View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_18 (Length: 260)

Name: NF0172_low_18
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_18
NF0172_low_18
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (1-237)||(23881063-23881299)
chr5 (1-237)||(6499235-6499470)
chr5 (1-237)||(21099609-21099845)
chr5 (13-224)||(642625-642836)
chr5 (1-237)||(9398649-9398875)
chr5 (1-237)||(21072145-21072381)
chr5 (1-237)||(23412880-23413115)
chr5 (1-237)||(21198911-21199144)
chr5 (1-142)||(12352795-12352936)
chr5 (1-237)||(89328-89563)
chr5 (1-237)||(7745599-7745834)
chr5 (1-237)||(17814964-17815199)
chr5 (8-212)||(25096753-25096960)
chr5 (8-212)||(25154723-25154930)
chr5 (1-237)||(21910552-21910787)
chr5 (1-237)||(6512337-6512569)
chr5 (1-237)||(41566338-41566575)
chr5 (1-216)||(20550891-20551107)
chr5 (1-237)||(19536206-19536442)
chr5 (4-237)||(26784353-26784587)
chr5 (1-237)||(33022660-33022895)
chr5 (13-206)||(13545455-13545641)
chr5 (1-174)||(31117873-31118047)
chr5 (1-92)||(4887018-4887109)
chr5 (1-92)||(29138456-29138547)
chr5 (1-93)||(28464388-28464480)
chr5 (1-68)||(9088965-9089032)
chr5 (1-92)||(25930206-25930297)
chr5 (1-93)||(3245490-3245582)
chr5 (1-89)||(11993884-11993972)
chr5 (8-68)||(30742983-30743043)
chr5 (1-68)||(14086613-14086680)
chr5 (1-68)||(30115911-30115978)
chr5 (1-47)||(28139603-28139649)
chr5 (1-93)||(10848769-10848861)
chr5 (8-68)||(42243683-42243743)
chr5 (1-68)||(33933263-33933330)
chr5 (2-68)||(11208060-11208125)
chr5 (201-237)||(12352722-12352758)
chr5 (8-92)||(15516972-15517056)
chr5 (1-89)||(35932059-35932147)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-237)||(40846093-40846330)
chr4 (1-237)||(23750516-23750751)
chr4 (1-237)||(55380284-55380519)
chr4 (1-237)||(6641678-6641912)
chr4 (63-234)||(15139283-15139456)
chr4 (8-237)||(45833395-45833625)
chr4 (1-237)||(16632434-16632669)
chr4 (1-237)||(29680424-29680661)
chr4 (1-224)||(37435428-37435652)
chr4 (1-237)||(12811058-12811292)
chr4 (5-237)||(12601099-12601330)
chr4 (1-237)||(19884696-19884932)
chr4 (1-216)||(19620962-19621178)
chr4 (1-188)||(37985541-37985729)
chr4 (2-237)||(14604788-14605023)
chr4 (1-237)||(56034568-56034803)
chr4 (13-225)||(41114663-41114875)
chr4 (8-237)||(22675402-22675630)
chr4 (1-201)||(19666366-19666567)
chr4 (1-224)||(3395584-3395808)
chr4 (1-188)||(9140906-9141094)
chr4 (8-203)||(11915701-11915896)
chr4 (1-218)||(10072929-10073146)
chr4 (5-237)||(19911760-19911994)
chr4 (8-237)||(17247245-17247472)
chr4 (13-237)||(413008-413231)
chr4 (139-237)||(22089721-22089818)
chr4 (151-237)||(23123576-23123662)
chr4 (1-237)||(13575996-13576231)
chr4 (1-224)||(14904249-14904473)
chr4 (13-209)||(17787962-17788152)
chr4 (1-92)||(29121364-29121455)
chr4 (1-221)||(10692845-10693064)
chr4 (1-221)||(10906611-10906830)
chr4 (25-237)||(3483739-3483952)
chr4 (60-236)||(14833449-14833626)
chr4 (1-93)||(17398699-17398791)
chr4 (1-68)||(6517479-6517546)
chr4 (8-212)||(17540396-17540598)
chr4 (8-141)||(54679931-54680064)
chr4 (1-89)||(16853497-16853585)
chr4 (1-68)||(3105469-3105536)
chr4 (13-50)||(8685511-8685548)
chr4 (1-66)||(20977451-20977516)
chr4 (8-68)||(8105638-8105698)
chr4 (1-89)||(40860661-40860749)
chr4 (8-68)||(56533112-56533172)
chr4 (1-68)||(22190840-22190907)
chr4 (1-68)||(38513872-38513939)
chr4 (17-66)||(16940026-16940075)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-237)||(22454859-22455096)
chr2 (1-237)||(25189392-25189629)
chr2 (1-237)||(39037511-39037748)
chr2 (1-237)||(24377095-24377332)
chr2 (2-237)||(21537117-21537353)
chr2 (1-237)||(23595441-23595673)
chr2 (1-237)||(18376775-18377012)
chr2 (1-237)||(19540410-19540645)
chr2 (1-237)||(25829128-25829363)
chr2 (1-234)||(13963850-13964084)
chr2 (1-237)||(22187971-22188208)
chr2 (4-224)||(20568632-20568853)
chr2 (1-237)||(23235001-23235238)
chr2 (1-237)||(30666983-30667220)
chr2 (1-237)||(9015240-9015474)
chr2 (1-246)||(41121582-41121825)
chr2 (1-237)||(10009620-10009856)
chr2 (1-237)||(24850534-24850772)
chr2 (1-237)||(25037128-25037365)
chr2 (1-237)||(25041235-25041472)
chr2 (1-237)||(30621210-30621447)
chr2 (1-237)||(30623831-30624068)
chr2 (1-237)||(23184184-23184410)
chr2 (8-210)||(26618998-26619200)
chr2 (1-224)||(24576029-24576254)
chr2 (14-237)||(22272139-22272361)
chr2 (13-237)||(44881173-44881395)
chr2 (1-216)||(28140509-28140725)
chr2 (8-236)||(22317594-22317824)
chr2 (13-224)||(19115089-19115300)
chr2 (8-237)||(6573993-6574223)
chr2 (13-237)||(38781405-38781628)
chr2 (25-237)||(20151905-20152117)
chr2 (1-188)||(24779337-24779525)
chr2 (1-142)||(40782471-40782612)
chr2 (13-225)||(18702744-18702956)
chr2 (77-212)||(18430835-18430970)
chr2 (1-141)||(28711664-28711804)
chr2 (1-89)||(31800905-31800993)
chr2 (1-93)||(28550932-28551024)
chr2 (1-93)||(44840428-44840520)
