View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0169_low_30 (Length: 248)

Name: NF0169_low_30
Description: NF0169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0169_low_30
NF0169_low_30
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-227)||(50210107-50210333)
chr1 (1-225)||(34509783-34510007)
chr1 (1-228)||(22532269-22532496)
chr1 (1-228)||(27250623-27250850)
chr1 (1-228)||(21026680-21026907)
chr1 (2-227)||(20135188-20135413)
chr1 (14-227)||(22468604-22468816)
chr1 (13-225)||(433012-433222)
chr1 (46-225)||(23593719-23593897)
chr1 (62-226)||(21840766-21840929)
chr1 (62-225)||(13988866-13989028)
chr1 (62-225)||(21923291-21923453)
chr1 (62-228)||(45574842-45575008)
chr1 (62-225)||(21475087-21475249)
chr1 (62-225)||(29776688-29776850)
chr1 (62-225)||(31612313-31612475)
chr1 (46-227)||(16361915-16362095)
chr1 (62-225)||(29298137-29298298)
chr1 (22-228)||(13212821-13213027)
chr1 (25-225)||(21346961-21347161)
chr1 (1-151)||(22354466-22354616)
chr1 (25-231)||(21342090-21342296)
chr1 (62-225)||(16275363-16275526)
chr1 (62-225)||(21707167-21707329)
chr1 (62-225)||(21711709-21711871)
chr1 (62-225)||(22123067-22123230)
chr1 (117-231)||(15860064-15860177)
chr1 (126-228)||(20847173-20847275)
chr1 (1-91)||(22356068-22356159)
chr1 (1-91)||(22357754-22357845)
chr1 (102-221)||(21754052-21754170)
chr1 (46-209)||(21896195-21896358)
chr1 (47-209)||(21861510-21861672)
chr1 (46-224)||(33681011-33681188)
chr1 (13-228)||(38801297-38801508)
chr1 (12-90)||(48603652-48603730)
chr1 (7-213)||(16758664-16758872)
chr1 (62-222)||(40389157-40389317)
chr1 (106-224)||(22921868-22921986)
chr1 (19-209)||(35260992-35261180)
chr1 (21-224)||(21714546-21714754)
chr1 (81-224)||(22237631-22237773)
chr1 (113-228)||(14295557-14295672)
chr1 (160-227)||(20454606-20454673)
chr1 (46-209)||(50614055-50614219)
chr1 (46-209)||(50621883-50622047)
chr1 (113-224)||(20248283-20248394)
chr1 (113-212)||(20918620-20918719)
chr1 (61-209)||(41049990-41050138)
chr1 (44-201)||(21787979-21788136)
chr1 (106-209)||(16368284-16368388)
chr1 (130-213)||(52927993-52928076)
chr1 (53-179)||(33797570-33797694)
chr1 (13-91)||(21477653-21477732)
chr1 (46-179)||(22130850-22130978)
chr1 (7-207)||(26064959-26065160)
chr1 (160-224)||(42865266-42865330)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (1-228)||(9077952-9078179)
chr5 (1-225)||(24529223-24529447)
chr5 (1-228)||(25421532-25421759)
chr5 (1-228)||(1096467-1096694)
chr5 (1-228)||(25431395-25431621)
chr5 (1-228)||(23390390-23390617)
chr5 (1-228)||(24493569-24493795)
chr5 (1-228)||(8286736-8286964)
chr5 (1-228)||(13025311-13025537)
chr5 (1-228)||(13095495-13095721)
chr5 (13-225)||(22412187-22412388)
chr5 (1-228)||(22075018-22075246)
chr5 (62-225)||(264768-264930)
chr5 (62-225)||(29329934-29330096)
chr5 (62-225)||(39363384-39363546)
chr5 (63-225)||(10732941-10733102)
chr5 (120-228)||(21997547-21997655)
chr5 (62-225)||(20909012-20909174)
chr5 (61-228)||(21808343-21808510)
chr5 (62-225)||(42245365-42245527)
chr5 (13-225)||(11581151-11581361)
chr5 (109-228)||(21729066-21729185)
chr5 (62-225)||(29345980-29346142)
chr5 (1-228)||(21292864-21293090)
chr5 (62-225)||(36154783-36154942)
chr5 (62-225)||(29348453-29348615)
chr5 (62-225)||(29350926-29351088)
chr5 (62-225)||(39245136-39245298)
chr5 (62-225)||(32027393-32027555)
chr5 (62-225)||(20902008-20902172)
chr5 (62-225)||(2154613-2154776)
chr5 (62-222)||(18319033-18319193)
chr5 (62-225)||(10775675-10775838)
chr5 (62-225)||(31061068-31061231)
chr5 (21-221)||(37723910-37724108)
chr5 (102-225)||(38619434-38619557)
chr5 (4-124)||(21986044-21986164)
chr5 (7-209)||(22144068-22144271)
chr5 (46-224)||(21565546-21565723)
chr5 (102-224)||(23064512-23064634)
chr5 (62-225)||(20917952-20918110)
chr5 (62-222)||(24067110-24067270)
chr5 (13-214)||(18418594-18418793)
chr5 (13-162)||(20766035-20766174)
chr5 (110-228)||(21329500-21329618)
chr5 (110-209)||(20026942-20027043)
chr5 (113-224)||(22959538-22959649)
chr5 (1-92)||(22107267-22107358)
chr5 (152-228)||(19660879-19660956)
chr5 (13-228)||(40725853-40726069)
chr5 (130-228)||(36314577-36314675)
chr5 (109-228)||(21502158-21502277)
chr5 (106-228)||(26012034-26012154)
chr5 (113-228)||(19668898-19669013)
chr5 (80-226)||(17517174-17517320)
chr5 (66-224)||(26704075-26704236)
chr5 (66-224)||(26973808-26973969)
chr5 (48-209)||(22178161-22178323)
chr5 (106-179)||(29448052-29448126)
chr5 (171-225)||(20806850-20806904)
chr5 (159-212)||(26732884-26732937)
chr5 (53-179)||(20910745-20910869)
chr5 (109-179)||(18356364-18356432)
chr5 (21-201)||(21873277-21873453)
chr5 (159-209)||(26740697-26740747)
chr5 (139-224)||(23201360-23201445)
chr5 (160-209)||(23469822-23469871)
chr5 (139-224)||(23501387-23501472)
chr5 (160-224)||(22032323-22032387)
chr5 (165-201)||(22757148-22757184)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (1-227)||(28648938-28649164)
chr8 (1-231)||(6759255-6759483)
chr8 (1-228)||(16092235-16092463)
chr8 (2-228)||(22875065-22875291)
chr8 (1-228)||(18818303-18818530)
chr8 (1-228)||(22626736-22626962)
chr8 (1-228)||(21923822-21924049)
chr8 (1-228)||(20536208-20536435)
chr8 (1-228)||(7372778-7372997)
chr8 (1-228)||(23406379-23406608)
chr8 (1-228)||(21918894-21919121)
chr8 (1-228)||(18879131-18879352)
chr8 (2-227)||(23648554-23648779)
chr8 (7-228)||(31971257-31971476)
chr8 (1-228)||(45130892-45131117)
chr8 (62-225)||(14409444-14409606)
chr8 (62-225)||(1484402-1484564)
chr8 (62-225)||(5853292-5853454)
chr8 (62-221)||(16413316-16413474)
chr8 (62-225)||(20403227-20403389)
chr8 (62-225)||(22001753-22001915)
chr8 (13-225)||(41598188-41598399)
chr8 (62-225)||(20046195-20046357)
chr8 (62-225)||(4483281-4483442)
chr8 (62-225)||(15203231-15203393)
chr8 (7-228)||(16199546-16199765)
chr8 (13-225)||(26219717-26219918)
chr8 (62-225)||(4542373-4542535)
chr8 (62-225)||(19896265-19896430)
chr8 (82-225)||(26225268-26225409)
chr8 (7-228)||(21389353-21389571)
chr8 (12-228)||(21395888-21396101)
chr8 (12-228)||(21790381-21790594)
chr8 (62-225)||(14823774-14823935)
chr8 (25-228)||(21778697-21778897)
chr8 (62-227)||(26223917-26224081)
chr8 (106-228)||(38855250-38855372)
chr8 (62-225)||(25484275-25484430)
chr8 (13-209)||(19801333-19801527)
chr8 (103-231)||(19937046-19937174)
chr8 (46-221)||(13508024-13508199)
chr8 (62-221)||(45290694-45290853)
chr8 (110-228)||(6520368-6520486)
chr8 (102-212)||(15070571-15070681)
chr8 (46-221)||(13597556-13597731)
chr8 (113-228)||(5866280-5866395)
chr8 (125-228)||(17140916-17141019)
chr8 (113-228)||(21490995-21491110)
chr8 (13-228)||(17612018-17612231)
chr8 (106-224)||(21285601-21285719)
chr8 (1-90)||(25363034-25363123)
chr8 (46-209)||(20498581-20498744)
chr8 (110-213)||(983407-983512)
chr8 (106-224)||(23760843-23760961)
chr8 (80-226)||(18678075-18678221)
chr8 (107-224)||(26355699-26355815)
chr8 (46-209)||(37116366-37116530)
chr8 (106-216)||(21673716-21673826)
chr8 (12-224)||(17353843-17354060)
chr8 (113-228)||(21249384-21249500)
chr8 (113-228)||(21255222-21255338)
chr8 (80-226)||(32121734-32121880)
chr8 (25-209)||(17439423-17439609)
chr8 (106-209)||(17266991-17267096)
chr8 (106-209)||(24353039-24353143)
chr8 (44-201)||(23776772-23776929)
chr8 (13-64)||(26222987-26223039)
chr8 (112-209)||(19154890-19154989)
chr8 (160-209)||(20502154-20502203)
chr8 (158-207)||(22525579-22525628)
chr8 (106-147)||(40492850-40492891)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (1-225)||(3564258-3564482)
chr7 (1-228)||(12698831-12699059)
chr7 (13-225)||(18456319-18456530)
chr7 (1-228)||(9509189-9509416)
chr7 (1-228)||(38227481-38227707)
chr7 (1-228)||(26211995-26212223)
chr7 (13-225)||(48273392-48273594)
chr7 (1-213)||(15143931-15144143)
chr7 (1-228)||(10589039-10589265)
chr7 (62-228)||(13647325-13647491)
chr7 (62-228)||(18430709-18430874)
chr7 (1-228)||(16386141-16386369)
chr7 (62-225)||(456321-456483)
chr7 (62-225)||(11972496-11972658)
chr7 (62-225)||(14949122-14949284)
chr7 (62-225)||(15376713-15376875)
chr7 (46-225)||(16213684-16213861)
chr7 (62-225)||(16232520-16232682)
chr7 (62-225)||(18640272-18640434)
chr7 (62-225)||(20385123-20385285)
chr7 (62-225)||(21189595-21189757)
chr7 (62-225)||(24702238-24702400)
chr7 (62-225)||(32125491-32125653)
chr7 (62-225)||(41522917-41523079)
chr7 (62-225)||(41525379-41525541)
chr7 (62-224)||(11393287-11393448)
chr7 (62-225)||(27216860-27217022)
chr7 (62-225)||(44116509-44116671)
chr7 (75-221)||(24275175-24275320)
chr7 (64-225)||(16410059-16410219)
chr7 (22-228)||(2280033-2280238)
chr7 (7-226)||(40443393-40443610)
chr7 (62-225)||(3386333-3386495)
chr7 (62-225)||(24704688-24704847)
chr7 (13-225)||(17061866-17062077)
chr7 (102-225)||(13869346-13869469)
chr7 (62-221)||(38898376-38898535)
chr7 (102-225)||(13831373-13831495)
chr7 (45-225)||(20110556-20110724)
chr7 (13-228)||(27847739-27847951)
chr7 (105-228)||(67745-67868)
chr7 (13-209)||(12756622-12756817)
chr7 (113-228)||(34200786-34200901)
chr7 (106-228)||(22072913-22073036)
chr7 (109-224)||(16219719-16219834)
chr7 (106-224)||(18005650-18005768)
chr7 (130-228)||(28505321-28505419)
chr7 (13-228)||(19486649-19486865)
chr7 (7-213)||(1867895-1868101)
chr7 (113-228)||(16495402-16495517)
chr7 (62-162)||(26355983-26356083)
chr7 (62-162)||(26358435-26358535)
chr7 (118-224)||(811142-811248)
chr7 (110-228)||(47831807-47831925)
chr7 (115-224)||(44014182-44014291)
chr7 (7-205)||(15008398-15008597)
chr7 (113-228)||(11996033-11996148)
chr7 (113-228)||(15754893-15755008)
chr7 (46-206)||(12255730-12255892)
chr7 (44-222)||(18154773-18154956)
chr7 (106-213)||(16056343-16056449)
chr7 (59-224)||(14932685-14932851)
chr7 (52-201)||(15211484-15211633)
chr7 (59-224)||(15356120-15356286)
chr7 (59-224)||(15360234-15360400)
chr7 (50-224)||(19649427-19649606)
chr7 (106-228)||(10063817-10063939)
chr7 (122-213)||(12901338-12901431)
chr7 (109-179)||(2530140-2530208)
chr7 (46-209)||(20220129-20220290)
chr7 (158-213)||(14044761-14044817)
chr7 (158-213)||(14354791-14354847)
chr7 (45-140)||(15113031-15113125)
chr7 (167-225)||(26356098-26356156)
chr7 (167-225)||(26358550-26358608)
chr7 (21-113)||(24054581-24054673)
chr7 (160-224)||(12187019-12187083)
chr7 (160-224)||(17138113-17138177)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-228)||(3045-3271)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-228)||(29060540-29060767)
chr6 (1-228)||(25629249-25629476)
chr6 (1-227)||(18409721-18409947)
chr6 (1-228)||(19303435-19303661)
chr6 (1-228)||(20593773-20594000)
chr6 (1-228)||(20638177-20638404)
chr6 (1-228)||(20360854-20361081)
chr6 (1-228)||(17287690-17287917)
chr6 (1-228)||(22780121-22780348)
chr6 (62-225)||(22782227-22782389)
chr6 (62-225)||(2291180-2291342)
chr6 (62-225)||(12742317-12742479)
chr6 (62-225)||(18334592-18334754)
chr6 (62-225)||(19005046-19005208)
chr6 (62-225)||(19858919-19859081)
chr6 (62-225)||(24422547-24422709)
chr6 (62-225)||(33861794-33861956)
chr6 (62-225)||(33864278-33864440)
chr6 (61-228)||(20076700-20076863)
chr6 (62-227)||(30676710-30676874)
chr6 (62-225)||(8055029-8055191)
chr6 (62-225)||(25754809-25754971)
chr6 (62-225)||(26924640-26924802)
chr6 (62-227)||(34963371-34963535)
chr6 (7-213)||(25644335-25644543)
chr6 (62-225)||(1595549-1595711)
chr6 (109-228)||(16496244-16496363)
chr6 (62-225)||(25656629-25656791)
chr6 (13-209)||(18456735-18456930)
chr6 (62-225)||(20556894-20557054)
chr6 (62-225)||(1540911-1541073)
chr6 (62-225)||(3852017-3852179)
chr6 (82-225)||(25688502-25688644)
chr6 (62-222)||(16448526-16448686)
chr6 (75-209)||(18461895-18462028)
chr6 (7-228)||(16920533-16920751)
chr6 (44-209)||(18821782-18821946)
chr6 (46-228)||(20109140-20109322)
chr6 (7-228)||(22831503-22831723)
chr6 (53-228)||(35245586-35245758)
chr6 (13-228)||(8227416-8227632)
chr6 (1-190)||(25603279-25603467)
chr6 (113-228)||(28496477-28496592)
chr6 (113-228)||(29808888-29809003)
chr6 (2-201)||(15041446-15041644)
chr6 (106-224)||(19652199-19652316)
chr6 (130-228)||(27333241-27333339)
chr6 (130-228)||(27393981-27394079)
chr6 (106-228)||(23019408-23019528)
chr6 (21-190)||(25611637-25611805)
chr6 (167-228)||(25714417-25714478)
chr6 (113-228)||(1561303-1561418)
chr6 (113-213)||(9098518-9098620)
chr6 (110-213)||(19668386-19668491)
chr6 (62-226)||(19847949-19848114)
chr6 (20-209)||(11185524-11185710)
chr6 (115-226)||(23992429-23992540)
chr6 (113-216)||(4185827-4185930)
chr6 (151-207)||(33443068-33443124)
chr6 (44-119)||(25642120-25642196)
chr6 (181-228)||(22080799-22080846)
chr6 (109-179)||(27415943-27416011)
chr6 (139-224)||(19873120-19873205)
chr6 (139-224)||(22432249-22432334)
chr6 (139-224)||(22438799-22438884)
chr6 (113-216)||(4186379-4186482)
chr6 (1-46)||(5834391-5834436)
chr6 (163-224)||(19862978-19863039)
chr6 (1-46)||(20177096-20177141)
chr6 (160-201)||(21766718-21766759)
chr6 (1-46)||(22158850-22158895)
chr6 (46-209)||(23076749-23076913)
chr6 (21-116)||(19863089-19863184)
chr6 (21-116)||(19873231-19873326)
chr6 (158-209)||(35008167-35008219)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (1-228)||(14972854-14973081)
chr3 (1-225)||(40213615-40213838)
chr3 (1-228)||(18438534-18438761)
chr3 (1-228)||(25476279-25476506)
chr3 (1-228)||(13442274-13442501)
chr3 (1-228)||(17487856-17488083)
chr3 (1-228)||(26686887-26687114)
chr3 (1-228)||(11424657-11424880)
chr3 (7-210)||(42386428-42386632)
chr3 (5-228)||(23083259-23083482)
chr3 (1-228)||(17499338-17499565)
chr3 (9-228)||(43840932-43841151)
chr3 (1-224)||(14576727-14576949)
chr3 (1-228)||(20698330-20698556)
chr3 (13-225)||(24153115-24153326)
chr3 (2-228)||(12399209-12399435)
chr3 (1-215)||(14572602-14572815)
chr3 (46-225)||(29172567-29172745)
chr3 (62-226)||(13544024-13544187)
chr3 (62-225)||(9707607-9707769)
chr3 (62-221)||(12567564-12567722)
chr3 (62-225)||(17463178-17463340)
chr3 (62-225)||(34159326-34159488)
chr3 (82-225)||(36166598-36166739)
chr3 (62-225)||(45606907-45607069)
chr3 (62-225)||(55476491-55476653)
chr3 (62-225)||(7781347-7781509)
chr3 (62-225)||(8899094-8899256)
chr3 (62-225)||(16454281-16454443)
chr3 (62-225)||(17672626-17672788)
chr3 (62-225)||(28848611-28848773)
chr3 (62-225)||(38961891-38962053)
chr3 (62-225)||(13151790-13151953)
chr3 (62-225)||(13154255-13154418)
chr3 (62-225)||(6469134-6469296)
chr3 (62-225)||(10247723-10247885)
chr3 (13-214)||(21618460-21618650)
chr3 (62-225)||(50242822-50242984)
chr3 (62-228)||(43550478-43550644)
chr3 (62-223)||(16282811-16282971)
chr3 (62-225)||(17446655-17446816)
chr3 (62-209)||(53070653-53070799)
chr3 (62-223)||(41123892-41124049)
chr3 (102-225)||(15977515-15977637)
chr3 (111-225)||(55500942-55501055)
chr3 (22-225)||(12119684-12119887)
chr3 (13-228)||(24340628-24340844)
chr3 (46-225)||(8499518-8499697)
chr3 (102-225)||(15412429-15412552)
chr3 (46-225)||(27165250-27165429)
chr3 (13-209)||(52523633-52523831)
chr3 (1-213)||(30029855-30030066)
chr3 (46-224)||(16103784-16103960)
chr3 (106-225)||(10556985-10557104)
chr3 (113-228)||(13210333-13210448)
chr3 (102-221)||(32307684-32307802)
chr3 (106-224)||(15470928-15471046)
chr3 (46-224)||(16097332-16097509)
chr3 (12-90)||(14179570-14179648)
chr3 (49-225)||(53301492-53301669)
chr3 (13-228)||(37642170-37642386)
chr3 (125-225)||(44494809-44494908)
chr3 (110-228)||(14234487-14234605)
chr3 (13-210)||(23274705-23274903)
chr3 (113-224)||(12174265-12174376)
chr3 (126-225)||(17737236-17737337)
chr3 (102-224)||(49668071-49668193)
chr3 (80-226)||(46822267-46822413)
chr3 (1-90)||(16796685-16796774)
chr3 (102-221)||(1644670-1644787)
chr3 (122-224)||(9512924-9513026)
chr3 (122-224)||(9520899-9521001)
chr3 (46-167)||(2051138-2051260)
chr3 (109-226)||(12511059-12511176)
chr3 (106-209)||(37251165-37251270)
chr3 (106-209)||(43925977-43926082)
chr3 (164-225)||(28194693-28194755)
chr3 (106-209)||(22110349-22110454)
chr3 (13-228)||(22147431-22147646)
chr3 (172-225)||(45577947-45578000)
chr3 (112-209)||(12377940-12378039)
chr3 (158-207)||(13919350-13919399)
chr3 (139-224)||(15878083-15878168)
chr3 (139-224)||(23077509-23077594)
chr3 (160-224)||(856140-856204)
chr3 (13-64)||(36166747-36166799)
chr3 (165-227)||(14665398-14665460)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-225)||(16377417-16377639)
chr4 (1-223)||(14038653-14038875)
chr4 (1-228)||(12902757-12902984)
chr4 (1-228)||(44052829-44053056)
chr4 (11-228)||(16270140-16270356)
chr4 (1-228)||(16239864-16240090)
chr4 (1-228)||(7088877-7089104)
chr4 (1-228)||(7893703-7893927)
chr4 (9-226)||(22636437-22636653)
chr4 (44-228)||(7798774-7798958)
chr4 (13-225)||(54798669-54798872)
chr4 (13-225)||(14280316-14280518)
chr4 (13-225)||(44928829-44929042)
chr4 (1-221)||(23374253-23374473)
chr4 (62-227)||(19618172-19618336)
chr4 (62-225)||(18215274-18215436)
chr4 (56-228)||(6899891-6900062)
chr4 (62-225)||(12307-12469)
chr4 (46-225)||(1837494-1837671)
chr4 (62-225)||(15118352-15118514)
chr4 (62-225)||(44773087-44773249)
chr4 (62-225)||(52312510-52312672)
chr4 (109-228)||(52873369-52873488)
chr4 (62-231)||(19242693-19242861)
chr4 (62-225)||(3515007-3515169)
chr4 (62-225)||(44615288-44615450)
chr4 (62-225)||(50222339-50222501)
chr4 (62-225)||(18239419-18239581)
chr4 (62-225)||(23803265-23803427)
chr4 (62-225)||(51463868-51464030)
chr4 (13-225)||(44102214-44102425)
chr4 (62-221)||(15355324-15355483)
chr4 (82-225)||(8574844-8574985)
chr4 (12-228)||(17046487-17046700)
chr4 (62-227)||(14970707-14970871)
chr4 (13-213)||(52243099-52243302)
chr4 (62-225)||(12610950-12611105)
chr4 (13-228)||(15367690-15367905)
chr4 (13-228)||(15402703-15402918)
chr4 (62-225)||(7641192-7641344)
chr4 (13-228)||(15371202-15371417)
chr4 (13-228)||(15373483-15373698)
chr4 (46-209)||(13790-13953)
chr4 (7-228)||(14053202-14053422)
chr4 (142-228)||(3096293-3096379)
chr4 (13-228)||(15370018-15370232)
chr4 (64-209)||(21815587-21815731)
chr4 (13-228)||(16223532-16223747)
chr4 (46-213)||(43198492-43198661)
chr4 (102-224)||(12774011-12774132)
chr4 (62-226)||(22353835-22353999)
chr4 (118-228)||(39706299-39706409)
chr4 (7-209)||(6190481-6190683)
chr4 (62-222)||(20149832-20149992)
chr4 (113-228)||(15551817-15551932)
chr4 (110-213)||(12288211-12288316)
chr4 (14-90)||(17047979-17048055)
chr4 (1-91)||(3096781-3096870)
chr4 (124-224)||(8846360-8846460)
chr4 (46-209)||(46640395-46640558)
chr4 (53-179)||(43256106-43256230)
chr4 (46-209)||(53082091-53082254)
chr4 (64-146)||(15464888-15464970)
chr4 (13-64)||(8574784-8574836)
chr4 (125-190)||(16596686-16596751)
chr4 (21-113)||(13569624-13569716)
chr4 (44-201)||(15093798-15093955)
chr4 (158-207)||(17333298-17333347)
chr4 (161-209)||(15791793-15791841)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-227)||(17109-17337)
scaffold0056 (13-209)||(79235-79430)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-221)||(25959-26179)
scaffold0122 (82-225)||(44682-44825)
scaffold0122 (1-103)||(33389-33491)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-228)||(4508-4734)
scaffold0228 (1-228)||(12090-12316)
scaffold0228 (1-228)||(22042-22268)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (1-228)||(22337115-22337342)
chr2 (1-228)||(23060513-23060739)
chr2 (4-228)||(23076442-23076666)
chr2 (5-228)||(23660023-23660245)
chr2 (1-228)||(22731128-22731355)
chr2 (1-228)||(23285865-23286088)
chr2 (1-228)||(22738074-22738300)
chr2 (1-228)||(23654280-23654507)
chr2 (62-225)||(22105412-22105575)
chr2 (7-228)||(38016-38235)
chr2 (1-225)||(298708-298933)
chr2 (62-225)||(18808943-18809105)
chr2 (62-225)||(23130862-23131024)
chr2 (62-225)||(23133329-23133491)
chr2 (62-225)||(23709532-23709694)
chr2 (62-225)||(23712013-23712175)
chr2 (62-225)||(26505379-26505541)
chr2 (62-225)||(26507857-26508019)
chr2 (62-225)||(34402522-34402684)
chr2 (62-225)||(39682313-39682475)
chr2 (62-227)||(32214921-32215085)
chr2 (62-225)||(571397-571559)
chr2 (62-225)||(6725995-6726157)
chr2 (62-225)||(23135590-23135752)
chr2 (62-225)||(24367774-24367936)
chr2 (62-222)||(21155060-21155219)
chr2 (62-225)||(24898195-24898358)
chr2 (62-225)||(24900678-24900841)
chr2 (62-225)||(24903155-24903318)
chr2 (62-225)||(24905632-24905795)
chr2 (62-225)||(24908107-24908270)
chr2 (62-225)||(32039498-32039660)
chr2 (62-223)||(43137301-43137461)
chr2 (7-228)||(20309108-20309326)
chr2 (62-225)||(28577099-28577261)
chr2 (62-225)||(45029854-45030016)
chr2 (59-228)||(23103348-23103516)
chr2 (7-228)||(23708518-23708738)
chr2 (62-225)||(24529528-24529691)
chr2 (13-228)||(19671830-19672043)
chr2 (62-225)||(38967374-38967537)
