View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0171-INSERTION6 (Length: 304)

Name: NF0171-INSERTION6
Description: NF0171
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0171-INSERTION6
NF0171-INSERTION6
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (7-299)||(39811936-39812227)
chr2 (9-303)||(32246626-32246923)
chr2 (7-304)||(44312571-44312868)
chr2 (11-299)||(19344266-19344556)
chr2 (11-299)||(19349124-19349414)
chr2 (7-304)||(11098885-11099181)
chr2 (7-297)||(14291337-14291627)
chr2 (49-304)||(9296402-9296656)
chr2 (49-256)||(25398386-25398591)
chr2 (49-256)||(25403524-25403729)
chr2 (49-143)||(3491751-3491846)
chr2 (58-144)||(8040059-8040147)
chr2 (61-143)||(40738844-40738926)
chr2 (49-140)||(13569331-13569425)
chr2 (49-144)||(21629943-21630040)
chr2 (32-143)||(28259161-28259274)
chr2 (49-144)||(10445444-10445542)
chr2 (49-144)||(17865202-17865300)
chr2 (49-144)||(20522219-20522317)
chr2 (49-144)||(34682334-34682432)
chr2 (49-113)||(25407653-25407718)
chr2 (49-142)||(34388859-34388955)
chr2 (49-144)||(14699008-14699105)
chr2 (32-142)||(10707235-10707348)
chr2 (32-140)||(8390133-8390244)
chr2 (32-143)||(23078454-23078567)
chr2 (58-121)||(31056067-31056131)
chr2 (49-144)||(33528621-33528719)
chr2 (49-144)||(39482930-39483028)
chr2 (49-122)||(42039670-42039744)
chr2 (58-144)||(16940219-16940307)
chr2 (58-144)||(17010884-17010972)
chr2 (59-122)||(33118158-33118222)
chr2 (60-143)||(36757774-36757859)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (7-304)||(14737524-14737821)
chr6 (7-303)||(28184344-28184642)
chr6 (7-304)||(14742384-14742680)
chr6 (7-304)||(22010644-22010941)
chr6 (7-304)||(11856812-11857112)
chr6 (10-304)||(28155520-28155815)
chr6 (11-304)||(6438341-6438634)
chr6 (11-303)||(6005259-6005552)
chr6 (10-303)||(16838586-16838880)
chr6 (10-303)||(33330394-33330690)
chr6 (10-303)||(33335891-33336187)
chr6 (49-166)||(5674771-5674889)
chr6 (98-303)||(5343322-5343527)
chr6 (32-143)||(5757462-5757575)
chr6 (199-304)||(30125944-30126049)
chr6 (49-143)||(21356036-21356132)
chr6 (59-144)||(10077176-10077263)
chr6 (49-144)||(5572241-5572339)
chr6 (60-144)||(31086485-31086571)
chr6 (59-143)||(4629954-4630040)
chr6 (49-144)||(31979512-31979610)
chr6 (61-121)||(22709041-22709102)
chr6 (49-122)||(18232867-18232942)
chr6 (49-122)||(21801344-21801419)
chr6 (49-144)||(22963699-22963796)
chr6 (49-144)||(23824597-23824694)
chr6 (61-144)||(5017482-5017567)
chr6 (80-144)||(31936586-31936651)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (11-299)||(39784774-39785063)
chr8 (7-303)||(25328226-25328521)
chr8 (7-300)||(7289873-7290167)
chr8 (7-304)||(6311138-6311435)
chr8 (11-303)||(35745233-35745526)
chr8 (7-304)||(33037765-33038061)
chr8 (7-304)||(36979220-36979516)
chr8 (7-304)||(4760033-4760330)
chr8 (9-304)||(18853127-18853423)
chr8 (7-304)||(30655483-30655785)
chr8 (7-304)||(10689101-10689397)
chr8 (26-299)||(10684229-10684504)
chr8 (7-304)||(18870519-18870814)
chr8 (49-143)||(1261955-1262050)
chr8 (61-143)||(26287902-26287985)
chr8 (61-143)||(26301159-26301242)
chr8 (61-143)||(26313153-26313236)
chr8 (58-144)||(26403240-26403328)
chr8 (49-143)||(31071230-31071326)
chr8 (49-122)||(4456050-4456124)
chr8 (61-144)||(4696609-4696694)
chr8 (49-140)||(7412344-7412437)
chr8 (49-143)||(19175755-19175851)
chr8 (32-144)||(23799560-23799675)
chr8 (49-122)||(6127243-6127318)
chr8 (49-144)||(5702483-5702581)
chr8 (80-141)||(9765852-9765914)
chr8 (61-144)||(19752407-19752492)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (7-304)||(31109531-31109827)
chr7 (7-304)||(12406172-12406469)
chr7 (7-304)||(12396752-12397049)
chr7 (7-304)||(24024274-24024572)
chr7 (11-299)||(19992158-19992447)
chr7 (54-304)||(4866570-4866820)
chr7 (10-299)||(21812188-21812478)
chr7 (7-304)||(20357505-20357802)
chr7 (7-304)||(2057801-2058104)
chr7 (26-299)||(24261288-24261563)
chr7 (26-299)||(24266167-24266442)
chr7 (26-299)||(16879918-16880192)
chr7 (26-299)||(16884774-16885048)
chr7 (49-304)||(1533445-1533695)
chr7 (49-166)||(18408742-18408859)
chr7 (49-256)||(21639701-21639904)
chr7 (49-166)||(18413619-18413735)
chr7 (49-256)||(21645899-21646102)
chr7 (32-144)||(29159802-29159917)
chr7 (59-142)||(21983285-21983370)
chr7 (49-144)||(33332450-33332548)
chr7 (49-144)||(46516310-46516408)
chr7 (49-144)||(49091660-49091758)
chr7 (49-143)||(44848685-44848781)
chr7 (49-144)||(2647696-2647794)
chr7 (61-144)||(9190021-9190106)
chr7 (61-144)||(20284088-20284173)
chr7 (49-144)||(55947-56044)
chr7 (32-144)||(2580389-2580503)
chr7 (60-121)||(35960839-35960901)
chr7 (61-144)||(9185178-9185263)
chr7 (80-122)||(28617258-28617300)
chr7 (64-143)||(47263678-47263757)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (7-304)||(45357244-45357541)
chr4 (11-304)||(9224358-9224651)
chr4 (10-304)||(5732502-5732799)
chr4 (11-304)||(9229145-9229438)
chr4 (7-304)||(45347764-45348062)
chr4 (7-304)||(51520297-51520595)
chr4 (11-303)||(18855568-18855860)
chr4 (13-304)||(56146664-56146956)
chr4 (10-303)||(3813865-3814158)
chr4 (7-304)||(24741783-24742079)
chr4 (49-304)||(29760485-29760737)
chr4 (61-143)||(28468542-28468625)
chr4 (49-144)||(10047378-10047476)
chr4 (49-144)||(39245993-39246091)
chr4 (49-144)||(36315230-36315327)
chr4 (49-144)||(36329439-36329536)
chr4 (49-143)||(31985635-31985730)
chr4 (49-144)||(16623293-16623391)
chr4 (32-143)||(5396655-5396768)
chr4 (58-144)||(38152449-38152537)
chr4 (61-146)||(5269204-5269291)
chr4 (32-143)||(3796502-3796616)
chr4 (59-142)||(5143260-5143345)
chr4 (59-142)||(5147678-5147763)
chr4 (58-122)||(24333831-24333896)
chr4 (49-142)||(3777550-3777645)
chr4 (49-122)||(16630680-16630755)
chr4 (58-138)||(6743425-6743507)
chr4 (61-144)||(25862035-25862120)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (7-304)||(22173142-22173439)
chr3 (10-304)||(18656272-18656569)
chr3 (7-304)||(28503822-28504109)
chr3 (7-304)||(7167087-7167383)
chr3 (10-303)||(2677036-2677331)
chr3 (49-304)||(2671587-2671841)
chr3 (10-303)||(2672880-2673175)
chr3 (26-303)||(8512057-8512337)
chr3 (26-303)||(8516937-8517217)
chr3 (10-295)||(24967957-24968243)
chr3 (7-304)||(8739021-8739319)
chr3 (7-304)||(9091259-9091557)
chr3 (26-299)||(32475330-32475603)
chr3 (26-299)||(32480188-32480461)
chr3 (49-161)||(40372796-40372908)
chr3 (49-166)||(8477340-8477458)
chr3 (95-303)||(10207775-10207983)
chr3 (7-100)||(28501655-28501750)
chr3 (49-166)||(26928592-26928709)
chr3 (49-143)||(1305949-1306044)
chr3 (49-143)||(27452958-27453054)
chr3 (49-143)||(8370477-8370573)
chr3 (49-143)||(27974943-27975039)
chr3 (49-143)||(32143321-32143417)
chr3 (49-144)||(18552873-18552971)
chr3 (32-143)||(16264350-16264463)
chr3 (49-144)||(21711222-21711319)
chr3 (61-143)||(27986449-27986533)
chr3 (49-142)||(36029094-36029190)
chr3 (49-140)||(1736295-1736389)
chr3 (49-143)||(30709780-30709877)
chr3 (61-143)||(33386669-33386753)
chr3 (32-144)||(40592755-40592870)
chr3 (49-122)||(48438236-48438311)
chr3 (49-144)||(3715992-3716090)
chr3 (49-122)||(6794704-6794778)
chr3 (49-144)||(26298987-26299085)
chr3 (49-144)||(47923896-47923994)
chr3 (61-144)||(1417493-1417578)
chr3 (49-143)||(25795781-25795878)
chr3 (61-144)||(3328359-3328444)
chr3 (61-144)||(37466290-37466375)
chr3 (61-143)||(39039995-39040079)
chr3 (233-297)||(40372980-40373043)
chr3 (49-122)||(40844674-40844748)
chr3 (77-118)||(4386947-4386988)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (7-304)||(15044527-15044823)
chr5 (7-304)||(43592119-43592417)
chr5 (7-304)||(43598564-43598862)
chr5 (7-304)||(43604056-43604354)
chr5 (7-304)||(43609548-43609846)
chr5 (7-304)||(27444810-27445108)
chr5 (7-304)||(27449654-27449952)
chr5 (7-304)||(1457109-1457406)
chr5 (10-303)||(28807524-28807818)
chr5 (11-299)||(37556573-37556863)
chr5 (11-299)||(37561395-37561685)
chr5 (7-304)||(30631248-30631545)
chr5 (11-303)||(2785217-2785510)
chr5 (11-303)||(33791158-33791451)
chr5 (11-303)||(33768021-33768314)
chr5 (7-221)||(31180138-31180352)
chr5 (26-303)||(31401815-31402093)
chr5 (26-303)||(31396958-31397236)
chr5 (49-256)||(38192064-38192269)
chr5 (49-256)||(38219289-38219494)
chr5 (49-256)||(24135740-24135944)
chr5 (49-143)||(35387663-35387758)
chr5 (49-143)||(9353333-9353429)
chr5 (49-143)||(36932351-36932447)
chr5 (32-143)||(10281751-10281865)
chr5 (49-143)||(15464532-15464628)
chr5 (49-142)||(11916972-11917068)
chr5 (32-143)||(14520230-14520343)
chr5 (58-144)||(17003970-17004058)
chr5 (49-122)||(3880321-3880396)
chr5 (49-140)||(12084176-12084269)
chr5 (49-143)||(19588746-19588843)
chr5 (61-144)||(28832258-28832343)
chr5 (61-144)||(42127423-42127508)
chr5 (80-139)||(4410241-4410301)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (11-304)||(35013-35306)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (10-303)||(9593-9883)
scaffold0355 (201-280)||(28-107)
scaffold0355 (10-57)||(3798-3845)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (11-303)||(25445040-25445333)
chr1 (11-303)||(39445341-39445633)
chr1 (11-303)||(44023825-44024116)
chr1 (7-303)||(41398079-41398373)
chr1 (11-303)||(1054963-1055255)
chr1 (7-247)||(41390483-41390718)
chr1 (7-304)||(24787322-24787622)
chr1 (26-303)||(43988429-43988709)
chr1 (49-256)||(24202770-24202973)
chr1 (243-303)||(41386590-41386650)
chr1 (49-143)||(19358844-19358939)
chr1 (49-143)||(19361433-19361528)
chr1 (49-143)||(19380073-19380168)
chr1 (32-143)||(26644881-26644994)
chr1 (58-144)||(47703946-47704034)
chr1 (49-143)||(19072928-19073025)
chr1 (49-143)||(19120818-19120915)
chr1 (49-144)||(16124516-16124614)
chr1 (49-144)||(27104372-27104470)
chr1 (32-143)||(3281708-3281821)
chr1 (58-144)||(9476260-9476348)
chr1 (58-144)||(13598397-13598485)
chr1 (58-144)||(29651810-29651898)
chr1 (51-143)||(37069770-37069864)
chr1 (58-144)||(775671-775759)
chr1 (32-113)||(21536553-21536635)
chr1 (49-121)||(13604624-13604697)
chr1 (61-144)||(47098837-47098922)
chr1 (61-122)||(32889461-32889523)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (11-299)||(208-496)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (26-303)||(148921-149199)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (26-303)||(2216-2494)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (26-303)||(19130-19408)
scaffold0197 (26-299)||(14274-14549)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (75-299)||(181980-182204)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (49-143)||(17953-18048)
scaffold0188 (49-143)||(24046-24141)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (111-304)||(300-492)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (243-303)||(34132-34192)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (49-143)||(8420-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (49-142)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (32-143)||(43945-44058)
scaffold0087 (32-143)||(36816-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (58-144)||(2491-2579)
scaffold0006 (58-144)||(5682-5770)
scaffold0006 (49-121)||(133281-133354)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (49-144)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (61-121)||(45276-45337)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (260-295)||(13198-13233)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Original strand, 39811936 - 39812227
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39811936 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 39812035  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtgg 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39812036 gattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttct-cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtgg 39812134  T
