View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0169_low_18 (Length: 291)

Name: NF0169_low_18
Description: NF0169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0169_low_18
NF0169_low_18
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (1-253)||(602627-602879)
chr8 (1-268)||(39693527-39693793)
chr8 (1-253)||(23185135-23185385)
chr8 (1-231)||(16207298-16207528)
chr8 (1-253)||(12757670-12757922)
chr8 (1-268)||(16681198-16681462)
chr8 (1-253)||(19156188-19156440)
chr8 (1-268)||(21932875-21933142)
chr8 (1-272)||(17525619-17525888)
chr8 (1-272)||(16188976-16189244)
chr8 (1-268)||(17797414-17797679)
chr8 (1-268)||(17914451-17914717)
chr8 (1-268)||(29693307-29693573)
chr8 (8-267)||(19943234-19943494)
chr8 (25-222)||(33082873-33083070)
chr8 (1-268)||(24646330-24646596)
chr8 (1-231)||(17441737-17441966)
chr8 (1-253)||(18679807-18680057)
chr8 (1-231)||(18121038-18121265)
chr8 (2-268)||(15335982-15336246)
chr8 (2-268)||(15425047-15425311)
chr8 (2-268)||(15516351-15516615)
chr8 (1-222)||(18321097-18321318)
chr8 (1-268)||(20382289-20382553)
chr8 (1-268)||(24551266-24551531)
chr8 (15-268)||(23263506-23263757)
chr8 (1-231)||(30421359-30421588)
chr8 (1-268)||(40845282-40845546)
chr8 (1-222)||(17267466-17267686)
chr8 (1-222)||(17701737-17701958)
chr8 (8-268)||(9320567-9320827)
chr8 (1-222)||(18718993-18719214)
chr8 (1-253)||(45538348-45538598)
chr8 (13-268)||(1237641-1237894)
chr8 (1-268)||(36105187-36105452)
chr8 (1-268)||(22673770-22674035)
chr8 (116-265)||(22745594-22745742)
chr8 (13-266)||(22663120-22663371)
chr8 (91-196)||(20255529-20255634)
chr8 (8-136)||(18722670-18722798)
chr8 (8-136)||(18731015-18731143)
chr8 (8-136)||(18685421-18685549)
chr8 (25-253)||(24832965-24833192)
chr8 (1-253)||(6407718-6407958)
chr8 (1-83)||(43644888-43644970)
chr8 (1-68)||(19707498-19707565)
chr8 (1-68)||(25164062-25164129)
chr8 (1-75)||(14989536-14989610)
chr8 (166-265)||(3598243-3598340)
chr8 (1-75)||(18151731-18151805)
chr8 (25-83)||(33560301-33560359)
chr8 (8-268)||(43639782-43640031)
chr8 (196-268)||(43774053-43774126)
chr8 (3-75)||(13430713-13430785)
chr8 (2-118)||(45567943-45568059)
chr8 (25-71)||(21288419-21288465)
chr8 (25-71)||(21301038-21301084)
chr8 (173-253)||(14989369-14989447)
chr8 (243-272)||(19156415-19156444)
chr8 (243-272)||(21301230-21301259)
chr8 (236-268)||(21541184-21541216)
chr8 (15-67)||(22461731-22461783)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (1-253)||(19884696-19884947)
chr4 (1-257)||(3395584-3395840)
chr4 (1-231)||(29680431-29680661)
chr4 (1-268)||(37435388-37435652)
chr4 (8-268)||(45833395-45833654)
chr4 (1-222)||(12811074-12811292)
chr4 (1-222)||(16632434-16632655)
chr4 (1-202)||(19666366-19666567)
chr4 (1-202)||(37985528-37985729)
chr4 (1-238)||(10072929-10073165)
chr4 (8-231)||(22675409-22675630)
chr4 (1-216)||(19620963-19621178)
chr4 (13-253)||(413008-413246)
chr4 (8-268)||(17247245-17247502)
chr4 (25-249)||(3483739-3483963)
chr4 (5-197)||(12601099-12601291)
chr4 (1-192)||(9140906-9141097)
chr4 (1-251)||(56034568-56034816)
chr4 (1-253)||(10692845-10693095)
chr4 (1-253)||(10906611-10906861)
chr4 (25-231)||(13576003-13576207)
chr4 (1-253)||(6517479-6517729)
chr4 (2-268)||(14604759-14605023)
chr4 (1-216)||(55380284-55380499)
chr4 (1-222)||(14904252-14904473)
chr4 (5-216)||(19911782-19911994)
chr4 (8-231)||(54679931-54680150)
chr4 (60-216)||(14833449-14833605)
chr4 (8-268)||(8105638-8105898)
chr4 (1-268)||(29121364-29121618)
chr4 (1-268)||(40846093-40846359)
chr4 (1-253)||(17398551-17398791)
chr4 (1-216)||(3105324-3105536)
chr4 (8-151)||(56533028-56533172)
chr4 (104-222)||(23123528-23123646)
chr4 (1-268)||(6641678-6641941)
chr4 (21-139)||(16940030-16940148)
chr4 (8-138)||(25651084-25651214)
chr4 (1-216)||(23750516-23750729)
chr4 (1-98)||(16853497-16853594)
chr4 (108-207)||(15139328-15139427)
chr4 (13-83)||(3499687-3499757)
chr4 (1-75)||(22190840-22190914)
chr4 (25-75)||(38513896-38513946)
chr4 (173-253)||(3793289-3793367)
chr4 (91-267)||(55731863-55732036)
chr4 (1-83)||(9751575-9751657)
chr4 (13-73)||(1672395-1672455)
chr4 (13-73)||(1674870-1674930)
chr4 (27-139)||(11915720-11915832)
chr4 (13-52)||(8685509-8685548)
chr4 (8-67)||(17540396-17540455)
chr4 (227-266)||(17700680-17700719)
chr4 (1-71)||(20977451-20977521)
chr4 (25-83)||(39419770-39419827)
chr4 (1-75)||(40860661-40860735)
chr4 (227-268)||(3499530-3499571)
chr4 (166-253)||(14571183-14571268)
chr4 (13-56)||(17788109-17788152)
chr4 (238-268)||(3499515-3499545)
chr4 (1-73)||(14154038-14154111)
chr4 (236-268)||(17700663-17700695)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-268)||(22676-22943)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-272)||(22599993-22600263)
chr1 (1-253)||(28492233-28492485)
chr1 (1-253)||(32785767-32786018)
chr1 (1-272)||(33256164-33256432)
chr1 (1-272)||(33276336-33276604)
chr1 (1-222)||(1577866-1578087)
chr1 (1-268)||(20954288-20954554)
chr1 (1-268)||(38282566-38282831)
chr1 (1-253)||(36134189-36134438)
chr1 (1-268)||(22427173-22427438)
chr1 (14-268)||(35401821-35402072)
chr1 (1-231)||(1900344-1900574)
chr1 (1-222)||(22153856-22154077)
chr1 (1-268)||(19717523-19717787)
chr1 (1-268)||(12284422-12284689)
chr1 (13-268)||(22464624-22464878)
chr1 (1-268)||(48704203-48704467)
chr1 (1-214)||(10757420-10757634)
chr1 (1-268)||(2268530-2268792)
chr1 (1-202)||(22201616-22201817)
chr1 (8-253)||(39200823-39201066)
chr1 (13-253)||(16235127-16235365)
chr1 (1-231)||(29215796-29216024)
chr1 (1-216)||(2267088-2267301)
chr1 (25-272)||(23036340-23036584)
chr1 (1-207)||(30893091-30893298)
chr1 (1-253)||(35040165-35040415)
chr1 (1-268)||(25448380-25448647)
chr1 (13-253)||(2834701-2834938)
chr1 (13-268)||(2327255-2327509)
chr1 (1-272)||(21702813-21703081)
chr1 (1-268)||(48570048-48570312)
chr1 (1-253)||(44821376-44821626)
chr1 (1-268)||(46088988-46089244)
chr1 (25-202)||(7309842-7310018)
chr1 (1-185)||(12613713-12613895)
chr1 (1-268)||(10250985-10251240)
chr1 (8-164)||(14263369-14263525)
chr1 (1-253)||(21028792-21029044)
chr1 (8-139)||(30572203-30572334)
chr1 (1-139)||(21191808-21191946)
chr1 (13-268)||(7744906-7745159)
chr1 (1-253)||(26701958-26702210)
chr1 (25-123)||(17024923-17025021)
chr1 (1-83)||(37642247-37642329)
chr1 (8-75)||(21204930-21204997)
chr1 (16-75)||(42284642-42284701)
chr1 (1-75)||(21121071-21121145)
chr1 (1-75)||(21135167-21135241)
chr1 (25-75)||(21984619-21984669)
chr1 (1-71)||(19215611-19215681)
chr1 (1-71)||(23024787-23024857)
chr1 (227-268)||(34255359-34255400)
chr1 (209-268)||(17024796-17024855)
chr1 (189-268)||(19170164-19170245)
chr1 (238-268)||(34255344-34255374)
chr1 (227-268)||(10757630-10757671)
chr1 (239-268)||(17371261-17371290)
chr1 (227-268)||(19215807-19215848)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (2-216)||(29918018-29918231)
chr6 (1-253)||(32544265-32544517)
chr6 (1-268)||(13602172-13602438)
chr6 (1-253)||(20112596-20112849)
chr6 (1-268)||(26972110-26972375)
chr6 (1-268)||(9717843-9718109)
chr6 (1-268)||(23284564-23284830)
chr6 (1-253)||(12715318-12715569)
chr6 (25-268)||(18435580-18435823)
chr6 (1-253)||(20730603-20730853)
chr6 (13-253)||(22802153-22802391)
chr6 (8-216)||(14100374-14100582)
chr6 (13-268)||(13435544-13435798)
chr6 (13-272)||(15531503-15531761)
chr6 (1-199)||(15302200-15302398)
chr6 (1-253)||(16265049-16265299)
chr6 (1-268)||(22076291-22076556)
chr6 (8-268)||(21618251-21618509)
chr6 (14-202)||(21625114-21625301)
chr6 (25-216)||(19688790-19688979)
chr6 (1-202)||(15987233-15987435)
chr6 (1-253)||(19086158-19086399)
chr6 (2-222)||(19623980-19624200)
chr6 (8-253)||(16877220-16877463)
chr6 (1-183)||(18378314-18378496)
chr6 (1-222)||(24116828-24117050)
chr6 (8-268)||(20487801-20488060)
chr6 (1-253)||(15954703-15954953)
chr6 (31-222)||(34451596-34451787)
chr6 (8-268)||(19832916-19833175)
chr6 (91-268)||(25597569-25597745)
chr6 (1-261)||(16336127-16336381)
chr6 (1-151)||(12423261-12423410)
chr6 (13-253)||(21235137-21235363)
chr6 (3-216)||(12348995-12349205)
chr6 (14-185)||(10640384-10640555)
chr6 (1-83)||(25594068-25594150)
chr6 (2-144)||(26943577-26943719)
chr6 (1-76)||(17381521-17381596)
chr6 (1-139)||(33351939-33352075)
chr6 (14-268)||(19470683-19470933)
chr6 (1-75)||(19066093-19066167)
chr6 (199-268)||(17381610-17381679)
chr6 (1-71)||(19482752-19482822)
chr6 (192-268)||(26589782-26589858)
chr6 (1-92)||(17316583-17316674)
chr6 (192-253)||(19065926-19065987)
chr6 (173-268)||(22386958-22387052)
chr6 (189-253)||(17608222-17608286)
chr6 (236-268)||(19482957-19482989)
chr6 (1-72)||(26589599-26589671)
chr6 (240-268)||(26589845-26589873)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-268)||(9069558-9069825)
chr7 (1-253)||(15088516-15088768)
chr7 (1-265)||(10883072-10883335)
chr7 (1-222)||(13302806-13303027)
chr7 (1-253)||(2913518-2913770)
chr7 (1-252)||(44467060-44467312)
chr7 (1-272)||(13880100-13880370)
chr7 (1-251)||(33691624-33691874)
chr7 (1-234)||(13137824-13138057)
chr7 (1-253)||(48236814-48237064)
chr7 (1-253)||(2500034-2500286)
chr7 (1-253)||(21695397-21695649)
chr7 (1-253)||(30025901-30026153)
chr7 (1-268)||(21283271-21283535)
chr7 (8-247)||(23279875-23280113)
chr7 (1-253)||(28622268-28622518)
chr7 (1-200)||(13730638-13730837)
chr7 (1-231)||(11792903-11793133)
chr7 (13-216)||(15467924-15468127)
chr7 (1-268)||(28409035-28409300)
chr7 (1-222)||(22577962-22578183)
chr7 (1-222)||(24788137-24788358)
chr7 (1-268)||(16316455-16316719)
chr7 (1-216)||(30944272-30944485)
chr7 (1-261)||(11319401-11319660)
chr7 (1-216)||(30945305-30945518)
chr7 (1-222)||(29935300-29935520)
chr7 (25-231)||(9709736-9709940)
chr7 (1-216)||(21692283-21692498)
chr7 (25-253)||(33605705-33605932)
chr7 (1-202)||(13648725-13648926)
chr7 (1-221)||(12366690-12366910)
chr7 (1-267)||(35952585-35952850)
chr7 (1-253)||(16111796-16112046)
chr7 (1-196)||(5000788-5000984)
chr7 (8-268)||(12174237-12174496)
chr7 (1-216)||(14426543-14426756)
chr7 (2-185)||(19237022-19237204)
chr7 (1-268)||(4821470-4821734)
chr7 (1-134)||(14193110-14193243)
chr7 (1-253)||(331641-331894)
chr7 (26-272)||(13692372-13692606)
chr7 (1-253)||(39284475-39284726)
chr7 (31-253)||(16542932-16543152)
chr7 (31-253)||(16622510-16622730)
chr7 (1-268)||(8182926-8183190)
chr7 (2-139)||(13018529-13018666)
chr7 (1-109)||(16309961-16310069)
chr7 (1-222)||(41842215-41842435)
chr7 (8-223)||(2265461-2265674)
chr7 (133-216)||(4494634-4494717)
chr7 (1-222)||(13260564-13260777)
chr7 (1-117)||(19711059-19711175)
chr7 (1-75)||(1293026-1293100)
chr7 (2-253)||(14425444-14425683)
chr7 (50-216)||(15704448-15704612)
chr7 (1-267)||(48062727-48062982)
chr7 (20-185)||(13880603-13880768)
chr7 (8-202)||(13893960-13894153)
chr7 (13-139)||(19339283-19339400)
chr7 (50-137)||(16556664-16556751)
chr7 (50-137)||(16608911-16608998)
chr7 (25-123)||(9098286-9098384)
chr7 (22-68)||(13032167-13032213)
chr7 (92-187)||(13472555-13472651)
chr7 (1-75)||(27871714-27871789)
chr7 (192-268)||(48805785-48805861)
chr7 (25-83)||(48805959-48806017)
chr7 (173-268)||(4428984-4429077)
chr7 (1-65)||(24794813-24794877)
chr7 (166-253)||(27871871-27871956)
chr7 (13-56)||(4494585-4494628)
chr7 (236-272)||(4428964-4429001)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (1-268)||(28582105-28582372)
chr3 (1-253)||(2561187-2561439)
chr3 (1-266)||(49642658-49642922)
chr3 (13-272)||(18121511-18121770)
chr3 (1-268)||(14392900-14393164)
chr3 (1-270)||(31303385-31303653)
chr3 (1-222)||(37467332-37467553)
chr3 (1-268)||(15903197-15903464)
chr3 (1-268)||(13948335-13948601)
chr3 (13-216)||(38177588-38177791)
chr3 (1-253)||(12962995-12963245)
chr3 (1-268)||(20646153-20646420)
chr3 (2-253)||(47207706-47207958)
chr3 (1-268)||(52920405-52920670)
chr3 (16-253)||(14969341-14969578)
chr3 (1-268)||(6090731-6090997)
chr3 (25-196)||(13824092-13824263)
chr3 (1-231)||(40799873-40800101)
chr3 (4-178)||(41495001-41495175)
chr3 (1-231)||(47405353-47405581)
chr3 (1-199)||(17238884-17239082)
chr3 (1-268)||(53056622-53056887)
chr3 (26-268)||(46349739-46349979)
chr3 (8-253)||(11223569-11223812)
chr3 (13-268)||(2785075-2785329)
chr3 (13-222)||(49553428-49553637)
chr3 (1-265)||(29951335-29951598)
chr3 (1-265)||(30000489-30000752)
chr3 (1-222)||(12726169-12726390)
chr3 (1-170)||(13780575-13780744)
chr3 (13-216)||(18142697-18142900)
chr3 (1-231)||(16658548-16658778)
chr3 (8-268)||(14955433-14955691)
chr3 (1-268)||(24775427-24775694)
chr3 (14-231)||(20627363-20627578)
chr3 (1-253)||(19888854-19889103)
chr3 (25-265)||(33583252-33583492)
chr3 (1-216)||(22140763-22140976)
chr3 (64-253)||(11869130-11869317)
chr3 (1-202)||(16032524-16032724)
chr3 (13-272)||(21640878-21641134)
chr3 (1-136)||(22804048-22804183)
chr3 (8-268)||(29855415-29855674)
chr3 (13-268)||(49666310-49666553)
chr3 (8-216)||(5213583-5213788)
chr3 (1-253)||(46796287-46796527)
chr3 (1-121)||(25398295-25398415)
chr3 (1-71)||(11868268-11868338)
chr3 (1-189)||(12388845-12389032)
chr3 (25-151)||(50300246-50300372)
chr3 (1-75)||(21605740-21605814)
chr3 (8-268)||(20725093-20725349)
chr3 (189-268)||(50300387-50300466)
chr3 (1-75)||(21636756-21636830)
chr3 (26-189)||(19249385-19249547)
chr3 (15-63)||(23538264-23538312)
chr3 (144-196)||(25398238-25398290)
chr3 (1-69)||(30054309-30054377)
chr3 (25-75)||(40850991-40851041)
chr3 (227-268)||(37412799-37412840)
chr3 (14-106)||(11909079-11909171)
chr3 (8-56)||(12968312-12968360)
chr3 (240-272)||(19888850-19888882)
chr3 (189-265)||(33598036-33598112)
chr3 (193-268)||(1727920-1727995)
chr3 (1-47)||(1728129-1728175)
chr3 (1-71)||(9700126-9700196)
chr3 (243-272)||(2561414-2561443)
chr3 (227-268)||(21636574-21636615)
chr3 (2-47)||(37412605-37412650)
chr3 (240-268)||(12962995-12963023)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (1-253)||(32485-32737)
scaffold0084 (1-231)||(49332-49562)
scaffold0084 (2-118)||(339-455)
scaffold0084 (173-268)||(190-283)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-268)||(23235001-23235267)
chr2 (1-253)||(13963832-13964084)
chr2 (1-216)||(30666983-30667198)
chr2 (1-222)||(25829128-25829349)
chr2 (1-268)||(22187942-22188208)
chr2 (1-268)||(25037099-25037365)
chr2 (1-268)||(25041206-25041472)
chr2 (4-222)||(20568635-20568853)
chr2 (8-268)||(22317594-22317855)
chr2 (25-253)||(20151890-20152117)
chr2 (1-231)||(30621210-30621440)
chr2 (1-231)||(30623831-30624061)
chr2 (1-222)||(19540410-19540631)
chr2 (1-253)||(24377095-24377347)
chr2 (2-268)||(21537088-21537353)
chr2 (8-253)||(6573978-6574223)
chr2 (1-268)||(9015211-9015474)
chr2 (25-268)||(38781417-38781657)
chr2 (1-265)||(24850508-24850772)
chr2 (1-253)||(18376760-18377012)
chr2 (1-268)||(10009591-10009856)
chr2 (1-268)||(24576029-24576294)
chr2 (1-268)||(33074220-33074485)
chr2 (1-253)||(39037496-39037748)
chr2 (25-264)||(45087027-45087266)
chr2 (1-253)||(31800743-31800993)
chr2 (1-268)||(35743843-35744106)
chr2 (1-189)||(24779337-24779525)
chr2 (1-216)||(28140510-28140725)
chr2 (8-268)||(31327806-31328065)
chr2 (8-268)||(31334527-31334786)
chr2 (33-202)||(22260432-22260601)
chr2 (13-268)||(30557160-30557415)
chr2 (13-269)||(34321776-34322030)
chr2 (1-268)||(40782471-40782729)
chr2 (8-253)||(6392634-6392879)
chr2 (1-253)||(28711553-28711804)
chr2 (14-272)||(28701065-28701322)
chr2 (8-268)||(22802461-22802717)
chr2 (8-253)||(1586898-1587132)
chr2 (1-221)||(23595456-23595673)
chr2 (1-65)||(22455032-22455096)
chr2 (1-68)||(25189392-25189459)
chr2 (1-75)||(28550950-28551024)
chr2 (1-75)||(44840428-44840502)
chr2 (1-222)||(41121605-41121825)
chr2 (1-65)||(23184346-23184410)
chr2 (1-75)||(22776320-22776394)
chr2 (1-75)||(22781698-22781772)
chr2 (1-75)||(31968075-31968149)
chr2 (13-272)||(22785502-22785749)
chr2 (91-264)||(7609045-7609216)
chr2 (8-139)||(26619069-26619200)
chr2 (21-75)||(14581529-14581583)
chr2 (1-75)||(40332081-40332155)
chr2 (14-75)||(3277037-3277098)
chr2 (13-67)||(19115089-19115143)
chr2 (13-67)||(44881173-44881227)
chr2 (25-71)||(23392704-23392750)
chr2 (1-37)||(22258195-22258231)
chr2 (153-207)||(25189543-25189597)
chr2 (14-67)||(22272139-22272192)
chr2 (153-265)||(22454833-22454945)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-268)||(18466-18732)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-268)||(17814964-17815228)
chr5 (1-253)||(6512322-6512569)
chr5 (1-253)||(23412865-23413115)
chr5 (1-253)||(41566323-41566575)
chr5 (1-253)||(33022660-33022910)
chr5 (1-222)||(21910552-21910773)
chr5 (1-222)||(89342-89563)
chr5 (1-222)||(7745613-7745834)
chr5 (1-216)||(20550891-20551106)
chr5 (1-231)||(21072152-21072381)
chr5 (4-253)||(26784353-26784602)
chr5 (1-256)||(11993884-11994137)
chr5 (1-253)||(4887018-4887268)
chr5 (1-268)||(19536177-19536442)
chr5 (8-268)||(30742983-30743241)
chr5 (13-214)||(13545448-13545641)
chr5 (1-268)||(29138284-29138547)
chr5 (1-216)||(31117873-31118087)
chr5 (8-268)||(42243683-42243942)
chr5 (1-253)||(14086428-14086680)
chr5 (13-268)||(26759157-26759410)
chr5 (8-253)||(15516972-15517215)
chr5 (1-268)||(33933263-33933532)
chr5 (1-253)||(3245333-3245582)
chr5 (1-272)||(23881063-23881332)
chr5 (1-68)||(6499235-6499302)
chr5 (1-68)||(12352869-12352936)
chr5 (1-68)||(9398808-9398875)
chr5 (8-189)||(25096777-25096960)
chr5 (8-189)||(25154747-25154930)
chr5 (1-222)||(21198925-21199144)
chr5 (13-268)||(642583-642836)
chr5 (1-151)||(28139603-28139752)
chr5 (1-83)||(9088965-9089047)
chr5 (1-75)||(28464406-28464480)
chr5 (2-268)||(32160763-32161028)
chr5 (1-68)||(21099778-21099845)
chr5 (8-139)||(26765501-26765632)
chr5 (2-117)||(11208011-11208125)
chr5 (1-72)||(25930226-25930297)
chr5 (1-116)||(30115863-30115978)
chr5 (113-253)||(5429991-5430130)
chr5 (143-243)||(9398644-9398744)
chr5 (1-84)||(10848769-10848852)
chr5 (1-75)||(35932073-35932147)
chr5 (153-268)||(21099580-21099694)
chr5 (227-268)||(23391505-23391546)
chr5 (100-268)||(35986117-35986282)
chr5 (166-253)||(30115767-30115852)
chr5 (240-268)||(6512322-6512350)
chr5 (228-268)||(7745555-7745595)
chr5 (240-268)||(23412865-23412893)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (1-268)||(377404-377670)
scaffold0004 (5-268)||(220242-220503)
scaffold0004 (1-216)||(211398-211611)
scaffold0004 (6-139)||(244257-244390)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-268)||(12209-12475)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-231)||(25856-26086)
scaffold0083 (34-162)||(44654-44782)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-222)||(60016-60237)
scaffold0026 (1-216)||(7926-8141)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-268)||(475-741)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-225)||(9994-10219)
scaffold0161 (1-68)||(14816-14883)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (6-246)||(7708-7948)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-268)||(36620-36886)
scaffold0120 (1-268)||(42119-42385)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-199)||(14648-14846)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (1-253)||(27290-27540)
scaffold0171 (240-272)||(27286-27318)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (8-268)||(215343-215601)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-253)||(89916-90166)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-268)||(19319-19583)
scaffold0035 (1-268)||(99054-99316)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (25-268)||(4792-5034)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-199)||(1690-1888)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-268)||(5537-5801)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-268)||(20816-21082)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-253)||(9969-10219)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-222)||(1660-1881)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (25-268)||(6586-6827)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (1-253)||(19031-19283)
scaffold0217 (1-268)||(21977-22242)
scaffold0217 (1-253)||(9560-9809)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-199)||(15117-15315)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (14-216)||(103585-103787)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (2-268)||(212355-212619)
scaffold0005 (60-216)||(6094-6250)
scaffold0005 (166-253)||(246108-246193)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (1-169)||(13571-13739)
scaffold0426 (224-268)||(13832-13876)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (25-253)||(78227-78453)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (42-253)||(143129-143340)
scaffold0007 (243-272)||(143315-143344)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-253)||(60803-61053)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-216)||(553-766)
scaffold1359 (2-253)||(1626-1865)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-267)||(5446-5713)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-268)||(3304-3569)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (60-216)||(30283-30439)
scaffold0047 (1-222)||(9903-10123)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-216)||(15793-16010)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (64-252)||(39488-39676)
scaffold0022 (64-252)||(137548-137736)
scaffold0022 (1-189)||(159055-159242)
scaffold0022 (13-62)||(37414-37463)
scaffold0022 (13-62)||(135474-135523)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (8-268)||(7002-7260)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (14-252)||(9168-9403)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (31-268)||(9825-10059)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (25-215)||(1598-1786)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (91-268)||(633-807)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-253)||(6007-6256)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (3-231)||(9958-10186)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (117-202)||(4903-4988)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (1-268)||(25520-25776)
scaffold0056 (1-253)||(34674-34915)
scaffold0056 (15-178)||(36119-36281)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-139)||(2704-2841)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (130-250)||(5801-5922)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (21-85)||(2022-2086)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (32-223)||(7963-8151)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (55-253)||(65290-65485)
scaffold0011 (55-253)||(144335-144530)
scaffold0011 (2-118)||(164940-165056)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (1-75)||(25436-25510)
scaffold0247 (123-253)||(23424-23551)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (8-68)||(1324-1384)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (8-68)||(27-87)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (3-83)||(7383-7463)
scaffold0387 (192-266)||(7561-7635)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-73)||(17804-17876)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-98)||(74581-74678)
scaffold0025 (236-268)||(74814-74846)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (2-117)||(15617-15732)
scaffold0211 (239-268)||(15463-15492)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (2-144)||(40638-40780)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (8-202)||(43830-44023)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (1-75)||(87637-87711)
scaffold0045 (173-268)||(87457-87548)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (8-117)||(38080-38189)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (14-123)||(1510-1619)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (98-253)||(2573-2725)
scaffold0473 (1-65)||(2738-2802)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (8-52)||(5634-5678)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (192-268)||(11550-11626)
scaffold0151 (228-268)||(11601-11641)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (8-75)||(858-925)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-70)||(3937-3999)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (179-268)||(9253-9339)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (227-268)||(922-963)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-106)||(1803-1895)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (8-70)||(7292-7354)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 602879 - 602627
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  602879 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 602780  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  602779 ttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctg 602680  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  602679 atgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatgaacttgcttctgatga 602627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 39693527 - 39693793
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  39693527 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 39693626  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39693627 ttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 39693726  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | ||||| ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39693727 atgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatg-acatgcttttgatgaacttgtttctgatga 39693793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23185385 - 23185135
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  23185385 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 23185286  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  23185285 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 23185188  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23185187 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 23185135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16207298 - 16207528
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  16207298 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 16207397  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16207398 ttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctg 16207497  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16207498 atgaactagagcttctggtgatctttagctt 16207528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12757922 - 12757670
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  12757922 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 12757823  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  12757822 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctg 12757723  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| |||| || ||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  12757722 atgaactagagctactggtgatcttcagcttctgatcaacttgcttctgatga 12757670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16681462 - 16681198
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| |    
T  16681462 gagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 16681363  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16681362 ttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 16681263  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16681262 atgaactttagcttctagtgatctt--gcttatgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16681198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 19156188 - 19156440
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  19156188 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 19156287  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  19156288 ttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttg 19156387  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19156388 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 19156440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 21932875 - 21933142
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||   || | || ||||| |    
T  21932875 gagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcct 21932974  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21932975 ttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 21933074  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || || ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21933075 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatga 21933142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17525888 - 17525619
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  17525888 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 17525789  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  17525788 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcct 17525689  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17525688 gatgaactacagtttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgacgaacttgcttctgatgatgtc 17525619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 16188976 - 16189244
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  16188976 gagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaatcat 16189075  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16189076 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 16189175  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    || |||| | |||||| ||||| ||  |||| |  || |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16189176 atgaacttcggcttctggtgatctt--gcttctaatg-agatacttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 16189244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17797414 - 17797679
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| || |    
T  17797414 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaattcct 17797513  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  17797514 ttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatctcctg 17797611  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17797612 atgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatga 17797679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17914451 - 17914717
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| |    
T  17914451 gagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 17914550  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||     
T  17914551 ttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactccta 17914650  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17914651 atgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatga 17914717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 29693307 - 29693573
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||   || |||||||||| |    
T  29693307 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcct 29693406  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  29693407 ttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatctccta 29693506  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||| | ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29693507 atgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 29693573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943494
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaag-aactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 267  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19943434 cttcagcttctagtgatctttagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttccgatg 19943494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083070
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 33083070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24646330 - 24646596
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  || | | |||||| |    
T  24646330 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaatcct 24646429  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24646430 ttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcttg 24646529  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || ||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24646530 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-aagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 24646596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17441966 - 17441737
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  || ||| |||||| |    
T  17441966 gagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctt-caaatcct 17441868  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17441867 ttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctg 17441768  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  17441767 atgaactagagcttctggtgatcttcagctt 17441737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 18679807 - 18680057
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  18679807 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 18679906  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||  ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  18679907 atcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 18680006  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || |  ||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  18680007 atgaaatgaagcttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 18680057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18121265 - 18121038
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  || | || ||||| |    
T  18121265 gagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcct 18121169  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121168 ttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 18121069  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  18121068 atgaactagagcttctggtgatctttagctt 18121038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15336246 - 15335982
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || | |||||||| ||    
T  15336246 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15336147  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||  || | |||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15336146 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15336049  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15336048 tgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatga 15335982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15425311 - 15425047
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || | |||||||| ||    
T  15425311 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15425212  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||  || | |||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15425211 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15425114  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15425113 tgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatga 15425047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15516615 - 15516351
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || | |||||||| ||    
T  15516615 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15516516  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||  || | |||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15516515 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15516418  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516417 tgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatga 15516351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18321318 - 18321097
