agcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 4989  T
Q  305 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaacta 403  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4988 gagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 4889  T
Q  404 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 atctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40351 - 39913
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40351 ctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctg-acagattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 40254  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggt-tttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40253 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgg 40154  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40153 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 40055  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||  ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40054 cttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaa 39956  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39955 ttaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 424
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  421 taag 424  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 90 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21265 - 20910
Alignment:
Q  90 cctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| | ||    
T  21265 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcag 21166  T
Q  190 aattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataat 288  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21165 agttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ctgattatgatgtgatataat 21067  T
Q  289 gttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 388  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21066 gttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgc 20967  T
Q  389 tg-ttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20966 tgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 21330 - 21276
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  21330 ctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgtacctggaa 21276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 86 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2310 - 1952
Alignment:
Q  86 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2310 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgt 2211  T
Q  186 tgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgata 284  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| || || | | ||||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  2210 cgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgt-tgattatgatgagata 2112  T
Q  285 taatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2111 taatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatg 2012  T
Q  385 ttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2011 tcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 2381 - 2327
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  2381 ctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 2327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40296 - 39858
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||||||    
T  40296 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggtt-tctaacctgtactcgccac 40198  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |    
T  40197 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaacctt-g 40099  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattatta-tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  40098 ggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaatgcatta 40000  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| | | |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39999 cttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaa 39901  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39900 ctaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  127 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaag 225  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  226 atgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatattta 324  Q
    |||||| |||| || | |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttg 26015  T
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaa 423  Q
    |||||||| | | |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26014 agatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 25916  T
Q  424 gttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25915 gttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 59184 - 59308
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  || |||||| |||||||||| |    
T  59184 ctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaacctgacc-gaactcgccatg 59282  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  59283 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26555
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaaagattgtagaatgaaacttttgg-attctgacctgaagtcgccacggc 26564  T
Q  107 gagcagagg 115  Q
    |||||||||    
T  26563 gagcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 39612 - 39669
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39612 ctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaaga 39669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 125022 - 124675
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  125022 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag---gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 124926  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  124925 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 124826  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  124825 atagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattac 124727  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattatt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  124726 ttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 174936 - 174767
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||||||   |    
T  174936 tatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 174840  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174839 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  375 actgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 63000 - 62946
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaa 60  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  63000 tgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaa 62946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 136412 - 136471
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136412 ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 145120 - 145179
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145120 ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 10118 - 10544
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  10118 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacg 10207  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  10208 gggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttggg 10307  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||| |  | |||| |||| || | ||||||||| |||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10308 tagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttga-tgattatgatgtgatataatgatta-tgcattact 10405  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt-attaac 401  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10406 tgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaac 10502  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10503 tatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 16280 - 16721
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactta-gaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  16280 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccat 16379  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || | | |||| |||||||  || ||||||||| |    
T  16380 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttgg 16479  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  16480 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattttgatgtgatataatgttatacgcatta 16578  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaa 400  Q
    ||||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  16579 cttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaa 16678  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16679 ctaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4948 - 4508
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt--agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4948 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgcca 4850  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |  | | |||| ||||||| ||| |||||||||     
T  4849 tggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttg 4750  T
Q  202 gggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  4749 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 4651  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  4650 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 4551  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4550 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12530 - 12090
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt--agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12530 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgcca 12432  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |  | | |||| ||||||| ||| |||||||||     
T  12431 tggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttg 12332  T
Q  202 gggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  12331 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 12233  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  12232 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 12133  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12132 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22482 - 22042
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt--agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22482 ctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgcca 22384  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaaccttt 201  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |  | | |||| ||||||| ||| |||||||||     
T  22383 tggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttg 22284  T
Q  202 gggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  22283 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 22185  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    |||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  22184 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 22085  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22084 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39844 - 39479
Alignment:
Q  77 tttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || || | | |    
