View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_12 (Length: 317)

Name: NF0172_low_12
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_12
NF0172_low_12
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (31-297)||(5866129-5866395)
chr8 (32-297)||(17140916-17141181)
chr8 (31-297)||(21490995-21491261)
chr8 (31-297)||(21255222-21255488)
chr8 (31-297)||(21249384-21249650)
chr8 (36-293)||(26355557-26355815)
chr8 (35-297)||(6520368-6520632)
chr8 (34-297)||(38855107-38855372)
chr8 (36-297)||(23760698-23760962)
chr8 (34-281)||(21285613-21285863)
chr8 (34-278)||(20498581-20498829)
chr8 (36-281)||(21673720-21673967)
chr8 (34-281)||(983257-983511)
chr8 (221-297)||(21396025-21396101)
chr8 (221-297)||(21790518-21790594)
chr8 (221-297)||(21389495-21389571)
chr8 (221-297)||(21778821-21778897)
chr8 (129-297)||(17612059-17612231)
chr8 (199-297)||(31971257-31971354)
chr8 (184-297)||(22626736-22626848)
chr8 (221-297)||(21919046-21919121)
chr8 (34-278)||(37116366-37116615)
chr8 (174-300)||(6759255-6759381)
chr8 (221-297)||(7372778-7372853)
chr8 (225-297)||(16199693-16199765)
chr8 (221-297)||(18818455-18818530)
chr8 (221-297)||(18879277-18879352)
chr8 (221-297)||(23406379-23406454)
chr8 (113-278)||(17439439-17439609)
chr8 (223-296)||(28649092-28649164)
chr8 (221-297)||(16092388-16092463)
chr8 (34-278)||(17266847-17267096)
chr8 (221-297)||(20536208-20536283)
chr8 (221-297)||(21923974-21924049)
chr8 (221-297)||(45131042-45131117)
chr8 (122-290)||(13508027-13508199)
chr8 (196-290)||(13597637-13597731)
chr8 (184-297)||(22875065-22875177)
chr8 (244-294)||(41598188-41598238)
chr8 (184-278)||(24353039-24353134)
chr8 (244-294)||(1484402-1484452)
chr8 (244-294)||(4542485-4542535)
chr8 (244-294)||(5853404-5853454)
chr8 (244-294)||(14409556-14409606)
chr8 (244-294)||(19896265-19896315)
chr8 (244-294)||(20046307-20046357)
chr8 (244-294)||(20403227-20403277)
chr8 (244-294)||(22001753-22001803)
chr8 (244-294)||(26225359-26225409)
chr8 (244-300)||(19937118-19937174)
chr8 (244-294)||(4483281-4483330)
chr8 (244-294)||(15203343-15203393)
chr8 (244-290)||(16413428-16413474)
chr8 (224-278)||(19154935-19154989)
chr8 (244-294)||(26219717-26219767)
chr8 (244-290)||(45290807-45290853)
chr8 (244-281)||(15070571-15070608)
chr8 (226-276)||(22525579-22525628)
chr8 (244-294)||(25484380-25484430)
chr8 (129-190)||(18862427-18862488)
chr8 (129-190)||(21383920-21383981)
chr8 (129-190)||(21387340-21387401)
chr8 (129-190)||(21411213-21411274)
chr8 (129-190)||(21805705-21805766)
chr8 (129-190)||(21827796-21827857)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (32-297)||(34200786-34201051)
chr7 (31-297)||(11995882-11996148)
chr7 (31-297)||(28505153-28505419)
chr7 (34-297)||(15754744-15755008)
chr7 (129-297)||(16495402-16495570)
chr7 (36-297)||(67745-68008)
chr7 (38-293)||(44014182-44014434)
chr7 (36-297)||(16219574-16219835)
chr7 (36-293)||(18005650-18005910)
chr7 (34-297)||(47831807-47832073)
chr7 (36-293)||(810988-811248)
chr7 (34-281)||(16056344-16056593)
chr7 (34-297)||(22072913-22073181)
chr7 (34-278)||(20220044-20220290)
chr7 (221-297)||(16386293-16386369)
chr7 (34-212)||(15113028-15113209)
chr7 (34-281)||(12901339-12901594)
chr7 (34-159)||(15116621-15116746)
chr7 (184-297)||(2280127-2280238)
chr7 (221-297)||(12698831-12698906)
chr7 (184-294)||(3564372-3564482)
chr7 (220-297)||(9509189-9509265)
chr7 (184-297)||(38227481-38227593)
chr7 (221-297)||(27847875-27847951)
chr7 (122-281)||(1867937-1868100)
chr7 (221-295)||(40443393-40443467)
chr7 (221-297)||(10589039-10589114)
chr7 (225-297)||(13647325-13647396)
chr7 (184-294)||(18456421-18456530)
chr7 (35-108)||(16324197-16324270)
chr7 (122-297)||(19486686-19486865)
chr7 (221-297)||(26211995-26212071)
chr7 (194-275)||(12255809-12255892)
chr7 (113-281)||(14044762-14044935)
chr7 (113-281)||(14354792-14354965)
chr7 (122-274)||(15008441-15008597)
chr7 (196-297)||(10063838-10063939)
chr7 (244-297)||(18430709-18430762)
chr7 (221-294)||(48273392-48273464)
chr7 (244-294)||(456321-456371)
chr7 (244-294)||(3386333-3386383)
chr7 (244-294)||(11972496-11972546)
chr7 (244-294)||(13869346-13869396)
chr7 (244-294)||(14949234-14949284)
chr7 (244-294)||(15376825-15376875)
chr7 (244-294)||(16213684-16213734)
chr7 (244-294)||(16232520-16232570)
chr7 (244-294)||(16410059-16410109)
chr7 (244-294)||(17062027-17062077)
chr7 (244-294)||(18640272-18640322)
chr7 (244-294)||(20110556-20110606)
chr7 (244-294)||(20385235-20385285)
chr7 (244-294)||(21189707-21189757)
chr7 (244-294)||(24702238-24702288)
chr7 (244-294)||(24704688-24704738)
chr7 (244-294)||(32125491-32125541)
chr7 (244-294)||(41522917-41522967)
chr7 (244-294)||(41525379-41525429)
chr7 (244-293)||(11393399-11393448)
chr7 (235-294)||(13831373-13831431)
chr7 (224-271)||(48991206-48991253)
chr7 (244-290)||(24275175-24275221)
chr7 (244-294)||(27216860-27216910)
chr7 (244-294)||(44116509-44116559)
chr7 (244-281)||(15144105-15144142)
chr7 (228-276)||(9177718-9177766)
chr7 (34-74)||(9389552-9389592)
chr7 (244-290)||(38898489-38898535)
chr7 (226-278)||(18203831-18203882)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (30-297)||(34123-34390)
scaffold0175 (244-297)||(273-326)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (31-297)||(19660690-19660956)
chr5 (36-293)||(22959392-22959649)
chr5 (36-297)||(19668898-19669161)
chr5 (34-293)||(21565546-21565808)
chr5 (34-297)||(21329352-21329618)
chr5 (34-297)||(21502009-21502277)
chr5 (34-297)||(26011890-26012154)
chr5 (34-278)||(20026795-20027043)
chr5 (196-297)||(36314577-36314678)
chr5 (221-297)||(21729110-21729185)
chr5 (221-297)||(21808435-21808510)
chr5 (221-297)||(25421532-25421607)
chr5 (221-294)||(24529223-24529295)
chr5 (221-297)||(8286889-8286964)
chr5 (221-297)||(21997580-21997655)
chr5 (34-278)||(22178074-22178323)
chr5 (221-297)||(23390542-23390617)
chr5 (184-278)||(22144068-22144162)
chr5 (184-297)||(24493569-24493681)
chr5 (221-290)||(37723910-37723979)
chr5 (221-297)||(13025311-13025386)
chr5 (221-297)||(13095495-13095570)
chr5 (221-297)||(21293015-21293090)
chr5 (223-297)||(9077952-9078025)
chr5 (184-294)||(22412187-22412296)
chr5 (221-297)||(22075018-22075094)
chr5 (122-297)||(40725853-40726032)
chr5 (129-176)||(36314672-36314719)
chr5 (244-297)||(1096467-1096520)
chr5 (221-297)||(25431395-25431469)
chr5 (243-294)||(20909012-20909063)
chr5 (244-294)||(264880-264930)
chr5 (244-294)||(2154726-2154776)
chr5 (244-294)||(10733052-10733102)
chr5 (244-294)||(11581311-11581361)
chr5 (244-294)||(20918060-20918110)
chr5 (244-294)||(29329934-29329984)
chr5 (244-294)||(36154892-36154942)
chr5 (244-294)||(38619434-38619484)
chr5 (244-294)||(39245136-39245186)
chr5 (244-294)||(39363384-39363434)
chr5 (244-293)||(23064512-23064561)
chr5 (246-294)||(10775790-10775838)
chr5 (34-89)||(21741400-21741455)
chr5 (244-294)||(29345980-29346030)
chr5 (244-294)||(31061068-31061118)
chr5 (244-294)||(42245477-42245527)
chr5 (244-281)||(20902121-20902158)
chr5 (244-291)||(18319146-18319193)
chr5 (247-294)||(29348453-29348500)
chr5 (247-294)||(29350926-29350973)
chr5 (235-294)||(32027393-32027451)
chr5 (244-294)||(20806854-20806904)
chr5 (227-281)||(26732884-26732937)
chr5 (129-190)||(10753627-10753688)
chr5 (129-190)||(22120146-22120207)
chr5 (244-293)||(26704075-26704124)
chr5 (244-293)||(26973808-26973857)
chr5 (132-188)||(21741486-21741541)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (31-297)||(11292-11558)
scaffold0046 (65-297)||(1997-2229)
scaffold0046 (221-297)||(28414-28489)
scaffold0046 (241-297)||(4552-4608)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (31-297)||(15551817-15552082)
chr4 (31-259)||(16596686-16596914)
chr4 (34-293)||(12774011-12774263)
chr4 (34-278)||(13705-13953)
chr4 (34-293)||(8846360-8846638)
chr4 (34-297)||(39706144-39706409)
chr4 (36-281)||(12288066-12288315)
chr4 (34-281)||(43198410-43198660)
chr4 (221-297)||(3096293-3096368)
chr4 (221-297)||(12902757-12902832)
chr4 (224-297)||(17046487-17046560)
chr4 (221-297)||(7088877-7088952)
chr4 (221-297)||(7798774-7798849)
chr4 (184-281)||(52243202-52243301)
chr4 (221-297)||(52873413-52873488)
chr4 (34-278)||(53082005-53082254)
chr4 (221-297)||(14053346-14053422)
chr4 (34-278)||(46640311-46640558)
chr4 (184-294)||(16377531-16377639)
chr4 (221-295)||(22636437-22636510)
chr4 (221-290)||(23374405-23374473)
chr4 (221-297)||(6899891-6899966)
chr4 (221-297)||(7893703-7893778)
chr4 (221-297)||(44052829-44052904)
chr4 (194-297)||(16270254-16270356)
chr4 (35-188)||(15099461-15099613)
chr4 (221-294)||(54798800-54798872)
chr4 (34-188)||(15190428-15190581)
chr4 (184-297)||(16239978-16240090)
chr4 (221-294)||(44928970-44929042)
chr4 (244-300)||(19242693-19242749)
chr4 (221-292)||(14038653-14038723)
chr4 (244-294)||(12419-12469)
chr4 (244-294)||(1837621-1837671)
chr4 (244-294)||(7641294-7641344)
chr4 (244-294)||(12610950-12611000)
chr4 (244-294)||(14280316-14280366)
chr4 (244-294)||(15118464-15118514)
chr4 (244-294)||(18215386-18215436)
chr4 (244-294)||(18239531-18239581)
chr4 (244-294)||(23803377-23803427)
chr4 (244-294)||(44102214-44102264)
chr4 (244-294)||(44615288-44615338)
chr4 (244-294)||(44773199-44773249)
chr4 (244-294)||(50222451-50222501)
chr4 (244-294)||(51463980-51464030)
chr4 (244-294)||(52312510-52312560)
chr4 (244-297)||(15367690-15367743)
chr4 (244-297)||(15370018-15370071)
chr4 (244-297)||(15371202-15371255)
chr4 (244-297)||(15373483-15373536)
chr4 (244-297)||(15402703-15402756)
chr4 (244-297)||(16223532-16223585)
chr4 (184-296)||(19618225-19618336)
chr4 (244-295)||(22353835-22353886)
chr4 (244-294)||(3515007-3515057)
chr4 (228-278)||(6190481-6190531)
chr4 (244-294)||(8574935-8574985)
chr4 (244-290)||(15355437-15355483)
chr4 (129-190)||(630725-630786)
chr4 (129-190)||(3331994-3332055)
chr4 (129-190)||(13812760-13812821)
chr4 (129-190)||(14953912-14953973)
chr4 (244-281)||(14970819-14970856)
chr4 (129-190)||(25690170-25690231)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (31-294)||(15664-15927)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (34-297)||(28496329-28496592)
chr6 (34-297)||(29808740-29809003)
chr6 (34-297)||(1561303-1561567)
chr6 (34-293)||(19652199-19652459)
chr6 (34-281)||(19668387-19668638)
chr6 (34-297)||(20109140-20109407)
chr6 (34-278)||(23019425-23019672)
chr6 (196-297)||(27333238-27333339)
chr6 (196-297)||(27393978-27394079)
chr6 (34-281)||(9098380-9098619)
chr6 (184-297)||(20076700-20076812)
chr6 (221-297)||(16496244-16496319)
chr6 (221-297)||(35245586-35245662)
chr6 (221-297)||(16920675-16920751)
chr6 (221-297)||(20638329-20638404)
chr6 (184-297)||(19303549-19303661)
chr6 (221-297)||(29060540-29060615)
chr6 (194-281)||(4185839-4185926)
chr6 (122-297)||(8227453-8227632)
chr6 (221-297)||(17287842-17287917)
chr6 (221-297)||(22780273-22780348)
chr6 (229-297)||(22831503-22831571)
chr6 (34-278)||(35008167-35008416)
chr6 (191-281)||(25644336-25644427)
chr6 (223-296)||(18409875-18409947)
chr6 (221-285)||(11185517-11185581)
chr6 (221-297)||(20361006-20361081)
chr6 (34-238)||(22080594-22080800)
chr6 (194-281)||(4186383-4186470)
chr6 (184-297)||(25629363-25629476)
chr6 (34-108)||(27333140-27333214)
chr6 (34-108)||(27393880-27393954)
chr6 (112-294)||(22782227-22782411)
chr6 (221-294)||(25656629-25656700)
chr6 (244-297)||(25714417-25714470)
chr6 (226-278)||(23076749-23076801)
chr6 (244-294)||(2291292-2291342)
chr6 (244-294)||(3852129-3852179)
chr6 (244-294)||(8055029-8055079)
chr6 (244-294)||(12742317-12742367)
chr6 (244-294)||(18334704-18334754)
chr6 (244-294)||(19005046-19005096)
chr6 (244-294)||(19859031-19859081)
chr6 (223-297)||(20593773-20593846)
chr6 (244-294)||(24422547-24422597)
chr6 (244-294)||(25754809-25754859)
chr6 (244-294)||(26924752-26924802)
chr6 (244-294)||(33861794-33861844)
chr6 (244-294)||(33864278-33864328)
chr6 (184-296)||(30676763-30676874)
chr6 (244-294)||(1541023-1541073)
chr6 (244-294)||(1595549-1595599)
chr6 (34-100)||(4668069-4668135)
chr6 (34-100)||(4674916-4674982)
chr6 (244-294)||(20557004-20557054)
chr6 (194-239)||(4668229-4668274)
chr6 (194-239)||(4675076-4675121)
chr6 (253-297)||(22080802-22080846)
chr6 (35-167)||(23076865-23076997)
chr6 (224-276)||(33443068-33443119)
chr6 (244-296)||(34963371-34963423)
chr6 (244-291)||(16448639-16448686)
chr6 (34-100)||(4185679-4185745)
chr6 (244-278)||(18456735-18456769)
chr6 (244-278)||(18461895-18461929)
chr6 (244-278)||(18821912-18821946)
chr6 (244-294)||(25688502-25688552)
chr6 (129-190)||(22949408-22949469)
chr6 (129-190)||(22953364-22953425)
chr6 (129-190)||(23871852-23871913)
chr6 (129-190)||(23875808-23875869)
chr6 (129-190)||(27325385-27325446)
chr6 (194-293)||(31155415-31155514)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (31-281)||(20918620-20918870)
chr1 (34-297)||(33681010-33681273)
chr1 (34-281)||(52927837-52928075)
chr1 (36-293)||(20248283-20248539)
chr1 (34-297)||(22237630-22237894)
chr1 (129-297)||(14295504-14295672)
chr1 (34-290)||(21754052-21754301)
chr1 (34-293)||(22921724-22921986)
chr1 (112-244)||(22130843-22130975)
chr1 (34-278)||(21896113-21896358)
chr1 (34-278)||(21861424-21861672)
chr1 (129-229)||(51130632-51130732)
chr1 (122-278)||(35261023-35261180)
chr1 (221-297)||(20847200-20847275)
chr1 (221-297)||(27250775-27250850)
chr1 (221-296)||(50210259-50210333)
chr1 (35-173)||(20636975-20637113)
chr1 (199-281)||(16758665-16758749)
chr1 (221-294)||(34509783-34509855)
chr1 (34-278)||(16368141-16368388)
chr1 (221-297)||(21026680-21026755)
chr1 (34-159)||(12271695-12271813)
chr1 (227-297)||(38801439-38801508)
chr1 (225-297)||(45574937-45575008)
chr1 (184-278)||(50614123-50614219)
chr1 (184-278)||(50621951-50622047)
chr1 (221-297)||(22532269-22532344)
chr1 (34-158)||(49261481-49261605)
chr1 (244-297)||(13212974-13213027)
chr1 (228-296)||(20454606-20454673)
chr1 (244-300)||(21342090-21342146)
chr1 (34-278)||(50686630-50686879)
chr1 (121-278)||(16093825-16093987)
chr1 (235-294)||(21707167-21707225)
chr1 (235-294)||(21711709-21711767)
chr1 (244-294)||(13988866-13988916)
chr1 (244-294)||(21346961-21347011)
chr1 (244-294)||(21923403-21923453)
chr1 (244-294)||(23593847-23593897)
chr1 (244-294)||(29298137-29298187)
chr1 (244-294)||(29776688-29776738)
chr1 (244-294)||(31612313-31612363)
chr1 (184-278)||(41050042-41050138)
chr1 (246-294)||(433012-433060)
chr1 (244-300)||(15860121-15860177)
chr1 (184-295)||(21840766-21840876)
chr1 (194-293)||(21161720-21161818)
chr1 (235-294)||(22123171-22123230)
chr1 (184-276)||(26064959-26065052)
chr1 (246-296)||(16361915-16361965)
chr1 (244-294)||(21475199-21475249)
chr1 (38-188)||(35981547-35981696)
chr1 (221-294)||(16275455-16275526)
chr1 (244-293)||(21714546-21714595)
chr1 (129-190)||(1924911-1924972)
chr1 (129-190)||(20923925-20923986)
chr1 (226-278)||(21533923-21533974)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (34-297)||(13210184-13210448)
chr3 (34-293)||(16097332-16097594)
chr3 (69-293)||(12174152-12174376)
chr3 (34-293)||(16103784-16104045)
chr3 (34-290)||(32307684-32307933)
chr3 (36-293)||(9512924-9513171)
chr3 (36-293)||(9520899-9521146)
chr3 (34-297)||(15470927-15471189)
chr3 (34-293)||(49667940-49668193)
chr3 (34-188)||(49389485-49389639)
chr3 (34-290)||(1644539-1644787)
chr3 (36-297)||(14234487-14234753)
chr3 (34-135)||(12934167-12934268)
chr3 (34-278)||(37251022-37251270)
chr3 (184-278)||(52523735-52523831)
chr3 (174-297)||(11424758-11424880)
chr3 (221-297)||(12399209-12399284)
chr3 (221-297)||(20698481-20698556)
chr3 (221-297)||(26686887-26686962)
chr3 (184-297)||(14972854-14972967)
chr3 (184-297)||(18438534-18438647)
chr3 (122-297)||(24340665-24340844)
chr3 (221-297)||(13442274-13442349)
chr3 (221-297)||(23083407-23083482)
chr3 (194-294)||(27165250-27165350)
chr3 (194-294)||(53301569-53301669)
chr3 (122-297)||(37642207-37642386)
chr3 (221-297)||(17487856-17487931)
chr3 (221-297)||(17499338-17499413)
chr3 (221-297)||(43840932-43841007)
chr3 (184-294)||(17672626-17672735)
chr3 (232-294)||(28194693-28194755)
chr3 (184-278)||(22110358-22110454)
chr3 (196-297)||(23274687-23274788)
chr3 (184-278)||(43925977-43926073)
chr3 (34-188)||(1465266-1465419)
chr3 (199-281)||(14572605-14572686)
chr3 (184-294)||(24153217-24153326)
chr3 (221-297)||(25476431-25476506)
chr3 (184-279)||(42386428-42386523)
chr3 (112-297)||(43550456-43550644)
chr3 (244-294)||(6469246-6469296)
chr3 (244-294)||(7781459-7781509)
chr3 (244-294)||(8499518-8499568)
chr3 (244-294)||(9707719-9707769)
chr3 (244-294)||(10556985-10557035)
chr3 (184-278)||(12377940-12378036)
chr3 (244-294)||(15412429-15412479)
chr3 (244-294)||(15977515-15977565)
chr3 (244-294)||(17463178-17463228)
chr3 (244-294)||(17737236-17737286)
chr3 (244-294)||(28848723-28848773)
chr3 (244-294)||(29172695-29172745)
chr3 (244-294)||(34159326-34159376)
chr3 (184-294)||(36166598-36166706)
chr3 (244-294)||(45577950-45578000)
chr3 (244-294)||(45607019-45607069)
chr3 (244-294)||(55476491-55476541)
chr3 (244-294)||(55500942-55500992)
chr3 (122-297)||(22147467-22147646)
chr3 (244-292)||(16282923-16282971)
chr3 (244-292)||(41123892-41123940)
chr3 (244-295)||(13544024-13544075)
chr3 (184-294)||(40213729-40213838)
chr3 (244-294)||(8899094-8899144)
chr3 (244-294)||(10247835-10247885)
chr3 (244-294)||(12119837-12119887)
chr3 (244-290)||(12567564-12567610)
chr3 (244-294)||(16454393-16454443)
chr3 (244-294)||(38962003-38962053)
chr3 (244-294)||(44494809-44494859)
chr3 (244-294)||(50242822-50242872)
chr3 (244-281)||(21618462-21618499)
chr3 (244-294)||(13151902-13151953)
chr3 (244-294)||(13154367-13154418)
chr3 (228-278)||(606378-606428)
chr3 (244-294)||(17446767-17446816)
chr3 (244-278)||(53070765-53070799)
chr3 (224-281)||(14576881-14576937)
chr3 (129-190)||(19776031-19776092)
chr3 (129-190)||(37439418-37439479)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (76-297)||(23071849-23072070)
chr2 (38-293)||(25175854-25176112)
chr2 (34-292)||(28405981-28406243)
chr2 (34-296)||(22134072-22134326)
chr2 (134-293)||(7679589-7679750)
chr2 (34-281)||(18786757-18787008)
chr2 (34-159)||(22459416-22459541)
chr2 (34-278)||(7587-7835)
chr2 (34-278)||(23207296-23207544)
chr2 (199-297)||(38138-38235)
chr2 (129-297)||(19671830-19672001)
chr2 (34-278)||(23791292-23791541)
chr2 (221-297)||(20309108-20309184)
chr2 (199-297)||(23654409-23654507)
chr2 (114-297)||(23708553-23708738)
chr2 (221-294)||(298860-298933)
chr2 (221-297)||(23060513-23060588)
chr2 (221-297)||(23103441-23103516)
chr2 (221-297)||(23285865-23285940)
chr2 (221-297)||(23076442-23076517)
chr2 (221-297)||(8946657-8946732)
chr2 (221-297)||(22731280-22731355)
chr2 (225-294)||(22105412-22105480)
chr2 (244-297)||(22337115-22337168)
chr2 (244-297)||(23040257-23040310)
chr2 (184-297)||(23660023-23660135)
chr2 (34-278)||(25108906-25109155)
chr2 (200-278)||(22413160-22413240)
chr2 (244-297)||(22738247-22738300)
chr2 (221-296)||(32215012-32215085)
chr2 (235-294)||(45029958-45030016)
chr2 (244-294)||(571397-571447)
chr2 (244-294)||(6725995-6726045)
chr2 (244-294)||(18808943-18808993)
chr2 (244-294)||(23130862-23130912)
chr2 (244-294)||(23133329-23133379)
chr2 (244-294)||(23135590-23135640)
chr2 (244-294)||(23709644-23709694)
chr2 (244-294)||(23712125-23712175)
chr2 (244-294)||(26505379-26505429)
chr2 (244-294)||(26507857-26507907)
chr2 (244-294)||(28577099-28577149)
chr2 (244-294)||(34402634-34402684)
chr2 (244-294)||(38967374-38967424)
chr2 (244-294)||(39682313-39682363)
chr2 (184-278)||(20520200-20520295)
chr2 (244-292)||(43137301-43137349)
chr2 (244-291)||(21155172-21155219)
chr2 (235-294)||(24529633-24529691)
chr2 (244-291)||(24643062-24643109)
chr2 (244-294)||(24367774-24367824)
chr2 (244-294)||(32039610-32039660)
chr2 (244-294)||(24898307-24898358)
chr2 (244-294)||(24900790-24900841)
chr2 (244-294)||(24903267-24903318)
chr2 (244-294)||(24905744-24905795)
chr2 (244-294)||(24908219-24908270)
chr2 (226-276)||(23287384-23287433)
chr2 (228-278)||(32451981-32452031)
chr2 (129-190)||(1283690-1283751)
chr2 (184-278)||(23004767-23004863)
chr2 (184-278)||(24697613-24697709)
chr2 (227-276)||(26392403-26392451)
chr2 (129-190)||(30344773-30344834)
chr2 (31-59)||(23071815-23071843)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (36-278)||(6831-7073)
scaffold0556 (34-215)||(8097-8281)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (31-250)||(29132-29354)
scaffold0218 (34-281)||(7931-8179)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (34-293)||(45647-45909)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (34-281)||(10396-10646)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (31-242)||(2297-2508)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (34-281)||(129921-130171)
scaffold0010 (184-278)||(60723-60818)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (34-293)||(160688-160949)
scaffold0001 (244-294)||(85692-85742)
scaffold0001 (244-290)||(501088-501134)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (34-293)||(133-394)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (129-297)||(1022-1190)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (34-281)||(22529-22775)
scaffold0037 (244-294)||(82072-82122)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (34-297)||(12766-13032)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (34-281)||(1098-1348)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (36-297)||(6535-6798)
scaffold0621 (34-281)||(8482-8735)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (36-297)||(5980-6244)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (34-281)||(10543-10793)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (36-293)||(19268-19528)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (34-278)||(53403-53651)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (34-293)||(40029-40291)
scaffold0023 (34-293)||(100378-100640)
scaffold0023 (225-297)||(119875-119947)
scaffold0023 (216-293)||(101503-101580)
scaffold0023 (34-77)||(101616-101659)
scaffold0023 (244-294)||(44454-44504)
scaffold0023 (244-294)||(94411-94461)
scaffold0023 (244-290)||(17552-17598)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (34-293)||(132662-132917)
scaffold0028 (40-279)||(62216-62455)
scaffold0028 (244-294)||(136680-136730)