Q  207 ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812135 ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39812227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32246923 - 32246626
Alignment:
Q  9 aatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32246923 aatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 32246824  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct---ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtg 205  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32246823 ttaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtg 32246724  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32246723 gttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattg 32246626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 44312571 - 44312868
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312571 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 44312670  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44312671 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgt 44312768  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312769 ggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgt 44312868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19344556 - 19344266
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19344556 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19344457  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||    
T  19344456 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtg 19344360  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19344359 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19349414 - 19349124
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19349414 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19349315  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||    
T  19349314 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtg 19349218  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19349217 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 11098885 - 11099181
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098885 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 11098983  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11098984 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttcttc-cttatcttgttt-tgctttggtatctctttgt 11099080  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  11099081 gtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 11099178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14291627 - 14291337
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291627 agaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 14291529  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14291528 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgt 14291432  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 297  Q
    ||||||||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14291431 gtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 14291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Original strand, 9296402 - 9296656
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  9296402 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 9296500  T
Q  148 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 245  Q
    |||||||||||||| ||||    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  9296501 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt 9296598  T
Q  246 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  9296599 tgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgt 9296656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25398591 - 25398386
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  25398591 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 25398493  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  25398492 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 25398397  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  25398396 tgcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25403729 - 25403524
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  25403729 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-ttt 25403631  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  25403630 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 25403535  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  25403534 tgcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3491846 - 3491751
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3491846 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13569425 - 13569331
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13569425 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21630040 - 21629943
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21630040 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 28259161 - 28259274
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   |||||    
T  28259161 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaact 28259260  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  28259261 gggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 10445444 - 10445542
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  10445444 tcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17865300 - 17865202
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  17865300 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20522317 - 20522219
Alignment:
Q  49 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20522317 tcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 34682334 - 34682432
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34682334 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25407718 - 25407653
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattagg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25407718 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34388955 - 34388859
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 14699008 - 14699105
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 10707235 - 10707348
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||   ||||    
T  10707235 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaac 10707334  T
Q  129 tgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||||||||    
T  10707335 tgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 8390133 - 8390244
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||   ||||    
T  8390133 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaac 8390232  T
Q  129 tgggtcaacaat 140  Q
    ||||||||||||    
T  8390233 tgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 23078454 - 23078567
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||| | |||||    
T  23078454 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaact 23078553  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| ||||    
T  23078554 gggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056067
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattg 31056067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 33528621 - 33528719
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33528621 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39483028 - 39482930
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  39483028 tcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 42039670 - 42039744
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  42039670 tcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattgg 42039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118158
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 33118158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 36757774 - 36757859
Alignment:
Q  60 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  36757774 tttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 14737524 - 14737821
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14737524 agaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 14737623  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc--ttgtgt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  14737624 gattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgt 14737721  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737722 ggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 14737821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28184642 - 28184344
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28184642 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggagagctgctctctccccca 28184543  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28184542 gattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtg 28184444  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagacca--tttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184443 gttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 28184344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 14742384 - 14742680
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14742384 agaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 14742483  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtg 205  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14742484 aattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtg 14742581  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742582 gttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 14742680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 22010644 - 22010941
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010644 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 22010743  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22010744 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgt 22010841  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010842 ggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgt 22010941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11857112 - 11856812
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857112 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 11857013  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttt---gttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-g 201  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  11857012 atattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttg 11856915  T
Q  202 tgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11856914 tgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcat 11856815  T
Q  302 tgt 304  Q
    |||    
T  11856814 tgt 11856812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 28155520 - 28155815
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28155520 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 28155619  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggt 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  28155620 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggt 28155718  T
Q  208 tttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155719 tttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 28155815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6438634 - 6438341
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6438634 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 6438536  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  6438535 taggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 6438437  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438436 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgt 6438341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6005552 - 6005259
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6005552 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 6005453  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||    
