View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_15 (Length: 269)

Name: NF0172_low_15
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_15
NF0172_low_15
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-258)||(19886483-19886740)
chr2 (29-258)||(11231161-11231393)
chr2 (29-258)||(22513008-22513240)
chr2 (29-258)||(28775630-28775862)
chr2 (29-258)||(24685604-24685836)
chr2 (1-207)||(8944019-8944226)
chr2 (29-207)||(12728593-12728772)
chr2 (29-165)||(23777963-23778100)
chr2 (134-258)||(24826522-24826646)
chr2 (29-207)||(34824676-34824855)
chr2 (29-207)||(42177845-42178024)
chr2 (29-170)||(3798516-3798658)
chr2 (29-207)||(16935794-16935973)
chr2 (29-207)||(17006454-17006633)
chr2 (29-165)||(12641560-12641697)
chr2 (29-207)||(12635744-12635923)
chr2 (62-207)||(23774370-23774516)
chr2 (62-165)||(5888548-5888652)
chr2 (1-80)||(25265402-25265481)
chr2 (31-119)||(21142098-21142187)
chr2 (1-77)||(19794719-19794795)
chr2 (1-77)||(20627328-20627404)
chr2 (1-80)||(462910-462989)
chr2 (1-80)||(7507856-7507935)
chr2 (1-80)||(8891414-8891493)
chr2 (2-61)||(24341420-24341479)
chr2 (1-60)||(43642989-43643048)
chr2 (1-80)||(14906452-14906531)
chr2 (1-80)||(19689413-19689492)
chr2 (1-80)||(23820243-23820322)
chr2 (1-80)||(36982453-36982532)
chr2 (134-207)||(25213372-25213446)
chr2 (1-80)||(17396665-17396743)
chr2 (1-80)||(20015183-20015262)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-265)||(12547-12811)
chr5 (1-265)||(21073410-21073674)
chr5 (1-258)||(18777814-18778071)
chr5 (1-258)||(19500072-19500328)
chr5 (1-258)||(22366302-22366560)
chr5 (1-258)||(4199807-4200064)
chr5 (1-258)||(25426801-25427058)
chr5 (1-258)||(43443220-43443474)
chr5 (1-258)||(29188107-29188363)
chr5 (29-258)||(10777793-10778025)
chr5 (1-232)||(27010014-27010244)
chr5 (29-258)||(21932204-21932436)
chr5 (29-258)||(21938374-21938606)
chr5 (29-258)||(35582237-35582469)
chr5 (29-232)||(7425525-7425729)
chr5 (29-258)||(22882907-22883139)
chr5 (29-258)||(36989593-36989825)
chr5 (29-208)||(11211940-11212120)
chr5 (29-207)||(35790974-35791153)
chr5 (29-258)||(17471411-17471643)
chr5 (29-207)||(23514762-23514941)
chr5 (29-207)||(1219396-1219575)
chr5 (134-258)||(11343008-11343134)
chr5 (62-207)||(23328791-23328937)
chr5 (62-207)||(24616395-24616541)
chr5 (62-207)||(24712771-24712917)
chr5 (62-207)||(24745789-24745935)
chr5 (4-80)||(34939452-34939528)
chr5 (1-80)||(18531079-18531158)
chr5 (1-80)||(22053845-22053924)
chr5 (134-258)||(16105967-16106093)
chr5 (1-80)||(23507137-23507216)
chr5 (2-80)||(25900418-25900496)
chr5 (1-80)||(20623141-20623220)
chr5 (1-80)||(21233540-21233619)
chr5 (1-80)||(27182559-27182638)
chr5 (1-80)||(37052916-37052995)
chr5 (1-80)||(16536369-16536448)
chr5 (1-77)||(32950867-32950943)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-258)||(27653805-27654062)
chr6 (1-232)||(25175736-25175968)
chr6 (1-154)||(16825678-16825833)
chr6 (1-258)||(14625952-14626209)
chr6 (29-258)||(16376196-16376428)
chr6 (29-258)||(16383520-16383752)
chr6 (29-258)||(10488900-10489132)
chr6 (29-258)||(22251389-22251621)
chr6 (29-258)||(22225561-22225793)
chr6 (1-165)||(1650022-1650184)
chr6 (29-232)||(16232093-16232297)
chr6 (58-258)||(19299467-19299670)
chr6 (29-247)||(16555973-16556194)
chr6 (29-247)||(16632529-16632750)
chr6 (29-232)||(18086674-18086878)
chr6 (29-207)||(1556206-1556385)
chr6 (29-207)||(19610219-19610398)
chr6 (62-232)||(29869627-29869798)
chr6 (29-207)||(23977970-23978149)
chr6 (149-258)||(16814820-16814930)
chr6 (29-165)||(13620712-13620849)
chr6 (1-161)||(29666046-29666208)
chr6 (1-80)||(35009451-35009530)
chr6 (4-78)||(15862646-15862720)
chr6 (4-80)||(1657760-1657836)
chr6 (1-78)||(23153619-23153696)
chr6 (7-79)||(27751603-27751675)
chr6 (134-207)||(4991396-4991470)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-258)||(13910846-13911103)
chr7 (1-258)||(10989582-10989841)
chr7 (1-258)||(16478785-16479041)
chr7 (1-258)||(2437630-2437889)
chr7 (1-232)||(13572849-13573079)
chr7 (29-258)||(7822929-7823161)
chr7 (29-258)||(7830240-7830472)
chr7 (29-258)||(27176634-27176866)
chr7 (29-258)||(27101460-27101692)
chr7 (29-258)||(27108808-27109040)
chr7 (29-258)||(38783552-38783784)
chr7 (29-232)||(18979872-18980076)
chr7 (29-232)||(15927769-15927973)
chr7 (29-258)||(15950613-15950846)
chr7 (1-165)||(18253761-18253926)
chr7 (29-207)||(15759990-15760169)
chr7 (29-207)||(13758571-13758750)
chr7 (83-165)||(15862174-15862257)
chr7 (29-170)||(14250811-14250953)
chr7 (29-165)||(48622584-48622721)
chr7 (1-80)||(13321188-13321267)
chr7 (62-165)||(16418731-16418835)
chr7 (1-80)||(47481043-47481122)
chr7 (62-165)||(10000288-10000392)
chr7 (1-80)||(11580751-11580830)
chr7 (3-80)||(13037026-13037103)
chr7 (3-80)||(16211940-16212017)
chr7 (1-80)||(11516399-11516478)
chr7 (1-80)||(15441576-15441655)
chr7 (1-80)||(30262141-30262220)
chr7 (134-208)||(15516719-15516793)
chr7 (1-80)||(7293188-7293267)
chr7 (1-61)||(36052836-36052896)
chr7 (1-80)||(3060138-3060217)
chr7 (1-80)||(25292350-25292429)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-258)||(36266-36523)
scaffold0023 (41-254)||(169736-169951)
scaffold0023 (29-207)||(153883-154062)
scaffold0023 (1-80)||(48770-48849)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-258)||(31497-31754)
scaffold0008 (1-80)||(128181-128260)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-258)||(30120895-30121153)
chr8 (1-258)||(24549154-24549410)
chr8 (1-258)||(6774082-6774337)
chr8 (2-258)||(21851786-21852043)
chr8 (1-258)||(21844393-21844651)
chr8 (1-229)||(16674245-16674471)
chr8 (29-258)||(271183-271415)
chr8 (29-258)||(644505-644737)
chr8 (29-258)||(830240-830472)
chr8 (55-258)||(15318982-15319188)
chr8 (55-258)||(15499351-15499557)
chr8 (29-258)||(22088617-22088849)
chr8 (29-207)||(22006134-22006313)
chr8 (29-207)||(13720804-13720983)
chr8 (29-207)||(16195432-16195611)
chr8 (54-207)||(13662141-13662295)
chr8 (29-170)||(16872964-16873106)
chr8 (1-80)||(16404987-16405066)
chr8 (4-76)||(17345744-17345816)
chr8 (1-80)||(24928803-24928882)
chr8 (1-86)||(43373474-43373559)
chr8 (1-80)||(16193728-16193807)
chr8 (1-80)||(5238259-5238338)
chr8 (1-80)||(22907226-22907305)
chr8 (1-80)||(24661260-24661339)
chr8 (1-80)||(43685718-43685797)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-258)||(10644392-10644648)
chr4 (1-207)||(47357827-47358030)
chr4 (29-232)||(15287096-15287300)
chr4 (29-258)||(18169171-18169403)
chr4 (29-232)||(15294205-15294409)
chr4 (62-232)||(22351915-22352086)
chr4 (29-207)||(7131941-7132120)
chr4 (29-207)||(20000924-20001103)
chr4 (29-165)||(19020687-19020824)
chr4 (31-165)||(18248421-18248556)
chr4 (29-170)||(17145570-17145712)
chr4 (54-156)||(8378377-8378480)
chr4 (62-207)||(26339253-26339399)
chr4 (29-127)||(22738470-22738568)
chr4 (1-80)||(15675101-15675180)
chr4 (134-232)||(14952085-14952183)
chr4 (1-80)||(10104262-10104341)
chr4 (1-80)||(54118256-54118335)
chr4 (1-61)||(31115801-31115861)
chr4 (1-80)||(122061-122140)
chr4 (91-165)||(9795490-9795564)
chr4 (1-61)||(13246602-13246662)
chr4 (1-80)||(10488734-10488813)
chr4 (1-80)||(16327938-16328017)
chr4 (1-80)||(26680372-26680451)
chr4 (29-80)||(33240900-33240951)
chr4 (133-207)||(14996444-14996518)
chr4 (1-52)||(13048261-13048312)
chr4 (132-165)||(8378491-8378524)
chr4 (1-61)||(40885585-40885645)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-236)||(13171-13404)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (1-232)||(55316392-55316622)
chr3 (1-232)||(41270248-41270478)
chr3 (29-258)||(49232637-49232869)
chr3 (29-258)||(1467562-1467794)
chr3 (29-258)||(12264614-12264847)
chr3 (1-208)||(16821312-16821517)
chr3 (29-258)||(12812042-12812274)
chr3 (29-258)||(22275410-22275642)
chr3 (1-165)||(15615006-15615168)
chr3 (29-207)||(15468216-15468395)
chr3 (29-207)||(25058940-25059119)
chr3 (29-207)||(18911194-18911373)
chr3 (1-165)||(15936553-15936718)
chr3 (29-207)||(18896920-18897099)
chr3 (29-165)||(12902008-12902145)
chr3 (1-165)||(15938395-15938560)
chr3 (29-207)||(5228514-5228692)
chr3 (3-165)||(54651632-54651795)
chr3 (3-207)||(14842446-14842650)
chr3 (1-80)||(15859036-15859115)
chr3 (1-80)||(51158030-51158109)
chr3 (29-165)||(44229186-44229323)
chr3 (1-80)||(12030159-12030238)
chr3 (1-80)||(13839066-13839145)
chr3 (1-80)||(17912495-17912573)
chr3 (1-80)||(2049982-2050061)
chr3 (1-80)||(2449250-2449329)
chr3 (133-207)||(8268609-8268683)
chr3 (133-207)||(8275709-8275783)
chr3 (1-77)||(11986181-11986257)
chr3 (1-77)||(16744130-16744206)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-232)||(1153-1383)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-258)||(43170-43427)
scaffold0076 (29-258)||(39304-39536)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-232)||(5072237-5072467)
chr1 (29-258)||(18059581-18059813)
chr1 (29-258)||(17148768-17149001)
chr1 (29-258)||(17004839-17005071)
chr1 (1-204)||(22227981-22228185)
chr1 (1-204)||(22232678-22232882)
chr1 (29-258)||(38054914-38055146)
chr1 (1-165)||(2116427-2116589)
chr1 (1-165)||(45051595-45051757)
chr1 (58-258)||(19962322-19962525)
chr1 (1-127)||(18601071-18601197)
chr1 (27-170)||(46523588-46523731)
chr1 (62-207)||(22035681-22035827)
chr1 (62-207)||(7640810-7640956)
chr1 (1-80)||(20445851-20445930)
chr1 (1-80)||(20913202-20913281)
chr1 (1-80)||(20931517-20931596)
chr1 (1-80)||(20531616-20531695)
chr1 (1-80)||(20893638-20893717)
chr1 (1-80)||(37844462-37844541)
chr1 (134-208)||(15861284-15861358)
chr1 (1-80)||(41394394-41394473)
chr1 (1-80)||(51452664-51452743)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-258)||(20936-21195)
scaffold0139 (1-258)||(13882-14140)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (54-223)||(29388-29558)
scaffold0213 (197-258)||(29565-29627)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-207)||(3135-3341)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (29-258)||(31510-31742)
scaffold0107 (29-117)||(39847-39935)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-165)||(9266-9428)
scaffold0215 (1-165)||(16164-16326)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-232)||(64372-64607)
scaffold0026 (1-165)||(107919-108084)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-207)||(3895-4102)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-207)||(5088-5295)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-207)||(208-411)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (54-207)||(10624-10778)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (31-258)||(7278-7509)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (29-207)||(1390-1569)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (29-207)||(1451-1630)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (29-258)||(2593-2826)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (62-232)||(6831-7002)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (64-232)||(23600-23769)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (134-258)||(130880-131006)
scaffold0028 (1-80)||(89466-89545)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (29-165)||(10257-10394)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-165)||(45203-45369)
scaffold0066 (3-165)||(54591-54755)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (29-165)||(54075-54212)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-165)||(34374-34551)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (1-127)||(3586-3712)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (29-165)||(34076-34213)
scaffold0012 (3-80)||(247454-247531)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (62-165)||(12045-12149)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (1-86)||(3362-3447)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-77)||(41820-41896)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (62-165)||(7443-7547)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-80)||(8192-8271)
scaffold0162 (5-80)||(26427-26502)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (1-165)||(13678-13855)
scaffold0132 (134-166)||(42677-42709)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (5-165)||(12289-12449)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-80)||(546-625)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-80)||(6076-6155)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-80)||(3594-3673)
scaffold0266 (1-80)||(1296-1375)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-80)||(968-1047)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-80)||(9021-9100)
scaffold0025 (1-61)||(148893-148953)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (141-232)||(154282-154373)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-80)||(5701-5780)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-80)||(19378-19457)
scaffold0195 (1-80)||(21462-21541)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-80)||(48359-48438)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (91-165)||(13268-13342)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-80)||(123176-123255)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (134-258)||(17115-17241)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-80)||(9050-9129)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-80)||(41901-41980)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-80)||(51194-51273)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-77)||(36928-37004)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-80)||(22712-22791)
scaffold0141 (1-80)||(26967-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-80)||(1594-1673)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-80)||(37078-37157)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-80)||(172077-172156)
scaffold0001 (1-80)||(177780-177859)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-77)||(56114-56190)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (5-80)||(5073-5148)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-61)||(272197-272257)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19886740 - 19886483
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886740 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 19886641  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19886640 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattca 19886541  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886540 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 19886483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11231393 - 11231161
