View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0169_low_4 (Length: 433)

Name: NF0169_low_4
Description: NF0169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0169_low_4
NF0169_low_4
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (12-412)||(17212775-17213175)
chr4 (55-358)||(54364419-54364722)
chr4 (22-358)||(12134566-12134902)
chr4 (22-359)||(17376373-17376711)
chr4 (14-358)||(9651249-9651594)
chr4 (164-358)||(5371655-5371849)
chr4 (154-358)||(14570272-14570476)
chr4 (198-355)||(19082173-19082330)
chr4 (16-151)||(19082032-19082167)
chr4 (227-358)||(12733078-12733209)
chr4 (24-201)||(10238362-10238539)
chr4 (282-358)||(19558348-19558424)
chr4 (247-358)||(49070753-49070864)
chr4 (226-358)||(24237815-24237947)
chr4 (229-358)||(16226295-16226423)
chr4 (231-350)||(19623245-19623364)
chr4 (240-358)||(38763707-38763826)
chr4 (247-344)||(15014429-15014526)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (12-394)||(16375243-16375626)
chr6 (22-387)||(17857348-17857712)
chr6 (22-351)||(23220723-23221053)
chr6 (22-345)||(26505777-26506098)
chr6 (55-305)||(4172555-4172805)
chr6 (129-305)||(4228238-4228414)
chr6 (12-357)||(26523127-26523470)
chr6 (285-412)||(31162090-31162217)
chr6 (249-358)||(17084398-17084508)
chr6 (187-259)||(18104642-18104714)
chr6 (226-347)||(22463243-22463365)
chr6 (226-298)||(10445428-10445500)
chr6 (226-345)||(22594452-22594571)
chr6 (227-331)||(29161467-29161571)
chr6 (226-341)||(11373880-11373995)
chr6 (226-331)||(34965865-34965970)
chr6 (257-342)||(19853122-19853206)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (13-403)||(428-818)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (22-387)||(3193001-3193366)
chr7 (23-358)||(39292599-39292934)
chr7 (54-358)||(15978951-15979255)
chr7 (26-358)||(28719471-28719801)
chr7 (23-358)||(21675773-21676108)
chr7 (22-358)||(8564440-8564776)
chr7 (26-358)||(44306042-44306374)
chr7 (22-305)||(17985790-17986074)
chr7 (34-358)||(21539064-21539389)
chr7 (22-264)||(46473032-46473274)
chr7 (49-393)||(19066470-19066815)
chr7 (56-358)||(16382564-16382864)
chr7 (123-345)||(18080638-18080859)
chr7 (49-358)||(16369282-16369591)
chr7 (58-358)||(12182957-12183254)
chr7 (269-358)||(13617749-13617838)
chr7 (282-358)||(4483744-4483820)
chr7 (227-358)||(14939704-14939836)
chr7 (227-358)||(15367297-15367429)
chr7 (226-298)||(36301409-36301481)
chr7 (226-298)||(38294814-38294886)
chr7 (226-295)||(33556819-33556888)
chr7 (270-318)||(14276123-14276171)
chr7 (247-331)||(9322193-9322277)
chr7 (226-344)||(20584011-20584128)
chr7 (226-316)||(13350982-13351072)
chr7 (296-348)||(31500149-31500201)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (22-331)||(76876-77185)
chr1 (162-358)||(20822004-20822200)
chr1 (247-358)||(33396316-33396428)
chr1 (227-358)||(40437406-40437537)
chr1 (189-358)||(21224200-21224368)
chr1 (226-298)||(34392210-34392282)
chr1 (22-152)||(9785041-9785170)
chr1 (227-358)||(52400233-52400365)
chr1 (226-331)||(20193050-20193155)
chr1 (247-344)||(8539111-8539208)
chr1 (247-344)||(8604350-8604447)
chr1 (285-358)||(49998509-49998583)
chr1 (286-358)||(46144701-46144774)
chr1 (247-322)||(21194098-21194174)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (23-358)||(4941-5274)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (22-358)||(14342581-14342917)
chr5 (23-358)||(21108525-21108860)
chr5 (54-358)||(24226431-24226736)
chr5 (164-358)||(20455061-20455247)
chr5 (226-358)||(11964966-11965098)
chr5 (187-358)||(33627485-33627655)
chr5 (269-358)||(23414149-23414238)
chr5 (270-350)||(19872798-19872878)
chr5 (54-171)||(33150254-33150371)
chr5 (52-165)||(20313661-20313774)
chr5 (240-347)||(26560940-26561048)
chr5 (230-345)||(16836447-16836561)
chr5 (283-358)||(20833185-20833259)
chr5 (240-347)||(5622581-5622689)
chr5 (226-274)||(11764618-11764666)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (87-358)||(22331734-22332006)
chr2 (22-358)||(43641732-43642068)
chr2 (19-348)||(19434389-19434718)
chr2 (22-358)||(24840816-24841151)
chr2 (35-343)||(29113238-29113546)
chr2 (22-351)||(20272382-20272701)
chr2 (187-358)||(45618416-45618587)
chr2 (188-358)||(24561851-24562021)
chr2 (12-358)||(23166793-23167140)
chr2 (12-358)||(23578050-23578397)
chr2 (226-358)||(18534843-18534975)
chr2 (227-358)||(6093849-6093980)
chr2 (27-164)||(7320550-7320687)
chr2 (226-298)||(23799536-23799608)
chr2 (233-331)||(25133135-25133234)
chr2 (247-322)||(24276828-24276904)
chr2 (247-322)||(22787186-22787262)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (54-358)||(11543530-11543833)
chr8 (13-358)||(18118853-18119192)
chr8 (26-358)||(20176803-20177135)
chr8 (26-358)||(20221530-20221862)
chr8 (23-358)||(22312685-22313018)
chr8 (57-358)||(19332465-19332767)
chr8 (23-358)||(25294985-25295320)
chr8 (182-358)||(3845120-3845296)
chr8 (23-358)||(25757005-25757340)
chr8 (23-358)||(45560033-45560368)
chr8 (22-318)||(17500983-17501279)
chr8 (155-403)||(24906769-24907015)
chr8 (226-331)||(22498407-22498512)
chr8 (227-358)||(7469179-7469311)
chr8 (226-328)||(22886812-22886914)
chr8 (226-358)||(24238610-24238742)
chr8 (227-358)||(38636798-38636930)
chr8 (226-322)||(18042650-18042747)
chr8 (309-358)||(25609062-25609111)
chr8 (54-171)||(34012912-34013029)
chr8 (257-331)||(33171213-33171287)
chr8 (285-331)||(16001046-16001092)
chr8 (282-331)||(25609178-25609228)
chr8 (283-344)||(37654832-37654892)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (22-358)||(9827-10165)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (22-358)||(8603637-8603975)
chr3 (57-358)||(40040076-40040377)
chr3 (22-358)||(37917292-37917628)
chr3 (22-359)||(17759257-17759594)
chr3 (22-359)||(19060577-19060914)
chr3 (100-358)||(25104969-25105225)
chr3 (12-358)||(14969843-14970187)
chr3 (224-358)||(11401591-11401725)
chr3 (227-358)||(38376831-38376962)
chr3 (282-358)||(5229188-5229264)
chr3 (182-344)||(17392372-17392534)
chr3 (226-325)||(14181133-14181232)
chr3 (22-200)||(18738909-18739085)
chr3 (27-204)||(15549573-15549750)
chr3 (226-298)||(12918084-12918156)
chr3 (247-350)||(11516638-11516741)
chr3 (226-298)||(45804098-45804170)
chr3 (285-358)||(43428727-43428801)
chr3 (281-344)||(41660533-41660595)
chr3 (285-342)||(18969037-18969095)
chr3 (247-344)||(33370012-33370109)
chr3 (250-328)||(17319733-17319812)
chr3 (289-350)||(10903312-10903373)
chr3 (240-347)||(21167868-21167976)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (130-359)||(8152-8381)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (22-358)||(11598-11932)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (54-358)||(13813-14117)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (156-358)||(14799-15001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (23-343)||(76006-76324)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (130-319)||(837-1025)
[»] scaffold0090 (5 HSPs)
scaffold0090 (187-351)||(35789-35952)
scaffold0090 (22-264)||(4191-4433)
scaffold0090 (282-358)||(1338-1414)
scaffold0090 (282-358)||(5718-5794)
scaffold0090 (215-264)||(1-50)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (54-242)||(1089-1277)
scaffold1204 (282-358)||(1297-1373)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (191-357)||(255380-255546)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (220-358)||(2118-2255)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (12-178)||(7149-7315)
scaffold0205 (127-166)||(7115-7154)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (22-295)||(11925-12198)
scaffold0468 (314-350)||(12200-12235)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (56-301)||(8390-8634)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (230-358)||(4871-4999)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (154-358)||(246900-247104)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (201-357)||(21081-21236)
scaffold0174 (23-164)||(20941-21081)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (187-358)||(39117-39289)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (65-357)||(9060-9350)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (121-244)||(118547-118670)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (249-358)||(44739-44848)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (226-358)||(34570-34702)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (282-343)||(807-868)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (227-320)||(6694-6787)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (257-322)||(3637-3702)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (279-345)||(3996-4061)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (283-344)||(84499-84559)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Original strand, 17212775 - 17213175
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatag 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17212775 agagacgaactttgtgattttcatgattttgtcgtatttagccggtgaaacgtacatgcatactcaagtgcacttatatgcgatctaagtgtatgcatag 17212874  T
Q  112 ttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaag 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17212875 ttgaggcattggaatttgtttaattggttttgtttcaattgcttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacaaactttgtcaaaaataatctttaag 17212974  T
Q  212 accaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgt 311  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17212975 atcaaatatttgacaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaaatgtgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgt 17213074  T
Q  312 tgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgatgtgatgat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17213075 tgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgtgacgttggttgatagttgtgataatgaatatgttgataatgatgtggtgat 17213174  T
Q  412 g 412  Q
    |    
T  17213175 g 17213175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 54364419 - 54364722
Alignment:
Q  55 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 154  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  54364419 ggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatacgcatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtc 54364518  T
Q  155 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54364519 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaggcccaaatacttggaaaatcttttgtagatagtttgatatgatt 54364618  T
Q  255 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagt 354  Q
    ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  54364619 atacgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgt 54364718  T
Q  355 tgtt 358  Q
    ||||    
T  54364719 tgtt 54364722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 12134566 - 12134902
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||||||  ||| |||||||||||   |    
T  12134566 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgatacgcacatgtatattcaactatactcatatgtgatctaagcttatacatagttgaggtcct 12134665  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12134666 agagtttatttacttgattttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatttgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaacaccaaatact 12134765  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12134766 tggcaaatcttttgtgtatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggttttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttct 12134865  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  12134866 cttttacttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 12134902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 17376373 - 17376711
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| | ||| ||| ||| || || | ||| | ||||||||||||| |||||| ||| |  |    
T  17376373 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcaaatgtatattcatctacactcataagtgatctaagtgtatacatagtcgagaccct 17376472  T
Q  122 agaatttgttt-acttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 220  Q
    ||| ||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||| | |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  17376473 agagtttattttacttggctttggtccaattgtttccattattttaaagttgtgaaataagagatgaactttgttgaaaagaatctttaagaccaaatac 17376572  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17376573 ttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattgtatgaagatatgtgaatgctttctaagtgttgaatatgatgtttatcatagtgtgttgtattttc 17376672  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  17376673 tcctttacttgaattgtgagaaattatatggggttgtta 17376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9651594 - 9651249
Alignment:
Q  14 agacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagtt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9651594 agacgaactttgtgatttttatgatttcgtcgtatttggccggtgaagcgcacatctatactcaactgcacttatatgtgatctaagtgtatacatagtt 9651495  T
Q  114 gaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagac 213  Q
     || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||     ||||  ||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||    
T  9651494 aagacattagaatttgtttgcttagttttgattcaattttcataattgattttaagttgtgaaacgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttgaaac 9651395  T
Q  214 caaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttg 313  Q
      ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  9651394 tgaatattttgcaaaccatttgtgaatagtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggtgttgaacatgatgtttatcatgatgtgatg 9651295  T
Q  314 ta-ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    || |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9651294 tacttttctcctttgttttgattgtgagaaattatatgaagttgtt 9651249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 358
Target Start/End: Original strand, 5371655 - 5371849
Alignment:
Q  164 ttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 263  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5371655 ttaaagttgtaaaataagagacatactttgtcgaaaataatctttaagagtaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 5371754  T
Q  264 tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5371755 tatgtgaatgttttctatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttgcctgaattgtgagaaactgtatggagttgtt 5371849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14570476 - 14570272
Alignment:
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||||    
T  14570476 ttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgat 14570377  T
Q  254 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 353  Q
    || || ||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |    
T  14570376 tacataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatg 14570277  T
Q  354 ttgtt 358  Q