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  || |  ||||||| |    
T  18321318 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcct 18321219  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || |||||||  ||||||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18321218 ttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 18321119  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  18321118 atgaacttcagcttctggtgat 18321097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20382553 - 20382289
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||   |||||||||||| |    
T  20382553 gagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcct 20382454  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  || |||||| |||| ||| | ||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20382453 ttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctg 20382354  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20382353 atgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttttgatga 20382289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24551266 - 24551531
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  24551266 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 24551365  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| |||||| | |||||  ||||||| | ||    
T  24551366 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatg 24551463  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  24551464 atgaactgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctaatgaactcgcttatgatga 24551531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263506
Alignment:
Q  15 gtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgt 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| ||||||||||||| |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  115 tgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaact-ttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  214 tcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||  |||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23263557 tctgatgatctt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 23263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30421588 - 30421359
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaa--gaactagcatctgatactttcaaatc 98  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  || | ||||||||    
T  30421588 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 30421490  T
Q  99 ttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcc 198  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||| |    
T  30421489 cattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatcttc 30421392  T
Q  199 tgataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  30421391 tgatgaactgcagcttctggtgattttgagctt 30421359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40845546 - 40845282
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||| |||| |    
T  40845546 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaatcct 40845447  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||   |||||||||||    
T  40845446 tccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatctcctg 40845350  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40845349 atgaactatagcttctggtgagtcttagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 40845282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17267466 - 17267686
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  17267466 gagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcct 17267565  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||  | | ||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17267566 ttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 17267664  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  17267665 atgaacttcagcttctggtgat 17267686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17701737 - 17701958
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| |||||||  || | |||||||| |    
T  17701737 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaatcct 17701836  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  17701837 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctg 17701936  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  17701937 atgaacttcagcttctggtgat 17701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 9320567 - 9320827
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  9320567 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 9320666  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaa-caacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||||| || || | |||||| | ||||||  ||||||  ||||| ||    
T  9320667 ataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatcctctgatgaa 9320764  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9320765 ctgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 9320827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18718993 - 18719214
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  18718993 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 18719092  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| |||||  |||| ||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  18719093 atcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 18719192  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    |  ||||  ||||||| |||||    
T  18719193 aagaacttaagcttctggtgat 18719214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45538598 - 45538348
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  45538598 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcct 45538499  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| |||||| | |||||  ||||||| | ||    
T  45538498 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatg 45538401  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| ||||||||| |||| || | |||| |||||||||||    
T  45538400 atgaactgcagcttctggtgatttttggcttatgataaactcgcttctgatga 45538348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 1237641 - 1237894
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||  || | |||||||| |||||||||||||    
T  1237641 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 1237740  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | |||||| | |||||  ||||||| | |||| || | ||||    
T  1237741 gttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcagc 1237838  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1237839 ttctggtaatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 1237894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 36105187 - 36105452
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||  | ||||  || | |||||||| |    
T  36105187 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcct 36105286  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  36105287 tccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctg 36105384  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36105385 atgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 36105452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 22673770 - 22674035
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||   ||| |||| |    
T  22673770 gagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatcct 22673869  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||| |    ||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||||| |    
T  22673870 tccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctccgg 22673967  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22673968 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 22674035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 265
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745742
Alignment:
Q  116 gcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttc 215  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  216 ttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    | ||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 22663120 - 22663371
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||   ||| ||||||| |||||||||     
T  22663120 gagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagtt 22663219  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |  | ||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||| |    
T  22663220 gttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaac 22663317  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 266  Q
    |||| ||||| || ||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22663318 ttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcatctgat 22663371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20255634 - 20255529
Alignment:
Q  91 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtctt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  20255634 ttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtctt 20255535  T
Q  191 gcatct 196  Q
    ||||||    
T  20255534 gcatct 20255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722670
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||  ||||||| || | |||||||  ||||||||    
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttct 136  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttct 18722670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18731015
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||  ||||||| || | |||||||  ||||||||    
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttct 136  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttct 18731015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685421
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||  ||||||| || | |||||||  ||||||||    
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttct 136  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttctggtcttct 18685421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24833192 - 24832965
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | ||||||||  |||||| ||| | ||||||||||    
T  24833192 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagccattgcttcact 24833093  T
Q  124 tttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||  || ||| ||| | |||| | |||||| | |||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||    
T  24833092 ttt-cagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgat 24832996  T
Q  223 ttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  24832995 ttttagcttctaataaacttgcttctgatga 24832965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 6407718 - 6407958
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||         |||  | |    
T  6407718 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc---------caatgcct 6407808  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||| |||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6407809 tccaaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 6407905  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| ||||||   | ||| || ||||||||||| ||||||    
T  6407906 atgaactgcagcttctggtgattcacaacttctgatgaacttgcttttgatga 6407958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 43644888 - 43644970
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||    
T  43644888 gagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatc 43644970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 19707498 - 19707565
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19707498 gagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttctt 19707565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 25164062 - 25164129
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  25164062 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactctt 25164129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14989610 - 14989536
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14989610 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 14989536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3598340 - 3598243
Alignment:
Q  166 aacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3598340 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctga 3598243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18151805 - 18151731
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18151805 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaa 18151731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33560359 - 33560301
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33560359 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 33560301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 43639782 - 43640031
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||   ||||||||||||||||| ||  ||||         |||||  | ||||||||    
T  43639782 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctttgaaaaataagca---------ttcaatgcctttcaaaa 43639872  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||    |||||||||||||| |||| |  |||| |||  || |||||    |||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  43639873 tagtcgttgtcatacttttccagtcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcatgatgaact 43639970  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     || ||||| |||||    ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639971 gcatcttctggtgatacacagcttctgatgattttgcttctgatgaacttgcttctgatga 43640031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Original strand, 43774053 - 43774126
Alignment:
Q  196 tcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatga 268  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43774053 tcctgatgaactacagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatga 43774126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13430785 - 13430713
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13430785 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaa 13430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 45568059 - 45567943
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |  | ||||  || | |||||||| ||    
T  45568059 agacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctt 45567960  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgct 118  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  45567959 tcaaattagccgttgct 45567943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 21288419 - 21288465
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  21288419 tagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctttga 21288465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 21301038 - 21301084
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  21301038 tagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttga 21301084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14989447 - 14989369
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14989447 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 14989369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 272
Target Start/End: Original strand, 19156415 - 19156444
Alignment:
Q  243 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156415 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 19156444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 272
Target Start/End: Original strand, 21301230 - 21301259
Alignment:
Q  243 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301230 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 21301259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 268
Target Start/End: Original strand, 21541184 - 21541216
Alignment:
Q  236 tgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21541184 tgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 21541216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461731
Alignment:
Q  15 gtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 67  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctct 22461731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 19884696 - 19884947
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  19884696 gagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 19884795  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19884796 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 19884894  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19884895 atgaactacagcttctggtgattgtcagcttctgatgaacttgcttctgatga 19884947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 3395584 - 3395840
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| |    
T  3395584 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaatcct 3395683  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3395684 ttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatctcctg 3395783  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaactt 257  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || | ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3395784 atgaactatagcttctagtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatgaactt 3395840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29680661 - 29680431
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  29680661 gagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 29680562  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29680561 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctg 29680462  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
     ||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  29680461 gtaaactagagcttctggtgatcttcagctt 29680431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37435652 - 37435388
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  37435652 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37435553  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37435552 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 37435453  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  || | || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37435452 atgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 37435388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 45833395 - 45833654
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  || | |||||||  ||||||||    
T  45833395 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaa 45833494  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45833495 tagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 45833594  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45833595 agagcttctggtgatctttagcttctgatg-agatgcttatgataaacttgcttctgatga 45833654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12811292 - 12811074
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  12811292 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaatcct 12811196  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12811195 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 12811096  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||| ||||||| |||||    
T  12811095 atgaactagagcttctggtgat 12811074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16632434 - 16632655
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  || | ||||||||||    
T  16632434 gagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaatctt 16632533  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16632534 ttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 16632633  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  16632634 atgaactttagcttctagtgat 16632655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19666366 - 19666567
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||   || |||||||||| |    
T  19666366 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaatcct 19666465  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19666466 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatctcctg 19666565  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  19666566 at 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37985729 - 37985528
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  37985729 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37985630  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37985629 ttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 37985530  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  37985529 at 37985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 10072929 - 10073165
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  || | |||||||| |    
T  10072929 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcct 10073028  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10073029 ttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 10073127  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtga 238  Q
    || |||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  10073128 atgaactactgcttctggtaattttcagcttctggtga 10073165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675409
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| || ||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
     |||||||| | ||||||| ||||    
T  22675432 gcagcttctggggattttttgctt 22675409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19621178 - 19620963
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  19621178 gagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 19621079  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19621078 ttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcctg 19620979  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  19620978 atgaacttcagcttct 19620963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413246
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   || | |||||||| ||||||| ||| |    
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagc 413205  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  413206 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247502
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||   || | |||||||| |||||||     
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaat 17247344  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||| ||||    
T  17247345 tagtcgttgcttcacttt-ccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagatt--catctcctgatgaact 17247441  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17247442 gcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 17247502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483963
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |   |||||| |||||||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||||| |    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatct 3483938  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctg 249  Q
    | ||||| || ||||||||||||||    
T  3483939 tcagcttctgatgaacttgcttctg 3483963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601291
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttca 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  105 aaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctc 197  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctc 12601291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 9140906 - 9141097
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  9140906 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 9141005  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgc 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9141006 ttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 56034568 - 56034816
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||  |    
T  56034568 gagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattat 56034667  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  56034668 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 56034767  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgat 251  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||    
T  56034768 atgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgat 56034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 10692845 - 10693095
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  10692845 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10692944  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  10692945 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 10693042  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  10693043 atgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 10693095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 10906611 - 10906861
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  10906611 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10906710  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  10906711 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 10906808  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  10906809 atgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 10906861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13576207 - 13576003
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||     
T  13576207 tagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactc 13576108  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  13576107 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 13576010  T
Q  225 ttagctt 231  Q
    | |||||    
T  13576009 tcagctt 13576003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 6517479 - 6517729
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||| |    
T  6517479 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaatcct 6517578  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | || ||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6517579 tccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 6517676  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  6517677 atgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 6517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14605023 - 14604759
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaat-ctt 100  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || ||||||||| |||    
T  14605023 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 14604924  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14604923 ttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctg 14604824  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || |  |||||||  |||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14604823 atgaagtttagcttctgatgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 14604759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 55380284 - 55380499
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  55380284 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 55380383  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || |||| |   |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  55380384 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 55380482  T
Q  200 gataaactacagcttct 216  Q
     || |||| ||||||||    
T  55380483 aatgaacttcagcttct 55380499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14904473 - 14904252
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||  ||   |||||||| |    
T  14904473 gagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaatcct 14904374  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14904373 ttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctg 14904274  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||||| ||||| |||||    
T  14904273 atgaactacaacttctggtgat 14904252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19911994 - 19911782
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaa-gaactagcatctgatactttcaaatcttttc 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |||  ||||||  || |||||||||| ||||    
T  19911994 cacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttc 19911895  T
Q  104 aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgata 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  19911894 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 19911795  T
Q  204 aactacagcttct 216  Q
    ||||||| |||||    
T  19911794 aactacaacttct 19911782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680150
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||  || | |||||||| ||||||||    
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |  ||| | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 54680126  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  54680127 gcagcttctggtgattttcagctt 54680150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833605
Alignment:
Q  60 aacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat 159  Q
    |||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  160 ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttct 14833605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 8105638 - 8105898
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  8105638 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 8105737  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaa-caacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| || || |||| |||||| | ||||||  ||||||  || || ||    
T  8105738 atagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt--tgcatcctctaatgaa 8105835  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |  || ||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8105836 cggcaacttctggtgatttttaacttctgataaacttgcttctgatgaactcacttctgatga 8105898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 29121364 - 29121618
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | | |||||||| |    
T  29121364 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcct 29121463  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | |||||| | |||||  ||||||          
T  29121464 ttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat------ 29121555  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
         ||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29121556 -----ctacaacttctggtgatttttagattctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 29121618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 40846093 - 40846359
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||  || ||||||| |       
T  40846093 gagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttca 40846192  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||  || |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  40846193 tttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttct 40846291  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||| |||||||  ||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40846292 gatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgtttctgatga 40846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17398791 - 17398551
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |    
T  17398791 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcct 17398701  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||| |||  || |||||    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  17398700 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 17398604  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||  |||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17398603 atgaaccgcagcttctggtgattcatagcttctgatgaacttgcttctgatga 17398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3105536 - 3105324
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||  |||| |    
T  3105536 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaatcct 3105437  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||    |||| | |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  3105436 ttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 3105340  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  3105339 atgaactgcagcttct 3105324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 56533172 - 56533028
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| || | |||||||| |||||||    
T  56533172 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaa 56533073  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacga 151  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  56533072 atagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacga 56533028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123646
Alignment:
Q  104 aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgata 203  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  204 aactacagcttcttgtgat 222  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgat 23123646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 6641678 - 6641941
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  || | |||||||| |    
T  6641678 gagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaatcct 6641777  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||| ||||| |||||| |||   |||||| || ||| ||| |   |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||    
T  6641778 tttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttctg 6641876  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || | |||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6641877 atgaaattcagcttctggtgatatt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttatgatga 6641941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 16940030 - 16940148
Alignment:
Q  21 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||   || | ||  |||| |||||||||||||||||||      
T  16940030 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctat 16940129  T
Q  121 acttttccagtcttctgca 139  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16940130 acttttccagtcttctgca 16940148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25651214 - 25651084
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||  |||||   || | |||||||| || |||||    
T  25651214 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaa 25651115  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgc 138  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25651114 tagccgttgcttcacttttcaagtcttctgc 25651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23750516 - 23750729
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt-tgaagaactagcatctgatactttcaaatct 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||   || ||| ||||||  || | || || |      
T  23750516 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaacttc 23750612  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcc 198  Q
     ||  ||  ||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23750613 atttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 23750711  T
Q  199 tgataaactacagcttct 216  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  23750712 tgatgaacttcagcttct 23750729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 16853497 - 16853594
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatc 98  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||    
T  16853497 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaatc 16853594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Original strand, 15139328 - 15139427
Alignment:
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  15139328 tagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaact 15139427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3499757 - 3499687