chr2 (106-223)||(28405981-28406099)
chr2 (151-228)||(8946657-8946734)
chr2 (7-209)||(32451829-32452031)
chr2 (1-73)||(27753730-27753802)
chr2 (106-224)||(25175854-25175972)
chr2 (165-228)||(23040247-23040310)
chr2 (61-209)||(7687-7835)
chr2 (102-227)||(22134203-22134326)
chr2 (110-224)||(7679589-7679702)
chr2 (130-228)||(23071972-23072070)
chr2 (7-209)||(20520092-20520295)
chr2 (148-222)||(24643036-24643109)
chr2 (44-201)||(22799063-22799220)
chr2 (106-209)||(23207296-23207401)
chr2 (80-221)||(25616192-25616333)
chr2 (7-209)||(22413035-22413240)
chr2 (106-209)||(23791292-23791397)
chr2 (62-139)||(24642856-24642933)
chr2 (44-224)||(23019643-23019823)
chr2 (113-213)||(18786907-18787009)
chr2 (106-209)||(23004767-23004872)
chr2 (44-116)||(22758652-22758725)
chr2 (158-207)||(23287384-23287433)
chr2 (44-119)||(22740897-22740973)
chr2 (57-207)||(23038048-23038204)
chr2 (159-207)||(26392403-26392451)
chr2 (13-209)||(24697512-24697709)
chr2 (106-209)||(25108906-25109011)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-228)||(16494-16721)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-226)||(39479-39703)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-226)||(75109-75333)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (24-227)||(3103-3306)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-225)||(339844-340065)
scaffold0003 (62-225)||(158450-158612)
scaffold0003 (109-179)||(71350-71418)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-228)||(51913-52140)
scaffold0011 (1-228)||(167873-168099)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-228)||(13211-13438)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-228)||(25896-26122)
scaffold0026 (1-228)||(39858-40084)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-228)||(38761-38987)
scaffold0145 (11-228)||(32942-33158)
scaffold0145 (62-230)||(9744-9912)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-225)||(22886-23109)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-228)||(3470-3697)
scaffold0292 (1-228)||(343-569)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-228)||(1851-2078)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-228)||(8427-8650)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (2-165)||(3424-3588)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-228)||(39913-40139)
scaffold0080 (107-209)||(19883-19987)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (17-228)||(16113-16323)
scaffold0120 (11-228)||(32863-33077)
scaffold0120 (11-228)||(45928-46142)
scaffold0120 (167-228)||(17389-17450)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (18-228)||(4849-5059)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-228)||(6015-6245)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-228)||(943-1169)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-228)||(8479-8702)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-146)||(27912-28057)
scaffold0130 (194-227)||(27878-27911)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-210)||(24203-24406)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-176)||(13144-13319)
scaffold0175 (113-228)||(34123-34238)
scaffold0175 (172-228)||(273-329)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-228)||(32067-32285)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-228)||(13497-13716)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-228)||(20910-21138)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-228)||(1952-2179)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (7-228)||(4712-4932)
scaffold0358 (7-163)||(1-156)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (62-226)||(10772-10935)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (12-228)||(15370-15584)
scaffold0114 (160-224)||(7295-7359)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (62-225)||(4694-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (62-225)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (62-225)||(37821-37983)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (62-225)||(141618-141780)
scaffold0028 (62-225)||(136680-136842)
scaffold0028 (62-225)||(139149-139311)
scaffold0028 (62-225)||(144087-144249)
scaffold0028 (62-225)||(134211-134373)
scaffold0028 (106-226)||(62200-62317)
scaffold0028 (102-224)||(132662-132784)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (62-225)||(94411-94573)
scaffold0023 (62-221)||(17440-17598)
scaffold0023 (65-225)||(44454-44614)
scaffold0023 (106-224)||(100378-100496)
scaffold0023 (106-224)||(40173-40291)
scaffold0023 (157-228)||(119875-119947)
scaffold0023 (21-224)||(38394-38596)
scaffold0023 (152-224)||(101503-101576)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (13-225)||(16784-16995)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (12-228)||(10331-10544)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (62-225)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (62-225)||(13947-14109)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (109-228)||(28414-28533)
scaffold0046 (113-228)||(11292-11407)
scaffold0046 (113-228)||(1997-2112)
scaffold0046 (175-228)||(4552-4605)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (62-225)||(82072-82234)
scaffold0037 (46-213)||(22610-22776)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (62-221)||(501088-501246)
scaffold0001 (22-225)||(85539-85742)
scaffold0001 (106-224)||(160688-160805)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (62-226)||(9241-9404)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (82-225)||(116430-116571)
scaffold0022 (106-209)||(128968-129072)
scaffold0022 (106-221)||(78328-78445)
scaffold0022 (13-64)||(116579-116631)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-228)||(16282-16506)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (62-227)||(11286-11450)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-228)||(1289-1507)
scaffold0106 (7-228)||(7266-7484)
scaffold0106 (160-225)||(15291-15356)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (62-225)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (62-225)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (62-227)||(12249-12413)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (10-209)||(20328-20524)
scaffold0031 (61-228)||(128751-128917)
scaffold0031 (50-224)||(65736-65915)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (22-225)||(161049-161252)
scaffold0007 (22-145)||(164550-164674)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (62-222)||(4300-4459)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-169)||(857-1021)
scaffold0395 (162-228)||(4888-4954)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (50-227)||(174767-174943)
scaffold0021 (1-91)||(124722-124812)
scaffold0021 (159-228)||(121766-121835)
scaffold0021 (110-209)||(136370-136471)
scaffold0021 (110-209)||(145078-145179)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-228)||(952-1170)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (22-225)||(2088-2291)
scaffold0247 (13-228)||(17932-18148)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-228)||(46995-47202)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (62-225)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (62-225)||(12064-12220)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (9-207)||(4545-4742)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (46-213)||(8481-8650)
scaffold0621 (106-228)||(6535-6657)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (12-228)||(51582-51795)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (62-211)||(29946-30094)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-169)||(6669-6837)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (46-225)||(38641-38820)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (22-213)||(16014-16206)
scaffold0357 (22-209)||(13147-13336)
scaffold0357 (158-209)||(2680-2732)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (111-228)||(11447-11564)
scaffold0235 (1-44)||(11407-11450)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (62-222)||(1280-1440)
scaffold0101 (20-224)||(8871-9080)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-225)||(5036-5246)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (106-224)||(19268-19386)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (22-213)||(27663-27855)
scaffold0165 (1-69)||(3640-3708)
scaffold0165 (1-69)||(7704-7772)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (46-213)||(10481-10647)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (46-209)||(53488-53651)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (106-224)||(2805-2923)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (46-228)||(11464-11646)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (46-224)||(45732-45909)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (46-228)||(38195-38377)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (46-216)||(129917-130086)
scaffold0010 (7-209)||(60614-60818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (106-224)||(14696-14814)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (113-225)||(15664-15776)
scaffold0261 (50-224)||(1339-1516)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (21-224)||(23843-24048)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-209)||(51784-51985)
scaffold0034 (106-228)||(32538-32657)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (46-209)||(12587-12749)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (46-224)||(133-310)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (106-216)||(5655-5765)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (118-228)||(6134-6244)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-90)||(1052-1141)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (113-228)||(1075-1190)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (122-224)||(23898-24000)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-68)||(10323-10390)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (118-228)||(15788-15898)
scaffold0020 (161-224)||(178898-178961)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (120-228)||(6611-6719)
scaffold0333 (120-228)||(13991-14099)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (110-228)||(1037-1155)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (46-207)||(7998-8161)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (110-228)||(12766-12884)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (106-224)||(2644-2762)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (106-209)||(1051-1154)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (106-213)||(10542-10649)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (106-224)||(1086-1204)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (110-213)||(8075-8180)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (46-171)||(225465-225588)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (113-216)||(6824-6927)
scaffold0556 (106-153)||(8090-8137)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (152-224)||(28813-28887)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (102-224)||(32102-32224)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (110-224)||(12943-13057)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (13-213)||(25121-25321)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (61-209)||(6237-6386)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (122-224)||(29558-29660)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (106-205)||(38339-38440)
scaffold0139 (50-224)||(19980-20159)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (21-224)||(36454-36662)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (21-201)||(16264-16442)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (46-209)||(97024-97188)
scaffold0006 (46-209)||(106302-106466)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-49)||(17881-17929)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (53-179)||(15362-15486)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (110-213)||(103632-103737)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (52-201)||(192920-193070)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (167-209)||(11982-12024)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-224)||(69794-70000)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (110-209)||(569-669)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (106-171)||(2217-2281)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (106-209)||(1795-1900)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (75-140)||(13092-13157)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (106-209)||(267679-267784)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (21-224)||(15584-15796)
scaffold0297 (160-224)||(10575-10639)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (10-116)||(32544-32650)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (122-209)||(2694-2783)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (158-207)||(206575-206624)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-36)||(20595-20630)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (122-201)||(29117-29196)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (7-95)||(10605-10694)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (160-224)||(1881-1945)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (160-224)||(21856-21920)
scaffold0210 (160-224)||(29748-29812)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 50210107 - 50210333
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50210107 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 50210206  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50210207 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50210306  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50210307 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34510007 - 34509783
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  34510007 ttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 34509908  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34509907 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34509808  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34509807 cggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22532496 - 22532269
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22532496 ttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 22532397  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  22532396 aatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27250623 - 27250850
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  27250623 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 27250722  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27250723 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21026907 - 21026680
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaa 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||       
T  21026907 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt-- 21026810  T
Q  99 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21026809 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatga 21026710  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026709 gtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20135413 - 20135188
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | | | ||     
T  20135413 taatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattga 20135314  T
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20135313 atacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
     |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135213 agtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | || |||||| |||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  114 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  214 tgaagatgatgatg 227  Q
    | |||||| |||||    
T  22468803 ttaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433012
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  433025 gattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 13212821 - 13213027
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||    
T  13212821 atctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 13212919  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13212920 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13213018  T
Q  220 tgatgatgt 228  Q
    |||||||||    
T  13213019 tgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346961
Alignment:
Q  25 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgact 122  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21347063  T
Q  123 tgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21347062 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21346964  T
Q  223 tga 225  Q
    |||    
T  21346963 tga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22354466 - 22354616
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||   ||    
T  22354466 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttg 22354565  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 151  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22354566 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342090
Alignment:
Q  25 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgact 122  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21342198  T
Q  123 tgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21342197 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21342099  T
Q  223 tgatgtcca 231  Q
    ||| |||||    
T  21342098 tgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |   || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  162 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860177
Alignment:
Q  117 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  217 agatgatgatgtcca 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  15860163 agatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  126 atttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  226 tgt 228  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22356068 - 22356159
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22356068 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22356159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22357754 - 22357845
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22357754 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22357845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754052
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  47 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 146  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  147 atgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681011
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 38801297 - 38801508
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||  || | ||||||  | | ||    
T  38801297 ttaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatat 38801395  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  38801396 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgtt---gcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagat 38801491  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  38801492 gttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16758872 - 16758664
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||      
T  16758872 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg- 16758774  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16758773 ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 16758674  T
Q  204 tctaagttga 213  Q
    ||||||||||    
T  16758673 tctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 35260992 - 35261180
Alignment:
Q  19 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt 117  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||   |||    
T  35260992 ataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgt 35261088  T
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35261089 tgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21714754 - 21714546
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |     
T  21714754 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctt 21714656  T