T  39844 tttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcg 39745  T
Q  176 cacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgatta 274  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  39744 cacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgatta 39646  T
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39645 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtat 39547  T
Q  375 actgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39546 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 15163 - 15584
Alignment:
Q  11 atgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagc 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | | | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15163 atgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------taaaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagc 15252  T
Q  111 agaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||||| ||    
T  15253 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggat 15352  T
Q  211 taagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga 309  Q
    ||||||||||| |  | |||| |||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  15353 taagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataat-atttatgcattacttgaaga 15450  T
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctg 408  Q
    ||||||  |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15451 atatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctg 15549  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15550 catgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgct-gtttttg 371  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| |  || ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  7459 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattgttgttg 7364  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7363 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 77 - 441
Target Start/End: Original strand, 74968 - 75333
Alignment:
Q  77 tttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || || | | |    
T  74968 tttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcg 75067  T
Q  176 cacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgatta 274  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  75068 cacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgatta 75166  T
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtat 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  75167 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtat 75265  T
Q  375 actgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75266 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 339639 - 340065
Alignment:
Q  12 tgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagc 110  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  339639 tgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaa-cttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagc 339737  T
Q  111 agaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| ||    
T  339738 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtat 339837  T
Q  211 taagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga 309  Q
    | ||||||||||| || |||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||      
T  339838 tgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaatt 339936  T
Q  310 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctg 408  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  339937 atgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctg 340033  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340034 catgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13924 - 13497
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||||    
T  13924 ctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacg 13835  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  13834 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcgg 13735  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13734 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 13637  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aact 402  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13636 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 13538  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13537 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32493 - 32067
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | |||||| |||||| ||||||    
T  32493 ctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacg 32404  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||    
T  32403 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttggg 32304  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | || |||| |||| || | ||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32303 taggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 32206  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32205 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaact 32108  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32107 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5141 - 4712
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||          | |||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5141 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 5052  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttt-gtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  5051 gcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgg 4952  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||  ||| || | ||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  4951 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgatataatgttta-tgccttac 4854  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaac 401  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4853 ttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaac 4754  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4753 taagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 365 - 1
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||          | |||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  365 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 276  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-gttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  275 gcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgg 176  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 302  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||  ||| || | ||||| ||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  175 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgatataatg-tttatgccttac 78  T
Q  303 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 379  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  77 ttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 744 - 1170
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  744 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacg 833  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  834 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttggg 933  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||||| |||||  | || ||||  ||| || | ||||||||| ||| || | ||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  934 taggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattact 1031  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt--gttattaac 401  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||    
T  1032 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaac 1128  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1129 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6669
Alignment:
Q  86 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6968 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgt 6869  T
Q  186 tgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgata 284  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||| || | | ||||||| || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  6868 cgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttg-ttgattatgatgtgata 6770  T
Q  285 taatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 384  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6769 taacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatg 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7039 - 6985
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  7039 ctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16708 - 16282
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||          | |||| | ||| | | ||||| ||||||| ||||    
T  16708 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctgaaa----------ttaaacttatgggattttgaccagaactcggcacg 16619  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||  |||||    
T  16618 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttggg 16519  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||| | || ||||  ||| || | ||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  16518 taggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgatgtgttataatgttta-tgcattact 16421  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatt-aac 401  Q
    |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  16420 tgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaac 16324  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16323 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 443
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  159 ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagat 257  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  258 gtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatg 357  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 3185  T
Q  358 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 tcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 694 - 837
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  694 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaa-cttttggaaatctgacctgaactcgccac 792  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 148  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  793 ggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1639 - 1289
Alignment:
Q  91 ctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgaga 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1639 ctgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgaga 1540  T
Q  191 attgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatg 289  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||  ||| || ||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  1539 gttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgt-tgattatgaagtgttataatg 1441  T
Q  290 ttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 389  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||    
T  1440 ttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgct 1345  T
Q  390 gtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1344 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7616 - 7266
Alignment:
Q  91 ctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgaga 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7616 ctgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgaga 7517  T
Q  191 attgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatg 289  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||  ||| || ||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  7516 gttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatg 7418  T
Q  290 ttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 389  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| |    
T  7417 -tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgtt 7322  T
Q  390 g-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7321 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 440
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Original strand, 32640 - 33077
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||   ||||  | |   |||  ||||||||||    
T  32640 ctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatt-tttgtgagttgcaccctaactcgccac 32738  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| || || | | |||| | ||||| ||| ||||||||| |    
T  32739 agcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttgg 32838  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaa-gatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||| || | ||||||| ||| | ||||   |||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  32839 ggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgt-tgatcatgatgtgttataatgttatatgcatt 32935  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32936 actcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaatta 33033  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33034 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 46365 - 45928
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||   ||||  | |   |||  ||||||||||    
T  46365 ctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatt-tttgtgagttgcaccctaactcgccac 46267  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| || || | | |||| | ||||| ||| ||||||||| |    
T  46266 agcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttgg 46167  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaa-gatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatt 300  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||| || | ||||||| ||| | ||||   |||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  46166 ggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatgatgc--tgatgt-tgatcatgatgtgttataatgttatatgcatt 46070  T
Q  301 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tta 399  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  46069 actcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaatta 45972  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45971 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16527 - 16331
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||  ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  16527 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaaagattgtagaattgaat-tttggaattctgaactgagctcgccac 16429  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctt 200  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16428 ggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16212 - 16113
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212 tgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 443
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  383 tgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52008 - 51582
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||          |||||| |  || | ||| |||||| |||||||||    
T  52008 ctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaa----------tgaaacttacgggattctaacctgagctcgccacg 51919  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  51918 gcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttggg 51819  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||    || ||||  ||| || | ||||||||  |||||| | ||| ||  ||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  51818 taggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgaatatgaagtgttataatg-tttatgcatttct 51721  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51720 tgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 51624  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  51623 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20843 - 20616
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  20843 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 20744  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  20743 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgga 20644  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgtta 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20643 atagcattaagacttaatgatgatgtta 20616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 385
Target Start/End: Original strand, 643 - 1021
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacct-ttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||        |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  643 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacctggtttagtagagaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccat 742  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttg 202  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  743 ggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttga 842  T
Q  203 ggtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcatta 301  Q
    ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  843 ggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtc-gattacgatgtgatataatgttatgtgcatta 941  T
Q  302 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 385  Q
    ||||||  ||  |||||||||| |||| ||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  942 cttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 443
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47415 - 46995
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||| |||||||||    
T  47415 ctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacg 47326  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  47325 gagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttggg 47226  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||||||||  | ||       ||| || | ||||||||| |||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47225 taggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgtttatgatgtgatataatgttta-tgcattact 47134  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    || |||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  47133 tggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaac 47037  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47036 taagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 51565 - 51779
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||    
T  51565 ctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccac 51664  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  51665 ggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggg 51764  T
Q  204 gtagcattaagactt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  51765 gtagcattaagactt 51779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32635 - 32538
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32635 tgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatg 32539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28223 - 27911
Alignment:
Q  52 acctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28223 acctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 28124  T
Q  152 tgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctg 249  Q
    ||| ||| |||||  | || | | |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||| ||    
T  28123 tgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttg 28024  T
Q  250 tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgata 349  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| |||||  |||||    
T  28023 tttaagatttgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 27925  T
Q  350 ttattatgtcatgc 363  Q
    ||||||||||||||    
T  27924 ttattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28976 - 28924
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctgg 57  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28976 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  407 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4960 - 4545
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| | ||||   ||| ||||||  ||||||| |||    
T  4960 aacatgtctattaatgactagggaagattgtagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaa-cttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggc 4862  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggt 205  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  4861 gagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggt 4762  T
Q  206 agcattaagacttaatgaagatgttatttatta-ttatgaagctg-tttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |||| |||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4761 agtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatg--ttgatg-ttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattact 4665  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaact 402  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  4664 tgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaact 4565  T
Q  403 aagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  4564 aagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1343 - 1037
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | ||||||| |||||||||| |    
T  1343 ctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgaccagaactcgccatg 1254  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1253 gcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttggg 1154  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || |||| || | ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1153 tagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 1055  T
Q  304 tgaagaatatttgaatat 321  Q
    |||  | |||||||||||    
T  1054 tgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3640
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  3910 ctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 3821  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3820 gcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttggg 3721  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatat 285  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  3720 tagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7974 - 7704
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  7974 ctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatg 7885  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7884 gcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttggg 7785  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatat 285  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || |||| || | |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  7784 tagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 428