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3499757 gagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcattgaagaaatagcatc 3499687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 22190840 - 22190914
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22190840 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 22190914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 38513896 - 38513946
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38513896 tagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaa 38513946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 3793289 - 3793367
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3793289 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctggtgaacttgcttttgatga 3793367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 267
Target Start/End: Original strand, 55731863 - 55732036
Alignment:
Q  91 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtctt 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| ||||||  ||||||  ||    
T  55731863 ttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagttttaag--tt 55731960  T
Q  191 gcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 267  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||| |    |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  55731961 gcatctcctgatgaactgcagcttccggtgattctcagcttct-aaaaacttgtttctgatgaccttgcttctgatg 55732036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9751657 - 9751575
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9751657 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 9751575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 1672395 - 1672455
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaag 73  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  1672395 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaag 1672455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 1674870 - 1674930
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaag 73  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  1674870 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaag 1674930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 11915720 - 11915832
Alignment:
Q  27 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactttt 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||  |||||  ||||||  || | ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  11915720 gtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagtcgttgcttcactctt 11915819  T
Q  127 ccagtcttctgca 139  Q
      |||||||||||    
T  11915820 ttagtcttctgca 11915832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685509
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 52  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540455
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 67  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactct 17540455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17700719 - 17700680
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17700719 agcttctggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 17700680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 20977451 - 20977521
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  20977451 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttga 20977521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 39419827 - 39419770
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39419827 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct-tttgaagaattagcatc 39419770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 40860661 - 40860735
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40860661 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 40860735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3499571 - 3499530
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3499571 agcttctggtgaacttgcttctgataaacttgcttctgatga 3499530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Original strand, 14571183 - 14571268
Alignment:
Q  166 aacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14571183 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 14571268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17788109
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 56  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtccttt 17788109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3499545 - 3499515
Alignment:
Q  238 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3499545 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 3499515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 14154111 - 14154038
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctctttgaag 73  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||    
T  14154111 gagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaagttgtacaatatcaacgttctttgaag 14154038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17700695 - 17700663
Alignment:
Q  236 tgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17700695 tgaacttgcttctgataaacttgcttctgatga 17700663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 22676 - 22943
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  22676 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 22775  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22776 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22875  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22876 atgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctggtggacttgattctgatga 22943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22600263 - 22599993
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  22600263 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22600164  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22600163 ttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22600064  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    || ||||| ||||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22600063 atgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatg-agatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtc 22599993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28492485 - 28492233
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  28492485 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 28492386  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28492385 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 28492286  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| |||||   ||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  28492285 atgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 28492233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785767
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  32785819 atgaactacaacttctagtgattttcagcttctaatgaacttgcttctaatga 32785767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33256432 - 33256164
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  33256432 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 33256333  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33256332 tttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 33256233  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
     | ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33256232 ttgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtc 33256164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33276604 - 33276336
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  33276604 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 33276505  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33276504 tttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 33276405  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
     | ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33276404 gtgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtc 33276336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1577866 - 1578087
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||  |    
T  1577866 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaattct 1577965  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1577966 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 1578065  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  1578066 ataaactttagcttcttgtgat 1578087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20954554 - 20954288
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||  || |||||||||| |    
T  20954554 gagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcct 20954455  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20954454 ttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 20954355  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20954354 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgaatctgatga 20954288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 38282566 - 38282831
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || | || ||||| |    
T  38282566 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcct 38282664  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38282665 ttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 38282764  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||| | ||||| |||||| | || || |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38282765 atgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatg-agatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 36134189 - 36134438
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||| |    
T  36134189 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctt-caaatcct 36134287  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36134288 ttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatcttctg 36134387  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |   ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  36134388 atga--gacagcttctggtgatcttcagcttctggtggagatgcttctgatga 36134438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22427438 - 22427173
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  22427438 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22427339  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  22427338 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 22427241  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22427240 atgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatga 22427173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402072
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||||    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   ||||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 35402018  T
Q  214 tcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35402019 tctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1900344 - 1900574
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   || | || ||||| |    
T  1900344 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcct 1900443  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1900444 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 1900543  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  1900544 atgaactagatcttctggcgatctttagctt 1900574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22153856 - 22154077
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  22153856 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 22153955  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22153956 ttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22154055  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  22154056 atgaacttcagcttctggtgat 22154077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 19717523 - 19717787
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||| |    
T  19717523 gagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaatcct 19717622  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  19717623 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccat 19717722  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19717723 atgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttatgatga 19717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12284422 - 12284689
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  12284422 gagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 12284521  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  12284522 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 12284621  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaactt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12284622 atgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22464878 - 22464624
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| |||||    
T  22464878 gagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagtc 22464779  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||| |||||  | || ||||||||||| ||||  ||    
T  22464778 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgtag 22464681  T
Q  212 cttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22464680 catctggtgattttcagcttcttatgaacttgcttctggtggacttgcttctgatga 22464624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 48704203 - 48704467
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||   | | |||||||| |    
T  48704203 gagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcct 48704302  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48704303 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 48704402  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| ||||  | |||||| || || |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48704403 atgaactttagcttctggtga--tctagcttctgatg-agatgcttctgatgaactagcttctgatga 48704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10757420 - 10757634
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  10757420 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 10757519  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10757520 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 10757619  T
Q  200 gataaactacagctt 214  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10757620 gatgaacttcagctt 10757634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 2268530 - 2268792
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   || | |||||||| |    
T  2268530 gagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaatcat 2268629  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  2268630 ttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatctccta 2268726  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| |||||| || |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2268727 atgaactttagcttctagtgattgtt-gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 2268792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22201817 - 22201616
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  22201817 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22201718  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22201717 ttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatctcctg 22201618  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  22201617 at 22201616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39201066 - 39200823
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||   |||||||| |||||||     
T  39201066 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaac 39200967  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||| | |||||| |||||  | ||||||||||| || ||||    
T  39200966 tagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 39200869  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
     |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39200868 gcagcttttggtgattttcagcttttgatgaacttgcttttgatga 39200823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16235365 - 16235127
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||   || | |||||||| |||||||||||||    
T  16235365 gagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 16235266  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||| |   ||| |    
T  16235265 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaac 16235168  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16235167 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttacttctgatga 16235127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 29215796 - 29216024
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  29215796 gagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 29215895  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  29215896 ttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 29215993  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || || | || ||||| |||||||| |||||    
T  29215994 atgaattgcaacttctggtgattttcagctt 29216024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 2267088 - 2267301
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||  |    
T  2267088 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattct 2267187  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  2267188 ttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 2267285  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || ||||  |||||||    
T  2267286 atgaactgtagcttct 2267301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23036584 - 23036340
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||   |||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  23036584 tagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactt 23036485  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| ||||| |    
T  23036484 ttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatct 23036387  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    | ||||| || || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23036386 tcagcttctgatg-agatgcttctgatgaaattgcttctgatgatgtc 23036340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 30893091 - 30893298
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||  | |||||||||| |    
T  30893091 gagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcct 30893190  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||   |||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30893191 ttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcct 30893290  T
Q  200 gataaact 207  Q
    ||| ||||    
T  30893291 gatgaact 30893298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 35040165 - 35040415
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||| |    
T  35040165 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaatcct 35040264  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||  ||||| | |||||| |||||| | |||||  ||||||| | ||    
T  35040265 ttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatg 35040362  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || | |||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  35040363 atgaattgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 35040415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25448647 - 25448380
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  25448647 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 25448548  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||||| |||    
T  25448547 ttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatcttctg 25448450  T
Q  201 ataaact--acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||   |||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  25448449 atgaactgcgcagcttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttttgatgaactggcttctaatga 25448380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 2834701 - 2834938
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| ||| |    
T  2834701 gagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 2834800  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| |||||||  |||||||||| ||| |||| ||||    
T  2834801 gttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcagc 2834898  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || |||||||||||||||    
T  2834899 ttctggtgattttcagcttctaatg-acttgcttctgatga 2834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2327509 - 2327255
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagt 111  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||  || | ||| |||| ||||||||||||    
T  2327509 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagt 2327410  T
Q  112 cgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacag 211  Q
      ||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||  || |||| | | |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  2327409 ttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 2327312  T
Q  212 cttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2327311 cttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 2327255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 21702813 - 21703081
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||   || |  |  |||| |    
T  21702813 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaatcct 21702912  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||  || |||||    |||||  |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21702913 ttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaagt--tgcatctcctg 21703009  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    || |||| |||||||| ||||||   ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703010 atgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 21703081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48570312 - 48570048
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||  |||| |    
T  48570312 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaatcct 48570213  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||||||||  || |||||  | |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48570212 tccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctg 48570116  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || |||||||||| |||||| | ||||| || | || |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48570115 atgaattacagcttctggtgattctcagcttctgataaaattgcttatgatgaacttgtttctgatga 48570048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44821626 - 44821376
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||   |  | |||||||| |    
T  44821626 gagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaatcct 44821527  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||   |||||||||  || |||||  | |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  44821526 tccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctg 44821429  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||||||| | |||||| | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  44821428 atgaactacagcttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 44821376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 46088988 - 46089244
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |    
T  46088988 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcct 46089078  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  |||| |||  || |||||    |||| | |||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  46089079 ttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcatg 46089176  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| |||||    | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46089177 atgaactgcagcttctggtgatacacaacttatgatgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 46089244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Original strand, 7309842 - 7310018
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||  || | ||||||||  | ||||||   ||||||||||||     
T  7309842 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgct-tttgaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgcttcactc 7309940  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||  ||||||||||| | ||||||||| | | |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7309941 ttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 7310018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12613895 - 12613713
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |  || ||||||||||||    
T  12613895 gagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaatctt 12613796  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaa 185  Q
    ||  || ||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||  ||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  12613795 tt-gaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 10250985 - 10251240
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||  || | |||           
T  10250985 gagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc------- 10251077  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
      |||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||  | |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  10251078 --caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctg 10251172  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  10251173 atgaactgcagcttctggtgattcatagcttctgatgaacttgctttcgatgaacttgcttttgatga 10251240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263369
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  || | |||||||| ||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14263426  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaat 164  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||    
T  14263425 tagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatccaat 14263369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 21028792 - 21029044
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || | | ||||||  || | ||||| |       
T  21028792 gagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttca 21028891  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||| || || ||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||  ||| | ||     
T  21028892 tttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatattcta 21028991  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21028992 atgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttttgatga 21029044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 30572203 - 30572334
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  | ||||  || ||||  |||| ||||||||    
T  30572203 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaa 30572302  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  30572303 tagccgttgctatacttttccagtcttctgca 30572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21191946 - 21191808
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  21191946 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21191847  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    ||  || |||  ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21191846 tttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgca 21191808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7745159 - 7744906
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| ||||||| ||       
T  7745159 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaact 7745060  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||||| | ||| | ||||||| |||| |  ||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||| || |  |||||||| ||||| |||| ||||    
T  7745059 gttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaactgcagc 7744962  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| ||||| | | |||| || ||||   |||||| || ||||||||||||||||    
T  7744961 ttctggtgatatatggcttctgatgaaacagcttctaataaacttgcttctgatga 7744906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26702210 - 26701958
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || | | || |||  || | ||||| |       
T  26702210 gagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttca 26702111  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || || | ||||||||||| | |  |||||||||| |||| | |||| ||| ||||||   |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  26702110 tttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctg 26702011  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||  ||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||    
T  26702010 atgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatgaacttgcttctgatga 26701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17025021 - 17024923
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||  || | |||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  17025021 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 17024923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 37642247 - 37642329
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37642247 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 37642329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204930
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 21204930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284701
Alignment:
Q  16 tagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 42284701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21121145 - 21121071
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21121145 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 21121071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21135241 - 21135167
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21135241 gagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaa 21135167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 21984619 - 21984669
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21984619 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 21984669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 19215611 - 19215681
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||    
T  19215611 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttga 19215681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 23024787 - 23024857
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  23024787 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttga 23024857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34255400 - 34255359
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34255400 agcttctggtgaacttgcttctgataaacttgcttctgatga 34255359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17024855 - 17024796
Alignment:
Q  209 cagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||  |||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17024855 cagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaacttgcttctgatga 17024796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19170245 - 19170164
Alignment:
Q  189 ttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaac--ttgcttctgatga 268  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19170245 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaacttgcttctgatgaacttttgcttctgatga 19170164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34255374 - 34255344
Alignment:
Q  238 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255374 aacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 34255344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 10757630 - 10757671
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10757630 agcttttgatgatcttgcttctgatgaacttgctcctgatga 10757671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 17371261 - 17371290
Alignment:
Q  239 acttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17371261 acttgcttctgatgaacttgcttctgatga 17371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 19215807 - 19215848
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19215807 agcttctggtgaatttgcttctgatgaatttgcttctgatga 19215848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 29918018 - 29918231
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  29918018 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttt 29918117  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29918118 tcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-atgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 29918216  T
Q  202 taaactacagcttct 216  Q
    | |||||||||||||    
T  29918217 tgaactacagcttct 29918231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 32544265 - 32544517
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || | || ||||| |    
T  32544265 gagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaatcct 32544364  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32544365 ttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 32544464  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| ||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  32544465 atgaactagagcttatggtgattttcagcttctgatgaacttgcatctgatga 32544517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 13602172 - 13602438
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||  ||||||  || | ||||| || |    
T  13602172 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaattcat 13602271  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13602272 ttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 13602371  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13602372 atgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13602438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20112849 - 20112596
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  20112849 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 20112750  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |    
T  20112749 ttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctctt 20112650  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| |||| |||||||  ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20112649 gatgaacttcagcttcaggtgatctttagcttctgaagaacttgcttctgatga 20112596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26972375 - 26972110
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | || ||||| |    
T  26972375 gagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaatcct 26972278  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26972277 ttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 26972178  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || || ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26972177 atgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttctaataaacttgcttctgatga 26972110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 9717843 - 9718109
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | || ||||| |    
T  9717843 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcct 9717942  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9717943 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 9718042  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| ||||| |||| ||| || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9718043 atgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatg-ggatgcttatgataaacttgcttctgatga 9718109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284830
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||   || | |||||||| |    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| | ||| ||  |||| || || |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23284764 atgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatg-agatgcttctaatgaacttgcttctgatga 23284830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12715569 - 12715318
