View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_17 (Length: 261)

Name: NF0172_low_17
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_17
NF0172_low_17
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (1-241)||(7088877-7089117)
chr4 (1-241)||(12902757-12902997)
chr4 (2-241)||(44052829-44053068)
chr4 (1-239)||(22636437-22636674)
chr4 (1-234)||(23374240-23374473)
chr4 (6-241)||(7893703-7893935)
chr4 (1-241)||(16239851-16240090)
chr4 (29-241)||(16270145-16270356)
chr4 (1-238)||(16377404-16377639)
chr4 (57-241)||(7798774-7798958)
chr4 (1-241)||(14053183-14053422)
chr4 (1-241)||(17046487-17046724)
chr4 (1-236)||(14038653-14038888)
chr4 (120-241)||(52873367-52873488)
chr4 (26-238)||(44928829-44929042)
chr4 (69-241)||(6899891-6900062)
chr4 (1-117)||(17047953-17048069)
chr4 (90-238)||(18215289-18215436)
chr4 (26-238)||(54798669-54798872)
chr4 (90-238)||(12322-12469)
chr4 (90-238)||(15118367-15118514)
chr4 (90-238)||(23803280-23803427)
chr4 (90-238)||(52312510-52312657)
chr4 (159-241)||(3096293-3096375)
chr4 (90-244)||(19242693-19242846)
chr4 (69-238)||(1837503-1837671)
chr4 (12-117)||(3096768-3096872)
chr4 (90-238)||(3515007-3515154)
chr4 (90-238)||(18239434-18239581)
chr4 (90-238)||(44615288-44615435)
chr4 (90-238)||(44773102-44773249)
chr4 (90-238)||(50222354-50222501)
chr4 (90-238)||(51463883-51464030)
chr4 (90-240)||(19618187-19618336)
chr4 (26-238)||(14280316-14280518)
chr4 (90-234)||(15355339-15355483)
chr4 (166-241)||(15551817-15551893)
chr4 (90-238)||(44102214-44102361)
chr4 (165-237)||(12774011-12774084)
chr4 (165-241)||(39706332-39706409)
chr4 (26-226)||(52243099-52243302)
chr4 (90-238)||(12610950-12611090)
chr4 (90-240)||(14970722-14970871)
chr4 (90-239)||(22353835-22353984)
chr4 (63-222)||(13794-13953)
chr4 (180-238)||(7641286-7641344)
chr4 (165-226)||(12288254-12288316)
chr4 (165-237)||(8846360-8846433)
chr4 (26-241)||(15367690-15367905)
chr4 (26-241)||(15402703-15402918)
chr4 (143-241)||(15370018-15370115)
chr4 (143-241)||(15371202-15371299)
chr4 (143-241)||(15373483-15373580)
chr4 (143-241)||(16223532-16223629)
chr4 (63-226)||(43198496-43198661)
chr4 (122-238)||(8574871-8574985)
chr4 (90-222)||(21815600-21815731)
chr4 (150-222)||(6190481-6190554)
chr4 (64-137)||(15121747-15121819)
chr4 (90-235)||(20149832-20149977)
chr4 (66-192)||(43256106-43256230)
chr4 (171-220)||(17333298-17333347)
chr4 (170-222)||(46640505-46640558)
chr4 (171-222)||(53082202-53082254)
chr4 (1-44)||(15091093-15091136)
chr4 (173-214)||(16348716-16348757)
chr4 (173-214)||(16357004-16357045)
chr4 (26-77)||(8574784-8574836)
chr4 (178-214)||(11250619-11250655)
chr4 (178-214)||(15353365-15353401)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-241)||(27250610-27250850)
chr1 (1-241)||(21026680-21026920)
chr1 (1-241)||(22532269-22532509)
chr1 (1-240)||(50210094-50210333)
chr1 (1-238)||(34509783-34510020)
chr1 (1-164)||(22354453-22354616)
chr1 (1-241)||(38801272-38801508)
chr1 (8-240)||(20135188-20135420)
chr1 (27-240)||(22468604-22468816)
chr1 (90-241)||(45574857-45575008)
chr1 (20-117)||(48603638-48603735)
chr1 (90-238)||(13988866-13989013)
chr1 (90-238)||(21923306-21923453)
chr1 (90-238)||(23593750-23593897)
chr1 (90-238)||(31612313-31612460)
chr1 (2-130)||(22356056-22356185)
chr1 (2-130)||(22357742-22357871)
chr1 (90-238)||(21475102-21475249)
chr1 (150-241)||(20847184-20847275)
chr1 (90-239)||(21840766-21840914)
chr1 (90-238)||(29298137-29298283)
chr1 (90-238)||(29776688-29776835)
chr1 (26-238)||(433012-433222)
chr1 (75-238)||(16275363-16275526)
chr1 (173-240)||(20454606-20454673)
chr1 (90-240)||(16361915-16362064)
chr1 (90-241)||(13212876-13213027)
chr1 (144-244)||(15860078-15860177)
chr1 (90-244)||(21342090-21342244)
chr1 (165-234)||(21754052-21754122)
chr1 (165-241)||(14295595-14295672)
chr1 (90-238)||(21346961-21347109)
chr1 (165-237)||(22921913-22921986)
chr1 (165-237)||(33681011-33681084)
chr1 (63-222)||(21861513-21861672)
chr1 (165-226)||(16758664-16758726)
chr1 (180-238)||(21707167-21707225)
chr1 (180-238)||(21711709-21711767)
chr1 (165-237)||(20248283-20248356)
chr1 (165-225)||(20918620-20918681)
chr1 (90-238)||(22123082-22123230)
chr1 (173-237)||(21714546-21714610)
chr1 (165-226)||(52928014-52928076)
chr1 (165-237)||(22237631-22237704)
chr1 (63-222)||(21896199-21896358)
chr1 (1-63)||(20847100-20847163)
chr1 (66-192)||(33797570-33797694)
chr1 (164-222)||(35261121-35261180)
chr1 (90-235)||(40389157-40389302)
chr1 (171-222)||(50614167-50614219)
chr1 (171-222)||(50621995-50622047)
chr1 (173-222)||(16368338-16368388)
chr1 (170-222)||(41050085-41050138)
chr1 (160-237)||(42865253-42865330)
chr1 (126-237)||(21161720-21161830)
chr1 (26-116)||(16758775-16758866)
chr1 (171-222)||(21533923-21533974)
chr1 (178-240)||(24783150-24783212)
chr1 (173-225)||(20958124-20958176)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-241)||(930-1169)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-241)||(167860-168099)
scaffold0011 (1-241)||(51913-52153)
scaffold0011 (173-222)||(38204-38253)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-241)||(13211-13450)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-241)||(23285865-23286101)
chr2 (1-241)||(23654267-23654507)
chr2 (1-241)||(22731115-22731355)
chr2 (1-241)||(22738061-22738300)
chr2 (1-238)||(298695-298933)
chr2 (1-241)||(37997-38235)
chr2 (11-241)||(23060513-23060742)
chr2 (25-241)||(23076442-23076658)
chr2 (1-241)||(20309108-20309345)
chr2 (1-241)||(22337115-22337355)
chr2 (1-241)||(23660023-23660262)
chr2 (90-238)||(22105412-22105560)
chr2 (26-241)||(23708524-23708738)
chr2 (90-235)||(21155075-21155219)
chr2 (90-238)||(18808943-18809090)
chr2 (90-238)||(23130862-23131009)
chr2 (90-238)||(23133329-23133476)
chr2 (90-238)||(23135590-23135737)
chr2 (90-238)||(23709547-23709694)
chr2 (90-238)||(23712028-23712175)
chr2 (90-238)||(26505379-26505526)
chr2 (90-238)||(26507857-26508004)
chr2 (90-238)||(34402537-34402684)
chr2 (90-238)||(39682313-39682460)
chr2 (90-240)||(32214936-32215085)
chr2 (90-238)||(571397-571544)
chr2 (90-238)||(6725995-6726142)
chr2 (90-238)||(24367774-24367921)
chr2 (90-238)||(24898210-24898358)
chr2 (90-238)||(24900693-24900841)
chr2 (90-238)||(24903170-24903318)
chr2 (90-238)||(24905647-24905795)
chr2 (90-238)||(24908122-24908270)
chr2 (122-241)||(23103399-23103516)
chr2 (90-238)||(32039513-32039660)
chr2 (164-241)||(8946657-8946734)
chr2 (2-86)||(27753730-27753814)
chr2 (90-238)||(28577099-28577246)
chr2 (90-238)||(45029869-45030016)
chr2 (178-241)||(23040247-23040310)
chr2 (90-236)||(43137301-43137446)
chr2 (165-240)||(22134251-22134326)
chr2 (122-236)||(28405981-28406096)
chr2 (165-237)||(7679589-7679662)
chr2 (165-241)||(23071993-23072070)
chr2 (143-238)||(24529597-24529691)
chr2 (69-241)||(19671830-19672001)
chr2 (165-237)||(25175854-25175927)
chr2 (90-238)||(38967374-38967522)
chr2 (159-235)||(24643034-24643109)
chr2 (111-234)||(25616192-25616315)
chr2 (165-226)||(18786947-18787009)
chr2 (34-237)||(40622123-40622327)
chr2 (94-222)||(7707-7835)
chr2 (171-220)||(23287384-23287433)
chr2 (172-220)||(26392403-26392451)
chr2 (170-222)||(23207296-23207349)
chr2 (150-222)||(32451958-32452031)
chr2 (171-222)||(20520243-20520295)
chr2 (173-220)||(23038048-23038095)
chr2 (173-222)||(9241945-9241994)
chr2 (170-222)||(22413187-22413240)
chr2 (173-214)||(22799179-22799220)
chr2 (171-222)||(23004767-23004819)
chr2 (178-214)||(24655396-24655432)
chr2 (178-214)||(24869903-24869939)
chr2 (171-222)||(25108906-25108958)
chr2 (178-214)||(25961592-25961628)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (1-241)||(20360841-20361081)
chr6 (5-241)||(20638168-20638404)
chr6 (1-241)||(29060540-29060780)
chr6 (1-241)||(17287677-17287917)
chr6 (9-241)||(22780116-22780348)
chr6 (1-241)||(25629236-25629476)
chr6 (1-240)||(18409708-18409947)
chr6 (1-241)||(20593773-20594013)
chr6 (74-241)||(16496244-16496411)
chr6 (1-241)||(16920514-16920751)
chr6 (1-241)||(19303422-19303661)
chr6 (1-241)||(22831503-22831742)
chr6 (66-241)||(35245586-35245758)
chr6 (74-241)||(20076700-20076863)
chr6 (26-226)||(25644335-25644537)
chr6 (90-238)||(12742317-12742464)
chr6 (90-238)||(18334607-18334754)
chr6 (90-238)||(19005046-19005193)
chr6 (90-238)||(19858934-19859081)
chr6 (90-238)||(22782227-22782374)
chr6 (90-238)||(24422547-24422694)
chr6 (90-238)||(25754809-25754956)
chr6 (90-238)||(33861794-33861941)
chr6 (90-238)||(33864278-33864425)
chr6 (90-240)||(30676725-30676874)
chr6 (94-238)||(1595549-1595692)
chr6 (90-238)||(2291195-2291342)
chr6 (90-238)||(8055029-8055176)
chr6 (1-222)||(11185524-11185742)
chr6 (90-238)||(26924655-26924802)
chr6 (143-238)||(25656629-25656723)
chr6 (90-240)||(34963371-34963520)
chr6 (90-238)||(1540926-1541073)
chr6 (90-238)||(25688502-25688649)
chr6 (165-241)||(27333262-27333339)
chr6 (165-241)||(27394002-27394079)
chr6 (90-235)||(16448541-16448686)
chr6 (26-222)||(18456735-18456930)
chr6 (90-238)||(3852032-3852179)
chr6 (90-222)||(18461895-18462026)
chr6 (94-241)||(20109140-20109285)
chr6 (90-238)||(20556909-20557054)
chr6 (180-241)||(25714417-25714478)
chr6 (165-241)||(28496515-28496592)
chr6 (165-241)||(29808926-29809003)
chr6 (165-237)||(19652199-19652272)
chr6 (164-226)||(9098557-9098620)
chr6 (1-214)||(25603266-25603478)
chr6 (66-192)||(27415887-27416011)
chr6 (90-239)||(19847964-19848114)
chr6 (188-241)||(1561303-1561356)
chr6 (166-229)||(4185866-4185930)
chr6 (150-222)||(18821875-18821946)
chr6 (164-226)||(19668386-19668449)
chr6 (170-220)||(33443068-33443118)
chr6 (26-241)||(8227416-8227632)
chr6 (34-214)||(15041465-15041644)
chr6 (131-239)||(23992429-23992537)
chr6 (194-241)||(22080799-22080846)
chr6 (164-241)||(23019408-23019484)
chr6 (1-214)||(25611604-25611816)
chr6 (166-229)||(4186379-4186443)
chr6 (173-237)||(19873120-19873184)
chr6 (176-237)||(19862978-19863039)
chr6 (173-214)||(21766718-21766759)
chr6 (172-237)||(22432249-22432314)
chr6 (172-237)||(22438799-22438864)
chr6 (171-222)||(23076749-23076801)
chr6 (171-222)||(35008167-35008219)
chr6 (173-218)||(16493169-16493214)
chr6 (173-222)||(18453201-18453250)
chr6 (188-237)||(31155465-31155514)
chr6 (189-229)||(4738626-4738666)
chr6 (178-214)||(18907134-18907170)
chr6 (200-244)||(19008799-19008843)
chr6 (178-214)||(19790837-19790873)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (2-241)||(17487856-17488095)
chr3 (6-241)||(20698322-20698556)
chr3 (1-241)||(12399209-12399449)
chr3 (5-241)||(13442274-13442510)
chr3 (2-241)||(17499338-17499577)
chr3 (1-241)||(14972854-14973094)
chr3 (11-241)||(26686887-26687117)
chr3 (1-241)||(23083242-23083482)
chr3 (11-241)||(43840932-43841162)
chr3 (1-241)||(18438534-18438774)
chr3 (1-237)||(14576714-14576949)
chr3 (1-241)||(25476266-25476506)
chr3 (26-238)||(24153115-24153326)
chr3 (1-228)||(14572602-14572828)
chr3 (1-241)||(11424644-11424880)
chr3 (1-238)||(40213602-40213838)
chr3 (25-223)||(42386428-42386627)
chr3 (1-117)||(16796671-16796787)
chr3 (90-238)||(29172598-29172745)
chr3 (20-117)||(14179556-14179653)
chr3 (90-238)||(7781362-7781509)
chr3 (90-238)||(9707622-9707769)
chr3 (90-238)||(17463178-17463325)
chr3 (90-238)||(17672626-17672773)
chr3 (90-238)||(28848626-28848773)
chr3 (90-238)||(34159326-34159473)
chr3 (90-238)||(45606922-45607069)
chr3 (90-238)||(55476491-55476638)
chr3 (90-238)||(8899094-8899241)
chr3 (90-238)||(16454296-16454443)
chr3 (90-238)||(38961906-38962053)
chr3 (94-241)||(43550497-43550644)
chr3 (90-236)||(16282826-16282971)
chr3 (90-238)||(13151805-13151953)
chr3 (90-238)||(13154270-13154418)
chr3 (90-239)||(13544024-13544172)
chr3 (1-226)||(30029855-30030079)
chr3 (90-238)||(6469149-6469296)
chr3 (90-238)||(10247738-10247885)
chr3 (90-234)||(12567564-12567707)
chr3 (90-238)||(17446670-17446816)
chr3 (90-238)||(50242822-50242969)
chr3 (124-238)||(55500942-55501055)
chr3 (165-237)||(12174303-12174376)
chr3 (165-241)||(13210371-13210448)
chr3 (90-236)||(41123892-41124034)
chr3 (122-238)||(36166598-36166712)
chr3 (90-222)||(53070668-53070799)
chr3 (143-238)||(12119793-12119887)
chr3 (143-238)||(15412429-15412523)
chr3 (165-234)||(32307684-32307754)
chr3 (165-241)||(14234487-14234564)
chr3 (165-237)||(15470928-15471001)
chr3 (165-237)||(16103784-16103857)
chr3 (26-241)||(24340628-24340844)
chr3 (165-237)||(49668120-49668193)
chr3 (126-238)||(15977515-15977626)
chr3 (143-238)||(8499518-8499612)
chr3 (164-238)||(27165250-27165325)
chr3 (143-238)||(44494809-44494903)
chr3 (180-238)||(17737236-17737294)
chr3 (165-237)||(9512924-9512997)
chr3 (165-237)||(9520899-9520972)
chr3 (165-237)||(16097332-16097405)
chr3 (26-222)||(52523633-52523831)
chr3 (143-238)||(10556985-10557079)
chr3 (164-238)||(53301594-53301669)
chr3 (177-238)||(28194693-28194755)
chr3 (122-227)||(21618460-21618563)
chr3 (185-238)||(45577947-45578000)
chr3 (111-239)||(46822267-46822395)
chr3 (165-234)||(1644718-1644787)
chr3 (17-117)||(12339891-12339986)
chr3 (121-239)||(12511059-12511177)
chr3 (26-241)||(37642170-37642386)
chr3 (164-223)||(23274705-23274765)
chr3 (70-237)||(856140-856304)
chr3 (171-220)||(13919350-13919399)
chr3 (173-237)||(15878104-15878168)
chr3 (171-222)||(22110402-22110454)
chr3 (173-237)||(23077530-23077594)
chr3 (171-222)||(43925977-43926029)
chr3 (178-240)||(14665398-14665460)
chr3 (152-237)||(23408428-23408513)
chr3 (170-222)||(37251217-37251270)
chr3 (173-222)||(606378-606428)
chr3 (174-220)||(9577646-9577691)
chr3 (178-240)||(14668554-14668616)
chr3 (173-214)||(11298580-11298621)
chr3 (170-222)||(12377940-12377993)
chr3 (173-214)||(14878569-14878610)
chr3 (173-222)||(15246037-15246086)
chr3 (160-237)||(17525198-17525275)
chr3 (178-214)||(3389994-3390030)
chr3 (26-81)||(21618594-21618650)
chr3 (26-77)||(36166747-36166799)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (2-241)||(9509189-9509428)
chr7 (1-241)||(12698831-12699072)
chr7 (1-241)||(26211995-26212236)
chr7 (1-241)||(10589039-10589278)
chr7 (5-241)||(16386132-16386369)
chr7 (1-239)||(40443393-40443629)
chr7 (26-238)||(18456319-18456530)
chr7 (1-238)||(3564245-3564482)
chr7 (1-241)||(38227481-38227720)
chr7 (1-241)||(27847714-27847951)
chr7 (90-241)||(13647325-13647476)
chr7 (69-238)||(16213684-16213852)
chr7 (26-238)||(48273392-48273594)
chr7 (90-238)||(456321-456468)
chr7 (90-238)||(11972496-11972643)
chr7 (90-238)||(14949137-14949284)
chr7 (90-238)||(15376728-15376875)
chr7 (90-238)||(16232520-16232667)
chr7 (90-238)||(18640272-18640419)
chr7 (90-238)||(20385138-20385285)
chr7 (90-238)||(21189610-21189757)
chr7 (90-234)||(24275175-24275318)
chr7 (90-238)||(32125491-32125638)
chr7 (90-238)||(41522917-41523064)
chr7 (90-238)||(41525379-41525526)
chr7 (90-237)||(11393302-11393448)
chr7 (90-241)||(18430709-18430859)
chr7 (35-241)||(2280033-2280238)
chr7 (90-238)||(16410059-16410206)
chr7 (90-238)||(24702238-24702385)
chr7 (90-238)||(27216860-27217007)
chr7 (90-238)||(44116509-44116656)
chr7 (8-226)||(15143925-15144143)
chr7 (165-241)||(67745-67822)
chr7 (165-241)||(28505342-28505419)
chr7 (165-241)||(34200786-34200863)
chr7 (90-238)||(3386333-3386480)
chr7 (90-238)||(24704688-24704832)
chr7 (143-238)||(13869346-13869440)
chr7 (165-237)||(811175-811248)
chr7 (165-241)||(16495402-16495479)
chr7 (165-237)||(44014182-44014255)
chr7 (167-241)||(47831807-47831882)
chr7 (26-238)||(17061866-17062077)
chr7 (165-241)||(11996071-11996148)
chr7 (169-237)||(18005650-18005719)
chr7 (90-234)||(38898391-38898535)
chr7 (150-241)||(22072913-22073005)
chr7 (144-238)||(13831373-13831466)
chr7 (120-237)||(16219717-16219834)
chr7 (184-238)||(20110556-20110610)
chr7 (173-235)||(18154894-18154956)
chr7 (188-241)||(15754955-15755008)
chr7 (63-237)||(17138006-17138177)
chr7 (72-237)||(14932685-14932851)
chr7 (72-237)||(15356120-15356286)
chr7 (72-237)||(15360234-15360400)
chr7 (64-237)||(12187019-12187189)
chr7 (165-226)||(16056343-16056405)
chr7 (164-241)||(19486787-19486865)
chr7 (170-226)||(1868044-1868101)
chr7 (90-222)||(12756686-12756817)
chr7 (171-226)||(14044761-14044817)
chr7 (171-226)||(14354791-14354847)
chr7 (167-241)||(10063864-10063939)
chr7 (165-219)||(12255837-12255892)
chr7 (164-226)||(12901338-12901401)
chr7 (180-238)||(26356098-26356156)
chr7 (180-238)||(26358550-26358608)
chr7 (177-237)||(19649546-19649606)
chr7 (171-222)||(18203831-18203882)
chr7 (178-240)||(2832499-2832561)
chr7 (173-214)||(15211484-15211525)
chr7 (90-175)||(26355998-26356083)
chr7 (90-175)||(26358450-26358535)
chr7 (178-214)||(9446216-9446252)
chr7 (171-222)||(20220238-20220290)
chr7 (178-214)||(20569654-20569690)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-241)||(20536208-20536448)
chr8 (6-241)||(21918886-21919121)
chr8 (1-241)||(31971257-31971495)
chr8 (1-241)||(18818290-18818530)
chr8 (1-241)||(21923809-21924049)
chr8 (2-241)||(18879119-18879352)
chr8 (1-241)||(45130879-45131117)
chr8 (10-241)||(7372778-7373001)
chr8 (1-240)||(28648925-28649164)
chr8 (1-241)||(16199527-16199765)
chr8 (1-241)||(22626736-22626975)
chr8 (11-241)||(23406379-23406611)
chr8 (1-244)||(6759255-6759496)
chr8 (10-241)||(16092231-16092463)
chr8 (20-241)||(21395883-21396101)
chr8 (20-241)||(21790376-21790594)
chr8 (25-241)||(21389358-21389571)
chr8 (1-240)||(23648554-23648793)
chr8 (25-241)||(22875065-22875281)
chr8 (38-241)||(21778697-21778897)
chr8 (1-117)||(25363021-25363137)
chr8 (90-238)||(14409459-14409606)
chr8 (90-238)||(1484402-1484549)
chr8 (90-238)||(5853307-5853454)
chr8 (90-234)||(16413331-16413474)
chr8 (90-238)||(20403227-20403374)
chr8 (90-238)||(22001753-22001900)
chr8 (90-238)||(41598188-41598335)
chr8 (90-238)||(4483281-4483427)
chr8 (90-238)||(15203246-15203393)
chr8 (90-238)||(20046210-20046357)
chr8 (165-241)||(6520368-6520445)
chr8 (165-241)||(21490995-21491072)
chr8 (165-241)||(38855295-38855372)
chr8 (90-238)||(4542388-4542535)
chr8 (166-241)||(17140916-17140992)
chr8 (165-241)||(5866318-5866395)
chr8 (90-238)||(19896265-19896415)
chr8 (149-244)||(19937080-19937174)
chr8 (143-234)||(45290763-45290853)
chr8 (165-226)||(983450-983512)
chr8 (169-237)||(23760892-23760961)
chr8 (165-237)||(26355742-26355815)
chr8 (90-238)||(14823774-14823920)
chr8 (111-239)||(18678093-18678221)
chr8 (90-238)||(25484290-25484430)
chr8 (143-225)||(15070571-15070652)
chr8 (166-241)||(21249384-21249461)
chr8 (166-241)||(21255222-21255299)
chr8 (164-237)||(21285601-21285675)
chr8 (90-240)||(26223917-26224066)
chr8 (184-238)||(26225355-26225409)
chr8 (63-234)||(13508028-13508199)
chr8 (122-238)||(26219717-26219831)
chr8 (111-239)||(32121734-32121862)
chr8 (164-241)||(17612153-17612231)
chr8 (63-234)||(13597560-13597731)
chr8 (90-222)||(19801397-19801527)
chr8 (63-222)||(20498581-20498740)
chr8 (165-229)||(21673716-21673781)
chr8 (171-222)||(24353039-24353091)
chr8 (171-222)||(37116366-37116418)
chr8 (170-222)||(19154936-19154989)
chr8 (173-222)||(20502154-20502203)
chr8 (171-220)||(22525579-22525628)
chr8 (171-222)||(17267044-17267096)
chr8 (173-237)||(17353996-17354060)
chr8 (26-77)||(26222987-26223039)
chr8 (171-222)||(17439557-17439609)
chr8 (178-214)||(20533467-20533503)
chr8 (26-81)||(26219862-26219918)
chr8 (174-222)||(28397569-28397617)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-241)||(1851-2086)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (6-241)||(23390382-23390617)
chr5 (1-241)||(8286723-8286964)
chr5 (1-241)||(22075018-22075259)
chr5 (1-241)||(25421532-25421772)
chr5 (1-241)||(25431395-25431634)
chr5 (1-241)||(9077952-9078192)
chr5 (1-241)||(24493569-24493808)
chr5 (12-238)||(24529223-24529449)
chr5 (1-241)||(1096467-1096707)
chr5 (1-241)||(13025311-13025550)
chr5 (1-241)||(13095495-13095734)
chr5 (1-241)||(21292851-21293090)
chr5 (74-241)||(21808343-21808510)
chr5 (74-241)||(21729018-21729185)
chr5 (1-105)||(22107254-22107358)
chr5 (143-241)||(21997557-21997655)
chr5 (90-238)||(264783-264930)
chr5 (90-238)||(10732955-10733102)
chr5 (26-238)||(22412187-22412388)
chr5 (90-238)||(39363384-39363531)
chr5 (90-238)||(20909012-20909159)
chr5 (90-238)||(29329934-29330081)
chr5 (90-238)||(42245380-42245527)
chr5 (90-238)||(29345980-29346127)
chr5 (90-238)||(39245136-39245283)
chr5 (90-238)||(36154798-36154942)
chr5 (165-241)||(19660879-19660956)
chr5 (165-241)||(21329541-21329618)
chr5 (26-227)||(18418594-18418793)
chr5 (90-238)||(29348453-29348600)
chr5 (90-238)||(29350926-29351073)
chr5 (90-235)||(18319048-18319193)
chr5 (90-238)||(20902023-20902172)
chr5 (90-238)||(2154628-2154776)
chr5 (165-237)||(22959576-22959649)
chr5 (94-238)||(11581218-11581361)
chr5 (90-238)||(32027393-32027540)
chr5 (144-238)||(20918017-20918110)
chr5 (90-238)||(10775690-10775838)
chr5 (165-241)||(36314577-36314654)
chr5 (34-234)||(37723910-37724108)
chr5 (37-222)||(22144068-22144254)
chr5 (143-238)||(31061068-31061162)
chr5 (143-238)||(38619434-38619528)
chr5 (120-241)||(21502156-21502277)
chr5 (165-237)||(21565546-21565619)
chr5 (66-192)||(18356364-18356488)
chr5 (143-237)||(23064512-23064605)
chr5 (165-241)||(26012079-26012154)
chr5 (165-241)||(19668898-19668975)
chr5 (164-222)||(20026984-20027043)
chr5 (1-103)||(21986028-21986130)
chr5 (111-239)||(17517192-17517320)
chr5 (173-237)||(26704075-26704139)
chr5 (173-237)||(26973808-26973872)
chr5 (66-192)||(20910745-20910869)
chr5 (63-237)||(22032323-22032492)
chr5 (184-238)||(20806850-20806904)
chr5 (90-235)||(24067110-24067255)
chr5 (64-137)||(23572182-23572254)
chr5 (172-225)||(26732884-26732937)
chr5 (63-237)||(18769947-18770118)
chr5 (172-222)||(26740697-26740747)
chr5 (173-222)||(23469822-23469871)
chr5 (165-241)||(40725853-40725930)
chr5 (26-77)||(20766035-20766087)
chr5 (173-214)||(20805575-20805616)
chr5 (173-222)||(21328268-21328317)
chr5 (173-218)||(21731514-21731559)
chr5 (173-218)||(21809634-21809679)
chr5 (173-214)||(21873277-21873318)
chr5 (170-222)||(22178270-22178323)
chr5 (174-214)||(20766997-20767037)
chr5 (173-237)||(23201360-23201424)
chr5 (173-237)||(23501408-23501472)
chr5 (178-214)||(26680605-26680641)
chr5 (178-214)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-241)||(3470-3710)
scaffold0292 (1-241)||(343-582)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (2-241)||(4849-5088)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-241)||(6003-6245)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-241)||(4712-4951)
scaffold0358 (1-176)||(1-175)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-241)||(32067-32304)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-241)||(20910-21151)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-241)||(13497-13735)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-241)||(15346-15584)
scaffold0114 (64-237)||(7295-7465)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (6-223)||(24187-24406)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-241)||(1952-2192)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-241)||(38761-39000)
scaffold0145 (29-241)||(32942-33153)
scaffold0145 (90-243)||(9744-9897)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-241)||(8424-8650)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-234)||(25946-26179)
scaffold0122 (122-238)||(44709-44825)
scaffold0122 (1-105)||(33376-33480)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-241)||(3032-3271)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-238)||(22886-23122)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-241)||(10307-10544)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-241)||(16282-16519)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-240)||(17096-17337)