scaffold0028 (244-294)||(139149-139199)
scaffold0028 (244-294)||(144087-144137)
scaffold0028 (244-294)||(134211-134261)
scaffold0028 (244-294)||(141618-141668)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (34-297)||(6611-6877)
scaffold0333 (34-297)||(13991-14257)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (46-293)||(32102-32345)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (36-281)||(5659-5906)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (36-293)||(2502-2762)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (34-297)||(32538-32801)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (36-297)||(892-1155)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (34-297)||(12942-13205)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (36-293)||(14554-14814)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (34-278)||(12587-12834)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (34-143)||(28666-28775)
scaffold0211 (225-293)||(28818-28887)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (34-293)||(2659-2923)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (194-297)||(15795-15898)
scaffold0020 (34-108)||(15687-15761)
scaffold0020 (244-293)||(178898-178947)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (34-278)||(136222-136471)
scaffold0021 (34-278)||(144930-145179)
scaffold0021 (221-296)||(174767-174842)
scaffold0021 (227-297)||(121766-121835)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (34-241)||(2073-2283)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (221-297)||(7266-7342)
scaffold0106 (221-297)||(1289-1365)
scaffold0106 (244-294)||(15306-15356)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (194-297)||(23901-24001)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (221-297)||(1094-1169)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (38-276)||(7917-8161)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (221-297)||(4712-4787)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (221-297)||(168024-168099)
scaffold0011 (221-297)||(51913-51988)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (34-281)||(103493-103736)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (184-296)||(3194-3306)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (184-297)||(3159-3271)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (184-281)||(16108-16205)
scaffold0357 (184-278)||(13147-13241)
scaffold0357 (226-278)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (184-281)||(27757-27854)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (221-297)||(10468-10544)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (221-297)||(16282-16358)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (221-297)||(16113-16188)
scaffold0120 (199-297)||(32980-33077)
scaffold0120 (199-297)||(45928-46025)
scaffold0120 (244-297)||(17397-17450)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (221-297)||(51582-51658)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (184-295)||(39479-39589)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (222-297)||(46995-47070)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (184-295)||(75223-75333)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (122-297)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (122-297)||(38198-38377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (65-278)||(128855-129072)
scaffold0022 (35-274)||(78345-78587)
scaffold0022 (244-294)||(116430-116480)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (221-297)||(1094-1170)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (221-297)||(13497-13572)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (221-297)||(4849-4924)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (221-297)||(32067-32142)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (199-278)||(1051-1130)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (221-297)||(6167-6245)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (221-296)||(17263-17337)
scaffold0056 (244-278)||(79396-79430)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (199-297)||(15487-15584)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (34-143)||(2158-2267)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (221-294)||(5173-5246)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (221-297)||(11489-11564)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (221-297)||(13211-13286)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (194-294)||(38720-38820)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (221-297)||(1851-1926)
scaffold0016 (129-190)||(207470-207531)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (199-294)||(339972-340065)
scaffold0003 (244-294)||(158562-158612)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (184-290)||(26073-26179)
scaffold0122 (221-294)||(44753-44825)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (131-281)||(25122-25276)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (122-297)||(17969-18148)
scaffold0247 (244-294)||(2241-2291)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (184-297)||(38761-38873)
scaffold0145 (194-297)||(32942-33044)
scaffold0145 (244-299)||(9744-9799)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (221-297)||(1952-2027)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (34-278)||(6137-6386)
scaffold0420 (231-278)||(13793-13840)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (221-297)||(343-418)
scaffold0292 (221-297)||(3470-3545)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (34-278)||(97024-97272)
scaffold0006 (34-278)||(106302-106550)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (194-297)||(39913-40015)
scaffold0080 (37-278)||(19742-19987)
scaffold0080 (129-190)||(48936-48997)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (194-297)||(25896-25998)
scaffold0026 (194-297)||(39858-39960)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (221-297)||(8479-8554)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (245-297)||(8598-8650)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (223-297)||(16648-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (221-279)||(24349-24406)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (184-278)||(569-664)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (184-278)||(267679-267775)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (34-274)||(38339-38584)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (230-297)||(4888-4954)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (244-294)||(13392-13442)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (244-294)||(20747-20797)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (244-294)||(22886-22936)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (244-294)||(16784-16834)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (244-294)||(37821-37871)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (184-295)||(10772-10882)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (194-278)||(2694-2780)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (229-297)||(20910-20978)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (244-291)||(4300-4347)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (244-295)||(9241-9292)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (244-294)||(106-156)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (244-294)||(4694-4744)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (34-100)||(9275-9341)
scaffold0475 (194-239)||(9136-9181)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (244-294)||(13947-13997)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (244-294)||(40400-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (248-294)||(161206-161252)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (34-278)||(1652-1900)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (253-294)||(12064-12105)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (244-293)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (244-293)||(36454-36503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (246-294)||(4214-4262)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (244-296)||(12361-12413)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (244-280)||(29946-29982)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (244-291)||(1393-1440)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (225-276)||(4545-4595)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (129-278)||(20373-20524)
scaffold0031 (243-297)||(128751-128805)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (244-278)||(11982-12016)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (129-190)||(30-91)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (244-297)||(4508-4560)
scaffold0228 (244-297)||(12090-12142)
scaffold0228 (244-297)||(22042-22094)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (244-296)||(11286-11338)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Original strand, 5866129 - 5866395
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866129 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 5866228  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5866229 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 5866328  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866329 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17141181 - 17140916
Alignment:
Q  32 ttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141181 ttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctta 17141082  T
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgc 17140982  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140981 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21491261 - 21490995
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491261 gttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgctt 21491162  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  21491161 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactg 21491062  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491061 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21255488 - 21255222
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255488 gttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 21255390  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  21255389 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactg 21255290  T
Q  231 cctatgttg-ttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    | ||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255289 cttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21249650 - 21249384
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249650 gttcaagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 21249552  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  21249551 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactg 21249452  T
Q  231 cctatgttg-ttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    | ||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249451 cttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Original strand, 26355557 - 26355815
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26355557 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 26355656  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   || | |||||   |||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  26355657 gttatataattgtatatacattaaatggaatatg-ttgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcct 26355755  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26355756 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6520632 - 6520368
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||    
T  6520632 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaa 6520533  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  6520532 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 6520434  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6520433 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 38855107 - 38855372
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  38855107 cgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 38855206  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  38855207 atgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 38855305  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38855306 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Original strand, 23760698 - 23760962
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttc---cagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgctta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |      
T  23760698 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgt 23760797  T
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   ||||  |||| |||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  23760798 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatac 23760896  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760897 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21285863 - 21285613
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||| ||| |  ||    
T  21285863 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgtta 21285764  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  21285763 atgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 21285664  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21285663 cctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20498829 - 20498581
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||  ||||| || |||||| |||||    
T  20498829 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttata 20498730  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| |   ||  |||||    
T  20498729 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatact 20498630  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498629 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21673967 - 21673720
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||  ||| |   |||||  |||||||| |  |||    
T  21673967 agttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 21673869  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| || | |||  || |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||    
T  21673868 tggtatataattgtatatacattaaataaattatatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgc 21673770  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21673769 ctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 983257 - 983511
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttacc---ttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |   ||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| | ||||||| |     
T  983257 cgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttg 983356  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtat 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  | | ||| ||    
T  983357 ataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcat 983456  T
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  983457 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21396025 - 21396101
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21396025 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21790518 - 21790594
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21790518 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21389495 - 21389571
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21389495 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21778821 - 21778897
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21778821 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgatggattgt 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| |||||||||||||  |||     
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 17612158  T
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971257
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22626848 - 22626736
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626848 tgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22626750  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  22626749 gaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21919046 - 21919121
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919046 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37116615 - 37116366
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | |||    
T  37116615 cgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaata 37116516  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||    
T  37116515 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtac 37116416  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37116415 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6759381 - 6759255
Alignment:
Q  174 ataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcgg 272  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759381 ataattgagatgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 6759283  T
Q  273 tctaagttgttgaagatgatgatgtcca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6759282 tctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7372853 - 7372778
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372853 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 16199693 - 16199765
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199693 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 18818455 - 18818530
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18818455 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 18879277 - 18879352
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18879277 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23406454 - 23406379
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23406454 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 278
Target Start/End: Original strand, 17439439 - 17439609
Alignment:
Q  113 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttat 209  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||||||||    
T  17439439 tatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17439538  T
Q  210 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17439539 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 296
Target Start/End: Original strand, 28649092 - 28649164
Alignment:
Q  223 gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28649092 gtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 16092388 - 16092463
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092388 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 17266847 - 17267096
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| |||| || ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  17266847 cgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 17266946  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--ac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| || |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||    || |||  ||    
T  17266947 atgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtac 17267046  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17267047 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20536283 - 20536208
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536283 ttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21923974 - 21924049
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21923974 ttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 45131042 - 45131117
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131042 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 290
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508199
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |   || ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 290
Target Start/End: Original strand, 13597637 - 13597731
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13597637 ttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22875177 - 22875065
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22875177 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 22875079  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  22875078 gaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41598238 - 41598188
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41598238 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24353134 - 24353039
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353134 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1484452 - 1484402
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1484452 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 5853404 - 5853454
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5853404 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 14409556 - 14409606
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14409556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 20046307 - 20046357
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20046307 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20403277 - 20403227
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20403277 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22001803 - 22001753
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22001803 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4483330 - 4483281
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4483330 ttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 15203343 - 15203393
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15203343 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 16413428 - 16413474
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16413428 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 278
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154989
Alignment:
Q  224 tatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219717
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290853
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 18862427 - 18862488