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11231393 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 11231294  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  11231293 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 11231194  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11231193 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 11231161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22513240 - 22513008
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22513240 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22513141  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  22513140 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 22513041  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22513040 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28775862 - 28775630
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28775862 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 28775763  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  28775762 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 28775663  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28775662 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 28775630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24685836 - 24685604
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24685836 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 24685737  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  24685736 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 24685637  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  24685636 caagctttcccttcaacacttttgttcttctct 24685604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 8944019 - 8944226
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8944019 gtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 8944118  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||     
T  8944119 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 8944218  T
Q  200 agctccta 207  Q
    ||||||||    
T  8944219 agctccta 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 12728593 - 12728772
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12728593 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 12728692  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  12728693 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23778100 - 23777963
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23778100 catcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 23778001  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778000 ttgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826522
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 24826547  T
Q  234 cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  24826546 cccttcaaccctcttgctcttctct 24826522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 34824676 - 34824855
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34824676 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 34824775  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  34824776 ttgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42178024 - 42177845
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42178024 catcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 42177925  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || ||||||||||||| ||||    
T  42177924 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagccccta 42177845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3798658 - 3798516
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3798658 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 3798559  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 170  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3798558 ttatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 3798516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 16935794 - 16935973
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16935794 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 16935893  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  ||  |||||||||||||||||    
T  16935894 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctccta 16935973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 17006454 - 17006633
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17006454 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 17006553  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  ||  |||||||||||||||||    
T  17006554 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctccta 17006633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12641697 - 12641560
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12641697 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 12641598  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641597 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 12641560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12635923 - 12635744
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12635923 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaaa 12635824  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  12635823 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 23774370 - 23774516
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23774370 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt 23774469  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  23774470 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888548
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  5888652 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 5888553  T
Q  161 acctt 165  Q
    |||||    
T  5888552 acctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25265481 - 25265402
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25265481 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagca 25265402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 21142098 - 21142187
Alignment:
Q  31 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 119  Q
    |||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142098 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19794795 - 19794719
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  19794795 gtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 19794719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20627404 - 20627328
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  20627404 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 20627328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 462910 - 462989
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  462910 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 462989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7507935 - 7507856
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7507935 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagca 7507856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 8891414 - 8891493
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  8891414 gtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagca 8891493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24341479 - 24341420
Alignment:
Q  2 taatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24341479 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 24341420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 43643048 - 43642989
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43643048 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaca 43642989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14906531 - 14906452
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  14906531 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 14906452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19689492 - 19689413
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19689492 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 19689413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 23820243 - 23820322
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23820243 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 23820322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 36982532 - 36982453
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  36982532 gtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 36982453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta-tccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17396743 - 17396665
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17396743 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 17396665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20015183 - 20015262
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20015183 gtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 20015262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 12547 - 12811
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 12646  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647 tttcatacaacatgagaaaatacaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattca 12746  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctctgctcctc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12747 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctcttctcctc 12811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21073674 - 21073410
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21073674 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccat 21073575  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073574 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 21073475  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctctgctcctc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21073474 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctcttctcctc 21073410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18778071 - 18777814
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18778071 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccat 18777972  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  18777971 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattca 18777872  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777871 gctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 18777814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 19500072 - 19500328
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19500072 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccat 19500171  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  19500172 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 19500271  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19500272 gctccta-gtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaactctcttgttcttctct 19500328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22366560 - 22366302
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22366560 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccat 22366461  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  22366460 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 22366361  T
Q  201 gctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22366360 actcctaggtcaccccacttgattgctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 22366302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4200064 - 4199807
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4200064 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcat 4199965  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  4199964 tttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatgattatgataatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 4199865  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4199864 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 4199807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 25426801 - 25427058
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426801 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 25426900  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatc-cttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||    
T  25426901 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattc 25427000  T
Q  200 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25427001 agctccta-gttacccacttgattctttaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 25427058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43443474 - 43443220
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43443474 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccat 43443375  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  43443374 tttcatataacatgagaatatgc--aattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 43443277  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43443276 gctcctaggtcacccacttgattcct-aagcttcccttcaaccctcatgctcttctct 43443220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29188363 - 29188107
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  29188363 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccat 29188264  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  29188263 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattataataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 29188166  T
Q  201 gctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29188165 gctcctaggtcaccccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 29188107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10778025 - 10777793
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10778025 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 10777926  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10777925 ttgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcct 10777826  T
Q  227 aaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10777825 caagcttccccttcaactctcttgttcttctct 10777793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27010014 - 27010244
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27010014 gtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 27010113  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||    
T  27010114 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattca 27010212  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27010213 gctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21932436 - 21932204
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21932436 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 21932337  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21932336 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 21932237  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21932236 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 21932204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21938606 - 21938374