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||   || |||||||||| |    
T  12715569 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcat 12715470  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12715469 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 12715370  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||||| ||||||||||    
T  12715369 gatgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatgaacttccttctgatga 12715318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 18435580 - 18435823
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18435580 tagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 18435679  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||| |||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |    
T  18435680 ttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatct 18435779  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  18435780 tcagcttctgatgaacttgcttctagtggactagcttctgatga 18435823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730603
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||  |||||| |||||||| ||||   | || |||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctg 20730656  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20730655 atgaactgcagcttctagtgattttcagcttatgatgaacttgcttctgatga 20730603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 22802153 - 22802391
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | || ||||  ||||||| | |||    
T  22802153 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtc 22802252  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||| |    
T  22802253 gttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaac 22802350  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  22802351 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 22802391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14100582 - 14100374
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  14100582 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14100483  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14100482 tagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaact 14100383  T
Q  208 acagcttct 216  Q
     ||||||||    
T  14100382 tcagcttct 14100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435798
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||   || |||||||||| |||||||||||||    
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 13435743  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | ||||| ||  |||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13435744 ttatggtgatcttctgcttctgatg-agatgcttttgatgaacttgcttctgatga 13435798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15531761 - 15531503
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||  |    
T  15531761 gagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataacc 15531662  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  15531661 gttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaac 15531562  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||| ||||| ||  | || || || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15531561 ttctggtgatcttatgattctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgattatgtc 15531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 15302200 - 15302398
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||  || | || ||||| |    
T  15302200 gagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcct 15302299  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15302300 ttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 15302398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16265299 - 16265049
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||| | |    
T  16265299 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaaacct 16265200  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||||||||| ||    
T  16265199 ttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatctcttg 16265102  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |  |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16265101 acgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 16265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22076556 - 22076291
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||| |||| |    
T  22076556 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaatcct 22076457  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||||||||  | |||| | ||| || |||||||  ||||||||||||    
T  22076456 tccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctg 22076359  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22076358 atgaactacatcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 22076291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618509
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| || |||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 21618350  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||| ||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  21618351 tagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaact 21618448  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618449 acagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21618509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625301
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   || | |||||||  ||||||| ||| ||    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccg 21625212  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgat 21625301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688979
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttct 19688979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15987233 - 15987435
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaat-ct 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | ||||||| |     
T  15987233 gagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccc 15987332  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15987333 ttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttct 15987432  T
Q  200 gat 202  Q
    |||    
T  15987433 gat 15987435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 19086158 - 19086399
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||           
T  19086158 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttc------- 19086250  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaa-caacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
       |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| || || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19086251 ---aaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatctcct 19086346  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  19086347 gatgaacttcagcttctggtgatcttcagc-tctgatgaacttgcttctgatga 19086399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19623980 - 19624200
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||   |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  19623980 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 19624078  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19624079 ttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctg 19624178  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  19624179 atgaacttcagcttctggtgat 19624200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 16877220 - 16877463
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || | |||||||| ||| || |    
T  16877220 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaaga 16877319  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16877320 tagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 16877417  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| ||| | ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16877418 acaacttttggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 16877463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18378314 - 18378496
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||  || | |||||||| |    
T  18378314 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaatcct 18378413  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaacttt 183  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  18378414 ttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24116828 - 24117050
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  24116828 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 24116927  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||  || | |||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24116928 ttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatcttct 24117027  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||    
T  24117028 gatgaacttcatcttctggtgat 24117050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20488060 - 20487801
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  20488060 aaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 20487961  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaatt-aaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  || ||  ||| | |||||| |||||| | |||||  |||||||  ||||| |||    
T  20487960 tagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaac 20487863  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  20487862 tgcaacttctagtgatttttagcttctgataaacttgcttctgattaactcgtttctgatga 20487801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 15954703 - 15954953
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||   || | |||||||| |    
T  15954703 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcct 15954802  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  15954803 ttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttg 15954900  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||||||||| || ||| | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  15954901 atgaactacagcttctggtaattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 15954953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451596
Alignment:
Q  31 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||   ||||   || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  131 tcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 34451596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19833175 - 19832916
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  19833175 aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 19833076  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  || |||||  | |||| | ||| || |||||||  |||||||||||||| |||    
T  19833075 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 19832978  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||| || | | |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19832977 tacatcttctggtgattctcagcttctgataatcttgctttggatgaacttgtttctgatga 19832916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Original strand, 25597569 - 25597745
Alignment:
Q  91 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtctt 190  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25597569 ttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtctt 25597668  T
Q  191 gcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25597669 gcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatg-agatgcttctgatgaacttgcttcagatga 25597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 16336127 - 16336381
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||   || | ||| |||| |    
T  16336127 gagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaatcct 16336226  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  16336227 tccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatctcctg 16336324  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgctt 261  Q
    || | ||||| ||||| |||||| | ||||| || | ||    ||||||||||||||||||    
T  16336325 atgatctacaacttctggtgattctcagcttctgataaa----cttctgatgaacttgctt 16336381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423410
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||   || | ||| |||| |    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcct 12423360  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacga 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12423361 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcatt-cttagacga 12423410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235363
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||    |||    
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa----gtc 21235232  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
           || ||   ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  21235233 -------ca-ttgaacagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactgcagc 21235322  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21235323 ttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 21235363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349205
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctttt 102  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||  |||| |||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatccttt 12349094  T
Q  103 caaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||    |||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  12349095 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgat 12349191  T
Q  203 aaactacagcttct 216  Q
     |||| ||||||||    
T  12349192 gaactgcagcttct 12349205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| |||  || |||||    
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaa 185  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 25594068 - 25594150
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  25594068 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatc 25594150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 26943577 - 26943719
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||  || | ||| |||| |     
T  26943577 agacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatccta 26943676  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgct 144  Q
    |  ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26943677 ttgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgct 26943719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 17381521 - 17381596
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaac 76  Q
    |||||| |||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17381521 gagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaac 17381596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33352075 - 33351939
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||  ||  |||  |||| |    
T  33352075 gagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc-ttgaagaataaacatccaatgtttttcaatcct 33351977  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  33351976 ttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgca 33351939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470933
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||   |||||| ||||||  || | |||||||| |||  || ||||||    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||||| | |||  ||||| |||| ||| ||| ||  ||||||||   ||||||||||||||| ||| |  |||  |||||  |||| | || || ||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaact 19470881  T
Q  214 tcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19470882 tcttgtgatgtt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 19470933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19066167 - 19066093
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  19066167 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaa 19066093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 17381610 - 17381679
Alignment:
Q  199 tgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17381610 tgatgaactgcaggttctggtgatttttggcttttgataaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 17381679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 19482752 - 19482822
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  19482752 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttga 19482822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Original strand, 26589782 - 26589858
Alignment:
Q  192 catctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||||   ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26589782 catctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttcagatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 26589858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17316674 - 17316583
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatacttt 92  Q
    |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||| |||  |||||| ||| ||||    
T  17316674 gagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccgatgcttt 17316583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19065987 - 19065926
Alignment:
Q  192 catctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19065987 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatga 19065926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Original strand, 22386958 - 22387052
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22386958 tttgaaactttaggt--tgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttatgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatga 22387052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17608286 - 17608222
Alignment:
Q  189 ttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17608286 ttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatga 17608222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 268
Target Start/End: Original strand, 19482957 - 19482989
Alignment:
Q  236 tgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19482957 tgaacttgcttctgatgaacttgcatctgatga 19482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 26589599 - 26589671
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaa 72  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  26589599 gagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaa 26589671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Original strand, 26589845 - 26589873
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26589845 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 26589873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 9069558 - 9069825
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   || | || ||||| |    
T  9069558 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaatcct 9069657  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9069658 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctg 9069757  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || || ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9069758 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatga 9069825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 15088516 - 15088768
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  15088516 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcct 15088615  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15088616 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctg 15088715  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || || ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15088716 atgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctgatga 15088768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10883335 - 10883072
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || | |||||||| |    
T  10883335 gagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcct 10883236  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10883235 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 10883136  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||| || ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  10883135 atgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatg-ggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13302806 - 13303027
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| |    
T  13302806 gagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 13302905  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13302906 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 13303005  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  13303006 atgaactacagcttctggtgat 13303027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2913770 - 2913518
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  2913770 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 2913671  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2913670 ttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatctcctg 2913571  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||||||| |||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||    
T  2913570 atgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatgaacttgcttttgatga 2913518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 44467060 - 44467312
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  44467060 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 44467159  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44467160 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 44467259  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatg 252  Q
    ||| |||| |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  44467260 gatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 44467312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 13880100 - 13880370
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || | |||||||| |    
T  13880100 gagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaatcct 13880199  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  13880200 ttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaattcctg 13880299  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    || ||||| |||||||  |||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880300 atgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 13880370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33691874 - 33691624
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||  |    
T  33691874 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaattct 33691775  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33691774 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatctcctg 33691675  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgat 251  Q
    || ||||| ||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  33691674 atgaactagagcttctggtgattttcaacttctaatgaacttgcttctgat 33691624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13138057 - 13137824
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  13138057 gagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 13137958  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13137957 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctt 13137858  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttg 234  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  13137857 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttttg 13137824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48237064 - 48236814
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |    
T  48237064 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcct 48236965  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  48236964 ttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 48236867  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  48236866 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 48236814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2500034 - 2500286
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |  ||||||  || |||||||||| |    
T  2500034 gagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaatcct 2500133  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2500134 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 2500233  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | |||| | ||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  2500234 aaaaacaagagcttctggtgatcctcagcttctgatgaacttgcttatgatga 2500286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 21695397 - 21695649
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  21695397 gagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcat 21695496  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21695497 tttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttg 21695596  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21695597 atgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttatgatga 21695649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 30025901 - 30026153
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | ||||| ||||    
T  30025901 gagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaattctt 30026000  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||| | |||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  30026001 ttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcttg 30026100  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  30026101 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 30026153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21283535 - 21283271
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || | |||||||| |    
T  21283535 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcct 21283436  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21283435 ttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctg 21283336  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| || ||||| ||||| ||  |||| || |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21283335 atgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatt-cttctgatgaacttgattctgatga 21283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279875
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcc-atgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23279915  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttc 247  Q
    ||| ||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||||    
T  23279914 acaacttctggtgattttcaccttctgacgaacttgcttc 23279875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28622518 - 28622268
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  || | |||||||| |    
T  28622518 gagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcct 28622419  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  28622418 ttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 28622321  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28622320 atgaactgcagcttctggtgatttttagcttatgatgaacttgcttctgatga 28622268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13730837 - 13730638
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  13730837 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatctt 13730738  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13730737 ttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcctg 13730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11792903 - 11793133
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||  |    
T  11792903 gagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaatgct 11793002  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11793003 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctg 11793102  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  11793103 atgaacttcagcttctggtgatctttagctt 11793133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468127
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||| |||||||||    
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 15468123  T
Q  213 ttct 216  Q
    ||||    
T  15468124 ttct 15468127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 28409035 - 28409300
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  28409035 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 28409134  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  28409135 ttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttg 28409234  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  ||||||| |||| | || |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28409235 atgaactttagcttctggtgactgtt-gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 28409300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22578183 - 22577962
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||   || | |||||||| |    
T  22578183 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaatcct 22578084  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22578083 ttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22577984  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  22577983 atgaacttcagcttctggtgat 22577962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24788137 - 24788358
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  || | |||||||| |    
T  24788137 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcct 24788236  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24788237 ttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 24788336  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  24788337 atgaacttcagcttctggtgat 24788358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16316719 - 16316455
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  16316719 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcct 16316620  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16316619 ttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctg 16316520  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| || ||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16316519 atgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16316455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30944485 - 30944272
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  30944485 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 30944386  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30944385 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30944288  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  30944287 atgaactgcagcttct 30944272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 11319401 - 11319660
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||  |||||  || | |||||||| |    
T  11319401 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcct 11319500  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11319501 ttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttg 11319600  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgctt 261  Q
    || | ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||||||||    
T  11319601 atgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgctt 11319660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945305
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || | |||||||| |    
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  30945320 atgaactgcagcttct 30945305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29935520 - 29935300
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  29935520 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 29935421  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || |||   |  |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29935420 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctcctg 29935322  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  29935321 atgaactttagcttctggtgat 29935300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9709940 - 9709736
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||     
T  9709940 tagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactc 9709841  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  9709840 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattt 9709743  T
Q  225 ttagctt 231  Q
    | |||||    
T  9709742 tcagctt 9709736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21692283 - 21692498
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  21692283 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21692382  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| || ||||||  || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  21692383 ttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatctccta 21692482  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  21692483 atgaacttcagcttct 21692498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Original strand, 33605705 - 33605932
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  33605705 tagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcaatt 33605804  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatt 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| | || |||||| |||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  33605805 ttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatt 33605902  T
Q  224 tttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| || |||| | | |||||||||    
T  33605903 ttcagcttctgatgaattcgattctgatga 33605932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13648725 - 13648926
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||  ||   || ||||| |    
T  13648725 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcct 13648824  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13648825 ttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctg 13648924  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  13648925 at 13648926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12366910 - 12366690
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||||  || |||||||||| |    
T  12366910 gagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcct 12366811  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12366810 ttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctg 12366711  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtga 221  Q
    || |||| |||||||| ||||    
T  12366710 atgaacttcagcttctggtga 12366690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35952850 - 35952585
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  || | |||||||| |    
T  35952850 gagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcct 35952751  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  || ||| ||| | |||| | |||||| | |||||  |||||||  ||    
T  35952750 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctct 35952653  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 267  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35952652 gatgaactgcaacttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaatttgcttctgatg 35952585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16112046 - 16111796
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |  |    
T  16112046 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaatttct 16111947  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||  || ||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||  |||    
T  16111946 tccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcctctg 16111849  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||    