Target Start/End: Original strand, 27698 - 27855
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  27698 ttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-g 27796  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
     ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27797 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 4823 - 5246
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |  ||| | ||| | ||||||||||||||||||      
T  4823 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------ttgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaa 4912  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4913 gagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttggg 5012  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 303  Q
    ||| ||||||| ||||| |  | |||| |||| || | |||| |||  ||| || | ||| ||  |||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  5013 taggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttg-ttgattaagatgtgttataatg-tttatacattact 5110  T
Q  304 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaac 401  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||| || |||||| |||||    
T  5111 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaac 5207  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5208 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3306
Alignment:
Q  242 tgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| |||||| |    
T  3106 tgaagctgtttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattac 3204  T
Q  342 aagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3205 atttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3304  T
Q  441 tg 442  Q
    ||    
T  3305 tg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 306 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  306 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaa 404  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  405 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4552
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4598 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 11205 - 11426
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          |||||| | ||| |  ||||||||||||||||| |    
T  11205 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----------tgaaacttgtgggatactgacctgaactcgccaag 11294  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttggg 204  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11295 gcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttggg 11394  T
Q  205 tagcattaagacttaatgaagatgttatttat 236  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  11395 tagaattaagacttaatgatgaggttaattat 11426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  322 ttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  421 taagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 191
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||     
T  344 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccaca 245  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg 158  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  244 gcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagg 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 17689 - 17929
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  17689 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccac 17788  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 203  Q
    ||||                     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17789 ggcg---------------------agtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgg 17867  T
Q  204 gtagcattaagacttaatgaagatgttatttattat-tatgaagctgtttaagatgtattga 264  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  17868 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 1758 - 1891
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  1758 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaac-tttggaaatctgacctgaattcgccat 1856  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccag 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1857 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20552 - 20426
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20552 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacg 20453  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  20452 acgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10571 - 10323
Alignment:
Q  39 agaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaat-ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgaccc 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||     
T  10571 agaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacct 10472  T
Q  137 agaaacagagtgacttgttagg-ttttgtgacctttattgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagatgttattta 235  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| || || | | |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| | |    
T  10471 agaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataa 10372  T
Q  236 ttat-tatgaagctgtttaagatgtattgatgactgattatgatgtgata 284  Q
    | || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10371 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44600 - 44454
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgcctatgttgctgttg 393  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  44600 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgttg 44502  T
Q  394 ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44501 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 101834 - 101709
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||     
T  101834 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactttagaatgaa--ttttgtgaacttgacctgaactcgccat 101737  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  101736 ggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  317 aatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgag 414  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  415 tcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 439
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Original strand, 38429 - 38596
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||  | |||||| |||| |||    
T  38429 tatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttg 38527  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |   ||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  38528 tgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13537 - 13392
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 394  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13537 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 13439  T
Q  395 ta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13438 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2250
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  2126 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 2224  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2225 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 80013 - 80137
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  80013 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgacat 80110  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  80111 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 428
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  416 cggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 133093 - 132967
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  133093 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 132996  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  132995 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62200
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  358 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttattaa-ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12861
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 340  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| || || ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4359 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 15296 - 15426
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15296 ctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctggatagattttagaatgaaac-tttgggaatctgacctgaactcgccat 15394  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacc 135  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15395 agcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12587
Alignment:
Q  319 tatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtc 416  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtc 12595  T
Q  417 ggtctaag 424  Q
    ||||||||    
T  12594 ggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 12490 - 12611
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  12490 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacatagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 12587  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgc 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12588 ggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17220 - 17090
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||     
T  17220 ctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattttagaat-aaaactttgagaatatgacctgaactcgccat 17122  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacc 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17121 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 130
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7576
Alignment:
Q  24 attaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggataatctga-ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgc 7568  T
Q  123 ctcgcgag 130  Q
    ||||||||    
T  7569 ctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  277 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |   | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 424
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20478 g-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 20107 - 20228
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | |||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| |    
T  20107 ctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatg-aactttttggaagctgacctgaactcgccatg 20205  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgc 127  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  20206 gcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 436  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 85647 - 85742
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85647 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160688
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 161125 - 161056
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  161125 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactttagaatgaa 161056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 497494 - 497445