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18862427 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 18862488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21383981 - 21383920
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21383981 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgat 21383920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21387401 - 21387340
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21387401 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21387340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21411274 - 21411213
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21411274 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21411213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21805766 - 21805705
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21805766 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21805705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 21827796 - 21827857
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21827796 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21827857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34201051 - 34200786
Alignment:
Q  32 ttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201051 ttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctta 34200952  T
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 34200852  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200851 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Original strand, 11995882 - 11996148
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995882 gttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 11995981  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11995982 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactg 11996081  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996082 cctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Original strand, 28505153 - 28505419
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505153 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 28505252  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28505253 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactg 28505352  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28505353 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 15754744 - 15755008
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15754744 cgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttat 15754843  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  15754844 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacc 15754943  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15754944 tatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16495570 - 16495402
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16495570 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 68008 - 67745
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| || |||| |   |||||  |||||||| |  |||    
T  68008 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 67909  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  67908 tgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 67811  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  67810 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44014434 - 44014182
Alignment:
Q  38 ttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatg 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| || |||||    
T  44014434 ttgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatg 44014338  T
Q  137 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 236  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  44014337 gtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 44014239  T
Q  237 ttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44014238 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Original strand, 16219574 - 16219835
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||    
T  16219574 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaat 16219673  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  16219674 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 16219773  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16219774 tatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18005910 - 18005650
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  |||    
T  18005910 agttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 18005811  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  18005810 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgc 18005712  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18005711 ttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47832073 - 47831807
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||    ||    
T  47832073 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgcta 47831974  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  47831973 atgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactg 47831874  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47831873 tctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Original strand, 810988 - 811248
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||    
T  810988 agttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaat 811087  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  811088 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 811187  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  811188 tatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16056593 - 16056344
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  16056593 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgtta 16056494  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||| ||| ||    
T  16056493 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg-ttgtttgcataatg 16056395  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16056394 tctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22073181 - 22072913
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  22073181 cgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgtta 22073082  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatgg-attgtatac 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||     
T  22073081 atgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatag 22072982  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 20220044 - 20220290
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||| |||||    |||| || |||||| | |||    
T  20220044 cgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaata 20220143  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgc 231  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | ||||||    
T  20220144 atgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgc 20220243  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  20220244 ctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 16386293 - 16386369
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386293 ttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15113209 - 15113028
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||   ||||| || |||||  |||||    
T  15113209 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattata 15113110  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatc 212  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  15113109 atgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12901594 - 12901339
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggt---taa-aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgct 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||  |||    ||||| ||||||||| |    
T  12901594 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgtt 12901495  T
Q  130 tataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgta 225  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| || | || ||| |||| ||||||||||||||||||  |   |||||    
T  12901494 gttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgta 12901395  T
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12901394 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15116746 - 15116621
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || |||||  |||||    
T  15116746 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttata 15116647  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattac 159  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  15116646 atgtgatataattgtatatatattac 15116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 2280127 - 2280238
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||      
T  2280127 tgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-- 2280224  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
     |||||||||||||    
T  2280225 aaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12698906 - 12698831
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12698906 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 3564372 - 3564482
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564372 tgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3564470  T
Q  283 tgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||    
T  3564471 tgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9509265 - 9509189
Alignment:
Q  220 attgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509265 attgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38227593 - 38227481
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38227593 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagat 38227495  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  38227494 gaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 27847875 - 27847951
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27847875 ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 281
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868100
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga-- 216  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagc 1868035  T
Q  217 tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868036 tgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40443467 - 40443393
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40443467 ttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10589114 - 10589039
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10589114 ttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13647396 - 13647325
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13647396 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 18456421 - 18456530
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18456421 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T
Q  284 gaagatgatga 294  Q
     ||||||||||    
T  18456520 taagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16324270 - 16324197
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  16324270 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486865
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |  |||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26212071 - 26211995
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26212071 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255892
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtct 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044762
Alignment:
Q  113 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacat---tcgatattgttat 209  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14044836  T
Q  210 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||| ||  ||  || | |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044835 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354792
Alignment:
Q  113 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacat---tcgatattgttat 209  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14354866  T
Q  210 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||| ||  ||  || | |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354865 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 274
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga-- 216  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||||  |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  217 tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 274  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063939
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgat 10063937  T
Q  296 gt 297  Q
    ||    
T  10063938 gt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18430762 - 18430709
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18430762 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48273464 - 48273392
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48273464 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 456371 - 456321
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  456371 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11972546 - 11972496
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11972546 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 14949234 - 14949284
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14949234 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 15376825 - 15376875
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15376825 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16213734 - 16213684
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16213734 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16232570 - 16232520
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16232570 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16410109 - 16410059
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16410109 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 17062027 - 17062077
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17062027 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18640322 - 18640272
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18640322 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 20385235 - 20385285
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20385235 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 21189707 - 21189757
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21189707 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24702288 - 24702238
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24702288 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24704738 - 24704688
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24704738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32125541 - 32125491
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32125541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41522967 - 41522917
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41522967 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41525429 - 41525379
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41525429 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 11393399 - 11393448
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11393399 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991206
Alignment:
Q  224 tatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24275221 - 24275175
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27216910 - 27216860
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27216910 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44116559 - 44116509
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44116559 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144142
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 276
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 9389552 - 9389592
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9389552 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagtt 9389592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898535
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34390 - 34123
Alignment:
Q  30 tgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34390 tgttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgct 34291  T
Q  130 tataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34290 tataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatact 34191  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34190 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Original strand, 19660690 - 19660956
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660690 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 19660789  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19660790 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactg 19660889  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660890 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Original strand, 22959392 - 22959649
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  22959392 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaat 22959491  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22959492 gttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 22959591  T
Q  236 gttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22959592 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19669161 - 19668898
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaat--taatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||    
T  19669161 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttata 19669062  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||    
T  19669061 atgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtct 19668962  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19668961 atgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21565808 - 21565546
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21565808 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 21565709  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  21565708 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactg 21565609  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21565608 cctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 21329352 - 21329618
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  21329352 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 21329451  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  21329452 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactg 21329551  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21329552 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 21502009 - 21502277
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtta-aaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgctta 131  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |      
T  21502009 cgagttgatgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgt 21502108  T
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || || ||||   || |||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||    
T  21502109 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatac 21502208  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21502209 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 26011890 - 26012154
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||| ||||    ||| |  | |||||| |  |     
T  26011890 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttg 26011989  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  26011990 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactg 26012089  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26012090 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 20026795 - 20027043
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   |||| ||||||| ||||    ||||  ||||||||| | |||    
T  20026795 cgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgata 20026894  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| | |||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  ||| |||||    
T  20026895 atgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatact 20026994  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026995 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314577
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  296 gt 297  Q
    ||    
T  36314578 gt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21729110 - 21729185
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729110 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21808435 - 21808510
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808435 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25421607 - 25421532
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421607 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24529295 - 24529223
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529295 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 8286889 - 8286964
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286889 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21997580 - 21997655
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21997580 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 22178074 - 22178323
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||  || |    ||||| |  |||||| | |||    
T  22178074 cgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaata 22178173  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||    
T  22178174 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatac 22178273  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178274 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 23390542 - 23390617
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23390542 ttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22144162 - 22144068
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22144162 tgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24493681 - 24493569
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24493681 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24493583  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  24493582 gaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37723979 - 37723910
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37723979 ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13025386 - 13025311
