View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0160_low_10 (Length: 261)

Name: NF0160_low_10
Description: NF0160
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0160_low_10
NF0160_low_10
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (11-235)||(15388178-15388402)
chr4 (11-235)||(14760106-14760330)
chr4 (11-235)||(14668261-14668485)
chr4 (11-235)||(5009120-5009344)
chr4 (11-235)||(6573103-6573327)
chr4 (11-235)||(17016291-17016515)
chr4 (11-235)||(34185760-34185984)
chr4 (11-235)||(18313978-18314202)
chr4 (11-235)||(24589161-24589385)
chr4 (11-235)||(54836636-54836860)
chr4 (11-235)||(14101788-14102012)
chr4 (15-235)||(20335221-20335441)
chr4 (11-235)||(24115907-24116131)
chr4 (22-235)||(39853893-39854106)
chr4 (11-235)||(15231117-15231341)
chr4 (11-235)||(27160117-27160341)
chr4 (11-235)||(36341317-36341541)
chr4 (12-235)||(1903500-1903723)
chr4 (22-235)||(18797414-18797627)
chr4 (11-235)||(33670600-33670824)
chr4 (13-235)||(15281737-15281959)
chr4 (11-235)||(21972946-21973170)
chr4 (11-235)||(30757005-30757229)
chr4 (11-235)||(31123312-31123536)
chr4 (11-235)||(40102437-40102661)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-235)||(27394793-27395017)
chr2 (11-235)||(23125357-23125581)
chr2 (11-235)||(12658767-12658991)
chr2 (11-235)||(34294385-34294609)
chr2 (11-235)||(37948651-37948875)
chr2 (13-235)||(27431230-27431452)
chr2 (22-235)||(27806945-27807158)
chr2 (11-228)||(28885438-28885655)
chr2 (11-235)||(20841144-20841368)
chr2 (11-235)||(39048608-39048832)
chr2 (22-235)||(13933336-13933549)
chr2 (11-235)||(11631973-11632197)
chr2 (22-235)||(257442-257655)
chr2 (22-235)||(12590050-12590263)
chr2 (11-235)||(39893300-39893524)
chr2 (11-235)||(40236739-40236963)
chr2 (13-235)||(19453212-19453434)
chr2 (11-235)||(16826127-16826351)
chr2 (11-235)||(16895129-16895353)
chr2 (11-235)||(19413290-19413514)
chr2 (11-235)||(31879517-31879741)
chr2 (11-235)||(32053034-32053258)
chr2 (11-235)||(34864915-34865139)
chr2 (11-235)||(37380908-37381132)
chr2 (11-235)||(37682684-37682908)
chr2 (11-235)||(37697949-37698173)
chr2 (11-235)||(37928600-37928824)
chr2 (22-235)||(9346775-9346988)
chr2 (22-235)||(21673964-21674177)
chr2 (11-235)||(12713390-12713614)
chr2 (32-235)||(21699960-21700163)
chr2 (121-230)||(31890285-31890394)
chr2 (121-230)||(3785834-3785943)
chr2 (121-230)||(16164821-16164930)
chr2 (121-230)||(22924942-22925051)
chr2 (121-230)||(27119865-27119974)
chr2 (121-230)||(27779575-27779684)
chr2 (121-230)||(27819332-27819441)
chr2 (121-224)||(34158185-34158288)
chr2 (161-235)||(27827841-27827915)
chr2 (52-114)||(12383932-12383994)
chr2 (52-114)||(22949665-22949727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (11-235)||(22077672-22077896)
chr8 (11-235)||(27605666-27605890)
chr8 (11-235)||(18793935-18794159)
chr8 (11-235)||(14560855-14561079)
chr8 (11-235)||(2134021-2134245)
chr8 (11-235)||(19691329-19691553)
chr8 (22-235)||(19205123-19205336)
chr8 (11-235)||(9357856-9358080)
chr8 (11-235)||(29832557-29832781)
chr8 (22-235)||(28358713-28358926)
chr8 (11-235)||(19677678-19677902)
chr8 (11-235)||(33261965-33262189)
chr8 (11-235)||(18712715-18712939)
chr8 (11-235)||(12089484-12089708)
chr8 (11-235)||(31357759-31357983)
chr8 (11-235)||(31486632-31486856)
chr8 (121-230)||(15770915-15771024)
chr8 (121-230)||(44564325-44564434)
chr8 (137-224)||(21344943-21345030)
chr8 (11-72)||(16286632-16286694)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (11-235)||(27287107-27287331)
chr6 (11-235)||(27022365-27022589)
chr6 (11-235)||(29552786-29553010)
chr6 (11-235)||(13295694-13295918)
chr6 (11-235)||(15421063-15421287)
chr6 (11-235)||(22931627-22931851)
chr6 (11-235)||(23854072-23854296)
chr6 (11-235)||(24866945-24867169)
chr6 (15-235)||(27626454-27626674)
chr6 (11-235)||(16677369-16677593)
chr6 (11-235)||(27179685-27179909)
chr6 (11-235)||(27269330-27269554)
chr6 (11-235)||(3699312-3699536)
chr6 (11-235)||(4760992-4761216)
chr6 (15-235)||(17089186-17089406)
chr6 (11-235)||(27010960-27011184)
chr6 (11-235)||(34461249-34461473)
chr6 (11-224)||(26921606-26921819)
chr6 (11-224)||(16753050-16753263)
chr6 (11-235)||(27060735-27060959)
chr6 (11-235)||(4528514-4528738)
chr6 (11-235)||(4542517-4542741)
chr6 (11-235)||(4720878-4721102)
chr6 (11-235)||(27488362-27488586)
chr6 (11-235)||(29504645-29504869)
chr6 (11-235)||(29576243-29576467)
chr6 (11-235)||(30554759-30554983)
chr6 (32-235)||(20171797-20172000)
chr6 (32-235)||(22163991-22164194)
chr6 (11-235)||(16940770-16940994)
chr6 (11-235)||(26113155-26113379)
chr6 (11-235)||(28210683-28210907)
chr6 (11-235)||(4776109-4776333)
chr6 (121-235)||(22455857-22455971)
chr6 (83-235)||(26992096-26992248)
chr6 (121-235)||(26775370-26775484)
chr6 (121-235)||(27358853-27358967)
chr6 (121-235)||(27449196-27449310)
chr6 (121-230)||(14142142-14142251)
chr6 (121-230)||(26789155-26789264)
chr6 (121-230)||(27197524-27197633)
chr6 (121-230)||(27251602-27251711)
chr6 (127-230)||(8902451-8902554)
chr6 (110-235)||(33373174-33373299)
chr6 (127-235)||(28163836-28163944)
chr6 (121-230)||(13520940-13521048)
chr6 (52-114)||(9136217-9136279)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (11-235)||(5593200-5593424)
chr3 (11-235)||(18054455-18054679)
chr3 (11-235)||(18273895-18274119)
chr3 (11-235)||(18289196-18289420)
chr3 (11-235)||(18304497-18304721)
chr3 (12-235)||(4793478-4793701)
chr3 (13-235)||(8286313-8286535)
chr3 (6-235)||(18333818-18334047)
chr3 (11-235)||(6205096-6205320)
chr3 (11-235)||(8299164-8299388)
chr3 (11-235)||(21677896-21678120)
chr3 (6-235)||(35883954-35884183)
chr3 (11-235)||(4686848-4687072)
chr3 (11-235)||(4724824-4725048)
chr3 (11-235)||(15737937-15738161)
chr3 (11-235)||(15889548-15889772)
chr3 (11-235)||(22384421-22384645)
chr3 (11-235)||(29145599-29145823)
chr3 (11-235)||(29661813-29662037)
chr3 (22-235)||(32442355-32442568)
chr3 (11-235)||(8214928-8215152)
chr3 (11-235)||(20069233-20069457)
chr3 (22-235)||(20573686-20573899)
chr3 (11-235)||(7076399-7076623)
chr3 (11-235)||(28024475-28024699)
chr3 (11-235)||(28112797-28113021)
chr3 (11-235)||(47026646-47026870)
chr3 (11-235)||(48469120-48469344)
chr3 (11-235)||(5606157-5606381)
chr3 (11-235)||(10399337-10399561)
chr3 (11-235)||(28342370-28342594)
chr3 (11-204)||(11107226-11107419)
chr3 (22-235)||(18245945-18246158)
chr3 (11-235)||(4343519-4343743)
chr3 (11-235)||(4420108-4420332)
chr3 (11-235)||(5016907-5017131)
chr3 (11-235)||(5470181-5470405)
chr3 (11-235)||(6539585-6539809)
chr3 (11-235)||(7999753-7999977)
chr3 (11-235)||(10646266-10646490)
chr3 (11-235)||(17981792-17982016)
chr3 (11-235)||(18228389-18228613)
chr3 (11-235)||(22867691-22867915)
chr3 (11-235)||(22882750-22882974)
chr3 (13-235)||(16621333-16621555)
chr3 (11-235)||(24331356-24331580)
chr3 (11-235)||(31961298-31961522)
chr3 (11-235)||(51785216-51785440)
chr3 (15-235)||(19697687-19697907)
chr3 (121-230)||(17992779-17992888)
chr3 (121-235)||(4627088-4627202)
chr3 (121-230)||(32293931-32294040)
chr3 (121-235)||(5714376-5714490)
chr3 (121-235)||(5725286-5725400)
chr3 (121-235)||(5766968-5767082)
chr3 (121-230)||(31033084-31033193)
chr3 (52-114)||(15592875-15592937)
chr3 (52-176)||(15918751-15918875)
chr3 (148-235)||(6963276-6963363)
chr3 (52-114)||(5950766-5950828)
chr3 (52-108)||(20443351-20443407)
chr3 (52-108)||(41440477-41440533)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (11-235)||(10913554-10913778)
chr7 (22-235)||(26516032-26516245)
chr7 (11-235)||(2157803-2158027)
chr7 (11-235)||(26534558-26534782)
chr7 (11-235)||(2106848-2107072)
chr7 (11-235)||(11421464-11421688)
chr7 (11-235)||(26271771-26271995)
chr7 (11-235)||(26438486-26438710)
chr7 (11-235)||(45390449-45390673)
chr7 (13-235)||(16515115-16515337)
chr7 (11-235)||(5131225-5131449)
chr7 (11-235)||(5144025-5144249)
chr7 (11-235)||(22145424-22145648)
chr7 (11-235)||(26316533-26316757)
chr7 (13-235)||(10844851-10845073)
chr7 (13-221)||(16044550-16044758)
chr7 (13-235)||(10842679-10842901)
chr7 (22-235)||(31561075-31561288)
chr7 (11-235)||(3448535-3448759)
chr7 (11-235)||(4141931-4142155)
chr7 (11-235)||(4202618-4202842)
chr7 (11-235)||(11444116-11444340)
chr7 (11-235)||(24589219-24589443)
chr7 (22-235)||(16748202-16748415)
chr7 (11-235)||(26666599-26666823)
chr7 (32-235)||(16446691-16446894)
chr7 (11-158)||(9621879-9622026)
chr7 (121-230)||(2776593-2776702)
chr7 (121-230)||(26512386-26512495)
chr7 (121-230)||(26681796-26681905)
chr7 (121-230)||(31127246-31127355)
chr7 (121-230)||(39209829-39209938)
chr7 (127-230)||(45734658-45734761)
chr7 (121-230)||(31087312-31087421)
chr7 (52-114)||(9469590-9469652)
chr7 (52-114)||(16393240-16393302)
chr7 (52-114)||(30369752-30369814)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (11-235)||(15655455-15655679)
chr5 (11-235)||(41677944-41678168)
chr5 (11-235)||(11552594-11552818)
chr5 (11-235)||(24973145-24973369)
chr5 (11-235)||(33295767-33295991)
chr5 (11-235)||(33780728-33780952)
chr5 (11-235)||(22995814-22996038)
chr5 (11-235)||(23629209-23629433)
chr5 (11-235)||(24684842-24685066)
chr5 (22-235)||(40470247-40470460)
chr5 (11-235)||(18372231-18372455)
chr5 (11-235)||(31434703-31434927)
chr5 (11-235)||(37355340-37355564)
chr5 (13-235)||(23895447-23895669)
chr5 (11-235)||(3792780-3793004)
chr5 (11-235)||(9320715-9320939)
chr5 (11-235)||(12135414-12135638)
chr5 (11-235)||(26483633-26483857)
chr5 (11-235)||(34619757-34619981)
chr5 (11-230)||(43081494-43081713)
chr5 (11-235)||(13321527-13321751)
chr5 (11-235)||(18497422-18497646)
chr5 (11-235)||(28652481-28652705)
chr5 (11-235)||(32592971-32593195)
chr5 (11-235)||(37767688-37767912)
chr5 (11-235)||(5641027-5641251)
chr5 (11-235)||(6877544-6877768)
chr5 (11-235)||(8662172-8662396)
chr5 (11-235)||(24586613-24586837)
chr5 (11-235)||(28956482-28956706)
chr5 (11-235)||(30032667-30032891)
chr5 (11-235)||(30155270-30155494)
chr5 (11-235)||(30171708-30171932)
chr5 (11-235)||(30937874-30938098)
chr5 (11-235)||(31823104-31823328)
chr5 (11-235)||(33519619-33519843)
chr5 (11-235)||(37668183-37668407)
chr5 (11-235)||(37758222-37758446)
chr5 (16-235)||(22891707-22891926)
chr5 (13-235)||(25203519-25203741)
chr5 (13-235)||(25267674-25267896)
chr5 (22-235)||(15755549-15755762)
chr5 (11-235)||(2514301-2514525)
chr5 (11-235)||(24727208-24727432)
chr5 (110-235)||(13183490-13183615)
chr5 (118-235)||(13439380-13439497)
chr5 (121-235)||(18125113-18125227)
chr5 (121-230)||(9547411-9547520)
chr5 (121-230)||(11326986-11327095)
chr5 (121-230)||(29887899-29888008)
chr5 (121-230)||(33878480-33878588)
chr5 (148-235)||(351912-351999)
chr5 (52-114)||(5440043-5440105)
chr5 (52-114)||(11944240-11944302)
chr5 (52-114)||(15784543-15784605)
chr5 (52-114)||(17957376-17957438)
chr5 (52-114)||(36375780-36375842)
chr5 (52-114)||(37000434-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-235)||(3301-3523)
scaffold0089 (11-149)||(43877-44015)
scaffold0089 (13-84)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-235)||(9268-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (11-235)||(30525-30749)
scaffold0143 (13-235)||(19304-19526)
scaffold0143 (121-235)||(7302-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (22-235)||(21894549-21894762)
chr1 (11-235)||(51641452-51641676)
chr1 (16-235)||(20339101-20339320)
chr1 (22-235)||(10965910-10966123)
chr1 (11-235)||(3644366-3644593)
chr1 (11-235)||(28588219-28588443)
chr1 (22-235)||(41790110-41790323)
chr1 (11-235)||(10948311-10948535)
chr1 (14-235)||(16204834-16205055)
chr1 (13-221)||(20464212-20464420)
chr1 (121-230)||(28153080-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-235)||(15813-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (16-235)||(1424-1643)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-235)||(12803-13027)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-235)||(22991-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-235)||(9254-9478)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-235)||(11728-11952)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-235)||(5979-6203)
scaffold0159 (11-83)||(23111-23183)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-235)||(11181-11405)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-235)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (13-235)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (11-119)||(1155-1263)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (21-224)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (52-114)||(35161-35223)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (52-139)||(29443-29530)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (25-86)||(33706-33770)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15388402 - 15388178
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388402 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 15388303  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15388302 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 15388203  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  15388202 gtggaaggaaggcccttgattatgt 15388178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14760330 - 14760106
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  14760330 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 14760231  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  14760230 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14760131  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14760130 gtggaaggaaggcctttgattatgt 14760106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 14668261 - 14668485
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  14668261 cacagaccgagaagcaagtcagagatttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 14668360  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  14668361 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14668460  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14668461 gtggaaggaaggcctttgattatgt 14668485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5009120 - 5009344
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  5009120 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5009219  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5009220 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5009319  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5009320 gtggaaggaaggcctttgattatgt 5009344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 6573103 - 6573327
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  6573103 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6573202  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  6573203 acttagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6573302  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6573303 gtggaaggaaggcctttgattatgt 6573327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 17016291 - 17016515
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  17016291 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 17016390  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  17016391 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 17016490  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17016491 gtggaaggaaggcctttgattatgt 17016515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34185984 - 34185760
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  |    
T  34185984 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagct 34185885  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  34185884 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34185785  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34185784 gtggaaggaaggcctttgattatgt 34185760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18314202 - 18313978
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  18314202 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18314103  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18314102 actgagcaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18314003  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18314002 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18313978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24589385 - 24589161
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  24589385 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24589286  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||  ||     
T  24589285 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 24589186  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24589185 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 54836636 - 54836860
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  54836636 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 54836735  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  54836736 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 54836835  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  54836836 gtggaaggaaggcctttgattatgt 54836860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 14101788 - 14102012
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  14101788 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 14101887  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  14101888 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14101987  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14101988 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 14102012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20335441 - 20335221
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||    
T  20335441 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 20335342  T
Q  115 agaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgg 214  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || || |    
T  20335341 agaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtag 20335242  T
Q  215 aaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  20335241 aaggaaggcctttgattatgt 20335221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24115907 - 24116131
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  24115907 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24116006  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||     
T  24116007 actcagaaagaatcagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcccaccc 24116106  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24116107 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24116131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 39853893 - 39854106
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  | || ||||| |    