Q  120 acttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 214  Q
      ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21714655 gtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T
Q  215 gaagatgatg 224  Q
     |||||||||    
T  21714555 caagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237631
Alignment:
Q  81 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 179  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||| |||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgtt 22237676  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22237675 atttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295672
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 50614055 - 50614219
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    |||||||||||  | |||||||||||   |||| ||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  50614055 ttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 50614153  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50614154 gaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 50621883 - 50622047
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    |||||||||||  | |||||||||||   |||| ||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  50621883 ttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 50621981  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50621982 gaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  212 gatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 41049990 - 41050138
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtata 159  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||    
T  41049990 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatata 41050087  T
Q  160 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41050088 ctgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 16368284 - 16368388
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16368284 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 16368382  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  16368383 tctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 52927993 - 52928076
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52927993 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||   || ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||     
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg- 33797598  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 -tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21477732 - 21477653
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 91  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21477732 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 21477653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 22130850 - 22130978
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||| |  || |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  22130850 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 22130945  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22130946 gatggtttgg-atactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26065160 - 26064959
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||   | || |||||||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||| ||      
T  26065160 atgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatgtcattaataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatg-atct 26065062  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-atgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||| ||  |||| | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||| ||    
T  26065061 ttgagatgttgttgatttgca-ttggtattgttatatcatgaattattttatgtactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttgg 26064963  T
Q  204 tcta 207  Q
    ||||    
T  26064962 tcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 42865266 - 42865330
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865266 ctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9078179 - 9077952
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9078179 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatg 9078080  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9078079 tataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggt 9077980  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077979 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24529447 - 24529223
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  24529447 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 24529348  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24529347 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 24529248  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24529247 cggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25421759 - 25421532
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  25421759 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25421660  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421659 aatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1096694 - 1096467
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1096694 ttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 1096595  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1096594 tatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25431621 - 25431395
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  25431621 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25431522  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25431521 aacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagt 25431422  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431421 cggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23390390 - 23390617
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  23390390 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 23390489  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23390490 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24493795 - 24493569
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| | ||    
T  24493795 ttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattg 24493696  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  24493695 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493596 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8286736 - 8286964
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||    
T  8286736 ttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 8286835  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt-tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
      || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286836 attatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 8286935  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286936 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13025537 - 13025311
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| | ||    
T  13025537 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13025438  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  13025437 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13025339  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025338 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13095721 - 13095495
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| | ||    
T  13095721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13095622  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  13095621 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13095523  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095522 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22075246 - 22075018
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaa 98  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||       
T  22075246 ttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt-- 22075149  T
Q  99 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  63 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg 162  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  163 cctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  220 tgatgatgt 228  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtat 158  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||   || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtat 21808440  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808441 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 11581151 - 11581361
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||||||||||    
T  11581151 ttaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgaga 11581248  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11581249 cgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11581347  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  11581348 gattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729185
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21729165  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21729166 gttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21292864 - 21293090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || | ||    
T  21292864 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 21292962  T
Q  101 tataattgagatgttgttgactt-gcat-ttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    ||||  | |||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21292963 tatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21293060  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293061 atcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||   || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245198 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 20902105  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 225  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902106 actg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 2154710  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154711 actg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061131 tac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723910
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatg 37724010  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 218  Q
    | ||  ||||||||| || |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  37724009 aatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaag 37723913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38619557 - 38619434
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38619557 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  38619458 cggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 21986044 - 21986164
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 103  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||    
T  21986044 atgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttat 21986143  T
Q  104 aattgagatgttgttgacttg 124  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  21986144 aatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22144271 - 22144068
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| || | |||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||      
T  22144271 atgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 22144172  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22144171 ttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22144073  T
Q  205 ctaag 209  Q
    |||||    
T  22144072 ctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565546
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23064634 - 23064512
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23064634 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  23064535 cggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatact 20918047  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918048 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | | | || || ||| |||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaat-attaaga 18418695  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766174
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcgta----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgaga 20766124  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20766125 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21329598  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329599 gttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  20027042 ag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959649
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  212 gatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||    
T  22959637 gatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 22107267 - 22107358
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 92  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  22107267 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaat 22107358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502277
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 21502256  T
Q  208 agttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  21502257 agttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012154
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  26012133 ctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668898
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19668914 gatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 17517174 - 17517320
Alignment:
Q  80 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  17517174 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 17517273  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517274 attaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26704236 - 26704075
Alignment:
Q  66 atataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||  ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| |||||  |    
T  26704236 atataatgttaattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctgtttt--atttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatc 26704139  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704138 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26973969 - 26973808
Alignment:
Q  66 atataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||  ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| |||||  |    
T  26973969 atataatgttaattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctgtttt--atttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatc 26973872  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973871 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 209
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  48 gatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 147  Q
    ||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||    
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  148 tgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
      | |||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22178260 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448052
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  171 gctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaattat--gaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||  ||    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaa----gatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgct 20910840  T
Q  149 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910841 g--tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356364
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873277
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || ||  || ||||||||   |    
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---a 21873358  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
      ||   |||||||||| | |||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21873357 aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201360
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 23501387 - 23501472
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501387 atgtcataatgttgatgtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032323
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22032387 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22757184 - 22757148
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22757184 tatgttgctgctgttatttaactaagttacatgagtc 22757148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28648938 - 28649164
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28648938 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 28649037  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28649038 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 28649137  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28649138 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6759483 - 6759255
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6759483 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagt 6759384  T
Q  100 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6759383 gtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 6759287  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759286 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16092235 - 16092463
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaat 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16092235 ttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaat 16092334  T
Q  100 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16092335 gtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16092434  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092435 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22875291 - 22875065
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875291 taatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22875192  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  22875191 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875092 cggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18818303 - 18818530
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  18818303 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 18818402  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18818403 aatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22626962 - 22626736
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  22626962 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattg 22626863  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22626862 aatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22626764  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626763 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21923822 - 21924049
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  21923822 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattg 21923921  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21923922 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20536435 - 20536208
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  20536435 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 20536336  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20536335 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7372997 - 7372778
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||| | ||    
T  7372997 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattg 7372906  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7372905 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23406608 - 23406379
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  23406608 ttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23406509  T
Q  101 tataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
     ||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23406508 aatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23406409  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406408 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21918894 - 21919121
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaat- 99  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || | |     
T  21918894 ttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattattt 21918992  T
Q  100 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21918993 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21919092  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919093 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18879131 - 18879352