scaffold0056 (90-222)||(79299-79430)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-241)||(25896-26135)
scaffold0026 (1-241)||(39858-40097)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (37-240)||(3103-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-239)||(39479-39716)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-239)||(75096-75333)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-241)||(4508-4747)
scaffold0228 (1-241)||(12090-12329)
scaffold0228 (1-241)||(22042-22281)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-241)||(16481-16721)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-241)||(8479-8715)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-241)||(933-1170)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-241)||(1289-1526)
scaffold0106 (1-241)||(7266-7503)
scaffold0106 (173-238)||(15291-15356)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-241)||(39913-40152)
scaffold0080 (170-222)||(19934-19987)
scaffold0080 (173-214)||(18708-18749)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (31-241)||(46995-47202)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-238)||(339831-340065)
scaffold0003 (90-238)||(158465-158612)
scaffold0003 (66-192)||(71350-71474)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-241)||(51582-51819)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (11-189)||(13144-13322)
scaffold0175 (170-241)||(34123-34195)
scaffold0175 (185-241)||(273-329)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (2-147)||(124679-124824)
scaffold0021 (172-241)||(121766-121835)
scaffold0021 (63-240)||(174767-174943)
scaffold0021 (171-222)||(136419-136471)
scaffold0021 (171-222)||(145127-145179)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (109-241)||(28414-28546)
scaffold0046 (165-241)||(11292-11369)
scaffold0046 (165-241)||(1997-2074)
scaffold0046 (188-241)||(4552-4605)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-182)||(6669-6850)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (12-241)||(32851-33077)
scaffold0120 (12-241)||(45928-46154)
scaffold0120 (30-241)||(16113-16323)
scaffold0120 (180-241)||(17389-17450)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-238)||(5012-5246)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-117)||(1038-1154)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-220)||(4545-4763)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (90-238)||(13392-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (90-238)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (90-238)||(37821-37968)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (90-238)||(94411-94558)
scaffold0023 (90-238)||(44454-44602)
scaffold0023 (90-234)||(17455-17598)
scaffold0023 (165-237)||(100378-100451)
scaffold0023 (169-241)||(119875-119948)
scaffold0023 (165-237)||(40218-40291)
scaffold0023 (165-237)||(101503-101576)
scaffold0023 (177-237)||(38536-38596)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (124-241)||(11447-11564)
scaffold0235 (1-57)||(11394-11450)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-82)||(3640-3721)
scaffold0165 (1-82)||(7704-7785)
scaffold0165 (35-226)||(27663-27855)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (90-238)||(4694-4841)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (90-238)||(13947-14094)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (90-238)||(82072-82219)
scaffold0037 (165-226)||(22714-22776)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (90-238)||(136680-136827)
scaffold0028 (90-238)||(139149-139296)
scaffold0028 (90-238)||(144087-144234)
scaffold0028 (90-238)||(134211-134358)
scaffold0028 (90-238)||(141618-141765)
scaffold0028 (164-237)||(132662-132736)
scaffold0028 (164-239)||(62200-62276)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (90-240)||(11286-11435)
scaffold0029 (64-137)||(12861-12933)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (90-235)||(4300-4444)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (90-239)||(10772-10920)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (15-178)||(3424-3588)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (90-238)||(16784-16931)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (90-234)||(501088-501231)
scaffold0001 (165-237)||(160688-160761)
scaffold0001 (90-238)||(85594-85742)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (165-241)||(6535-6612)
scaffold0621 (94-226)||(8481-8613)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (90-238)||(106-253)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-105)||(27966-28070)
scaffold0130 (205-240)||(27878-27913)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (90-238)||(40400-40547)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (90-240)||(12264-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (90-239)||(9241-9389)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (165-241)||(6611-6688)
scaffold0333 (165-241)||(13991-14068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (165-241)||(6167-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (165-237)||(19268-19341)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (165-241)||(15821-15898)
scaffold0020 (174-237)||(178898-178961)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (175-241)||(4888-4954)
scaffold0395 (1-105)||(844-948)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (34-237)||(26828-27027)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (90-238)||(4214-4362)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (165-241)||(1113-1190)
scaffold0184 (178-214)||(4284-4320)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (122-238)||(116430-116544)
scaffold0022 (171-222)||(129021-129072)
scaffold0022 (173-234)||(78328-78391)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (167-241)||(1080-1155)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (165-237)||(28813-28887)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (35-222)||(13147-13336)
scaffold0357 (35-226)||(16014-16206)
scaffold0357 (171-222)||(2680-2732)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (165-238)||(15664-15738)
scaffold0261 (173-237)||(1339-1403)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (90-224)||(29946-30079)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (165-237)||(1086-1159)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (165-237)||(2850-2923)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (90-238)||(12064-12205)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (26-241)||(17932-18148)
scaffold0247 (143-238)||(2197-2291)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (169-237)||(2693-2762)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (165-237)||(45836-45909)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (165-237)||(23927-24000)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (165-229)||(129917-129982)
scaffold0010 (164-222)||(60759-60818)
scaffold0010 (174-222)||(666-714)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (90-238)||(161104-161252)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-81)||(10323-10403)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (90-222)||(20394-20524)
scaffold0031 (74-241)||(128751-128917)
scaffold0031 (173-237)||(65851-65915)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (164-222)||(1051-1110)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (164-238)||(38745-38820)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (164-241)||(32538-32614)
scaffold0034 (143-222)||(51906-51985)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (171-237)||(14747-14814)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (165-226)||(10585-10647)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (90-235)||(1295-1440)
scaffold0101 (173-237)||(9016-9080)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (165-237)||(133-206)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (165-229)||(6824-6889)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (165-241)||(12766-12843)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (169-229)||(5655-5716)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-61)||(17868-17928)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (173-237)||(23843-23907)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (63-222)||(53492-53651)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (123-237)||(12943-13057)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (66-192)||(15362-15486)
scaffold0107 (173-222)||(36199-36248)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (164-241)||(11464-11542)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (34-237)||(21721-21920)
scaffold0210 (34-237)||(29613-29812)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (164-241)||(38299-38377)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (70-237)||(1881-2045)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (122-222)||(12587-12687)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (174-237)||(36454-36517)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (180-222)||(11982-12024)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (165-226)||(8118-8180)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (164-237)||(32102-32176)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (165-226)||(10542-10604)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (63-220)||(8002-8161)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (170-226)||(25121-25178)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (171-220)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (173-237)||(10575-10639)
scaffold0297 (177-237)||(15736-15796)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (133-237)||(29558-29662)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (173-237)||(69794-69858)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (2-49)||(20595-20642)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (173-222)||(569-619)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (170-222)||(6333-6386)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (170-218)||(38339-38388)
scaffold0139 (173-237)||(19980-20044)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (63-184)||(225465-225584)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (176-214)||(4999-5037)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (173-222)||(7450-7499)
scaffold0111 (173-222)||(14569-14618)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (120-237)||(4804-4921)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (170-222)||(2694-2747)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (173-214)||(44104-44145)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (160-237)||(18236-18313)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (170-226)||(103680-103737)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (133-214)||(29117-29198)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (173-214)||(193029-193070)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (173-237)||(6095-6159)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (178-214)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (174-222)||(3276-3324)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (174-214)||(16402-16442)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (174-222)||(30350-30398)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (171-222)||(97024-97076)
scaffold0006 (171-222)||(106302-106354)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7089117 - 7088877
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7089117 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 7089018  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089017 tgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 7088918  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088917 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12902997 - 12902757
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12902997 gtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 12902898  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902897 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12902798  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902797 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44053068 - 44052829
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  44053068 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 44052969  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44052968 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactg 44052869  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052868 agctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22636674 - 22636437
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22636674 gtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 22636576  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22636575 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaact 22636476  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636475 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 23374240 - 23374473
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23374240 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23374339  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374340 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23374439  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23374440 aagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893703
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaat 105  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||   | |||||||||||||     
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  106 aatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
     ||| |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct 7893739  T
Q  206 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893738 gcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16239851 - 16240090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  16239851 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattact 16239950  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    | ||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16239951 taaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaatt 16240049  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240050 aagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  129 gatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 228  Q
    | | | ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16377404 - 16377639
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16377404 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 16377503  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377504 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgt--atactgcctatgttgctgttgttatttaact 16377601  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377602 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtc 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  157 acgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14053183 - 14053422
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14053183 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 14053281  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataag-atgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 198  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14053282 tgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaa 14053379  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14053380 ctaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgt-ttatacattact 17046626  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||   |||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14038888 - 14038653
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  14038888 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 14038789  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| |||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14038788 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaact 14038689  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14038688 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 219  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 52873466  T
Q  220 aagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52873467 aagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| ||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    ||||  ||| ||||| | || || ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttg 168  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||  | | |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  169 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 17047953 - 17048069
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17047953 gtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 17048052  T
Q  101 tgaataatatttgaata 117  Q
    |||  | ||||||||||    
T  17048053 tgagaattatttgaata 17048069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215388 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||      |||||    ||||||||| ||   || |||  | |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata------cttat----tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12421 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118466 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 23803280 - 23803427
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  23803280 tatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 23803378  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803379 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312558 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3096375 - 3096293
Alignment:
Q  159 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096375 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19242846 - 19242693
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||    
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242747 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttg 168  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  169 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3096872 - 3096768
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3096872 acttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgt-ttatgcattacttgaagaatatt 3096774  T
Q  112 tgaata 117  Q
    ||||||    
T  3096773 tgaata 3096768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3515154 - 3515007
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3515154 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 3515056  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515055 gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239533 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615336 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 44773102 - 44773249
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  44773102 tatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44773200  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773201 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222453 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 51463883 - 51464030
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  51463883 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 51463981  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463982 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 19618187 - 19618336
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19618187 tatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 19618285  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618286 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||      |||||    ||||||||| ||   |  |||  | |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata------cttat----tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Original strand, 15355339 - 15355483
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  15355339 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 15355437  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355438 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15551893 - 15551817
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551893 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44102361 - 44102214
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| | | ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||  ||||    
T  44102361 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgtt 44102263  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102262 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706409
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||| || |||| |||||   | |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg--ctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    ||||| |||||| || | |||||  |||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  222 gttga 226  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12611090 - 12610950
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||         | ||||||||||    
T  12611090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt--------tgtgttgctgtt 12610999  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610998 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 14970722 - 14970871
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| | | ||||||||    
T  14970722 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt 14970820  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970821 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||||||| ||| |||||  |||||||| | ||||  | ||  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353884 gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13953
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 12288254 - 12288316
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288254 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||    ||||| ||| |||||| |||| ||||||  | |||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  125 tgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
     |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||    ||||| ||| |||||| |||| ||||||  | |||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  125 tgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
     |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15370115 - 15370018
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370115 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15371299 - 15371202
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371299 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15373580 - 15373483
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373580 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16223629 - 16223532
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223629 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 43198496 - 43198661
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |       
T  43198496 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaat 43198595  T
Q  163 t-ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198596 tgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574985