T  39853893 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccacaacctgcgggcctatcttcaagctgcttagaaaga 39853992  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  39853993 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaag 39854092  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  39854093 gcctttgattatgt 39854106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 15231117 - 15231341
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  15231117 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15231216  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  15231217 actcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15231316  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15231317 gtggaaggaagacctttgattatgt 15231341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27160341 - 27160117
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  27160341 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27160242  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27160241 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27160142  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27160141 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27160117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36341541 - 36341317
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  36341541 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 36341442  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  36341441 actcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaaagccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 36341342  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  36341341 gtggaaggaaggcctttgattatgt 36341317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 1903500 - 1903723
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatta 111  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||    
T  1903500 acagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcagcctgcgggccgatcttcaagtta 1903599  T
Q  112 ctcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccag 211  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |    
T  1903600 ctcaggaagaatcagcctattgtatggaacgttgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 1903699  T
Q  212 tggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1903700 tggaaggaaggcctttgattatgt 1903723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18797627 - 18797414
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | || ||||| |    
T  18797627 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctgcttagaaaga 18797528  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18797527 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaagtacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 18797428  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  18797427 gccgttgatcatgt 18797414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33670824 - 33670600
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  33670824 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33670725  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  33670724 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33670625  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33670624 gtggaaggaaggcctttgattatgt 33670600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15281959 - 15281737
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  15281959 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 15281860  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  15281859 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagatttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 15281760  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  15281759 ggaaggaaggcctttgattatgt 15281737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21972946 - 21973170
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  21972946 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 21973045  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  21973046 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 21973145  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21973146 gtggaaggaaggcctttgattatgt 21973170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30757005 - 30757229
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  30757005 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30757104  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30757105 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30757204  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30757205 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30757229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31123536 - 31123312
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  31123536 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31123437  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  31123436 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31123337  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31123336 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31123312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40102661 - 40102437
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  40102661 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 40102562  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  40102561 actaaggaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 40102462  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  40102461 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 40102437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27394793 - 27395017
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394793 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 27394892  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27394893 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 27394992  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  27394993 gtggaaggaaggcccttgattatgt 27395017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23125581 - 23125357
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  23125581 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 23125482  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||     
T  23125481 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtgccaccc 23125382  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23125381 gtggaaggaaggcctttgattatgt 23125357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 12658767 - 12658991
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  12658767 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12658866  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  12658867 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12658966  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12658967 gtggaaggaaggcctttgattatgt 12658991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 34294385 - 34294609
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  34294385 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34294484  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  34294485 actcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34294584  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34294585 gtggaaggaaggcctttgattatgt 34294609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37948875 - 37948651
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  37948875 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 37948776  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37948775 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37948676  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37948675 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 37948651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27431452 - 27431230
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  27431452 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 27431353  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  27431352 tcagaaagaattagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 27431253  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  27431252 ggaaggaaggcctttgattatgt 27431230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 27806945 - 27807158
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |    
T  27806945 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaaaga 27807044  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  27807045 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 27807144  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  27807145 gcctttgatcatgt 27807158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 28885438 - 28885655
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  |    
T  28885438 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccggtcttcaagct 28885537  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  28885538 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28885637  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttg 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28885638 gtggaaggaaggcccttg 28885655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20841144 - 20841368
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  20841144 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 20841243  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  20841244 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccaccc 20841343  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||    
T  20841344 atggaaggaaggcctttgattatgt 20841368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39048832 - 39048608
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  39048832 cacagactgagaagcaagtaagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 39048733  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  39048732 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 39048633  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39048632 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 39048608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13933549 - 13933336
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| || || |    
T  13933549 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaaggaaga 13933450  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13933449 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 13933350  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  13933349 gcctttgattatgt 13933336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11632197 - 11631973
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  11632197 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11632098  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11632097 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11631998  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11631997 gtggaaggaaggcctttgattatgt 11631973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 257655 - 257442
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  | || ||||| |    
T  257655 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagctgcttagaaaga 257556  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  257555 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 257456  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  257455 gccgttgatcatgt 257442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 12590050 - 12590263
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |    
T  12590050 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 12590149  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  12590150 accagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 12590249  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  12590250 gcctttgatcatgt 12590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 39893300 - 39893524
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  39893300 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 39893399  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  39893400 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 39893499  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39893500 gtggaaggaaggcctttgattatgt 39893524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 40236739 - 40236963
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  40236739 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 40236838  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  40236839 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagctttcgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 40236938  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  40236939 gtggaaggaaggcctttgattatgt 40236963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19453434 - 19453212
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  19453434 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19453335  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  19453334 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatggcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19453235  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  19453234 ggaaggaaggcctttgattatgt 19453212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16826351 - 16826127
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  16826351 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16826252  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  16826251 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16826152  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16826151 gtggaaggaaggcctttgattatgt 16826127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 16895129 - 16895353
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  16895129 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16895228  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  16895229 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16895328  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16895329 gtggaaggaaggcctttgattatgt 16895353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19413514 - 19413290
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  19413514 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19413415  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  19413414 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19413315  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19413314 gtggaaggaaggcctttgattatgt 19413290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31879517 - 31879741
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  31879517 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 31879616  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  31879617 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31879716  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31879717 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31879741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 32053034 - 32053258
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  32053034 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 32053133  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  32053134 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 32053233  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32053234 gtggaaggaaggcctttgattatgt 32053258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 34864915 - 34865139
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  34864915 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34865014  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  34865015 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 34865114  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34865115 gtggaaggaaggcctttgattatgt 34865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 37380908 - 37381132
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  37380908 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacacttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37381007  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37381008 actcaggaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37381107  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37381108 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 37381132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37682908 - 37682684
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  37682908 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37682809  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37682808 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37682709  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37682708 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37682684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37698173 - 37697949
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  37698173 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37698074  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37698073 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37697974  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37697973 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37697949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 37928600 - 37928824
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  37928600 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37928699  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37928700 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37928799  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37928800 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37928824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9346988 - 9346775
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |    
T  9346988 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 9346889  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  9346888 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 9346789  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  9346788 gcctttgattatgt 9346775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21674177 - 21673964
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |    
T  21674177 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 21674078  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  21674077 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 21673978  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  21673977 gcctttgattatgt 21673964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12713614 - 12713390
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  12713614 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12713515  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  12713514 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 12713415  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12713414 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 12713390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21700163 - 21699960