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  497494 ctgcctatgttgttgttgtatattaactaagctgcatgtgtcggtttaag 497445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 344
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  468 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaatacttagaatggaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccat 371  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  370 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8909
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8957 ctgcctatgttgctgttgtatattaa-taagctgcatgtgtcggtctaag 8909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 24332 - 24456
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  24332 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaa-ctttggataatctga-ctgaactcgccat 24429  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24430 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38377
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 38303  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38304 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 7975 - 8099
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||     
T  7975 ctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatct-aacagaactcgccat 8072  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8073 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53651
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| || |||||    
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttg 53596  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgtt--gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  53597 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 28961 - 29081
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||| |    
T  28961 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactagccatg 29059  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29060 gcgagcagaggctctcgcctcg 29081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 395  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
       | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10347 - 10226
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  10347 aacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacttagaaggaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgccatggc 10250  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  10249 gagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    | || |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctgt-----ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 9515 - 9639
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttgga-aatctgacctgaactcgccac 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  9515 ctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagacttagaatgaaa-ctttggagaatctga-ctgaactcgtcat 9612  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9613 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  297 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 395  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  396 a-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 442
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16098 - 15974
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||  || |  ||||||||| |||||||||| |    
T  16098 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagactcaaaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatg 16000  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15999 gcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  378 gcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 441  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 381
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  218 taatgaagatgttatttattat-tatgaagctgttt-aagatgtattgatgactgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatattt 315  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   |    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgt-tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagt 3522  T
Q  316 gaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 381  Q
    | ||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3523 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||| | ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  417 ggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129072
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgtt-gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 78400 - 78328
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatg 436  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  78400 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30027 - 29946
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30027 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32523 - 32397
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  32523 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 32426  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32425 tggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttattaa-ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  278 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 376  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    ||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12368 - 12243
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacg 104  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12368 ctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaaa-ctgacctgaactcgccatg 12270  T
Q  105 gcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  12269 gcgagtagaggctctcacctcgcgagt 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  383 tgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  279 gtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  378 gcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
     |||||| | || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1440
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1348 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13301 - 13147
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaata-tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgttttt 370  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||     
T  13301 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt- 13203  T
Q  371 gtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    | ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13202 gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 428
Target Start/End: Original strand, 16049 - 16206
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  16049 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-g 16147  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
     ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16148 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctg-ttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 2196 - 2291
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2196 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 154
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  90 cctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18148
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||    ||||||||||| ||||| |||| | |    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-g 18074  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18075 cataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 6509 - 6557
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaac 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6509 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 437
Alignment:
Q  8 aacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccacggc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||   ||||  | |   |||||||||||||| |||    
T  567 aacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacttggaaagattttagaatgaatt-tttgtgagttgcacctgaactcgccatggc 469  T
Q  107 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  468 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19706 - 19573
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctg--acctgaactcgcc 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||   |||  |  | |   |||||||||||||    
T  19706 ctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaa---tttttatgtgttgcacctgaactcgcc 19610  T
Q  102 acggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccag 138  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19609 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtta-ttaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  300 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt 398  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  399 -aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 440  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11464
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 11538  T
Q  372 tatactgcctatgttgctg-ttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11537 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6244
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 28490 - 28616
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  28490 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctacgaagactttagaatgaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 28587  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28588 tggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 443
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 142649 - 142600
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  142649 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaag 142600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| | | |  ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  416 cggtctaag 424  Q
    |||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  416 cggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 2484 - 2609
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||  || ||| ||||||||||||||    
T  2484 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctgtaaagattttagaatgaaa--tttgtgaa-ctgaacctgaactcgcca 2580  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2581 tggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 18639 - 18710
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagact-tagaatgaaac 75  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18639 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaac 18710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  416 cggtctaagttgatga 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 60687 - 60818
Alignment:
Q  295 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 392  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| | |||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  60687 tgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt 60784  T
Q  393 --gttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60785 tgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 130347 - 130222
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa-agacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||  | ||||||  |  ||||| |||   |||| |||||||||     