T  6005452 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtg 6005357  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6005356 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 6005259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16838880 - 16838586
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16838880 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 16838781  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  16838780 attaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 16838685  T
Q  205 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16838684 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcattg 16838586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 33330394 - 33330690
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33330394 atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 33330493  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  33330494 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 33330590  T
Q  205 gg-ttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 302  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330591 ggtttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33330689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 33335891 - 33336187
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33335891 atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 33335990  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  33335991 attaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 33336087  T
Q  205 gg-ttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 302  Q
    || |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33336088 ggtttttactatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Original strand, 5674771 - 5674889
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||     
T  5674771 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tcttt 5674869  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5674870 ggtgtgtttgttctttcttt 5674889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343322
Alignment:
Q  98 tctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtat 195  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| ||     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgc---ttgttag 5343432  T
Q  196 ctctt-gtgtggtttt-gctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 292  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  293 acacatcattg 303  Q
    |||||||||||    
T  5343332 acacatcattg 5343322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 5757462 - 5757575
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  5757462 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 5757561  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  5757562 gggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 304
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126049
Alignment:
Q  199 ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttgg-ctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  298 tcattgt 304  Q
    || ||||    
T  30126043 tctttgt 30126049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21356132 - 21356036
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21356132 tcttgtaactcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 5572241 - 5572339
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  5572241 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  60 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31979610 - 31979512
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709041
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18232942 - 18232867
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18232942 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 21801344 - 21801419
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21801344 tcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattgg 21801419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22963796 - 22963699
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 23824597 - 23824694
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  80 tggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 39784774 - 39785063
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39784774 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 39784872  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39784873 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggtt 39784972  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784973 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39785063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 25328226 - 25328521
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25328226 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 25328325  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtg 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  25328326 gattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctcttgtgtg 25328424  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328425 gttttgctatacactag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcattg 25328521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 7289873 - 7290167
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289873 agaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 7289972  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  7289973 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgt 7290071  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 300  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7290072 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatca 7290167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6311435 - 6311138
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311435 agaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 6311337  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  6311336 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtg 6311239  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6311238 tggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 6311139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35745526 - 35745233
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35745526 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 35745427  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||    
T  35745426 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtg 35745331  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35745330 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 35745233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 33037765 - 33038061
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037765 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 33037863  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33037864 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtg 33037960  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggctgtt--ttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  33037961 tggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttg-ttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 33038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36979516 - 36979220
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979516 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 36979418  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36979417 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgt 36979321  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  36979320 gtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 36979223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 4760033 - 4760330
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760033 agaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 4760131  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 202  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4760132 ccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-gatgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgt 4760229  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  4760230 gtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctt 4760327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 18853127 - 18853423
Alignment:
Q  9 aatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853127 aatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccc 18853225  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18853226 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtg 18853322  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggc-tgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 302  Q
    |||||||||| || || ||  || ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18853323 tggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatcttt 18853421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30655785 - 30655483
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30655785 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctccc 30655687  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttct---tttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct- 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||   |||   ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  30655686 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcta 30655588  T
Q  200 tgtgtggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30655587 tgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacaca 30655490  T
Q  298 tcattgt 304  Q
    || ||||    
T  30655489 tctttgt 30655483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 10689101 - 10689397
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689101 agaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 10689199  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttctt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-tt 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||   |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10689200 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgttt-tgctttggtatctcttt 10689294  T
Q  201 gtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||   || || || ||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10689295 gtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttg-ttgcttggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 10689392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 10684229 - 10684504
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  10684229 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 10684328  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  10684329 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 10684424  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  10684425 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 10684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 18870519 - 18870814
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcc 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18870519 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcc 18870617  T
Q  103 cccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttg 201  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18870618 cccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttg 18870714  T
Q  202 tgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    |||||||||||| || || ||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  18870715 tgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtttgcttggaaaccattt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctt 18870811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 1261955 - 1262050