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctat 131  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  21700163 gaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcaggaagaatcagcctat 21700064  T
Q  132 tgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    ||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||     
T  21700063 tgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccaccaatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgatt 21699964  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  21699963 atgt 21699960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31890394 - 31890285
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  31890394 aatcagcctattgtatggaacaatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31890295  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  31890294 ggcctttgat 31890285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 3785834 - 3785943
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  3785834 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattaactgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 3785933  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  3785934 ggcctttgat 3785943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 16164821 - 16164930
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  16164821 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 16164920  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  16164921 ggcctttgat 16164930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22925051 - 22924942
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22925051 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 22924952  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    | || |||||    
T  22924951 gacctttgat 22924942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 27119865 - 27119974
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27119865 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27119964  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  27119965 ggcctttgat 27119974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 27779575 - 27779684
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27779575 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27779674  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  27779675 ggcctttgat 27779684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 27819332 - 27819441
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27819332 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27819431  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  27819432 ggcctttgat 27819441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Original strand, 34158185 - 34158288
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  34158185 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 34158284  T
Q  221 ggcc 224  Q
    ||||    
T  34158285 ggcc 34158288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Original strand, 27827841 - 27827915
Alignment:
Q  161 ttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27827841 ttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 27827915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 12383932 - 12383994
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  12383932 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 12383994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 22949665 - 22949727
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  22949665 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 22949727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22077896 - 22077672
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077896 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctgatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 22077797  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22077796 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 22077697  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  22077696 gtggaaggaaggcccttgattatgt 22077672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27605890 - 27605666
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  27605890 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27605791  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27605790 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27605691  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27605690 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27605666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18793935 - 18794159
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  18793935 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18794034  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18794035 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18794134  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18794135 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18794159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 14560855 - 14561079
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  14560855 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 14560954  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  14560955 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14561054  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14561055 gtggaaggaaggcctttgattatgt 14561079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2134245 - 2134021
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  2134245 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 2134146  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  2134145 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccaccc 2134046  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2134045 gtggaaggaaggcctttgattatgt 2134021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19691329 - 19691553
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  19691329 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19691428  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  19691429 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19691528  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||    
T  19691529 gcggaaggaaggcctttgattatgt 19691553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19205336 - 19205123
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| || |    
T  19205336 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagctactcaggaaga 19205237  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19205236 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 19205137  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  19205136 gcctttgattatgt 19205123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9357856 - 9358080
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  9357856 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 9357955  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  9357956 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9358055  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9358056 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 9358080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 29832557 - 29832781
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  29832557 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29832656  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  29832657 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29832756  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29832757 gtggaaggaaggcctttgattatgt 29832781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28358926 - 28358713
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |    
T  28358926 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 28358827  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||   | | |||||||||    
T  28358826 atcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccatccgcggaaggaag 28358727  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  28358726 gcctttgattatgt 28358713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19677678 - 19677902
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  19677678 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19677777  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  19677778 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19677877  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19677878 gtggaaggaaggcctttgattatgt 19677902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 33261965 - 33262189
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  33261965 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 33262064  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  33262065 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 33262164  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33262165 gtggaaggaaggcctttgattatgt 33262189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18712715 - 18712939
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||  |    
T  18712715 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagct 18712814  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18712815 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18712914  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18712915 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18712939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12089708 - 12089484
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  12089708 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12089609  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  12089608 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12089509  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12089508 gtggaaggaaggcctttgattatgt 12089484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31357759 - 31357983
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  31357759 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31357858  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| | ||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  31357859 acttaaaaagaaccaccctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31357958  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31357959 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31357983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31486856 - 31486632
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  31486856 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 31486757  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  31486756 gcttagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 31486657  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31486656 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 31486632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 15770915 - 15771024
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15770915 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 15771014  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  15771015 ggcctttgat 15771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 44564325 - 44564434
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  44564325 aatcagcctattgtatagaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 44564424  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  44564425 ggcctttgat 44564434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21345030 - 21344943
Alignment:
Q  137 ggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21345030 ggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcc 21344943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 16286632 - 16286694
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcg-ggcgttttaattacatctcccgattcata 72  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||    
T  16286632 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgagacgattgaattacatctcccgattcata 16286694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27287331 - 27287107
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  27287331 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 27287232  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||     
T  27287231 actcagaaataatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacct 27287132  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27287131 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27287107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27022365 - 27022589
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  27022365 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgatttatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27022464  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27022465 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27022564  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27022565 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27022589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 29552786 - 29553010
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  29552786 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29552885  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  29552886 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29552985  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29552986 gtggaaggaaggcctttgattatgt 29553010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13295918 - 13295694
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  13295918 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 13295819  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  13295818 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgctaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 13295719  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13295718 gtggaaggaaggcctttgattatgt 13295694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15421287 - 15421063
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  15421287 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15421188  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  15421187 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15421088  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15421087 gtggaaggaaggcctttgattatgt 15421063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22931851 - 22931627
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  22931851 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22931752  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||     
T  22931751 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccaccc 22931652  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22931651 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22931627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23854296 - 23854072
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  23854296 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 23854197  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||     
T  23854196 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccaccc 23854097  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23854096 gtggaaggaaggcctttgattatgt 23854072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24866945 - 24867169
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |    
T  24866945 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 24867044  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  24867045 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24867144  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24867145 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24867169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27626674 - 27626454
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||    
T  27626674 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 27626575  T
Q  115 agaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgg 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||  || ||||    
T  27626574 agaaagaatcagcctattgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccacccgtgg 27626475  T
Q  215 aaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  27626474 aaggaaggcctttgattatgt 27626454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 16677369 - 16677593
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |    
T  16677369 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaatctgcgggccgatcttcaagct 16677468  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  16677469 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16677568  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16677569 gtggaaggaaggcctttgattatgt 16677593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27179685 - 27179909
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  27179685 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27179784  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||     
T  27179785 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 27179884  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27179885 gtggacggaaggcctttgattatgt 27179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27269554 - 27269330
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  27269554 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27269455  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||     
T  27269454 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 27269355  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27269354 gtggacggaaggcctttgattatgt 27269330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 3699312 - 3699536
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  3699312 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3699411  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  |      
T  3699412 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacgt 3699511  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3699512 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 3699536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4760992 - 4761216
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  4760992 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 4761091  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4761092 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4761191  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4761192 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4761216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17089406 - 17089186