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  18879131 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 18879229  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18879230 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18879324  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879325 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23648779 - 23648554
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | ||     
T  23648779 taatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattga 23648680  T
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23648679 atatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
     |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648579 agtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31971476 - 31971257
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  31971476 atgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 31971378  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31971377 taagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 31971279  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  31971278 aagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45130892 - 45131117
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || | ||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  101 tataattgagatgttgttgactt-gcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    ||||  | |||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41598399 - 41598188
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  41598399 ttaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 41598301  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41598300 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 16199546 - 16199765
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  16199546 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 16199644  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16199645 taagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16199742  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  16199743 taagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219717
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgaga 26219829  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26219828 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-actattttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26219731  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||||||||    
T  26219730 gattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat---gtcatgatgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattg-ttgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 124  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  125 catttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  224 gatgt 228  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855372
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38855349 ctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
           | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 19801431  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19801432 cgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 19937046 - 19937174
Alignment:
Q  103 taattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19937046 taattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19937144  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937145 ggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||| || || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508124 gatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||  |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6520387 gttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070571
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15070681 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T
Q  201 cggtctaagttg 212  Q
    ||||||||||||    
T  15070582 cggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140916
Alignment:
Q  125 catttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  224 gatgt 228  Q
    |||||    
T  17140920 gatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490995
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 17612018 - 17612231
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||   ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  17612018 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 17612114  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17612115 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  17612214 cgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 25363034 - 25363123
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  25363034 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | |  ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 23760843 - 23760961
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23760843 ttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23760941  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  23760942 ctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 18678075 - 18678221
Alignment:
Q  80 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  18678075 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 18678174  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678175 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355815
Alignment:
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  206 taagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26355797 taagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37116530 - 37116366
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  37116530 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37116431 gaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673716
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  205 ctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 17353843 - 17354060
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacg-cattacttgaattatgaatgtataattgag 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||  |   |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17353843 gttaattgtaatctgtgaagctgtt-atgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgag 17353941  T
Q  111 atgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    ||| || |  |||| |||||||||     ||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |     
T  17353942 atgatgcttgcttgtatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgata 17354041  T
Q  206 taagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  17354042 taagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249384
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21249402  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21249401 tgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255222
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21255240  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  21255239 tgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32121880 - 32121734
Alignment:
Q  80 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  32121880 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 32121781  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121780 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439609
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactt 123  Q
    |||||||||||| ||| |||  || |||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  124 gcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 17266991 - 17267096
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-atgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |   |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17266991 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 17267090  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  17267091 tctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24353143 - 24353039
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | |||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24353143 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 24353045  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  24353044 tctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| || | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 64  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 19154890 - 19154989
Alignment:
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19154890 tgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 40492850 - 40492891
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40492850 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3564258 - 3564482
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564258 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatg 3564357  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3564358 tataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3564458 cggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12699059 - 12698831
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  12699059 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 12698960  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12698959 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9509416 - 9509189
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  9509416 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttg 9509317  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9509316 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38227707 - 38227481
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| ||||| ||| | ||    
T  38227707 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattg 38227608  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38227607 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 38227509  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227508 cggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26212223 - 26211995
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaa 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||       
T  26212223 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt-- 26212126  T
Q  99 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtata-ttgaga 48273506  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15143931 - 15144143
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaat 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15143931 ttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaat 15144030  T
Q  100 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15144031 gtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15144129  T
Q  200 tcggtctaagttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  15144130 tcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10589265 - 10589039
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||   ||    
T  10589265 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaatatttg 10589167  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     | | |  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10589166 aacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10589067  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589066 cgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16386141 - 16386369
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    ||  ||    
T  16386141 ttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttg 16386240  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
     ||| || |||||||| |||  | || |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||    
T  16386241 aatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16386340  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386341 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  75 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  175 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  220 tgatgatgt 228  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40443610 - 40443393
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  40443610 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 40443512  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40443511 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40443414  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  40443413 taagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  ||||||||||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13869469 - 13869346
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13869469 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  13869370 cggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13831495 - 13831373
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13831495 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 13831397  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831396 ggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  45 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 144  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  145 tgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 27847739 - 27847951
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | ||||    
T  27847739 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 27847837  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  105 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 12756622 - 12756817
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||| |   || ||||||||||    
T  12756622 ttaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgaga 12756720  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  12756721 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219834
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| || |||||||    
T  16219818 agttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005650
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18005669 ctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486865
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||   ||  || ||||||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19486848 cgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  |    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtt 1867993  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  1867994 tgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggt 1868092  T
Q  205 ctaagttga 213  Q
    |||||||||    
T  1868093 ctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811248
Alignment:
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T
Q  217 agatgatg 224  Q
     |||||||    
T  811241 tgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831807
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | | | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47831826 gttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  214 tgaagatgatg 224  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008597
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||      
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 15008496  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  | |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 15008595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996148
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  11996132 gttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  146 g-atgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | ||   |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 222
Target Start/End: Original strand, 18154773 - 18154956
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatg 141  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||  |||||||||  |||||    
T  18154773 tgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt--atttgatatcgttatg 18154870  T
Q  142 tcatga-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    | |||      |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154871 tgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  205 ctaagttga 213  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||| | | | || |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  152 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 19649427 - 19649606
Alignment:
Q  50 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatt-----atgtc 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||  |||||||||| ||     |||||    
T  19649427 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctg-tttttatttgatattgttatgtgatgtc 19649525  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649526 atattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 10063817 - 10063939
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||    
T  10063817 ttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagt 10063915  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| | ||||| || ||||||    
T  10063916 ctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Original strand, 2530140 - 2530208
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530140 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 20220129 - 20220290
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||    
T  20220129 ttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcat 20220224  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20220225 gaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113031
Alignment:
Q  45 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||| ||||   || || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24054673 - 24054581
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 113  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24054673 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaattatgaatgaaagattgagatg 24054581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138177
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17138113 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3271
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3045 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 3144  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3145 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3243  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29060767 - 29060540
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29060767 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 29060668  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29060667 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29060568  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060567 cggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25629249 - 25629476
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629249 ttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 25629348  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25629349 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629449 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18409721 - 18409947
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  18409721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatg 18409820  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18409921 cggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19303435 - 19303661
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  19303435 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatg 19303534  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19303535 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20594000 - 20593773
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20594000 ttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattg 20593901  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |    
T  20593900 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgatt 20593801  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593800 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20638177 - 20638404
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||  ||    
T  20638177 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttg 20638276  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20638277 aatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 20638376  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638377 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20360854 - 20361081