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| || ||||||||||    
T  8574969 gttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 21815600 - 21815731
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  | |||||||||     
T  21815600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt-tgtgttgctgtc 21815698  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6190554 - 6190481
Alignment:
Q  150 ttatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190554 ttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121819
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattg 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 15121819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20149977 - 20149832
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| | |||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||||    
T  20149977 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgt 20149879  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149878 tgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |  | ||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 43256203  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    | | || ||||||||||||||||||||    
T  43256204 tggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 46640505 - 46640558
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640505 atactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15091136 - 15091093
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaag 44  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15091136 gtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348757
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357045
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27250610 - 27250850
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250610 gtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 27250709  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27250710 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 27250809  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250810 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21026920 - 21026680
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21026920 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21026821  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21026820 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaact 21026721  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026720 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22532509 - 22532269
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22532509 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22532410  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532409 tgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22532310  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532309 aaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 50210094 - 50210333
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  50210094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 50210193  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210194 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 50210293  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210294 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34510020 - 34509783
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  34510020 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattact 34509921  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||   || |||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509920 tgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 34509821  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509820 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 22354453 - 22354616
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22354453 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattact 22354552  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtt 164  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  22354553 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38801272 - 38801508
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38801272 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgt-ttatgcattact 38801370  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||  ||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38801371 tgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaac 38801467  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801468 taagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20135420 - 20135188
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataa 107  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||       
T  20135420 taagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagtt 20135321  T
Q  108 tatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 207  Q
    |  |||||||| |||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||| | |||| ||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
T  20135320 ttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgc 20135221  T
Q  208 atgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135220 atgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  27 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttga-ataatatttgaatacataagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattatt-gaataattaagat 22468701  T
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22468702 gttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  226 atgaagatgatgatg 240  Q
    || |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Original strand, 45574857 - 45575008
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | ||| |||| ||| ||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574857 tatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 45574956  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574957 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48603735 - 48603638
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaata 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  48603735 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaata 48603638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988914 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923405 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 23593750 - 23593897
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23593750 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23593848  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593849 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612361 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 22356056 - 22356185
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22356056 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22356155  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttga 130  Q
    |||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  22356156 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 22357742 - 22357871
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22357742 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22357841  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttga 130  Q
    |||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  22357842 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475201 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 20847184 - 20847275
Alignment:
Q  150 ttatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20847184 ttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21840914 - 21840766
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21840914 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 21840816  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840815 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29298283 - 29298137
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  29298283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29298186  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | | |||||| ||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776736 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433012
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  433025 gattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||| ||||||  | ||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 240
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16362064 - 16361915
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||  ||||||  | |||||||||     
T  16362064 tatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc 16361966  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Original strand, 13212876 - 13213027
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  |  || |||||    
T  13212876 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgt 13212974  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212975 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  144 atatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 243  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcc 15860176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21342244 - 21342090
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | |||   |||    
T  21342244 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgt 21342146  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21342145 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754052
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 14295595 - 14295672
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14295595 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21347109 - 21346961
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | |||   |||    
T  21347109 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgt 21347011  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347010 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 22921913 - 22921986
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22921913 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33681084 - 33681011
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33681084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861672
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||||||||| |||| |||||   | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| ||||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861613 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16758726 - 16758664
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758726 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20918681 - 20918620
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918681 tttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 22123082 - 22123230
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||  | |||  ||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||  | ||||||||||    
T  22123082 tatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22123180  T
Q  190 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123181 tgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714546
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714610 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22237704 - 22237631
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22237704 tttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 21896199 - 21896358
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||| ||||| |||| |||||   | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| ||||    
T  21896199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21896298  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896299 tttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20847100 - 20847163
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgtt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20847100 gtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaagatgtgttgtt 20847163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 33797597  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||    
T  33797596 ttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 35261121 - 35261180
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261121 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40389302 - 40389157
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| | |||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||||    
T  40389302 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgt 40389204  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389203 tgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368388
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 41050085 - 41050138
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050085 atactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 42865253 - 42865330
Alignment:
Q  160 ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865253 ctgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21161830 - 21161720
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| ||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21161830 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagtt 21161733  T
Q  225 gatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||||||    
T  21161732 gatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16758866 - 16758775
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaat 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  16758866 ttaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat 16758775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958124
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 930 - 1169
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  930 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 1028  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1029 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 1128  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1129 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 167860 - 168099
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167860 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 167958  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  167959 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 168058  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168059 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52153 - 51913
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  52153 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 52054  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52053 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaact 51954  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51953 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13450 - 13211
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13450 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 13351  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13350 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 13251  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13250 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23286101 - 23285865
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23286101 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23286002  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286001 tgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23285906  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285905 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23654267 - 23654507
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23654267 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23654366  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  23654367 tgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaact 23654466  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654467 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22731115 - 22731355
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22731115 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22731214  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731215 tgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaact 22731314  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731315 aagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22738061 - 22738300
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22738061 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22738160  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22738161 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaact 22738259  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738260 aagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 298695 - 298933
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  298695 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 298794  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  298795 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 298894  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298895 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 37997 - 38235
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37997 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 38095  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096 tgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 38194  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38195 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060513
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    || ||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23060544  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060543 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||| |||||||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtg 23076459  T
Q  225 gatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  23076458 gatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20309345 - 20309108
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20309345 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattact 20309247  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgct-gttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20309246 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaac 20309150  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20309149 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22337355 - 22337115
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22337355 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22337256  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22337255 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaact 22337156  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337155 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23660262 - 23660023
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  23660262 gtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 23660163  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||| | ||  |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660162 tgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaact 23660064  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660063 aagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105460 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708738
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||   | |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagt 23708722  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||  |||||||||||||    
T  23708723 tga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155174 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18808991 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130910 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133377 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709646 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712127 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505427 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507905 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402636 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682361 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 32214936 - 32215085
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 32215034  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215035 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 571544 - 571397
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  571544 tatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 571446  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571445 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6726142 - 6725995
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || || | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  6726142 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 6726044  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726043 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367774
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367822 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24898308  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898309 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24900791  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900792 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24903268  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903269 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24905745  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905746 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24908220  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908221 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| || |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgt--atactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  222 gttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039612 gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27753814 - 27753730
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg 86  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27753814 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28577246 - 28577099
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  |  |||||||||    
T  28577246 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt 28577148  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577147 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029968 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 241
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43137446 - 43137301
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| | | | ||||||||||    
T  43137446 tatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt 43137348  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137347 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 240
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28406096 - 28405981
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28406096 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 28405997  T
Q  221 agttgatgaagatgat 236  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28405996 agttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679589
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 23071993 - 23072070