T  16111848 atcaactgcagcttctggtgatttttatcttctaataaacttgcttctgatga 16111796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5000984 - 5000788
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||   || |||||||||| |    
T  5000984 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcct 5000885  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttc-cagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5000884 ttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12174496 - 12174237
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  12174496 aaacagagtactaaaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 12174397  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaat-gaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||| ||  |||| | |||||| | |||||  |||||||  ||||| ||    
T  12174396 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagc-ttaag--ttgcatcctctgatgaa 12174300  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12174299 ctgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 12174237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14426543 - 14426756
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  14426543 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 14426642  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  || |||||| | |||| | | |||| |||||||  ||||||||||||    
T  14426643 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctg 14426740  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| || |||||    
T  14426741 atgaactgcaccttct 14426756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaa 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 4821470 - 4821734
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  4821470 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc-t 4821568  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |  ||||||||  || |||    | |||| | |||||| |||||||  ||| |||||| |    
T  4821569 ttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatctccgg 4821666  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4821667 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgacgaacttgcttctgatgaccttgcttttgatga 4821734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14193110 - 14193243
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   || | |||||||| |    
T  14193110 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatcct 14193209  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14193210 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 331641 - 331894
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||  || | |||| ||| |    
T  331641 gagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatccaatgccttcagatcct 331739  T
Q  101 ttc-aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||   ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  331740 ttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatctcct 331838  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaac--ttgcttctgatga 253  Q
    |||  ||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  331839 gatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttttgcttctgatga 331894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692606
Alignment:
Q  26 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||         |||    |||||||||||| ||||||||||| |    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatc---------caatgtctttcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  126 tccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttt 225  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  226 tagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
      |||| ||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13692563 --gcttctgaag-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 13692606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39284726 - 39284475
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  || | |||||||       
T  39284726 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattca 39284627  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||||||||| |||||| |||  |||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||||||| |||| | |||  ||||| |||    
T  39284626 tttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctg 39284528  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  39284527 atgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 39284475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542932
Alignment:
Q  31 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 130  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  131 tcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagct 230  Q
    ||||||||| |  ||| ||||  || |||||| | |||| | |||||| | |||  | |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| || |    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtt 16542955  T
Q  231 tttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | || ||||||| ||||||||||    
T  16542954 tctgatgaactttcttctgatga 16542932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622730
Alignment:
Q  31 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 130  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  131 tcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagct 230  Q
    ||||||||| |  ||| ||||  || |||||| | |||| | |||||| | |||  | |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| || |    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtt 16622707  T
Q  231 tttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | || ||||||| ||||||||||    
T  16622708 tctgatgaactttcttctgatga 16622730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 8182926 - 8183190
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgata-ctttcaaatct 99  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||   |  ||||||| ||     
T  8182926 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa-tcc 8183024  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  || || |   |  ||||| ||| || |||| |||  ||||||||||    
T  8183025 tttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgagt--tgcatctcct 8183121  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8183122 gatgaactgcagcttctggtgattcacagcttttgatgaacttgcttctaatgaacttgcttctgatga 8183190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13018666 - 13018529
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||  || | ||||| |   |    
T  13018666 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaacttcat 13018567  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  13018566 ttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgca 13018529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16310069 - 16309961
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  16310069 gagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 16309970  T
Q  101 ttcaaaata 109  Q
    |||||||||    
T  16309969 ttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41842435 - 41842215
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || |||  ||   ||||| |       
T  41842435 gagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaacttca 41842336  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || |||||||||||||||| | |   |||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||    
T  41842335 tttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatcttctg 41842237  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  41842236 atgaacttcagcttctggtgat 41842215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265461
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||   |||| |||||||| || |||||    
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaa 2265575  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| |||||||  |||||| |||||||||||| |  ||||||||  || ||||   | |||| | ||| || |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2265574 tagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 2265477  T
Q  208 acagcttcttgtgatt 223  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  2265476 acaacttctggtgatt 2265461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494717
Alignment:
Q  133 ttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttct 4494717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13260777 - 13260564
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||  || ||||||          
T  13260777 gagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttca------ 13260684  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
     | | |||||| ||||||| |||  ||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13260683 -taagaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatcc-attaacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctg 13260586  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  13260585 atgaactttagcttctggtgat 13260564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19711175 - 19711059
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| |    
T  19711175 gagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcct 19711076  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgc 117  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19711075 ttcaaattagtcgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 1293026 - 1293100
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1293026 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 1293100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425683
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | ||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcatt 14425534  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||| || |||| |||  || |||||    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  14425535 tcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 14425631  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | ||||  ||||||| ||||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  14425632 tgaactntagcttctggtgaaacacancttttgntgaacttgcttctgatga 14425683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704448
Alignment:
Q  50 gtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagac 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  150 gaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    ||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaacttct 15704448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48062982 - 48062727
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |    
T  48062982 gagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcct 48062892  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  || |   ||| |||  || ||| |    |||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  48062891 ttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttcgacaatttctaggcgagtttgaattcttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcttg 48062794  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 267  Q
    || |||| |||||||| |||||    ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48062793 atgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatggacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 48062727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 13880603 - 13880768
Alignment:
Q  20 agagatagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgct 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||   | | |||||||| |||  || |||||||||||    
T  13880603 agaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgct 13880702  T
Q  119 tcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaa 185  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||   |||||| |||||||| ||||||    
T  13880703 tcactcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13894153 - 13893960
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||| | |||   || | |||||||| |||  ||     
T  13894153 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaat 13894054  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  13894053 tagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgat 13893960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339283
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |||||||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcatttcaaaatagtc 19339310  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19339309 gttgccacacttttccagtcttctgca 19339283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  50 gtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctg 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  50 gtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctg 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098286
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | ||||| || | |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcact 9098286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032167
Alignment:
Q  22 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctctt 13032167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13472651 - 13472555
Alignment:
Q  92 tcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaa-ctttaagt 187  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13472651 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaaagctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 27871714 - 27871789
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27871714 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaa 27871789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48805861 - 48805785
Alignment:
Q  192 catctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||||   |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48805861 catctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaactttcttctgatgaacttgcttctgatga 48805785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 48806017 - 48805959
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48806017 tagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaatagcatc 48805959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4429077 - 4428984
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||  |  |||||| ||| |||| |||||||| |||||    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4429077 tttgaaactttaagt--tcaatctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttctgatgaatttgcttctgatgaacttgcttctgatga 4428984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24794877 - 24794813
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24794877 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Original strand, 27871871 - 27871956
Alignment:
Q  166 aacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  27871871 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatttcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 27871956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Original strand, 4494585 - 4494628
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 56  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494585 gagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4429001 - 4428964
Alignment:
Q  236 tgaacttgcttctgatgaac-ttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4429001 tgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgatgtc 4428964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 28582105 - 28582372
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |  | ||||| |    
T  28582105 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcct 28582204  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28582205 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 28582304  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || || ||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582305 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 28582372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2561187 - 2561439
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  2561187 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaatcct 2561286  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2561287 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 2561386  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| ||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2561387 atgaactagagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatga 2561439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49642922 - 49642658
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  49642922 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaatcct 49642823  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49642822 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 49642723  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 266  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| |  || |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  49642722 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatg-agatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18121770 - 18121511
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||   || | || ||||| ||||||||||||     
T  18121770 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtt 18121671  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  18121670 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagc 18121571  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121570 ttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtc 18121511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14393164 - 14392900
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  14393164 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 14393065  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14393064 ttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatctccta 14392965  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14392964 atgaacttcagcttctagtgatctt--gcttttgatg-agatgcttatgatgatcttgcttctgatga 14392900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 31303385 - 31303653
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||   |||||||| |    
T  31303385 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcct 31303484  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  31303485 ttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctg 31303584  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatg 270  Q
    |  ||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31303585 agtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatgatg 31303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 37467332 - 37467553
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  37467332 gagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37467431  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  37467432 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatctcctg 37467531  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||||| |||||| |||||    
T  37467532 atgaactactgcttctggtgat 37467553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 15903197 - 15903464
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacta-gcatctgatactttcaaatct 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||   || ||||||||||     
T  15903197 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcc 15903296  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15903297 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcct 15903396  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||| |||||||| | ||||| || ||||| || || |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  15903397 gataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatg-agatggttctgatgaacttgcttctgatga 15903464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 13948335 - 13948601
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  13948335 gagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 13948434  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13948435 ttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 13948534  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | ||  ||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13948535 atgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgataaacttgcttctgatga 13948601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177588
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||     
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagc 38177592  T
Q  213 ttct 216  Q
    ||||    
T  38177591 ttct 38177588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12963245 - 12962995
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||  || |||||||| | |    
T  12963245 gagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaacct 12963146  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12963145 tctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctg 12963046  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  12963045 atgaactacaacttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 12962995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20646153 - 20646420
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  20646153 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 20646252  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaa-ctttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||| || |||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20646253 ttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatctcct 20646352  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20646353 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 20646420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 47207706 - 47207958
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||    
T  47207706 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatt 47207805  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgc-ttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  47207806 tcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctg 47207903  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaactt--gcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||  |||||||||||    
T  47207904 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaagttcagcttctgatga 47207958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 52920405 - 52920670
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||  || | |||||||  |    
T  52920405 gagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatact 52920504  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52920505 tt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 52920603  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  52920604 atgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 52920670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969578
Alignment:
Q  16 tagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  || |  ||||||| |||||||||||| |||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  116 gcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttc 215  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  216 ttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | ||||| || ||| | || ||||||||||| ||||||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatgaacttgcttatgatga 14969578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 6090731 - 6090997
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||   || | |||||||| |    
T  6090731 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaatcct 6090830  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6090831 ttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctg 6090930  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6090931 atgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatg-agatgcttttgatgaacttgcttctgatga 6090997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactc 13824191  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 196  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13824192 ttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 40799873 - 40800101
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || | |||||||  |    
T  40799873 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaatact 40799972  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  |  |||||||| ||    
T  40799973 ttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatctcttg 40800070  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  40800071 atgaactgcagcttctggtgattttcagctt 40800101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 41495001 - 41495175
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| ||||    
T  41495001 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 41495100  T
Q  104 aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  41495101 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaa 41495175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47405581 - 47405353
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  47405581 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcct 47405482  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||| ||    
T  47405481 ttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtg 47405384  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47405383 atgaactgcagcttctggtgattttcagctt 47405353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17239082 - 17238884
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  17239082 gagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 17238983  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17238982 ttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 17238884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53056887 - 53056622
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  53056887 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 53056788  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | |||||||| |||||  ||||||| | ||    
T  53056787 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcccatg 53056690  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||||||| |||| || | |||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  53056689 atgaactgcagcttctagtgatttttggcttctgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatga 53056622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46349979 - 46349739
Alignment:
Q  26 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46349979 agtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttt 46349880  T
Q  126 tccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttt 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| | |||||||| ||||||   |||||  |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  46349879 tccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgatttt 46349782  T
Q  226 tagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46349781 cagcttctaatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 46349739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 11223569 - 11223812
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  11223569 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 11223668  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |||||| | |||||| ||  |||  ||| |||||||||| ||||    
T  11223669 tagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatctcctgatgaact 11223766  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
     | |||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  11223767 gctgcttctggtgattttcagattctgatgaacttgcttctgatga 11223812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785329
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagt 111  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 2785174  T
Q  112 cgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacag 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  2785175 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 2785272  T
Q  212 cttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| |||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785273 cttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 2785329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49553637 - 49553428
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  || | |||||||| |||||||||||||    
T  49553637 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 49553538  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
      ||||||||| || || ||||||||| |||||||||||  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  49553537 actgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggc 49553438  T
Q  213 ttcttgtgat 222  Q
    |||| |||||    
T  49553437 ttctggtgat 49553428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29951598 - 29951335
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  29951598 gagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 29951499  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  | ||| |||    
T  29951498 ttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctg 29951399  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29951398 atgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgat-aaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30000752 - 30000489
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  30000752 gagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30000653  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  | ||| |||    
T  30000652 ttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctg 30000553  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30000552 atgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgat-aaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12726390 - 12726169
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||   ||||||  || |||||||||| |    
T  12726390 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 12726291  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12726290 ttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatctcctg 12726191  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| || |||||||||||    
T  12726190 atgaacttcaacttcttgtgat 12726169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13780744 - 13780575
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||  || | |||||||| |    
T  13780744 gagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaatcct 13780645  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13780644 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18142900 - 18142697
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||   || | || ||||| ||||||||||||     
T  18142900 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtt 18142801  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  18142800 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagc 18142701  T
Q  213 ttct 216  Q
    ||||    
T  18142700 ttct 18142697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16658778 - 16658548
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||  || |||||||||| |    
T  16658778 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcct 16658679  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| || | ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  16658678 ttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatctcctg 16658579  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16658578 atgaactacaacttctggtgatcttcagctt 16658548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955691
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||  ||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaa 14955532  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | |||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  14955533 tagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaact 14955630  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     || ||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955631 gcaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 14955691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24775694 - 24775427
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||   || | |||||||| |    
T  24775694 gagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcct 24775595  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  24775594 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 24775497  T
Q  201 ataaact--acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||   |||||||| |||||| | ||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24775496 atgaactgcgcagcttctggtgattctcagcttgtgataaacttggttctgatgaactggcttctgatga 24775427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20627578 - 20627363
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  || | ||||||||  ||||||||||| |    
T  20627578 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttg 20627479  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| |||| || ||    
T  20627478 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaact 20627381  T
Q  214 tcttgtgatttttagctt 231  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  20627380 tctggtgattttcagctt 20627363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19889103 - 19888854
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  19889103 gagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 19889006  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaaca-acctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||  | ||| || |||||||||||||||||| |    
T  19889005 ttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctctt 19888906  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  19888905 gatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 19888854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 33583252 - 33583492
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33583252 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcact 33583351  T
Q  124 tttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaat-gaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| |  || ||||| ||  |||||| |||||| | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||| | |||||    
T  33583352 tttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgat 33583449  T
Q  223 ttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33583450 ttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33583492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22140763 - 22140976
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| |      
T  22140763 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaaaccc 22140862  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||| |||  || |||||  |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22140863 ttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctg 22140960  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || ||||  |||||||    
T  22140961 atgaactgtagcttct 22140976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Original strand, 11869130 - 11869317
Alignment:
Q  64 ctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaa 163  Q
    ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||     
T  11869130 ctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcat 11869229  T