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||    
T  17089406 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgctacctgcgggccaatcttcaagctactc 17089307  T
Q  115 agaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgg 214  Q
    || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||  || ||||    
T  17089306 aggaagaatcagcctattgtgtggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgg 17089207  T
Q  215 aaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  17089206 aaggaaggcctttgattatgt 17089186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27010960 - 27011184
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  27010960 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 27011059  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27011060 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27011159  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27011160 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27011184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34461473 - 34461249
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  34461473 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34461374  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  34461373 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34461274  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34461273 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 34461249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 26921606 - 26921819
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  26921606 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26921705  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||| ||||||  ||     
T  26921706 actcagaaagaatcagcctgttgtttggaataatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatctttgtcccaccc 26921805  T
Q  211 gtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||||||||||||    
T  26921806 gtggaaggaaggcc 26921819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 16753050 - 16753263
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  16753050 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16753149  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||  ||     
T  16753150 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccaccc 16753249  T
Q  211 gtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||||||||||||    
T  16753250 gtggaaggaaggcc 16753263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27060735 - 27060959
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  27060735 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27060834  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27060835 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27060934  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27060935 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27060959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4528514 - 4528738
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  4528514 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaact 4528613  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4528614 acttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4528713  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4528714 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4528738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4542741 - 4542517
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  4542741 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagct 4542642  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4542641 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4542542  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4542541 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4721102 - 4720878
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  4721102 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagct 4721003  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4721002 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4720903  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4720902 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4720878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 27488362 - 27488586
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  27488362 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27488461  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  27488462 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27488561  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27488562 gtggaaggaaggcctttgattatgt 27488586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 29504645 - 29504869
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  29504645 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29504744  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  29504745 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29504844  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29504845 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 29504869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 29576243 - 29576467
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  29576243 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29576342  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  29576343 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 29576442  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29576443 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 29576467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30554983 - 30554759
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  30554983 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30554884  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30554883 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30554784  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30554783 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30554759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 20171797 - 20172000
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctat 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||    
T  20171797 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcaggaagaatcaacccat 20171896  T
Q  132 tgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||     
T  20171897 tgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccatggaaggaaggcctttgatt 20171996  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  20171997 atgt 20172000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22164194 - 22163991
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctat 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||    
T  22164194 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcaggaagaatcaacccat 22164095  T
Q  132 tgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||     
T  22164094 tgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccatggaaggaaggcctttgatt 22163995  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  22163994 atgt 22163991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16940994 - 16940770
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  16940994 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16940895  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  16940894 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16940795  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16940794 gtggaaggaagacctttgattatgt 16940770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26113379 - 26113155
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  26113379 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26113280  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  26113279 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26113180  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26113179 gtggaaggaaggcctttgattatgt 26113155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28210683 - 28210907
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  28210683 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28210782  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  28210783 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28210882  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28210883 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28210907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4776109 - 4776333
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||  |    
T  4776109 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgtgggccgatcttcaagct 4776208  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||  ||     
T  4776209 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctccc 4776308  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4776309 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4776333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22455971 - 22455857
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  22455971 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtcccacccgtggaaggaa 22455872  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  22455871 ggcctttgattatgt 22455857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 26992096 - 26992248
Alignment:
Q  83 ccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatct 182  Q
    |||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  26992096 ccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaagaatcagcctattctatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacct 26992195  T
Q  183 gttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26992196 gctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 26992248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26775484 - 26775370
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26775484 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 26775385  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  26775384 ggcctttgattatgt 26775370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27358967 - 27358853
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27358967 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27358868  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  27358867 ggcctttgattatgt 27358853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27449310 - 27449196
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27449310 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27449211  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  27449210 ggcctttgattatgt 27449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14142251 - 14142142
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14142251 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 14142152  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  14142151 ggcctttgat 14142142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 26789155 - 26789264
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26789155 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26789254  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  26789255 ggcctttgat 26789264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 27197524 - 27197633
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27197524 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27197623  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  27197624 ggcctttgat 27197633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27251711 - 27251602
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27251711 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27251612  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  27251611 ggcctttgat 27251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8902554 - 8902451
Alignment:
Q  127 cctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  8902554 cctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcatgaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaaggcctt 8902455  T
Q  227 tgat 230  Q
    ||||    
T  8902454 tgat 8902451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33373299 - 33373174
Alignment:
Q  110 tactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcc 209  Q
    |||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  33373299 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 33373200  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33373199 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33373174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 28163836 - 28163944
Alignment:
Q  127 cctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |    
T  28163836 cctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaagacctt 28163935  T
Q  227 tgatgatgt 235  Q
    |||| ||||    
T  28163936 tgattatgt 28163944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13521048 - 13520940
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  13521048 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgcc-ggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 13520950  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  13520949 ggcctttgat 13520940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9136279 - 9136217
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  9136279 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 9136217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5593424 - 5593200
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  5593424 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 5593325  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5593324 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5593225  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5593224 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 5593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18054455 - 18054679
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  18054455 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18054554  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18054555 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18054654  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18054655 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18054679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18274119 - 18273895
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  18274119 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18274020  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18274019 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18273920  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18273919 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18273895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18289420 - 18289196
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  18289420 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18289321  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18289320 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18289221  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18289220 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18289196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18304721 - 18304497
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  18304721 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18304622  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18304621 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18304522  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18304521 gtggaaggaaggcctttgattatgt 18304497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4793701 - 4793478
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  4793701 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagcta 4793602  T
Q  112 ctcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccag 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |    
T  4793601 ctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 4793502  T
Q  212 tggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  4793501 tggaaggaaggcctttgattatgt 4793478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8286535 - 8286313
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  8286535 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 8286436  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  8286435 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 8286336  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  8286335 ggaaggaaggcctttgattatgt 8286313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 18333818 - 18334047
Alignment:
Q  6 agcagcacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttc 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  18333818 agcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttc 18333917  T
Q  106 aaattactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcc 205  Q
    ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18333918 aagctactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcc 18334017  T
Q  206 tgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
      || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18334018 cacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 18334047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 6205096 - 6205320
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  6205096 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6205195  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||  ||     
T  6205196 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccaccc 6205295  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  6205296 gtggaaggaaggcccttgattatgt 6205320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 8299164 - 8299388
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  8299164 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8299263  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  8299264 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8299363  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8299364 gtggaaggaaggcctttgattatgt 8299388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21677896 - 21678120
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  21677896 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 21677995  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  21677996 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 21678095  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21678096 gtggaaggaaggcctttgattatgt 21678120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 35883954 - 35884183
Alignment:
Q  6 agcagcacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttc 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  35883954 agcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttc 35884053  T