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071993 tttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 24529597 - 24529691
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529597 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttg 168  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| | | ||||  | ||||| ||||| ||| | || |||||    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttg 19671904  T
Q  169 catactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25175927 - 25175854
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25175927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38967522 - 38967374
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||| ||  | ||| | |||    
T  38967522 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgt 38967424  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967423 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  159 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25616315 - 25616192
Alignment:
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  || |  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25616315 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatg 25616216  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  25616215 agtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatt-----tgaatacataagatgt 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||     || |||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgt 40622219  T
Q  128 tgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||  ||| |  |||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||    
T  40622220 tgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatga 40622316  T
Q  227 tgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||    
T  40622317 ttaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgtt 192  Q
    |||||||||||| |||| |||||   | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
      ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23207349 - 23207296
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207349 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Original strand, 32451958 - 32452031
Alignment:
Q  150 ttatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451958 ttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520295
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23038095 - 23038048
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038095 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 22413187 - 22413240
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413187 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 22799179 - 22799220
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799179 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004767
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20360841 - 20361081
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20360841 gtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 20360940  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360941 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaact 20361040  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361041 aagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 20638168 - 20638404
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaa 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20638168 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaa 20638267  T
Q  105 taatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
     ||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20638268 gaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagc 20638367  T
Q  205 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638368 tgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29060780 - 29060540
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  29060780 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattact 29060681  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060680 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 29060581  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060580 aagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 17287677 - 17287917
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||  | |||||||||    
T  17287677 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattact 17287776  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17287777 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaact 17287876  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287877 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780348
Alignment:
Q  9 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataat 108  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||  ||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  109 atttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    | |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgca 22780315  T
Q  209 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780316 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 25629236 - 25629476
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  25629236 gtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 25629335  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |||||||| | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  25629336 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaact 25629435  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629436 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18409708 - 18409947
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  18409708 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatt 18409807  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || ||   | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18409808 tgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 18409907  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409908 gagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20594013 - 20593773
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  20594013 gtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattact 20593914  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||| | ||  ||| |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  20593913 tgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaact 20593814  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593813 gagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16920514 - 16920751
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16920514 gtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgt-ttatgcattact 16920612  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||||  ||||||||   || | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16920613 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtca---tgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaac 16920709  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920710 taagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19303422 - 19303661
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  19303422 gtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattact 19303521  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19303522 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaact 19303620  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303621 aagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22831742 - 22831503
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22831742 gtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattact 22831644  T
Q  101 tgaataatatttgaataca--taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttattta 197  Q
    |||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22831643 tgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttattta 22831547  T
Q  198 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22831546 actaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatga-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||   ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |  |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25644537 - 25644335
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||| ||||| || ||||||||||||||    || ||||||||||||| |||| |||||   | |||    
T  25644537 ttaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 25644438  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||||||| || || | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644437 tgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T
Q  224 tga 226  Q
    |||    
T  25644337 tga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742365 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334706 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005094 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22782374 - 22782227
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22782374 tatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 22782276  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782275 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422595 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25754956 - 25754809
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  25754956 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 25754858  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754857 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861842 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864326 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 30676725 - 30676874
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  30676725 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 30676823  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676824 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291294 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055077 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11185742 - 11185524
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||   |||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  11185742 gtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagt-ttatgcattact 11185644  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||   |||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  11185643 tgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaac 11185547  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11185546 taagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924754 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25656723 - 25656629
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656723 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34963520 - 34963371
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  34963520 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34963422  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963421 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541025 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25688649 - 25688502
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  25688649 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 25688551  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688550 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 16448541 - 16448686
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  16448541 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 16448639  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448640 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
     |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 3852032 - 3852179
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |  |||| || |||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  3852032 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 3852130  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852131 gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461895
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgtt 192  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| | | | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 20556909 - 20557054
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    | ||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||| || |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  20556909 tatgcattacttgaattatatgtgaaat--tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20557005  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20557006 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 28496515 - 28496592
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28496515 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 29808926 - 29809003
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29808926 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25603266 - 25603478
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  25603266 gtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25603365  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||   |  |||||||  | |||||| | ||||||  ||  |||||  |||||||| | |||| ||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25603366 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25603464  T
Q  201 aagctgcatgagtc 214  Q
    |||  |||||||||    
T  25603465 aagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--t 27415984  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  27415985 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Original strand, 19847964 - 19848114
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaa-tacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||   ||||||  || |  ||||||||| |||| |    
T  19847964 tatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 19848063  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848064 tgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 4185866 - 4185930
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185866 ttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Original strand, 18821875 - 18821946
Alignment:
Q  150 ttatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821875 ttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19668449 - 19668386
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668449 ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227632
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||| ||  | |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8227615 tgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttga-ataatatttgaatacataagatgttgatg 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||| || | |||||| |  |||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||  ||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatg-tgcattacttgagattttatt-gaatacttaagatgttattg 15041562  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||| | ||||| || |||||| |||||| |||    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041563 aattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23992537 - 23992429
Alignment:
Q  131 tgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 230  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  || |  ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  23992537 tgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaa 23992438  T
Q  231 gatgatgat 239  Q
    |||| ||||    
T  23992437 gatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23019484 - 23019408
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23019484 ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25611604 - 25611816
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  25611604 gtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25611703  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||   |  |||||||  | |||||| | ||||||  ||  |||||  |||||||| | |||| ||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25611704 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25611802  T
Q  201 aagctgcatgagtc 214  Q
    |||  |||||||||    
T  25611803 aagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4186443 - 4186379
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4186443 ttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19873184 - 19873120
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873184 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19863039 - 19862978
Alignment:
Q  176 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863039 cctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22432314 - 22432249
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432314 actgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22438864 - 22438799
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438864 actgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18907170 - 18907134
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907170 tatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17488095 - 17487856
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17488095 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 17487996  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17487995 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17487896  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487895 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 20698322 - 20698556
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaat 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20698322 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaag 20698420  T
Q  106 aatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698421 aatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 20698520  T
Q  206 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698521 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12399449 - 12399209
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399449 gtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 12399350  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399349 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12399250  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399249 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13442510 - 13442274
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaa 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13442510 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 13442411  T
Q  105 taatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442410 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagc 13442311  T
Q  205 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442310 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17499577 - 17499338
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17499577 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattactt 17499478  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17499477 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17499378  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499377 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14973094 - 14972854
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14973094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14972995  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14972994 tgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 14972895  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972894 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26687117 - 26686887
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  26687117 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 26687018  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26687017 tggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 26686918  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686917 agtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23083242 - 23083482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  23083242 gtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 23083341  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
     |||  | | |||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083342 agaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 23083441  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083442 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840932
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 43840963  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43840962 agtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18438774 - 18438534
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18438774 gtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattact 18438675  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||   || ||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438674 tgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18438575  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438574 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 14576714 - 14576949
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14576714 gtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14576813  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14576814 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14576912  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14576913 aagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 25476266 - 25476506
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  25476266 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattact 25476365  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25476366 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaact 25476465  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476466 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||  ||| |||||||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14572828 - 14572602
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |    
T  14572828 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatt 14572729  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572728 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14572630  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572629 aagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11424644 - 11424880
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11424644 gtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattact 11424743  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | ||||||||||   |||| || |||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424744 tgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 11424839  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424840 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 40213602 - 40213838
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  40213602 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 40213701  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    || || ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  40213702 tggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaact 40213800  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213801 aagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386428
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||   ||||||  | ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  124 atgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16796787 - 16796671
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16796787 gtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 16796688  T
