View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0165-Insertion-1 (Length: 1035)

Name: NF0165-Insertion-1
Description: NF0165
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0165-Insertion-1
NF0165-Insertion-1
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (365-547)||(12670247-12670429)
chr8 (363-547)||(30454094-30454278)
chr8 (360-545)||(36720745-36720932)
chr8 (364-544)||(2626472-2626657)
chr8 (362-546)||(28817624-28817810)
chr8 (365-548)||(35261633-35261818)
chr8 (364-544)||(13160655-13160836)
chr8 (362-544)||(17823527-17823711)
chr8 (364-545)||(39460993-39461178)
chr8 (365-544)||(29521685-29521866)
chr8 (365-547)||(7136524-7136710)
chr8 (365-521)||(20869523-20869677)
chr8 (365-545)||(44530103-44530285)
chr8 (365-543)||(45071219-45071398)
chr8 (364-547)||(6760776-6760962)
chr8 (365-545)||(26954086-26954271)
chr8 (363-546)||(18164758-18164942)
chr8 (377-547)||(8897761-8897933)
chr8 (380-545)||(12625858-12626026)
chr8 (369-538)||(20284075-20284250)
chr8 (369-538)||(21070703-21070879)
chr8 (364-546)||(25250475-25250661)
chr8 (393-545)||(31457155-31457308)
chr8 (376-531)||(44781517-44781675)
chr8 (376-544)||(28407381-28407538)
chr8 (365-522)||(24245405-24245562)
chr8 (388-522)||(24365081-24365218)
chr8 (432-545)||(19729363-19729476)
chr8 (428-542)||(29877111-29877227)
chr8 (419-546)||(5135288-5135416)
chr8 (366-476)||(11748254-11748366)
chr8 (429-547)||(20869941-20870063)
chr8 (364-545)||(40604905-40605087)
chr8 (420-532)||(8483950-8484064)
chr8 (376-530)||(42083712-42083868)
chr8 (410-532)||(389642-389768)
chr8 (437-544)||(16225045-16225156)
chr8 (387-535)||(22598133-22598282)
chr8 (470-547)||(26102578-26102655)
chr8 (376-522)||(14017990-14018138)
chr8 (397-500)||(23000263-23000365)
chr8 (390-491)||(35105902-35106006)
chr8 (387-522)||(11000971-11001109)
chr8 (420-532)||(5689640-5689754)
chr8 (428-546)||(10857845-10857966)
chr8 (700-779)||(20242063-20242142)
chr8 (700-779)||(20250925-20251004)
chr8 (685-779)||(20241956-20242050)
chr8 (685-779)||(20251017-20251111)
chr8 (437-491)||(23286378-23286432)
chr8 (376-454)||(30962865-30962942)
chr8 (389-546)||(36918102-36918261)
chr8 (366-498)||(44742564-44742698)
chr8 (466-546)||(16013511-16013593)
chr8 (422-531)||(17250888-17251001)
chr8 (435-504)||(43942348-43942421)
chr8 (364-408)||(23286431-23286475)
chr8 (481-545)||(35107310-35107374)
chr8 (561-645)||(20241863-20241947)
chr8 (561-645)||(20251120-20251204)
chr8 (495-547)||(27468089-27468141)
chr8 (698-779)||(20242153-20242235)
chr8 (852-903)||(20242315-20242366)
chr8 (852-903)||(20250794-20250845)
chr8 (456-546)||(26457776-26457864)
chr8 (502-544)||(23286337-23286379)
chr8 (365-402)||(42840863-42840900)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (365-547)||(1346918-1347100)
chr6 (365-545)||(1354756-1354936)
chr6 (364-546)||(29355853-29356040)
chr6 (376-545)||(12221913-12222087)
chr6 (364-547)||(9161076-9161262)
chr6 (379-548)||(2166406-2166579)
chr6 (379-548)||(2178039-2178212)
chr6 (429-546)||(26097178-26097295)
chr6 (367-537)||(3815084-3815256)
chr6 (429-546)||(25557743-25557860)
chr6 (365-547)||(1941809-1941993)
chr6 (364-477)||(8409196-8409311)
chr6 (389-545)||(28007604-28007761)
chr6 (365-531)||(15866052-15866218)
chr6 (365-482)||(6024187-6024306)
chr6 (421-537)||(32579436-32579553)
chr6 (376-522)||(14553477-14553626)
chr6 (366-489)||(13905034-13905158)
chr6 (364-454)||(14975172-14975262)
chr6 (397-531)||(23240837-23240971)
chr6 (376-548)||(24097546-24097716)
chr6 (388-545)||(32728156-32728314)
chr6 (396-547)||(18277190-18277343)
chr6 (369-484)||(20400625-20400742)
chr6 (376-544)||(7947371-7947541)
chr6 (419-532)||(33138841-33138956)
chr6 (387-543)||(2755422-2755583)
chr6 (387-544)||(12889402-12889562)
chr6 (548-645)||(21861937-21862034)
chr6 (369-545)||(23930126-23930303)
chr6 (369-454)||(24734591-24734676)
chr6 (368-454)||(12063424-12063510)
chr6 (482-546)||(6808468-6808532)
chr6 (466-547)||(12892064-12892147)
chr6 (377-547)||(3116126-3116299)
chr6 (465-545)||(12885967-12886049)
chr6 (472-546)||(13267788-13267862)
chr6 (362-520)||(22967122-22967287)
chr6 (362-520)||(23821106-23821271)
chr6 (365-447)||(33922927-33923009)
chr6 (467-544)||(383760-383837)
chr6 (686-779)||(21862044-21862137)
chr6 (383-481)||(27855500-27855601)
chr6 (838-934)||(22860737-22860837)
chr6 (381-440)||(8417442-8417501)
chr6 (403-544)||(17432332-17432483)
chr6 (830-913)||(22860875-22860957)
chr6 (387-500)||(11849031-11849145)
chr6 (420-508)||(15865893-15865982)
chr6 (376-414)||(19649299-19649337)
chr6 (711-779)||(28063624-28063691)
chr6 (556-592)||(13167330-13167366)
chr6 (510-546)||(25997750-25997786)
chr6 (843-906)||(18981350-18981413)
chr6 (493-547)||(20906783-20906837)
chr6 (364-417)||(1916190-1916243)
chr6 (696-741)||(13167366-13167411)
chr6 (545-606)||(28063793-28063853)
[»] chr7 (97 HSPs)
chr7 (362-547)||(32758212-32758397)
chr7 (365-545)||(21172008-21172188)
chr7 (364-544)||(48735122-48735303)
chr7 (376-544)||(10693073-10693241)
chr7 (393-547)||(42391097-42391251)
chr7 (364-543)||(42476826-42477005)
chr7 (385-540)||(33871914-33872070)
chr7 (365-547)||(47077852-47078034)
chr7 (363-544)||(2541019-2541203)
chr7 (365-546)||(42798623-42798806)
chr7 (364-546)||(42805477-42805663)
chr7 (376-547)||(19426887-19427059)
chr7 (378-543)||(11617589-11617756)
chr7 (364-547)||(34626205-34626389)
chr7 (365-544)||(22698967-22699151)
chr7 (376-546)||(27629599-27629771)
chr7 (365-544)||(47716413-47716596)
chr7 (364-542)||(35334818-35334996)
chr7 (390-543)||(11741774-11741927)
chr7 (365-547)||(43557426-43557613)
chr7 (365-532)||(2662948-2663112)
chr7 (365-515)||(46354148-46354302)
chr7 (371-545)||(40463837-40464012)
chr7 (408-545)||(31591108-31591245)
chr7 (376-547)||(19265781-19265951)
chr7 (376-522)||(13805068-13805214)
chr7 (376-544)||(23419674-23419843)
chr7 (387-522)||(19266426-19266563)
chr7 (376-522)||(28362167-28362314)
chr7 (419-547)||(7879646-7879776)
chr7 (376-520)||(48123508-48123653)
chr7 (394-547)||(32233132-32233286)
chr7 (366-483)||(5180218-5180337)
chr7 (387-500)||(14099050-14099165)
chr7 (387-500)||(14409067-14409182)
chr7 (387-543)||(29907393-29907552)
chr7 (364-463)||(42495917-42496017)
chr7 (369-532)||(14732833-14732999)
chr7 (366-504)||(8148985-8149126)
chr7 (366-463)||(18326989-18327087)
chr7 (410-542)||(18512455-18512588)
chr7 (397-543)||(18747472-18747621)
chr7 (364-522)||(28078154-28078313)
chr7 (364-483)||(12473257-12473378)
chr7 (376-543)||(3469176-3469348)
chr7 (386-499)||(7644931-7645047)
chr7 (365-453)||(7193039-7193127)
chr7 (377-545)||(39123857-39124031)
chr7 (388-489)||(6736867-6736969)
chr7 (368-547)||(25198679-25198864)
chr7 (430-522)||(38604546-38604639)
chr7 (370-454)||(7794598-7794682)
chr7 (402-547)||(38262193-38262340)
chr7 (421-532)||(21566445-21566559)
chr7 (371-482)||(1423972-1424085)
chr7 (387-543)||(16341254-16341413)
chr7 (465-548)||(27889312-27889395)
chr7 (387-454)||(44123713-44123780)
chr7 (545-676)||(11828629-11828756)
chr7 (436-545)||(35787268-35787378)
chr7 (422-514)||(15108427-15108520)
chr7 (423-508)||(1408469-1408556)
chr7 (686-765)||(11828573-11828653)
chr7 (409-499)||(35203437-35203531)
chr7 (700-779)||(44338386-44338465)
chr7 (685-792)||(46963788-46963895)
chr7 (685-779)||(44338279-44338373)
chr7 (365-454)||(21447544-21447633)
chr7 (387-529)||(42101899-42102044)
chr7 (553-674)||(6530526-6530647)
chr7 (677-741)||(11828629-11828693)
chr7 (697-760)||(21813823-21813887)
chr7 (427-532)||(23231573-23231680)
chr7 (698-779)||(21813855-21813938)
chr7 (452-546)||(39093437-39093532)
chr7 (554-676)||(21813745-21813867)
chr7 (432-546)||(23618975-23619088)
chr7 (465-544)||(45018923-45019006)
chr7 (830-871)||(26403154-26403195)
chr7 (376-416)||(29140490-29140530)
chr7 (481-548)||(45811919-45811985)
chr7 (452-519)||(33500556-33500625)
chr7 (497-547)||(36602535-36602585)
chr7 (370-414)||(28685266-28685310)
chr7 (465-532)||(36267829-36267897)
chr7 (561-645)||(44338186-44338270)
chr7 (664-739)||(6530567-6530647)
chr7 (386-500)||(22065563-22065678)
chr7 (466-545)||(23065924-23066003)
chr7 (698-779)||(44338476-44338558)
chr7 (852-903)||(44338638-44338689)
chr7 (812-910)||(46963628-46963730)
chr7 (801-859)||(10236423-10236481)
chr7 (442-531)||(21139761-21139851)
chr7 (366-420)||(45019002-45019056)
chr7 (807-860)||(11828531-11828583)
chr7 (830-871)||(21813922-21813963)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (364-545)||(34725097-34725278)
chr1 (365-547)||(47214488-47214670)
chr1 (365-548)||(38478278-38478461)
chr1 (365-545)||(32632556-32632737)
chr1 (365-547)||(45812534-45812716)
chr1 (365-548)||(46247949-46248134)
chr1 (364-545)||(14617014-14617197)
chr1 (369-545)||(19414420-19414596)
chr1 (365-545)||(20004089-20004273)
chr1 (365-547)||(18944620-18944807)
chr1 (365-548)||(46991781-46991966)
chr1 (371-545)||(30395725-30395903)
chr1 (402-546)||(35253185-35253329)
chr1 (371-545)||(12126836-12127010)
chr1 (370-547)||(45402077-45402257)
chr1 (380-530)||(23768334-23768486)
chr1 (364-550)||(27201623-27201813)
chr1 (365-545)||(10668197-10668386)
chr1 (364-545)||(27474257-27474439)
chr1 (363-545)||(41319805-41319989)
chr1 (376-547)||(18724543-18724714)
chr1 (384-547)||(6925096-6925261)
chr1 (365-508)||(22930105-22930248)
chr1 (364-547)||(8197019-8197204)
chr1 (370-546)||(18741955-18742137)
chr1 (388-523)||(25468284-25468421)
chr1 (376-545)||(6983810-6983978)
chr1 (376-522)||(11596502-11596648)
chr1 (364-542)||(19932755-19932934)
chr1 (376-508)||(20036209-20036343)
chr1 (376-532)||(2435798-2435956)
chr1 (429-547)||(31382211-31382330)
chr1 (404-545)||(35005139-35005284)
chr1 (376-490)||(4430080-4430196)
chr1 (387-541)||(10378738-10378884)
chr1 (387-532)||(35117777-35117927)
chr1 (371-545)||(9939443-9939623)
chr1 (451-544)||(4349703-4349796)
chr1 (376-491)||(33222972-33223089)
chr1 (430-547)||(23796507-23796626)
chr1 (388-547)||(19701570-19701732)
chr1 (376-483)||(22327088-22327196)
chr1 (388-522)||(44485131-44485267)
chr1 (387-483)||(17470407-17470505)
chr1 (376-547)||(35019219-35019390)
chr1 (363-440)||(34714598-34714675)
chr1 (366-487)||(24564322-24564445)
chr1 (376-546)||(50811928-50812100)
chr1 (697-779)||(15630025-15630108)
chr1 (420-542)||(22324925-22325049)
chr1 (422-532)||(45264411-45264524)
chr1 (387-482)||(50760288-50760385)
chr1 (368-454)||(25290143-25290231)
chr1 (387-532)||(27136663-27136811)
chr1 (451-547)||(1517308-1517404)
chr1 (452-547)||(43768205-43768300)
chr1 (376-542)||(15511150-15511320)
chr1 (369-527)||(18335305-18335465)
chr1 (367-432)||(40424721-40424786)
chr1 (387-487)||(52910216-52910319)
chr1 (454-522)||(15505632-15505700)
chr1 (387-454)||(2435985-2436052)
chr1 (686-763)||(2072366-2072444)
chr1 (366-452)||(21723642-21723727)
chr1 (374-489)||(34679274-34679390)
chr1 (481-547)||(50606498-50606564)
chr1 (388-532)||(23371124-23371268)
chr1 (398-490)||(31272429-31272522)
chr1 (388-541)||(39214961-39215117)
chr1 (421-530)||(43207528-43207640)
chr1 (399-545)||(19974073-19974221)
chr1 (467-534)||(4249453-4249520)
chr1 (467-534)||(4249777-4249844)
chr1 (467-534)||(4250101-4250168)
chr1 (430-530)||(34148974-34149076)
chr1 (686-763)||(2075896-2075974)
chr1 (451-546)||(42304205-42304302)
chr1 (363-452)||(22151479-22151568)
chr1 (418-522)||(30682844-30682948)
chr1 (422-537)||(31442396-31442515)
chr1 (686-755)||(19825091-19825161)
chr1 (365-491)||(10163736-10163864)
chr1 (428-522)||(20169111-20169207)
chr1 (798-865)||(2072299-2072364)
chr1 (798-865)||(2075829-2075894)
chr1 (854-921)||(15629861-15629929)
chr1 (494-545)||(19386575-19386626)
chr1 (376-451)||(25554817-25554891)
chr1 (466-541)||(28894561-28894636)
chr1 (732-859)||(3775100-3775226)
chr1 (465-535)||(4430008-4430078)
chr1 (477-539)||(4587568-4587630)
chr1 (451-545)||(20999849-20999943)
chr1 (429-475)||(44745854-44745900)
chr1 (451-500)||(21910693-21910742)
chr1 (451-491)||(46859131-46859172)
chr1 (432-487)||(21723728-21723784)
chr1 (479-531)||(33594144-33594196)
chr1 (838-934)||(9168197-9168296)
chr1 (374-429)||(49546024-49546078)
chr1 (455-508)||(6358190-6358244)
chr1 (451-521)||(20982773-20982843)
chr1 (465-533)||(7074595-7074664)
chr1 (724-788)||(15629924-15629989)
chr1 (493-546)||(16120823-16120876)
chr1 (392-476)||(49722641-49722726)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (365-547)||(11054145-11054327)
chr4 (362-544)||(20224935-20225117)
chr4 (364-546)||(48598823-48599005)
chr4 (365-547)||(47528527-47528709)
chr4 (364-546)||(5648212-5648395)
chr4 (363-543)||(6430627-6430808)
chr4 (364-547)||(30639333-30639517)
chr4 (376-547)||(16408598-16408773)
chr4 (364-547)||(5306657-5306845)
chr4 (376-543)||(8473621-8473790)
chr4 (389-546)||(9832311-9832468)
chr4 (403-542)||(29207900-29208039)
chr4 (365-541)||(21646918-21647098)
chr4 (365-547)||(23501747-23501927)
chr4 (384-543)||(40915802-40915962)
chr4 (368-545)||(16911519-16911700)
chr4 (391-547)||(17043392-17043549)
chr4 (392-547)||(39077793-39077948)
chr4 (70-241)||(24225013-24225186)
chr4 (386-547)||(47443928-47444095)
chr4 (391-546)||(54175043-54175202)
chr4 (384-544)||(44363130-44363294)
chr4 (387-548)||(35567146-35567309)
chr4 (365-546)||(13256397-13256578)
chr4 (386-532)||(19027823-19027971)
chr4 (364-491)||(14590790-14590920)
chr4 (368-545)||(14983791-14983970)
chr4 (397-546)||(25463108-25463258)
chr4 (389-544)||(30690176-30690340)
chr4 (365-530)||(37494805-37494972)
chr4 (428-547)||(20639655-20639777)
chr4 (361-532)||(54730199-54730375)
chr4 (365-547)||(10660358-10660544)
chr4 (365-547)||(10874503-10874689)
chr4 (370-547)||(30352577-30352767)
chr4 (419-546)||(10277755-10277882)
chr4 (365-544)||(20405047-20405224)
chr4 (377-522)||(49938615-49938759)
chr4 (376-532)||(30496334-30496490)
chr4 (394-505)||(41018833-41018945)
chr4 (394-521)||(7385499-7385628)
chr4 (431-546)||(25629069-25629186)
chr4 (374-508)||(47441566-47441701)
chr4 (365-544)||(55766466-55766647)
chr4 (365-544)||(55830721-55830902)
chr4 (366-522)||(54966977-54967133)
chr4 (387-547)||(20908633-20908797)
chr4 (423-547)||(9987831-9987957)
chr4 (368-454)||(17315390-17315476)
chr4 (473-547)||(38786673-38786747)
chr4 (387-492)||(487186-487294)
chr4 (429-543)||(7909281-7909397)
chr4 (389-544)||(32478792-32478942)
chr4 (387-547)||(39029059-39029220)
chr4 (431-522)||(49796818-49796910)
chr4 (376-483)||(25343153-25343261)
chr4 (376-469)||(42164224-42164317)
chr4 (454-544)||(20225119-20225211)
chr4 (435-545)||(51865037-51865149)
chr4 (423-531)||(21489099-21489210)
chr4 (616-792)||(54147639-54147813)
chr4 (389-547)||(23580205-23580365)
chr4 (376-528)||(30581481-30581636)
chr4 (685-777)||(16870646-16870738)
chr4 (388-522)||(3580862-3580994)
chr4 (399-545)||(7038041-7038188)
chr4 (376-454)||(54640431-54640508)
chr4 (368-441)||(5313099-5313172)
chr4 (387-452)||(43035224-43035289)
chr4 (483-547)||(32484307-32484371)
chr4 (480-547)||(28494222-28494289)
chr4 (376-541)||(36589710-36589876)
chr4 (451-547)||(36816381-36816478)
chr4 (376-481)||(51420539-51420646)
chr4 (451-543)||(12711450-12711542)
chr4 (470-547)||(33836484-33836563)
chr4 (396-505)||(32629308-32629418)
chr4 (583-741)||(54147571-54147730)
chr4 (482-544)||(38755908-38755970)
chr4 (450-528)||(16494258-16494338)
chr4 (386-507)||(44357195-44357319)
chr4 (376-491)||(49938491-49938608)
chr4 (480-544)||(11394923-11394987)
chr4 (480-544)||(11404650-11404714)
chr4 (387-451)||(12257688-12257752)
chr4 (368-408)||(18969698-18969738)
chr4 (366-442)||(20373898-20373974)
chr4 (438-541)||(12047721-12047823)
chr4 (387-457)||(41549358-41549428)
chr4 (402-490)||(10379997-10380086)
chr4 (364-409)||(29879634-29879679)
chr4 (494-547)||(35532077-35532130)
chr4 (483-544)||(40553937-40553998)
chr4 (483-544)||(44718641-44718702)
chr4 (493-546)||(56322984-56323037)
chr4 (838-897)||(16871155-16871215)
chr4 (451-544)||(48327763-48327858)
chr4 (725-788)||(54147869-54147933)
chr4 (833-913)||(16871079-16871155)
chr4 (420-491)||(17079704-17079777)
chr4 (482-544)||(25388249-25388311)
chr4 (698-759)||(42265431-42265492)
chr4 (376-438)||(50856344-50856405)
chr4 (482-547)||(8820581-8820646)
chr4 (421-503)||(14783722-14783806)
chr4 (682-735)||(24225498-24225551)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (365-546)||(30533-30714)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (364-546)||(1217065-1217247)
chr3 (369-543)||(22122918-22123092)
chr3 (364-548)||(40272808-40272994)
chr3 (364-544)||(39203491-39203671)
chr3 (365-547)||(13730599-13730785)
chr3 (364-545)||(13628789-13628975)
chr3 (363-543)||(22609741-22609921)
chr3 (365-547)||(46421031-46421218)
chr3 (363-543)||(7696893-7697068)
chr3 (365-545)||(12914034-12914216)
chr3 (378-547)||(26869696-26869866)
chr3 (365-547)||(52926216-52926391)
chr3 (363-545)||(16735415-16735598)
chr3 (364-547)||(8247683-8247871)
chr3 (366-545)||(29366719-29366902)
chr3 (419-544)||(31592879-31593004)
chr3 (365-532)||(6411834-6412002)
chr3 (376-547)||(26573115-26573287)
chr3 (364-527)||(9607178-9607345)
chr3 (392-547)||(7942993-7943150)
chr3 (438-548)||(15797271-15797381)
chr3 (362-546)||(5173717-5173905)
chr3 (365-471)||(10870025-10870132)
chr3 (388-546)||(34420641-34420802)
chr3 (397-546)||(516417-516571)
chr3 (365-491)||(4495717-4495845)
chr3 (419-544)||(10795423-10795552)
chr3 (447-546)||(34771362-34771461)
chr3 (429-546)||(54484730-54484850)
chr3 (376-491)||(45620881-45620998)
chr3 (388-547)||(25944468-25944630)
chr3 (439-546)||(26292382-26292489)
chr3 (387-546)||(53996563-53996725)
chr3 (421-544)||(14986989-14987116)
chr3 (364-547)||(12525385-12525567)
chr3 (404-548)||(54374341-54374488)
chr3 (391-522)||(30928169-30928302)
chr3 (400-528)||(33926094-33926224)
chr3 (432-548)||(49013469-49013589)
chr3 (361-545)||(25517169-25517358)
chr3 (376-532)||(45948850-45949010)
chr3 (387-532)||(19731000-19731147)
chr3 (385-543)||(33235526-33235687)
chr3 (435-549)||(45786209-45786327)
chr3 (469-548)||(24577917-24577996)
chr3 (400-505)||(45139515-45139624)
chr3 (435-509)||(47624088-47624163)
chr3 (451-542)||(353351-353444)
chr3 (698-792)||(42530741-42530835)
chr3 (400-491)||(54032612-54032705)
chr3 (545-779)||(50295443-50295677)
chr3 (395-522)||(8410889-8411016)
chr3 (428-543)||(31904857-31904975)
chr3 (391-498)||(39211992-39212101)
chr3 (387-461)||(53062036-53062112)
chr3 (387-532)||(19751576-19751723)
chr3 (368-484)||(21874999-21875111)
chr3 (469-548)||(24578007-24578086)
chr3 (431-544)||(31831241-31831343)
chr3 (376-454)||(35417904-35417981)
chr3 (478-547)||(24851298-24851367)
chr3 (484-545)||(30452892-30452953)
chr3 (421-498)||(55401208-55401288)
chr3 (422-530)||(43114882-43114994)
chr3 (420-519)||(9276289-9276395)
chr3 (408-489)||(52428532-52428616)
chr3 (387-546)||(44403553-44403715)
chr3 (663-779)||(46692047-46692165)
chr3 (368-454)||(26782345-26782431)
chr3 (374-497)||(29106535-29106659)
chr3 (375-532)||(829454-829612)
chr3 (427-548)||(50624949-50625072)
chr3 (389-508)||(1121260-1121382)
chr3 (364-454)||(11461733-11461826)
chr3 (428-535)||(31672732-31672842)
chr3 (387-484)||(28904941-28905041)
chr3 (502-547)||(6242282-6242327)
chr3 (365-454)||(43956552-43956640)
chr3 (364-404)||(9276249-9276289)
chr3 (386-454)||(9627712-9627780)
chr3 (365-409)||(39430465-39430509)
chr3 (834-869)||(42530844-42530879)
chr3 (496-547)||(47624208-47624259)
chr3 (839-894)||(50295873-50295928)
chr3 (511-548)||(4495672-4495709)
chr3 (368-405)||(23871418-23871455)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (364-545)||(21779260-21779441)
chr2 (364-544)||(23397719-23397899)
chr2 (365-545)||(8455315-8455497)
chr2 (365-545)||(9671134-9671315)
chr2 (361-544)||(14530268-14530455)
chr2 (366-544)||(10543653-10543835)
chr2 (368-547)||(25249735-25249915)
chr2 (367-545)||(11514392-11514571)
chr2 (365-508)||(12023955-12024099)
chr2 (366-545)||(24200622-24200805)
chr2 (367-548)||(19977710-19977893)
chr2 (402-547)||(14444720-14444866)
chr2 (363-544)||(25079717-25079901)
chr2 (364-509)||(22371010-22371154)
chr2 (365-547)||(7214488-7214674)
chr2 (371-546)||(27573581-27573757)
chr2 (402-547)||(10546153-10546301)
chr2 (382-549)||(17667973-17668142)
chr2 (366-544)||(14544018-14544201)
chr2 (388-528)||(99281-99421)
chr2 (367-546)||(17896215-17896397)
chr2 (366-535)||(32781298-32781467)
chr2 (365-545)||(5840982-5841166)
chr2 (382-549)||(17623535-17623704)
chr2 (427-547)||(36871509-36871629)
chr2 (377-545)||(39914305-39914475)
chr2 (376-547)||(24859985-24860156)
chr2 (387-522)||(21377095-21377232)
chr2 (389-499)||(5450263-5450376)
chr2 (365-481)||(17705449-17705567)
chr2 (365-546)||(26684618-26684803)
chr2 (387-522)||(33795261-33795398)
chr2 (426-547)||(30826052-30826173)
chr2 (376-545)||(44643488-44643659)
chr2 (386-544)||(40416871-40417031)
chr2 (396-547)||(25641487-25641639)
chr2 (389-546)||(31158437-31158598)
chr2 (376-541)||(4516354-4516520)
chr2 (549-741)||(1173572-1173765)
chr2 (391-522)||(17380259-17380391)
chr2 (431-544)||(40762234-40762349)
chr2 (387-506)||(23145736-23145857)
chr2 (387-506)||(23557526-23557647)
chr2 (388-548)||(45235813-45235976)
chr2 (420-547)||(15296403-15296533)
chr2 (400-533)||(19614981-19615117)
chr2 (387-522)||(44521395-44521532)
chr2 (383-464)||(44604826-44604908)
chr2 (451-544)||(25632551-25632644)
chr2 (387-483)||(29419946-29420048)
chr2 (685-770)||(8986208-8986293)
chr2 (830-930)||(38583930-38584027)
chr2 (363-411)||(39189556-39189604)
chr2 (422-543)||(13245096-13245210)
chr2 (830-934)||(38583959-38584066)
chr2 (421-532)||(17471558-17471673)
chr2 (365-414)||(27466262-27466311)
chr2 (426-522)||(30864439-30864536)
chr2 (405-488)||(2003592-2003678)
chr2 (451-531)||(24890453-24890533)
chr2 (396-532)||(31821355-31821491)
chr2 (628-779)||(1173471-1173620)
chr2 (484-545)||(34080176-34080237)
chr2 (685-737)||(38584195-38584247)
chr2 (483-543)||(40579750-40579810)
chr2 (483-547)||(41409936-41410000)
chr2 (478-552)||(4794871-4794945)
chr2 (376-442)||(35017783-35017849)
chr2 (451-534)||(39499240-39499323)
chr2 (493-547)||(39189501-39189555)
chr2 (463-545)||(23488535-23488619)
chr2 (834-871)||(29409360-29409397)
chr2 (474-531)||(31523296-31523353)
chr2 (696-760)||(38584136-38584201)
chr2 (366-454)||(17472926-17473014)
chr2 (701-741)||(32290604-32290644)
chr2 (484-548)||(34766330-34766394)
chr2 (400-508)||(44449419-44449529)
chr2 (388-545)||(4795730-4795891)
chr2 (493-544)||(8575979-8576030)
chr2 (422-484)||(12315712-12315775)
chr2 (474-541)||(31525771-31525838)
chr2 (686-779)||(38584085-38584180)
chr2 (496-545)||(22371199-22371248)
chr2 (388-449)||(34752759-34752820)
chr2 (834-871)||(38583918-38583955)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (365-547)||(35710267-35710449)
chr5 (364-545)||(41014272-41014454)
chr5 (365-546)||(8169982-8170163)
chr5 (398-545)||(32703411-32703558)
chr5 (364-545)||(38879534-38879719)
chr5 (365-547)||(24448844-24449028)
chr5 (368-545)||(4619103-4619284)
chr5 (368-546)||(43334159-43334341)
chr5 (365-544)||(1565385-1565566)
chr5 (362-474)||(37024626-37024738)
chr5 (426-541)||(7368413-7368528)
chr5 (363-544)||(22187237-22187422)
chr5 (363-522)||(22600406-22600567)
chr5 (368-545)||(22861668-22861844)
chr5 (368-522)||(27328709-27328867)
chr5 (366-521)||(2838733-2838890)
chr5 (368-543)||(12006329-12006508)
chr5 (420-544)||(13801767-13801895)
chr5 (387-545)||(28516432-28516593)
chr5 (545-730)||(11335393-11335572)
chr5 (376-547)||(19142940-19143111)
chr5 (450-544)||(34154814-34154908)
chr5 (394-548)||(1405170-1405326)
chr5 (362-454)||(23974732-23974823)
chr5 (422-532)||(43574617-43574729)
chr5 (389-522)||(24323727-24323862)
chr5 (389-522)||(24360351-24360486)
chr5 (371-540)||(30006285-30006456)
chr5 (387-532)||(208939-209086)
chr5 (435-544)||(7097760-7097870)
chr5 (436-544)||(16880647-16880757)
chr5 (430-543)||(20135623-20135740)
chr5 (376-507)||(39301089-39301222)
chr5 (395-532)||(1850624-1850762)
chr5 (830-919)||(11335266-11335355)
chr5 (370-483)||(31299591-31299705)
chr5 (469-545)||(16957374-16957450)
chr5 (396-504)||(22907904-22908014)
chr5 (451-532)||(9794390-9794471)
chr5 (368-441)||(17419871-17419944)
chr5 (686-791)||(11335361-11335466)
chr5 (451-545)||(3771381-3771475)
chr5 (485-547)||(16028621-16028683)
chr5 (431-545)||(29334415-29334532)
chr5 (403-532)||(42924842-42924977)
chr5 (419-504)||(41425956-41426043)
chr5 (698-764)||(9511813-9511880)
chr5 (663-760)||(9511742-9511845)
chr5 (391-522)||(34074584-34074717)
chr5 (426-544)||(5873322-5873441)
chr5 (832-907)||(9511882-9511960)
chr5 (485-544)||(30877564-30877623)
chr5 (429-544)||(12575660-12575779)
chr5 (365-414)||(19438703-19438752)
chr5 (502-543)||(19438759-19438800)
chr5 (376-437)||(39079875-39079935)
chr5 (464-532)||(13774920-13774988)
chr5 (406-454)||(22025538-22025586)
chr5 (493-545)||(32354211-32354263)
chr5 (836-871)||(11335165-11335200)
chr5 (867-932)||(11335324-11335391)
chr5 (364-403)||(41956885-41956924)
chr5 (554-676)||(9511703-9511825)
chr5 (376-454)||(10634238-10634315)
chr5 (677-760)||(11335424-11335510)
chr5 (698-779)||(24136896-24136978)
chr5 (482-544)||(25622533-25622595)
chr5 (484-545)||(39801591-39801652)
chr5 (481-533)||(4654426-4654478)
chr5 (574-645)||(24136719-24136790)
chr5 (459-548)||(11657695-11657785)
chr5 (474-547)||(10943842-10943914)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (368-542)||(10052-10226)
scaffold0187 (368-542)||(20380-20554)
scaffold0187 (362-430)||(8896-8964)
scaffold0187 (362-430)||(19224-19292)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (376-544)||(11097-11264)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (367-546)||(13022-13202)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (370-544)||(58936-59114)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (364-547)||(24769-24949)
scaffold0057 (376-547)||(46796-46969)
scaffold0057 (424-545)||(43672-43794)
scaffold0057 (456-549)||(46702-46796)
scaffold0057 (388-434)||(46995-47041)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (420-545)||(48633-48758)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (380-540)||(1591-1751)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (376-545)||(10775-10946)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (364-491)||(226458-226588)
scaffold0005 (421-503)||(55924-56008)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (365-491)||(35070-35200)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (379-513)||(4125-4264)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (457-547)||(24130-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (376-544)||(72867-73031)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (364-439)||(83828-83903)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (376-522)||(23569-23712)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (366-547)||(24619-24786)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (379-491)||(43097-43209)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (385-454)||(8865-8934)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (427-532)||(3560-3667)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (474-544)||(58630-58699)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (420-528)||(3685-3793)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 6e-77; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670247
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 12670330  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12670329 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttaccctttttt 12670247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 363 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30454278 - 30454094
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30454278 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaa 30454179  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30454178 ggctgcgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 30454094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 545
Target Start/End: Original strand, 36720745 - 36720932
Alignment:
Q  360 agtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacag 457  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36720745 agtttgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacag 36720844  T
Q  458 ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36720845 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccctttt 36720932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 364 - 544
Target Start/End: Original strand, 2626472 - 2626657
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-----aaaacagg 458  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  2626472 tgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagg 2626571  T
Q  459 gtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  2626572 gtaagactgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 362 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28817810 - 28817624
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 459  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28817810 tttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 28817711  T
Q  460 taagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  28817710 taaggctgcgtacaatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttttt 28817624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261818
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 35261818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 364 - 544
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160836
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 13160754  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttt 13160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 362 - 544
Target Start/End: Original strand, 17823527 - 17823711
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caggg 459  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  17823527 tttgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccagga 17823626  T
Q  460 taagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17823627 taagactgcgtaaaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17823711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39461178 - 39460993
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  39461178 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 39461079  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39461078 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 39460993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521685
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136524
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttttt 7136524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 365 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 20869578  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 521  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20869577 ctgtgtacaatacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530285