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261955 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 31071230 - 31071326
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  31071230 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4456124 - 4456050
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4456124 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4456050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7412437 - 7412344
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  7412437 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 19175755 - 19175851
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 23799560 - 23799675
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||   ||||    
T  23799560 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaac 23799659  T
Q  129 tgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  23799660 tgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6127318 - 6127243
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  6127318 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattgg 6127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 5702483 - 5702581
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5702483 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  80 tggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 31109531 - 31109827
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31109531 agaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccta 31109630  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtgg 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31109631 gattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtgg 31109730  T
Q  207 ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31109731 ttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcattgt 31109827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12406469 - 12406172
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12406469 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctattctctccccc 12406370  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12406369 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgt 12406272  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12406271 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 12406172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12397049 - 12396752
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12397049 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgttctctccccc 12396950  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12396949 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgt 12396852  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396851 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 12396752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 24024274 - 24024572
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24024274 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 24024373  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg-ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||    
T  24024374 gattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt 24024472  T
Q  205 ggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24024473 ggttttgctatatactagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 24024571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19992447 - 19992158
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19992447 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 19992348  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  19992347 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 19992249  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19992248 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatc 19992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866570
Alignment:
Q  54 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgtt 4866722  T
Q  154 ttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc-tcttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttg 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  4866721 ttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttg 4866623  T
Q  252 gagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4866622 gagaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 4866570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 21812188 - 21812478
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagctt-ga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21812188 atctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccag 21812286  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtg 205  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||    
T  21812287 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttaactctttgtgtg 21812385  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21812386 gttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 21812478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 20357505 - 20357802
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357505 agaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 20357604  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  20357605 caaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtg 20357701  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 302  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20357702 tggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcttt 20357800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2058104 - 2057801
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058104 agaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 2058006  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg----tttgtgctttggtatctc- 198  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    ||| ||||||||||||||     
T  2058005 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctct 2057907  T
Q  199 ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 297  Q
    ||||||||||||||| || || ||  || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2057906 ttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacaca 2057808  T
Q  298 tcattgt 304  Q
    || ||||    
T  2057807 tctttgt 2057801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 24261288 - 24261563
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  24261288 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 24261387  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  24261388 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 24261483  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24261484 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 24266167 - 24266442
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  24266167 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 24266266  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  24266267 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 24266362  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24266363 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24266442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16880192 - 16879918
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16880192 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 16880093  T
Q  125 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  16880092 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 16879997  T
Q  222 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
     ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16879996 ggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16885048 - 16884774
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16885048 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 16884949  T
Q  125 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  16884948 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 16884853  T
Q  222 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
     ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16884852 ggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16884774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Original strand, 1533445 - 1533695
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  1533445 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt- 1533543  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggct-gttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||| |||||  |||||||   |||||| |||||| ||||| ||||||||  |  |||| |||||||||||| |    
T  1533544 ggtgtgtttgttctttc-tttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttg-t 1533638  T
Q  246 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||    
T  1533639 tgcttggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttgt 1533695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18408859 - 18408742
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18408859 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18408762  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttcttt 18408742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21639904 - 21639701
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  21639904 tcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 21639806  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  21639805 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21639712  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  21639711 tgcttggagac 21639701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18413735 - 18413619
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18413735 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccag-attaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18413639  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18413638 ggtgtgtttgttctttcttt 18413619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21646102 - 21645899
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  21646102 tcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 21646004  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||   ||| |||| |||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  21646003 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttg---ttttgtat-tctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21645910  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  21645909 tgcttggagac 21645899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29159917 - 29159802
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||    
T  29159917 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaac 29159818  T
Q  129 tgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  29159817 tgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 33332450 - 33332548
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332450 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 46516310 - 46516408
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  46516310 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 49091758 - 49091660
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  49091758 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 44848685 - 44848781
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    |||||||||||||||||||    
T  44848685 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 2647696 - 2647794
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 56044 - 55947
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  56044 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2580503 - 2580389
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||   ||| |    
T  2580503 aagcttgcaagctattttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaatt 2580404  T
Q  130 gggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||    