Q  101 tgaataatatttgaata 117  Q
    |||  | ||||||||||    
T  16796687 tgagaattatttgaata 16796671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172697 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14179653 - 14179556
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaata 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14179653 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaata 14179556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781461 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707721 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463226 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17672773 - 17672626
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17672773 tatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt 17672675  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672674 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159374 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607021 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476539 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899142 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454395 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962053
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38962005 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 16282826 - 16282971
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16282826 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16282924  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282925 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13151903  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151904 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13154368  T
Q  190 gttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154369 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13544172 - 13544024
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 13544074  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544073 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30030079 - 30029855
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  30030079 gtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattact 30029980  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||   |  |||||||  ||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| |  ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  30029979 tgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaact 30029881  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029880 aagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 6469149 - 6469296
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| ||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  6469149 tatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 6469247  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469248 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247837 gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12567707 - 12567564
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 12567609  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567608 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446769 gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50242969 - 50242822
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  50242969 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 50242871  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242870 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  124 atgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  224 tgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 13210371 - 13210448
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13210371 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41124034 - 41123892
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    |  || ||||    
T  41124034 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgttgtt 41123939  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123938 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070799
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 12119793 - 12119887
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119793 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15412523 - 15412429
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15412523 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14234564 - 14234487
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  14234564 tttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15471001 - 15470928
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15471001 tttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103784
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||| | | ||||  | ||||| ||||| ||| | |||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15977626 - 15977515
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977626 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15977528  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  15977527 attaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8499612 - 8499518
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8499612 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27165325 - 27165250
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165325 ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44494903 - 44494809
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44494903 gatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16097405 - 16097332
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16097405 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||   | |||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg--ctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10557079 - 10556985
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| || |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10557079 gatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 53301594 - 53301669
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301594 ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  177 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618460
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T
Q  222 gttgat 227  Q
    ||||||    
T  21618465 gttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  185 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46822395 - 46822267
Alignment:
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  | ||||  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46822395 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 46822296  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822295 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12339986 - 12339891
Alignment:
Q  17 atgaagaggttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||    
T  12339986 atgaagaggctaattataatatgtgaagctgttttaagatgtgttgttgt------tgatgtgatataatgttttatgcatcacttgagaattatttgaa 12339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511059
Alignment:
Q  121 aagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  | ||||  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattcta 12511078  T
Q  221 agttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  12511077 agttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||| ||  | |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23274765 - 23274705
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274765 ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgct-gtttttg 168  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||  || | | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgt-ttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattgaattgg-tataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  169 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
     |  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 15878104 - 15878168
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878104 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925977
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  152 atgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 37251217 - 37251270
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251217 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12377993 - 12377940
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12377993 atactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878610
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 17525198 - 17525275
Alignment:
Q  160 ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  17525198 ctgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9509428 - 9509189
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  9509428 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattactt 9509329  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9509328 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaacta 9509229  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509228 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12699072 - 12698831
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  12699072 gtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 12698973  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgt-ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698972 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 12698873  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698872 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26212236 - 26211995
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26212236 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattact 26212137  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212136 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26212037  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 241  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212036 aagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10589278 - 10589039
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10589278 gtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattgct 10589180  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10589179 tgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaact 10589080  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589079 aagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 16386132 - 16386369
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  16386132 cattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgag 16386231  T
Q  105 taatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 203  Q
     | | ||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16386232 aattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaag 16386331  T
Q  204 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386332 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40443629 - 40443393
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443629 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 40443531  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40443530 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaac 40443433  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443432 taagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 3564245 - 3564482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  3564245 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattact 3564344  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| || || | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564345 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3564444  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564445 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38227720 - 38227481
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||||| |    
T  38227720 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaat 38227621  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38227620 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaact 38227522  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227521 aagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27847714 - 27847951
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27847714 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgt-ttatgcattact 27847812  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||  |||   ||| | |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27847813 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaac 27847909  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27847910 taagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647376 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttg 168  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  169 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||      |||||    ||||||||| ||   || |||  | |||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata------cttat----tacttgaattatgaatgtatat-tgaga 48273506  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456369 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972544 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949236 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376827 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232568 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640320 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385237 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189709 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275175
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275219 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125539 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525427 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393401 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||  ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430760 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |  |||| |||| |||||| |||| ||||||  | |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  134 attgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 232  Q
     ||||| | ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  233 tgatgatgt 241  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16410206 - 16410059
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16410206 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16410108  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410107 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702286 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216908 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44116656 - 44116509
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  44116656 tatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 44116558  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116557 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 15143925 - 15144143
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaata 106  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||     
T  15143925 taagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaatt 15144024  T
Q  107 atatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 206  Q
    ||   || |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||| || || ||  |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144025 atgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagctg 15144123  T
Q  207 catgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15144124 catgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67745
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 28505342 - 28505419
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505342 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34200863 - 34200786
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34200863 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3386480 - 3386333
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| || |||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||    
T  3386480 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 3386382  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386381 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||    |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct---tgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24704737  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704736 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13869440 - 13869346
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13869440 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 811175 - 811248
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  811175 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16495479 - 16495402
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16495479 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47831882 - 47831807
Alignment:
Q  167 tgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47831882 tgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||  | |||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
     |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  224 tgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 11996071 - 11996148
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11996071 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18005719 - 18005650
Alignment:
Q  169 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005719 catactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Original strand, 38898391 - 38898535
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| | |||    
T  38898391 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgt 38898489  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898490 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22073005 - 22072913
Alignment:
Q  150 ttatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22073005 ttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  144 atatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219834
Alignment:
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 16219815  T
Q  219 taagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| || |||||||    
T  16219816 taagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20110610 - 20110556
Alignment:
Q  184 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154956
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ct 161  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||| |  |    
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgatt 17138101  T
Q  162 gtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaa-ttgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgca 170  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||   |  |||||||  |||  ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| |    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaa-ttgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgca 170  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||   |  |||||||  |||  ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| |    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaa-ttgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgca 170  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||   |  |||||||  |||  ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| |    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ctg 162  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||| |  ||    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12187094  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |  ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  12187093 taattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16056405 - 16056343
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056405 tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 19486787 - 19486865
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  19486787 ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 1868044 - 1868101
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868044 atactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 12756686 - 12756817
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||| |||| | | ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  | ||||||||||    
T  12756686 tatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgctgtt 12756784  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756785 gttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 10063864 - 10063939
Alignment:
Q  167 tgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||    
T  10063864 tgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 12255837 - 12255892
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 219  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255837 tttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356156
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358608
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 19649546 - 19649606
Alignment:
Q  177 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649546 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15211525 - 15211484
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211525 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 175
Target Start/End: Original strand, 26355998 - 26356083
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactg 175  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  26355998 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 175
Target Start/End: Original strand, 26358450 - 26358535
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactg 175  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  26358450 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220290
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20536448 - 20536208
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20536448 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 20536349  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20536348 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaact 20536249  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536248 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 21918886 - 21919121
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaat 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21918886 attaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaag 21918984  T
Q  106 aat-atttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
    ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918985 aattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 21919084  T
Q  205 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919085 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31971495 - 31971257
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31971495 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 31971397  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971396 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 31971298  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971297 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18818290 - 18818530
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  18818290 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 18818389  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  ||||||| || ||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818390 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18818489  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818490 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21923809 - 21924049