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21938606 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 21938507  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21938506 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 21938407  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21938406 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 21938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 35582237 - 35582469
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35582237 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 35582336  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  35582337 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 35582436  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35582437 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 35582469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 7425525 - 7425729
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7425525 catcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 7425624  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7425625 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 7425724  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  7425725 aagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22883139 - 22882907
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22883139 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22883040  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |     
T  22883039 ttgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcc 22882940  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22882939 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22882907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36989825 - 36989593
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  36989825 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaaga 36989726  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  36989725 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 36989626  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36989625 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 36989593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11212120 - 11211940
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11212120 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 11212021  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 208  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||    
T  11212020 ttgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 11211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35791153 - 35790974
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35791153 catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 35791054  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  35791053 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 35790974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17471643 - 17471411
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17471643 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaat 17471544  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||  || ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  17471543 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 17471444  T
Q  227 aaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  17471443 caagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 17471411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 23514762 - 23514941
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23514762 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 23514861  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  23514862 ttgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 23514941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1219575 - 1219396
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1219575 catcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 1219476  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  1219475 ttgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343134
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  232 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctct 11343134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328937
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23328791 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 23328890  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  23328891 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616541
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24616395 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24616494  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24616495 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712917
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24712771 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24712870  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24712871 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745935
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24745789 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 24745888  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  24745889 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 34939452 - 34939528
Alignment:
Q  4 atttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34939452 atttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 34939528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18531158 - 18531079
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  18531158 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 18531079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22053924 - 22053845
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  22053924 gtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 22053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106093
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||     
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  232 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctct 16106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 23507137 - 23507216
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  23507137 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagca 23507216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25900496 - 25900418
Alignment:
Q  2 taatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25900496 taatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 25900418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20623141 - 20623220
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  20623141 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 20623220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21233619 - 21233540
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  21233619 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 21233540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27182638 - 27182559
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  27182638 gtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagca 27182559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 37052916 - 37052995
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  37052916 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 37052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 16536369 - 16536448
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16536369 gtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 16536448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 32950867 - 32950943
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32950867 gtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 32950943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27654062 - 27653805
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27654062 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccat 27653963  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  27653962 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaaccccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 27653863  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27653862 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 27653805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 25175736 - 25175968
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25175736 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccat 25175835  T
Q  101 tttcatacaacatgag-aaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatc-cttaatcctagcttcaatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||    
T  25175836 tttcatacaacatgagaaaaatgcaaaattatacatgattatggtaatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaatt 25175935  T
Q  199 cagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25175936 cagctccta-gtcacccacttgattccgaaagct 25175968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16825833 - 16825678
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaatta--tacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaaccc 98  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825833 gtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaaccc 16825734  T
Q  99 attttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16825733 attttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14626209 - 14625952
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| | | ||     
T  14626209 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaa 14626110  T
Q  101 tttcatacaacat--gagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaatt 198  Q
    || || |||||||  |||||  || ||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  14626109 tt-caaacaacatttgagaatttgtaaagtga-agatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaatt 14626012  T
Q  199 cagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14626011 cagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 14625952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16376428 - 16376196
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16376428 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 16376329  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16376328 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 16376229  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16376228 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 16376196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16383752 - 16383520
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16383752 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 16383653  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16383652 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 16383553  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16383552 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 16383520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 10488900 - 10489132
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10488900 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 10488999  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  10489000 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 10489099  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10489100 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 10489132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22251621 - 22251389
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22251621 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22251522  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22251521 ttgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 22251422  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22251421 caagctttccattcaacactcttgttcttctct 22251389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22225793 - 22225561
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22225793 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22225694  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22225693 ttgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 22225594  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22225593 caagctttccattcaacactcttgttcttctct 22225561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1650184 - 1650022
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1650184 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 1650085  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650084 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 16232093 - 16232297
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16232093 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 16232192  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232193 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 16232292  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  16232293 aagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Original strand, 19299467 - 19299670
Alignment:
Q  58 acagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaaccc 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19299467 acagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccc 19299566  T
Q  157 ccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttctt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19299567 ccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttctt 19299666  T
Q  255 ctct 258  Q
    ||||    
T  19299667 ctct 19299670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16556194 - 16555973
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16556194 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 16556095  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  16556094 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 16555995  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctct 247  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  16555994 caagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16632750 - 16632529
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16632750 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 16632651  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  16632650 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 16632551  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctct 247  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  16632550 caagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18086878 - 18086674
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18086878 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 18086779  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18086778 ttgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgatttcta 18086679  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  18086678 aagct 18086674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 1556206 - 1556385