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||    
T  20360854 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 20360953  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20360954 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17287690 - 17287917
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  17287690 ttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 17287789  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17287790 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22780121 - 22780348
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||| | ||    
T  22780121 ttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattg 22780220  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22780221 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagt 22780320  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780321 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||  || |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25644543 - 25644335
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||      
T  25644543 atgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgt 25644444  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25644443 ttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 25644344  T
Q  205 ctaagttga 213  Q
    |||||||||    
T  25644343 ctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496244
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16496264  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16496263 gttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattat--atgtgaaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541011 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  75 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg 18461930  T
Q  175 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 16920533 - 16920751
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  16920533 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 16920631  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920632 taagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     ||| || |||||||||||||||    
T  16920729 aaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatg 141  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatg 18821879  T
Q  142 tcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22831723 - 22831503
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata-a 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||| |    
T  22831723 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 22831625  T
Q  106 t-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    | | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831624 tctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtc---atgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22831528  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||   || |||||||||||||||    
T  22831527 tctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227632
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8227615 tgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 25603279 - 25603467
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| | | | ||    
T  25603279 ttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattg 25603378  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 190  Q
     ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25603379 aataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25603467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
      |||||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
      |||||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15041446 - 15041644
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt 101  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||  |||||||||||  | | | ||     
T  15041446 taatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttgagattttattga 15041544  T
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15041545 atacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652199
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333339
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394079
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 25611637 - 25611805
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| | | | || ||||||||||||| || ||    
T  25611637 aatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-ga 25611735  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 190  Q
     ||  |  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25611736 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25611805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T
Q  211 tga 213  Q
    |||    
T  9098618 tga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 19668392  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  19668391 agttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   ||| || |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  || ||||  ||||     
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaa 19848046  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848047 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185524
Alignment:
Q  20 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||  |||  ||||||    ||||| || ||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992429
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 214  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  215 gaagatgatgat 226  Q
     |||||| ||||    
T  23992440 taagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  212 gatga 216  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Original strand, 25642120 - 25642196
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  181 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Original strand, 27415943 - 27416011
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415943 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186379
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  212 gatga 216  Q
    |||||    
T  4186383 gatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5834391 - 5834436
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 46  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5834391 ttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19863039 - 19862978
Alignment:
Q  163 cctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863039 cctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20177141 - 20177096
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 46  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20177141 ttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 22158850 - 22158895
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 46  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22158850 ttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23076913 - 23076749
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  || || ||||||||| |  || ||||||||||||| ||      
T  23076913 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctg 23076815  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||| | |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23076814 gatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19863184 - 19863089
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 116  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19863184 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19863089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19873326 - 19873231
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 116  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19873326 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19873231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14973081 - 14972854
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14973081 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 14972982  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14972981 tatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 40213615 - 40213838
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213615 ttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatg 40213714  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213715 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagt 40213813  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  40213814 cggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18438761 - 18438534
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18438761 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatg 18438662  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438661 tataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 18438562  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438561 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25476279 - 25476506
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25476279 ttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatg 25476378  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25476379 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagt 25476478  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476479 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13442501 - 13442274
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  13442501 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 13442402  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13442401 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17488083 - 17487856
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||    
T  17488083 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17487984  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17487983 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26687114 - 26686887
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |    
T  26687114 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatgg 26687015  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26687014 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11424657 - 11424880
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424657 ttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 11424756  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424757 cataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11424852  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424853 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42386632 - 42386428
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||     
T  42386632 atgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatat 42386533  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42386532 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtc 42386433  T
Q  206 taagt 210  Q
    |||||    
T  42386432 taagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23083259 - 23083482
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | || |||    
T  23083259 tgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaata 23083358  T
Q  105 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083359 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23083458  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23083459 ctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17499565 - 17499338
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||    
T  17499565 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17499466  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17499465 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43841151 - 43840932
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| ||     
T  43841151 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 43841052  T
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaa 43840952  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  43840951 gttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14576727 - 14576949
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  14576727 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattg 14576826  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  14576827 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagt 14576925  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  14576926 cggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20698330 - 20698556
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||    
T  20698330 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 20698428  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20698429 aatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20698528  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698529 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||| | || ||| || ||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12399435 - 12399209
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaat 99  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||   |    
T  12399435 taatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatt--t 12399338  T
Q  100 gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399337 gaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12399238  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399237 tcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14572815 - 14572602
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||| | ||    
T  14572815 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattg 14572716  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14572715 aatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14572617  T
Q  201 cggtctaagttgatg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  14572616 cggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 29172567 - 29172745
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172567 ttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29172666  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172667 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618460
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgaga 21618561  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21618560 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15977637 - 15977515
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15977637 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 15977539  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15977538 ggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  111 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 12119684 - 12119887
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||||   || |||||||||| |||| |||    
T  12119684 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12119881  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  12119882 tgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8499697 - 8499518
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 144  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||||   || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499697 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 8499598  T
Q  145 tgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8499597 tgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15412552 - 15412429
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15412552 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  15412453 cggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30030066 - 30029855
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | | | ||    
T  30030066 ttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattg 30029967  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  30029966 aatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T
Q  201 cggtctaagttga 213  Q
    | |||||||||||    
T  30029867 cagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103784
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||  |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556985
Alignment:
Q  106 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 10557006  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10557005 ctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307684
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470928
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  15470947 ctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097332
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Original strand, 53301492 - 53301669
Alignment:
Q  49 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt-tgacttgcatttgatattattatgtcatga 147  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  |||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||     
T  53301492 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgt 53301591  T
Q  148 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301592 tgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  125 catttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaa 14234507  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14234506 gttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23274903 - 23274705
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgt-ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | |||||||||||||   || ||| ||||||    
T  23274903 ttaatgatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  23274803 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174376
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  212 gatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||    
T  12174364 gatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  126 atttgatattattatgtcatgatgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||   || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17737239  T
Q  223 tga 225  Q
    |||    
T  17737238 tga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 49668071 - 49668193
Alignment:
Q  102 ataattgagatgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgag 199  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49668071 ataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| |||||| |||||||    
T  49668169 tcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46822413 - 46822267
Alignment:
Q  80 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  46822413 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 46822314  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822313 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16796774 - 16796685
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16796774 ttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Original strand, 1644670 - 1644787
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  1644670 ataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagtt 1644767  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  1644768 ggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512924
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 220  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9512928  T
Q  221 gatg 224  Q
    ||||    
T  9512927 gatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520899
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 220  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9520903  T
Q  221 gatg 224  Q
    ||||    
T  9520902 gatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 167
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051260
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctat 167  Q
    ||  | ||||| |||||||||||    
T  2051238 gaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12511176 - 12511059
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  12511176 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaa 12511077  T
Q  209 gttgatgaagatgatgat 226  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  12511076 gttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcgg 37251264  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  37251265 tctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43926082 - 43925977
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  43926082 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 43925983  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  43925982 tctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  164 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 22110349 - 22110454