T  2580403 gggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960839
Alignment:
Q  60 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 35960839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617300
Alignment:
Q  80 tggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattgg 28617300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  64 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 45357244 - 45357541
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45357244 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 45357343  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtg 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45357344 gattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtg 45357442  T
Q  206 gttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357443 gttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgt 45357541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 9224358 - 9224651
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9224358 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 9224457  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9224458 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtt 9224555  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9224556 ttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 9224651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5732799 - 5732502
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5732799 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 5732700  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  5732699 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgt 5732602  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5732601 ggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgt 5732502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 9229145 - 9229438
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9229145 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 9229244  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9229245 taggccatattggctgaactgggttaacaatcttct-cggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtt 9229342  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9229343 ttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 9229438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 45347764 - 45348062
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347764 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 45347863  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgt 204  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45347864 agattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgt 45347962  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347963 ggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgt 45348062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51520595 - 51520297
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520595 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 51520496  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |    
T  51520495 agattaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtat 51520397  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51520396 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 51520297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18855860 - 18855568
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18855860 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 18855762  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  18855761 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 18855663  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855662 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 18855568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146956
Alignment:
Q  13 tagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggatta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 56146763  T
Q  112 ggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggtttt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  56146764 ggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggtttt 56146862  T
Q  211 gctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56146863 gctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 56146956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3814158 - 3813865
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3814158 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 3814059  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||    
T  3814058 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtggtt 3813961  T
Q  209 tt-gctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    || || |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3813960 tttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 3813865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24742079 - 24741783
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742079 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 24741981  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24741980 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgt 24741884  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24741883 gtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 24741786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29760737 - 29760485
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  29760737 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 29760639  T
Q  148 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 246  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||| ||    
T  29760638 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttg-tt 29760542  T
Q  247 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29760541 gcttggaaaccattt-tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgt 29760485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10047476 - 10047378
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10047476 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39246091 - 39245993
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39246091 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 36315230 - 36315327
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36315230 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 36329439 - 36329536
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36329439 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 31985635 - 31985730
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31985635 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 16623293 - 16623391
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16623293 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 5396655 - 5396768
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   |||||    
T  5396655 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaact 5396754  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  5396755 gggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 146
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttgtt 146  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 3796502 - 3796616
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||    
T  3796502 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaac 3796601  T
Q  129 tgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||||||||    
T  3796602 tgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  59 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333831
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 24333831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3777645 - 3777550
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||   ||||||||||||||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 16630680 - 16630755
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||    
T  16630680 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattgg 16630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 138
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaaca 138  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||  |||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 22173142 - 22173439
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173142 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 22173241  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  22173242 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgt 22173339  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22173340 ggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 22173439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18656569 - 18656272
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18656569 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 18656470  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  18656469 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgt 18656372  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18656371 ggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgt 18656272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 28503822 - 28504109
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28503822 agaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccc 28503921  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||          |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28503922 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt----------tcttgtttatgctttgttatctctttgtg 28504010  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  28504011 tggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattg 28504108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7167383 - 7167087
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167383 agaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 7167285  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  7167284 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgt 7167187  T
Q  203 gtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 302  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7167186 gtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatcttt 7167089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 2677036 - 2677331
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2677036 atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 2677135  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  2677136 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 2677232  T
Q  205 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2677233 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2677331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Original strand, 2671587 - 2671841
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  2671587 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 2671685  T
Q  148 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 245  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2671686 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt 2671783  T
Q  246 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2671784 tgcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt 2671841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 2672880 - 2673175
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2672880 atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 2672979  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  2672980 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 2673076  T
Q  205 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2673077 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2673175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8512337 - 8512057