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1556206 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 1556305  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || ||||||||||||||||||    
T  1556306 ttgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctccta 1556385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 19610219 - 19610398
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19610219 catcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaa 19610318  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  19610319 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 19610398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869627
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29869798 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt 29869699  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||| ||||  ||| | ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29869698 accttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 23977970 - 23978149
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23977970 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 23978069  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  23978070 ttgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814820
Alignment:
Q  149 actaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctct 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagcttcccttcaaacctct 16814831  T
Q  248 tgttcttctct 258  Q
    || ||||||||    
T  16814830 tgctcttctct 16814820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13620849 - 13620712
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13620849 catcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 13620750  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620749 ttgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 29666046 - 29666208
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| | ||||| |||||    
T  29666046 gtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcaccccat 29666145  T
Q  101 tttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaaccccctta 161  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666146 tttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35009530 - 35009451
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35009530 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagca 35009451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 15862646 - 15862720
Alignment:
Q  4 atttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 78  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15862646 atttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttag 15862720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1657836 - 1657760
Alignment:
Q  4 atttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1657836 atttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 1657760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23153619 - 23153696
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttag 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  23153619 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttag 23153696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751675
Alignment:
Q  7 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagc 79  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagc 27751675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgatta-tccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13911103 - 13910846
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13911103 gtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcat 13911004  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  13911003 tttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatgattatgataatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 13910904  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13910903 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 13910846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 10989582 - 10989841
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10989582 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccat 10989681  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  10989682 tttcatacaacatgagaatatgcaaaattatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaa 10989781  T
Q  201 gctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagcttcccttc-aaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  10989782 gctcctatgtcacctcacttgattcctcaagctccccttctaacactcttgatcttctct 10989841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16479041 - 16478785
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16479041 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccat 16478942  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16478941 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--aaatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttca 16478844  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16478843 gctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 16478785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 2437630 - 2437889
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  2437630 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccat 2437729  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  2437730 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 2437829  T
Q  201 gctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2437830 gctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcctgttcttctct 2437889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13572849 - 13573079
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13572849 gtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 13572948  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||    
T  13572949 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattca 13573047  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13573048 gctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 7822929 - 7823161
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7822929 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 7823028  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7823029 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 7823128  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7823129 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 7823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 7830240 - 7830472
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7830240 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 7830339  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7830340 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 7830439  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7830440 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 7830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 27176634 - 27176866
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27176634 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 27176733  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27176734 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 27176833  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27176834 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27176866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27101692 - 27101460
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27101692 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 27101593  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  27101592 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 27101493  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27101492 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27101460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27109040 - 27108808
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27109040 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 27108941  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  27108940 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 27108841  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27108840 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 27108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38783784 - 38783552
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38783784 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 38783685  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  38783684 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 38783585  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38783584 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 38783552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18980076 - 18979872
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18980076 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 18979977  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18979976 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 18979877  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  18979876 aagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 15927769 - 15927973
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15927769 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 15927868  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15927869 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 15927968  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  15927969 aagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15950846 - 15950613
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15950846 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 15950747  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  15950746 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 15950647  T
Q  227 aaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     ||||  || |||||||  | |||||||||||||    
T  15950646 caagctatttccttcaaaacccttgttcttctct 15950613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18253926 - 18253761
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18253926 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccat 18253827  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18253826 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15760169 - 15759990
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15760169 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 15760070  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || ||||||||||||||||||    
T  15760069 ttgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctccta 15759990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 13758571 - 13758750
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13758571 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 13758670  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  13758671 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 165
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  83 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14250953 - 14250811
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14250953 catcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 14250854  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 170  Q
     |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14250853 atgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaag 14250811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48622721 - 48622584
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  48622721 catcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaa 48622622  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48622621 tttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 13321188 - 13321267
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13321188 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 13321267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418835
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  16418731 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 16418830  T
Q  161 acctt 165  Q
    |||||    
T  16418831 acctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47481122 - 47481043
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47481122 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 47481043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10000392 - 10000288
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||| |  || |||||||||    
T  10000392 caagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaaccccctt 10000293  T
Q  161 acctt 165  Q
    |||||    
T  10000292 acctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11580830 - 11580751
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  11580830 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagca 11580751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13037103 - 13037026
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13037103 aatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 16211940 - 16212017
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16211940 aatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 11516399 - 11516478
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  11516399 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 11516478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15441655 - 15441576
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  15441655 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 15441576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30262220 - 30262141
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  30262220 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 30262141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 7293188 - 7293267
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  7293188 gtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 7293267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 36052836 - 36052896
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36052836 gtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacag 36052896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 3060138 - 3060217
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  3060138 gtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagca 3060217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25292429 - 25292350
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| |||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25292429 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 25292350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 36266 - 36523