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22110349 ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 22110448  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  22110449 tctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147646
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattt-atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22147530 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  22147629 cgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  172 ctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 23077509 - 23077594
Alignment:
Q  139 atgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077509 atgtcataatgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 64  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16377417 - 16377639
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377417 ttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16377516  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16377517 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16377615 cggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14038875 - 14038653
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  14038875 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatg 14038776  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14038775 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14038675 cagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12902984 - 12902757
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  12902984 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 12902885  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12902884 aatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44053056 - 44052829
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  44053056 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 44052957  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44052956 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgag 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  111 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16239864 - 16240090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7089104 - 7088877
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  7089104 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 7089005  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7089004 aatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7088905  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088904 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7893927 - 7893703
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| | ||    
T  7893927 ttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattg 7893831  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  7893830 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22636653 - 22636437
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   || ||| ||     
T  22636653 gatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattta 22636555  T
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22636455  T
Q  209 gttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22636454 gttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||          |  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23374253 - 23374473
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaa 98  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||       
T  23374253 ttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt-- 23374350  T
Q  99 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374351 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23374450  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  23374451 gtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873488
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52873469 gttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 231  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44102425 - 44102214
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  44102425 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44102327  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44102326 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44102228  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  44102227 gattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 17046602  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17046601 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 17046505  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  17046504 tgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||  ||| ||  ||||||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T
Q  210 ttga 213  Q
    ||||    
T  52243299 ttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg------ 7641285  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641286 -----tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371202
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15371319  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15371318 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15371219 cgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373483
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15373600  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15373599 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15373500 cgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 14053202 - 14053422
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   |||||       
T  14053202 atgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgca 14053300  T
Q  107 tgag-atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    | || |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  14053301 taagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 14053398  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  14053399 ctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  142 tcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15370232 - 15370018
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || | | |||||||||   || ||||||||||    
T  15370232 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgaga 15370135  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15370134 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15370035 cgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16223747 - 16223532
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||  |||||||||||  |||| |  ||| |||||||||   || ||||||||||    
T  16223747 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgaga 16223649  T
Q  112 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16223648 cgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  16223549 cgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  146 g-atgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    | ||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706409
Alignment:
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  39706398 agatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6190683 - 6190481
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||| | ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  6190683 atgatattaattacaattcgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 6190586  T
Q  106 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    |||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  6190585 ttgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 6190487  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  6190486 tctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551817
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15551834  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15551833 gttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  12288311 agttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3096870 - 3096781
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 91  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  3096870 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaa 3096781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8846460 - 8846360
Alignment:
Q  124 gcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  8846460 gcattcgatattgttatctcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatga 8846362  T
Q  223 tg 224  Q
    ||    
T  8846361 tg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 46640395 - 46640558
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  46640395 ttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcat 46640492  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46640493 gaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 150  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||   || ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||     
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg- 43256202  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 -ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 53082091 - 53082254
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  53082091 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 53082188  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53082189 gaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464970
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 146  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 64  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16596751 - 16596686
Alignment:
Q  125 catttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16596751 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13569716 - 13569624
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 113  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13569716 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 13569624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| | ||||||| ||  || | |||||||||| | |||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtc 15093856  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||| |||| ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15093855 atgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15791841 - 15791793
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15791841 tgcctatgttgttgttgtcttttaattaaactacatgagtcggtctaag 15791793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 17109 - 17337
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17109 ttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 17208  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17209 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 17308  T
Q  199 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 79235 - 79430
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  79235 ttaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 79333  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79334 cgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25959 - 26179
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25959 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 26058  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26059 tatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26158  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26159 cggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 33389 - 33491
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33389 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 33488  T
Q  101 tat 103  Q
    |||    
T  33489 tat 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4508
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 4635  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4634 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4535 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12316 - 12090
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12316 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 12217  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12216 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12117 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22268 - 22042
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22268 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22169  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22168 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22069 cggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22337342 - 22337115
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337342 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22337243  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22337242 tatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23060739 - 23060513
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |     
T  23060739 ttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt 23060641  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23060640 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23076666 - 23076442
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||    
T  23076666 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23076567  T
Q  104 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076566 atttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  23076466 tctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23660245 - 23660023
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  23660245 tgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaata 23660146  T
Q  105 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23660145 tttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggt 23660047  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23660046 ctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22731128 - 22731355
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  22731128 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22731227  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22731228 aatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23286088 - 23285865
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |    ||    
T  23286088 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttg 23285989  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23285988 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23285893  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285892 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22738074 - 22738300
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  22738074 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22738173  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22738174 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagt 22738272  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738273 cggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23654280 - 23654507
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||   ||    
T  23654280 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttg 23654379  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23654380 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 38016 - 38235
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  38016 atgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 38114  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | ||||| || ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38115 taagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 38213  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  38214 aagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 298708 - 298933
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaa 98  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||       
T  298708 ttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt-- 298805  T
Q  99 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatg 197  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  298806 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 298905  T
Q  198 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298906 agtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20309326 - 20309108
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  20309326 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 20309228  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20309227 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20309131  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  20309130 taagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 228
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103516
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgta 157  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 23708518 - 23708738
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||      
T  23708518 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgt 23708617  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23708618 ttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggt 23708716  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  23708717 ctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgta-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529628 tg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19672043 - 19671830
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||    
T  19672043 ttaatgataatctgtgaagctgatctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgaga 19671947  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19671946 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19671847 cgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 32451829 - 32452031
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  32451829 atgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 32451926  T
Q  106 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  32451927 ttgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcgg 32452025  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  32452026 tctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27753802 - 27753730
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753802 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175854
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25175873 ctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  161 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 227
Target Start/End: Original strand, 22134203 - 22134326
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22134203 ataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtc 22134300  T
Q  202 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134301 ggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 7679605  T
Q  209 gttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||||||||    
T  7679604 gttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20520092 - 20520295
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||      
T  20520092 atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 20520190  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | |||| | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20520191 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 20520289  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  20520290 tctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 24643036 - 24643109
Alignment:
Q  148 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643036 tgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 22799162  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  22799163 atgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 23207302  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  23207301 tctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25616333 - 25616192
Alignment:
Q  80 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| |||| ||||     
T  25616333 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgta 25616234  T
Q  180 atttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25616233 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 22413035 - 22413240
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||      
T  22413035 atgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatg-atg- 22413132  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatat--tattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| | ||||||||    