chr2 (33-224)||(22260432-22260624)
chr2 (1-93)||(22776302-22776394)
chr2 (1-93)||(22781680-22781772)
chr2 (151-237)||(7609107-7609191)
chr2 (8-93)||(1587047-1587132)
chr2 (17-93)||(14581525-14581601)
chr2 (1-37)||(22258195-22258231)
chr2 (1-89)||(31968061-31968149)
chr2 (1-93)||(40332081-40332173)
chr2 (13-68)||(30557360-30557415)
chr2 (1-48)||(33074220-33074267)
chr2 (1-68)||(35744039-35744106)
chr2 (14-92)||(3277037-3277115)
chr2 (13-93)||(22785669-22785749)
chr2 (8-68)||(22802461-22802521)
chr2 (195-241)||(28379634-28379680)
chr2 (14-92)||(28701244-28701322)
chr2 (191-237)||(30557190-30557236)
chr2 (8-68)||(6392634-6392694)
chr2 (2-38)||(19498012-19498048)
chr2 (25-89)||(23392686-23392750)
chr2 (13-93)||(34321950-34322030)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (1-237)||(39284490-39284726)
chr7 (2-237)||(13018432-13018666)
chr7 (1-224)||(41842212-41842435)
chr7 (1-237)||(21695397-21695634)
chr7 (1-237)||(16316484-16316719)
chr7 (1-237)||(29935286-29935520)
chr7 (22-189)||(13032045-13032213)
chr7 (1-237)||(44467060-44467298)
chr7 (1-237)||(11792903-11793140)
chr7 (1-237)||(15088516-15088753)
chr7 (1-236)||(10883099-10883335)
chr7 (1-224)||(13302806-13303030)
chr7 (1-237)||(13648725-13648960)
chr7 (1-237)||(2913533-2913770)
chr7 (1-237)||(11319401-11319638)
chr7 (1-237)||(28409035-28409271)
chr7 (1-224)||(13137833-13138057)
chr7 (8-212)||(13893949-13894153)
chr7 (2-237)||(19236969-19237204)
chr7 (1-237)||(21283300-21283535)
chr7 (1-221)||(21692283-21692504)
chr7 (1-224)||(22577959-22578183)
chr7 (1-237)||(24788137-24788372)
chr7 (1-237)||(2500034-2500271)
chr7 (1-237)||(9069558-9069795)
chr7 (13-237)||(15467924-15468149)
chr7 (1-221)||(33691653-33691874)
chr7 (1-237)||(12366675-12366910)
chr7 (1-181)||(13730656-13730837)
chr7 (1-237)||(13880100-13880337)
chr7 (1-199)||(5000784-5000984)
chr7 (1-237)||(30025901-30026138)
chr7 (26-224)||(13692372-13692562)
chr7 (25-191)||(13880608-13880775)
chr7 (1-237)||(28622283-28622518)
chr7 (1-92)||(16309978-16310069)
chr7 (1-216)||(30944271-30944485)
chr7 (1-92)||(16111955-16112046)
chr7 (1-237)||(30945285-30945518)
chr7 (8-221)||(23279900-23280113)
chr7 (1-224)||(13260561-13260777)
chr7 (1-237)||(331641-331877)
chr7 (1-237)||(9709729-9709964)
chr7 (133-216)||(4494634-4494718)
chr7 (1-237)||(48236829-48237064)
chr7 (1-93)||(1293026-1293118)
chr7 (1-92)||(4821470-4821561)
chr7 (1-92)||(14426543-14426634)
chr7 (1-92)||(33605681-33605772)
chr7 (1-92)||(14193110-14193201)
chr7 (1-93)||(48062890-48062982)
chr7 (2-89)||(14425444-14425531)
chr7 (1-68)||(19711108-19711175)
chr7 (1-68)||(35952783-35952850)
chr7 (170-216)||(9098205-9098251)
chr7 (1-46)||(8182926-8182971)
chr7 (25-125)||(9098284-9098384)
chr7 (13-89)||(19339324-19339400)
chr7 (1-65)||(27871714-27871778)
chr7 (8-68)||(2265614-2265674)
chr7 (191-235)||(12174269-12174313)
chr7 (171-235)||(14193241-14193305)
chr7 (1-65)||(24794813-24794877)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (3-232)||(9958-10188)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (5-237)||(220242-220474)
scaffold0004 (6-225)||(244172-244390)
scaffold0004 (1-237)||(377433-377670)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-237)||(21028792-21029029)
chr1 (1-237)||(26701973-26702210)
chr1 (1-237)||(33256197-33256432)
chr1 (1-237)||(33276369-33276604)
chr1 (1-237)||(28492248-28492485)
chr1 (1-237)||(22153856-22154093)
chr1 (1-181)||(21191766-21191946)
chr1 (1-237)||(12284422-12284657)
chr1 (1-237)||(22600026-22600263)
chr1 (1-224)||(1577866-1578090)
chr1 (1-237)||(10757420-10757656)
chr1 (17-237)||(17024811-17025029)
chr1 (1-197)||(12613700-12613895)
chr1 (1-223)||(48704203-48704426)
chr1 (1-241)||(1900344-1900585)
chr1 (1-237)||(20954317-20954554)
chr1 (1-237)||(19717523-19717758)
chr1 (1-237)||(38282566-38282802)
chr1 (1-221)||(32785798-32786018)
chr1 (1-216)||(22201601-22201817)
chr1 (1-181)||(2267088-2267269)
chr1 (1-237)||(2268530-2268763)
chr1 (1-233)||(36134189-36134419)
chr1 (14-237)||(35401821-35402043)
chr1 (1-237)||(22427203-22427438)
chr1 (1-237)||(29215796-29216031)
chr1 (14-237)||(23036373-23036595)
chr1 (1-237)||(30893091-30893327)
chr1 (8-88)||(39200986-39201066)
chr1 (13-174)||(22464716-22464878)
chr1 (13-237)||(16235142-16235365)
chr1 (1-89)||(35040165-35040253)
chr1 (1-93)||(46088988-46089080)
chr1 (1-93)||(48570220-48570312)
chr1 (1-92)||(25448556-25448647)
chr1 (14-156)||(18896523-18896665)
chr1 (8-68)||(30572203-30572263)
chr1 (1-68)||(21702813-21702880)
chr1 (13-92)||(2834701-2834780)
chr1 (156-237)||(7309973-7310054)
chr1 (1-66)||(19215611-19215676)
chr1 (1-66)||(23024787-23024852)
chr1 (194-237)||(12284648-12284689)
chr1 (1-89)||(21121057-21121145)
chr1 (13-68)||(2327454-2327509)
chr1 (1-92)||(10250985-10251076)