    |||||    
T  14570276 ttgtt 14570272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 355
Target Start/End: Original strand, 19082173 - 19082330
Alignment:
Q  198 aaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgt 297  Q
    |||| ||||||||| |  |||| || |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19082173 aaatgatctttaaggctgaatactttgcaaatattttgtgaatagctttatatgattatattaagatgtatgaaggattgataggtgttgaatatgatgt 19082272  T
Q  298 ttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 355  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19082273 ttatcttagcgtgatatattttctcctttacttgaattgtaagaaattgcatgaagtt 19082330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Original strand, 19082032 - 19082167
Alignment:
Q  16 acgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttga 115  Q
    ||||| |||||||| || |||||||  | |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  19082032 acgaactttgtgatctttatgatttcattgtatttggccggtgaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgaactaagtgtatacatagttga 19082131  T
Q  116 ggcattagaatttgtttacttggttttggttcaatt 151  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19082132 ggcactagaatttgtttacttagttttggttcaatt 19082167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12733209 - 12733078
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 326  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||| | |||||||| || |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12733209 aatctttcgtgaatagctttatatgatcaaatgaagatatgtgaataattgttacgtgttgaacatgatgtttatcataaggtgttgtattttctccttt 12733110  T
Q  327 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  12733109 acttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgtt 12733078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 10238362 - 10238539
Alignment:
Q  24 tgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattag 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||    
T  10238362 tgtgattttgatgattttgtcgtagtaggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctag 10238461  T
Q  124 aatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaat 201  Q
    | ||| |||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| |||||    
T  10238462 agtttatttacttggtgttagttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagttgaactttgtcaaaaat 10238539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19558424 - 19558348
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19558424 gtgttggatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgtt 19558348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49070864 - 49070753
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattg 346  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  49070864 atatgattaaatgaagatatgtgagtgattgttaggtgttgaatatgatatttatgataaggtgttgtattctctcctttacttggattgtgagaaagta 49070765  T
Q  347 tatgaagttgtt 358  Q
    |||| |||||||    
T  49070764 tatggagttgtt 49070753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24237947 - 24237815
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  24237947 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgttaatgatttttaggtgttgaatatgatatttatcataaggttttgtattttctcctt 24237848  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||    
T  24237847 tacttggattataagaacgtgtatggagttgtt 24237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 358
Target Start/End: Original strand, 16226295 - 16226423
Alignment:
Q  229 tcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttac 328  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||| ||||   | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  16226295 tctttcgtgaatagctttatatgattaaatgatgatgtgtgaatttcttctaggtgttgaatatgaaatttatcataatgtgttgtattttct-cgttac 16226393  T
Q  329 ttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16226394 ttggattgtgaggaattgtatggagttgtt 16226423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 19623245 - 19623364
Alignment:
Q  231 ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt 330  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||||||| ||||||||    
T  19623245 ttttgtgaatagctttgtatgattacataaagatgtatgaatgattgctaggtgtcgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttactt 19623344  T
Q  331 gaattgtgagaaattgtatg 350  Q
      |||||||||| |||||||    
T  19623345 tgattgtgagaagttgtatg 19623364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38763826 - 38763707
Alignment:
Q  240 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 338  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| || || | ||||  |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  38763826 tagtttgatacgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttaaatatgatatttatcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatg 38763727  T
Q  339 agaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | || |||||||||||||||    
T  38763726 aaaagttgtatgaagttgtt 38763707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Original strand, 15014429 - 15014526
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  15014429 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 15014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16375626 - 16375243
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatag 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16375626 agagacgaactttgtgattttcatgattttgtcatatttagccggtgaaacgtagatgcatactcaactccacttatatgtgatctaagtgtatgcaaag 16375527  T
Q  112 ttgaggcattagaatttgtttacttggtttt-ggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16375526 ttgaggcattagaatttctttgcttggtttttggttcaattgcttcaattattttaaagttgttaaatgatagacgaactttgtcgaaaataatctttaa 16375427  T
Q  211 gaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtg 310  Q
    |||| |||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  16375426 gacctaatacttgaaaaatattttggggatagtttgatatgattatatgaagatgtgtgaatgatttctaggtgtggaatatgatgtttatcatagtgtg 16375327  T
Q  311 ttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16375326 ttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgtgatgttggttgatagttgtgataatgattatgtt 16375243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 387
Target Start/End: Original strand, 17857348 - 17857712
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |  | | |||||||  ||||| ||| |||||  || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  17857348 tttgtggtttttatgattttgtcgtagtcggccagtgaaactgacatgtatattcaaccacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccct 17857447  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17857448 agagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 17857547  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17857548 tggcaaatcttttttggatagtttgatatgattatatgaagatatgttaatgatagctaggtgttgaacatgatatttatcataatgtgttgtattttct 17857647  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatga 387  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||    
T  17857648 tctttacttgaattgtgagaacttgtatgga-ttgttatgattttgattgataattgtgataatga 17857712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23221053 - 23220723
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||| | ||| |||||| ||| |  |    
T  23221053 tttgtgattttgatgattttgtcgtagttggccggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaattttatacatagtcgagaccct 23220954  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23220953 agagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 23220854  T
Q  222 tggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    || |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  23220853 tgccaaatctttttctggataatttgatattattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgtttaatatgatgtttatcataatgtgtttcattttc 23220754  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23220753 tcctttacttgaattgtgagaaattatatga 23220723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26506098 - 26505777
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| ||||| | | |||||| || | ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |    
T  26506098 tttgtgattttgattattttgtcgtagttggccggtgaaacgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacattgtcgaggccct 26505999  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26505998 agagtttatttacttggttttggctca-ttgtctcaattatattaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattact 26505900  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26505899 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatca-aatgtgttgtattttct 26505801  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaatt 345  Q
    | |||||||| || ||||||||||    
T  26505800 catttacttggatcgtgagaaatt 26505777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 305
Target Start/End: Original strand, 4172555 - 4172805
Alignment:
Q  55 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 154  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||| || | ||| | |||||||| |||| || |||||||||| | || || ||||| || |||||||||||||||      
T  4172555 ggtgatacgcacatgtatacttaactacactcataagtgatctaagagtatacaaagttgaggcacttgacttggtttatttagttttggttcaattgtc 4172654  T
Q  155 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 254  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4172655 tcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagattgaatatcttgcaaatcttttgtgaatagtttgacatgatt 4172754  T
Q  255 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 305  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4172755 atatgaagatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcata 4172805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 4228238 - 4228414
Alignment:
Q  129 gtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaa 228  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  4228238 gtttatttagttttggttcaattgtctcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaatatcttgcaaa 4228337  T
Q  229 tcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 305  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4228338 tcttttgtgaatagtttgacatgattatatgaatatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcata 4228414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Original strand, 26523127 - 26523470
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatag 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  26523127 agagacgaactttgtgatttttatgattaagtcgtatttaatcggtgaaaagcacatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatag 26523226  T
Q  112 ttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaag 211  Q
    |||||||| |||||||| |||  || |||| | ||||||||  ||||||  || |||||| | ||| || | || ||| |||||  |||| |||||||||    
T  26523227 ttgaggcagtagaatttatttggttagtttggattcaattgtctcaatt-cttcaaagttgtgaaacgacatacgaac-ttgtcagaaatgatctttaag 26523324  T
Q  212 accaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgatt-gctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtg 310  Q
    ||| | || ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||   ||    
T  26523325 accgagtacttttcaaatcttttgtgtatagcttgatatgattatacgaagatgtgtgaatgattagttaggtgttgaatatgatg-atataatagtatg 26523423  T
Q  311 ttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 357  Q
     |||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26523424 atgtatttctttcgttacttgaattgtgagaaattatatgaaattgt 26523470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 285 - 412
Target Start/End: Original strand, 31162090 - 31162217
Alignment:
Q  285 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  31162090 ttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgtatgaagttgttgtgatgttggttgatagttgtgataa 31162189  T
Q  385 tgaatatgttgataatgatgtgatgatg 412  Q
    ||| |||||| || || ||||| |||||    
T  31162190 tgattatgttaatgataatgtggtgatg 31162217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Original strand, 17084398 - 17084508
Alignment:
Q  249 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtg-ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgt 347  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17084398 atgattatatgaagatatgtgaatgctttttaggtgattgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcatttacttgtattgtgagaaattgt 17084497  T
Q  348 atgaagttgtt 358  Q
    ||| |||||||    
T  17084498 atggagttgtt 17084508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 259
Target Start/End: Original strand, 18104642 - 18104714
Alignment:
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18104642 aactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggcaaatctttcgtggatagtttgatatgattatatg 18104714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 347
Target Start/End: Original strand, 22463243 - 22463365
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcct 324  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22463243 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcct 22463342  T
Q  325 ttacttgaattgtgagaaattgt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22463343 ttacttggattgtgagaaattgt 22463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10445500 - 10445428
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10445500 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctatgtgttgaatatgatgtt 10445428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Original strand, 22594452 - 22594571
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 324  Q
    ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  22594452 aaatcttttatgaatagatttatatgattatatgaagatatttgagtgacttgttaggtgttggatatgatgttcatcataaggtgttgtatttcct-ct 22594550  T
Q  325 ttacttgaattgtgagaaatt 345  Q
    ||||||| | |||| ||||||    
T  22594551 ttacttggaatgtgggaaatt 22594571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 29161467 - 29161571
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 326  Q
    ||||||||||  |||| || || ||| || |||||||| || || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  29161467 aatcttttgtaaatagctttatgtgactaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttctccttt 29161566  T
Q  327 acttg 331  Q
    |||||    
T  29161567 acttg 29161571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Original strand, 11373880 - 11373995
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||  |||||||| || |||||||||||| || ||  ||  || ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  11373880 aaatctttcgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgctaagttttttatgcgaggtttatcctaatgctttgtattttctcctt 11373979  T
Q  326 tacttgaattgtgaga 341  Q
    |||||| |||||||||    
T  11373980 tacttggattgtgaga 11373995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34965970 - 34965865