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgacctttt 44530285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071398
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 45071318  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  45071319 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Original strand, 6760776 - 6760962
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6760776 tgaggggtaactt-ggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 6760874  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6760875 aggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 6760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954271
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttt 26954271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 363 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18164942 - 18164758
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 461  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18164942 ttgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 18164843  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||  |||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  18164842 aggttgcgtacaatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccattttt 18164758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 377 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8897933 - 8897761
Alignment:
Q  377 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaa 474  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| || |||||||    
T  8897933 tggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaa 8897834  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  8897833 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgccctttttt 8897761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 545
Target Start/End: Original strand, 12625858 - 12626026
Alignment:
Q  380 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  12625858 cgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaata 12625957  T
Q  477 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12625958 caccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 369 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaga 464  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||     
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  465 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 538  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 369 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-----aaaacagggtaag 463  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  464 actgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 538  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Original strand, 25250475 - 25250661
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  25250475 tgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggta 25250574  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25250575 tggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttttt 25250661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 545
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457308
Alignment:
Q  393 gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  492 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 31457308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 376 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 44781675 - 44781517
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  44781675 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtaca 44781577  T
Q  474 atacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44781576 atacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Original strand, 28407381 - 28407538
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||               
T  28407381 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag----------- 28407469  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  28407470 -gcaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 522
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245562
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||    
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt--aacagggtaaga 24245501  T
Q  465 ctgcgtacaatacacc---aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    || |||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  24245502 ctacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 432 - 545
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729476
Alignment:
Q  432 tggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcac 19729462  T
Q  532 caggttgccctttt 545  Q
      | ||||||||||    
T  19729463 tggattgccctttt 19729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 428 - 542
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877227
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  ||    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  526 gtgcaccaggttgccct 542  Q
    |||||||||| ||||||    
T  29877211 gtgcaccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5135416 - 5135288
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  5135416 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgca 5135317  T
Q  517 ggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  5135316 ggagct-ttgtgcaccgggctgcccttttt 5135288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 366 - 476
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748366
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 463  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  464 actgcgtacaata 476  Q
    || ||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaata 11748366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 429 - 547
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870063
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| |    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  525 agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgccctttttt 20870063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604905
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggta 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||  ||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||   |||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacactaaatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgccctttt 40604905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 420 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 8484064 - 8483950
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  8484064 gggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgg 8483965  T
Q  518 gagctctagtgcacc 532  Q
    ||||| ||| |||||    
T  8483964 gagctttagggcacc 8483950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 42083868 - 42083712
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||| |||||||||    
T  42083868 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtaca 42083770  T
Q  474 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 530  Q
     || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || | ||||||| |||||||    
T  42083769 gtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 532
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389768
Alignment:
Q  410 gaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagacc 505  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  506 ctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||  |||||| ||||| |||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcacc 389768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 437 - 544
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225156
Alignment:
Q  437 acagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  533 aggttgcccttt 544  Q
     ||||| |||||    
T  16225145 gggttgtccttt 16225156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 535
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598282
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 535  Q
    |||| || || ||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcaccagg 22598282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 547
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102655
Alignment:
Q  470 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 26102655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14018138 - 14017990
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  14018138 ttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtaca 14018040  T
Q  474 atacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  14018039 atacactaaattggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagct 14017990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000263
Alignment:
Q  397 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||| |||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  496 ttccc 500  Q
    |||||    
T  23000267 ttccc 23000263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 491
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106006
Alignment:
Q  390 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacacca-aatgg 486  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  487 tggga 491  Q
    |||||    
T  35106002 tggga 35106006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 387 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||  |||||   |||||| | |||| ||| |||||||||||||||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 532
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689754
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  518 gagctctagtgcacc 532  Q
    ||||| |||||||||    
T  5689740 gagctttagtgcacc 5689754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 546
Target Start/End: Original strand, 10857845 - 10857966
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||  |||| ||  |||||||||||| |    
T  10857845 gtccaggaaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagcttt 10857944  T
Q  525 agtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  10857945 agtgcaccgggttgcccttttt 10857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 700 - 779
Target Start/End: Original strand, 20242063 - 20242142
Alignment:
Q  700 gtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20242063 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 20242142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 700 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 20251004 - 20250925
Alignment:
Q  700 gtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20251004 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 20250925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 685 - 779
Target Start/End: Original strand, 20241956 - 20242050
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20241956 actcataatttgcttgtttggtgagtcgagttctcacattttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 20242050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 685 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 20251111 - 20251017
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20251111 actcataatttgcttgtttggtgagtcgagttctcacattttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 20251017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286378
Alignment:
Q  437 acagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23286432 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtggga 23286378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30962942 - 30962865
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30962942 ttggcgcaac-ggaaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 30962865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 546
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918261
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||  |  |||||||| |||||||||   |||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatag 36918201  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    | |||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||    
T  36918202 taggattccttcccaaaccctatgtatgcgagagctttaatgcaaaaggttgtccttttt 36918261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742564
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 463  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| || |||||   | |||||||| |||||||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  464 actgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttc 498  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttc 44742564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013593
Alignment:
Q  466 tgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttttt 16013593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250888
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||||  ||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  518 gagctctagtgcac 531  Q
    ||||| ||||||||    
T  17250901 gagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 435 - 504
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942421
Alignment:
Q  435 aaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagac 504  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagac 43942421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23286475 - 23286431
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 408  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286475 tgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107310
Alignment:
Q  481 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35107374 aaatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccctttt 35107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 561 - 645
Target Start/End: Original strand, 20241863 - 20241947
Alignment:
Q  561 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggt 645  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  20241863 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 20241947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 561 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20251204 - 20251120
Alignment:
Q  561 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggt 645  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  20251204 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 20251120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 495 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468089
Alignment:
Q  495 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 27468089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 779
Target Start/End: Original strand, 20242153 - 20242235
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaa-gtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20242153 ttgtttggtgagtagagttctcaca-tttggttgtctggtgagtagtgtgctcacaatttggtttcttctcccccttttgattc 20242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 903
Target Start/End: Original strand, 20242315 - 20242366
Alignment:
Q  852 attgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacactt 903  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20242315 attgatttcattgcacttctcccccttttgattcttttgattgattgcactt 20242366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 20250845 - 20250794
Alignment:
Q  852 attgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacactt 903  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20250845 attgatttcattgcacttctcccccttttgattcttttgattgattgcactt 20250794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 546
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457864
Alignment:
Q  456 agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtttcctttttt 26457864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 502 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23286379 - 23286337
Alignment:
Q  502 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23286379 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 23286337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 402
Target Start/End: Original strand, 42840863 - 42840900
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtca 402  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42840863 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtca 42840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 6e-77; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347100
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaacagggtaagg 1347017  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1347018 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 1347100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354756
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 1354837  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1354836 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29356040 - 29355853
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaag-ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggt 460  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29356040 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 29355941  T
Q  461 aagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29355940 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 29355853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 376 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12222087 - 12221913
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  12222087 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 12221988  T
Q  474 atacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12221987 atacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 12221913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Original strand, 9161076 - 9161262
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9161076 tgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaa 9161175  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctttttt 9161262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 379 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2166579 - 2166406
Alignment:
Q  379 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  2166579 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2166480  T
Q  477 cacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2166479 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 2166406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 379 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2178212 - 2178039
Alignment:
Q  379 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  2178212 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2178113  T
Q  477 cacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2178112 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 2178039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 429 - 546
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097295
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  529 caccaggttgcccttttt 546  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttttt 26097295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| | |||| ||    
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||   ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 429 - 546
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557860
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  529 caccaggttgcccttttt 546  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttttt 25557860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941993
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  || | ||| |||||||||| | | |||||||  |||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgccctttttt 1941993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 477
Target Start/End: Original strand, 8409196 - 8409311
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8409196 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggta 8409295  T
Q  462 agactgcgtacaatac 477  Q
    || |||||||||||||    
T  8409296 aggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 545
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007761
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgac-tgaaa-ggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatgc 28007703  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||| ||||||||  | |||  |||||||| |||||||||||||| | || |||||||    
T  28007704 tgggaccccttccc-taacctccatatgcggaagctctagtgcaccggattaccctttt 28007761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866052
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
      ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||| || ||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcac 15866052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 6024187 - 6024306
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6024187 gaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 6024286  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6024287 gactgcgtacaatacaccaa 6024306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 421 - 537
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579553
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  520 gctctagtgcaccaggtt 537  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  32579536 gctttagtactccaggtt 32579553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553626
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  474 atacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 366 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905034
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgg 489  Q
     |||| |||||| |||||||||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaaatggtgg 13905034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14975262 - 14975172
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14975262 tgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 14975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240837
Alignment:
Q  397 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatccct 496  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccct 23240872  T
Q  497 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    ||   |||  ||  |||||||||||| ||||||||    
T  23240871 tctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcac 23240837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 548
Target Start/End: Original strand, 24097546 - 24097716
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||    
T  24097546 ttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca 24097645  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |    ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24097646 a----ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgccctttttta 24097716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728156
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||  |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaaata 32728215  T
Q  486 gtgggatccc-ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||  |||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  32728214 gtgg--tccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgccctttt 32728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277190
Alignment:
Q  396 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 493  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||  |||||||||||||||| |    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  494 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| |||| ||   |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtcctttttt 18277190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 484
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400742
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagact 466  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  467 gcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  20400725 gcgtacagtacactaaat 20400742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 7947541 - 7947371
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  7947541 ttggcgcaac-ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtaca 7947443  T
Q  474 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  7947442 atacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttt 7947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 532
Target Start/End: Original strand, 33138841 - 33138956
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||     
T  33138841 cgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtatgca 33138940  T
Q  517 ggagctctagtgcacc 532  Q
    | |||| |||||||||    
T  33138941 gtagctttagtgcacc 33138956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt--gtaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc--aa 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| |||||| |    |||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatat--gcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||||||||  |||||||| | |||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 544
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889562
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaa 483  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacctaaa 12889501  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
     | ||||| ||||| || |||||| | | || ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  12889502 cgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttt 12889562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 548 - 645
Target Start/End: Original strand, 21861937 - 21862034
Alignment:
Q  548 agtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggt 645  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21861937 agtttagttcagtttgatttggtttcgtttggttcaatttatttggtttttgagtgagtcaaaatagttctcacaattggtttgtttgtttgtttggt 21862034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930126
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttc-aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactg 467  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||  || |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    |    ||    
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagatagttg 23930204  T
Q  468 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  23930203 cgtacaatacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 23930126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 454
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734676
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaa 24734676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063510
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaa 12063510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 546
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808532
Alignment:
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6808532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 466 - 547
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892147
Alignment:
Q  466 tgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 12892147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 3116299 - 3116126
Alignment:
Q  377 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-------ctgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcg 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||      | |||||||    
T  3116299 tggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgagttgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaa------atgactgcg 3116206  T
Q  470 tacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||||||||  |||||||| |||||| | |||| ||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  3116205 cacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgccctttttt 3116126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 545
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886049
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12886049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 472 - 546
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267862
Alignment:
Q  472 caatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 13267862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 520
Target Start/End: Original strand, 22967122 - 22967287
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt 460  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||| |    
T  22967122 tttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggat 22967221  T
Q  461 aagactgc------gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 520  Q
    ||| ||||       |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||    
T  22967222 aaggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23821271 - 23821106
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt 460  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||| |    
T  23821271 tttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggat 23821172  T
Q  461 aagactgc------gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 520  Q
    ||| ||||       |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||    
T  23821171 aaggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922927
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttg 447  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||  |||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaacgtcctcttg 33922927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383760
Alignment:
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcccttt 383760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Original strand, 21862044 - 21862137
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21862044 ctcacaatttgcttgtttggtgagtcgaattctcacattttggttgtttgttgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 21862137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855500
Alignment:
Q  383 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| | ||||||| || |||||   |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T
Q  480 ca 481  Q
    ||    
T  27855501 ca 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 838 - 934
Target Start/End: Original strand, 22860737 - 22860837
Alignment:
Q  838 ttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattg-attacacttctcctcc--tttgattctt-tgattgattgcac 933  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  22860737 ttttgattcttctgtttgattgcattgcacttctctcccttttgattcttctgattgcattgcacttctccccccttttggttcttctgattgattgcac 22860836  T
Q  934 t 934  Q
    |    
T  22860837 t 22860837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 440
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417501
Alignment:
Q  381 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 544