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  8512337 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 8512238  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||     
T  8512237 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtgtggttgtgctacacat 8512141  T
Q  220 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8512140 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8512057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8517217 - 8516937
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  8517217 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 8517118  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||     
T  8517117 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtgtggttgtgctacacat 8517021  T
Q  220 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8517020 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8516937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24968243 - 24967957
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgg 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||       
T  24968243 atctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaa 24968144  T
Q  108 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 204  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  24968143 attaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 24968048  T
Q  205 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 295  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24968047 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 8739021 - 8739319
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739021 agaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 8739119  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8739120 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgt 8739216  T
Q  203 gtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 300  Q
    |||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  8739217 gtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatct 8739315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 9091259 - 9091557
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctccc 103  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091259 agaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 9091357  T
Q  104 ccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgt 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9091358 ccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgt 9091454  T
Q  203 gtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 300  Q
    |||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  9091455 gtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatct 9091553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32475603 - 32475330
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  32475603 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 32475505  T
Q  125 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  32475504 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 32475409  T
Q  222 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
     ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32475408 ggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32475330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32480461 - 32480188
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  32480461 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 32480363  T
Q  125 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  32480362 gaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 32480267  T
Q  222 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
     ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32480266 ggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32480188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Original strand, 40372796 - 40372908
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  40372796 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 40372894  T
Q  148 ggtgttttgttctt 161  Q
    ||||||||||||||    
T  40372895 ggtgttttgttctt 40372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8477458 - 8477340
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  8477458 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 8477360  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  8477359 ggtgtgtttgttctttcttt 8477340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207775
Alignment:
Q  95 ctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-ctttt-accgcttatcttgtttgtgctttgg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |  | ||||||||||  ||||| |     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtta-tgctt-gt 10207887  T
Q  193 tatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgct 290  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  291 ccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||    
T  10207787 ccacacatcattg 10207775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 28501655 - 28501750
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 100  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501655 agaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 166
Target Start/End: Original strand, 26928592 - 26928709
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  26928592 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 26928689  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  26928690 ggtgtgtttgttctttcttt 26928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1306044 - 1305949
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1306044 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27453054 - 27452958
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  27453054 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 8370477 - 8370573
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8370477 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 27974943 - 27975039
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32143417 - 32143321
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  32143417 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 18552873 - 18552971
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18552873 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16264463 - 16264350
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  16264463 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 16264364  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
     |||||||||||||    
T  16264363 aggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21711319 - 21711222
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21711319 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36029190 - 36029094
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36029190 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Original strand, 1736295 - 1736389
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1736295 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 30709780 - 30709877
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30709780 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 40592755 - 40592870
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||   ||||    
T  40592755 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaac 40592854  T
Q  129 tgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  40592855 tgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48438311 - 48438236
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48438311 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 3715992 - 3716090
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3715992 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 6794704 - 6794778
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  6794704 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 6794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26299085 - 26298987
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 47923896 - 47923994
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923896 tcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417578
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25795878 - 25795781
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  25795878 tcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt-tgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373043
Alignment:
Q  233 ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 40373043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40844748 - 40844674
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  40844748 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattgg 40844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4386988
Alignment:
Q  77 tattggattggagagctgctctctcccccggattaggccata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcata 4386988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15044823 - 15044527
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15044823 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 15044724  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtgg 206  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15044723 tattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtgg 15044625  T
Q  207 ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15044624 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattgt 15044527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43592417 - 43592119
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592417 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 43592318  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43592317 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 43592219  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43592218 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 43592119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43598862 - 43598564
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598862 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 43598763  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43598762 agattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 43598664  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43598663 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 43598564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43604354 - 43604056
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604354 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 43604255  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43604254 agattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 43604156  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43604155 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 43604056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43609846 - 43609548
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609846 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 43609747  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43609746 agattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 43609648  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43609647 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 43609548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27445108 - 27444810
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445108 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 27445009  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27445008 agattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 27444910  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27444909 ggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 27444810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27449952 - 27449654