Q  164 tgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | |||||  |||||| | |||||  ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  11869230 taaacaaattttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatga 11869317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16032524 - 16032724
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  16032524 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 16032623  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |  |||||||||| ||  ||| |   |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  16032624 ttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctg 16032722  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  16032723 at 16032724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 21640878 - 21641134
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||  |||| || |||||||| |    
T  21640878 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagcc 21640977  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | ||||| |||  || |||||    |||| | |||||  |||||||  |||||||||||||| |||| || |    
T  21640978 gttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaac 21641074  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||| ||||||   ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21641075 ttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgctgaacttgcttctgatgatgtc 21641134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22804183 - 22804048
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  || | ||||| || |    
T  22804183 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaagtcct 22804084  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttct 136  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  22804083 ttcaaaatagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 29855415 - 29855674
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  || | |||||||  |||||||     
T  29855415 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaac 29855514  T
Q  108 tagtcgttgcttcac-ttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | ||||||   |||||  ||||||| | |||| |||    
T  29855515 tagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcatcccatgatgaac 29855612  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||| || | ||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29855613 tgcaggttttggtgatttttggcttccgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 29855674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49666553 - 49666310
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||     || |    ||||||| || |||||||||||||    
T  49666553 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaat----atgt----ctttcaa-tcctttcaaaatagtc 49666463  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  49666462 gttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagc 49666366  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| ||||||   | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49666365 ttctggtgattcacaacttatgatgaaattgcttctgatgaacttgcttctgatga 49666310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 5213583 - 5213788
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||| || | |||||||| || |||||    
T  5213583 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgct-tttgaataataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaa 5213681  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||| |  ||| ||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5213682 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 5213779  T
Q  208 acagcttct 216  Q
    |||||||||    
T  5213780 acagcttct 5213788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 46796527 - 46796287
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  || |||| || | ||            
T  46796527 gagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatgcctt-------- 46796436  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
     ||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||  | |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46796435 -tcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctg 46796340  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  46796339 atgaactgcagcttcttgtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 46796287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25398415 - 25398295
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||   || | |||||||| |    
T  25398415 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaatcct 25398316  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttca 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25398315 ttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 11868268 - 11868338
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11868268 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttga 11868338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12389032 - 12388845
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  ||||||  || | || ||||  |    
T  12389032 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaattct 12388933  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    ||  || ||||||| |||||||| |||   ||||||||| | | |||||   |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12388932 tttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300372
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||  || | ||||||||  ||| ||||||  |||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcact 50300344  T
Q  124 tttccagtcttctgcattgcttagacga 151  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  50300345 tttccagtcttctgcaatccttagacga 50300372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21605814 - 21605740
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21605814 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaa 21605740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725349
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |  ||| ||||||  ||   |||||||| |||  ||     
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||  |||| |||   |||||| |||||||| |||||| |||  || ||  |||| | ||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatct 20725291  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     |||||||| ||||| |||  |||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20725292 tcagcttctggtgatgttt--cttttgatg-aggtgcttatgatgaacttgcttctgatga 20725349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Original strand, 50300387 - 50300466
Alignment:
Q  189 ttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50300387 ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttaacttatgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 50300466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21636830 - 21636756
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21636830 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 21636756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19249547 - 19249385
Alignment:
Q  26 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||  |||||| | ||||  || | |||||||| |||  || |||  ||||||||||| |    
T  19249547 agtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcactct 19249448  T
Q  126 tccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    ||  |||||||||| ||| ||| ||  ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19249447 tctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538264
Alignment:
Q  15 gtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacg 23538264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25398290 - 25398238
Alignment:
Q  144 ttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 196  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25398290 ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30054377 - 30054309
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 69  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30054377 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt 30054309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 40850991 - 40851041
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  40850991 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaa 40851041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 37412799 - 37412840
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37412799 agcttttggtgaactagcttctgataaacttgcttctgatga 37412840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968360
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 56  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttt 12968360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19888882 - 19888850
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888882 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 19888850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 33598036 - 33598112
Alignment:
Q  189 ttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33598036 ttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33598112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1727995 - 1727920
Alignment:
Q  193 atctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1727995 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatga 1727920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 1728175 - 1728129
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaa 47  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1728175 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 9700196 - 9700126
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  9700196 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttga 9700126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 272
Target Start/End: Original strand, 2561414 - 2561443
Alignment:
Q  243 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561414 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 2561443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21636615 - 21636574
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21636615 agcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 21636574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaa 47  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12963023 - 12962995
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12963023 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 12962995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 32485 - 32737
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  32485 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaatcct 32584  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32585 ttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 32684  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||||||  || | ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  32685 atgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgatga 32737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 49332 - 49562
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  49332 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 49431  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49432 ttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctg 49531  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  49532 atgaactacaacttctggtgatcttcagctt 49562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 339
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| ||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 356  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgct 118  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  355 tcaaattagccgttgct 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 190
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |  ||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  283 tttgaaactttaggt--tgcatcttctgatgaagtacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgataaacttgcttctgatga 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 23235001 - 23235267
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  || | |||||||  |    
T  23235001 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaattct 23235100  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23235101 ttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 23235200  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23235201 atgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 23235267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13964084 - 13963832
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||  |    
T  13964084 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattct 13963985  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  13963984 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactg 13963885  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  13963884 atgaactagagcttctagtgatctttaacttctgaggaacttgcttctgatga 13963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 30666983 - 30667198
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||  || | |||||||| |    
T  30666983 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaatcct 30667082  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30667083 ttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctg 30667182  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || ||||||| |||||    
T  30667183 atgaactacaacttct 30667198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25829128 - 25829349
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  25829128 gagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 25829227  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25829228 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 25829327  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  25829328 atgaactttagcttctggtgat 25829349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22188208 - 22187942
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||||     
T  22188208 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcta 22188109  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22188108 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctg 22188009  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| || ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22188008 atgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 22187942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25037365 - 25037099
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  25037365 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 25037266  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25037265 ttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 25037166  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25037165 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25037099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25041472 - 25041206
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  25041472 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 25041373  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25041372 ttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 25041273  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25041272 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25041206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20568853 - 20568635
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttc 103  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| ||||    
T  20568853 acacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 20568754  T
Q  104 aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgata 203  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  20568753 aaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 20568654  T
Q  204 aactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20568653 aactacagcttctggtgat 20568635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 22317594 - 22317855
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | || ||||| ||||||||    
T  22317594 aaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaa 22317693  T
Q  108 -tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||     
T  22317694 atagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaa 22317793  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22317794 tagagcttctggtgattttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatga 22317855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151890
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattt 20151919  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  20151918 tcagcttctgatgaacttgtttctgatga 20151890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621440
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||  || | |||||||| |    
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    ||  |||||| ||||| ||||| || |||||    
T  30621410 atgcactacaacttctagtgatattcagctt 30621440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624061
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||  || | |||||||| |    
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    ||  |||||| ||||| ||||| || |||||    
T  30624031 atgcactacaacttctagtgatattcagctt 30624061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19540410 - 19540631
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||| | |    
T  19540410 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacct 19540509  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19540510 ttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatg 19540609  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  19540610 atgaacttcagcttctggtgat 19540631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 24377095 - 24377347
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || || ||||| | |    
T  24377095 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacct 24377194  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  24377195 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctctt 24377293  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  24377294 gatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgaactttcttctgatga 24377347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21537353 - 21537088
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||  || | | |||| | ||    
T  21537353 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctt 21537254  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21537253 tcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 21537154  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | |||| || ||||| ||||| |||| ||| || || |  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21537153 tgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatg-aggtgcttctggtgagcttgcttctgatga 21537088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6573978
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |||||||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgc-ttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  6574025 ctgcaacttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 6573978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9015474 - 9015211
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  || |||||||||| |    
T  9015474 gagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcct 9015377  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9015376 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 9015277  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||  || ||| || ||| ||  |||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9015276 atgaactttagtttc-tgggatcttctgcttctgatg-agttgtttctgatgaacttgcttctgatga 9015211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 38781417 - 38781657
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38781417 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactt 38781516  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |   ||| ||||| ||||| |    
T  38781517 ttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatcttctggtgatct 38781614  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38781615 tcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 38781657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24850772 - 24850508
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| ||||| |    
T  24850772 gagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcct 24850673  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24850672 ttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 24850573  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctga 265  Q
    |||  ||| |||| ||| ||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24850572 gatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18377012 - 18376760
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  18377012 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 18376913  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |      
T  18376912 ttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatcttcaa 18376813  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| || ||||| ||||| ||  |||| || ||||||| ||||||||||    
T  18376812 atgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatgaacttacttctgatga 18376760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10009856 - 10009591
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  10009856 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 10009757  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttc-cagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||   ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10009756 ttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcct 10009657  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||  ||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10009656 gatgaacttcagcttctggtgatcttt--cttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 10009591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24576029 - 24576294
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| | || |  || | || ||||| |    
T  24576029 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaatcct 24576128  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacga-aattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24576129 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcct 24576228  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     || ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24576229 aatgaactttagcttctggtgatctt--gcttatgatg-atatgcttctgatgaactagcttctgatga 24576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 33074220 - 33074485
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||  ||||||| || | ||| |||||     
T  33074220 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaatctg 33074319  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | ||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33074320 tccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctg 33074417  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33074418 atgaactacaacttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 33074485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39037748 - 39037496
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||| || | ||||| |       
T  39037748 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaacttca 39037649  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||    
T  39037648 tttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatcttctg 39037549  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||  | ||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  39037548 atcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 39037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087027
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaac-ctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||| | ||||||  |||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||| |||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtgat 45087069  T
Q  223 ttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctg 264  Q
     |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45087068 atttagcttctgataaacttgcttcttatgaacttgcttctg 45087027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31800993 - 31800743
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  || |||||||||| |    
T  31800993 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaatcct 31800894  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||  ||  ||||| | | || | |||||| |||||||  ||||||| | ||    
T  31800893 ttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcccatg 31800796  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| ||| |||| |||||| || |||| || | ||||||||||||||||    
T  31800795 atgaactgcagtttctggtgattatttgcttctgataaacttgcttctgatga 31800743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35744106 - 35743843
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || | |||||||| |    
T  35744106 gagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaatcct 35744007  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |  |||||||   || | ||   | |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  35744006 tccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagacg--tttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatctcctg 35743911  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743910 atgaactacagcttctggtgattttcagcttccgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 35743843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24779337 - 24779525
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||| | |||| ||| |||||||||| |    
T  24779337 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcct 24779436  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24779437 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28140725 - 28140510
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  ||  ||||||||| |    
T  28140725 gagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaatcct 28140626  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||       |||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  28140625 ttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatctcccg 28140526  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  28140525 atgaacttcagcttct 28140510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31328065 - 31327806
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |  | |||||    
T  31328065 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaa 31327966  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaac-ctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||| |||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  31327965 tagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaac 31327868  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | |||||||| ||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31327867 tgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatga 31327806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31334786 - 31334527
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |  | |||||    
T  31334786 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaa 31334687  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaac-ctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||| |||  || |||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  31334686 tagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaac 31334589  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | |||||||| ||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31334588 tgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttatgatga 31334527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260601
Alignment:
Q  33 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtc 132  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||   | | |||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  133 ttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgat 22260601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557160
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagt 111  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||   |||||||  ||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagt 30557316  T
Q  112 cgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactaca 210  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||  || ||| ||| | |||||  |||||| | |||||  |||||||  ||||| |||| ||    
T  30557315 cgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 30557218  T
Q  211 gcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30557217 gcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttttgatga 30557160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321776
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||  || |||  || | ||  |||| |||||||||||||    
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtc 34321931  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  34321930 gttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaagt--tgcatctcctgatgaattacagc 34321833  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgat 269  Q
    |||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34321832 ttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttatgatgat 34321776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 40782471 - 40782729
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  40782471 gagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 40782570  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||     |||  | || ||||||||||||||||||    
T  40782571 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatctcctg 40782664  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || |  ||||||| ||||| ||  |||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40782665 atgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgaa-atgcttctggtgaacttgcttctgatga 40782729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 6392634 - 6392879
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  6392634 aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 6392733  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatc-caatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||| || | |||| | |||||| | |||||   ||||||  ||||| ||    
T  6392734 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag--atgcatcctctgatgaa 6392831  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  6392832 ctgcaacttatggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 6392879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28711804 - 28711553
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||       
T  28711804 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattca 28711705  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |  || |||||| | |||| | |||||| | |||||  ||||||| | |     
T  28711704 ttcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatt 28711607  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtga-tttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  28711606 atgaactgcagcttctggtgattttttggcttctgataaacttgcttctgatga 28711553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28701322 - 28701065
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||   |    
T  28701322 agtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctg 28701223  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||  || |||| | | |||| | |||||| | |||||  ||||||| | |||| |||| |||||    
T  28701222 ttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagct 28701125  T
Q  214 tcttgtga-tttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||| |||| ||||| |||| || | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28701124 tctggtgattttttggcttctgataaacttgtttctgatgaactcacttctgatgatgtc 28701065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 22802461 - 22802717
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  22802461 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaa 22802560  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| | |||||| || |||| ||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | || | | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  22802561 tagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaact 22802658  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     ||| ||||  | |  ||  |||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22802659 gcaggttctgataaactt--gcttctgatgaattttcttctgatgaccttgcttctgatga 22802717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1587132 - 1586898
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||         |||  | ||||||||    
T  1587132 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc---------caatgcctttcaaaa 1587042  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| |||||    |||||| |||||||||||| |  | ||| ||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| ||||    
T  1587041 tagccgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttccatctcctgatgaact 1586944  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
     |||||||| |||||| | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  1586943 ccagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgtttctgatga 1586898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23595673 - 23595456
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||| || |||  || | |||||||       
T  23595673 gagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaacaagaatccaatgccttcaaattca 23595576  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||  |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  23595575 tttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatcttctg 23595477  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtga 221  Q
    || | || |||||||| ||||    
T  23595476 atgatcttcagcttctggtga 23595456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22455096 - 22455032
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455096 gagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 22455032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 25189392 - 25189459
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25189392 gagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 25189459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28551024 - 28550950
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28551024 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 28550950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 44840428 - 44840502
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44840428 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 44840502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41121825 - 41121605
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| | |  |||  || | |||||||| |    
T  41121825 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaatcct 41121726  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||  || || |||    
T  41121725 tttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagcttctg 41121627  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || | || |||||||| |||||    
T  41121626 atgatcttcagcttctggtgat 41121605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23184410 - 23184346
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 65  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184410 gagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 23184346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22776394 - 22776320