T  130347 ctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttgggaattacacctaaactcgccat 130249  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  130248 ggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 45470 - 45596
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccac 103  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||  |||   ||||||||||||||     
T  45470 ctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacctggtaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccat 45569  T
Q  104 ggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45570 ggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 45836 - 45909
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45836 tttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 1982 - 2108
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagac-ttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  1982 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacataaaaagactttagaatgaaa--ttttgtgaactgaacctgaactcgcca 2079  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgagt 131  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2080 tggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 2766 - 2823
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2766 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaga 2823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26996 - 26828
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg-ctgtt 367  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||  ||||    
T  26996 tgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgtt 26901  T
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
     |||||  ||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  26900 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7251 - 7126
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  7251 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgcca 7154  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  7153 tggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 428
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  416 cggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1017 - 897
Alignment:
Q  7 gaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagacttagaatgaaac-ctttggaaatctgacctgaactcgccacgg 105  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||||| ||    
T  1017 gaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagataggacctggaaagacttagaatgaaacaacttgggattctgccctgaactcgccatgg 918  T
Q  106 cgagcagaggctcttgcctcg 126  Q
    |||||||| | ||| ||||||    
T  917 cgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 443
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 439
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  373 atactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 2325 - 2378
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctgga 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  2325 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25184 - 25121
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  318 atatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatta-actaagctgcatgagt 415  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  416 cggtctaagttgatga 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  275 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttga--atatttaagatgttgat-gaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||  ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    ||  || |||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  368 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg-ctgtttttg 371  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || || ||| ||||  |||||  |||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttg 1950  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttattaa-ctaagctgcatgagtcgg 418  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9516 - 9391
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaaga-cttagaatgaaacctttggaaatctg-acctgaactcgcca 102  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||||   ||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  9516 ctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagtttagaatgaa--tttttgtgaactgaacctgaactcgcca 9419  T
Q  103 cggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9418 tggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  321 tttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  419 tctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 13380 - 13326
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||    
T  13380 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaa 13326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 422
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8161
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcat--gctgtttt 369  Q
    |||| |||||||||||| || | | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||  ||||  ||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctg-att 8106  T
Q  370 tgtatactgcctatgttgct-gttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8107 tgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 416
Target Start/End: Original strand, 192921 - 193070
Alignment:
Q  269 tgattatgatgtgatataatgttttg-tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||    
T  192921 tgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 193019  T
Q  368 tttgt-atactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtc 416  Q
     |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  193020 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgtt-attaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 569
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38339
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt-attaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 103674 - 103737
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  103674 ttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 6327 - 6386
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6327 ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 424
Target Start/End: Original strand, 13812 - 13840
Alignment:
Q  396 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13340
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctg 56  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13289 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcctg 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2753 - 2694
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2753 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3318
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  3372 ctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaa 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 43465 - 43519
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  43465 ctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaa 43519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 47385 - 47439
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  47385 ctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaa 47439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 416
Target Start/End: Original strand, 16299 - 16442
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| |  || ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  16299 tatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttg 16396  T
Q  372 t-atactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16397 tgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  325 agatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  423 agttga 428  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97024
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106302
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 439
Target Start/End: Original strand, 4754 - 4921
Alignment:
Q  273 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || || ||||||||| | |||| |||||| |||    
T  4754 tatgatgtgatataacgttatgtatattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttg 4852  T
Q  372 tatactgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |   ||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  4853 tgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17521
Alignment:
Q  374 tactgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17572 tactgcctaagttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 17521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 10583 - 10544
Alignment:
Q  6 tgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatga 45  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10583 tgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225465
Alignment:
Q  272 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaagtgatattattatgtcatgctgtttttg 371  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg-ttttg 225481  T
Q  372 tatactgcctatgttg 387  Q
     |||||| ||||||||    
T  225480 catactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12435 - 12381
Alignment:
Q  5 ctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 59  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  12435 ctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaa 12381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 420
Target Start/End: Original strand, 813 - 858
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  813 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 57885 - 57837
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  57885 ctgcctatgttgctgatgtatattaa-taagctgcatgagtcggtctaag 57837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1005 - 957
Alignment:
Q  377 tgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1005 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaag 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1962 - 1914
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgt-tattaactaagctgcatgagtcggtctaa 423  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1962 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcgttctaa 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 439
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  376 ctgcctatgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 3287 - 3339
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3287 ttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2189 - 2137
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  2189 ttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 2137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9871 - 9819
Alignment:
Q  78 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 130  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  9871 ttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 9819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 267738 - 267679
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgcctatgttgctgttg--ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267738 ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 946 times since January 2019
Visitors: 2241