Q  106 aaattactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcc 205  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35884054 aagctactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcc 35884153  T
Q  206 tgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
      || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35884154 cacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 35884183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4686848 - 4687072
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  4686848 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4686947  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| |  ||     
T  4686948 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccaccc 4687047  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  4687048 gtggaaggaaggcccttgattatgt 4687072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4724824 - 4725048
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  4724824 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4724923  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| |  ||     
T  4724924 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccaccc 4725023  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  4725024 gtggaaggaaggcccttgattatgt 4725048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15738161 - 15737937
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  15738161 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15738062  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  15738061 actcagaaagaatcagcctactgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15737962  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15737961 gtggaaggaaggcctttgattatgt 15737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15889772 - 15889548
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  15889772 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15889673  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  15889672 cctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15889573  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15889572 gtggaaggaaggcctttgattatgt 15889548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22384645 - 22384421
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  22384645 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22384546  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  22384545 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22384446  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22384445 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22384421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29145823 - 29145599
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  29145823 cacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29145724  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  29145723 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29145624  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29145623 gtggagggaaggcctttgattatgt 29145599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29662037 - 29661813
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  29662037 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29661938  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  29661937 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29661838  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29661837 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 29661813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 32442355 - 32442568
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |    
T  32442355 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 32442454  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    ||||  || |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32442455 atcagtctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgcccgtggaaggaag 32442554  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  32442555 gcctttgattatgt 32442568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 8214928 - 8215152
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  8214928 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8215027  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  8215028 gctcagaaaaaatcagcctgttgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8215127  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8215128 gtggaaggaaggcctttgattatgt 8215152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20069233 - 20069457
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  20069233 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 20069332  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||  ||     
T  20069333 actcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 20069432  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20069433 gtggaaggaaggcctttgattatgt 20069457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20573899 - 20573686
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| |    
T  20573899 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgattttcaagctgcttagaaaga 20573800  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20573799 accagcctattgtatggaatgaggaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 20573700  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  20573699 gcctttgatcatgt 20573686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 7076399 - 7076623
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  |    
T  7076399 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcgcatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagct 7076498  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  7076499 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 7076598  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7076599 gtggaaggaaggcctttgattatgt 7076623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28024475 - 28024699
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  28024475 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28024574  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28024575 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 28024674  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28024675 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28024699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28113021 - 28112797
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  28113021 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacagcaacctgcgggccgatcttcaagct 28112922  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  28112921 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28112822  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28112821 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 47026646 - 47026870
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |    
T  47026646 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagct 47026745  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  47026746 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 47026845  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  47026846 gtggaaggaaggcctttgattatgt 47026870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 48469120 - 48469344
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  48469120 cacagacagagaaacaagtcataggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 48469219  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  48469220 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 48469319  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  48469320 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 48469344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5606381 - 5606157
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  5606381 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5606282  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5606281 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5606182  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5606181 gtggaaggaaggcctttgattatgt 5606157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 10399337 - 10399561
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  10399337 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10399436  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||  ||     
T  10399437 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 10399536  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10399537 gtggaaggaaggcctttgattatgt 10399561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28342370 - 28342594
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |    
T  28342370 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccgatcttcaagct 28342469  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  28342470 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28342569  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28342570 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28342594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11107419 - 11107226
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  |    
T  11107419 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagct 11107320  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtc 204  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11107319 actcagaaagagtcagcctattgtatggaatgaagaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtc 11107226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 18245945 - 18246158
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |    
T  18245945 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaaaga 18246044  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18246045 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 18246144  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  18246145 gcctttgattatgt 18246158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4343743 - 4343519
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  4343743 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4343644  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4343643 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4343544  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4343543 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4343519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4420108 - 4420332
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  4420108 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4420207  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4420208 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 4420307  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4420308 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4420332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5016907 - 5017131
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  5016907 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 5017006  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5017007 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5017106  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5017107 gtggaaggaaggcctttgattatgt 5017131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5470181 - 5470405
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  5470181 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 5470280  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5470281 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 5470380  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5470381 gtggaaggaaggcctttgattatgt 5470405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6539809 - 6539585
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  6539809 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6539710  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  6539709 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6539610  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6539609 gtggaaggaaggcctttgattatgt 6539585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 7999753 - 7999977
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  7999753 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 7999852  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  7999853 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 7999952  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7999953 gtggaaggaaggcctttgattatgt 7999977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 10646266 - 10646490
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  10646266 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10646365  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  10646366 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 10646465  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10646466 gtggaaggaaggcctttgattatgt 10646490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17982016 - 17981792
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  17982016 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 17981917  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  17981916 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 17981817  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17981816 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 17981792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 18228389 - 18228613
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  18228389 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18228488  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18228489 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 18228588  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18228589 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 18228613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22867915 - 22867691
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  22867915 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22867816  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  22867815 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 22867716  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22867715 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22867691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22882974 - 22882750
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  22882974 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22882875  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  22882874 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 22882775  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22882774 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22882750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16621555 - 16621333
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  16621555 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 16621456  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| | ||||| |||||||||||||  || ||    
T  16621455 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaacctcctatccttgtcccacccgt 16621356  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  16621355 ggaaggaaggcctttgattatgt 16621333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24331356 - 24331580
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  24331356 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24331455  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  24331456 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaaaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24331555  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24331556 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24331580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31961522 - 31961298
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  31961522 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31961423  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||     
T  31961422 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtccctccc 31961323  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31961322 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 51785216 - 51785440
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  51785216 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 51785315  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  51785316 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 51785415  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51785416 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 51785440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 19697687 - 19697907
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||    
T  19697687 gaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccaattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 19697786  T
Q  115 agaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgg 214  Q
    |  || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  19697787 aagaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcgtcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgg 19697886  T
Q  215 aaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  19697887 aaggaaggcctttgattatgt 19697907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17992888 - 17992779
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  17992888 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 17992789  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  17992788 ggcctttgat 17992779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 4627088 - 4627202
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  4627088 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 4627187  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  4627188 ggcctttgattatgt 4627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 32293931 - 32294040
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  32293931 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 32294030  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  32294031 ggcctttgat 32294040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 5714376 - 5714490
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5714376 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5714475  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  5714476 ggcctttgatcatgt 5714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 5725286 - 5725400
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5725286 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5725385  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  5725386 ggcctttgatcatgt 5725400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5767082 - 5766968