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22776394 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 22776320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22781772 - 22781698
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22781772 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 22781698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 31968149 - 31968075
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31968149 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaa 31968075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785502
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |||||||||||||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcctttcaaaatagtc 22785659  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||  || |||||||| ||||||| |  |||| |||  || ||  |    || | | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||    
T  22785658 gttgctatacatttccagttttctgcaat-tttaggcgagtttgaaatcttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgtagc 22785562  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||| ||||||   ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22785561 ttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtc 22785502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 264
Target Start/End: Original strand, 7609045 - 7609216
Alignment:
Q  91 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag-tcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||  | |||| || | ||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  7609045 ttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtct 7609144  T
Q  190 tgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctg 264  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  7609145 tgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26619069
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||   |||||  |||||   || | |||||||  |||  |||    
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgca 26619069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 14581529 - 14581583
Alignment:
Q  21 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14581529 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 14581583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 40332081 - 40332155
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40332081 gagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 40332155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277098
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaa 3277098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115143
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactct 19115143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881227
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctct 44881227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392704
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttga 71  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctttga 23392704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22258195 - 22258231
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtaca 37  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22258195 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Original strand, 25189543 - 25189597
Alignment:
Q  153 attaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||    
T  25189543 attaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaataaact 25189597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272192
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||    
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctct 22272192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22454945 - 22454833
Alignment:
Q  153 attaaatccaatgaacaaccttt-gaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgat 251  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||||| ||||| || ||||| || |||  | |||||||||    
T  22454945 attaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatcttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggt-gcttctgat 22454847  T
Q  252 gaacttgcttctga 265  Q
    || |||||||||||    
T  22454846 gagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18732 - 18466
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  || | |||||||| |    
T  18732 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcct 18633  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  18632 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctg 18533  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18532 atgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17814964 - 17815228
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  17814964 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcct 17815063  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17815064 ttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 17815163  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || |  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17815164 atgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgctactgatga 17815228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6512569 - 6512322
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||   ||   | |||||||| |    
T  6512569 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagccaatg---ccttcaaatcct 6512473  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6512472 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 6512373  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  6512372 atgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 6512322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23413115 - 23412865
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||||  || |||||||||| |    
T  23413115 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaatcct 23413016  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23413015 ttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23412916  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  23412915 atgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 23412865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41566575 - 41566323
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||  | ||||  || | |||||||| |    
T  41566575 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaatcct 41566476  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41566475 ttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctg 41566376  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| |||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  41566375 atgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 41566323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 33022660 - 33022910
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  33022660 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 33022759  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  33022760 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 33022857  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| ||  |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  33022858 atgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 33022910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21910552 - 21910773
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  21910552 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21910651  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21910652 ttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 21910751  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  21910752 atgaactttagcttctggtgat 21910773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 89563 - 89342
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||   || |||||||||  |    
T  89563 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaattct 89464  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  89463 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatctcctg 89364  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||||| ||||| |||||    
T  89363 atgaactacaacttctggtgat 89342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7745834 - 7745613
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  7745834 gagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 7745735  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7745734 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcctg 7745635  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||  ||| ||||||||||||||    
T  7745634 atgtacttcagcttcttgtgat 7745613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20550891 - 20551106
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  20550891 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 20550989  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20550990 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 20551089  T
Q  200 gataaactacagcttct 216  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  20551090 gatgaacttcagcttct 20551106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21072381 - 21072152
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  21072381 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 21072282  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||  || |  ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21072281 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctcctg 21072183  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || |||| |||||||| ||||| || |||||    
T  21072182 atgaacttcagcttctggtgatcttcagctt 21072152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 26784353 - 26784602
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttc 103  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||   | ||| |||||| ||||    
T  26784353 acacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttc 26784452  T
Q  104 aaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgata 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |     
T  26784453 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctg 26784552  T
Q  204 aactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26784553 aactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 26784602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 11993884 - 11994137
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||      
T  11993884 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaatccc 11993983  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || |||||  |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11993984 ttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatctcctg 11994081  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaact 256  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  11994082 atgaactacagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaact 11994137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4887018 - 4887268
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  4887018 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 4887117  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |  | |||| |  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||| || ||    
T  4887118 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatatcttg 4887215  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4887216 atgaactgcagcttctggtgattctcagcttctaatgaacttgcttctgatga 4887268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19536442 - 19536177
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||  || ||||||||||      
T  19536442 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcca 19536343  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcact-tttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||   ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19536342 ttcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcct 19536243  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||| | |||||||| ||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19536242 gatgaacttctgcttcttgcgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttacttctgatga 19536177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 30742983 - 30743241
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||  || | |||||||| ||||||||    
T  30742983 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 30743082  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    || |||||||||  | |||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  30743083 taatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 30743180  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     || ||||| || ||| | ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743181 gcaacttctcgtaattctcagcttatgataaatttgcttctgatgaacttgcttctgatga 30743241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13545641 - 13545448
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||| ||||     
T  13545641 gagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagtt 13545542  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13545541 gttgcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 13545450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29138547 - 29138284
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||  ||||||  || | ||| |||| |    
T  29138547 gagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatcct 29138448  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||  || ||||   | |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29138447 tccaaaatagttgttgctatac-tttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctg 29138352  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29138351 atgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 29138284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 31117873 - 31118087
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||  |    
T  31117873 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattct 31117972  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||| |||||| |||||  | |||||||||||    
T  31117973 ttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatctcct 31118070  T
Q  200 gataaactacagcttct 216  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  31118071 gatgaactgcagcttct 31118087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 42243683 - 42243942
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaag-aactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||  ||   |||||||| |||||||    
T  42243683 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaa 42243782  T
Q  107 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  42243783 atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 42243880  T
Q  207 tacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42243881 tacagcttctggtgattctcagtttttgataaatttgcttctgatgaccttgcatctgatga 42243942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14086680 - 14086428
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatct 99  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || | ||||||||     
T  14086680 gagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaaatca 14086581  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcc 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||| | |||| | |||||| | |||||  |||||||  |    
T  14086580 cttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctc 14086483  T
Q  199 tgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14086482 tgatgaactgcagcttctggtaatttttagcttttgataaacttgcttctgatga 14086428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 26759157 - 26759410
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| || ||||||||||    
T  26759157 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 26759256  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| |  |||| |||| || |||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  26759257 gttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 26759354  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| |||||| | ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26759355 ttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatga 26759410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 15516972 - 15517215
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||  || | |||||||| || |||||    
T  15516972 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 15517071  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  |||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  15517072 tagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaact 15517169  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| ||||| |||||| | | ||| || | ||||||||||||||||    
T  15517170 acaacttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatga 15517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 33933263 - 33933532
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-gaagaactagcatctgatactttcaaatct 99  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||| ||||||  || | || |||||     
T  33933263 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaaatcc 33933362  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat-ccaatgaacaac--ctttgaaactttaagtcttgcatct 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||| | ||||||   |||||| |||||||  |||||||     
T  33933363 tttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgcatcc 33933460  T
Q  197 cctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     ||||| |||| || ||| | |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33933461 tctgatgaactgcaacttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactgtcttctgatga 33933532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3245582 - 3245333
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgat-actttcaaatct 99  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||  ||||||| ||     
T  3245582 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattc- 3245484  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||    ||||   || ||| |||||||  |||||||||||    
T  3245483 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcct 3245387  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  3245386 gatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatga 3245333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 23881063 - 23881332
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | | ||||||  || | ||||| |       
T  23881063 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttca 23881162  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||  || |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||  ||||| ||    
T  23881163 tttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatcttct 23881260  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||| |||| |||||||| ||| | || ||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23881261 gatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatg-aggtgcttctgatgaccttgcttctgatgatgtc 23881332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 6499235 - 6499302
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499235 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 6499302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12352936 - 12352869
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12352936 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 12352869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9398875 - 9398808
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9398875 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 9398808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25096960 - 25096777
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtac---tttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttca 104  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||   |||||||| |||      
T  25096960 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25096861  T
Q  105 aaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    || || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25096860 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25154930 - 25154747
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtac---tttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttca 104  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||   |||||||| |||      
T  25154930 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25154831  T
Q  105 aaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    || || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25154830 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21199144 - 21198925
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||  || | |||||||       
T  21199144 gagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaattca 21199045  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||| |||||| ||| |||||  |||||||||| | | ||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  21199044 tttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctg 21198947  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| ||||| || |||||    
T  21198946 atgaacttcagctcctggtgat 21198925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 642836 - 642583
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtc 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||  || | ||||| | | ||  || ||| |    
T  642836 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagcc 642737  T
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagc 212  Q
    |||| |||||| | |   ||||||| | ||| |||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||      
T  642736 gttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaat 642638  T
Q  213 ttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||| ||||| || ||| | |  || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  642637 ttctggtgatcttcagcatctcatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 642583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 28139603 - 28139752
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgat-actttcaaatct 99  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||  ||||||  ||  ||||| ||||     
T  28139603 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttc-aatcc 28139701  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacga 151  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  28139702 tttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacatt-cttagacga 28139752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 9088965 - 9089047
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9088965 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 9089047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28464480 - 28464406
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28464480 gagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 28464406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 32160763 - 32161028
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| ||    
T  32160763 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 32160862  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaac-ctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||| |||  |||||| |  |  | |||||||  || ||  ||||||||  || |||||| | ||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  32160863 tcaaattagctgttgctactatacttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttagg--ttgcatcttctg 32160960  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||||||| |||| ||||| |  ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160961 atgaactacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 32161028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21099845 - 21099778
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21099845 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttctt 21099778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 26765501 - 26765632
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| || |||||    
T  26765501 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 26765600  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26765601 tagttgttgctatacttttccagtcttctgca 26765632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208011
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    ||||||  || | ||||||||| |    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctct 11208027  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgc 117  Q
    ||||||||||||||||    
T  11208026 tcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25930297 - 25930226
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaa 72  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25930297 gagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaa 25930226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30115978 - 30115863
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || |  |  |||| |    
T  30115978 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaatcct 30115879  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttg 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  30115878 ttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 253
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430130
Alignment:
Q  113 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaa-caacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacag 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||  || ||||| || || || | |||||| | ||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 5430088  T
Q  212 cttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  5430089 cttctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatga 5430130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9398744 - 9398644
Alignment:
Q  143 cttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaactt 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  9398744 cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatgaactt 9398645  T
Q  243 g 243  Q
    |    
T  9398644 g 9398644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 10848769 - 10848852
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatct 84  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10848769 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatct 10848852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 35932147 - 35932073
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35932147 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaa 35932073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21099694 - 21099580
Alignment:
Q  153 attaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatg 252  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||| |||||    
T  21099694 attaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatcttctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggt-gcttttgatg 21099596  T
Q  253 aacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  21099595 aacttgcttctgatga 21099580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23391546 - 23391505
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23391546 agcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 23391505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35986282 - 35986117
Alignment:
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||| |||  |  | |||    |||| | |||||||||||||||  |  |||||||    
T  35986282 tttcaaaatagtcgttgccacacttttccagtcttctgcaatt-ttaggcgagttagagtccttgaaacatcttttgaaactttaagt--tcaatctcct 35986186  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35986185 gatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaattagcttctgatga 35986117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30115852 - 30115767
Alignment:
Q  166 aacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  30115852 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatga 30115767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6512350 - 6512322
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6512350 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 6512322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7745595 - 7745555
Alignment:
Q  228 gcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7745595 gcttttgatgaacttgcttcttatgaccttgcttctgatga 7745555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23412893 - 23412865
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23412893 cttgcttctgatgaacttgcttctgatga 23412865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 377670 - 377404
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  377670 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 377571  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  377570 ttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatctcctg 377471  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| | ||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  377470 atgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 377404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 220242 - 220503
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttca 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||  || |||  || || ||| |    
T  220242 cacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgcttcaaattcatttga 220341  T
Q  105 aaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataa 204  Q
    |  ||| |||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
T  220342 at-tagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatga 220440  T
Q  205 actacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  220441 acttcagcttctggtgatcttcagcttctgatg-aggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 220503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 211398 - 211611
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | || ||||| |    
T  211398 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaatcct 211497  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||   |||||||||||    
T  211498 tacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatctcctg 211595  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || | |||||||||||    
T  211596 atgagctacagcttct 211611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244257
Alignment:
Q  6 acaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaa 105  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||  ||   |||||||| |||  |    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  106 aatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    | |||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgca 244257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12209 - 12475
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  || |||||||||  |    
T  12209 gagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattct 12308  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  12309 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctg 12408  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| |||||  | | ||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12409 atgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 12475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26086 - 25856
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  26086 gagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 25987  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25986 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 25887  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    || | ||  ||||||| ||||| || |||||    
T  25886 atgagctttagcttctggtgatcttcagctt 25856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44654
Alignment:
Q  34 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtct 133  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  134 tctgcattgcttagacgaaattaaatcca 162  Q
    ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatcca 44654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 60016 - 60237
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  60016 gagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcct 60115  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  60116 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 60215  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || ||||  ||||||| |||||    
T  60216 atgaactttagcttctggtgat 60237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7926 - 8141
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  ||   |||||||| |    
T  7926 gagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcct 8025  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8026 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctg 8125  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || ||||  |||||||    
T  8126 atgaactttagcttct 8141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 475 - 741
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  475 gagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 574  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  575 ttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 674  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || | ||  ||||||| ||||| || ||||| || || |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  675 atgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgataaacttgcttctgatga 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10219 - 9994
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  || | |||||||| |    
T  10219 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10120  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10119 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 10020  T
Q  200 gataaactacagcttcttgtgatttt 225  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10019 gatgaacttcagcttctggtgatttt 9994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14883 - 14816
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14883 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7948
Alignment:
Q  6 acaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaa 105  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||   || | || ||||| || |||    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  106 aatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaa 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T
Q  206 ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgctt 246  Q
     || ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  7908 atagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36886 - 36620
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  36886 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 36787  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36786 ttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 36687  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36686 atgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatg-agatgcttctaatgaacttgcttctgatga 36620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 42119 - 42385