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36266 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccag 36365  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  36366 tttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattca 36465  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36466 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctttccttcaaccctcttgctcttctct 36523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169736
Alignment:
Q  41 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgatta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  169951 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta 169852  T
Q  141 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttc-cctt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  169851 tgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgcctt 169752  T
Q  239 caaccctcttgttctt 254  Q
    |||| |||||||||||    
T  169751 caactctcttgttctt 169736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 154062 - 153883
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  154062 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 153963  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||  || ||||||||||||||||||    
T  153962 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctccta 153883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 48770 - 48849
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  48770 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 48849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31754 - 31497
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31754 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcat 31655  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  31654 tttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 31555  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31554 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 128260 - 128181
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  128260 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagca 128181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 30120895 - 30121153
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30120895 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcat 30120994  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||    
T  30120995 tttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattc 30121094  T
Q  200 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30121095 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttgctcttctct 30121153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 24549154 - 24549410
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24549154 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 24549253  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24549254 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttca 24549351  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  24549352 gctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 24549410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6774337 - 6774082
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6774337 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 6774238  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  6774237 tttcatataacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattca 6774140  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  6774139 gctccta-gtcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 6774082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21852043 - 21851786
Alignment:
Q  2 taatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccatt 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  21852043 taatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaat 21851944  T
Q  102 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21851943 ttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcag 21851845  T
Q  202 ctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt--cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  21851844 cttctaggtcacccacttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctct 21851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21844651 - 21844393
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  21844651 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaa 21844552  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21844551 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgattatccttaatcctagctccacttca 21844453  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt--cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  21844452 gcttctaggtcacccacttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctct 21844393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16674471 - 16674245
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16674471 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccat 16674372  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  || ||  || |||||||||||    
T  16674371 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattca 16674274  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaa 229  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  16674273 gctcataagtcacccacttgattcctaaa 16674245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 271415 - 271183
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  271415 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 271316  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  271315 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 271216  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  271215 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 271183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 644505 - 644737
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  644505 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 644604  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  644605 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 644704  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  644705 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 830240 - 830472
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  830240 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 830339  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  830340 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 830439  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  830440 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15319188 - 15318982
Alignment:
Q  55 atcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15319188 atcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa 15319089  T
Q  154 cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgtt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||    
T  15319088 cccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgtt 15318989  T
Q  252 cttctct 258  Q
    |||||||    
T  15318988 cttctct 15318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15499557 - 15499351
Alignment:
Q  55 atcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15499557 atcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa 15499458  T
Q  154 cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgtt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||    
T  15499457 cccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgtt 15499358  T
Q  252 cttctct 258  Q
    |||||||    
T  15499357 cttctct 15499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22088849 - 22088617
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22088849 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 22088750  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  22088749 ttgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 22088650  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22088649 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 22088617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22006313 - 22006134
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22006313 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 22006214  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||  || ||||||||||||||||||    
T  22006213 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctccta 22006134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13720983 - 13720804
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13720983 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 13720884  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  13720883 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 13720804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 16195432 - 16195611
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16195432 catcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 16195531  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||  || ||||||||||| ||||||    
T  16195532 ttgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13662295 - 13662141
Alignment:
Q  54 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataacta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13662295 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 13662196  T
Q  153 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  13662195 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 13662141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16873106 - 16872964
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16873106 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 16873007  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 170  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16873006 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 16872964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16405066 - 16404987
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16405066 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16404987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Original strand, 17345744 - 17345816
Alignment:
Q  4 atttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 76  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17345744 atttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaattt 17345816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24928882 - 24928803
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||    
T  24928882 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagca 24928803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43373559 - 43373474
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaatt 86  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  43373559 gtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaatt 43373474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16193807 - 16193728
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16193807 gtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagca 16193728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 5238259 - 5238338
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5238259 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 5238338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22907305 - 22907226
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22907305 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 22907226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24661339 - 24661260
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  24661339 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 24661260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 43685718 - 43685797
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  43685718 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 43685797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 10644392 - 10644648
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10644392 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 10644491  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10644492 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcacttca 10644589  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  10644590 gctcctagatcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 10644648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 47357827 - 47358030
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357827 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 47357926  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||    
T  47357927 tttcatacaacatgaggaaatgcaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacc-caactcttgcttcaattca 47358023  T
Q  201 gctccta 207  Q
    |||||||    
T  47358024 gctccta 47358030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15287300 - 15287096
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15287300 catcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 15287201  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15287200 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccta 15287101  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  15287100 aagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 18169171 - 18169403
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18169171 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 18169270  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  18169271 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 18169369  T
Q  227 aaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     ||||  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  18169370 caagctattctcttcaaaacccttgttcttctct 18169403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15294409 - 15294205
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15294409 catcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 15294310  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattccta 227  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15294309 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttcattccta 15294210  T
Q  228 aagct 232  Q
    |||||    
T  15294209 aagct 15294205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22352086 - 22351915
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22352086 caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22351987  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22351986 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7132120 - 7131941
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7132120 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaa 7132021  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |  ||  || ||||||||||||||||||    