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432483
Alignment:
Q  403 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--------cagggtaagactgcgtacaatacac--caaatggtgggat 492  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||         |||||||| ||| |||||||||||   |||||||| ||     
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |  ||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17432432 cttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17432483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 830 - 913
Target Start/End: Original strand, 22860875 - 22860957
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctcctccttt 913  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |  |||||||| || |||||| |||||    
T  22860875 tctccccctattgattcttttgattgattgcattgcacttct-ccccttttggttcttccgattgattgcatttctcccccttt 22860957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 500
Target Start/End: Original strand, 11849031 - 11849145
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaa 483  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||   |||  |||||||||| |||    
T  11849031 ggtaaagttattgtcacgtgactgaaatgttt--ggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaaaa 11849128  T
Q  484 tggtgggatcccttccc 500  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11849129 tggtgggaccccttccc 11849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15865982 - 15865893
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15865982 gggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctg 15865893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19649337 - 19649299
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 414  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19649337 ttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaag 19649299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 711 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 28063691 - 28063624
Alignment:
Q  711 cgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaag-tactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28063691 cgagtgctcacaatt-ggttgtttggtgagtcaggtgctcacaatttggtttctt-ctcccttttgattc 28063624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 592
Target Start/End: Original strand, 13167330 - 13167366
Alignment:
Q  556 tcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttg 592  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13167330 tcagtttgatttggtttcgtttggttcaatttgtttg 13167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 546
Target Start/End: Original strand, 25997750 - 25997786
Alignment:
Q  510 atatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25997750 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 25997786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 843 - 906
Target Start/End: Original strand, 18981350 - 18981413
Alignment:
Q  843 attcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctc 906  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | || |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18981350 attcttttgattgattgcattgcactttttctccttttgattcttctgattgattgcacttctc 18981413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20906837 - 20906783
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  20906837 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgaaccaagttgctctttttt 20906783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1916243 - 1916190
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtt 417  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1916243 tgaggggtaactgtgacgcaactgataaagatgttgtcatataactgaaaggtt 1916190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 696 - 741
Target Start/End: Original strand, 13167366 - 13167411
Alignment:
Q  696 gtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt 741  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13167366 gtttgtttggtgggtcaagtgctcgcaatttgcttgtttggtgagt 13167411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 28063853 - 28063793
Alignment:
Q  545 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagt 606  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  28063853 tttaatttggttcagtttgatttggtttcgtttggttcaa-ttgtttggttgttaggtgagt 28063793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 97)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 362 - 547
Target Start/End: Original strand, 32758212 - 32758397
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32758212 tttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 32758311  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32758312 aggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 32758397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172008
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 21172089  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21172088 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21172008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 364 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 48735303 - 48735122
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct-ggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48735303 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacacggtaa 48735204  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48735203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48735122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10693241 - 10693073
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10693241 ttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagagggtaaggctgcgtacaat 10693142  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10693141 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttt 10693073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 393 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391097
Alignment:
Q  393 gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 42391152  T
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42391151 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 42391097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 543
Target Start/End: Original strand, 42476826 - 42477005
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42476826 tgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgtaaaacaaggtaag 42476925  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42476926 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 385 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871914
Alignment:
Q  385 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 540  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcc 33871914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077852
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||      
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagagtaaag 47077935  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  47077934 ttgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgccttttttt 47077852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 363 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2541203 - 2541019
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caggg 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2541203 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 2541104  T
Q  460 taagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  2541103 taaggctgcgtactatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttt 2541019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 365 - 546
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798806
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttttt 42798806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Original strand, 42805477 - 42805663
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42805477 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 42805576  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42805577 aggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 42805663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426887
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgccctttttt 19426887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 378 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11617756 - 11617589
Alignment:
Q  378 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11617756 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 11617657  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11617656 acaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 34626389 - 34626205
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34626389 tgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaa 34626290  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgccctttttt 34626205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698967
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  463 gactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 22698967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 376 - 546
Target Start/End: Original strand, 27629599 - 27629771
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |    
T  27629599 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtaaa 27629698  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27629699 atacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 27629771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716596
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 47716596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 364 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35334996 - 35334818
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  35334996 tgagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctcgtgtaaaaaacagggtaag 35334897  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35334896 actgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 543
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  390 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgtaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 11741873  T
Q  490 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11741874 gatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557613
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttttt 43557613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662948
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 2663015  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2663014 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcacc 2662948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 365 - 515
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc 515  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 545
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464012
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcg 469  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcg 40463936  T
Q  470 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  40463937 tataatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgccctttt 40464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 408 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591108
Alignment:
Q  408 ctgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccct 507  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggacctt 31591146  T
Q  508 gtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31591145 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 31591108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Original strand, 19265781 - 19265951
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  19265781 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaa 19265879  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  19265880 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttttt 19265951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Original strand, 13805068 - 13805214
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaagactgcgtacaa 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  13805068 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaacaggggtaaggctgtgtacaa 13805166  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  13805167 tacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct 13805214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23419843 - 23419674
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23419843 ttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 23419745  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | |||||| ||| ||||||| | || ||||||||    
T  23419744 atacaccaaatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttt 23419674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 522
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 19266525  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
     ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  19266526 tgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28362314 - 28362167
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||    
T  28362314 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtaca 28362216  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28362215 atacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagct 28362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 547
Target Start/End: Original strand, 7879646 - 7879776
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  7879646 cgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcg 7879745  T
Q  517 ggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7879746 ggagcttcagtgcaccgggttgccctttttt 7879776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 376 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 48123653 - 48123508
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  48123653 ttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcataca 48123555  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||| || |||||||||||    
T  48123554 atacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 394 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233132
Alignment:
Q  394 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggat 492  Q
    |||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  32233186 tccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgccctttttt 32233132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 366 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180218
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaa 5180218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099050
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  485 ggtgggatcccttccc 500  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14099065 ggtgggaccccttccc 14099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409067
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  485 ggtgggatcccttccc 500  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14409082 ggtgggaccccttccc 14409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 543
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgt--catgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-a 481  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| ||||||||| |    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42496017 - 42495917
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42496017 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaa 42495918  T
Q  463 g 463  Q
    |    
T  42495917 g 42495917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732833
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcct--cttgtgtaaaacagggtaagact 466  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  467 gcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcacc 14732833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 366 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148985
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||| ||||  ||||||||||   |||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagac 504  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagac 8148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 366 - 463
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327087
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 18327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 410 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512455
Alignment:
Q  410 gaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctg 18512489  T
Q  509 tatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
      |||||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  18512488 cgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 543
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  397 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 493  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  494 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28078313 - 28078154
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||    
T  28078313 tgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggtaa 28078214  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||    
T  28078213 ggttgcatgcaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 364 - 483
Target Start/End: Original strand, 12473257 - 12473378
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12473257 tgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggta 12473356  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  12473357 aggatgcgtacaatacaccaaa 12473378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 376 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3469348 - 3469176
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa----cagggtaagactgcgta 471  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||||  |||||||||||||    ||||||| |  ||||||    
T  3469348 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgta 3469250  T
Q  472 caatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  3469249 caatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 386 - 499
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aa 482  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  483 atggtgggatcccttcc 499  Q
    || |||||| |||||||    
T  7645031 attgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 365 - 453
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa 453  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 39123857 - 39124031
Alignment:
Q  377 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt----aagactgcgta 471  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    ||| |||||||    
T  39123857 tggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgta 39123955  T
Q  472 caatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  39123956 aaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcaccaagctgccctttt 39124031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 489
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736969
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  487 tgg 489  Q
    |||    
T  6736967 tgg 6736969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 547
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198864
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaa---gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 461  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||| ||||   ||| ||||||||| || ||||||||||   || ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcactttttt 25198864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 430 - 522
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604639
Alignment:
Q  430 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagct 38604639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794598
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaa 7794598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 402 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262193
Alignment:
Q  402 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcc 499  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||   ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  500 cagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |  || |||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttttt 38262193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 421 - 532
Target Start/End: Original strand, 21566445 - 21566559
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  21566445 ggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcatatgcgg 21566544  T
Q  518 gagctctagtgcacc 532  Q
    ||||| |||||||||    
T  21566545 gagctttagtgcacc 21566559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423972
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgc 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||  ||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  469 gtacaatacaccaa 482  Q
     |||| ||||||||    
T  1423985 atacactacaccaa 1423972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 387 - 543
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaa 483  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||||||  | |||||| ||||    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27889395 - 27889312
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  27889395 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgccctttttta 27889312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123713
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaa 44123713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 545 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 11828756 - 11828629
Alignment:
Q  545 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttgg 644  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| || | ||| ||||||||    |||||| ||||||| ||    
T  11828756 tttagtttggttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttgattgtaggatgagacaagatagtgctcacaa----tttgttagtttggtggg 11828661  T
Q  645 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagt 676  Q
    || |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  11828660 tcaagtgctcacaatttggttgtctggtgagt 11828629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787268
Alignment:
Q  436 aacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 534  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  | |||||| |    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  535 gttgccctttt 545  Q
    |||||||||||    
T  35787278 gttgccctttt 35787268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 15108520 - 15108427
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatg 514  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15108520 gttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaaaccctgtgtatg 15108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 508
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408556
Alignment:
Q  423 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctg 1408556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 686 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11828653 - 11828573
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtttcttc 765  Q
    ||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11828653 ctcacaatttggttgtctggtgagtcgggtgctcacattttggttgtttggtgagttaagtactcacaatttggtttcttc 11828573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 499
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203531
Alignment:
Q  409 tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcc 499  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 700 - 779
Target Start/End: Original strand, 44338386 - 44338465
Alignment:
Q  700 gtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44338386 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 44338465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 685 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 46963895 - 46963788
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattcctttg 784  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |     
T  46963895 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttcttctcccctttttattcttctc 46963796  T
Q  785 attgattg 792  Q
    ||||||||    
T  46963795 attgattg 46963788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 685 - 779
Target Start/End: Original strand, 44338279 - 44338373
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44338279 actcataatttgcttgtttggtgagtcgagttctcacattttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 44338373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 454
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447633
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaa 21447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa- 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||| ||| | |||     
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaaag 42101945  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgc 529  Q
    |||||||| || ||||| |||||||  ||| ||| |||| ||||||    
T  42101944 tggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 553 - 674
Target Start/End: Original strand, 6530526 - 6530647
Alignment:
Q  553 cgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggtctagtgc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||| | |||   ||||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||     
T  6530526 cgttcagtttgatttggattcgttttgttcaatttgtttgattgttgggtgagtcaagatagtattcacaattggtttgtctgtttggtgagtcaaatgt 6530625  T
Q  653 tcacaatttagttgttgggtga 674  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  6530626 tcacaatttggttgtttggtga 6530647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 11828693 - 11828629
Alignment:
Q  677 aagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt 741  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11828693 aagatagtgctcacaatttgttagtttggtgggtcaagtgctcacaatttggttgtctggtgagt 11828629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 697 - 760
Target Start/End: Original strand, 21813823 - 21813887
Alignment:
Q  697 tttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggtt 760  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21813823 tttgtttggtgagtcaagtgctcacactttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtt 21813887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 532
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231680
Alignment:
Q  427 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| |    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  525 agtgcacc 532  Q
    ||||||||    
T  23231673 agtgcacc 23231680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 698 - 779
Target Start/End: Original strand, 21813855 - 21813938
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtg-agtaagtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21813855 ttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggttgcttggtgaaataagtacccacaatttggttttttctcccccttttgattc 21813938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093437
Alignment:
Q  452 aaacagggtaagactgcgtacaatacacca-aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || | || |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacaccataatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttttt 39093437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 676
Target Start/End: Original strand, 21813745 - 21813867
Alignment:
Q  554 gttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggtctagtgct 653  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  | |||||| | ||   |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  21813745 gttcggtttgatttggattcggttggttcaatttgtttggttgttaggcgagtcaagatattcctcacaattggtttatttgtttggtgagtcaagtgct 21813844  T
Q  654 cacaatttagttgttgggtgagt 676  Q
    |||| ||| |||||| |||||||    
T  21813845 cacactttggttgtttggtgagt 21813867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23619088 - 23618975
Alignment:
Q  432 tggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||  | ||| |||||| |||||||     
T  23619088 tggaaacaacctct-gtataaaacagagtaagcttgtgtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcag 23618990  T
Q  532 caggttgcccttttt 546  Q
    | |||||||||||||    
T  23618989 cgggttgcccttttt 23618975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 45019006 - 45018923
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaa----tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||| ||||||    |||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45019006 ctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 871
Target Start/End: Original strand, 26403154 - 26403195
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 871  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26403154 tctcccccttttgattcttttgattgattgcattgcacttct 26403195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29140530 - 29140490
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29140530 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggt 29140490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 548
Target Start/End: Original strand, 45811919 - 45811985
Alignment:
Q  481 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  45811919 aaatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgccctttttta 45811985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 519
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  452 aaacagggtaagactgcgtacaatacac--caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 497 - 547
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602585
Alignment:
Q  497 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 36602585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28685310 - 28685266
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 414  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28685310 gtaactttagtgcaactgttaaagttgttgtcatgtgactgaaag 28685266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 465 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36267897 - 36267829
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc-cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36267897 ctgcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcacc 36267829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 561 - 645
Target Start/End: Original strand, 44338186 - 44338270
Alignment:
Q  561 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggt 645  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  44338186 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 44338270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 664 - 739
Target Start/End: Original strand, 6530567 - 6530647
Alignment:
Q  664 ttgttgggtgagt-aagatagtactcacaattggtt----tgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtga 739  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  6530567 ttgttgggtgagtcaagatagtattcacaattggtttgtctgtttggtgagtcaaatgttcacaatttggttgtttggtga 6530647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065678
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||   | ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| | |||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaaatagggtaaagctgcatacaataaagcaaat 22065662  T
Q  485 ggtgggatcccttccc 500  Q
     ||| || ||||||||    
T  22065663 agtgagaccccttccc 22065678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23066003 - 23065924
Alignment:
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  | |||| ||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  23066003 tgcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggattgccctttt 23065924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 779
Target Start/End: Original strand, 44338476 - 44338558
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaa-gtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44338476 ttgtttggtgagtagagttctcaca-tttggttgtctggtgagtagtgtgctcacaatttggtttcttctcccccttttgattc 44338558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 903
Target Start/End: Original strand, 44338638 - 44338689
Alignment:
Q  852 attgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacactt 903  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  44338638 attgatttcattgcacttctcccccttttgattcttttgattgattgcactt 44338689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 46963730 - 46963628
Alignment:
Q  812 ttcttctgtttgattg--tctctcccccttttgattcttctgattg-attgcattgcacttctgc-cccatttgattcctttgattgattacacttctcc 907  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||| | ||||||||| ||||||| |    
T  46963730 ttcttctgattgattgcatttctccccctattggttcttctgattgcattgcattgcacttctccactcttttgattcttctgattgattgcacttcttc 46963631  T
Q  908 tcc 910  Q
    |||    
T  46963630 tcc 46963628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 801 - 859
Target Start/End: Original strand, 10236423 - 10236481
Alignment:
Q  801 cccctattggtttcttctgtttgattgtctctcccccttttgattcttctgattgattg 859  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  10236423 cccctcttggtttcttctgttttatagtctctgtccctattgattcttcttattgattg 10236481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  442 ctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaacagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 366 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45019056 - 45019002
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcg 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||    
T  45019056 aggggtaaccttggcgcaactggtaaaggtcctgtcatgtgactggaaggctgcg 45019002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 807 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 11828583 - 11828531
Alignment:
Q  807 ttggtttcttctgtttgattgtctctcccccttttgattcttctgattgattgc 860  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  11828583 ttggtttcttctgtttgattgtct-ttctcctattgattcttctggttgattgc 11828531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 830 - 871
Target Start/End: Original strand, 21813922 - 21813963
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 871  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  21813922 tctcccccttttgattcttctgtgtgattccattgcacttct 21813963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 34725278 - 34725097
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725278 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 34725179  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34725178 gctgcgtacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 34725097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214670
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaacagggtaagg 47214587  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47214588 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattaccctttttt 47214670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478278
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 38478362  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38478361 ctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttta 38478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632556
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 32632638  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32632637 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttccctttt 32632556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812534
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaagagggtaagg 45812617  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45812616 ctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 45812534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247949
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttttta 46247949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Original strand, 14617014 - 14617197
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggta 461  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  14617014 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggta 14617113  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  14617114 aggttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 14617197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 369 - 545
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414596
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgc 468  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaacaggttaaggctgc 19414519  T
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19414520 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 19414596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004089
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaa 20004174  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20004173 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 20004089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944807
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttttt 18944807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991966
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccattttta 46991966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395725
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgc 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  469 gtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 30395725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 402 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253185
Alignment:
Q  402 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccca 501  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 35253230  T
Q  502 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35253229 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 35253185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126836
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgt 470  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgt 12126911  T
Q  471 acaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  12126910 acaatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgccctttt 12126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402257
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt--aag-ac 465  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |    
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttc 45402175  T
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  45402176 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccgttttt 45402257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 23768486 - 23768334
Alignment:
Q  380 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23768486 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 23768387  T
Q  478 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 530  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23768386 accaaatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 364 - 550
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201813
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  462 agactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttagt 550  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttttttagt 27201813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668386
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt-----gactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacag 457  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  458 ggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474439
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaa 27474356  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
      |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacactgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 27474439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 41319989 - 41319805
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 460  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  41319989 ttgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 41319890  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||    
T  41319889 aaggctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccctttt 41319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18724714 - 18724543
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  18724714 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtaca 18724616  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  18724615 atacaccaaatcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccaagctgccccttttt 18724543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 384 - 547
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925261
Alignment:
Q  384 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgccttttttt 6925261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930105
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggtaag 22930149  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
      || | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22930148 gttgtg-acaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctg 22930105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197204
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || || |||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgccctttttt 8197204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741955
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct-ggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagac 465  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || | |||||||| || |||| |   ||||||||||||| |    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  466 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttttt 18741955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 388 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468284
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatg 485  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  486 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctc 523  Q
    || ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagctc 25468284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 376 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6983978 - 6983810
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  6983978 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaat 6983880  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||  || || |||||| | ||||||| || |||||||||    
T  6983879 acaccaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccctttt 6983810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Original strand, 11596502 - 11596648
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11596502 ttggcgcaac-ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtataa 11596600  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  11596601 tacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19932934 - 19932755
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||| ||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  19932934 tgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggta 19932838  T
Q  462 agactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||  || |  |||||||||||||||||||    
T  19932837 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 20036209 - 20036343
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaagactgcgtac 472  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||| ||||| |    
T  20036209 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttc 20036307  T
Q  473 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  20036308 aatacaccaaatggtggaaccccttcccggaccctg 20036343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2435956 - 2435798
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  2435956 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtaca 2435858  T
Q  474 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||    ||||||||||| |||||||||    
T  2435857 atacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcacc 2435798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 429 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382211
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| || |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  528 gcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgccctttttt 31382211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 545
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005284
Alignment:
Q  404 gtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcc 499  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  500 cagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | |||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgccctttt 35005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4430196 - 4430080
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4430196 ttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 4430097  T
Q  474 atacaccaaatggtggg 490  Q
    |||||||||||||||||    
T  4430096 atacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378738
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||        || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaag-------tgag-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 10378793  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    ||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  10378792 tgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117777
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacacc--aa 482  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtat-atgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcacc 35117777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 545
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939623
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactg 467  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||  ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  468 cgtacaatacacc--aaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||  |||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 9939623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 451 - 544
Target Start/End: Original strand, 4349703 - 4349796
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4349703 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4349796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 376 - 491
Target Start/End: Original strand, 33222972 - 33223089
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  33222972 ttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtacaa 33223071  T
Q  475 tacacc-aaatggtggga 491  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33223072 tacaccaaaatggtggga 33223089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 430 - 547
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796626
Alignment:
Q  430 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  528 gcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgccctttttt 23796626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 547
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701732
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaat 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||||  ||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaaaat 19701669  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  19701670 ggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctaccctttttt 19701732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 483
Target Start/End: Original strand, 22327088 - 22327196
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||     
T  22327088 ttggcgcaac-ggcaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacg 22327186  T
Q  474 atacaccaaa 483  Q
    || |||||||    
T  22327187 atgcaccaaa 22327196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485131
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatg 485  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 44485168  T
Q  486 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    || ||| |||||||| || |||   ||||||||||||    
T  44485167 gttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagct 44485131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470407
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 17470407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Original strand, 35019219 - 35019390
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  |||| |||| ||||    
T  35019219 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcataca 35019317  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  35019318 atacaccaattggtggga-cccctcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgccatttttt 35019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 440
Target Start/End: Original strand, 34714598 - 34714675
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  34714598 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 366 - 487
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564445
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggt 487  Q
      |||||||||| |||||||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaatggt 24564445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 546
Target Start/End: Original strand, 50811928 - 50812100
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtac 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||    
T  50811928 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtac 50812026  T
Q  473 aatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||   |||||  |||||||||||| || |||||  || ||||||||||    
T  50812027 aatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttttt 50812100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 697 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 15630108 - 15630025
Alignment:
Q  697 tttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15630108 tttgtttggtgagtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattc 15630025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 420 - 542
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||   ||| |||| |||||||  ||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  517 ggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 422 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 45264524 - 45264411
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  45264524 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccctgcatatgcggg 45264425  T
Q  519 agctctagtgcacc 532  Q
    |||| |||||||||    
T  45264424 agctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 482  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290231
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaa--acagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaa 25290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136663
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa- 483  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||   || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||||     
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaaa 27136712  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27136711 tggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcacc 27136663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1517404 - 1517308
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1517404 aaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 1517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 547
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768300
Alignment:
Q  452 aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgccctttttt 43768300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15511320 - 15511150
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcg--ta 471  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |   || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||    
T  15511320 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggata 15511222  T
Q  472 caatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||  |||| | ||||| ||||||||| || ||||||    
T  15511221 caatacaccaaaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335305
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagact 466  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||   |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  18335365 gcgtacaatacatcaaatgatgggaccctttcctagaccatgtgtatacgggagctttagt 18335305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 487
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910319
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  484 tggt 487  Q
    ||||    
T  52910316 tggt 52910319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 522
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  454 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435985
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaa 2435985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 686 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 2072444 - 2072366
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtttct 763  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2072444 ctcacaatttgattgtttgatgagtcgagtgctcatactttggttgtttggtgagttatgtactcacaatttggtttct 2072366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 452
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 452  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 34679390 - 34679274
Alignment:
Q  374 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgta 471  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  |  |||| | |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34679390 ctttggcgcaac-ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 34679292  T
Q  472 caatacaccaaatggtgg 489  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  34679291 ctatacatcaaatggtgg 34679274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 547
Target Start/End: Original strand, 50606498 - 50606564
Alignment:
Q  481 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50606498 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 50606564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 532
Target Start/End: Original strand, 23371124 - 23371268
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||     
T  23371124 gtaaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtacaatacaccaaatgc 23371223  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||    
T  23371224 tgggacccctt-ccagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcacc 23371268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272429
Alignment:
Q  398 tgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggg 490  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg 31272429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaat 484  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 530
Target Start/End: Original strand, 43207528 - 43207640
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||     
T  43207528 ggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcga 43207627  T
Q  518 gagctctagtgca 530  Q
    ||||| |||||||    
T  43207628 gagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974073
Alignment:
Q  399 gtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatccct 496  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  497 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||| ||| || | |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgccctttt 19974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249453
Alignment:
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4249453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249777
Alignment:
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4249777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250101
Alignment:
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4250101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148974
Alignment:
Q  430 cctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagt 34148977  T
Q  528 gca 530  Q
    |||    
T  34148976 gca 34148974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 686 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 2075974 - 2075896
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtttct 763  Q
    ||||||||| | |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2075974 ctcacaatttggttgtttgacgagtcgagtgctcatactttggttgtttggtgagttatgtactcacaatttggtttct 2075896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 42304302 - 42304205
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  42304302 aaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 42304205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 452
Target Start/End: Original strand, 22151479 - 22151568
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 452  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22151479 ttgagggataattttagcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 522
Target Start/End: Original strand, 30682844 - 30682948
Alignment:
Q  418 gcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||    
T  30682844 gcgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtac-atacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcg 30682942  T
Q  517 ggagct 522  Q
    ||||||    
T  30682943 ggagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 31442515 - 31442396
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 517  Q
    ||||||||| | |||||||||| || |||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||    
T  31442515 gttcaagtcttagaaacagccttttatgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgg 31442416  T
Q  518 gagctctagtgcaccaggtt 537  Q
    ||||| | ||||||| ||||    
T  31442415 gagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19825161 - 19825091
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatt 755  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19825161 ctcacaatttggttgtttggcgagtcgagtgctcacaatttggttgtttggtgagttaagtgctcacaatt 19825091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 491
Target Start/End: Original strand, 10163736 - 10163864
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |  ||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||| |   | |||    
T  10163736 gaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaaaatatgataa 10163835  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10163836 gattgtatacaatacatcaaatggtggga 10163864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 428 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169111
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagct 20169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 798 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 2072364 - 2072299
Alignment:
Q  798 cttcccctattggtttcttctgtttgattgtctctcccccttttgattcttctgattgattgcattgc 865  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2072364 cttcccgtcttggtttcttctgtttggttgtctct--cccttttgattcttctgattggttgctttgc 2072299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 798 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 2075894 - 2075829
Alignment:
Q  798 cttcccctattggtttcttctgtttgattgtctctcccccttttgattcttctgattgattgcattgc 865  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2075894 cttcccgtcttggtttcttctgtttggttgtctct--cccttttgattcttctgattggttgctttgc 2075829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 854 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 15629929 - 15629861
Alignment:
Q  854 tgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttct-cctcctttgattcttt 921  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15629929 tgattgcattgcacttctccccctttttgttcttttgattgattgcacttctccctcctttgattcttt 15629861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19386626 - 19386575
Alignment:
Q  494 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19386626 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgaaccaggttgctctttt 19386575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 25554891 - 25554817
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25554891 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 28894636 - 28894561
Alignment:
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    ||||||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28894636 tgcgtacaatacatcaaatggtaaaaccccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 732 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 3775226 - 3775100
Alignment:
Q  732 tttggtgagtaa-gtactcacaatttggtttcttcct-cccttttgattcctttgattgattggtttgcttcccctattggtttcttctgtttgattgtc 829  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||  || | ||| || | ||||| || |||||||      
T  3775226 tttggtgagtaaagtactcacaatttggattgtttctgcccttttgattcttttgattgattgctt--ctcctcct-tttgattcttttgattgattgct 3775130  T
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattg 859  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3775129 tctccccattttgattcttctgatcgattg 3775100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 465 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 4430078 - 4430008
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  || ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  4430078 ctgcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgctccagg 4430008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4587630 - 4587568
Alignment:
Q  477 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgc 539  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  4587630 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 451 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20999943 - 20999849