T  22413133 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtc 22413232  T
Q  202 ggtctaag 209  Q
    ||||||||    
T  22413233 ggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23791397 - 23791292
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| | |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23791397 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcgg 23791298  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  23791297 tctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 139  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019823
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 23019742  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23019743 atgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 18786907 - 18787009
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  |  |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18786907 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18787006  T
Q  211 tga 213  Q
    |||    
T  18787007 tga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004767
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  | |||| | |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 23004773  T
Q  204 tctaag 209  Q
    | ||||    
T  23004772 tttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 22758652 - 22758725
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Original strand, 22740897 - 22740973
Alignment:
Q  44 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23038204 - 23038048
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgt 150  Q
    |||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||||||  |||    
T  23038204 tatgatgtgatataatgtttaattgaattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgt 23038105  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23038104 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24697512 - 24697709
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 112  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||  || |||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| |||||| |  ||| |   |||||||    
T  24697512 ttaatgatgatctgtgaagctgtataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagat 24697610  T
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg-tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| | ||||||||| |||| || |||||  ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24697611 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25109011 - 25108906
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||  | |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25109011 ttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcgg 25108912  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  25108911 tctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16494 - 16721
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16494 ttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16593  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16594 tatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16693  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16694 cggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39703 - 39479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39703 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 39604  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39603 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 39505  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39504 cggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 75109 - 75333
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  75109 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 75208  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  75209 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 75307  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  75308 cggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  24 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  124 gcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  224 gatg 227  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 339844 - 340065
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  339844 ttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 339943  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  339944 tatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagt 340040  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  340041 cggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 71418 - 71350
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  71418 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52140 - 51913
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  52140 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 52041  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52040 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 167873 - 168099
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  167873 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 167971  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  167972 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13211
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||    
T  13438 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 13339  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13338 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26122 - 25896
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  26122 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 26023  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26022 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 25924  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25923 cggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40084 - 39858
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  40084 ttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 39985  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39984 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 39886  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39885 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38987 - 38761
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  38987 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 38888  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |    
T  38887 aatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgact 38789  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38788 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgag 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  111 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtat 9815  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 230  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9814 actgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23109 - 22886
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  23109 ttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23010  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23009 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3697 - 3470
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  3697 ttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttg 3598  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3597 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 343
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |    
T  569 ttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcg 470  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  469 aatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagt 371  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  370 cggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1851
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  2078 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 1979  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1978 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8427 - 8650
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  8427 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 8526  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  8527 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagt 8622  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8623 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcct 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40139 - 39913
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |       
T  40139 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatca 40040  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  40039 aatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 39941  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39940 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggt 19982  T
Q  205 ctaag 209  Q
    |||||    
T  19983 ctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  17 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  116 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  216 aagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 32863 - 33077
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| || |    
T  32863 tgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtat-aatgaatatttaa 32959  T
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32960 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 33058  T
Q  210 ttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33059 ttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46142 - 45928
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattga 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| || |    
T  46142 tgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtat-aatgaatatttaa 46046  T
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46045 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 45947  T
Q  210 ttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45946 ttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaatgtataattgagatgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||   || ||| || |||||||    
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatacttaagatgtt 4962  T
Q  116 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatg 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  4961 gttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttg 4862  T
Q  216 aagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  4861 aagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6245
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||    
T  6015 ttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 6114  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctacatg 197  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6115 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 6214  T
Q  198 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6215 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 943 - 1169
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  943 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 1041  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1042 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8702 - 8479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||||| ||    ||    
T  8702 ttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttg 8607  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  8606 aatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28057 - 27912
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28057 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 27958  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27911 - 27878
Alignment:
Q  194 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27911 catgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24406
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttga-ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataatt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   || ||| ||    
T  24203 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 24302  T
Q  108 gagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24303 aagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  207 aagt 210  Q
    ||||    
T  24403 aagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13319 - 13144
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  13319 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 13220  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 176  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13219 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  34139 gttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  172 ctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32285 - 32067
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  32285 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 32187  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32186 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 32089  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  32088 aagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13716 - 13497
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  13716 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 13618  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | |||||||| ||| | | | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13617 taagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 13519  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  13518 aagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21138 - 20910
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |    ||    
T  21138 ttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttg 21039  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
     |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  21038 aatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgag 20939  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20938 tcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2179 - 1952
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||    
T  2179 ttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttg 2080  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2079 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4932 - 4712
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||   ||||||      
T  4932 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 4834  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4833 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 4734  T
Q  207 aagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  4733 aagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||   ||||||      
T  156 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 58  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc 163  Q
    | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  57 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||   | ||||  | |||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataaga 15468  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15469 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15567  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  15568 gttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 62317 - 62200
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  62317 ttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
     ||||| || || |||||||||    
T  62221 ttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| || | |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  65 gatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-tttttgtatactgc 163  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 100496 - 100378
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  100496 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 100398  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  100397 ctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40291
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  40272 ctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38596
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 38492  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 220  Q
      || | |||||||||  | |||||| |||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||| |||||    
T  38493 aatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagat 38592  T
Q  221 gatg 224  Q
    ||||    
T  38593 gatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16995 - 16784
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  ||||||||||    
T  16995 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgaga 16897  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16896 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   |||||| || |||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaaga 10429  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10430 tgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagt 10526  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||||||||||||||    
T  10527 tgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28433 gttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||| ||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||| ||| |||| |||    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 160805 - 160688
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  160805 ttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 160708  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  160707 ctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 226  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  82 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  182 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 128968 - 129072
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  128968 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcgg 129066  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  129067 tctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 78445 - 78328
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  78445 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 78347  T
Q  204 tctaagttg-atgaagatg 221  Q
    || ||| || |||||||||    
T  78346 tccaagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 116631 - 116579
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  116631 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatatgttaatgttgattatgatgt 116579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16506 - 16282
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||    
T  16506 ttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 16408  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgag 199  Q
    ||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  16407 tatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgag 16311  T
Q  200 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  16310 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1289
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  1507 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 1409  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1408 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1312  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  1311 taagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7484 - 7266
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  7484 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 7386  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7385 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7289  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7288 taagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 20328 - 20524
Alignment:
Q  10 atgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||    
T  20328 atgttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 20425  T
Q  109 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20426 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 65736 - 65915
Alignment:
Q  50 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatat-----tattatgt 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||  ||  |||||||||     ||| ||||    
T  65736 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattaattgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttg--ttttatttgatatccttatatgatgt 65833  T