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  42119 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 42218  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42219 ttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 42318  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||  |||| || || |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42319 atgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatg-agatgcttctaatgaacttgcttctgatga 42385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 14648 - 14846
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  || | |||||||| |    
T  14648 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcct 14747  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14748 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcct 14846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27540 - 27290
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || | ||| |||| |    
T  27540 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcct 27441  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
     |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27440 atcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 27341  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||| ||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  27340 atgaacttcagcatctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 27290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27286
Alignment:
Q  240 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318 cttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 27286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 215601 - 215343
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  215601 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 215502  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||| | ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  215501 tagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaact 215404  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
     |||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215403 gcagcttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 215343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 89916
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  90166 gagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 90067  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  90066 ttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 89969  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  89968 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 89916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19583 - 19319
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||  || |||| ||||| |    
T  19583 gagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcct 19484  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  19483 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctc 19384  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||| ||  |||| |  || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19383 atgaactacaacttctggtgatctt--gcttcttatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 19319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 99316 - 99054
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||||||||  ||||||  || | ||  |||| |    
T  99316 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtca--gcgctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatcct 99219  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||  |||||    
T  99218 tccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgca-actttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcacttcctg 99122  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  99121 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttacttttgatga 99054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5034 - 4792
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||  || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  5034 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgcttcactc 4935  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |    
T  4934 tttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatct 4835  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4834 tcagcttatgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 4792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1888
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  || | |||||||| |    
T  1690 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcct 1789  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1790 ttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcct 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5801 - 5537
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||| ||| |    
T  5801 gagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcatatcct 5702  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||| || | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5701 ttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 5602  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||  ||||| ||  |||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5601 atgaacttcagcttcaggtgatctt--gcttctagtg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21082 - 20816
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  21082 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 20983  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20982 ttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 20883  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| || ||| | ||||| || ||||| |  || |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20882 atgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatg-agatgcttctgatgaacttgtttctgatga 20816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10219
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||   ||||||  || |||||||||| |    
T  9969 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 10068  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10069 ttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 10168  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| || ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10169 atgaacttcaacttcttgtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 10219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1660 - 1881
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||  || |||||||||| |    
T  1660 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 1759  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1760 ttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 1859  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  1860 atgaacttcagcttctggtgat 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6827 - 6586
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6827 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgcttcactt 6728  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  6727 ttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattc 6630  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | ||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6629 tcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatga 6586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 19031 - 19283
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  || | || ||||| |    
T  19031 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcct 19130  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  19131 tccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatcacctg 19230  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || || || ||||||| ||||| || | ||| || | ||||||||||||||||    
T  19231 atgaaatagagcttctggtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatga 19283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22242 - 21977
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||  || | ||| |||| |    
T  22242 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaatcct 22143  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |  || ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||| ||     
T  22142 tcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatcttcta 22045  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044 atgaactacaacttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 21977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 9560 - 9809
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||  || |  |  |||| |    
T  9560 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcct 9659  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||| |  || |||||    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  9660 ttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 9756  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9757 atgaactgcagcttctggtgattcacagcttatgatgaacttgcttctgatga 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 15117 - 15315
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||  || |||||||||| |    
T  15117 gagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 15216  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcct 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15217 ttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103787
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | || | ||| ||||||||||| ||    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 103784  T
Q  214 tct 216  Q
    |||    
T  103785 tct 103787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 212355 - 212619
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaat-ctt 100  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || ||||||||| |||    
T  212355 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 212454  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  212455 ttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctg 212554  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || || |  |||||||  |||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  212555 atgaagtttagcttctgatgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctgatga 212619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6094
Alignment:
Q  60 aacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat 159  Q
    |||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  160 ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttct 6094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 246193 - 246108
Alignment:
Q  166 aacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  246193 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 246108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 13571 - 13739
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||  || | |||||||| |    
T  13571 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 13670  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaaca 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13671 ttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13876
Alignment:
Q  224 tttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832 tttagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatga 13876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 78453 - 78227
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  78453 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 78354  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgattt 224  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||  || ||||| || || | | |||||| |||||||   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||     
T  78353 ttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgattc 78256  T
Q  225 ttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | || || || ||||||||||||||||||    
T  78255 tcagattctgatgaacttgcttctgatga 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 253
Target Start/End: Original strand, 143129 - 143340
Alignment:
Q  42 gtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcatt 141  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  || | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  143129 gtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 143228  T
Q  142 gcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaact 241  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  143229 gctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatgaact 143328  T
Q  242 tgcttctgatga 253  Q
    ||||||||||||    
T  143329 tgcttctgatga 143340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 272
Target Start/End: Original strand, 143315 - 143344
Alignment:
Q  243 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143315 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 143344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 60803 - 61053
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||   || | ||| |||| |    
T  60803 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcct 60902  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||  | |||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  60903 tccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctg 61000  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || ||||||| ||||| |||||| | | ||| || | ||||||||||||||||    
T  61001 atgaactacaacttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatga 61053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 553
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  766 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 667  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || ||||||   |||| | | |||| |||||||  ||||||||||||    
T  666 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctg 569  T
Q  201 ataaactacagcttct 216  Q
    || |||| || |||||    
T  568 atgaactgcaccttct 553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1626
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | ||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcatt 1775  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || |||| |||  || |||||    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  1774 tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 1678  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | ||||  ||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  1677 tgaactgtagcttctggtgaaacacagcttttggtgaacttgcttctgatga 1626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5713 - 5446
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||| |    
T  5713 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaatcct 5614  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||| | |||||| |||||| ||||||   |||||||| |||    
T  5613 ttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatcttctg 5516  T
Q  201 ataaa---ctacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatg 267  Q
    || ||   |  |||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5515 atgaacagcagcagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatg 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 3304 - 3569
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||  | ||||  || | |||||||| |    
T  3304 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcct 3403  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||| |  ||||||||  || |||||  | |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  3404 tccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctg 3501  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || ||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3502 atgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30439
Alignment:
Q  60 aacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaat 159  Q
    |||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  160 ccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttct 216  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttct 30439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10123
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||||       
T  9903 gagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaattca 10002  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || ||||||||| | |||| |||   ||||||||| ||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||    
T  10003 tttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatcttctg 10101  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    || |||| |||||||| |||||    
T  10102 atgaacttcagcttctggtgat 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15793 - 16010
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  || | ||||| ||     
T  15793 gagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaagtcc 15892  T
Q  100 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaa-cctttgaaactttaagtcttgcatctcc 198  Q
    |||||||||| | | |||||||||  ||  ||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15893 tttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcatctcc 15992  T
Q  199 tgataaactacagcttct 216  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  15993 tgatgaactttagcttct 16010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Original strand, 39488 - 39676
Alignment:
Q  64 ctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaa 163  Q
    |||||| ||||||  |||||| || | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||     
T  39488 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 39587  T
Q  164 tgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatg 252  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  39588 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 39676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Original strand, 137548 - 137736
Alignment:
Q  64 ctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaa 163  Q
    |||||| ||||||  |||||| || | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||     
T  137548 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 137647  T
Q  164 tgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatg 252  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  137648 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatg 137736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 159055 - 159242
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| | || | |||||||       
T  159055 gagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaattca 159154  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtct 189  Q
    ||  || ||| |||||||||||| |||   |||| |||| || |||||||  |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||    
T  159155 tttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 37414 - 37463
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 62  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37414 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 135474 - 135523
Alignment:
Q  13 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 62  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135474 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7002
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | |||||||||  ||||||  || ||||| |||| || |||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaa 7161  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaact 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||   || |||||    |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7160 tagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7063  T
Q  208 acagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7062 acagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgataacattgcttctgatga 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 9168 - 9403
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || | ||| |||| || |||||||||||    
T  9168 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcg 9267  T
Q  114 ttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagct 213  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| | ||| || ||  || |||||  | |||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  9268 ttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaact 9364  T
Q  214 tcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatg 252  Q
    ||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||    
T  9365 tctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatg 9403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10059
Alignment:
Q  31 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  131 tcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagct 230  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt--gct 10022  T
Q  231 tttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    | || || |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10023 tatgatg-agatgcttctgattaacttgcttctgatga 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1786 - 1598
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactt 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1786 tagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 1687  T
Q  125 ttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttc 215  Q
    ||| ||||||||||| |  ||| ||||  || |||||| | |||| | |||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  1686 ttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 807 - 633
Alignment:
Q  91 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtctt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  807 ttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagtctttgaagttttaagtctt 708  T
Q  191 gcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  707 gcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatga 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 6007 - 6256
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||| |    
T  6007 gagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 6106  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||  || |||| ||||||||  | |||  |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||  ||||| |||    
T  6107 tttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatcttctg 6205  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    || |||| || ||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  6206 atgaacttcaacttctagtgatatt--gcttctgatgaacttgcttctgatga 6256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10186
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctttt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  || | |||||||   ||    
T  9958 gacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatt 10057  T
Q  103 caaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacc-tttgaaactttaagtcttgcatctcctga 201  Q
      || ||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||   |||| ||||    
T  10058 tgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctga 10156  T
Q  202 taaactacagcttcttgtgatttttagctt 231  Q
    | |||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  10157 tgaacttcagcttctggtgaactttagctt 10186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4903
Alignment:
Q  117 cttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgat 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25776 - 25520
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||         |||  | |    
T  25776 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatc---------caatgcat 25686  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    |||||||||   |||||   |||||||||||||| |||| |   ||| |||  || |||||    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  25685 ttcaaaatatctgttgccatacttttccagtcttttgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaagt--tgcatctcctg 25588  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    || |||| |||||||| |||||   |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25587 atgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatga 25520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34915 - 34674
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||         |||  | |    
T  34915 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc---------caatgcat 34825  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 200  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |   ||| |||  || |||||    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34824 ttcaaaatattcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaag--ttgcatctcctg 34727  T
Q  201 ataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |  |||| |||||||| |||||    ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34726 aagaactgcagcttctagtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatga 34674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36119
Alignment:
Q  15 gtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||   | |||  ||||||  || | || ||| |  ||  ||||||| ||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  115 tgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaa 178  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaa 36119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2841 - 2704
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||   |||||  || ||||| || | |    
T  2841 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa-cct 2743  T
Q  101 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgca 139  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2742 tccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgca 2704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5922 - 5801
Alignment:
Q  130 gtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaaccttt-gaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttag 228  Q
    |||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |||||    
T  5922 gtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtgatctttag 5823  T
Q  229 cttttggtgaacttgcttctga 250  Q
    ||| || ||||||| |||||||    
T  5822 cttctgatgaacttacttctga 5801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 2022
Alignment:
Q  21 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  2086 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcttctg 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 223
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8151
Alignment:
Q  32 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagt 131  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || |  |  |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  132 cttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatt 223  Q
    |||||||| | |||||||||  || |||||    |||| | |||||| |||||||  || ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgatt 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65290
Alignment:
Q  55 ttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |  |  |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  155 taaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | |||||    || | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 65290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144335
Alignment:
Q  55 ttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |  |  |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  155 taaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    | |||||    || | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatga 144335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164940
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| ||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 164957  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgct 118  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  164956 tcaaattagttgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25510 - 25436
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25510 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaa 25436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23551 - 23424
Alignment:
Q  123 ttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgat 222  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||    |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23551 ttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 23455  T
Q  223 ttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    |   ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23454 tcacagcttctgatgaacttgcttttgatga 23424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1384
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctctt 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 27
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctctt 27  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 7383 - 7463
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatc 83  Q
    |||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7383 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgatgaattagcatc 7463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7635
Alignment:
Q  192 catctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgat 266  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7561 catctcttgatgaactaaagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactaacttctgat 7635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17876 - 17804
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaag 73  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  17876 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaag 17804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 74581 - 74678
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatc 98  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||| | ||||||| || | ||||||||    
T  74581 gagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaatc 74678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 268
Target Start/End: Original strand, 74814 - 74846
Alignment:
Q  236 tgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  74814 tgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 74846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15617
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||  |  ||||||  || | |||||||| ||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctt 15633  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgc 117  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  15632 tcaaactagccgttgc 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15492 - 15463
Alignment:
Q  239 acttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15492 acttgcttctgatgaacttgcttctgatga 15463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40780
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttt 101  Q
    ||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | ||||  || | |||||||  ||    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  102 tcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgct 144  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct 40780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44023 - 43830
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||  | ||||  |||||  || | ||||||||||||  ||     
T  44023 aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaat 43924  T
Q  108 tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgat 202  Q
    ||| | |||||||||| |||   ||||||||| || |||| ||  ||||||||   |||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |||||    
T  43923 tagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgat 43830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 87711 - 87637
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  87711 gagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 87637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 87548 - 87457
Alignment:
Q  173 tttgaaactttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  87548 tttgaaactttaagt--tcaatctcctgataaactacagtttctgatgaactt--gcttttgatgaacttgcttatgatgaactagcttctgatga 87457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 38189 - 38080
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaa 107  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| |||||||     
T  38189 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaat 38090  T
Q  108 tagtcgttgc 117  Q
    ||||| ||||    
T  38089 tagtcattgc 38080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1510
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaaatagtcg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||  | | ||  || | |||||||| |||  |||||||||    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  114 ttgcttcact 123  Q
    ||||||||||    
T  1519 ttgcttcact 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2725 - 2573
Alignment:
Q  98 cttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgcttagacgaaattaaatccaatgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctc 197  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  |||| |||  || |||||    |||| | |||||||||||| ||  ||||| ||    
T  2725 cttttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatt-ttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaaactttaggt--tgcatttc 2629  T
Q  198 ctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatga 253  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2628 ctgatgaactgcagtttctggtgatttacagcttctgatgaacttgcttctgatga 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2738
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2802 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5678
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 52  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta 5678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Original strand, 11550 - 11626
Alignment:
Q  192 catctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11550 catctcttgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Original strand, 11601 - 11641
Alignment:
Q  228 gcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11601 gcttttgatgaacttgcttctgatgaactagcttctgatga 11641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 858
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 75  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  925 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaa 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3937
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttg 70  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctttg 3937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9253
Alignment:
Q  179 actttaagtcttgcatctcctgataaactacagcttcttgtgatttttagcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  |||| || || |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9339 actttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgaactttcttctgatga 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 922 - 963
Alignment:
Q  227 agcttttggtgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 268  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  922 agcttctggtgaacttgcttatgatgaacttgcttctgatga 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  14 agtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaactagcatctgatactttcaaatcttttcaaa 106  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || | |||||||| |||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7354
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttg 70  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  7292 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaacactctttg 7354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1145 times since January 2019
Visitors: 2244