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13025386 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13095570 - 13095495
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13095570 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 21293015 - 21293090
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21293015 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9078025 - 9077952
Alignment:
Q  223 gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9078025 gtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22412296 - 22412187
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22412296 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T
Q  284 gaagatgatga 294  Q
     ||||||||||    
T  22412197 taagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22075094 - 22075018
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22075094 ttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725853
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| |||||||||| |||| || |  |||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36314719 - 36314672
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36314719 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgata 36314672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1096520 - 1096467
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1096520 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25431469 - 25431395
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  25431469 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20909063 - 20909012
Alignment:
Q  243 tttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20909063 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 264880 - 264930
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  264880 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10733052 - 10733102
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10733052 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29329984 - 29329934
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29329984 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245136
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39363434 - 39363384
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39363434 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 294
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  246 gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 89
Target Start/End: Original strand, 21741400 - 21741455
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  21741400 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgtt 21741455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345980
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 42245477 - 42245527
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42245477 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 20902121 - 20902158
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  247 ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  247 ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32027451 - 32027393
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32027451 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 281
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10753688 - 10753627
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10753688 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 10753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 22120146 - 22120207
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22120146 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22120207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11292
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11558 gttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 11459  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11458 ataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 11359  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2229 - 1997
Alignment:
Q  65 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2229 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 2130  T
Q  165 ttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgca 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2129 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgca 2030  T
Q  265 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28489 - 28414
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28489 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  241 tgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15552082 - 15551817
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552082 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgctt 15551984  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15551983 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactg 15551884  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551883 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16596914 - 16596686
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596914 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgctt 16596815  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||     
T  16596814 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacta 16596715  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaag 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16596714 cctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12774263 - 12774011
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  12774263 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 12774164  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||        |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  12774163 atg--------ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 12774073  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12774072 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 13705 - 13953
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||    
T  13705 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttata 13804  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  13805 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 13904  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13905 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8846638 - 8846360
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  8846638 cgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 8846539  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat------------------tta-cattcgatattgttatatcat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||                  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  8846538 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcat 8846439  T
Q  215 gatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8846438 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 39706144 - 39706409
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||    |||||  |||||||| |  ||    
T  39706144 cgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgcta 39706243  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  39706244 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 39706342  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39706343 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Original strand, 12288066 - 12288315
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  ||||    
T  12288066 agttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaat 12288165  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgc 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  12288166 gttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgc 12288265  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288266 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 43198410 - 43198660
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  43198410 cgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttata 43198506  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtata 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| | |||||   || |||| ||||| ||||||||||||  ||  ||| |||    
T  43198507 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcata 43198606  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198607 ttgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12902832 - 12902757
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902832 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17046560 - 17046487
Alignment:
Q  224 tatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046560 tatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7088952 - 7088877
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7088952 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7798849 - 7798774
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7798849 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 52243202 - 52243301
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243202 tgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 52873413 - 52873488
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52873413 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 53082005 - 53082254
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaa-aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||    
T  53082005 cgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 53082104  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtg---ttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtata 227  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||   ||||||| | || ||||||||||||||||||  ||  || | ||    
T  53082105 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 53082203  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082204 ctgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 14053346 - 14053422
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14053346 ttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 46640311 - 46640558
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  ||||    ||||| || |||||| | ||     
T  46640311 cgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatg 46640409  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  46640410 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatac 46640508  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46640509 tgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 16377531 - 16377639
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16377531 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16377628  T
Q  284 gaagatgatga 294  Q
    |||||| ||||    
T  16377629 gaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22636510 - 22636437
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22636510 ttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Original strand, 23374405 - 23374473
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23374405 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6899966 - 6899891
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6899966 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7893778 - 7893703
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893778 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44052904 - 44052829
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44052904 ttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Original strand, 16270254 - 16270356
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  16270353 atgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15099613 - 15099461
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | ||||    
T  15099613 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataa 15099514  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15099513 tgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 54798800 - 54798872
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  54798800 ttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15190581 - 15190428
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | |||    
T  15190581 cgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgata 15190482  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15190481 atgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 16239978 - 16240090
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  16239978 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgat 16240076  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  16240077 gaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 44928970 - 44929042
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44928970 ttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14038723 - 14038653
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14038723 ttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 12419 - 12469
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12419 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 1837621 - 1837671
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1837621 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14280366 - 14280316
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14280366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 15118464 - 15118514
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15118464 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 18215386 - 18215436
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18215386 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239581
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 23803377 - 23803427
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23803377 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44615338 - 44615288
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44615338 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 44773199 - 44773249
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44773199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222501
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 51463980 - 51464030
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51463980 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52312560 - 52312510
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52312560 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 19618225 - 19618336
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19618225 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19618322  T
Q  283 tgaagatgatgatg 296  Q
    | |||||| |||||    
T  19618323 ttaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3515057 - 3515007
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3515057 ttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574985
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355483
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 630725 - 630786
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  630725 ttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgat 630786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3332055 - 3331994
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3332055 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 3331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 13812760 - 13812821
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13812760 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 13812821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 14953912 - 14953973
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14953912 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 14953973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970856
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25690231 - 25690170
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25690231 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 25690170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15927 - 15664
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15927 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgctt 15828  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15827 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactg 15728  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15727 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 28496329 - 28496592
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28496329 cgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttata 28496428  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28496429 atgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcct 28496528  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28496529 atgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 29808740 - 29809003
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29808740 cgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttata 29808839  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29808840 atgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcct 29808939  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29808940 atgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1561567 - 1561303
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1561567 cgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttat 1561468  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  1561467 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacc 1561368  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1561367 tatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19652459 - 19652199
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  19652459 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 19652360  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | |||||  ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  19652359 atgttatataattgtatatactttaaatggattatg-ttgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 19652261  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19652260 ctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19668638 - 19668387
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||    
T  19668638 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgata 19668539  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||    
T  19668538 atgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatact 19668439  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
      |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668438 atctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20109407 - 20109140
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    ||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||    
T  20109407 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttata 20109308  T
Q  134 atgttatata--attgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtata 227  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||| ||| ||  ||| |||    
T  20109307 atgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcata 20109208  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20109207 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23019672 - 23019425
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||| | |  ||    
T  23019672 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgtta 23019573  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  23019572 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 23019473  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019472 cttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333339
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  296 gt 297  Q
    ||    
T  27333338 gt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394079
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  296 gt 297  Q
    ||    
T  27394078 gt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 9098380 - 9098619
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||           
T  9098380 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgtt------- 9098472  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
         |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || |||||  | |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||    
T  9098473 -----atataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatact 9098567  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098568 gcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16496319 - 16496244
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496319 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35245662 - 35245586
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 16920675 - 16920751
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16920675 ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 20638329 - 20638404
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20638329 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 19303549 - 19303661
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19303549 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 19303647  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  19303648 gaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29060615 - 29060540
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060615 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 281
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185926
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227632
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| |||||||||| |||| || |  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 17287842 - 17287917
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17287842 ttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 22780273 - 22780348
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22780273 ttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35008416 - 35008167
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | |||    
T  35008416 cgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaata 35008317  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtg---ttgatttacattcgatattgttatatcatg--atggattgtatac 228  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  || || ||   ||||||  || | |||||| |||||||  |  |||  || | |||    