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 324  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  34965970 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtaaatgaattgttagatgttgaatatgatatttatcataaggtgttttattttct-ct 34965872  T
Q  325 ttacttg 331  Q
    |||||||    
T  34965871 ttacttg 34965865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19853206 - 19853122
Alignment:
Q  257 atgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaa 342  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  19853206 atgaagatgtgtgaatgaattgttaagtgttggatatgatatttatcatagggtgttgtattttctc--ttacttgaaatatgagaa 19853122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 818 - 428
Alignment:
Q  13 gagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagt 112  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||| | | |||||  |||||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  818 gagacaaactttgtgaattttatgattctattgtattgggtcggtgaaacgtacatgtatgctctactccactcatatgtgatctaagtgtatacatagt 719  T
Q  113 tgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaaga 212  Q
    |||||||||  || |||||| ||| |||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  718 tgaggcattgaaacttgtttgcttagttttgattcaattgtctcaattgtttcaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaaga 619  T
Q  213 ccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgtt 312  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||    
T  618 ccaactacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtattaatggtttctagttgtggaatatgatgcttatcataatatgtt 519  T
Q  313 gtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgat 403  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||    
T  518 gtgttttctcctttacttgaattgtgagacattgtatgaagttgttatgatgttggttgatagttgtgatgatgatcatgttaataatgat 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 387
Target Start/End: Original strand, 3193001 - 3193366
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |    
T  3193001 tttgtgattttgataattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcttagtgtatacatagtcgaggccct 3193100  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattatttt-aaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 220  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3193101 agagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattatttttaaagttgtaaaatgtgagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatac 3193200  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  3193201 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtattgaatatgatgtttatcataatttgtcgtattttc 3193300  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatga 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  3193301 tcctttacttgaattgtgagaacttgtatgga-ttgttatgatgttgattgataattgtgataatga 3193366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 39292599 - 39292934
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||   |    
T  39292599 ttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtggtctaagtgtatacatagtcgaggcccca 39292698  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39292699 taatttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatactt 39292798  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39292799 ggcaaattgtttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattctctc 39292898  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  39292899 ctttacgtgtattgtgagaaattgtatggagttgtt 39292934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Original strand, 15978951 - 15979255
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||||| ||||| | | ||| || || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15978951 cggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgt 15979050  T
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 253  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15979051 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacaaactttgtcaaaaataatcgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 15979150  T
Q  254 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 353  Q
    ||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15979151 tatatgaagatatatgaatgatttttaggtgttgaatattatgtttatcctaatgtgatgtattttctactttacttggattgtgagaaattgtatgaag 15979250  T
Q  354 ttgtt 358  Q
    |||||    
T  15979251 ttgtt 15979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28719801 - 28719471
Alignment:
Q  26 tgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||     
T  28719801 tgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcct-agag 28719703  T
Q  126 tttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggc 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  28719702 tttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagatgaactttgtcgaaaataatctt-aagaccaaatacttgga 28719604  T
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28719603 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcttt 28719504  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28719503 tacttgaattttgagaaattgtatggagttgtt 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 21675773 - 21676108
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgatttt-gtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  || | |||||||||| |||||  || |||||| ||   ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |  |    
T  21675773 ttgtgattttgatgatttttgtcgtggttggccggtgaaacgaacatgtgtattcaactacatgcatatgtgatctaagtgtatacatagtagagaccct 21675872  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  21675873 agagtttatttatttggttttgattcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataatctt-aagaccaaatact 21675971  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21675972 tggcaaatcttttgtggatagttttctatgactatatgaatatatgtgaatgctttataggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct 21676071  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21676072 cctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 21676108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 8564440 - 8564776
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||| | ||||| | | |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |    
T  8564440 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaatgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccct 8564539  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  8564540 agagtttattttcttagttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaattttgtcaaaaataatctttaagtccaaatact 8564639  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  8564640 tggaaaatcttatgtggatagtttgctatgattatatgaagatatgtgaatgctttctaagtgctgaatatgatgtttatcattgtgtgttgtatgttct 8564739  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8564740 cctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgtt 8564776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Original strand, 44306042 - 44306374
Alignment:
Q  26 tgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  ||||     
T  44306042 tgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagag 44306141  T
Q  126 tttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggc 225  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  44306142 tttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttgga 44306240  T
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44306241 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctt 44306340  T
Q  326 tacttg-aattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  44306341 tacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgtt 44306374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 17985790 - 17986074
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||   |||| |||||| |||||||||||||||    
T  17985790 tttgtgatttcattgattttgtcgtagttagccggtgaaacgcacatgtatactctactgcactcatatgtagtctaggtgtatacatagttgaggcatt 17985889  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatcttt-aagaccaaatat 220  Q
     ||  |||||| |||||| ||| || | ||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17985890 ggatcttgttttcttggtcttgatttatttgttccaattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatctttaaagaccaaatac 17985989  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17985990 atggcaaatcttttgtggatagtttgatataattatatgaagatatgtgaatgattgctaagtgttgaatatgatgtttatcata 17986074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 358
Target Start/End: Original strand, 21539064 - 21539389
Alignment:
Q  34 atgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgttta 133  Q
    |||||||||||||  | || | |||||| | ||||| ||| |||||| || |  |||| ||||||||| ||| |||||| ||||   |||| ||| ||||    
T  21539064 atgattttgtcgtggtcagccagtgaaatgcacatgtatattcaactacactcttatgtgatctaagtctatacatagtcgaggtcctagagtttattta 21539163  T
Q  134 cttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttt 233  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21539164 cttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgttgaaaataatctttaagacctaatacttggcaaatcttt 21539263  T
Q  234 tgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgat-gtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt-g 331  Q
     |||||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |    
T  21539264 ggtggatagttggttatgtttatatgaagatatgtgaatgattgctagatattgaatatgatattttatcatgatgtgatgtattttctcc-ttacttgg 21539362  T
Q  332 aattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21539363 atttgtgagaaattgtatggagttgtt 21539389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46473274 - 46473032
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||    
T  46473274 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggctggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggcctt 46473175  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  46473174 agagtttatttacttgatttttgttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatact 46473075  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46473074 tagcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 46473032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19066815 - 19066470
Alignment:
Q  49 ttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttca 148  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||   | ||| |||||| ||| || |    
T  19066815 ttagccggtgaaacgcacatgtatactctactgcacttatatgtggtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcgtatttgcttggtcttgattta 19066716  T
Q  149 attgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaag-accaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttga 247  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||| | |||| | ||||||||     
T  19066715 cttgtttcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatatttgaggaccaaatacttg-caaaacctttgagaatagtttgt 19066617  T
Q  248 tatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgt 347  Q
     |||||||| || |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  19066616 gatgattatgtggagatatgtgaatgattgttaggtgctgaacatgaggtttatcataatgtgttgtattttttcttttacttgaattgtgagaaattgc 19066517  T
Q  348 atgaagttgttatgacg-ttggttgatagttgtggtaatgaatatgt 393  Q
    |||| |||||  ||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  19066516 atgatgttgtcgtgatgattggttgataattgtgataatgattatgt 19066470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16382864 - 16382564
Alignment:
Q  56 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttg-gttcaattgct 154  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||||  ||||| |||      
T  16382864 gtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgtttttaagttcatttgtc 16382765  T
Q  155 tcaattattttaaagttctaa----aatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatat 250  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||       |||||| |||||||| | |||    
T  16382764 tcaattattttaaagttgtaattaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattactt-------cttttgcggatagttcgttat 16382672  T
Q  251 gattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 350  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  16382671 gattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggattatgagaaagtatatg 16382572  T
Q  351 aagttgtt 358  Q
     |||||||    
T  16382571 gagttgtt 16382564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 345
Target Start/End: Original strand, 18080638 - 18080859
Alignment:
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18080638 gaatttatttacttggttttgcttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaattgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattactt 18080737  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  18080738 ggaaaatcttttgtggatagctttatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgttaggcattggatatgatgttcatcataacgtattgtattttct- 18080836  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaatt 345  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  18080837 ctttacttggaatgtgggaaatt 18080859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 358
Target Start/End: Original strand, 16369282 - 16369591
Alignment:
Q  49 ttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttca 148  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  ||| ||| |  ||     
T  16369282 ttagttggtgaaacgcacatgtatcctctactgcaattatatgtggtgtaagtgtatgcatagttgaggcatcataccttgtttgtttgatttcgactcc 16369381  T
Q  149 attgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgat 248  Q
     ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16369382 tttgttccaattactttaaagttttaaaatgatagacgaaccttgtcgaaagtaatctttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgat 16369481  T
Q  249 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 348  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |  ||  ||||||||||  ||||||  ||| |||||||| |||    
T  16369482 atgactatatgtagatgtatgaatgatttataggagttgaatatgatgtgtatcatgatatggcgtattttctctcttactttgattatgagaaatggta 16369581  T
Q  349 tgaagttgtt 358  Q
     |||||||||    
T  16369582 ggaagttgtt 16369591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12183254 - 12182957
Alignment:
Q  58 gaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttca 157  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||| |||||||||  ||    
T  12183254 gaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgatctaagagtatacatagttgaggcattatagtttttt--ctcagttttgattcaattgccaca 12183157  T
Q  158 attattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattata 257  Q
    ||| ||| ||||||  |||| ||||||| |||| |||| ||||| | ||||||   | ||||| | | |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  12183156 attgttt-aaagttgaaaaacgatagacgaactctgtcaaaaatgacctttaatgtcgaatatcttgtaaatcttttgagatcagtttgatatgattata 12183058  T