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5767082 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5766983  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  5766982 ggcctttgatcatgt 5766968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31033193 - 31033084
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  31033193 aatcagcctattatatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31033094  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  31033093 ggcctttgat 31033084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15592937 - 15592875
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  15592937 aattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcaggccgatattcaaattactc 15592875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 176
Target Start/End: Original strand, 15918751 - 15918875
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||| | ||  | |||  |||||||||||   | || ||||    
T  15918751 aattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcggaccgatattcaaactactccgcaaagaacaagatattgtgtggacagaggattgcc 15918850  T
Q  152 aggaagcctttgatagcatcaaaga 176  Q
    || | || |||||||||||||||||    
T  15918851 agaaggcttttgatagcatcaaaga 15918875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6963363 - 6963276
Alignment:
Q  148 tgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  6963363 tgccagaaagcttttgatagcatcaaagggtatttgttagaacctccgattcttgtccctccagttgaaggaaggcctttgatcatgt 6963276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5950828 - 5950766
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  5950828 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 5950766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 20443351 - 20443407
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  20443351 aattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaaa 20443407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 41440477 - 41440533
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  41440477 aattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaaa 41440533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10913778 - 10913554
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  10913778 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10913679  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  10913678 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 10913579  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10913578 gtggaaggaaggcctttgattatgt 10913554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 26516032 - 26516245
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| || || |    
T  26516032 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaaggaaga 26516131  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  26516132 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 26516231  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  26516232 gcctttgatcatgt 26516245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 2157803 - 2158027
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  2157803 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2157902  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  2157903 actgaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 2158002  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2158003 gtggaaggaaggcctttgattatgt 2158027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26534782 - 26534558
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  26534782 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatttcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26534683  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  26534682 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26534583  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26534582 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 26534558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2107072 - 2106848
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  2107072 cacataccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2106973  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  2106972 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 2106873  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  2106872 gtggaaggaagacctttgattatgt 2106848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11421688 - 11421464
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  11421688 cacagaccgagaagcaagtcagagggttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11421589  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11421588 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11421489  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  11421488 gtggaaggaagacctttgattatgt 11421464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26271995 - 26271771
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  26271995 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26271896  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  26271895 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26271796  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26271795 gtggaaggaaggcctttgattatgt 26271771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 26438486 - 26438710
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  26438486 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 26438585  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||     
T  26438586 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 26438685  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26438686 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 26438710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 45390449 - 45390673
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  45390449 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaaact 45390548  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  45390549 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 45390648  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45390649 gtggaaggaaggcctttgattatgt 45390673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16515337 - 16515115
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||    
T  16515337 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggctgatcttcaagctac 16515238  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  16515237 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaatcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 16515138  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  16515137 ggaaggaaggcctttgattatgt 16515115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5131225 - 5131449
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  5131225 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5131324  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5131325 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5131424  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5131425 gtggaagggaggcctttgattatgt 5131449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5144249 - 5144025
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  5144249 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5144150  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  5144149 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5144050  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5144049 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 5144025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 22145424 - 22145648
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  22145424 cacagaccgagaaacaagttagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22145523  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  22145524 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22145623  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22145624 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 22145648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26316757 - 26316533
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  26316757 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 26316658  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  26316657 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26316558  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26316557 gtggaaggaaggcctttgattatgt 26316533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 10844851 - 10845073
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  10844851 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10844950  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||  || ||    
T  10844951 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgtaaccacctatccttgtcccacccgt 10845050  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  10845051 ggaaggaaggcctttgattatgt 10845073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 16044550 - 16044758
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16044550 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 16044649  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| || || ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16044650 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaggcttttaatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 16044749  T
Q  213 ggaaggaag 221  Q
    |||||||||    
T  16044750 ggaaggaag 16044758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10842901 - 10842679
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  10842901 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgcattacatctcccgatttatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10842802  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  10842801 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 10842702  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  10842701 ggaaggaaggcctttgattatgt 10842679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31561288 - 31561075
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |    
T  31561288 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaaaga 31561189  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  31561188 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 31561089  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  31561088 gcctttgattatgt 31561075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 3448535 - 3448759
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  3448535 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3448634  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  3448635 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 3448734  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3448735 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 3448759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4142155 - 4141931
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  4142155 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4142056  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4142055 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4141956  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4141955 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4141931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 4202618 - 4202842
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  4202618 cacagacagagaagcaagttagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 4202717  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| |  || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  4202718 actcagaaagagccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4202817  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4202818 gtggaaggaaggcctttgattatgt 4202842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 11444116 - 11444340
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  11444116 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11444215  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11444216 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11444315  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11444316 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 11444340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24589443 - 24589219
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  24589443 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24589344  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||     
T  24589343 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaatcacctatccttgtcccaccc 24589244  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24589243 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 24589219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16748415 - 16748202
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||| || |    
T  16748415 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagctactcaggaaga 16748316  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  16748315 atcaacctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaag 16748216  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  16748215 gcctttgattatgt 16748202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26666823 - 26666599
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  26666823 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26666724  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| | || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||     
T  26666723 acttagaaagaaccagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgttccaccc 26666624  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26666623 gtggaaggaaggcctttgattatgt 26666599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16446894 - 16446691
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctat 131  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| || |||||  ||||    
T  16446894 gaggtttcctcgggtgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcaggccgatcttcaagctactcaggaagaatcagactat 16446795  T
Q  132 tgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    ||| |||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||     
T  16446794 tgtatggaacgatgaatgccaaggggcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgatt 16446695  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  16446694 atgt 16446691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 9621879 - 9622026
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  9621879 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 9621978  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagc 158  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  9621979 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagc 9622026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 2776593 - 2776702
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  2776593 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 2776692  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  2776693 ggcctttgat 2776702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26512495 - 26512386
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26512495 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26512396  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  26512395 ggcctttgat 26512386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26681905 - 26681796
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  26681905 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26681806  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  26681805 ggcctttgat 26681796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 31127246 - 31127355
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  31127246 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31127345  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  31127346 ggcctttgat 31127355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39209938 - 39209829
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  39209938 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 39209839  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  39209838 ggcctttgat 39209829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 45734658 - 45734761
Alignment:
Q  127 cctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |    
T  45734658 cctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaagacctt 45734757  T
Q  227 tgat 230  Q
    ||||    
T  45734758 tgat 45734761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31087421 - 31087312
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||  || ||||||||||    
T  31087421 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31087322  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  31087321 ggcctttgat 31087312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 9469590 - 9469652
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  9469590 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 9469652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16393302 - 16393240
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  16393302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 16393240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30369814 - 30369752
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  30369814 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 30369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15655679 - 15655455
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  15655679 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15655580  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  15655579 actcagaaagaatcagcccattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgccc 15655480  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15655479 gtggaaggaaggcctttgattatgt 15655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 41677944 - 41678168
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  41677944 cacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 41678043  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  41678044 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 41678143  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41678144 gtggaaggaaggcctttgattatgt 41678168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 11552594 - 11552818
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  11552594 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11552693  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11552694 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11552793  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11552794 gtggaaggaaggcctttgattatgt 11552818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24973145 - 24973369