chr1 (1-68)||(44821559-44821626)
chr1 (191-237)||(7744936-7744982)
chr1 (16-89)||(42284642-42284715)
chr1 (191-235)||(2327287-2327331)
chr1 (8-68)||(14263465-14263525)
chr1 (1-89)||(21135153-21135241)
chr1 (8-68)||(21204937-21204997)
chr1 (13-89)||(21984607-21984683)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-221)||(9903-10123)
scaffold0047 (60-236)||(30283-30460)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (1-234)||(17701737-17701971)
chr8 (1-224)||(19707498-19707721)
chr8 (1-237)||(18321081-18321318)
chr8 (1-203)||(43644888-43645090)
chr8 (1-237)||(19156188-19156425)
chr8 (25-237)||(33082873-33083084)
chr8 (1-237)||(39693527-39693764)
chr8 (1-235)||(12757687-12757922)
chr8 (1-237)||(602642-602879)
chr8 (1-224)||(16188976-16189200)
chr8 (1-237)||(16207298-16207535)
chr8 (1-237)||(17525652-17525888)
chr8 (1-224)||(16681238-16681462)
chr8 (8-237)||(19943234-19943466)
chr8 (1-235)||(24646330-24646565)
chr8 (1-237)||(21932875-21933112)
chr8 (1-237)||(18718993-18719228)
chr8 (1-237)||(17914451-17914688)
chr8 (1-235)||(17441732-17441966)
chr8 (1-237)||(18121031-18121265)
chr8 (1-237)||(18679807-18680042)
chr8 (1-237)||(23185150-23185385)
chr8 (8-208)||(18685348-18685549)
chr8 (8-208)||(18722597-18722798)
chr8 (8-208)||(18730942-18731143)
chr8 (1-237)||(30421352-30421588)
chr8 (1-237)||(17267466-17267700)
chr8 (1-237)||(20382318-20382553)
chr8 (15-237)||(23263535-23263757)
chr8 (1-237)||(29693307-29693544)
chr8 (15-210)||(22461588-22461783)
chr8 (1-237)||(17797414-17797649)
chr8 (130-237)||(22745608-22745716)
chr8 (1-92)||(40845455-40845546)
chr8 (1-68)||(25164062-25164129)
chr8 (2-221)||(15336028-15336246)
chr8 (2-221)||(15425093-15425311)
chr8 (2-221)||(15516397-15516615)
chr8 (1-92)||(14989519-14989610)
chr8 (8-68)||(9320567-9320627)
chr8 (1-141)||(45538458-45538598)
chr8 (1-68)||(6407718-6407785)
chr8 (1-92)||(18151714-18151805)
chr8 (1-68)||(22673770-22673837)
chr8 (1-92)||(24551266-24551357)
chr8 (19-160)||(19956341-19956482)
chr8 (13-141)||(1237641-1237769)
chr8 (13-68)||(22663120-22663175)
chr8 (2-38)||(7018418-7018454)
chr8 (191-235)||(9320751-9320795)
chr8 (2-38)||(20259654-20259690)
chr8 (2-38)||(21046284-21046320)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-237)||(6007-6241)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-241)||(16032524-16032761)
chr3 (1-235)||(29951363-29951598)
chr3 (1-235)||(30000517-30000752)
chr3 (1-237)||(6090731-6090968)
chr3 (1-237)||(49642685-49642922)
chr3 (1-224)||(14392940-14393164)
chr3 (1-212)||(12388821-12389032)
chr3 (15-212)||(19249361-19249558)
chr3 (8-221)||(20725093-20725306)
chr3 (1-237)||(37467332-37467567)
chr3 (1-237)||(52920405-52920641)
chr3 (1-237)||(12963010-12963245)
chr3 (1-237)||(17238847-17239082)
chr3 (4-181)||(41495001-41495179)
chr3 (1-237)||(13948335-13948572)
chr3 (1-237)||(31303385-31303622)
chr3 (1-237)||(2561187-2561424)
chr3 (13-237)||(38177566-38177791)
chr3 (1-237)||(20646153-20646391)
chr3 (13-237)||(18121545-18121770)
chr3 (1-221)||(28582105-28582326)
chr3 (1-237)||(15903197-15903435)
chr3 (1-169)||(13780575-13780744)
chr3 (1-237)||(16658541-16658778)
chr3 (2-237)||(47207706-47207941)
chr3 (16-237)||(14969341-14969563)
chr3 (1-224)||(12726166-12726390)
chr3 (13-237)||(18142677-18142900)
chr3 (1-237)||(40799873-40800108)
chr3 (1-237)||(47405346-47405581)
chr3 (25-188)||(13824092-13824256)
chr3 (8-224)||(12968312-12968528)
chr3 (8-224)||(26417616-26417832)
chr3 (1-92)||(22804092-22804183)
chr3 (14-237)||(20627356-20627578)
chr3 (15-181)||(23538146-23538312)
chr3 (1-237)||(19888869-19889103)
chr3 (13-224)||(49553425-49553637)
chr3 (8-92)||(11223569-11223653)
chr3 (1-68)||(11868268-11868335)
chr3 (1-68)||(25398348-25398415)
chr3 (1-92)||(53056796-53056887)
chr3 (8-92)||(14955433-14955517)
chr3 (1-89)||(21605726-21605814)
chr3 (13-89)||(21640878-21640954)
chr3 (8-92)||(29855415-29855499)
chr3 (1-68)||(46796460-46796527)
chr3 (14-178)||(46349826-46349991)
chr3 (1-89)||(21636742-21636830)
chr3 (1-141)||(24775554-24775694)
chr3 (13-68)||(2785075-2785130)
chr3 (1-88)||(22140763-22140850)
chr3 (1-68)||(30054310-30054377)
chr3 (13-68)||(33583240-33583295)
chr3 (1-47)||(1728129-1728175)
chr3 (13-47)||(49666519-49666553)
chr3 (1-66)||(9700131-9700196)
chr3 (2-47)||(37412605-37412650)
chr3 (151-203)||(25398230-25398282)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (1-237)||(49332-49569)
scaffold0084 (1-237)||(32485-32722)
scaffold0084 (2-68)||(389-455)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-237)||(23284564-23284801)
chr6 (1-203)||(15987233-15987437)
chr6 (1-236)||(9717843-9718079)
chr6 (14-204)||(10640364-10640555)
chr6 (1-234)||(20112614-20112849)
chr6 (1-237)||(13602172-13602409)
chr6 (1-237)||(26972140-26972375)
chr6 (1-237)||(32544265-32544502)