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||  || ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20999943 aaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 20999849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21910742 - 21910693
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccc 500  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21910742 aaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 21910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 491
Target Start/End: Original strand, 46859131 - 46859172
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtggga 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46859131 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtggga 46859172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 432 - 487
Target Start/End: Original strand, 21723728 - 21723784
Alignment:
Q  432 tggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21723728 tggaaacagcctcttgtataaaaatagggtaaggctgagtacaatacaccaaatggt 21723784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 479 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33594196 - 33594144
Alignment:
Q  479 ccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  33594196 ccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 33594144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 9168296 - 9168197
Alignment:
Q  838 ttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattg-attacacttctcctcc-tttgattctt-tgattgattgcact 934  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9168296 ttttaattcttctgatggattgcattgcacttcccccccttttcattcttcttattgcattgcacttctcctccttttgattcttctgatcgattgcact 9168197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 49546078 - 49546024
Alignment:
Q  374 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  49546078 ctttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtggctgaaaggttacaggttcaagt 49546024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 508
Target Start/End: Original strand, 6358190 - 6358244
Alignment:
Q  455 cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6358190 cagggtaaagctgcgtacaaaacaccaaaatggtgggaccccttcccagaccctg 6358244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20982843 - 20982773
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 521  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||    
T  20982843 aaaatagggtaaggctgccaacaatacacctaatggtgggatctcttctcggaccctgcgtatgcgggagc 20982773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 465 - 533
Target Start/End: Original strand, 7074595 - 7074664
Alignment:
Q  465 ctgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 533  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7074595 ctgcgtacaatacaccaaaattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacca 7074664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 724 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 15629989 - 15629924
Alignment:
Q  724 tttggttgtttggtgagta-agtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattcctttgattg 788  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  15629989 tttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtttcttctccccttatgattcttctgattg 15629924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 546
Target Start/End: Original strand, 16120823 - 16120876
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16120823 cccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttttt 16120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 49722726 - 49722641
Alignment:
Q  392 agttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aacagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||||||  || || ||||||||| |||||||||||    
T  49722726 agttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgtaaaataatagggtaagattgcgtacaata 49722641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054145
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaga 11054228  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11054227 ctgcgtacaatacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 11054145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 362 - 544
Target Start/End: Original strand, 20224935 - 20225117
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20224935 tttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagggta 20225034  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20225035 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 48599005 - 48598823
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599005 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 48598906  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48598905 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 48598823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528527
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 47528610  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47528609 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 47528527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648395
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 5648311  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttttt 5648395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 363 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6430808 - 6430627
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 461  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6430808 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 6430709  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  6430708 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Original strand, 30639333 - 30639517
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30639333 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggtaa 30639432  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  30639433 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttttt 30639517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16408773 - 16408598
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16408773 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 16408674  T
Q  474 atacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16408673 atacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 16408598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 5306845 - 5306657
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5306845 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaa 5306746  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatg----cgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||    |||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgccctttttt 5306657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 376 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473621
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaacagggtaaggctgcatacaat 8473691  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccag--accctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8473690 acaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 389 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832311
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 9832369  T
Q  489 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9832368 ggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttttt 9832311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 403 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  403 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccag 502  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  503 accctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 541
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647098
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501927
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 23501927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 384 - 543
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  384 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 368 - 545
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911700
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 465  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  466 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccctttt 16911700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 391 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043392
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  489 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  17043449 ggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta-tgcaccaggctgccccttttt 17043392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 392 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077793
Alignment:
Q  392 agttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgaga 39077849  T
Q  492 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
       ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39077848 catctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 39077793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 24225013 - 24225186
Alignment:
Q  70 gtttggatggttttgagcatgcttttgaaattaattgcatcactcatcaataatttggattttagagacatagaagttattcttttaccatggtatttcc 169  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24225013 gtttggatggttttgagcacg-ttttgaaattaattgcatcaatcatcaatattttggattttagagacgtagaagttattctttcaccatggtatttac 24225111  T
Q  170 ttg-----tttctttgatatacttgtcgtcactggttaatgattgttcggtttgctctgattgttggtcgatatgta 241  Q
    |||     ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  24225112 ttgtttaatttctttg--atgcttgtcgtcattggttaatgtttgttcggtctgctccggttgttggttgatatgta 24225186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 547
Target Start/End: Original strand, 47443928 - 47444095
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactga----aaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47443928 tggtaaagttgttctcatgtgaccgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 47444027  T
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  47444028 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgccctttttt 47444095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 391 - 546
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175202
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctgg-aaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  488 gggatccctt-cccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 54175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363130
Alignment:
Q  384 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||     
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  481 -aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 44363130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567309
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttttta 35567309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256397
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 13256397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 386 - 532
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027971
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcacc 19027971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 491
Target Start/End: Original strand, 14590790 - 14590920
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 460  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  14590790 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 14590889  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14590890 aaggctgcatacaatacatcaaatggtggga 14590920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 368 - 545
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983970
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagac 465  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||      
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgccctttt 14983970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 397 - 546
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463258
Alignment:
Q  397 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  495 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccaggctacccttttt 25463258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 389 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690176
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---------cagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttt 30690176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 365 - 530
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 530  Q
    |  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  37494905 ggttgcatacaatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 428 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639655
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  525 agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgccctttttt 20639655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 532
Target Start/End: Original strand, 54730199 - 54730375
Alignment:
Q  361 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacag 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||    
T  54730199 gtttgatgggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaatag 54730298  T
Q  458 ggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    | |||| ||||||| |||||||||  |||| ||| | |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54730299 gataaggctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 54730375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660544
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccccttttt 10660544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874689
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccccttttt 10874689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352577
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-------aaaacagggtaa 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  463 g----actgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |     ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctttttt 30352577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 419 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 10277882 - 10277755
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 518  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10277882 cgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcggg 10277783  T
Q  519 agctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||    
T  10277782 agttctagtgaaccggattgcccttttt 10277755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405224
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 461  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||       ||| |||||||||||||||||||||   |||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 377 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 49938759 - 49938615
Alignment:
Q  377 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   | |||||||    
T  49938759 tggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaat 49938663  T
Q  476 acacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  49938662 acaccaaaatggtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 376 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 30496490 - 30496334
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  30496490 ttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacacgggtaaggctgcatacaat 30496391  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||  ||||  |||||| |||||||||    
T  30496390 acaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcacc 30496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 394 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018833
Alignment:
Q  394 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggat 492  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  493 cccttcccagacc 505  Q
    |||||||||||||    
T  41018845 cccttcccagacc 41018833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  394 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  492 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 521  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 546
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629186
Alignment:
Q  431 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  529 caccaggttgcccttttt 546  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25629169 caccgggttgcccttttt 25629186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 374 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 47441701 - 47441566
Alignment:
Q  374 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgta 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  47441701 ctttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgta 47441603  T
Q  472 caatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  47441602 caatacaccaaatggttggaccccttcccggaccctg 47441566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcggg-ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||  |||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaa 55766548  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||| |||| ||  |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  55766547 ggctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830721
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgg-gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaa 55830803  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
      |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55830802 tgctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 366 - 522
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967133
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
      ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagct 54967133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908633
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag-gttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  484 -tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20908697 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgccctttttt 20908633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 423 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987831
Alignment:
Q  423 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  521 ctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || || |||||| || |||| ||||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgccttttttt 9987831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315390
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaa 17315390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 547
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786747
Alignment:
Q  473 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 38786747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 387 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487186
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagactgcgtacaatacac-caaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||  |||    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  484 tggtgggat 492  Q
    |||||||||    
T  487194 tggtgggat 487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 429 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc-gggagctctag 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  527 tgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||| | ||||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478792
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggt 487  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||     |||||||||||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  488 gggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggcccttt 32478792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029059
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacac-caaa 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag-gca-caggatgccctttttt 39029059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 522
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796910
Alignment:
Q  431 ctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 483
Target Start/End: Original strand, 25343153 - 25343261
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25343153 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 25343251  T
Q  474 atacaccaaa 483  Q
    ||||||||||    
T  25343252 atacaccaaa 25343261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42164317 - 42164224
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcg 469  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42164317 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 544
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225211
Alignment:
Q  454 acagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 435 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865037
Alignment:
Q  435 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcacc 51865050  T
Q  533 aggttgccctttt 545  Q
     |  |||||||||    
T  51865049 ggactgccctttt 51865037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 531
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489210
Alignment:
Q  423 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  520 gctctagtgcac 531  Q
    ||| | ||||||    
T  21489199 gctttcgtgcac 21489210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 616 - 792
Target Start/End: Original strand, 54147639 - 54147813
Alignment:
Q  616 gctcacaatcggtttgtttgtttggttggtctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagt 715  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||| ||   || |||||| ||   |||||||||| ||| |||    
T  54147639 gctcactattggattgtttgtttggtgggtcaagtgctcataatttgtttgtttggtgagtcag---gtgctcacactttagttgtttggtgagtctagt 54147735  T
Q  716 gctcacactttggttgtttggtgagtaag-tactcacaatttggtttcttcctcccttttgattcctttgattgattg 792  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  54147736 tctcacattttggttgtttggtgagtttggtgctcacaatttggtttctttcccccttttgattcttctgattgattg 54147813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 389 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580205
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tg 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  486 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | | || ||||||   |||| ||| |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttggacc-tgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgccctttttt 23580205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30581636 - 30581481
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtac 472  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||  || ||||    
T  30581636 ttggcgcaac-gctaaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtac 30581538  T
Q  473 aatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||    
T  30581537 aatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 685 - 777
Target Start/End: Original strand, 16870646 - 16870738
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgat 777  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16870646 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgat 16870738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580862
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||   |||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtc-tggaaac---ctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  486 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
     | ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 3580862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 545
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038188
Alignment:
Q  399 gtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  496 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | ||| |||||||  ||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccctttt 7038188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 54640508 - 54640431
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54640508 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa 54640431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313099
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagc 441  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 452
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035289
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 452  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaa 43035289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 547
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484371
Alignment:
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 32484371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 547
Target Start/End: Original strand, 28494222 - 28494289
Alignment:
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28494222 caaatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgccttttttt 28494289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 541
Target Start/End: Original strand, 36589710 - 36589876
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||   |||    
T  36589710 ttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttgaca 36589807  T
Q  474 atacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||   ||||| | |||||||||||| | ||||||| || |||||    
T  36589808 gtacaccaaaatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 36816478 - 36816381
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat-ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36816478 aaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttttt 36816381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 481
Target Start/End: Original strand, 51420539 - 51420646
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtt-gcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtac 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  51420539 ttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtac 51420637  T
Q  473 aatacacca 481  Q
    |||||||||    
T  51420638 aatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12711542 - 12711450
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |  ||||||| | || |||||||||  |||||||||    
T  12711542 aaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836484
Alignment:
Q  470 tacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgccctttttt 33836484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629308
Alignment:
Q  396 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatc 493  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||| |||| |    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  494 ccttcccagacc 505  Q
    ||||||| ||||    
T  32629319 ccttcccggacc 32629308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 741
Target Start/End: Original strand, 54147571 - 54147730
Alignment:
Q  583 aatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggtctagtgctcacaat----ttagttgttgggtgagtaa 678  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    ||  ||||| |||| || |    
T  54147571 aatttgtttggttgttaggtgagtcaagatagtcctcacaattggtttgtttgtttggtaggtcaagtgctcactattggattgtttgtttggtgggtca 54147670  T
Q  679 gatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt 741  Q
       ||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54147671 ---agtgctcataatttgtttgtttggtgagtcaggtgctcacactttagttgtttggtgagt 54147730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755908
Alignment:
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38755908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 450 - 528
Target Start/End: Original strand, 16494258 - 16494338
Alignment:
Q  450 taaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16494258 taaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtg 16494338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 507
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357319
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aa 482  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||| || |||||||  ||||||||||||| ||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccct 507  Q
    |||| |||| | |||||||||||||    
T  44357295 atggcgggacctcttcccagaccct 44357319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 49938608 - 49938491
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  49938608 ttggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtccaa 49938509  T
Q  475 taca-ccaaatggtggga 491  Q
    | || | |||||||||||    
T  49938508 ttcatcaaaatggtggga 49938491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 544
Target Start/End: Original strand, 11394923 - 11394987
Alignment:
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11394923 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 544
Target Start/End: Original strand, 11404650 - 11404714
Alignment:
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11404650 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 12257752 - 12257688
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 451  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12257752 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 408
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20373974 - 20373898
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcc 442  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |  |||||| |||| |||||||||    
T  20373974 aggggtaactttggcgcaactggtcaagttgttctcatatgactgaaatgtcacatgttcaattccttgaaacagcc 20373898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 12047823 - 12047721
Alignment:
Q  438 cagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 537  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||| || |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||| |    
T  12047823 cagcctattgttaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccagttgat-ggacccattcccataccctatgtatgcgggacctatagtgcaccaggct 12047725  T
Q  538 gccc 541  Q
    ||||    
T  12047724 gccc 12047721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 457
Target Start/End: Original strand, 41549358 - 41549428
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag 457  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41549358 ggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaacag 41549428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10379997
Alignment:
Q  402 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggg 490  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaatagtggg 10379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29879679 - 29879634