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  24973145 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24973244  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  24973245 acttagaaagaatcagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24973344  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24973345 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24973369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 33295767 - 33295991
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  33295767 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33295866  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  33295867 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33295966  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33295967 gtggaaggaaggcctttgattatgt 33295991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 33780728 - 33780952
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  33780728 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33780827  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||  ||     
T  33780828 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccaccc 33780927  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33780928 gtggaaggaaggcctttgattatgt 33780952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22996038 - 22995814
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  22996038 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22995939  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  22995938 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22995839  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22995838 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22995814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 23629209 - 23629433
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||  |    
T  23629209 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagct 23629308  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  23629309 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 23629408  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23629409 gtggaaggaaggcctttgattatgt 23629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24685066 - 24684842
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |    
T  24685066 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 24684967  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  24684966 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24684867  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24684866 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24684842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40470460 - 40470247
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |    
T  40470460 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaaaga 40470361  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||  || |||||||||||    
T  40470360 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccacccgtggaaggaag 40470261  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40470260 gcctttgattatgt 40470247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18372455 - 18372231
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  18372455 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 18372356  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18372355 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18372256  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18372255 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 18372231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31434703 - 31434927
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  31434703 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 31434802  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  31434803 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31434902  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31434903 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31434927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37355564 - 37355340
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  37355564 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 37355465  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37355464 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37355365  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37355364 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37355340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 23895447 - 23895669
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  23895447 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 23895546  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  23895547 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttatgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 23895646  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  23895647 ggaaggaaggcctttgattatgt 23895669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 3792780 - 3793004
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  3792780 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 3792879  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||  ||     
T  3792880 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccaccc 3792979  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3792980 gtggaaggaaggcctttgattatgt 3793004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9320715 - 9320939
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  9320715 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 9320814  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  9320815 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9320914  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9320915 gtggaaggaaggcctttgattatgt 9320939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 12135414 - 12135638
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  12135414 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 12135513  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  12135514 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12135613  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12135614 gtggaaggaaggcctttgattatgt 12135638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 26483633 - 26483857
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  26483633 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 26483732  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  26483733 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26483832  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26483833 gtggaaggaaggcctttgattatgt 26483857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 34619757 - 34619981
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  34619757 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34619856  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  34619857 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 34619956  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34619957 gtggaaggaaggcctttgattatgt 34619981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 43081494 - 43081713
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  43081494 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 43081593  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  43081594 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 43081693  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgat 230  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  43081694 gtggaaggaaggcctttgat 43081713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13321751 - 13321527
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  13321751 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 13321652  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  13321651 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 13321552  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13321551 gtggaaggaaggcctttgattatgt 13321527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18497646 - 18497422
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  18497646 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18497547  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  18497546 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18497447  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18497446 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 18497422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28652481 - 28652705
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  28652481 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28652580  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||  ||     
T  28652581 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28652680  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28652681 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28652705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32593195 - 32592971
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  32593195 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 32593096  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32593095 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 32592996  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32592995 gtggaaggaaggcctttgattatgt 32592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37767912 - 37767688
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  37767912 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaact 37767813  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37767812 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37767713  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37767712 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37767688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5641027 - 5641251
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  5641027 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5641126  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5641127 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 5641226  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5641227 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 5641251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 6877544 - 6877768
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  6877544 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 6877643  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  6877644 acttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6877743  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6877744 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 6877768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8662396 - 8662172
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  8662396 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8662297  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  8662296 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8662197  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8662196 gtggaaggaaggcctttgattatgt 8662172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24586613 - 24586837
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  24586613 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24586712  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  24586713 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 24586812  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24586813 gtggaaggaaggcctttgattatgt 24586837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28956706 - 28956482
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  28956706 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 28956607  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28956606 gcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 28956507  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28956506 gtggaaggaaggcctttgattatgt 28956482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30032667 - 30032891
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |    
T  30032667 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 30032766  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30032767 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30032866  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30032867 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30032891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30155270 - 30155494
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  30155270 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30155369  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30155370 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30155469  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30155470 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30155494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30171708 - 30171932
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  30171708 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 30171807  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30171808 gcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgagtgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30171907  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30171908 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 30171932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30937874 - 30938098
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  30937874 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30937973  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||     
T  30937974 actgaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcaccaagagttacctgctggaaccacatatccttgtcccaccc 30938073  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30938074 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30938098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31823328 - 31823104
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  31823328 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31823229  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  31823228 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 31823129  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31823128 gtggaaggaaggcctttgattatgt 31823104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 33519619 - 33519843
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  33519619 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33519718  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  33519719 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33519818  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33519819 gtggaaggaaggcctttgattatgt 33519843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37668407 - 37668183
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  37668407 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37668308  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37668307 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37668208  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37668207 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 37758222 - 37758446
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  37758222 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37758321  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  37758322 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37758421  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37758422 gtggaaggaaggcctttgattatgt 37758446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 22891707 - 22891926
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||    
T  22891707 accgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggcccgatcttcaagctactca 22891806  T
Q  116 gaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgga 215  Q
    | || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22891807 ggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgga 22891906  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  22891907 aggaaggcctttgattatgt 22891926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25203519 - 25203741
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  25203519 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25203618  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  25203619 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25203718  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  25203719 ggaaggaaggcctttgattatgt 25203741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25267674 - 25267896
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  25267674 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25267773  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  25267774 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25267873  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  25267874 ggaaggaaggcctttgattatgt 25267896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15755762 - 15755549
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |    
T  15755762 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 15755663  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  15755662 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 15755563  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  15755562 gcctttgatcatgt 15755549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 2514301 - 2514525
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  2514301 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2514400  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  2514401 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagagttacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 2514500  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2514501 gtggaaggaaggcctttgattatgt 2514525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 24727208 - 24727432
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  24727208 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24727307  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||  ||     
T  24727308 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 24727407  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24727408 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 24727432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13183615 - 13183490
Alignment:
Q  110 tactcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcc 209  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13183615 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaattccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacc 13183516  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13183515 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 13183490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13439497 - 13439380
Alignment:
Q  118 aacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaag 217  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  13439497 aacaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaag 13439398  T
Q  218 gaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  13439397 gaaggcctttgattatgt 13439380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18125227 - 18125113
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  18125227 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 18125128  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  18125127 ggcctttgattatgt 18125113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9547520 - 9547411
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  9547520 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagtatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 9547421  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  9547420 ggcctttgat 9547411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 11326986 - 11327095
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  11326986 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtccctcccatggaaggaa 11327085  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  11327086 ggcctttgat 11327095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29888008 - 29887899
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||||    
T  29888008 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtctcatccgtggaaggaa 29887909  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  29887908 ggcctttgat 29887899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 33878480 - 33878588
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  33878480 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgcc-ggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 33878578  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  33878579 ggcctttgat 33878588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 351999 - 351912
Alignment:
Q  148 tgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  351999 tgccagaaagcttttgatagcatcaaagggtatttgttagaacctccgattcttgtccctccagttgaaggaaggcctttgatcatgt 351912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5440105 - 5440043
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  5440105 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 5440043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11944302 - 11944240
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  11944302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 11944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15784605 - 15784543
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  15784605 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 15784543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 17957376 - 17957438
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  17957376 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 17957438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36375842 - 36375780
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  36375842 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 36375780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37000496 - 37000434
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  37000496 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 37000434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 3301 - 3523
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  3301 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 3400  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  3401 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 3500  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  3501 ggaaggaaggcctttgattatgt 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44015 - 43877
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  44015 cacagacccagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 43916  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatg 149  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  43915 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatg 43877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 32096
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgacc 84  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32167 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacc 32096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9492
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  9268 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 9367  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  9368 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9467  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9468 gtggaaggaaggcctttgattatgt 9492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30525 - 30749
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  30525 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30624  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  30625 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30724  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30725 gtggaaggaaggcctttgattatgt 30749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 19304 - 19526
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  19304 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19403  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  19404 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19503  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  19504 ggaaggaaggcctttgattatgt 19526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 7302 - 7416
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  7302 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 7401  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  7402 ggcctttgattatgt 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21894762 - 21894549
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |    
T  21894762 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 21894663  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  21894662 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 21894563  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  21894562 gcctttgattatgt 21894549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 51641452 - 51641676
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  51641452 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 51641551  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  51641552 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 51641651  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51641652 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 51641676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20339320 - 20339101
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  20339320 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 20339221  T
Q  116 gaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgga 215  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  20339220 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 20339121  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20339120 aggaaggcctttgattatgt 20339101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 10965910 - 10966123
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |    
T  10965910 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccaatcttcaagctactcaggaaga 10966009  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  10966010 atcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 10966109  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  10966110 gcctttgattatgt 10966123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 3644366 - 3644593
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  3644366 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3644465  T
Q  111 actcag-aaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgcc-aggaagcctttgatagcatcaaag-attatctgttggaaccacctatccttgtcctg 207  Q
     || || ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  3644466 gcttagaaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaagaagcttttgatagcatcaaagaattacttgttggaaccacctatccttgtccca 3644565  T
Q  208 ccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3644566 cccgtggaaggaaggcctttgattatgt 3644593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28588219 - 28588443
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  28588219 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 28588318  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
     || ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  28588319 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28588418  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28588419 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 28588443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41790323 - 41790110
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaaca 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |    
T  41790323 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagctacttagaaaga 41790224  T
Q  122 atcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  41790223 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 41790124  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  41790123 gcctttgattatgt 41790110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 10948311 - 10948535
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  10948311 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10948410  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  10948411 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 10948510  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10948511 gtggaaggaaggcctttgattatgt 10948535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16205055 - 16204834
Alignment:
Q  14 agaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattact 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  16205055 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcagacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctact 16204956  T
Q  114 cagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtg 213  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||  |||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  16204955 caggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaagagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtg 16204856  T
Q  214 gaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  16204855 gaaggaaggcctttgattatgt 16204834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 20464212 - 20464420
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||  |||    
T  20464212 cagaccgagaaacaagtctgaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagctac 20464311  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||  || ||    
T  20464312 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaacacctatccttgtcccacccgt 20464411  T
Q  213 ggaaggaag 221  Q
    |||||||||    
T  20464412 ggaaggaag 20464420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 28153080 - 28153189
Alignment:
Q  121 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  28153080 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 28153179  T
Q  221 ggcccttgat 230  Q
    |||| |||||    
T  28153180 ggcctttgat 28153189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 15813 - 16037
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |    
T  15813 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 15912  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  15913 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16012  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16013 gtggaaggaaggcctttgattatgt 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1424
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  1643 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 1544  T
Q  116 gaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagtgga 215  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  1543 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 1444  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  1443 aggaaggcctttgattatgt 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 12803 - 13027
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  12803 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 12902  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||     
T  12903 actcagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttatcccaccc 13002  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13003 gtggaaggaaggcctttgatcatgt 13027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23215 - 22991
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |    
T  23215 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagct 23116  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  23115 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 23016  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23015 gtggaaggaaggcctttgattatgt 22991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9478
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  9254 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 9353  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  9354 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9453  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9454 gtggaaggaaggcctttgattatgt 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11728
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  11952 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11853  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11852 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11753  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11752 gtggaaggaaggcctttgattatgt 11728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 5979
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  6203 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6104  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  6103 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagtatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 6004  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6003 gtggaaggaaggccgttgatcatgt 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 23111 - 23183
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgac 83  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 23183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 11181 - 11405
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  11181 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11280  T
Q  111 actcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgcca 210  Q
    ||| ||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||     
T  11281 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11380  T
Q  211 gtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11381 gtggaaggaaggcctttgattatgt 11405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 9279 - 9501
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9279 cagaccgagaaacaagtcagaggcttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 9378  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    || | || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |  || ||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||    
T  9379 tctggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgtcaaggggcttttgataacatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacttgt 9478  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  9479 ggaaggaaggcctttgattatgt 9501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5693 - 5471
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  |||    
T  5693 cagactgagaagcaagtcagaggttttctcgggcgtttgaattatatctcaaggttcatatctcacatgactgccacctgcgggccgatcttcaagctac 5594  T
Q  113 tcagaaacaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcctttgatagcatcaaagattatctgttggaaccacctatccttgtcctgccagt 212  Q
    |||| || ||||||||| | || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||  || ||    
T  5593 tcaggaaaaatcaacctgtggtatgaaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacctgttagagccacctatccttgtcccacctgt 5494  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| | ||||| ||||    
T  5493 ggaaggaaggtcgttgatcatgt 5471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Original strand, 1155 - 1263
Alignment:
Q  11 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  1155 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgaatgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 1254  T
Q  111 actcagaaa 119  Q
    |||||||||    
T  1255 actcagaaa 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43754 - 43541
Alignment:
Q  21 aaagcaagtccgaggtttcctcgggcgttttaa-ttacatctcccgattcatatctcatatgaccgc-aacctgcgggccaattttcaaattac-tcaga 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||  ||| | |||    
T  43754 aaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaaacctgcgggccgatcttcaagctactttaga 43655  T
Q  118 aacaatca-acctattgtgtggaat--aatgaatgccaggaagccttt--gatagcatcaa-agattatctgttggaaccacc-tatccttgtcctgcca 210  Q
    || |||||  |||||||| ||||||  | ||||||||| ||||| |||   |||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||     
T  43654 aagaatcagtcctattgtatggaattaattgaatgccaagaagctttttgtatagcatcaagaaattacctgctggaaccaccttatccttgtcccaccc 43555  T
Q  211 gtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||||||||||||    
T  43554 gtggaaggaaggcc 43541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35223 - 35161
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35223 aattacatctcccgtttcatttctcatatgacggcaacgtgcgggccgatattcaaattactc 35161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Original strand, 29443 - 29530
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaacaatcaacctattgtgtgga 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||| | || || |||  |||||||||||    
T  29443 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaaaaacaaggtattgtgtgga 29530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 33706 - 33770
Alignment:
Q  25 caagtccgaggtttcctcggg-cgttttaattacatctcccga-ttc-atatctcatatgaccgc 86  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  33706 caagtcagaggtttcctcggggcgtttgaattacatctcccgacttctatatctcacatgaccgc 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 615 times since January 2019
Visitors: 2233