chr6 (14-237)||(19470683-19470904)
chr6 (1-237)||(15302200-15302435)
chr6 (13-237)||(15531536-15531761)
chr6 (13-237)||(13435544-13435769)
chr6 (1-224)||(24116828-24117053)
chr6 (1-224)||(19086158-19086372)
chr6 (8-216)||(14100373-14100582)
chr6 (2-224)||(19623980-19624203)
chr6 (1-181)||(18378314-18378495)
chr6 (1-237)||(12715333-12715569)
chr6 (2-236)||(29918018-29918250)
chr6 (13-237)||(22802153-22802376)
chr6 (14-237)||(21625114-21625335)
chr6 (1-237)||(18435556-18435793)
chr6 (1-88)||(25594068-25594155)
chr6 (2-160)||(26943577-26943735)
chr6 (25-216)||(19688790-19688980)
chr6 (1-89)||(16265211-16265299)
chr6 (1-181)||(20730672-20730853)
chr6 (1-92)||(15954703-15954794)
chr6 (13-92)||(21235137-21235216)
chr6 (1-68)||(22076489-22076556)
chr6 (8-92)||(20487976-20488060)
chr6 (130-237)||(25597608-25597716)
chr6 (1-68)||(12423261-12423328)
chr6 (1-68)||(16336127-16336194)
chr6 (3-93)||(12348995-12349085)
chr6 (8-68)||(16877220-16877280)
chr6 (8-92)||(21618251-21618335)
chr6 (1-68)||(33352008-33352075)
chr6 (1-66)||(19482752-19482817)
chr6 (31-222)||(34451595-34451787)
chr6 (1-68)||(17381521-17381588)
chr6 (1-66)||(17316609-17316674)
chr6 (1-89)||(19066079-19066167)
chr6 (8-68)||(19833115-19833175)
chr6 (166-238)||(25930642-25930714)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-221)||(9997-10219)
scaffold0161 (1-68)||(14816-14883)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-237)||(14648-14883)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-237)||(1660-1895)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-237)||(18495-18732)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-224)||(19359-19583)
scaffold0035 (1-47)||(99270-99316)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (1-216)||(159055-159270)
scaffold0022 (105-237)||(39529-39662)
scaffold0022 (105-237)||(137589-137722)
scaffold0022 (13-62)||(37414-37463)
scaffold0022 (13-62)||(135474-135523)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-222)||(12209-12431)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-237)||(25849-26086)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-224)||(5577-5801)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-224)||(60016-60240)
scaffold0026 (1-237)||(7926-8161)
scaffold0026 (76-199)||(151783-151906)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-237)||(27305-27540)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-237)||(15117-15352)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-237)||(1690-1925)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-237)||(475-712)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-237)||(36649-36886)
scaffold0120 (1-237)||(42119-42356)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-237)||(22676-22913)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (8-209)||(43822-44023)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (2-210)||(40638-40846)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (15-237)||(36061-36281)
scaffold0056 (1-65)||(25712-25776)
scaffold0056 (1-89)||(34827-34915)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (2-237)||(212355-212590)
scaffold0005 (60-236)||(6073-6250)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (6-237)||(7708-7940)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-237)||(9969-10204)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (14-224)||(1409-1619)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-237)||(20845-21082)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (8-224)||(5634-5849)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (19-237)||(4821-5040)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (1-164)||(13571-13735)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (14-219)||(103585-103791)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-216)||(15793-16011)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-237)||(89931-90166)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (1-224)||(19031-19255)
scaffold0217 (1-65)||(9560-9624)
scaffold0217 (1-92)||(22151-22242)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-221)||(74581-74788)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (118-237)||(5813-5934)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (8-92)||(1324-1408)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (8-92)||(3-87)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (31-224)||(9825-10019)
scaffold0334 (1-35)||(7824-7858)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (8-92)||(215517-215601)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-92)||(675-766)