Q  143 catgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  65834 catactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161252
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaaga 161246  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  161247 tgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 857 - 1021
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  857 ttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattg 956  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||    
T  957 aatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  50 tgttgattatgatgtgatataatgtt-atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  149 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 227  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174843 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 124812 - 124722
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  124812 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaa 124722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 136469  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  136470 ag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 145177  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  145178 ag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 952 - 1170
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||      
T  952 atgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 1050  T
Q  107 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 205  Q
    | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1051 taagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtc 1147  T
Q  206 taagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  1148 taagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2291
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||  |||    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaa 2285  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  2286 tgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
     | |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||   ||||||  | ||||||||     
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |   ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4742 - 4545
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataatt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  4742 gatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatattt 4645  T
Q  108 gagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
     |||||||||||| ||  |||||||||||| || || || || | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4644 aagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 143  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6535
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51795 - 51582
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  ||   ||||||  | |||    
T  51795 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataaga 51697  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  51696 tgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 51600  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || |||| ||||||||||    
T  51599 tgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6669
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 100  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||  ||    
T  6837 ttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttg 6738  T
Q  101 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
     ||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6737 aatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38741 gttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  | | ||  |||||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg-agatgttgttg 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||  |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  111 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  211 tgatgaagatgatgatgt 228  Q
    || ||||||||| |||||    
T  11547 tgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11407 - 11450
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11407 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatga 222  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Original strand, 8871 - 9080
Alignment:
Q  20 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacg-cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||| || |||||  |   |||||||||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  8871 taatctgtgaagctgtt-atgaaatgttgatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgct 8969  T
Q  119 gacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
      |||| |||||||||     ||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||    
T  8970 tgcttgtatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatga 9069  T
Q  214 tgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||    
T  9070 tcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 5134  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5135 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5231  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  5232 tgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19268
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19287 ctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   || ||  |||||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3640
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3708 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7772 - 7704
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7772 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 213  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11546 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45909
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  ||| || |||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttg-ataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38295 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 130086 - 129917
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  130086 ttgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 129988  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  129987 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 60614 - 60818
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||      
T  60614 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 60713  T
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  60714 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 60812  T
Q  204 tctaag 209  Q
    | ||||    
T  60813 tttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1516 - 1339
Alignment:
Q  50 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtc 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||  |||||||||      || |||||    
T  1516 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg--attg-cttttatttgatatcgttgcatgatgtc 1420  T
Q  144 atgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1419 ataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23843
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||     
T  24048 aatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgt 23950  T
Q  121 cttgcatttgatattattat-----gtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatg 215  Q
     ||  |||||||||| ||||     |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  23949 ttt--atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatc 23852  T
Q  216 aagatgatg 224  Q
    |||||||||    
T  23851 aagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 51784 - 51985
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 105  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  51784 atgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 51881  T
Q  106 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  51882 ttgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 51979  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  51980 tctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||  ||   || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 133
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  310 ttgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 212  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  211 gatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5655
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggt 5667  T
Q  205 ctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||    
T  5666 ctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6244
Alignment:
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  6233 agatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1052
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1141 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  212 gatgaagatgatgatgt 228  Q
    | |||||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24000
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 220  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  221 gatg 224  Q
    ||||    
T  23997 gatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10323
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 68  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10390 ttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15898
Alignment:
Q  118 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15886  T
Q  217 agatgatgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  15887 agatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6719 - 6611
Alignment:
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 218  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6719 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 6621  T
Q  219 atgatgatgt 228  Q
    ||||||||||    
T  6620 atgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14099 - 13991
Alignment:
Q  120 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 218  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14099 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 14001  T
Q  219 atgatgatgt 228  Q
    ||||||||||    
T  14000 atgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1155
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1037 gatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1135  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1136 gttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||| ||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||  |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  8098 gagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  209 gttgatgaagatgatgatgt 228  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12785 gttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 2644 - 2762
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2644 ttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttac-atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2742  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  2743 ctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  205 ctaag 209  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  205 ctaagttga 213  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1086
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 204  Q
    |||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1204 ttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1106  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1105 ctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtcta 8174  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  8175 agttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225465
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  146 gatgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||    
T  225489 gctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6824
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 211  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  212 gatga 216  Q
    |||||    
T  6828 gatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  102 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  201 cggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12943
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  209 gttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| || |||||||    
T  12958 gttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25321 - 25121
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| | || |||||||||| |  ||||  |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||    
T  25321 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-taataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgaga 25224  T
Q  112 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25223 tgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T
Q  210 ttga 213  Q
    ||||    
T  25124 ttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6386
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtata 159  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  | |||| ||||    
T  6237 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatata 6335  T
Q  160 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6336 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||  || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  222 atg 224  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38440 - 38339
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  38440 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcgg 38341  T
Q  204 tc 205  Q
    ||    
T  38340 tc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20159 - 19980
Alignment:
Q  50 tgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatat-----tattatgt 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||  ||  |||||||||     ||| ||||    
T  20159 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttg--ttttatttgatattgttatatgatgt 20062  T
Q  143 catgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||  |||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20061 catactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36662 - 36454
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||       
T  36662 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgcgt 36564  T
Q  120 acttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 214  Q
      ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| |||||   |||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36563 gtttatatttgatatcgttatatgatgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T
Q  215 gaagatgatg 224  Q
     |||||||||    
T  36463 caagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16442
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 120  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 16362  T
Q  121 cttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
      |  | |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  16363 aat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 97188 - 97024
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  97188 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 97090  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  97089 gaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 106466 - 106302
Alignment:
Q  46 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 145  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  106466 ttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 106368  T
Q  146 gatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    ||  | |||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  106367 gaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17881 - 17929
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 49  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17881 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||   || ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||     
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg- 15458  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 -tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctacatgagtcggtct 206  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttt-tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtct 103730  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  103731 aagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatacg-cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||   ||| ||||||| | | | || |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  151 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69794
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  70000 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctg 69902  T
Q  120 acttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 214  Q
      ||    |||||||     | | |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  69901 --tttttattgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgat 69804  T
Q  215 gaagatgatg 224  Q
     |||||||||    
T  69803 caagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  669 gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 571  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  570 ag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 171
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2281
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1900
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| |||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcgg 1894  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  1895 tctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 13092
Alignment:
Q  75 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 140  Q
    |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13157 tatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 267784 - 267679
Alignment:
Q  106 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcgg 203  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| |||||||| ||||||| || |||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  267784 ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcgg 267685  T
Q  204 tctaag 209  Q
    ||||||    
T  267684 tctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15796
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |     
T  15584 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgctt 15682  T
Q  120 acttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgtttttgtatactgc----ctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 210  Q
     |||  |||||||||     ||| ||||||| ||||| |||||  ||||    ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||     
T  15683 gcttatatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcgtagctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataaga 15782  T
Q  211 tgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||    
T  15783 tgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 32650 - 32544
Alignment:
Q  10 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 108  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  32650 atgttaattgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgattg 32552  T
Q  109 agatgttg 116  Q
    ||||||||    
T  32551 agatgttg 32544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 20630 - 20595
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 36  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20630 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29196 - 29117
Alignment:
Q  122 ttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtc 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||  || |||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  29196 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10694 - 10605
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattat 95  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  10694 atgatattaatgatgatctgtgaagctgtataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattat 10605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 21856 - 21920
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  21856 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29812
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  29748 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1126 times since January 2019
Visitors: 2244