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449952 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 27449853  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27449852 agattaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 27449754  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27449753 ggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacatatcattgt 27449654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 1457109 - 1457406
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457109 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 1457208  T
Q  106 ggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgt 204  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  1457209 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 1457306  T
Q  205 ggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1457307 ggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 1457406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 28807524 - 28807818
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28807524 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 28807622  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg- 206  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||| ||||     
T  28807623 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggt 28807721  T
Q  207 -ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807722 tttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 28807818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 37556573 - 37556863
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37556573 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 37556672  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggt 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  37556673 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggt 37556771  T
Q  208 tttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556772 tttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37556863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 37561395 - 37561685
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37561395 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 37561494  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggt 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||    
T  37561495 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggt 37561593  T
Q  208 tttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561594 tttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30631545 - 30631248
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631545 agaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 30631446  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttctt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tg 201  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||   |||||||||||| ||||||| ||||| | |     
T  30631445 cagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgtttatgctttgttatctatata 30631350  T
Q  202 tgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 301  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30631349 tgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttg-ttgcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcat 30631251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2785510 - 2785217
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2785510 tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 2785411  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||    
T  2785410 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtg 2785315  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2785314 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2785217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33791451 - 33791158
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33791451 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccaga 33791352  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || |||| | ||||    
T  33791351 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctctatatgtg 33791256  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33791255 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33791158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33768314 - 33768021
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccgga 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33768314 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccaga 33768215  T
Q  109 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||| ||    ||| || |||| | ||||    
T  33768214 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctgtatg---cttgttagctctatatgtg 33768119  T
Q  206 gttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33768118 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31180352 - 31180138
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180352 agaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 31180254  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  31180253 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc-tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtg 31180156  T
Q  204 tggttttgctatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31180155 tggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 31401815 - 31402093
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||     
T  31401815 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggc 31401914  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |    
T  31401915 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctttacatt 31402010  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31402011 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 31402093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 31396958 - 31397236
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  31396958 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 31397057  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt-tgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  31397058 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctttacatta 31397154  T
Q  222 -gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
     ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31397155 ggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 31397236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38192269 - 38192064
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  38192269 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38192171  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  38192170 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 38192075  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  38192074 tgcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38219494 - 38219289
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  38219494 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38219396  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 245  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  38219395 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 38219300  T
Q  246 tgcttggagac 256  Q
    |||||||||||    
T  38219299 tgcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24135944 - 24135740
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  24135944 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 24135846  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 246  Q
    ||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||  |||||||   | |||  |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  24135845 ggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgttt 24135750  T
Q  247 gcttggagac 256  Q
    ||||||||||    
T  24135749 gcttggagac 24135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35387758 - 35387663
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35387758 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 9353333 - 9353429
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9353333 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 36932351 - 36932447
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10281865 - 10281751
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaac 128  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||    
T  10281865 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaac 10281766  T
Q  129 tgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||||||||    
T  10281765 tgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15464628 - 15464532
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Original strand, 11916972 - 11917068
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11916972 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14520343 - 14520230
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||   |||||    
T  14520343 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaact 14520244  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  14520243 gggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3880396 - 3880321
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  3880396 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattgg 3880321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Original strand, 12084176 - 12084269
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||   ||||||||||||||||    
T  12084176 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19588843 - 19588746
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  80 tggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 35013 - 35306
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35013 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 35112  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35113 taggccatattggctgaactgggttaacaatcttct-cggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtt 35210  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35211 ttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgt 35306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 9593 - 9883
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9593 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 9692  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  9693 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctcttgtgtggttt 9789  T
Q  210 tgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9790 tgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 9883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 280
Target Start/End: Original strand, 28 - 107
Alignment:
Q  201 gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgattatcact 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Original strand, 3798 - 3845
Alignment:
Q  10 atctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3798 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 25445040 - 25445333
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25445040 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 25445139  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| || ||| |||||||||    
T  25445140 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagctctttgtgtggt 25445238  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445239 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattg 25445333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39445633 - 39445341
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39445633 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 39445535  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  39445534 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 39445436  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445435 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 39445341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 44023825 - 44024116