scaffold1359 (2-89)||(1778-1865)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (17-68)||(2039-2090)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-92)||(60803-60894)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (130-237)||(662-768)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-92)||(78386-78477)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (14-92)||(9168-9246)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-93)||(17784-17876)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (13-92)||(6760-6839)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-68)||(2774-2841)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (1-68)||(25443-25510)
scaffold0247 (1-38)||(15813-15850)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (130-188)||(4916-4975)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (2-92)||(15642-15732)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (3-68)||(7383-7448)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (191-237)||(9282-9326)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (8-47)||(7221-7260)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-68)||(5646-5713)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (191-237)||(60743-60789)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (2-68)||(164990-165056)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-38)||(6006-6043)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (196-237)||(13407-13448)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-68)||(3939-3999)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (1-65)||(2738-2802)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23881063 - 23881299
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23881063 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttca 23881162  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23881163 tttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagctt-tagtctctcatcttctg 23881261  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23881262 atgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatga 23881299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 6499235 - 6499470
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6499235 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaacttca 6499334  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||      
T  6499335 tttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatactgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaag--tctcatcttcat 6499432  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6499433 atgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatga 6499470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21099845 - 21099609
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21099845 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagcttca 21099746  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21099745 tttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgctaggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatcttctga 21099646  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21099645 tgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatga 21099609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 642836 - 642625
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
T  642836 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagcc 642737  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  642736 gttgtttcactctcctgatcttctgtaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaatt 642637  T
Q  213 tctggtgatctt 224  Q
    ||||||||||||    
T  642636 tctggtgatctt 642625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9398875 - 9398649
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9398875 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaacttca 9398776  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||          || |||| || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9398775 tttgaattagtcgttgctccactctcctg----------atcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctga 9398686  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9398685 tgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21072381 - 21072145
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  21072381 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 21072282  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||    
T  21072281 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtgagtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctcctga 21072182  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21072181 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21072145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23413115 - 23412880
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | |     