Q  258 tgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 357  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  12183057 tgaagttgtgtgaatgatttatagatgttgaatatgatgtttatcatagtatgatggattttcttcgttacttgaattgtgagatattgtatagagttgt 12182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13617838 - 13617749
Alignment:
Q  269 gaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  13617838 gaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 13617749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4483820 - 4483744
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4483820 gtgttgaatatgatgtttatcataatatgttgtattttcccctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 4483744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14939836 - 14939704
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14939836 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 14939737  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  14939736 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgtt 14939704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15367429 - 15367297
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15367429 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 15367330  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  15367329 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgtt 15367297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Original strand, 36301409 - 36301481
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301409 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 36301481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38294886 - 38294814
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38294886 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 38294814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 295
Target Start/End: Original strand, 33556819 - 33556888
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgat 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  33556819 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaataattgctaggtgttgtatatgat 33556888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Original strand, 14276123 - 14276171
Alignment:
Q  270 aatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14276123 aatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 14276171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Original strand, 9322193 - 9322277
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 331  Q
    |||||| || |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  9322193 atatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttg 9322277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 344
Target Start/End: Original strand, 20584011 - 20584128
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 324  Q
    |||||||| |||  ||| || |||||| || ||||||||  | |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  20584011 aaatctttcgtgactagctttatatgactaaatgaagatacgtgaatgaattgttaagtgttggatatgatgtttatcatagggtgttgtattttctc-- 20584108  T
Q  325 ttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  20584109 ttacttgaaatatgagaaat 20584128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13351072 - 13350982
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtat 316  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| | ||| || || ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13351072 aaatcatttgtgaatagctttatatgattaaaagaatatatgtgaatgattcttaggtattgaatatgatgtttaccataaggtgatgtat 13350982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31500201 - 31500149
Alignment:
Q  296 gtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 348  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  31500201 gtttatcacaaggtgttgtattttctcttttacttggatggtgataaattgta 31500149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 76876 - 77185
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |    
T  76876 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccct 76975  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  76976 agagtttatttacttggttttggctcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 77075  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  77076 tggcaaatcttttgtggatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttct 77175  T
Q  322 cctttacttg 331  Q
    | ||||||||    
T  77176 cttttacttg 77185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20822200 - 20822004
Alignment:
Q  162 ttttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaa 261  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20822200 ttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataatctttaagaccaaatactttgcaaatattttgtggatagtttgttatgattatatgaa 20822101  T
Q  262 gatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||    
T  20822100 gatatgtggatgattgctaggtgttgaatataatgtttatcataatgtgaagtattttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgtt 20822004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33396428 - 33396316
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt-gaattgtgagaaatt 345  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  33396428 atatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcgtaaggtgttgtattttctcatttacttggaattgtgagaaata 33396329  T
Q  346 gtatgaagttgtt 358  Q
     ||||| ||||||    
T  33396328 atatgatgttgtt 33396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Original strand, 40437406 - 40437537
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 326  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| |||||| | || || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  40437406 aatcttttgtgaataactttatatgattaaatgaagttatgtgagtaattgttaggtgttgaacatgatgtttatcataaggtattgtatttcctccttt 40437505  T
Q  327 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  40437506 acttggattgtgagaaattgtgcgaagttgtt 40437537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21224368 - 21224200
Alignment:
Q  189 ctttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttga 288  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||    |||||| ||||||| |||  ||||||| |||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  21224368 ctttgtcgaaagtgatctttaagactgaataccgtgcaaatattttgtgtataacttgatataattacatgaagatatgtgaatgattattgggtgttga 21224269  T
Q  289 atatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||| | |||||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21224268 atatgatgat-atcataatatggtgcgctttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 21224200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34392282 - 34392210
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34392282 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 34392210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Original strand, 9785041 - 9785170
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| ||||| |||||||| | || | ||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |    
T  9785041 tttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggtcggtgaaacgcacatgtatactcaaatacactcatatgtgatctaagtgtatacgtagtcgaggc-ct 9785139  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattg 152  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9785140 agagtttatttacttggttttggttcaattg 9785170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52400365 - 52400233
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  52400365 aatcttttgtgattagttttatatgattgagtgaagatatgtgactaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 52400266  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  52400265 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 52400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20193155 - 20193050
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    ||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||||||| |    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20193155 aaatcttttatgattagctttatatgattaaatgaagatatttagatgattgttaagcgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgcattttctcctt 20193056  T
Q  326 tacttg 331  Q
    ||||||    
T  20193055 tacttg 20193050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Original strand, 8539111 - 8539208
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  8539111 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 8539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Original strand, 8604350 - 8604447
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  8604350 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 8604447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 358
Target Start/End: Original strand, 49998509 - 49998583
Alignment:
Q  285 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  49998509 ttgaatatgatatttaacataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgtt 49998583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 46144774 - 46144701
Alignment:
Q  286 tgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc-tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  46144774 tgaatatgatatttatcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 46144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21194174 - 21194098
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21194174 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgatatatgttggatatgatatttatcataaagtgttgtattttctc 21194098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 4941 - 5274
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  || | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||  ||    
T  4941 ttgtgattttgatgattttgtcatggttggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatatatagtcgaggcccta 5040  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
    || ||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5041 gagtttatttacttgattttggttcatttgtctcaattattttaaagttttaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatactt 5140  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5141 gacaaatcttttgtggatagtttg--ttgattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaataagatgtttatcataatgtgttgtattttctc 5238  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5239 cattaattgaattgtgagaaatggtatgaagttgtt 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 14342581 - 14342917
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||| | || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  |    
T  14342581 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaattacactcatatgtgatataagtgtatccatagtcgaggccct 14342680  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342681 agagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagatacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 14342780  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14342781 tggcaaatcttgtgtggatagtttgatgtgattaaatgaagatatgtgggtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct 14342880  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14342881 ccattaattgaattgtgagaaatggtatggagttgtt 14342917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21108860 - 21108525
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||  ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| || ||  ||    
T  21108860 ttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaagcccta 21108761  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21108760 gagtttatttacttggtattggttcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatactt 21108661  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21108660 gtcaaatcttttgcggatagttcgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttaccataaggtgttgtattttctc 21108561  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  21108560 ctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 21108525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Original strand, 24226431 - 24226736
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  24226431 cggtgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgt 24226530  T
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtgga-tagtttgatatga 252  Q
     |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  24226531 ctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatctattatagattagtttgatatga 24226630  T
Q  253 ttatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 352  Q
    |||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24226631 ttatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttttactttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgga 24226730  T
Q  353 gttgtt 358  Q
    ||||||    
T  24226731 gttgtt 24226736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 358
Target Start/End: Original strand, 20455061 - 20455247
Alignment:
Q  164 ttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 263  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  20455061 ttaaagttgtaaaataagagacaaattttgtcgaaaataatctttaagagcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga--------aga 20455152  T
Q  264 tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20455153 tatgtgaatgttttctaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgtt 20455247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11965098 - 11964966
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11965098 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctt 11964999  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964998 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 11964966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Original strand, 33627485 - 33627655
Alignment:
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    ||| |||||    
T  33627485 aactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttagcaaattttttgtggataatttgttatgattatatggagatatgtgaatgccctctaagtgtt 33627584  T
Q  287 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  33627585 gaatatg-tgtttatcatagtgtgttgtattttctcctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgtt 33627655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23414238 - 23414149
Alignment:
Q  269 gaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  23414238 gaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 23414149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19872878 - 19872798
Alignment:
Q  270 aatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 350  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  19872878 aatgattgttaagtgtggaatatgatgtttatcataaggtgtgatattttctcctttacttggaatgtgggaaatcgtatg 19872798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 171
Target Start/End: Original strand, 33150254 - 33150371
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  || | ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  33150254 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatacttggttttggttcatttgt 33150353  T
Q  154 ttcaattattttaaagtt 171  Q
     |||||||||||| ||||    
T  33150354 ctcaattattttagagtt 33150371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20313774 - 20313661
Alignment:
Q  52 gtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaatt 151  Q
    ||||||||| || ||||| ||  |||||| || | ||||  ||||||||||| | |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20313774 gtcggtgaagcgcacatgtatgttcaactacactcatatctgatctaagtgtttacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 20313675  T
Q  152 gcttcaattatttt 165  Q
    |  |||||||||||    
T  20313674 gtctcaattatttt 20313661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 347
Target Start/End: Original strand, 26560940 - 26561048
Alignment:
Q  240 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 338  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  26560940 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtg 26561039  T
Q  339 agaaattgt 347  Q
    | |||||||    
T  26561040 acaaattgt 26561048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 345
Target Start/End: Original strand, 16836447 - 16836561
Alignment:
Q  230 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 329  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16836447 cttttgtgaatagctttgtatgattaaataaagatatgttaatgattgttaggcattggatatgatgttcatcataaggtgttgtatttcct-ctttact 16836545  T
Q  330 tgaattgtgagaaatt 345  Q
    || | |||| ||||||    
T  16836546 tggaatgtgggaaatt 16836561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 358
Target Start/End: Original strand, 20833185 - 20833259
Alignment:
Q  283 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  20833185 tgttggatatgatatttatcataagatgatgtattttct-ctttacttgtattgtgagaaataatatggagttgtt 20833259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 347
Target Start/End: Original strand, 5622581 - 5622689
Alignment:
Q  240 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 338  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  5622581 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtg 5622680  T
Q  339 agaaattgt 347  Q
    | |||||||    
T  5622681 acaaattgt 5622689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 11764618 - 11764666
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga 274  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  11764618 aaatcttttgtgtatagcttgatatgaatatatgaaggtgtgagaatga 11764666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 87 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22332006 - 22331734
Alignment:
Q  87 atatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagaca 186  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||     
T  22332006 atatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattatgttaaagttgtaatatgagagacg 22331907  T
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtg-t 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |    
T  22331906 aactttgtcaaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctaggtgat 22331807  T
Q  286 tgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22331806 tgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatcttctcctttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgtt 22331734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43642068 - 43641732
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||| || || |||||| |||||  |    
T  43642068 tttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaattggatacatagtcgaggccct 43641969  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43641968 agagtttatatacttggtttttgttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 43641869  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43641868 tggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct 43641769  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43641768 cctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 43641732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 348
Target Start/End: Original strand, 19434389 - 19434718
Alignment:
Q  19 aagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggc 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |  | | |||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19434389 aagtttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccagtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatgcatagtcgaggc 19434488  T
Q  119 attagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaat 218  Q
      |||| ||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19434489 cctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaat 19434588  T
Q  219 atttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattt 318  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||   |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19434589 aattggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatatgttgaatatgatgtttatcataatgtattgtattt 19434688  T
Q  319 tctcctttacttgaattgtgagaaattgta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19434689 tctcctttacttgaattgtgagaaattgta 19434718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24841151 - 24840816
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||| | |||||||||||||  ||||| |||||  |    
T  24841151 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatacgtgatctaagtgtataaatagtcgaggccct 24841052  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24841051 agagtttatttaattggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttctaaaatgagaaacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 24840952  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || | ||  || |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24840951 tggcaaatcttttgtggatagttttctattattatatgaatatatgtgcatcctttctaggtttttaatatgatttttatcataatgtgttgtattttct 24840852  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  24840851 cc-tcacttgaattgtgagaaataatatgatgttgtt 24840816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29113546 - 29113238
Alignment:
Q  35 tgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttac 134  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |   ||| ||| |||||    
T  29113546 tgattttgtcgtagtcggccgttgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagttgagccccaagagtttatttac 29113447  T
Q  135 ttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatctttt 234  Q
    |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29113446 ttggttttggttcatttgtctcaactattttaaagttgtaaaatgagagacaaaccttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggcaaatctttt 29113347  T
Q  235 gtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaat 334  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  29113346 gtgaatagtttgttatgattatatgaagatatgtggatgattgctaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttctcctttatttggat 29113247  T
Q  335 tgtgagaaa 343  Q
    |||||||||    
T  29113246 tgtgagaaa 29113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20272701 - 20272382
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtc-ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcat 120  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20272701 tttgtgattttattgattttgtcgtagttagcccggtgaaacgtacatgtatactcaacttcactcatatgaggtctaggtgtatacatagttgaggcat 20272602  T
Q  121 tagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 220  Q
    | ||| || |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20272601 tggaacttttttatttggttttgatttaattgtttcaattattttaaagttgtaaaataagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagactaaataa 20272502  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatg-attgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 319  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||            |||| ||||||||||||    
T  20272501 ttgacaaatctcttgtggatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgaatttttaggtgttgaat------------ataatgtgttgtatttt 20272414  T
Q  320 ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 351  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20272413 ctcctttacttggattgtgagaaattgtatga 20272382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45618587 - 45618416
Alignment:
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||    
T  45618587 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggtaaatcttttgtggataatttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctacgtgtt 45618488  T
Q  287 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45618487 gaatatgatttttatcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 45618416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 188 - 358
Target Start/End: Original strand, 24561851 - 24562021
Alignment:
Q  188 actttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  24561851 actttgtcgaaaataatctttaggaccaaatacttagaaaatcttttgtagattgtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgttagatgttg 24561950  T
Q  288 aatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  24561951 aatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 24562021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 23166793 - 23167140
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttc-atgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcata 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||| |||||||||    
T  23166793 agagacgaactttgtgattttttatgatttcgtcgtatttagcaggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcata 23166892  T
Q  111 gttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |  || |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  23166893 gttgaggcattagaatttgtttgcttagttttgattcaattgcgaccgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaa 23166992  T
Q  211 gaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtg 310  Q
    | || ||||  | || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |  || | |||||||||| |||||||||||   ||    
T  23166993 ggccgaataccttgcgaaccttttgtgaacagtttgatatgattatatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatg 23167092  T
Q  311 ttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
     || |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23167093 atgcacattctcctttacttgaattatgagaaatggtatgaagttgtt 23167140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 23578050 - 23578397
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttc-atgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcata 110  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||| |||||||||    
T  23578050 agagacgaactttgtgattttttatgatttcgtcgtatttagcaggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcata 23578149  T
Q  111 gttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |  || |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  23578150 gttgaggcattagaatttgtttgcttagttttgattcaattgcgaccgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaa 23578249  T
Q  211 gaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtg 310  Q
    | || ||||  | || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |  || | |||||||||| |||||||||||   ||    
T  23578250 ggccgaataccttgcgaaccttttgtgaacagtttgatatgattatatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatg 23578349  T
Q  311 ttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
     || |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23578350 atgcacattctcctttacttgaattatgagaaatggtatgaagttgtt 23578397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18534975 - 18534843
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18534975 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgttttacatgtgttgaatatgatgattatcataatgtgttgtattttctcctt 18534876  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18534875 tacttgaattgtgagaaattatatggagttgtt 18534843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6093980 - 6093849
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 326  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  6093980 aatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataatgcgaagtattttctccttt 6093881  T
Q  327 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  6093880 acttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 6093849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7320687 - 7320550
Alignment:
Q  27 gattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaat 126  Q
    |||||| ||||| |||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| |    
T  7320687 gattttgatgatgttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagt 7320588  T
Q  127 ttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattt 164  Q
    || | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7320587 ttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattt 7320550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23799608 - 23799536
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799608 aaatattttgtggataatttgatatgattatatggggatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 23799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25133234 - 25133135
Alignment:
Q  233 ttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttg 331  Q
    ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||| || | | || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  25133234 ttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatgtgtgagtaaatgttaagtgttgaatgtgatgtttatcacaaggtgttgtattttcctcctttacttg 25133135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24276904 - 24276828
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  24276904 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaatttttaggtgttggatatgatatttatcatagggtgttgtattttctc 24276828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 22787186 - 22787262
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22787186 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctc 22787262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11543833 - 11543530
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||     
T  11543833 cggtgaaaagcacatgtatattcaactacattcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagaatttaattacttggttttggttcatttgt 11543734  T
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 253  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11543733 ctcaattattttaaagttgtaaattgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgtcaaatcttttgaggatagtttgttatgat 11543634  T
Q  254 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 353  Q
    || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11543633 taaatgaaggtatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatggag 11543535  T
Q  354 ttgtt 358  Q
    |||||    
T  11543534 ttgtt 11543530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 18118853 - 18119192
Alignment:
Q  13 gagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagt 112  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| | | |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| || | || || | |||| |||||| ||||||    
T  18118853 gagacgaacttggtgaattttatgattctattgtatttagccggtgaaacgcacatgtatactctactacactcatgtgtggtctaggtgtatacatagt 18118952  T
Q  113 tgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaaga 212  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||| ||  || | ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||      |||||    
T  18118953 tgaggcattggatcttggttacttggtcttaatttatttgtttcaattattttaaaattgtaaagtgagagacgaactttgtcgaaaat------taaga 18119046  T
Q  213 ccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgtt 312  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  18119047 tcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgtttgctaggtgttgaatatgatgtttatcatagcatggt 18119146  T
Q  313 gtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18119147 agattttctcctttacttgaattttgagaaattgtatgaagttgtt 18119192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Original strand, 20176803 - 20177135
Alignment:
Q  26 tgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  ||||     
T  20176803 tgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagag 20176902  T
Q  126 tttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggc 225  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  20176903 tttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttgga 20177001  T
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20177002 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctt 20177101  T
Q  326 tacttg-aattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  20177102 tacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgtt 20177135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Original strand, 20221530 - 20221862
Alignment:
Q  26 tgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  ||||     
T  20221530 tgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagag 20221629  T
Q  126 tttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggc 225  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  20221630 tttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttgga 20221728  T
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20221729 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctt 20221828  T
Q  326 tacttg-aattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  20221829 tacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgtt 20221862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22313018 - 22312685
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | | |||||||| ||||  ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  22313018 ttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggcccgtgaaacgcacatctatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 22312919  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
    || ||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22312918 gagtttatctacttggttttggttct-ttgtatcaattattttaaagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatttttaagacgaaatactt 22312820  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  22312819 ggcaaatcttttgtgaatagtttgttatgatgaaatgaaggtatgtgaatggttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctc 22312720  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22312719 c-tcacttgaattgtgagaaatagtatggagttgtt 22312685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 358
Target Start/End: Original strand, 19332465 - 19332767
Alignment:
Q  57 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 156  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  19332465 tgaaacgcacatgtataatcaattacacttatatgtggtctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctc 19332564  T
Q  157 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgatta 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19332565 aattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatttttaagaccaattgcttagcaaatctttttgtggatagtttgatatgatta 19332664  T
Q  256 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 355  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||| ||||    
T  19332665 tatgaagatatgtggatgatttctaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttcttctttacttggattgtgaggaagtatatggagtt 19332764  T
Q  356 gtt 358  Q
    |||    
T  19332765 gtt 19332767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25295320 - 25294985
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  25295320 ttgtgattttgatgattttgtcgtggtcagtcggtgaaacgcacatgtataatcaactacactcctatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 25295221  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatt 221  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||  |||| ||      
T  25295220 gagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattctaa-gttgtgtaatgagagacgaactttgtcgaaaatggttctttaaagccaattacc 25295122  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |   |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25295121 ttataaatattttgtggatatctttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct 25295022  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25295021 cctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgtt 25294985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 358
Target Start/End: Original strand, 3845120 - 3845296
Alignment:
Q  182 agacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctag 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||    
T  3845120 agacgaactttgtcgaaaataatctgtaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatataaagatatgtaaatgatttcaag 3845219  T
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3845220 gctttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgtt 3845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25757340 - 25757005
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||| || || | | |||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  25757340 ttgtgattttgatgattttgtcgcggtcggtcggtgaaacgcacgtgtacattcaactacactcctatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 25757241  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatt 221  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |  ||||| ||||  ||||||||||||||  | ||||||  |||| ||      
T  25757240 gagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattctaa-gttgtgtaatgagagacgtactttgtcgaaaatggttctttaaagccaattacc 25757142  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |   |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25757141 ttataaatattttgtggatatctttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct 25757042  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25757041 cctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgtt 25757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 45560033 - 45560368
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  45560033 ttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 45560132  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatt 221  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||| ||| |  ||  | ||||  ||||||||||||||  | ||||||  |||| ||      
T  45560133 gagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattgttctaa-gttgtgtaagtagagacggactttgtcgaaaatggttctttaaagccaattacc 45560231  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    |   ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45560232 ttataaatcttttgtggatatcattatatgattatatgaagatatgtgaacgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttct 45560331  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45560332 cctttacttggattgtgagaagttgtatggagttgtt 45560368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17501279 - 17500983
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | || |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  17501279 tttgtgatttcgatgatgttgtcgtagtcagccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcact 17501180  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctt--taagaccaaata 219  Q
    ||| ||| | |||||||  ||||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  17501179 agagtttatatacttgg-attggttcatctgtctcaattattttagagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatttttgtaagaccaatta 17501081  T
Q  220 tttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattt 318  Q
      |    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17501080 cct-tataatcttttgtggatagctttatatgattaaatgaaattatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 17500983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24907015 - 24906769
Alignment:
Q  155 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 254  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||| | ||  |   |||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  24907015 tcaattaatttaaagttgcaaaatgagagacgaatcttgtcgaaaataatctctaagaccgattaccttataaatcttttgtgaatagccttatatgatt 24906916  T
Q  255 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagt 354  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  24906915 atatgaagatatgtgaatgatctctatgtgatgaacatgatgtttatcatagtgcgttgtattccctcctttacttgaattgtgagtaattgaat--aat 24906818  T
Q  355 tgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgat 403  Q
     || ||||| |||||||||| ||||| | || |  ||||||||||||||    
T  24906817 cgtgatgacattggttgatacttgtgatcataatcatgttgataatgat 24906769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Original strand, 22498407 - 22498512
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  22498407 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcacaaggtgttgtattttctccta 22498506  T
Q  326 tacttg 331  Q
    ||||||    
T  22498507 tacttg 22498512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7469311 - 7469179
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 325  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7469311 aatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgcgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcctt 7469212  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7469211 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 7469179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22886914 - 22886812
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| || |||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22886914 aaatcttttgtgaatagctttatatgactaaatgaagctatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatcttctcctt 22886815  T
Q  326 tac 328  Q
    |||    
T  22886814 tac 22886812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24238742 - 24238610
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||  | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  24238742 aaatctttcgtgaatagatttatatgattaaatgaagataagtgaatgattcttcggtgttgaatacgaggtttatcgtaacgtgttgtatttacttctt 24238643  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24238642 tacttggattatgagaaagtatatgaagttgtt 24238610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Original strand, 38636798 - 38636930
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 325  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38636798 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtattgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 38636897  T
Q  326 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||  ||| |||||| || ||||||||||||    
T  38636898 tacttatattatgagaagttatatgaagttgtt 38636930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 322
Target Start/End: Original strand, 18042650 - 18042747
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18042650 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 18042747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25609111 - 25609062
Alignment:
Q  309 tgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  25609111 tgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 25609062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 171
Target Start/End: Original strand, 34012912 - 34013029
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  || | ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  34012912 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatacttggttttggttcatttgt 34013011  T
Q  154 ttcaattattttaaagtt 171  Q
     |||||||||||| ||||    
T  34013012 ctcaattattttagagtt 34013029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33171287 - 33171213
Alignment:
Q  257 atgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 331  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  33171287 atgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttg 33171213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16001092 - 16001046
Alignment:
Q  285 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16001092 ttgaatatgatgtttatcatagggtgttgtattttctccttcacttg 16001046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25609228 - 25609178
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  25609228 gtgttgaatatgatgtttatcataaggcgttgtattttcctcctttacttg 25609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 344
Target Start/End: Original strand, 37654832 - 37654892
Alignment:
Q  283 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  37654832 tgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 37654892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10165 - 9827
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtc-ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcat 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||| ||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| | |||| |||||      
T  10165 tttgtgattttgatgattttgtcgtggtc-gtctggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacgtagtcgaggccc 10067  T
Q  121 tagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10066 tagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgttgaaaataatctttaagaccaaatac 9967  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga-tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 319  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  9966 ttggctaatcttttgttgatagtttgatatgattatatgaagattatgtgaattctttctaggtgttgaatatgatgtttaccataatatgttgtatttt 9867  T
Q  320 ctcctttacttgaattgtgag-aaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9866 ctcttttacttgaattgtgagaaaattgtatggagttgtt 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8603975 - 8603637
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||||||||  |||||||||| || || | |||||||||  || |  |||  |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  8603975 tttgtgattttgttgattttgtcatagttggccggtgaaacacacgtatatatgcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccct 8603876  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaa-taatctttaagaccaaatat 220  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |      