T  35008316 atgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtac 35008217  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35008216 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25644427 - 25644336
Alignment:
Q  191 ttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644427 ttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 296
Target Start/End: Original strand, 18409875 - 18409947
Alignment:
Q  223 gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409875 gtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11185581 - 11185517
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 285  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185581 ttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 20361006 - 20361081
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20361006 ttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Original strand, 22080594 - 22080800
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagact-gatgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||| ||||||| ||  ||   |||||  ||||| || |  |    
T  22080594 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgtt 22080693  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg--atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |   |||  ||||| |||||   | | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  22080694 aatgttatataaatgtatatacattatattaattatg-acgatgtttgagatgttgttctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactg 22080792  T
Q  231 cctatgtt 238  Q
    ||||||||    
T  22080793 cctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186383
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 25629363 - 25629476
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||  |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629363 tgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25629461  T
Q  283 tgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||    
T  25629462 tgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 27333140 - 27333214
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    
T  27333140 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctga 27333214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 27393880 - 27393954
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    
T  27393880 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctga 27393954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22782411 - 22782227
Alignment:
Q  112 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---ggtgttgatttacattcgatattgtt 207  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || || ||||||||   | |||||| || |||| |||||| ||    
T  22782411 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 22782313  T
Q  208 atatcatgatg-gattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    || ||||| ||   |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22782312 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25656700 - 25656629
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25656700 ttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 2291292 - 2291342
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2291292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852179
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8055079 - 8055029
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8055079 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12742367 - 12742317
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12742367 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 18334704 - 18334754
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18334704 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19005096 - 19005046
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19005096 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 19859031 - 19859081
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19859031 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20593846 - 20593773
Alignment:
Q  223 gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20593846 gtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24422597 - 24422547
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24422597 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25754859 - 25754809
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25754859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 26924752 - 26924802
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26924752 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33861844 - 33861794
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33861844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33864328 - 33864278
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33864328 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 30676763 - 30676874
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30676763 tgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 30676860  T
Q  283 tgaagatgatgatg 296  Q
    | |||||| |||||    
T  30676861 ttaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541073
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1595599 - 1595549
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  1595599 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 4668069 - 4668135
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4668069 cgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 4674916 - 4674982
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4674916 cgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4674982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 20557004 - 20557054
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20557004 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 4668229 - 4668274
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4668229 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4668274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 4675076 - 4675121
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4675076 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Original strand, 22080802 - 22080846
Alignment:
Q  253 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22080802 aactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23076997 - 23076865
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||    
T  23076997 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataa 23076898  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgactta 167  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  23076897 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaatta 23076865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  224 tatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34963423 - 34963371
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34963423 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 4185679 - 4185745
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | || |||| ||||||||||    
T  4185679 cgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagt 4185745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18456769 - 18456735
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18456769 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18461929 - 18461895
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821946
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25688552 - 25688502
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  25688552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22949469 - 22949408
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22949469 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22949408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22953425 - 22953364
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22953425 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22953364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23871913 - 23871852
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23871913 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23871852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23875869 - 23875808
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23875869 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23875808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 27325385 - 27325446
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27325385 ttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgat 27325446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Original strand, 31155415 - 31155514
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttg-tttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  31155415 cattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgat 31155513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20918870 - 20918620
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20918870 gttcgacttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgctt 20918771  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  20918770 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 20918671  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918670 cctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33681273 - 33681010
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  33681273 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 33681174  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  33681173 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 33681074  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681073 cctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 52927837 - 52928075
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  52927837 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 52927936  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||         ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  52927937 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg---------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtct 52928027  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928028 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20248539 - 20248283
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  20248539 agttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgt-ccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataat 20248441  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  20248440 gatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 20248341  T
Q  236 gttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20248340 gttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22237894 - 22237630
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctg-ttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| || |    
T  22237894 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttct 22237795  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  22237794 aaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataat 22237695  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237694 gcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 14295504 - 14295672
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  14295504 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21754301 - 21754052
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  21754301 cgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 21754202  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||        |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21754201 atg--------ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 21754111  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21754110 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Original strand, 22921724 - 22921986
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |    
T  22921724 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtt 22921823  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  22921824 aatgttatataattgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 22921922  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22921923 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 22130843 - 22130975
Alignment:
Q  112 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatat 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22130843 ttatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatat 22130942  T
Q  212 catgatggattgtatactgcctatgttgttgtt 244  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22130943 catgatggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 21896113 - 21896358
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||   |||| ||||||| ||||   |||||| || |||||| |||||    
T  21896113 cgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgt---tgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttata 21896209  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  21896210 atgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatact 21896309  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896310 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 21861424 - 21861672
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||| ||||   ||||||  | |||||| |||||    
T  21861424 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttata 21861523  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  21861524 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatact 21861623  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  21861624 gcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51130732 - 51130632
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  51130732 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  51130632 t 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatgga 220  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtt 35261122  T
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261123 ttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 27250775 - 27250850
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250775 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 50210259 - 50210333
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210259 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20637113 - 20636975
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| ||||    |||   ||||||||| | ||||    
T  20637113 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataa 20637014  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20637013 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttg 20636975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758665
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34509855 - 34509783
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34509855 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 16368141 - 16368388
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  16368141 cgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 16368240  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||     |||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| |    
T  16368241 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgc 16368338  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16368339 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21026755 - 21026680
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21026755 ttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12271813 - 12271695
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||       ||| || |||||  |||||    
T  12271813 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-------tgagttgatgttatttata 12271721  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattac 159  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  12271720 atgtgatataattgtatatatattac 12271695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Original strand, 38801439 - 38801508
Alignment:
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38801439 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 45574937 - 45575008
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45574937 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 50614123 - 50614219
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50614123 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 50621951 - 50622047
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50621951 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22532344 - 22532269
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22532344 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 49261605 - 49261481
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| | ||    |||    |||||||| | |||    
T  49261605 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgata 49261506  T
Q  134 atgttatataattgtatatacatta 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49261505 atgttatataattgtatatacatta 49261481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 296
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50686879 - 50686630
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    |||||    |||||| | |||    
T  50686879 cgagttgacgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaata 50686780  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--ac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||    
T  50686779 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaac 50686680  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||  |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  50686679 tgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  121 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg----atttacattcgatattgttatatcatga 216  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  217 --tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
      ||  || |||||||||||||||| | ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13988916 - 13988866
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13988916 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 21923403 - 21923453
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21923403 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 23593847 - 23593897
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23593847 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29776738 - 29776688
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29776738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31612363 - 31612313
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31612363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 41050042 - 41050138
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   || |||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050042 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 433060 - 433012
Alignment:
Q  246 gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  433060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21840876 - 21840766
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21840876 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21840779  T
Q  283 tgaagatgatgat 295  Q
    | |||||| ||||    
T  21840778 ttaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21161818 - 21161720
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  | ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  21161818 cattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123230
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26065052 - 26064959
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgta--tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26065052 tgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  246 gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 21475199 - 21475249
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  21475199 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 35981547 - 35981696
Alignment:
Q  38 ttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgt 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | |||||||    
T  35981547 ttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgt 35981646  T
Q  138 tatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  35981647 tatataattgcatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 16275455 - 16275526
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16275455 ttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 1924911 - 1924972
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1924911 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1924972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 20923925 - 20923986
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20923925 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 20923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 13210184 - 13210448
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13210184 cgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttat 13210283  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13210284 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcc 13210383  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210384 tatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16097594 - 16097332
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16097594 cgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 16097495  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||    
T  16097494 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattg 16097395  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16097394 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174376
Alignment:
Q  69 taagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaa 168  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  169 gtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgag 268  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12174351  T
Q  269 tcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12174352 tcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16104045 - 16103784
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||    