T  23413115 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaatcct 23413016  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || || | |||| |||||||| |||||||||||||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  23413015 ttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23412916  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23412915 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 23412880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21199144 - 21198911
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| | | ||||||||||||||| || ||||    
T  21199144 gagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaattca 21199045  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  |||| | || | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21199044 tttgaattagccgttgct-catttttctggtcttctgcagtactaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctga 21198946  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  21198945 tgaacttcagctcctggtga--tattgcttctgatga 21198911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12352936 - 12352795
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12352936 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaacttca 12352837  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg 142  Q
    ||||||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12352836 tttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatg 12352795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 89563 - 89328
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || || |||     
T  89563 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaattct 89464  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||    
T  89463 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatctcctg 89364  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  89363 atgaactacaacttctggtgatc--ttgcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7745834 - 7745599
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  7745834 gagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 7745735  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  7745734 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcctg 7745635  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  7745634 atgtacttcagcttcttgtgatc--ttgcttctgatga 7745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17814964 - 17815199
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | |     
T  17814964 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcct 17815063  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||   | |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  17815064 ttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 17815163  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17815164 atgaaatttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 17815199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25096960 - 25096753
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||||    
T  25096960 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25096861  T
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
    ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  25096860 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgat 25096761  T
Q  205 cttcagct 212  Q
    ||||||||    
T  25096760 cttcagct 25096753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25154930 - 25154723
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||||    
T  25154930 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25154831  T
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
    ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  25154830 aattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgat 25154731  T
Q  205 cttcagct 212  Q
    ||||||||    
T  25154730 cttcagct 25154723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21910552 - 21910787
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  21910552 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21910651  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || || | |||| |||||| | |  ||||| || |||| |||| || ||||||||| |||  ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| |||    
T  21910652 ttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 21910751  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21910752 atgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6512569 - 6512337
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||   |||||||||| || | |     
T  6512569 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaag---ccaatgccttcaaatcct 6512473  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||| |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  6512472 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 6512373  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  6512372 atgaactacaacttctagtgatc--ttgcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41566575 - 41566338