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||  | |||||||||    
T  21923809 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattact 21923908  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923909 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaact 21924008  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924009 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 18879119 - 18879352
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  18879119 tagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 18879217  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879218 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 18879312  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879313 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 45130879 - 45131117
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45130879 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 45130977  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaa-ttgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130978 tgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaac 45131075  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45131076 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7373001 - 7372778
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataata 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||  |||    
T  7373001 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtata 7372910  T
Q  110 tttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 209  Q
     |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372909 attgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 7372810  T
Q  210 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372809 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28648925 - 28649164
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  28648925 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 28649024  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649025 tgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaact 28649124  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649125 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16199527 - 16199765
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16199527 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgt-ttatgcattact 16199625  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16199626 tgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaac 16199723  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16199724 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22626975 - 22626736
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  22626975 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattact 22626876  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626875 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22626777  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626776 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23406611 - 23406379
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  23406611 gacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23406512  T
Q  111 ttgaatacataagatgtt--gatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    |||||||  ||||||| |  | ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406511 ttgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23406412  T
Q  209 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406411 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6759496 - 6759255
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattac 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||     
T  6759496 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaa 6759397  T
Q  100 ttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||||| ||   || |||  | |||||||||    ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759396 ttgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaac 6759300  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759299 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 16092231 - 16092463
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataat 108  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||    
T  16092231 agacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattat 16092330  T
Q  109 atttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
       || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092331 gaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 16092430  T
Q  209 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092431 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 21395883 - 21396101
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaataca 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  21395883 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21395981  T
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395982 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21396078  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21396079 taagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 21790376 - 21790594
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaataca 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  21790376 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21790474  T
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790475 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21790571  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21790572 taagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21389456  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||||| |   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21389457 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21389553  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||||||||||||||    
T  21389554 tgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23648793 - 23648554
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  23648793 gtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattact 23648694  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||   |  |||||||  |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||| | |||| ||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23648693 tgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaact 23648594  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648593 aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||   || |||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  124 atgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  38 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattg 137  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  138 caatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
     | | ||||| ||||||||| |||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  237 gatgt 241  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 25363021 - 25363137
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25363021 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattact 25363120  T
Q  101 tgaataatatttgaata 117  Q
    |||  | ||||||||||    
T  25363121 tgagaattatttgaata 25363137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409558 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484450 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853406 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Original strand, 16413331 - 16413474
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  16413331 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16413429  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413430 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403275 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001801 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598236 gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483328 gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 15203246 - 15203393
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || || | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  15203246 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15203344  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203345 gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 20046210 - 20046357
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  20046210 tatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20046308  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046309 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6520445 - 6520368
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6520445 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21491072 - 21490995
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491072 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 38855295 - 38855372
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855295 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 4542388 - 4542535
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||  | ||||||||||    
T  4542388 tatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgtt 4542486  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542487 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17140992 - 17140916
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17140992 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 5866318 - 5866395
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5866318 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19896415 - 19896265
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatgga---tatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgct 186  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||| |  | |||||||    
T  19896415 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccg-ttgtgttgct 19896317  T
Q  187 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896316 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 19937080 - 19937174
Alignment:
Q  149 attatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937080 attatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Original strand, 45290763 - 45290853
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290763 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983512
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Original strand, 23760892 - 23760961
Alignment:
Q  169 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23760892 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14823920 - 14823774
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||||    
T  14823920 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttgtt 14823822  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823821 gttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 18678093 - 18678221
Alignment:
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18678093 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 18678192  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678193 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 25484290 - 25484430
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||         ||||||    
T  25484290 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta--------gctgtt 25484381  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15070652 - 15070571
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070652 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21249461 - 21249384
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249461 ttgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21255299 - 21255222
Alignment:
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255299 ttgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21285675 - 21285601
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21285675 ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26224066 - 26223917
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||| | | ||||||||    
T  26224066 tatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgtt 26223968  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223967 gttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 26225355 - 26225409
Alignment:
Q  184 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26225355 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Original strand, 13508028 - 13508199
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| | | ||||  | ||||| ||||| ||| | ||    
T  13508028 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13508127  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    || | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508128 ttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219717
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||  || |||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| | ||||||||    
T  26219733 gttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32121862 - 32121734
Alignment:
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32121862 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 32121763  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121762 agtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 17612153 - 17612231
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612153 ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Original strand, 13597560 - 13597731
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| | | ||||  | ||||| ||||| ||| | ||    
T  13597560 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13597659  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597660 -ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 19801397 - 19801527
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||  | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | ||||||| ||    
T  19801397 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgttgctatt 19801494  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801495 gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498581
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||||||||| |||| |||||   | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgcta 20498641  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498640 tttta-catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21673781 - 21673716
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21673781 tttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 17353996 - 17354060
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  17353996 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439609
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219862
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1851
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaat 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  2086 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 1987  T
Q  106 aatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 1887  T
Q  206 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1886 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 23390382 - 23390617
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaat 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  23390382 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 23390481  T
Q  106 aatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390482 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 23390581  T
Q  206 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390582 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 8286723 - 8286964
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  8286723 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 8286822  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg-tttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286823 tgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 8286922  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286923 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22075259 - 22075018
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075259 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 22075160  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22075159 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaact 22075060  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075059 aagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25421772 - 25421532
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25421772 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25421673  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421672 tgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 25421573  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421572 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25431634 - 25431395
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25431634 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25431535  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431534 tgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 25431435  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431434 aagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9078192 - 9077952
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  9078192 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 9078093  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||| | ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078092 tgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 9077993  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077992 aagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24493808 - 24493569
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  24493808 gtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcact 24493709  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  24493708 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaacc 24493610  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493609 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24529449 - 24529223
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatt 111  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||       
T  24529449 acttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  112 tgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 211  Q
    || |||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 24529250  T
Q  212 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24529249 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1096707 - 1096467
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1096707 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 1096608  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1096607 tgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaact 1096508  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096507 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13025550 - 13025311
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  | | ||||| |    
T  13025550 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13025451  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025450 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13025352  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025351 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13095734 - 13095495
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  | | ||||| |    
T  13095734 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13095635  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095634 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13095536  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095535 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21292851 - 21293090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21292851 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 21292949  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgca--atggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaa 198  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||  |  || ||||| |||||||||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292950 tgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaa 21293047  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293048 ctaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22107254 - 22107358
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22107254 gtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattact 22107353  T
Q  101 tgaat 105  Q
    |||||    
T  22107354 tgaat 22107358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 21997557 - 21997655
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997557 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264882 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733054 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      |||||    ||||||||| ||   || |||  | ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata------cttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  126 gttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363432 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctttt 20909061  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329982 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245479 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346028 gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39245283 - 39245136
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  |  || |||  ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  39245283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39245185  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||   || || ||||    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgtt 36154893  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154894 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||   |  |||||||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgt--atactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29348600 - 29348453
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||    
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29348502  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348501 cttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29351073 - 29350926
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||    
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29350975  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350974 cttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 18319048 - 18319193
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  18319048 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 18319146  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319147 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 20902023 - 20902172
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaa-tacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20902023 tatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt 20902121  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902122 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 2154628 - 2154776
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaa-tacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||| |    