T  16104045 cgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttata 16103946  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16103945 atgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 16103846  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16103845 ctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32307933 - 32307684
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32307933 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttata 32307834  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||        |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  32307833 atg--------ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 32307743  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32307742 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9513171 - 9512924
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9513171 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9513072  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 235  Q
    |        || ||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9513071 g--------ttttatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 9512982  T
Q  236 gttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9512981 gttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9521146 - 9520899
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9521146 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9521047  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 235  Q
    |        |  ||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9521046 g--------tgttatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 9520957  T
Q  236 gttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9520956 gttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15471189 - 15470927
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    |||||  ||| |||| |  ||    
T  15471189 cgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgtta 15471091  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  15471090 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 15470991  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470990 cctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Original strand, 49667940 - 49668193
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||    
T  49667940 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgtatata 49668039  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgattta---cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||| |        |||||||| ||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||  || |   |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  49668040 atgct--------gtatatactttaaatggattatgtt-gataaatgagatgtttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 49668130  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  49668131 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Original strand, 49389485 - 49389639
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  49389485 cgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 49389584  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  49389585 atgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 1644539 - 1644787
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  1644539 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 1644638  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||        |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| | ||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  1644639 atg--------ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatattgttgattgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgc 1644729  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1644730 ctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14234753 - 14234487
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttc--cagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||||   ||||||| ||||    | | |  |||||||| |  ||    
T  14234753 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgcta 14234654  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  14234653 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 14234554  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  14234553 cctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Original strand, 12934167 - 12934268
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  12934167 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 12934266  T
Q  134 at 135  Q
    ||    
T  12934267 at 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 37251022 - 37251270
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  37251022 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaata 37251121  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  37251122 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatac 37251220  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251221 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 52523735 - 52523831
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52523735 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 297
Target Start/End: Original strand, 11424758 - 11424880
Alignment:
Q  174 ataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggt 273  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11424758 ataattgagatgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 11424856  T
Q  274 ctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  11424857 ctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12399284 - 12399209
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399284 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 20698481 - 20698556
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20698481 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26686962 - 26686887
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26686962 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14972967 - 14972854
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972967 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14972869  T
Q  283 tgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||    
T  14972868 tgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18438647 - 18438534
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18438647 tgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 18438549  T
Q  283 tgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||    
T  18438548 tgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340844
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |   || ||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13442349 - 13442274
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442349 ttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 23083407 - 23083482
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083407 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27165350 - 27165250
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||  ||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27165350 catttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  27165250 a 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 53301569 - 53301669
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  53301569 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  53301669 a 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642386
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |  |||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17487931 - 17487856
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17487931 ttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17499413 - 17499338
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17499413 ttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43841007 - 43840932
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  43841007 ttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17672735 - 17672626
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17672735 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 17672638  T
Q  283 tgaagatgatga 294  Q
    | ||||||||||    
T  17672637 ttaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 22110358 - 22110454
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22110358 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274687
Alignment:
Q  196 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgat 23274689  T
Q  296 gt 297  Q
    ||    
T  23274688 gt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43926073 - 43925977
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43926073 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Original strand, 1465266 - 1465419
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactg--atgcttatgaattaatgttgctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |    |||||||||| |||   || ||||    |||||||| | |    
T  1465266 cgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttat--tctaatgttgatga 1465363  T
Q  132 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1465364 taatgttatacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14572686 - 14572605
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||| |||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572686 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 24153217 - 24153326
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153217 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T
Q  284 gaagatgatga 294  Q
     ||||||||||    
T  24153316 taagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 25476431 - 25476506
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25476431 ttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42386523 - 42386428
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagt 279  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386523 tgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 297
Target Start/End: Original strand, 43550456 - 43550644
Alignment:
Q  112 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagg---tgttgatttacattcgatattgtt 207  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||||    |||||| || |||| |||||| ||    
T  43550456 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 43550554  T
Q  208 atatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    || ||||| ||  || | ||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43550555 atgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 6469246 - 6469296
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6469246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 7781459 - 7781509
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7781459 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 9707719 - 9707769
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9707719 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12378036 - 12377940
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgt-tattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12378036 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctatt-aactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17463228 - 17463178
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17463228 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 28848723 - 28848773
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28848723 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 29172695 - 29172745
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29172695 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34159376 - 34159326
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34159376 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36166706 - 36166598
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36166706 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T
Q  284 gaagatgatga 294  Q
     ||||||||||    
T  36166608 taagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 45607019 - 45607069
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45607019 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55476541 - 55476491
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55476541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55500992 - 55500942
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55500992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| |||| ||||| |||| || |  |||   ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13544075 - 13544024
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  13544075 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Original strand, 40213729 - 40213838
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggat-tgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40213729 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 40213826  T
Q  283 tgaagatgatga 294  Q
    | ||||||||||    
T  40213827 ttaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8899144 - 8899094
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8899144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247885
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12567610 - 12567564
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12567610 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 16454393 - 16454443
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16454393 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 38962003 - 38962053
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  38962003 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50242872 - 50242822
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  50242872 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21618499 - 21618462
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618499 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 13151902 - 13151953
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13151902 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 13154367 - 13154418
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13154367 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 278
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 17446767 - 17446816
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17446767 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Original strand, 53070765 - 53070799
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53070765 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 281
Target Start/End: Original strand, 14576881 - 14576937
Alignment:
Q  224 tatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14576881 tatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19776092 - 19776031
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19776092 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 19776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 37439418 - 37439479
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  37439418 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 37439479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 76 - 297
Target Start/End: Original strand, 23071849 - 23072070
Alignment:
Q  76 tttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 175  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071849 tttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 23071948  T
Q  176 aattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtct 275  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23071949 aattgagttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggact 23072048  T
Q  276 aagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23072049 aagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25176112 - 25175854
Alignment:
Q  38 ttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||||    
T  25176112 ttgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatg 25176013  T
Q  137 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 233  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25176012 ttatataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcct 25175914  T
Q  234 atgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28406243 - 28405981
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| || ||    |||||  || ||||| |  |    
T  28406243 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 28406144  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatac 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||    
T  28406143 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatac 28406045  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28406044 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Original strand, 22134072 - 22134326
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  22134072 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttata 22134171  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||        |||||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||| ||||  |  || |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  22134172 atg--------ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttattgattgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgc 22134262  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  22134263 ctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 18786757 - 18787008
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| || |    ||||| | ||||||  | |||    
T  18786757 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgata 18786856  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  18786857 atgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatact 18786956  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
     ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786957 acctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 22459416 - 22459541
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || || || |||||  |||||    
T  22459416 cgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttata 22459515  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattac 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22459516 atgtgatataattgtatatacattac 22459541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 7587 - 7835
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | || ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  ||    
T  7587 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgtta 7686  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 7786  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23207544 - 23207296
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  23207544 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 23207445  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat--tgaggtgt---tgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtat 226  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||   || |||||  |||| |||   |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||    
T  23207444 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaatta---tttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatat 23207348  T
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23207347 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38235
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgatggattgta 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||| ||||| ||   | | ||||||||| |||||||||||||  ||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgca 19671902  T
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23791541 - 23791292
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  23791541 cgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 23791442  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | | ||  ||||   | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  || | |||    
T  23791441 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtac 23791342  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791341 tgcctatgttgttgtttgcttatt-aactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20309184 - 20309108
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309184 ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Original strand, 23654409 - 23654507
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654409 gatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708738
Alignment:
Q  114 atgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgt---tgatttacattcgatattgttat 209  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| |  ||||| |||   |||||| || | |||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  210 atcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 298860 - 298933
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  298860 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23060588 - 23060513
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060588 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 23103441 - 23103516
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23103441 ttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23285940 - 23285865
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23285940 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23076517 - 23076442
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23076517 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 22731280 - 22731355
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22731280 ttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22105480 - 22105412
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22105480 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22337168 - 22337115
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22337168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23660135 - 23660023
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||  ||  | ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  23660135 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgat 23660037  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  23660036 gaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25109155 - 25108906
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||| |||||||| | | | | | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  25109155 cgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 25109056  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggt---gttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgta--tac 228  Q