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| || | |     
T  41566575 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaatcct 41566476  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  41566475 ttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctg 41566376  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||    
T  41566375 atgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 41566338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20550891 - 20551107
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |       
T  20550891 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 20550989  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| || || |||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  20550990 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 20551089  T
Q  199 gatgaacttcagcttctg 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20551090 gatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19536442 - 19536206
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | ||    
T  19536442 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcca 19536343  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcact-ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  ||  ||| |||| |||||| ||  ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  19536342 ttcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcct 19536243  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||    
T  19536242 gatgaacttctgcttcttgcgatc--ttgcttctgatga 19536206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 26784353 - 26784587
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||| | | |  || | | ||     
T  26784353 acacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttc 26784452  T
Q  104 gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatg 202  Q
     || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||  ||||| ||| ||    
T  26784453 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctg 26784552  T
Q  203 aacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26784553 aactacagcttctggtgatcttcagcttctgatga 26784587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 33022660 - 33022895
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | |     
T  33022660 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 33022759  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||| |||    
T  33022760 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 33022857  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||||    
T  33022858 atgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatga 33022895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13545641 - 13545455
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||||    
T  13545641 gagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagtt 13545542  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||| |||||        |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  13545541 gttgcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 31117873 - 31118047
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||| || |||     
T  31117873 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattct 31117972  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt 174  Q
    ||  ||||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || | |||||||| ||  |||||||||    
T  31117973 ttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttt 31118047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 4887018 - 4887109
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  4887018 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 4887109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29138547 - 29138456
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| || ||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  29138547 gagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 29138456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28464480 - 28464388
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28464480 gagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28464388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 9088965 - 9089032
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9088965 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 9089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25930297 - 25930206
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  25930297 gagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcctt 25930206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3245582 - 3245490