T  2154628 tatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctat 2154726  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154727 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 11581218 - 11581361
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||| |||  ||||||  | ||| |||  ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  11581218 cattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 11581316  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581317 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027441 gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  144 atatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 10775690 - 10775838
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||| | ||| |||||    
T  10775690 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgt 10775788  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775789 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36314654 - 36314577
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314654 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723910
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttat-gcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||   |||||   | |||||||||||    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatg 37724010  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||  | | ||||| || |||||| |||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  37724009 aatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaag 37723913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22144254 - 22144068
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaat 135  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||   | |||||||| ||| |    
T  22144254 ctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt 22144155  T
Q  136 tgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144154 tgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31061162 - 31061068
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061162 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38619528 - 38619434
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38619528 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502277
Alignment:
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattta-catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 21502254  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21502255 taagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21565619 - 21565546
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21565619 tttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23064605 - 23064512
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064605 gatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012154
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 20026984 - 20027043
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026984 ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 21986028 - 21986130
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  21986028 gtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattact 21986127  T
Q  101 tga 103  Q
    |||    
T  21986128 tga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 17517192 - 17517320
Alignment:
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| || |||||  |||||||  ||||||  || |  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17517192 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatg 17517291  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517292 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26704139 - 26704075
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704139 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26973872 - 26973808
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973872 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||    ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 20910842  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  20910843 ttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||| | |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgat- 22032398  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||| |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  184 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24067255 - 24067110
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| | |||| || ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||| |||||    
T  24067255 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgt 24067157  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067156 tgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572182
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattg 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 23572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ct 161  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||| |  |    
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgatt 18770042  T
Q  162 gtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40725930 - 40725853
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  40725930 tttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21873318 - 21873277
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873318 ctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 22178270 - 22178323
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178270 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23201424 - 23201360
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23201424 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 23501408 - 23501472
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501408 ctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3710 - 3470
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  3710 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattact 3611  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3610 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaact 3511  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3510 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 343
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  582 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 483  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| | |||||  |||||||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  482 tgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaact 384  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  383 aagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5088 - 4849
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5088 tagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 4989  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4988 gagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 4889  T
Q  202 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 atctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6245
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  6003 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 6102  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgccta---tgttgctgttgttatttaa 198  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||   ||||| |||||||||||||    
T  6103 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaa 6202  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4951 - 4712
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4951 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgccttact 4853  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4852 tgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 4753  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4752 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 1
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  175 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgccttact 77  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgc 176  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  76 tgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32304 - 32067
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32304 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 32206  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32205 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtt--tactgcctatgttgctgttgttatttaact 32108  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32107 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21151 - 20910
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21151 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21052  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21051 tgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaac 20952  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20951 taagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13735 - 13497
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13735 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattact 13637  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13636 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 13538  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13537 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15346 - 15584
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15346 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatat-ttatgcattact 15444  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15445 tgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaact 15543  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15544 aagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ctg 162  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||  ||| |  ||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aatttgtataatta--tcatgattg 7370  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7369 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 24187 - 24406
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttga-ttatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaa 104  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24187 attaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 24286  T
Q  105 taatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgt-ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 203  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 24386  T
Q  204 ctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24387 ctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2192 - 1952
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2192 gtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattact 2093  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2092 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaact 1993  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1992 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39000 - 38761
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  39000 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 38901  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38900 tgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 38802  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801 aagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  129 gatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 228  Q
    | | | ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9744
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaa-tacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  9897 tatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt 9799  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9798 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8650
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  8424 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 8523  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8524 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatg 8619  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8620 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25946 - 26179
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  25946 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 26045  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | ||| |||| |||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26046 tgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26145  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26146 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 44808  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||    
T  44809 gttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 33376 - 33480
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  33376 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 33475  T
Q  101 tgaat 105  Q
    |||||    
T  33476 tgaat 33480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 3032 - 3271
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3032 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 3131  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3132 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3230  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3231 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23122 - 22886
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  23122 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 23023  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  23022 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaact 22924  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22923 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10544
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10307 gtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattact 10405  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10406 tgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaac 10502  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10503 tatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16519 - 16282
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16519 gtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattact 16421  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16420 tgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaac 16324  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16323 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17096 - 17337
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  17096 gtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 17195  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttttt--gcatactgcctatgttgctgttgttatttaa 198  Q
    ||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17196 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 17295  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17296 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 79299 - 79430
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | || || ||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  79299 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt 79397  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79398 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26135 - 25896
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  26135 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 26036  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  | |||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26035 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 25937  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25936 aagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40097 - 39858
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  40097 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 39998  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |||||||  | |||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39997 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 39899  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39898 aagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaatt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  137 gcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 236  Q
     || | ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  237 gatg 240  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39716 - 39479
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  39716 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 39617  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39616 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 39518  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39517 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 75096 - 75333
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  75096 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 75195  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  75196 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 75294  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75295 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4747 - 4508
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4747 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 4648  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4647 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 4548  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4547 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12329 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 12230  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12229 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 12130  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12129 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22281 - 22042
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22281 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22182  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22181 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 22082  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22081 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16481 - 16721
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16481 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattact 16580  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | ||||| || ||| || || | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16581 tgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 16680  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16681 aagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8715 - 8479
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||  | |||||||||    
T  8715 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattact 8620  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  | | ||||||   |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  8619 tgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaacc 8520  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8519 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 933 - 1170
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  933 gtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattact 1031  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||   || | ||| ||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  1032 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtca---tgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaac 1128  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1129 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1526 - 1289
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  1526 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattact 1428  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||   || | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1427 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaac 1331  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1330 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7503 - 7266
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7503 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattact 7405  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7404 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 7308  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7307 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 238
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40152 - 39913
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  40152 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 40053  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||| |  ||||  |||||||||  |||  |||| | ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40052 tgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 39954  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39953 aagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 19934 - 19987
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19934 atactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 18708 - 18749
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18708 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  31 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttga 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  131 tgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  230 agatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 339831 - 340065
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  339831 gtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 339930  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  339931 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaact 340027  T
Q  201 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340028 aagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158564 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--t 71377  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  71376 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51819 - 51582
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  51819 gtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgt-ttatgcatttct 51721  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaac 199  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||| | |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51720 tgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaac 51624  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  51623 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13144
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |||     
T  13322 gacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 13223  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13222 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34195 - 34123
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34195 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  185 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 124824 - 124679
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  124824 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 124725  T
Q  102 gaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatat 147  Q
    ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  124724 gaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtctta--tgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgc 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| ||||||| | | ||||| || |||||| ||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgt-ttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgc 174845  T