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 409  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29879679 tgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgact 29879634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 547
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532130
Alignment:
Q  494 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 35532130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553937
Alignment:
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 544
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718702
Alignment:
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttt 44718702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 546
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323037
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 56323037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 838 - 897
Target Start/End: Original strand, 16871155 - 16871215
Alignment:
Q  838 ttttgattcttctgattgattgcattgcacttct-gccccatttgattcctttgattgatt 897  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||    
T  16871155 ttttgattcgtctgattgattgcattgcacttctctccccttttgattcttctgattgatt 16871215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 48327858 - 48327763
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||   |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||    
T  48327858 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggttacccttt 48327763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 725 - 788
Target Start/End: Original strand, 54147869 - 54147933
Alignment:
Q  725 ttggttgtttggtgagta-agtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattcctttgattg 788  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  54147869 ttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattcttctgattg 54147933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 833 - 913
Target Start/End: Original strand, 16871079 - 16871155
Alignment:
Q  833 cccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctcctccttt 913  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| || | |||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  16871079 cccccttttgattcttctgat----tgcattgcacttctcccacttttggttcttctgattgattgcacttctcccccttt 16871155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079704
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgctaaatggtggga 17079704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 544
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388311
Alignment:
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25388311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 698 - 759
Target Start/End: Original strand, 42265431 - 42265492
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggt 759  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  42265431 ttgtttggtgagtcgagt-ctcacaatttggttgtttggtgattcaagtgctcacaatttggt 42265492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 376 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50856405 - 50856344
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaac 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  50856405 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaac 50856344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 547
Target Start/End: Original strand, 8820581 - 8820646
Alignment:
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  8820581 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgcatcagattgtcctttttt 8820646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 503
Target Start/End: Original strand, 14783722 - 14783806
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccaga 503  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||  ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14783722 ggttcaagttctgtaaacagtcttttgtgtaaaaaacagaataaaattgcatacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaga 14783806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 682 - 735
Target Start/End: Original strand, 24225498 - 24225551
Alignment:
Q  682 agtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttg 735  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24225498 agtactcacaatttggttgtttggtgaatcgagtgcttacaatttggttgtttg 24225551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 365 - 546
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30714
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaggg 30632  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30633 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 364 - 546
Target Start/End: Original strand, 1217065 - 1217247
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217065 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 1217164  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1217165 gctgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 1217247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 369 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  369 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgc 468  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaggctgc 22122993  T
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22122992 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 364 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40272994 - 40272808
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40272994 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 40272895  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40272894 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 40272808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 544
Target Start/End: Original strand, 39203491 - 39203671
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203491 tgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 39203590  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39203591 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730599
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 13730599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13628975 - 13628789
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggt 460  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13628975 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 13628876  T
Q  461 aagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13628875 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13628789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 363 - 543
Target Start/End: Original strand, 22609741 - 22609921
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggta 461  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22609741 ttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 22609839  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22609840 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421031
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgccctttttt 46421031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 363 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7697068 - 7696893
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7697068 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaa 7696969  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||      |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7696968 ggctgcgtacaatacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914034
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccctttt 12914034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 378 - 547
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869866
Alignment:
Q  378 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  477 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctttttt 26869866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926216
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||     
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-------gtaagg 52926299  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  52926298 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctttttt 52926216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 16735415 - 16735598
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggta 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16735415 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 16735514  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||    
T  16735515 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccctttt 16735598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8247871 - 8247683
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8247871 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 8247772  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||    
T  8247771 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccctatttt 8247683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366719
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  464 actgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccctttt 29366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Original strand, 31592879 - 31593004
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31592879 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcggg 31592978  T
Q  519 agctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31592979 agctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 365 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411834
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 463  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6411903  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  6411902 gctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcacc 6411834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Original strand, 26573115 - 26573287
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  26573115 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 26573213  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  26573214 atacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccctctttt 26573287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 364 - 527
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607345
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggta 9607277  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    || ||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9607278 aggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 547
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943150
Alignment:
Q  392 agttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgg 489  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  490 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgccttttttt 7943150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 438 - 548
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797381
Alignment:
Q  438 cagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15797271 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtt 15797370  T
Q  538 gccctttttta 548  Q
    |||||||||||    
T  15797371 gccctttttta 15797381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 362 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5173905 - 5173717
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacaggg 459  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  5173905 tttgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaag 5173806  T
Q  460 taagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||  ||| | |||||||||  ||||||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5173805 taaggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 5173717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 365 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870025
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 10870033  T
Q  464 actgcgta 471  Q
     |||||||    
T  10870032 gctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420641
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaat 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaaaat 34420703  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  34420702 ggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttttt 34420641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 546
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516571
Alignment:
Q  397 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc---aaatggtggga 491  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  492 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
     |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495717
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 4495717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10795552 - 10795423
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  10795552 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatg 10795453  T
Q  515 cgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10795452 cgggagcttcagtgcaccaggttgcccttt 10795423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 447 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34771461 - 34771362
Alignment:
Q  447 gtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34771461 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttt 34771362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 429 - 546
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484850
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  526 gtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgcccttttt 54484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 45620998 - 45620881
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtac 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  45620998 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtac 45620900  T
Q  473 aatacaccaaatggtggga 491  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  45620899 aatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 547
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944630
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaat 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaaaat 25944567  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  25944568 ggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgccctttttt 25944630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 439 - 546
Target Start/End: Original strand, 26292382 - 26292489
Alignment:
Q  439 agcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26292382 agcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggttg 26292481  T
Q  539 cccttttt 546  Q
     |||||||    
T  26292482 tccttttt 26292489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996563
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaa 483  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaaaa 53996626  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  53996625 tggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 53996563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 421 - 544
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||| || |||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  517 ggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525567
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || ||||| |  | ||   |||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  12525482 aggctgcgaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctctttttt 12525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374341
Alignment:
Q  404 gtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttccc 500  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  501 agaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagctttagttcaccaggctgccatttttta 54374341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 391 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928169
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || ||| |||||||||| ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  489 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 30928169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 400 - 528
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  400 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca-aatggtgggatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  498 cccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 432 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013469
Alignment:
Q  432 tggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagt 49013490  T
Q  528 gcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  49013489 gcaccgggttgccctttttta 49013469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 25517358 - 25517169
Alignment:
Q  361 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagt--cctggaaacagcctcttgtgtaaaa---c 455  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || | | |   |||||||||| ||||||||||||||   |    
T  25517358 gttttagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaac 25517259  T
Q  456 agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | | || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25517258 aagatatggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccctttt 25517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 376 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 45949010 - 45948850
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaa---aggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgt 470  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||| |    
T  45949010 ttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcat 45948912  T
Q  471 acaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  45948911 acaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 45948850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731147
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcacc 19731147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Original strand, 33235526 - 33235687
Alignment:
Q  385 ctggtaaagttgttgtcatgtgac-tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacacc 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||     
T  33235526 ctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacact 33235625  T
Q  481 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33235626 aaatggtggga-cccctcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 435 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786209
Alignment:
Q  435 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 530  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||| |||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  531 ccaggttgcccttttttag 549  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  45786227 ccgggttgccctttattag 45786209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 469 - 548
Target Start/End: Original strand, 24577917 - 24577996
Alignment:
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24577917 gtacaatacactaaatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgccctttttta 24577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139515
Alignment:
Q  400 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatccc 495  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  496 ttcccagacc 505  Q
    ||||||||||    
T  45139524 ttcccagacc 45139515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624163
Alignment:
Q  435 aaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgt 509  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgt 47624163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 451 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 353444 - 353351
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  353444 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 698 - 792
Target Start/End: Original strand, 42530741 - 42530835
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattcctttgattgattg 792  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  42530741 ttgtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccccttttgattcttctgattgattg 42530835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032612
Alignment:
Q  400 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtggga 54032612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 545 - 779
Target Start/End: Original strand, 50295443 - 50295677
Alignment:
Q  545 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttgg 644  Q
    |||||||  ||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||  |||||   | ||| || ||||||  | |||||||||| || ||    
T  50295443 tttagttcggttcagtttaatttcgttctgtttggttcaatttgtttggttgttggatgagttgagatagtgcacacaatttgattgtttgtttagtggg 50295542  T
Q  645 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taa 743  Q
    || |||||||||||||| ||||||  ||||||     ||| |||||| |||| |||||||||| || |||| |||  |||||| |||||||||||| |||    
T  50295543 tcaagtgctcacaatttggttgtttcgtgagtcg---agtgctcacacttgggttgtttggtgagttgagttctcgtactttgattgtttggtgagttaa 50295639  T
Q  744 gtactcacaatttggtttct--tcctcccttttgattc 779  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  50295640 gtactcataatttggtttcttctccccccttttgattc 50295677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410889
Alignment:
Q  395 tgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 494  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |     
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacct 8410917  T
Q  495 cttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  8410916 cttctcagaccctgcataggcggaagct 8410889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904857
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |   | |||||||||| |    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagcttt 31904876  T
Q  525 agtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  31904875 agtgcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 391 - 498
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212101
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||  |    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaatacatcagatgacg 39212091  T
Q  489 ggatcccttc 498  Q
    ||||||||||    
T  39212092 ggatcccttc 39212101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 461
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751723
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||| || |||||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcacc 19751723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 484
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875111
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaga 464  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | ||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||     
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga-------cgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacactaaat 21875111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 469 - 548
Target Start/End: Original strand, 24578007 - 24578086
Alignment:
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24578007 gtacaatacactaaatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgccctttttta 24578086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 544
Target Start/End: Original strand, 31831241 - 31831343
Alignment:
Q  431 ctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 530  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||           || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31831241 ctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt-----------ccggaccctgcatatgcgggtgctctagtgca 31831329  T
Q  531 ccaggttgcccttt 544  Q
    || |||||||||||    
T  31831330 ccgggttgcccttt 31831343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 454
Target Start/End: Original strand, 35417904 - 35417981
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35417904 ttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 35417981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 478 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24851367 - 24851298
Alignment:
Q  478 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24851367 accaaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 24851298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 484 - 545
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452953
Alignment:
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30452953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401288
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttc 498  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttc 55401288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa-gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccaga-ccctgtatatgcg 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  ||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  517 ggagctctagtgca 530  Q
    |||||| |||||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 519
Target Start/End: Original strand, 9276289 - 9276395
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaaca------gcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtat 511  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  |    
T  9276289 gggttcaagtcctggaaacaacctcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgt 9276387  T
Q  512 atgcggga 519  Q
    ||||||||    
T  9276388 atgcggga 9276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428532
Alignment:
Q  408 ctgaaaggttgcgggttcaagtc-ctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgg 489  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtgg 52428532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403553
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaata-caccaaa 483  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||  | |||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | |||| ||| |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaaaa 44403616  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   ||||| | |||| ||||||||| || |||| |||||    
T  44403615 tggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgcctttttt 44403553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 46692165 - 46692047
Alignment:
Q  663 gttgttgggtgagt-aagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagta-agtactcacaatttggtt 760  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| | |||||||||| ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  46692165 gttgttgggtgagttaatctagttctcacaatttggttgtttggtgagtctaattctcaca-tttagttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtt 46692067  T
Q  761 tcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  46692066 tcttctctcccttttgattc 46692047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782431
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||  ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaa 26782431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 497
Target Start/End: Original strand, 29106535 - 29106659
Alignment:
Q  374 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgta 471  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||| |  ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |  || ||||  | ||||    
T  29106535 ctttggcgcaac-ggtaaaaatgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgta 29106633  T
Q  472 caatacaccaaatggtgggatccctt 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29106634 caatacaccaaattgtgggatccctt 29106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 829612 - 829454
Alignment:
Q  375 tttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtac 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    || |||||||| || |||||| |||||||| ||||  |||  ||||   |||||||    
T  829612 tttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtac 829515  T
Q  473 aatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  829514 aatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 829454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624949
Alignment:
Q  427 agtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||  ||||||  | |||||  || | ||||||| |    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagcttt 50624973  T
Q  525 agtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  50624972 agtgcaccgggctgccctttttta 50624949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121260
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatg 485  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaaatg 1121283  T
Q  486 gtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
    | |||| || ||| |||||||||    
T  1121282 gcgggagcctttctcagaccctg 1121260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11461826 - 11461733
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcg---caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| ||||||| || || ||||||||||    
T  11461826 tgaggggtaactttgacgacgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaa 11461733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 535
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672842
Alignment:
Q  428 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |   | |||||||||| |    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacaccaaatggtgggactctcttcccatatcttacgtgtgcgggagcttt 31672831  T
Q  525 agtgcaccagg 535  Q
    |||||||||||    
T  31672832 agtgcaccagg 31672842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 484
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905041
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| |||||| || ||||| |||||||||||   |||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  484 t 484  Q
    |    
T  28905041 t 28905041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6242327 - 6242282
Alignment:
Q  502 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6242327 gaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 6242282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 43956640 - 43956552
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  43956640 gagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaa 43956552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 404
Target Start/End: Original strand, 9276249 - 9276289
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatg 404  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9276249 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 454
Target Start/End: Original strand, 9627712 - 9627780
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9627712 tggtaacgttggtgtcacgtgactgaaagggtatgggtttaagtcctagaaacagactcttgtgtaaaa 9627780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 409
Target Start/End: Original strand, 39430465 - 39430509
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39430465 gaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 869
Target Start/End: Original strand, 42530844 - 42530879
Alignment:
Q  834 ccccttttgattcttctgattgattgcattgcactt 869  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42530844 ccccttttgattcttctgattgattgcatttcactt 42530879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 547
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624259
Alignment:
Q  496 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 47624259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 839 - 894
Target Start/End: Original strand, 50295873 - 50295928
Alignment:
Q  839 tttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattg 894  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||    
T  50295873 tttgattcttttgattgattgcattgcacttctccctcttttgattcttctgattg 50295928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4495709 - 4495672
Alignment:
Q  511 tatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4495709 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 4495672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 405
Target Start/End: Original strand, 23871418 - 23871455
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 405  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23871418 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgt 23871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21779441 - 21779260
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21779441 tgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 21779342  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21779341 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21779260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 364 - 544
Target Start/End: Original strand, 23397719 - 23397899
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23397719 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaag 23397818  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23397819 gctacgtacaatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 23397899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455315
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccctttt 8455315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671315
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 9671233  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9671234 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 9671315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 361 - 544
Target Start/End: Original strand, 14530268 - 14530455
Alignment:
Q  361 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagg 458  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  14530268 gtttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagg 14530367  T
Q  459 gtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14530368 gtaaggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 14530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 366 - 544
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543835
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  464 actgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 368 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249735
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagact 466  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggct 25249816  T
Q  467 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25249815 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgccctttttt 25249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 367 - 545
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514571
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||     
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 11514571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023955
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 12024000  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  12023999 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctg 12023955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200622
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  464 actgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 24200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977710
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||     
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattaccctttttta 19977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 547
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444866
Alignment:
Q  402 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccc 500  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  501 agaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
     |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccctttttt 14444866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 363 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25079901 - 25079717
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacaggg 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||   |||||| ||    
T  25079901 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaagg 25079802  T
Q  460 taagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25079801 taaggatgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 509
Target Start/End: Original strand, 22371010 - 22371154
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 463  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22371010 tgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt-aaaaacagggtaag 22371108  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgt 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22371109 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgt 22371154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214674
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaa 462  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  463 gactgcgtacaatacac--caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgccttttttt 7214674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 546
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573757
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagactgcg 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcg 27573680  T
Q  470 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  27573681 tacaatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttttt 27573757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 402 - 547
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546301
Alignment:
Q  402 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttc 498  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  499 ccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 10546301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 382 - 549
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668142
Alignment:
Q  382 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 549  Q
    |||||||||| | |||||| |  ||||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17668073 caaatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttttttag 17668142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 366 - 544
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544201
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  463 gactgcgtacaata--caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||| |||||  ||  ||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttt 14544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 388 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggt 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 99322  T
Q  488 gggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    || | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  99321 ggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 546
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896397
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaag 463  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttttt 17896397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 366 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781298
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 463  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||  || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct-ttgtgcaccagg 32781298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841166
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 5841166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 382 - 549
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623704
Alignment:
Q  382 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 549  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||  |||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  17623635 caaatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttttttag 17623704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 547
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871629
Alignment:
Q  427 agtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||| ||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  526 gtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgccctttttt 36871629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39914475 - 39914305
Alignment:
Q  377 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  || |||||    
T  39914475 tggcgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtaca 39914376  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  39914375 atacaccgaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 39914305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24860156 - 24859985
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  24860156 ttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggt-aggctgcgtacaa 24860058  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||| | | |||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  24860057 tacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccttttttt 24859985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 387 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377095
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagct 21377095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 389 - 499
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  486 gtgggatcccttcc 499  Q
    |||||| |||||||    
T  5450363 gtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 365 - 481
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaa 462  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  463 gactgcgtacaatacacca 481  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 365 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684618
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag-cctcttgtgtaaaacag---ggt 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||  |||||||||||| || |||||| | ||| |||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtccttttt 26684618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 522
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtac-aatacaccaaa 483  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc-ta 33795359  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33795360 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 426 - 547
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826173
Alignment:
Q  426 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtggaa-cccttcccagaccctacatatgcgggagcttt 30826150  T
Q  525 agtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||| ||| ||||||||    
T  30826151 agtgcaccagattgtcctttttt 30826173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 545
Target Start/End: Original strand, 44643488 - 44643659
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtac 472  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||| || |||| ||||||||  ||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  44643488 ttggcgcaa-tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtac 44643586  T
Q  473 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  44643587 aatgtaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgccctttt 44643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 386 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416871
Alignment:
Q  386 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    || ||||| || ||    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 40416871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 547
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641639
Alignment:
Q  396 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 494  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  495 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtcctttttt 25641639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158437
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaa--t 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||  |    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacctgattgtccttttt 31158437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 376 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 4516520 - 4516354
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||    
T  4516520 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtaca 4516422  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||| || |||| ||||| ||| || |||||    
T  4516421 atacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 549 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 1173765 - 1173572
Alignment:
Q  549 gtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttg----tttggttgg 644  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||  |||| ||| ||||||||||    |||||| ||    
T  1173765 gtttggttcagtttgatttggtttcgtttgattaaatttgtttggttgttaggtgagtcaagatagttctcaaaattggtttgtttgtttgtttggtggg 1173666  T
Q  645 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt 741  Q
    || |||||||| |||||  ||||| |||| ||     ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  1173665 tcaagtgctcataatttgtttgtttggtgggt---cgagtgctcataatttgtttgtttggtgagtcgagtactcatattttggttgtttggtgagt 1173572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380259
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgg 489  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||| |||    
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatgatgg 17380292  T
Q  490 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
     | |||||||  |||||||   |||||||||||    
T  17380291 aaccccttcctggaccctgcggatgcgggagct 17380259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762234
Alignment:
Q  431 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  |||| ||||||| |||||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  529 caccaggttgcccttt 544  Q
    |||| |||||||||||    
T  40762249 caccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccc 506  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccc 506  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235813
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||   || |||||||| || |||  ||||||| ||||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccccttttta 45235813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296403
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||  |||| |    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  517 ggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  15296433 gaagctttggtgcgccaggctgccctttttt 15296403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 533
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615117
Alignment:
Q  400 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatccc 495  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||| |||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  496 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 533  Q
    |||||  ||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacca 19615117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521395
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||| || ||||||||  |||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaat 44521433  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    || |||| ||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  44521432 ggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagct 44521395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 464
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604908
Alignment:
Q  383 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaga 464  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaga 44604908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 544
Target Start/End: Original strand, 25632551 - 25632644
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25632551 aaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419946
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaga----ctgcgtacaatacacc 480  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  481 aaa 483  Q
    |||    
T  29419948 aaa 29419946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 685 - 770
Target Start/End: Original strand, 8986208 - 8986293
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtttcttcctccc 770  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  8986208 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttctttctccc 8986293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 830 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 38584027 - 38583930
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctcctcctttgattctt-tgattgat 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38584027 tctcccccttttgattcttctgattg----cattgcatttctcgcccttttgattcttctgattgattgcacttctccccctttgattcttctgattgat 38583932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39189604 - 39189556
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189604 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13245210 - 13245096
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 521  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||    
T  13245210 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagc 13245118  T
Q  522 tctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    | ||||| | | ||||||||||    
T  13245117 tttagtgtatcgggttgccctt 13245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 38584066 - 38583959
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattg-attacacttctc-ctcctttgattctt-tgattg 926  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||| || ||||| | | |||||||||| ||||||    
T  38584066 tctcccccttttgatttttctgagtgattgcattgcacttctcccccttttgattcttctgattgcattgcatttctcgcccttttgattcttctgattg 38583967  T
Q  927 attgcact 934  Q
    ||||||||    
T  38583966 attgcact 38583959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 532
Target Start/End: Original strand, 17471558 - 17471673
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 516  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||  ||||||    
T  17471558 ggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcctatgcg 17471657  T
Q  517 ggagctctagtgcacc 532  Q
    |||| | |||||||||    
T  17471658 ggagttttagtgcacc 17471673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27466311 - 27466262
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 414  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27466311 gaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864439
Alignment:
Q  426 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagct 30864439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  405 tgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 531
Target Start/End: Original strand, 24890453 - 24890533
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  24890453 aaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  396 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc 495  Q
    ||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||   |||  |||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccgtgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggacccc 31821392  T
Q  496 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    || ||  | ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  31821391 tttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 1173620 - 1173471
Alignment:
Q  628 tttgtttgtttggttggtctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttg 727  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||    |||| ||||||  | |||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  1173620 tttgtttgtttggtgagtcgagtactcatattttggttgtttggtgagtc---tagtgctcacatgttgtttgtttggtgagta-agcgctcacactttg 1173525  T
Q  728 gttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1173524 gttgtttggtgagtctagtgctcacaatttggtttcttctcgcccttttgattc 1173471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 545
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080237
Alignment:
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccctttt 34080237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 685 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 38584247 - 38584195
Alignment:
Q  685 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggt 737  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38584247 actcacaatttgcttgtttggtgagtcgagtgctcacattttggttgtttggt 38584195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 547
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41410000
Alignment:
Q  483 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctctttt 41410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 552
Target Start/End: Original strand, 4794871 - 4794945
Alignment:
Q  478 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg-cccttttttagttt 552  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  4794871 accaaatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgca-caggttgtcccttttatagttt 4794945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 442
Target Start/End: Original strand, 35017783 - 35017849
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcc 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  35017783 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagcc 35017849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 39499323 - 39499240
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 534  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39499323 aaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcaccag 39499240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189501
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 39189501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 545
Target Start/End: Original strand, 23488535 - 23488619
Alignment:
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  23488535 gactgcgtgcaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctctttt 23488619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 29409397 - 29409360
Alignment:
Q  834 ccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 871  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29409397 cccctgttgattcttctgattgattgcattgcacttct 29409360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 531
Target Start/End: Original strand, 31523296 - 31523353
Alignment:
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 531  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31523296 atacaccaaatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 31523353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 38584201 - 38584136
Alignment:
Q  696 gtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtt 760  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38584201 gtttggttggtgagtcaagtgctcacaatttggtagtttggtgagttaagtgctcacaatttggtt 38584136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 454
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473014
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaa 17473014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 701 - 741
Target Start/End: Original strand, 32290604 - 32290644
Alignment:
Q  701 tttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt 741  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32290604 tttggtgggtcaagtgctcacaatttggttgtttggtgagt 32290644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 548
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766394
Alignment:
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttccctttttta 34766394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44449529 - 44449419
Alignment:
Q  400 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttg--tgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaatggtgggatccct 496  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||| ||||  ||||| |||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  44449529 tcatgtaactgaaaggtcacgagttcaa-tcctaaaaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccct 44449431  T
Q  497 tcccagaccctg 508  Q
    |||| |||||||    
T  44449430 tcccggaccctg 44449419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 545
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795891
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagactgcgtacaatacacc-aaa 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||  |  ||| ||||| || |||||||||| || ||||||   || | | ||||||||| ||||||||| |||    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaaaa 4795829  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |  ||||| |||| ||| ||||| | |||| |||||||   ||||||||||||    
T  4795830 tggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgccctttt 4795891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 544
Target Start/End: Original strand, 8575979 - 8576030
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8575979 cccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 8576030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12315775 - 12315712
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaat 484  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12315775 gttcaagtcatggaaacagcttcttattaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaat 12315712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 541
Target Start/End: Original strand, 31525771 - 31525838
Alignment:
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 541  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  31525771 atacaccaaatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 38584180 - 38584085
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattc 779  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  38584180 ctcacaatttggtagtttggtgagttaagtgctcacaatttggttgtttggtgagttaaatgctcacaatttgattttttctcccccttttgattc 38584085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 545
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371248
Alignment:
Q  496 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 22371248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34752820 - 34752759
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg 449  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34752820 gtaaacttgttatcatgtgactgaaaggtcacgaattcaagttctggaaacaacctcttgtg 34752759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 834 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 38583955 - 38583918
Alignment:
Q  834 ccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 871  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38583955 ccccctttgattcttctgattgattgtattgcacttct 38583918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710449
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 35710366  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35710367 ctgcgttcaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 35710449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Original strand, 41014272 - 41014454
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41014272 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 41014371  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 41014454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 365 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169982
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 464  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaacagggtaagg 8170064  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  8170063 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttttt 8169982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 398 - 545
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703558
Alignment:
Q  398 tgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 32703510  T
Q  498 cccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32703511 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 32703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879719
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 461  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  462 agactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 38879719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449028
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  463 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 24449028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 368 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619103
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  466 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 4619103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 368 - 546
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334341
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaga 464  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||     
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  465 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctg-cgatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 43334341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565566
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttt 1565566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 362 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 37024738 - 37024626
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 461  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37024738 tttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 37024639  T
Q  462 agactgcgtacaa 474  Q
    || ||||||||||    
T  37024638 aggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 426 - 541
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  426 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctcta 7368512  T
Q  526 gtgcaccaggttgccc 541  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7368513 gtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 363 - 544
Target Start/End: Original strand, 22187237 - 22187422