T  8603875 agagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaaataatttttaaggccaattgc 8603776  T
Q  221 ttggcaaatctttt-gtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 319  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8603775 tttgcaaatctttttgtggatagtttgatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatttt 8603676  T
Q  320 ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  8603675 ctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 8603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 358
Target Start/End: Original strand, 40040076 - 40040377
Alignment:
Q  57 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 156  Q
    ||||||| || || ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  40040076 tgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtctc 40040175  T
Q  157 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattat 256  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  40040176 aattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggacataatatttaagatcaaatacttggcaaatattttgtggatagttggttatgattat 40040275  T
Q  257 atgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttg 356  Q
    ||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||| ||||    
T  40040276 atggagatatttgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttctcatagtgtgaagtattttctcctttatttggatggtgataaatcatatgatgttg 40040375  T
Q  357 tt 358  Q
    ||    
T  40040376 tt 40040377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 37917292 - 37917628
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |  |  ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||  |    
T  37917292 tttgtgattttgaagtttttgtcgtagtcggcgggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaagccct 37917391  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  37917392 ataatttatttacttggtttttgttcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttatcggacataatctttcagaccaaatact 37917491  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  37917492 tggcaaatcttttgtggatagttggttatgattatatggacatatttgaatgattgatatgtgttgaatatgatgtttatcatagtgtggagtattttct 37917591  T
Q  322 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||| ||| || |||||||||  ||||| ||||||    
T  37917592 cctttatttggatggtgagaaatcatatgatgttgtt 37917628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 17759257 - 17759594
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |     
T  17759257 tttgtgattttaaagtttttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgagggct- 17759355  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17759356 agagtttattttcttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 17759455  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatga-tgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| |  ||| ||||||||||  | | ||||||||   |||||||||||||    
T  17759456 tggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgattatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttatcatggtgtgttgtattttc 17759555  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 359  Q
    || |||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  17759556 tcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgtta 17759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Original strand, 19060577 - 19060914
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |     
T  19060577 tttgtgattttaaagtttttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgagggct- 19060675  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19060676 agagtttattttcttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 19060775  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatga-tgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| |  ||| ||||||||||  | | ||||||||   |||||||||||||    
T  19060776 tggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgattatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttatcatggtgtgttgtattttc 19060875  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 359  Q
    || |||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  19060876 tcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgtta 19060914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 358
Target Start/End: Original strand, 25104969 - 25105225
Alignment:
Q  100 gtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaa 199  Q
    |||||| |||||| |||||  |||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||  ||||||  ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  25104969 gtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttccttggatttggttcatttgtctcaattgctttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaa 25105068  T
Q  200 ataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgttt 299  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||| |||| ||||| |||||||    
T  25105069 agaatccttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgttatgattatatggagatatgtgaatgctctctaagtgtcgaatacgatgttt 25105168  T
Q  300 atcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25105169 atc--acggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgggaaattgtatggagttgtt 25105225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14970187 - 14969843
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatag 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||     
T  14970187 agagacgaactttgtgatttttatgacttcttcgtatttagccggtgaaacgtacatgtatattcaactgcactcatatgtgatctaagagtatacataa 14970088  T
Q  112 ttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaag 211  Q
    |||| |||||| ||| ||||| |||  ||||  ||||| || | ||||| |||||||||| | ||| ||||||  ||| ||||||||| | ||  |||||    
T  14970087 ttgatgcattataatgtgttttcttatttttacttcaaatgttacaattgttttaaagttgtgaaacgatagatgaaccttgtcgaaagtgattcttaag 14969988  T
Q  212 accaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgt 311  Q
    ||  |||  || ||||||  ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  14969987 actgaattctttgcaaatactttatgaatag-ttgatatgattgtatgaagatgtgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcatagtatga 14969889  T
Q  312 tgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    || |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  14969888 tggattttc-cccttacttggattgtgagaaatagtatagagttgtt 14969843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11401725 - 11401591
Alignment:
Q  224 gcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcc 323  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11401725 gcaaatcttttgtgaatagctttatatgattacataaagttgtatgaatgattgctagttgttgaatatgatgtttatcataatgtgctgtgttttctcc 11401626  T
Q  324 tttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11401625 tttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 11401591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 358
Target Start/End: Original strand, 38376831 - 38376962
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38376831 aatcttttgtgaatagtttgatatcattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgtgtatgatgtttatcataaggtgttatattttctccttt 38376930  T
Q  327 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  38376931 acttggattttgagaaataatatgatgttgtt 38376962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Original strand, 5229188 - 5229264
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5229188 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgtt 5229264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17392534 - 17392372
Alignment:
Q  182 agacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatg-attgcta 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |     
T  17392534 agacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggaaaatcttttgcggatagtttgatataaatatatgaagatgtgtgaatgaattgttg 17392435  T
Q  281 ggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
      |||||||| ||||   ||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17392434 aatgttgaatgtgat-catatcatggtatgatgtattttctcctttacttgaaatgtgagaaat 17392372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Original strand, 14181133 - 14181232
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 325  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14181133 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctt 14181232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18739085 - 18738909
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||| | ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  18739085 tttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaatgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggc-ct 18738987  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaa 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||    
T  18738986 agagtttatttacttggttttggttcatttgtctc-attgttttaaagttgtaaaaggagagacgaactttatcgaaaa 18738909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15549750 - 15549573
Alignment:
Q  27 gattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaat 126  Q
    |||||| ||||| |||||||| |  | || ||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| |    
T  15549750 gattttgatgatgttgtcgtagtcggccgatgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagt 15549651  T
Q  127 ttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat 204  Q
    || | |||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15549650 ttatatacttggtattggttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgccggaaataat 15549573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Original strand, 12918084 - 12918156
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12918084 aaatcttttgtggataatatgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 12918156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Original strand, 11516638 - 11516741
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattg 346  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11516638 atatgattacataaagatgtatgaataattgctaggtgttgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttacttggattgtgagaagttg 11516737  T
Q  347 tatg 350  Q
    ||||    
T  11516738 tatg 11516741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Original strand, 45804098 - 45804170
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45804098 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgatgaatatgatgtt 45804170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 358
Target Start/End: Original strand, 43428727 - 43428801
Alignment:
Q  285 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  43428727 ttgaatatgatgtttatcataaggtattgtattttcctctattacttgtattatgagaaattgtatggagttgtt 43428801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41660595 - 41660533
Alignment:
Q  281 ggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41660595 ggtgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttgaaatatgagaaat 41660533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18969095 - 18969037
Alignment:
Q  285 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaa 342  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18969095 ttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaa 18969037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Original strand, 33370012 - 33370109
Alignment:
Q  247 atatgattatatgaagatgtgcgaatg-attgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  33370012 atatgactaaatgaagatgtgtgaatggattgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 33370109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 17319733 - 17319812
Alignment:
Q  250 tgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttac 328  Q
    |||||| |||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  17319733 tgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatttgatgtttatcagaaggtgttgtattttcctcctttac 17319812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10903373 - 10903312
Alignment:
Q  289 atatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 350  Q
    |||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  10903373 atatgatgtttatcataaggtctgatactttctcctttacttgaaatgtgggaaatcgtatg 10903312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 347
Target Start/End: Original strand, 21167868 - 21167976
Alignment:
Q  240 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 338  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  21167868 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtg 21167967  T
Q  339 agaaattgt 347  Q
    | |||||||    
T  21167968 acaaattgt 21167976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 359
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8381
Alignment:
Q  130 tttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8152 tttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtagaatgagagacgaaccttgtcggaaataatctttaagaccaattacttgacaaat 8251  T
Q  230 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8252 cttttgtggatagtttgatatgattacatgaatatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcctttact 8351  T
Q  330 tgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8352 tggattgtgagaaagtgtatgaagttgtta 8381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11932 - 11598
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |    
T  11932 tttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaggccct 11833  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |    
T  11832 agagtttagttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaacgagagacgaactttgtcgaaaataa---ttaagaccaattact 11736  T
Q  222 tggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11735 tggcaaatctttttttggatagtttgatatgattatatgaagatatgtcaattatttttgggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttttattttc 11636  T
Q  321 tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635 tcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgtt 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Original strand, 13813 - 14117
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| |||| |||||||| |||||| |||||  |||| ||  ||||||||||||||||||| |||     
T  13813 cggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcaaagtgtatacatagtcgaggccctagagtta-tttacttggttttggttcatttgt 13911  T
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 253  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13912 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgagctttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttagcaaatcttttgtggatagtttgttatgat 14011  T
Q  254 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgta-ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 352  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||     