Q  161 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174844 tgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 136419 - 136471
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136419 tactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 145127 - 145179
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145127 tactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28414
Alignment:
Q  109 atttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28546 atttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 28447  T
Q  209 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28446 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11369 - 11292
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11369 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2074 - 1997
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2074 tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6850 - 6669
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6850 gtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattact 6751  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgt 182  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  6750 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 32851 - 33077
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||  |||     
T  32851 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 32948  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32949 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 33046  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33047 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46154 - 45928
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatat 110  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||  |||     
T  46154 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 46057  T
Q  111 ttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46056 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 45959  T
Q  211 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45958 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  30 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||   || |||| | ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  129 gatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 228  Q
    | ||  ||||| | ||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 5012 - 5246
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  5012 gtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgt-ttatacattact 5110  T
Q  101 tgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||   || | ||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  5111 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaac 5207  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5208 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1038
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1154 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 1055  T
Q  101 tgaataatatttgaata 117  Q
    |||  | ||||||||||    
T  1054 tgagaattatttgaata 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4545
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattac 99  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763 gtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattac 4666  T
Q  100 ttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||||  |||  ||||||  |||||||||| ||||||  | | ||||| || || ||  |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4665 ttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaac 4566  T
Q  200 taagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4565 taagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13440 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20795 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37869 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94459 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttttt-gcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44503 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Original strand, 17455 - 17598
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  17455 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt 17553  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17554 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 100451 - 100378
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  100451 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119875
Alignment:
Q  169 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 40218 - 40291
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40218 tttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38596
Alignment:
Q  177 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  38536 ctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  124 atgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || ||||||||| |||||    
T  11547 tgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11394 - 11450
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 57  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11394 gtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3721 - 3640
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7785 - 7704
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7785 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    ||||||||||| |||| |||| |||||   | |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  134 attgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
     || || | |||||  |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4694
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  4841 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 4743  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4742 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13995 gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 82219 - 82072
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  82219 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 82121  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82120 gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 22714 - 22776
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22714 tttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136728 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139197 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144135 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134259 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141666 gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 132736 - 132662
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  132736 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 62276 - 62200
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  62276 tttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11286
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11435 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 11337  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11336 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12861
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattg 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4444 - 4300
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||  | ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  4444 tatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 4346  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4345 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10920 - 10772
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10920 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 10822  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10821 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  15 taatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttg 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||   ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  114 aatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcct 178  Q
     |||  | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16931 - 16784
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  16931 tatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 16833  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16832 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 501231 - 501088
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  501231 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 501133  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501132 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160688
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 85594 - 85742
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||||    
T  85594 tatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgt 85692  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85693 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6535
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6612 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  94 cattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gtt 192  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 253 - 106
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||| |||||   | ||||||||||    
T  253 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 155  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  154 gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28070 - 27966
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28070 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 27971  T
Q  101 tgaat 105  Q
    |||||    
T  27970 tgaat 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  205 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40547 - 40400
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  40547 tatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 40449  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40448 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 12264 - 12413
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  12264 tatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt 12362  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12363 gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9389 - 9241
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||  ||||||  | ||||||||||    
T  9389 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 9291  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9290 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6244
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19341 - 19268
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19341 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 844 - 948
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||  || | || |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  844 gtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 943  T
Q  101 tgaat 105  Q
    |||||    
T  944 tgaat 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26828
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 26931  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacg-ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||| ||| ||||| ||||  ||| |  |||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||     
T  26930 aattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4362 - 4214
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||| |||||    
T  4362 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 4264  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4263 cgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1190
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1113 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129072
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78328
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 1080 - 1155
Alignment:
Q  167 tgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1080 tgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacata-agatgttgatg 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||   |  |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    | ||||| | |||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| ||||  ||||   | |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  134 attgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
     || || | |||||  |||| ||| | || ||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1403 - 1339
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1403 ctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30079 - 29946
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || || | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  30079 tatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29981  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29980 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 2850 - 2923
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2850 tttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12106 ------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  125 tgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 223  Q
    ||||| | | ||||  | ||||| ||||| ||| | |||| | ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 2197 - 2291
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2197 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Original strand, 2693 - 2762
Alignment:
Q  169 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2693 catactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 45836 - 45909
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45836 tttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 129982 - 129917
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  129982 tttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 60759 - 60818
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60759 ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 161104 - 161252
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||   |||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  161104 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 161202  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161203 tgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10403 - 10323
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10403 gtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20524
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||  | ||||||||||    
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactga-tgtgttgctgtt 20491  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatac 173  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||   |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttt 128818  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128817 ttttt-tgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 65851 - 65915
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  65851 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1051
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1110 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 38745 - 38820
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38745 ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32614 - 32538
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32614 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 51906 - 51985
Alignment:
Q  143 gatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51906 gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 237
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 10585 - 10647
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10585 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1440
Alignment:
Q  90 tatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgat-gaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgt 188  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| | |||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||  |||    
T  1295 tatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgt 1393  T
Q  189 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1394 tgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9080
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  9016 ctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 133
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  206 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12843 - 12766
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12843 tttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5716 - 5655
Alignment:
Q  169 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716 catactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 17868 - 17928
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 61  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17868 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23907 - 23843
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23907 ctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53651
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    ||| |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| | ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53592 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12943
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 221  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  222 gttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| || |||||||    
T  12958 gttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 15459  T
Q  166 ttgcatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||    
T  15460 ttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11542 - 11464
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11542 ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 21817  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacg-ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||| ||| | ||| ||||  ||| |  |||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  21818 aattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 21914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 29709  T
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacg-ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||| ||| | ||| ||||  ||| |  |||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  29710 aattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 29806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 38299 - 38377
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38299 ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacg-ctgtttttg 168  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||| |  |||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgt-ttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttg 1950  T
Q  169 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
     |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12587
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtcta 12589  T
Q  221 ag 222  Q
    ||    
T  12588 ag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32176 - 32102
Alignment:
Q  164 ttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32176 ttttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10604 - 10542
Alignment:
Q  165 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10604 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 220
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8161
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtca--cgc 160  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||| |||||   |||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||   ||    
T  8002 tgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagc 8101  T
Q  161 tgtttttgcatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8102 tg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25178 - 25121
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25178 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  177 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29662 - 29558
Alignment:
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| |  || |||||| | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29662 aattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaaga 29563  T
Q  233 tgatg 237  Q
    |||||    
T  29562 tgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 69858 - 69794
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69858 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20642 - 20595
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtt 49  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20642 tagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 569
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 6333 - 6386
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6333 atactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38388 - 38339
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38388 atactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20044 - 19980
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20044 ctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 225584 - 225465
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgaataatatttgaatacataagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||   | |||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  225584 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg 225486  T
Q  163 tttttgcatactgcctatgttg 184  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  225485 -ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 214
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  176 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  120 taagatgttgatgaattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 219  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||| || | |||| |||||| |||    ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatat 4903  T
Q  220 aagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  4904 aagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2694
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2747 atactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44104
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18313 - 18236
Alignment:
Q  160 ctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18313 ctgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 103680 - 103737
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 226  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  103680 atactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29198 - 29117
Alignment:
Q  133 aattgcaatggatatcattatgtcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| |  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29198 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 193029 - 193070
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  193029 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 16402 - 16442
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16402 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30350
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 30350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97024
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106302
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 935 times since January 2019
Visitors: 2241