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 460  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |    
T  22187237 ttgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgat 22187336  T
Q  461 aagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   || || ||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22187337 aagactgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttt 22187422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 363 - 522
Target Start/End: Original strand, 22600406 - 22600567
Alignment:
Q  363 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggt 460  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||    
T  22600406 ttgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggt 22600505  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  22600506 aaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 368 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861668
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactg 467  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaaca-agtaagactg 22861746  T
Q  468 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22861745 ctcacaatacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgccctttt 22861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328867
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 465  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  466 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 27328867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 521
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 463  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaag 2838832  T
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 521  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  2838833 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 368 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12006508 - 12006329
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcggg-ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaga 464  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  |||||||     
T  12006508 gggtagctttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaagg 12006410  T
Q  465 ctgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    || | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  12006409 ctccatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 420 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801767
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc 515  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  516 gggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttt 13801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 387 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516432
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaataca-ccaaa 483  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| || |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccctttt 28516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 545 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 11335572 - 11335393
Alignment:
Q  545 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttgg 644  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  11335572 tttagtttcattcagtttgatttgatttcgtttggttcaatttgtttggttgttg-gtgagtcaagatagtgctcacaattggtttgtttgtttggcggg 11335474  T
Q  645 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggtt 730  Q
    || ||||||||||||||  ||||| ||||     |  |||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11335473 tcaagtgctcacaatttgtttgtttggtg-----ggaagtactcacactttggttgtttggtgagtcgaatgctcacaatttggtt 11335393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19143111 - 19142940
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaa 474  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  19143111 ttggcgcaa-tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacag 19143013  T
Q  475 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||| | ||||||||  |  |||||||||||    
T  19143012 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgccctttttt 19142940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34154908 - 34154814
Alignment:
Q  450 taaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34154908 taaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttt 34154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 548
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405326
Alignment:
Q  394 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  492 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
     || ||||   |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgccctttttta 1405326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 362 - 454
Target Start/End: Original strand, 23974732 - 23974823
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23974732 tttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa 23974823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 532
Target Start/End: Original strand, 43574617 - 43574729
Alignment:
Q  422 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 519  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  43574617 gttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 43574716  T
Q  520 gctctagtgcacc 532  Q
    ||| ||| |||||    
T  43574717 gctttagagcacc 43574729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 389 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 389 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  389 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatgg 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  487 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 540
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006456
Alignment:
Q  371 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgc 468  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    | ||||||||| | ||||| |||||| | ||||  |||||||||| |||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 540  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30006385 gtacattacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208939
Alignment:
Q  387 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaaaat 208987  T
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  208986 ggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcacc 208939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 435 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097760
Alignment:
Q  435 aaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 533  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacca 7097771  T
Q  534 ggttgcccttt 544  Q
     | ||||||||    
T  7097770 tgctgcccttt 7097760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 436 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880647
Alignment:
Q  436 aacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 533  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||     
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 16880658  T
Q  534 ggttgcccttt 544  Q
    |||| ||||||    
T  16880657 ggtttcccttt 16880647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 430 - 543
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  430 cctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 525  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||  |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  526 gtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 507
Target Start/End: Original strand, 39301089 - 39301222
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |    
T  39301089 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtata 39301187  T
Q  474 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccct 507  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  39301188 atgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccct 39301222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 395 - 532
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850762
Alignment:
Q  395 tgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  494 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
     |||||  |||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcacc 1850762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 830 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 11335355 - 11335266
Alignment:
Q  830 tctcccccttttgattcttctgattgattgcattgcacttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctcctcct-ttgattct 919  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11335355 tctccccctattgattcttctgattgattgcattgcacttct-ccccttttcattcttttgattgatttcacttctcctcctattgattct 11335266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 483
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299705
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaagactgc 468  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgc 31299690  T
Q  469 gtacaatacaccaaa 483  Q
    |||||||||| ||||    
T  31299691 gtacaatacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 545
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957450
Alignment:
Q  469 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 16957450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907904
Alignment:
Q  396 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  495 ct-tcccagac 504  Q
    || ||||||||    
T  22907914 ctctcccagac 22907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794390
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||| |||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaatagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcacc 9794390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 441
Target Start/End: Original strand, 17419871 - 17419944
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagc 441  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17419871 gggtaattttggcgtaactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 686 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 11335466 - 11335361
Alignment:
Q  686 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggtttcttc-ctcccttttgattccttt 783  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  11335466 ctcacaatttgtttgtttggtggga--agtactcacactttggttgtttggtgagtcgaatgctcacaatttggtttcttctcccccttttgattctttt 11335369  T
Q  784 gattgatt 791  Q
    ||||||||    
T  11335368 gattgatt 11335361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 451 - 545
Target Start/End: Original strand, 3771381 - 3771475
Alignment:
Q  451 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  3771381 aaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 3771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 485 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028621
Alignment:
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 16028621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 545
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334532
Alignment:
Q  431 ctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacca-aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 527  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  |||| |||| || || |    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaat 29334514  T
Q  528 gcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||| || |||||||||    
T  29334515 gcaccgggctgccctttt 29334532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924842
Alignment:
Q  403 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttc 498  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  499 ccag--accctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    ||||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacc 42924842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 504
Target Start/End: Original strand, 41425956 - 41426043
Alignment:
Q  419 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagac 504  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41425956 cgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccagac 41426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 764
Target Start/End: Original strand, 9511813 - 9511880
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgag-taagtactcacaatttggtttctt 764  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9511813 ttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggttgtttggtgagttaaatactcacaatttgatttctt 9511880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 663 - 760
Target Start/End: Original strand, 9511742 - 9511845
Alignment:
Q  663 gttgttgggtgagt-aagatagtactcacaattggttt----gtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaattt 756  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  9511742 gttgttaggtgagttaagatagtcctcacaattcgtttgtttgtttggtgagtcgagtgctcacacttcggttgtttggtgagtcgagtgctcacaattt 9511841  T
Q  757 ggtt 760  Q
    ||||    
T  9511842 ggtt 9511845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074584
Alignment:
Q  391 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtg 488  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  489 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||  ||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  34074617 gggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagct 34074584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873322
Alignment:
Q  426 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||  |||||||||||| |    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagcttt 5873342  T
Q  525 agtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||| | || ||||||||    
T  5873341 agtgcatcgggatgcccttt 5873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 832 - 907
Target Start/End: Original strand, 9511882 - 9511960
Alignment:
Q  832 tcccccttttgattctt-ctgattgattgcattgcacttctg--ccccatttgattcctttgattgattacacttctcc 907  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  9511882 tcccccttttgattctttctaattgattgcattgcacttctgatccccttttgattcttctgattgattgcacttctcc 9511960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877564
Alignment:
Q  485 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30877564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 429 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575660
Alignment:
Q  429 tcctggaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||||| |    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  525 agtgcaccaggttgcccttt 544  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgcccttt 12575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438752
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 414  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaag 19438752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 543
Target Start/End: Original strand, 19438759 - 19438800
Alignment:
Q  502 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19438759 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39079935 - 39079875
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaa 437  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  39079935 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 532
Target Start/End: Original strand, 13774920 - 13774988
Alignment:
Q  464 actgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 532  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13774920 actgcgcacaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 13774988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 454
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025586
Alignment:
Q  406 gactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 22025586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 545
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354263
Alignment:
Q  493 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 32354263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 11335200 - 11335165
Alignment:
Q  836 ccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 871  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11335200 ccttttgattcttctgattgattgcattgcacttct 11335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 867 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11335391 - 11335324
Alignment:
Q  867 cttctgccccatttgattcctttgattgattacacttctcctcct-ttgattctt-tgattgattgca 932  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11335391 cttctcccccttttgattcttttgattgattacacttctccccctattgattcttctgattgattgca 11335324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 403
Target Start/End: Original strand, 41956885 - 41956924
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41956885 tgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 554 - 676
Target Start/End: Original strand, 9511703 - 9511825
Alignment:
Q  554 gttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggtctagtgct 653  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||  |||||| | | |||  ||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  9511703 gttcggtttgatttggattcgcttggttgaatttgtttggttgttaggtgagttaagatagtcctcacaattcgtttgtttgtttggtgagtcgagtgct 9511802  T
Q  654 cacaatttagttgttgggtgagt 676  Q
    |||| ||  |||||| |||||||    
T  9511803 cacacttcggttgtttggtgagt 9511825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10634315 - 10634238
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  10634315 ttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaa 10634238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 677 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 11335510 - 11335424
Alignment:
Q  677 aagatagtactcacaattggtttg----tttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtaagtactcacaatttggtt 760  Q
    |||||||| |||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  11335510 aagatagtgctcacaattggtttgtttgtttggcgggtcaagtgctcacaatttgtttgtttggtg-ggaagtactcacactttggtt 11335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 698 - 779
Target Start/End: Original strand, 24136896 - 24136978
Alignment:
Q  698 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagt-aagtactcacaatttggtttcttcctcccttttgattc 779  Q
    |||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  24136896 ttgtttggtgagccgacttctcacaatttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaattttgtttcttccccccttctgattc 24136978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 544
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622595
Alignment:
Q  482 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 545
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801652
Alignment:
Q  484 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttt 39801652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4654478 - 4654426
Alignment:
Q  481 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 533  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4654478 aaatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacca 4654426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 645
Target Start/End: Original strand, 24136719 - 24136790
Alignment:
Q  574 gtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaatcggtttgtttgtttggttggt 645  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24136719 gtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattggtttgttcgtttgtttggt 24136790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 459 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657695
Alignment:
Q  459 gtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 548  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| | | |||||| || |||| |||| || ||||||||||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgccctttttta 11657695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 10943914 - 10943842
Alignment:
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  10943914 atacaccaaataacgggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttttt 10943842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 368 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactg 467  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 10127  T
Q  468 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10126 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 368 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  368 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactg 467  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 20455  T
Q  468 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  20454 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 430
Target Start/End: Original strand, 8896 - 8964
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtc 430  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  8896 tttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 430
Target Start/End: Original strand, 19224 - 19292
Alignment:
Q  362 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtc 430  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19224 tttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 117; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Original strand, 11097 - 11264
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaat 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  11097 ttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaagtaaggctgcttacaat 11195  T
Q  476 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196 acaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 367 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13022
Alignment:
Q  367 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagac 465  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggtaaggc 13103  T
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 546  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13102 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttttt 13022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 370 - 544
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59114
Alignment:
Q  370 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactg 467  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  468 cgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 364 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24949 - 24769
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 461  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     |||||||||||||||||||  |||||||    
T  24949 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 24855  T
Q  462 agactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  24854 aggctgcgtacaacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgccctttttt 24769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 376 - 547
Target Start/End: Original strand, 46796 - 46969
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagactgcgtaca 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||||||    
T  46796 ttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtaca 46895  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  46896 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 46969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 545
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43794
Alignment:
Q  424 tcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc-ttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagct 43771  T
Q  523 ctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  43772 ctagtgcactgagttgccctttt 43794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46702
Alignment:
Q  456 agggtaagactgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 549  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcaggctgcccatttttag 46702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46995
Alignment:
Q  388 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctgg 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 98; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 420 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48633
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 519  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 48659  T
Q  520 gctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48658 gctctagtgcaccgggttgccctttt 48633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1591
Alignment:
Q  380 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 479  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  1751 cgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgtaaaacaggataaggctgcatacaatacac 1652  T
Q  480 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 540  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1651 caaatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 85; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 376 - 545
Target Start/End: Original strand, 10775 - 10946
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||    
T  10775 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtcca 10874  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 545  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  10875 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctctttt 10946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 226588 - 226458
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 460  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  226588 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 226489  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  226488 aaggctgcatacaatacatcaaatggtggga 226458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 56008 - 55924
Alignment:
Q  421 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccaga 503  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||  ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  56008 ggttcaagttctgtaaacagtcttttgtgtaaaaaacagaataaaattgcatacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaga 55924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35070
Alignment:
Q  365 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttg-ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 460  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  461 aagactgcgtacaatacaccaaatggtggga 491  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 35070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 379 - 513
Target Start/End: Original strand, 4125 - 4264
Alignment:
Q  379 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaata 476  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  4125 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 4224  T
Q  477 cacc---aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatat 513  Q
    ||||   || |||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  4225 caccaataattggtgggaccccttcccggaccctatatat 4264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 457 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24130
Alignment:
Q  457 gggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttttt 24130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 63; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 73031 - 72867
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaaca-gcctcttgtgtaaaa--cagggtaagactgcgtac 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |       |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  || |||||| |||| |||    
T  73031 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgtgtca-------cgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctac 72939  T
Q  473 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  72938 aatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 364 - 439
Target Start/End: Original strand, 83828 - 83903
Alignment:
Q  364 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaaca 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  83828 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 522
Target Start/End: Original strand, 23569 - 23712
Alignment:
Q  376 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagactgcgtaca 473  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  23569 ttggcgcaac-ggtaaagttgt----atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtaca 23663  T
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 522  Q
    ||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  23664 atgtagcaaatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtgggagct 23712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 547
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24786
Alignment:
Q  366 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagac 465  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||              |||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc--------------gggtaagac 24704  T
Q  466 tgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 547  Q
    |||||| |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  24705 tgcgtataatacaccaaatagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgccctttttt 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 379 - 491
Target Start/End: Original strand, 43097 - 43209
Alignment:
Q  379 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagactgcgtacaatac 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||||||    
T  43097 gcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaagac-atttacaatac 43195  T
Q  478 accaaatggtggga 491  Q
    | ||||||||||||    
T  43196 atcaaatggtggga 43209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 454
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8934
Alignment:
Q  385 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaa 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 532
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3667
Alignment:
Q  427 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 524  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| |    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  525 agtgcacc 532  Q
    ||||||||    
T  3660 agtgcacc 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 58699 - 58630
Alignment:
Q  474 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 544  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  58699 atacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagctct-gtgcaccaggctgcccttt 58630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3793 - 3685
Alignment:
Q  420 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 518  Q
    |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| || || |  || | ||||||||||||    
T  3793 gggttcaagttctgaaaacaacc-cttgtgtaaatacaaggtaacgttgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttctcgatcttgtatatgcggg 3695  T
Q  519 agctctagtg 528  Q
    |||| |||||    
T  3694 agctttagtg 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 605 times since January 2019
Visitors: 2233