T  7132020 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctccta 7131941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 20000924 - 20001103
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20000924 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 20001023  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  20001024 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 19020687 - 19020824
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19020687 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaa 19020786  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020787 ttgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 18248421 - 18248556
Alignment:
Q  31 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaatt 129  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18248421 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaatt 18248520  T
Q  130 acacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248521 gtacaagattatgataataactaacccccttacctt 18248556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17145712 - 17145570
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||| | |  || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17145712 catcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 17145613  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 170  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17145612 ttgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 17145570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
Alignment:
Q  54 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-caaaattacacatgattatgataataacta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8378377 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta 8378476  T
Q  153 accc 156  Q
    ||||    
T  8378477 accc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 26339253 - 26339399
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26339253 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 26339352  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  26339353 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 127
Target Start/End: Original strand, 22738470 - 22738568
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738470 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22738568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15675180 - 15675101
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  15675180 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15675101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10104341 - 10104262
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  10104341 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagca 10104262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54118335 - 54118256
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  54118335 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 54118256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 31115801 - 31115861
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31115801 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 31115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 122061 - 122140
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||    
T  122061 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagca 122140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  91 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 13246602 - 13246662
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13246602 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacag 13246662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 10488734 - 10488813
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  10488734 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 10488813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16328017 - 16327938
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16328017 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 16327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 26680372 - 26680451
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26680372 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 26680451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33240951
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 33240951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996518
Alignment:
Q  133 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 14996518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 13048312 - 13048261
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 52  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  13048312 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacata 13048261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 165
Target Start/End: Original strand, 8378491 - 8378524
Alignment:
Q  132 acatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378491 acatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40885645 - 40885585
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40885645 gtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag 40885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13404 - 13171
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13404 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 13305  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13304 tttcatacaacatgagaaaatgaaaaatt--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttca 13207  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13206 gttcctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 55316392 - 55316622
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316392 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 55316491  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  55316492 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattca 55316590  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55316591 gctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 41270248 - 41270478
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270248 gtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 41270347  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  41270348 tttcatacaacatgagtagatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattca 41270446  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41270447 gctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 49232637 - 49232869
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49232637 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 49232736  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||     
T  49232737 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcataggtcacccaaattgattccc 49232836  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49232837 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 49232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1467794 - 1467562
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1467794 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 1467695  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  1467694 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 1467595  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1467594 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 1467562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12264847 - 12264614
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264847 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 12264748  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc--acttgattcc 225  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || | | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  12264747 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaaattgattcc 12264648  T
Q  226 taaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12264647 tcaagctttcccttcaacactcttgttcttctct 12264614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16821312 - 16821517
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16821312 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccat 16821411  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||  || |||||||||||    
T  16821412 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattca 16821509  T
Q  201 gctcctag 208  Q
    ||||||||    
T  16821510 gctcctag 16821517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 12812042 - 12812274
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12812042 catcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaaga 12812141  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  12812142 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 12812241  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12812242 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 12812274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 22275410 - 22275642
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22275410 catcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 22275509  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  22275510 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 22275609  T
Q  227 aaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22275610 caagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 22275642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 15615006 - 15615168
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15615006 gtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccat 15615105  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615106 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15468395 - 15468216
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15468395 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 15468296  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  15468295 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctccta 15468216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 25058940 - 25059119
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25058940 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 25059039  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  | ||||||||||||||||||    
T  25059040 ttgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctccta 25059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 18911194 - 18911373
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18911194 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 18911293  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  18911294 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 18911373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15936718 - 15936553
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15936718 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccat 15936619  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  15936618 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18897099 - 18896920
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18897099 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaac 18897000  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  18896999 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 18896920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12902145 - 12902008
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12902145 catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 12902046  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902045 ttgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15938560 - 15938395
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||   ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15938560 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccat 15938461  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15938460 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 5228514 - 5228692
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5228514 catcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaa 5228612  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || | ||||||||||||||||    
T  5228613 ttgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctccta 5228692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 54651632 - 54651795
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattt 102  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  54651632 aatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattt 54651731  T
Q  103 tcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  54651732 tcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctt 54651795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14842650 - 14842446
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattt 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  |||| | ||| | | ||  |    
T  14842650 aatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-at 14842552  T
Q  103 tcatacaaca--tgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||| | | | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||  || |||||||||||    
T  14842551 tcatacaacatttgagaatttgcaaagtga-agatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattca 14842453  T
Q  201 gctccta 207  Q
    |||||||    
T  14842452 gctccta 14842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15859115 - 15859036
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  15859115 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15859036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 51158109 - 51158030
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  51158109 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 51158030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 44229186 - 44229323
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgcaaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||    
T  44229186 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaaaaa 44229285  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229286 tttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12030238 - 12030159
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  12030238 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 12030159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 13839066 - 13839145
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13839066 gtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13839145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17912573 - 17912495
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17912573 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagca 17912495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 2049982 - 2050061