    || | |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |   ||||||||   || ||||||||||||||||||   ||| ||  |||    
T  25109055 atatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtac 25108956  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108955 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 22413160 - 22413240
Alignment:
Q  200 atattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413160 atattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738300
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 32215012 - 32215085
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32215012 ttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030016
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 571447 - 571397
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  571447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6726045 - 6725995
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6726045 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18808993 - 18808943
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18808993 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23130912 - 23130862
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23130912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23133379 - 23133329
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23133379 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23135640 - 23135590
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23135640 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 23709644 - 23709694
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23709644 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 23712125 - 23712175
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23712125 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26505429 - 26505379
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26505429 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26507907 - 26507857
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26507907 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 34402634 - 34402684
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34402634 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39682363 - 39682313
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39682363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 20520200 - 20520295
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20520200 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Original strand, 21155172 - 21155219
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21155172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Original strand, 24529633 - 24529691
Alignment:
Q  235 tgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24529633 tgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24367824 - 24367774
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  24367824 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039660
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 24898307 - 24898358
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24898307 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 24900790 - 24900841
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24900790 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 24903267 - 24903318
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24903267 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 24905744 - 24905795
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24905744 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 24908219 - 24908270
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24908219 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 278
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1283751 - 1283690
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1283751 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1283690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23004863 - 23004767
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||   ||| |||  ||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004863 tgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 24697613 - 24697709
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  |  | ||||||||| |||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697613 tgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 30344773 - 30344834
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30344773 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30344834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 59
Target Start/End: Original strand, 23071815 - 23071843
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagag 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071815 gttcgagttgatgtgagttgatcttagag 23071843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7073 - 6831
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7073 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataat 6974  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  6973 gttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 6874  T
Q  236 gttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6873 gttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8281 - 8097
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  8281 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgtta 8182  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||   | |||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  8181 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 250
Target Start/End: Original strand, 29132 - 29354
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29132 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 29231  T
Q  131 ata---atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtata 227  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  29232 ataattatgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaata 29331  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttat 250  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  29332 ctacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 7931 - 8179
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| | |||    
T  7931 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgt---tgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgata 8027  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  8028 atgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatact 8127  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8128 gcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Original strand, 45647 - 45909
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  45647 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 45746  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  45747 atgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 45846  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45847 cctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 10396 - 10646
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10396 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 10495  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  10496 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 10595  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10596 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Original strand, 2297 - 2508
Alignment:
Q  31 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2297 gttcgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 2396  T
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |    
T  2397 ataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacgg 2496  T
Q  231 cctatgttgttg 242  Q
     ||| |||||||    
T  2497 tctaagttgttg 2508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 130171 - 129921
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |    
T  130171 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttaca 130072  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  130071 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 129972  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  129971 cctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Original strand, 60723 - 60818
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  60723 tgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 160949 - 160688
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  160949 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 160850  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  160849 atgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 160750  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  160749 ctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 501134 - 501088
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  501134 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 394 - 133
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  394 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttata 296  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  295 atattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 196  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  195 cctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1190
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  1022 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 22529 - 22775
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    | |||||| |||||    
T  22529 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttata 22624  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  22625 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 22724  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22725 tctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 82122 - 82072
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  82122 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13032 - 12766
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||    |||||  |||||||| |  ||    
T  13032 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttatta 12933  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||    
T  12932 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattg 12833  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12832 cctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1098
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |  ||    
T  1348 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgtta 1249  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttac---attcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||  |||||||   |   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  1248 atgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 1149  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1148 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6535
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||    
T  6798 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 6700  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  6699 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 6601  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6600 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8735 - 8482
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  8735 cgagttgatgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttata 8636  T
Q  134 atgttatata--attgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtata 227  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||    
T  8635 atgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcata 8536  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8535 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6244
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 135  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||    
T  5980 agttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaat 6079  T
Q  136 gttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  6080 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 6179  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6180 tatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10793 - 10543
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||    
T  10793 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgtta 10694  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  10693 atgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 10594  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10593 cctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19528 - 19268
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||  |||||    |||||  |||||||| |  |||    
T  19528 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 19429  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  19428 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 19330  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19329 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 53403 - 53651
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||    
T  53403 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttata 53502  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  53503 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 53602  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||    
T  53603 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Original strand, 40029 - 40291
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  | |||||| |  |    
T  40029 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgtt 40128  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  40129 aatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctact 40227  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  40228 gcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 100640 - 100378
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| || | |   |||||  |||||||| |  |    
T  100640 cgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgtt 100541  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||||   | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  100540 aatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatact 100442  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  100441 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101503
Alignment:
Q  216 atggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 101659 - 101616
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101659 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 101616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44504 - 44454
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 94461 - 94411
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  94461 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17598
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 132917 - 132662
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  132917 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 132818  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatg-gattgtatactg 230  Q
    ||||| ||      ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||     
T  132817 atgttgta------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatacta 132725  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  132724 cttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 62455 - 62216
Alignment:
Q  40 gatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||| || |  |||||||    
T  62455 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgtt 62356  T
Q  139 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgtt 62257  T
Q  239 gttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagt 279  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  62256 gctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 136730 - 136680
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  136730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 139199 - 139149
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  139199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 144137 - 144087
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  144137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 134261 - 134211
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  134261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 141668 - 141618
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  141668 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6877 - 6611
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  |||    |||||  |||||||| |  ||    
T  6877 cgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgtta 6778  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  6777 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactg 6678  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6677 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14257 - 13991
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  |||    |||||  |||||||| |  ||    
T  14257 cgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgtta 14158  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  14157 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactg 14058  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14057 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32102
Alignment:
Q  46 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||        
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta---- 32250  T
Q  146 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatg-gattgtatactgcctatgttgttg 242  Q
      ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||||    
T  32249 --tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttg 32153  T
Q  243 tttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  32152 tttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5906 - 5659
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||    
T  5906 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 5808  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  5807 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgc 5709  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5708 ctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Original strand, 2502 - 2762
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||    
T  2502 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 2601  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||||||    
T  2602 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgc 2700  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2701 ctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32801 - 32538
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||  |  ||    
T  32801 cgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgtta 32702  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  32701 atgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgc 32602  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  32601 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Original strand, 892 - 1155
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaat-taatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||   || | ||| |||||||| |  |||    
T  892 agttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaa--ttgtaaatctaatgttgttgctaa 989  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||| ||||||||||||||||   || ||||| |    
T  990 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactac 1089  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1090 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13205 - 12942
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||     || |  |||||||| |  ||    
T  13205 cgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgcta 13106  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  13105 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactg 13006  T
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13005 cctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 293
Target Start/End: Original strand, 14554 - 14814
Alignment:
Q  36 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||  |  |||    
T  14554 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaa 14653  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgc 231  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||   ||||||    
T  14654 tggtatataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgc 14752  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14753 ctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12587
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| || |||  ||| | || |||||| |||||    
T  12834 cgagtggatgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttata 12735  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | | | || ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  12734 atgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatact 12636  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12635 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 28666 - 28775
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  28666 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 28765  T
Q  134 atgttatata 143  Q
    ||||||||||    
T  28766 atgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtt-tgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Original strand, 2659 - 2923
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  || ||||| |  |    
T  2659 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgtt 2758  T
Q  133 aatgttatataattgtatata----cattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgta 225  Q
    |||| ||||  ||||||||||    ||||  |||| ||||| | |||| ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |    
T  2759 aatggtata--attgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgca 2855  T
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2856 tactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15898