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44023825 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 44023923  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggtt 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||    
T  44023924 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggtt 44024022  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44024023 ttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacacatcattg 44024116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41398373 - 41398079
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41398373 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 41398274  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtg 205  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||      |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41398273 gattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtg 41398181  T
Q  206 g--ttttgctatacactagcttatggctgtt---ttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 300  Q
    |  |||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41398180 gttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataa 41398082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 1054963 - 1055255
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1054963 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagat 1055061  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  1055062 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 1055160  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055161 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 1055255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41390718 - 41390483
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41390718 agaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 41390619  T
Q  107 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtg 205  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||      |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  41390618 gattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtg 41390526  T
Q  206 g--ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttg 247  Q
    |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41390525 gttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgtttg 41390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 24787322 - 24787622
Alignment:
Q  7 agaatctagggttagttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 104  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24787322 agaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccc 24787421  T
Q  105 cggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtg 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  24787422 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtg 24787518  T
Q  204 tggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgttgt--ttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    |||||||||| ||||  ||  || |||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24787519 tggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatc 24787617  T
Q  300 attgt 304  Q
     ||||    
T  24787618 tttgt 24787622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 43988429 - 43988709
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  43988429 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 43988528  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 219  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||   |   ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| |||||||||     
T  43988529 tgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttgtgctatacat 43988625  T
Q  220 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43988626 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 43988709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Original strand, 24202770 - 24202973
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  24202770 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 24202868  T
Q  148 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 246  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24202869 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgttt 24202963  T
Q  247 gcttggagac 256  Q
    ||||||||||    
T  24202964 gcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386590
Alignment:
Q  243 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 41386590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 19358844 - 19358939
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19358844 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 19361433 - 19361528
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19361433 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 19380073 - 19380168
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19380073 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 26644881 - 26644994
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  26644881 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 26644980  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  26644981 gggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19073025 - 19072928
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19073025 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19120915 - 19120818
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19120915 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 16124516 - 16124614
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  16124516 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 27104372 - 27104470
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27104372 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3281821 - 3281708
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  3281821 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 3281722  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||| ||||||    
T  3281721 gggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  51 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Original strand, 21536553 - 21536635
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattagg 113  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21536553 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 13604624 - 13604697
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889461
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg 122  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattgg 32889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 208
Alignment:
Q  11 tctagggttagttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  496 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 398  T
Q  110 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  397 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 299  T
Q  208 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  298 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccacacatc 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 148921 - 149199
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||     
T  148921 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggc 149020  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  149021 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 149116  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  149117 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 149199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 2216 - 2494
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||     
T  2216 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggc 2315  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  2316 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 2411  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2412 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 19130 - 19408
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  19130 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggc 19229  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  19230 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 19325  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19326 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 19408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 14274 - 14549
Alignment:
Q  26 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggt 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  14274 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 14373  T
Q  124 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  14374 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 14469  T
Q  221 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14470 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 14549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182204
Alignment:
Q  75 catattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  173 ttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcat 269  Q
    ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  182080 ttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcat 182174  T
Q  270 tgattatcactatcacttgctccacacatc 299  Q
     ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  182175 agattacctctatctcttgctccacacatc 182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 17953 - 18048
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17953 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 24046 - 24141
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24046 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 304
Target Start/End: Original strand, 300 - 492
Alignment:
Q  111 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttt-taccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 208  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttctttcta--gcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggtt 395  T
Q  209 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtt--tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgt 304  Q
    |||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  396 ttgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34192
Alignment:
Q  243 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 34192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8516
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85684
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  85779 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 43945 - 44058
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||   |||||    
T  43945 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaact 44044  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  44045 gggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 36816 - 36929
Alignment:
Q  32 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaact 129  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||   |||||    
T  36816 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaact 36915  T
Q  130 gggtcaacaatctt 143  Q
    ||||||||||||||    
T  36916 gggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  58 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 133281 - 133354
Alignment:
Q  49 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10826 - 10728
Alignment:
Q  49 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45276
Alignment:
Q  61 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccggattaggccatattg 121  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 45276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13198
Alignment:
Q  260 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 13198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 537 times since January 2019
Visitors: 2229