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||    
T  2049982 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagca 2050061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2449329 - 2449250
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  2449329 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 2449250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  133 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  133 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11986257 - 11986181
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11986257 gtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 11986181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16744206 - 16744130
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  16744206 gtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 16744130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1153
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1383 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 1284  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  1283 tttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattca 1185  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1184 gctcctaagtcaccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 43170 - 43427
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  43170 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccat 43269  T
Q  101 tttcatacaacatgag-aaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43270 tttcatacaacatgagaaaaatgcaaaatt--acatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttc 43367  T
Q  200 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  43368 agctcctagatcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 43427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 39304 - 39536
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39304 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 39403  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  39404 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 39503  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39504 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 39536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5072467 - 5072237
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072467 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 5072368  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||||||||    
T  5072367 tttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattca 5072269  T
Q  201 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5072268 gctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18059813 - 18059581
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18059813 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 18059714  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcct 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18059713 ttatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcct 18059614  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18059613 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 18059581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 17148768 - 17149001
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17148768 catcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 17148867  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcc 225  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17148868 ttgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcctatgtcaccccacttgattcc 17148967  T
Q  226 taaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148968 tcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctct 17149001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 17004839 - 17005071
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17004839 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 17004938  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  17004939 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 17005038  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17005039 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 17005071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22227981 - 22228185
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227981 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 22228080  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||    
T  22228081 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 22228180  T
Q  200 agctc 204  Q
    |||||    
T  22228181 agctc 22228185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22232678 - 22232882
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232678 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 22232777  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||    
T  22232778 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 22232877  T
Q  200 agctc 204  Q
    |||||    
T  22232878 agctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38055146 - 38054914
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || |||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38055146 catcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaaga 38055047  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  38055046 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 38054947  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38054946 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 38054914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2116427 - 2116589
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2116427 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 2116526  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2116527 ttttatacaacatgagaaaatgcaaaatt--acatgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 45051595 - 45051757
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45051595 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 45051694  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45051695 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaat--cacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19962525 - 19962322
Alignment:
Q  58 acagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaaccc 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19962525 acagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccc 19962426  T
Q  157 ccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttctt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19962425 ccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttctt 19962326  T
Q  255 ctct 258  Q
    ||||    
T  19962325 ctct 19962322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18601197 - 18601071
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601197 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 18601098  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18601097 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 18601071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 170
Target Start/End: Original strand, 46523588 - 46523731
Alignment:
Q  27 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 126  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523588 aacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 46523687  T
Q  127 attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaag 170  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46523688 atggaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaag 46523731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 22035681 - 22035827
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22035681 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 22035780  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  22035781 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7640956 - 7640810
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7640956 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 7640857  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||    
T  7640856 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20445851 - 20445930
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  20445851 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 20445930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20913202 - 20913281
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  20913202 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20913281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20931517 - 20931596
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  20931517 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20931596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 20531616 - 20531695
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||||||||||    
T  20531616 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagca 20531695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20893717 - 20893638
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  20893717 gtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagca 20893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37844541 - 37844462
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  37844541 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagca 37844462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861284
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctag 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  || |||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15861284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 41394394 - 41394473
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  41394394 gtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagca 41394473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 51452664 - 51452743
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||    
T  51452664 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagca 51452743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21195 - 20936
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21195 gtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 21096  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| |||||||||||    
T  21095 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattca 20996  T
Q  201 gctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20995 gctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctct 20936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14140 - 13882
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    |||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14140 gtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccat 14042  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| |||||||||||    
T  14041 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattca 13942  T
Q  201 gctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13941 gctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctct 13882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 29388 - 29558
Alignment:
Q  54 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataacta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29388 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 29487  T
Q  153 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgatt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29488 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctaggtcacccacttgatt 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 258
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29627
Alignment:
Q  197 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctct 29627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3135 - 3341
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3135 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3234  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||    
T  3235 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattca 3334  T
Q  201 gctccta 207  Q
    |||||||    
T  3335 gctccta 3341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 31510 - 31742
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 127  Q
    |||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31510 catcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 31609  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcct 226  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  31610 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccc 31709  T
Q  227 aaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31710 caagctttcccttcaacactcttgttcttctct 31742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Original strand, 39847 - 39935
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 117  Q
    |||||||||||||| |  || |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39847 catcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9428 - 9266
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9428 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 9329  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9328 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16164
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16326 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 16227  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16226 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 64607 - 64372
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat-----tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  64607 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 64508  T
Q  96 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttca 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||    
T  64507 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat-tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttca 64409  T
Q  196 attcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64408 attcagctcctaagtcacccacttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 107919 - 108084
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  107919 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccat 108018  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  108019 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4102
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3895 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3994  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||  || ||||||||||    
T  3995 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 4094  T
Q  200 agctccta 207  Q
    ||||||||    
T  4095 agctccta 4102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5295 - 5088