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  15895 atgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 15687 - 15761
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  15687 cgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 136222 - 136471
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || ||||||| |  |    
T  136222 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgtt 136321  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||| |||    
T  136322 aatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtac 136421  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| | ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  136422 tgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 144930 - 145179
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || ||||||| |  |    
T  144930 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgtt 145029  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||| |||    
T  145030 aatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtac 145129  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| | ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  145130 tgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 174842 - 174767
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  174842 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  227 actgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 241
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2283
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||   ||||||| |  |    
T  2073 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgtt 2172  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatact 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  2173 aatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatact 2271  T
Q  230 gcctatgttgtt 241  Q
    ||||||||||||    
T  2272 gcctatgttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 7266
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7342 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1289
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1365 ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24001
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatg 23997  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 1094 - 1169
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 276
Target Start/End: Original strand, 7917 - 8161
Alignment:
Q  38 ttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||    
T  7917 ttgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgt 8016  T
Q  138 tatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga----ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgc 231  Q
     |||||||| |||||||||||| ||| |||  | |||   || |    | |||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  ||| |||||||    
T  8017 gatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgc 8116  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    ||||| || | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  8117 ctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4787 - 4712
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4787 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 168024 - 168099
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168024 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51988 - 51913
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51988 ttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 103493 - 103736
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  ||    
T  103493 cgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgtta 103592  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgc 231  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||      | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||| |    
T  103593 atgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgtatgat------gttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactac 103686  T
Q  232 ctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||| ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103687 ctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttg 103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 3194 - 3306
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3194 tgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3292  T
Q  283 tgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||||||    
T  3293 tgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Original strand, 3159 - 3271
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3159 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3257  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  3258 gaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 16108 - 16205
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108 tgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13241 - 13147
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13241 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 27757 - 27854
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757 tgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10544
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16358 - 16282
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358 ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16188 - 16113
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16188 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Original strand, 32980 - 33077
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32980 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46025 - 45928
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46025 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51658 - 51582
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51658 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39589 - 39479
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39589 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39491  T
Q  284 gaagatgatgat 295  Q
    ||||| ||||||    
T  39490 gaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47070 - 46995
Alignment:
Q  222 tgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47070 tgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Original strand, 75223 - 75333
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75223 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 75321  T
Q  284 gaagatgatgat 295  Q
    ||||| ||||||    
T  75322 gaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11464
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38377
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 278
Target Start/End: Original strand, 128855 - 129072
Alignment:
Q  65 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 164  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  128855 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaa 128954  T
Q  165 ttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaag 259  Q
    |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  128955 ttatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaag 129053  T
Q  260 ctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||||||||||||||    
T  129054 ctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 78587 - 78345
Alignment:
Q  35 gagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 134  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| |  |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||    
T  78587 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 78488  T
Q  135 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatact 229  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||     |||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| ||    
T  78487 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgct 78390  T
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 274  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  78389 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116430
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 1094 - 1170
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1094 ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13572 - 13497
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13572 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4924 - 4849
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4924 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32142 - 32067
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32142 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1051
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6245
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtt--tgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6167 ttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 17263 - 17337
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17263 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79430
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15584
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 2158 - 2267
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |  | | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  2158 cgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 2257  T
Q  134 atgttatata 143  Q
    ||||| ||||    
T  2258 atgttgtata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 5173 - 5246
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5173 ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 11489 - 11564
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11489 ttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13286 - 13211
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13286 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38820
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  38720 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatg 38819  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  38820 a 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1851
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1926 ttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 207470 - 207531
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  207470 ttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgat 207531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 294
Target Start/End: Original strand, 339972 - 340065
Alignment:
Q  199 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  339972 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 158562 - 158612
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  158562 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 290
Target Start/End: Original strand, 26073 - 26179
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26073 tgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26171  T
Q  283 tgaagatg 290  Q
    ||||||||    
T  26172 tgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 44753 - 44825
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44753 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25122
Alignment:
Q  131 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgta 225  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||| ||||||||||||  ||  || ||    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  226 tactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18148
Alignment:
Q  122 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  218 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |   || ||| ||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2291
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38873 - 38761
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 283  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  38873 tgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgat 38775  T
Q  284 gaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||    
T  38774 gaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32942
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  32945 atgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcc 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2027 - 1952
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2027 ttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 6137 - 6386
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||  |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| |  ||    
T  6137 cgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttatta 6236  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||    
T  6237 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatac 6336  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6337 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  231 cctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 343
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  418 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3545 - 3470
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3545 ttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 97272 - 97024
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | |||    
T  97272 cgagttgatgtgagttgatcat-ggggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaata 97174  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||    
T  97173 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtac 97074  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  97073 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 106550 - 106302
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | |||    
T  106550 cgagttgatgtgagttgatcat-ggggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaata 106452  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||    
T  106451 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtac 106352  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  106351 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40015 - 39913
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40015 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  39916 atgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 19742 - 19987
Alignment:
Q  37 gttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatg 136  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||  |||    ||||| || |||||  | ||||||    
T  19742 gttgatatgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatg 19841  T
Q  137 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcc 232  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |  || || ||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||||||    
T  19842 tgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatgctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcc 19941  T
Q  233 tatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  19942 tatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 48936 - 48997
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48936 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 48997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25998 - 25896
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25998 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg 25900  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  25899 atgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39960 - 39858
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||| |||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39960 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T
Q  294 atgt 297  Q
    ||||    
T  39861 atgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8554 - 8479
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8554 ttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 297
Target Start/End: Original strand, 8598 - 8650
Alignment:
Q  245 tgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8598 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 297
Target Start/End: Original strand, 16648 - 16721
Alignment:
Q  223 gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16648 gtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 24349 - 24406
Alignment:
Q  221 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagt 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24349 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 664 - 569
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  664 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 267775 - 267679
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  267775 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38584 - 38339
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 133  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || ||||||    ||    
T  38584 cgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagatta 38485  T
Q  134 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatac 228  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||| |   || |||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||    
T  38484 atgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatac 38385  T
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 274  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  38384 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  230 gcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13442 - 13392
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13442 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20797 - 20747
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20797 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22936 - 22886
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22936 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16834 - 16784
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16834 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37871 - 37821
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37871 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10882 - 10772
Alignment:
Q  184 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 282  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10882 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 10785  T
Q  283 tgaagatgatgat 295  Q
    | |||||| ||||    
T  10784 ttaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgt-tattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattga-ctaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20978 - 20910
Alignment:
Q  229 tgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20978 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9241
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 106
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4744 - 4694
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  4744 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9275
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  9341 cgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9181 - 9136
Alignment:
Q  194 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9181 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13997 - 13947
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13997 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40400
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  248 tattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 278
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1900
Alignment:
Q  34 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttaa-aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  || ||| || ||  |||||||||||| ||||    ||||| || | |||| | ||    
T  1652 cgagttgatgtgagttgatctt-gagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaat 1750  T
Q  133 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtata 227  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||  | ||||  ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   || ||||    
T  1751 aatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatata 1849  T
Q  228 ctgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    || ||||||||  |||| |||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1850 ctacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12105 - 12064
Alignment:
Q  253 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12105 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  246 gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 294  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12413
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29946
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4595 - 4545
Alignment:
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 276  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4595 atactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 278
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagg---tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgt 224  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgt 20472  T
Q  225 atactgcctatgttgttgtttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    ||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20473 atactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  243 tttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11982
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaag 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 30
Alignment:
Q  129 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 190  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  91 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4508
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4560 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12142 - 12090
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  12142 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22094 - 22042
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 297  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  22094 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11338 - 11286
Alignment:
Q  244 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 296  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  11338 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 979 times since January 2019
Visitors: 2242