T  14012 tatatgaagatatgtggatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatttgaagtatttttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgat 14111  T
Q  353 gttgtt 358  Q
    ||||||    
T  14112 gttgtt 14117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Original strand, 14799 - 15001
Alignment:
Q  156 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14799 caattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatttttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgatataatca 14898  T
Q  256 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 355  Q
    ||||| ||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14899 tatgacgatatgtcaatgttttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagtt 14998  T
Q  356 gtt 358  Q
    |||    
T  14999 gtt 15001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 76324 - 76006
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||    ||||||||| ||||| |||||| |||  | |  | || |||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  76324 ttgtgattttgataattttgtcgtagttgactggtgaaacgcacatgtatactctactatactcttgtgtgatctaagtgtatgcatagtcgagacccta 76225  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 222  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  76224 gagcttatttacttggttttggttcatttgtctcaactattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagaccaattactt 76125  T
Q  223 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||    
T  76124 ggcaaatcttttgtggatagtttgttttgattatataaagatgt-cg-atgattgttaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttatc 76027  T
Q  323 ctttacttgaattgtgagaaa 343  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  76026 ctttatttggattgtgagaaa 76006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 319
Target Start/End: Original strand, 837 - 1025
Alignment:
Q  130 tttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837 tttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaagtgaaagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 936  T
Q  230 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 319  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  937 cttttgtgaatagtttgttatgattaaatgaagatatgcagatgattgttaggtgttgaatataatgtttatcataa-gtgtggtatttt 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 351
Target Start/End: Original strand, 35789 - 35952
Alignment:
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  35789 aactttgtcgaaaataatctttaaaaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctgggtgtt 35888  T
Q  287 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 351  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  35889 gaatatgatgtttatcatagtgtggtgtattttct-ctttacttggaatatgagaaatcgtatga 35952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 4191 - 4433
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||| |||| |||||| |||||  |    
T  4191 tttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagagtatacatagtcgaggctct 4290  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4291 agagtttatatacttggtttttgttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagacgaaatact 4390  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 264  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4391 tggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagat 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Original strand, 1338 - 1414
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1338 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Original strand, 5718 - 5794
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5718 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 264
Target Start/End: Original strand, 1 - 50
Alignment:
Q  215 aaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 264  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagat 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 242
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1277
Alignment:
Q  54 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 153  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||     
T  1089 cggtgaaacgcacatgtatactcaaccacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgattttggttcagttgt 1188  T
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatag 242  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1189 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggcaaatcttttgtggatag 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1373
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  1297 gtgttgaatacgatgtttatcatggtgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 1373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 255380 - 255546
Alignment:
Q  191 ttgtcgaaaataatctttaa-gaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaa 289  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  255380 ttgttgaaaataatctttaaagatcaaatacatggcaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaa 255479  T
Q  290 tatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 357  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  255480 tatgatgtttatcatactgtggtgtattttc-ccctcacttgaattgtgagaaatagtatgatgttgt 255546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 358
Target Start/End: Original strand, 2118 - 2255
Alignment:
Q  220 tttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2118 tttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatg-ttatcataaggtgttgtatttt 2216  T
Q  320 ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  2217 ctcctttacttggattgtgagaaataatatgatgttgtt 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7315 - 7149
Alignment:
Q  12 agagacgaagtttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatag 111  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  7315 agagacgaattttgtgattttgatgatttggtcgtagttggccggtgaaatgtacatgtatactcaattgcactcatatgtgatctaagtgtatacatag 7216  T
Q  112 ttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaat 178  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||    
T  7215 ttgaggcactagagtttgtttacttggttttggttcaattgtctcaattgtttaaaagttgtaaaat 7149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 7115 - 7154
Alignment:
Q  127 ttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattatttta 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7115 ttgtttacttggttttggttcaattgtctcaattatttta 7154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 11925 - 12198
Alignment:
Q  22 tttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  11925 tttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccct 12024  T
Q  122 agaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatt 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||   | || |||||||||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  12025 agattttatttacttggttttggttcatttgtcccaattattttaaaattataaaatatgatacgaactttgtcgaaaacaatcttttggaccaaatgct 12124  T
Q  222 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgat 295  Q
    | | |||||  ||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  12125 ttgtaaatcccttgtgcatagattgatatgaataaatgaatatatgtgaatgattgctaggtaatgaatatgat 12198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 350
Target Start/End: Original strand, 12200 - 12235
Alignment:
Q  314 tattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12200 tattttctcctt-acttgaattgtgagaaattgtatg 12235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 301
Target Start/End: Original strand, 8390 - 8634
Alignment:
Q  56 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgctt 155  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||| |||||| |||  |    
T  8390 gtgaaacgcacatgtatactcaactacactcaaatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagttcatttacttggttt-ggttcatttgtct 8488  T
Q  156 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 255  Q
    ||||| |||||||||  ||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8489 caatttttttaaagtcgtaaaataggagacgaactttgttgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatattttgtggatagtttgttatgatta 8588  T
Q  256 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttat 301  Q
    |||  |||| || ||||| |  ||| ||||||| || |||||||||    
T  8589 tatagagatatgtgaatgctctctaagtgttgattacgatgtttat 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4999 - 4871
Alignment:
Q  230 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 329  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4999 ctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttact 4900  T
Q  330 tgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4899 tggattgtgagaaagtgtatgaagttgtt 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 358
Target Start/End: Original strand, 246900 - 247104
Alignment:
Q  154 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||||    
T  246900 ttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgat 246999  T
Q  254 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 353  Q
    || || ||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |    
T  247000 tacataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatg 247099  T
Q  354 ttgtt 358  Q
    |||||    
T  247100 ttgtt 247104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 21081 - 21236
Alignment:
Q  201 taatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgttta 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |  |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21081 taatctttaagaccaaatacttggcaaatcatttgtggatagttggttatgattatataaagatatgtggttgatttttaggtgttgaatatgattttta 21180  T
Q  301 tcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 357  Q
    |||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21181 tcatactgtgatgtattttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatgatgttgt 21236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Original strand, 20941 - 21081
Alignment:
Q  23 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcatta 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  ||    
T  20941 ttgtgattttgatgattttgtcgttgtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaaatacacttatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggcccta 21040  T
Q  123 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattt 164  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  21041 gagtttatttacatgg-tttggttcatttgtctcaattattt 21081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Original strand, 39117 - 39289
Alignment:
Q  187 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  39117 aactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaataccttgaaaatcttttatgaatagtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggtgtt 39216  T
Q  287 gaatatgatgtttatcataacgtgttgta-ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||| |||||||||||||  | ||| |||| | |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39217 gaacatgatgtttatcaagatgtgatgtactcttctcctttgttttgattgtgagaaattgtatgaagttgtt 39289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9350 - 9060
Alignment:
Q  65 acatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattt 164  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| | ||||||||  ||||||  ||    
T  9350 acatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcactagaatttatttgcttagtttggattcaattgtctcaatt-gtt 9252  T
Q  165 taaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 264  Q
     |||||| | ||| | || || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  9251 aaaagttgtgaaacgttatacgaac-ttgtcggaaatgatctttaaaaccgagtactttgcaaatcttttgtgtatagcttgatacgattatatgaagat 9153  T
Q  265 gtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 357  Q
    |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||  |||  ||   || |||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9152 gtgtaaatgatttgttaggtgtttaatatgatg-atatagtagtatggtgtatttcttccgtcacttgaattgtgagaaattatatgaaattgt 9060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Original strand, 118547 - 118670
Alignment:
Q  121 tagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  118547 tagagtttatttacttggttttggttcatttgtcccaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaatgatctttaaaaccaaatat 118646  T
Q  221 ttggcaaatcttttgtggatagtt 244  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||    
T  118647 tttacaaaccttttgtgaatagtt 118670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Original strand, 44739 - 44848
Alignment:
Q  249 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 348  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  44739 atgattaaatgaagatctatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctctacttggaatgtgagaaagtgta 44838  T
Q  349 tgaagttgtt 358  Q
    |  |||||||    
T  44839 tagagttgtt 44848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Original strand, 34570 - 34702
Alignment:
Q  226 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 324  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34570 aaatctttcgtgattagctttatatgattaaatgaagatatacgaatgaattgttaggtgttgaatatgaagtttatcataaggtgttgtattttctcc- 34668  T
Q  325 ttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 358  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  34669 ttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 34702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 868 - 807
Alignment:
Q  282 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  868 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaa 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6787 - 6694
Alignment:
Q  227 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 320  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6787 aatcttttgtcaatagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttc 6694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3702 - 3637
Alignment:
Q  257 atgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 322  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3702 atgaagatgtgtgaatgaatgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 3996 - 4061
Alignment:
Q  279 taggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatt 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| | |||| ||||||    
T  3996 taggtgttgaatatgatgttcatcataaggtgtggtatttcct-ctttacttggaatgtgggaaatt 4061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 84559 - 84499
Alignment:
Q  283 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 344  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  84559 tgttggatatgatatttatcataaggtattgtattttct-ctttacttgaaatatgagaaat 84499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 697 times since January 2019
Visitors: 2236