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5295 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccat 5196  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattc 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||    
T  5195 tttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 5096  T
Q  200 agctccta 207  Q
    ||||||||    
T  5095 agctccta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 208 - 411
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  208 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 307  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattca 200  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |  ||  || |||||||||||    
T  308 tttcatataacatgag-caatgcaaaatt--acatgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattca 404  T
Q  201 gctccta 207  Q
    |||||||    
T  405 gctccta 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10624
Alignment:
Q  54 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattacacatgattatgataataacta 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
Q  153 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||||||||||    
T  10678 acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7509 - 7278
Alignment:
Q  31 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaatt 129  Q
    |||||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7509 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatg 7410  T
Q  130 acacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaa 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |    
T  7409 gaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctca 7310  T
Q  229 agc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  7309 agctattctcttcaaaacccttgttcttctct 7278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1569 - 1390
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1569 catcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 1470  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  1469 ttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctccta 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1630 - 1451
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1630 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 1531  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctccta 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  1530 ttgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctccta 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 2593 - 2826
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2593 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 2692  T
Q  128 -ttacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcc 225  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  2693 tttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 2792  T
Q  226 taaagc--ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    | ||||  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  2793 tcaagctattcccttcaaatc-cttgttcttctct 2826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 6831 - 7002
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6831 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 6930  T
Q  161 acctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6931 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcgtaaagct 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23600
Alignment:
Q  64 agagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaacccccttac 162  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23769 agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaa 23670  T
Q  163 ctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23669 cttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcacccacttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131006
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 231  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  232 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctct 131006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 89545 - 89466
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  89545 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 89466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10394 - 10257
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 127  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10394 catcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaa 10295  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  ||||||||||||  |  || ||||||||||||||    
T  10294 ttgaacatgattatgaagaagacaaacccccttacctt 10257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 45203 - 45369
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  45203 gtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaacccat 45302  T
Q  101 tttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45303 tttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 54591 - 54755
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattt 102  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||  |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  54591 aatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattt 54690  T
Q  103 tcatacaac-atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54691 tcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 54075 - 54212
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa- 127  Q
    |||||||||||||| |  || | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  54075 catcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaa 54174  T
Q  128 ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54175 tttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34551 - 34374
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttca--------- 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| | ||             
T  34551 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccattcattcaa 34452  T
Q  92 -tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
     ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34451 ttcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 3586 - 3712
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  | |||||||||||| | |  || | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3586 gtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccat 3685  T
Q  101 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3686 tttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34213 - 34076
Alignment:
Q  29 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgc-aaa 126  Q
    |||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34213 catcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaa 34115  T
Q  127 attacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  34114 attgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 247531 - 247454
Alignment:
Q  3 aatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  247531 aatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagca 247454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccct 159  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  160 tacctt 165  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 3362 - 3447
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaatt 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3362 gtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 41820 - 41896
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41820 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattta 41896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Original strand, 7443 - 7547
Alignment:
Q  62 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacaca-tgattatgataataactaaccccctt 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| | ||| |||||||||    
T  7443 caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaaccccctt 7542  T
Q  161 acctt 165  Q
    |||||    
T  7543 acctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8192
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8271 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26502 - 26427
Alignment:
Q  5 tttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26502 tttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 26427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13678 - 13855
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcat-------- 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||| | |||            
T  13678 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaa 13777  T
Q  93 --caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa-aattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
      |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13778 ttcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaataaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 166
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttaccttt 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 12289 - 12449
Alignment:
Q  5 tttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||| | ||| | |  | ||||    
T  12289 tttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttc 12388  T
Q  105 atacaacatgagaaa-atgcaaaattacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    ||||| |||  ||||  | |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12389 atacagcatttgaaagttacaaaatta-agatgattatgataaagactaacccccttacctt 12449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 625 - 546
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  625 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 6076
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  6155 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3673 - 3594
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  3673 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1375
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1296 gtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1047 - 968
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1047 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 9021 - 9100
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  9021 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagca 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 148893 - 148953
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  148893 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag 148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  141 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 5701 - 5780
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5701 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttggagcacgaatttagca 5780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 19378 - 19457
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  19378 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 19457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 21462 - 21541
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  21462 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 48359 - 48438
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  48359 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagca 48438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  91 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa-ttacacatgattatgataataactaacccccttacctt 165  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 123255 - 123176
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  123255 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 123176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17115
Alignment:
Q  134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 231  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  232 ttcccttcaaccctcttgttcttctct 258  Q
    |||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  17141 ttcctttcaacactcctgtgcttctct 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 9050 - 9129
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  9050 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagca 9129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 41901 - 41980
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  41901 gtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 41980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 51273 - 51194
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  51273 gtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagca 51194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 37004 - 36928
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  37004 gtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 36928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 22712 - 22791
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22712 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 22791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 26967 - 27046
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26967 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 27046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1594
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1673 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 1594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37157 - 37078
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  37157 gtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 37078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 172077 - 172156
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  172077 gtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagca 172156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 177780 - 177859
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||    
T  177780 gtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagca 177859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 56190 - 56114
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 77  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  56190 gtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattta 56114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 5148 - 5073
Alignment:
Q  5 tttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 80  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||| ||||||||||||    
T  5148 tttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagca 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 272197 - 272257
Alignment:
Q  1 gtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 61  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  272197 gtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacag 272257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 920 times since January 2019
Visitors: 2241