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  3245582 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttt 3245490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 11993884 - 11993972
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  11993884 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 11993972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 30742983 - 30743043
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30742983 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30743043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14086680 - 14086613
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14086680 gagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 14086613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 30115978 - 30115911
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30115978 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 28139603 - 28139649
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28139603 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 28139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10848769 - 10848861
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | | |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  10848769 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgccttt 10848861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 42243683 - 42243743
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||    
T  42243683 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctctt 42243743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 33933263 - 33933330
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||    
T  33933263 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctt 33933330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208060
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctt 11208060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352722
Alignment:
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 12352722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 15516972 - 15517056
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| || |||| |||||  || |  ||||||||||||||||    
T  15516972 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgcctt 15517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35932147 - 35932059
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  35932147 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 40846093 - 40846330
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40846093 gagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttca 40846192  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40846193 tttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctg 40846292  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  40846293 atgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatga 40846330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23750516 - 23750751
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaa-aaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23750516 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaacttc 23750612  T
Q  100 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  23750613 atttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 23750712  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  23750713 gatgaacttcagcttctggttatctttaacttctgatga 23750751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 55380284 - 55380519
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  55380284 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 55380383  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  55380384 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctccta 55380483  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  55380484 atgaacttcagcttctgatgatc--ttgcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 6641678 - 6641912
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| || | |     
T  6641678 gagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaatcct 6641777  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6641778 tttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgctaggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttctga 6641877  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  6641878 tgaaattcagcttctggtga--tattgcttctgatga 6641912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139456
Alignment:
Q  63 gctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcca 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  162 ttgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac-ttcagcttctggtgatcttttgcttctga 234  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctga 15139456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 45833395 - 45833625
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || || | | ||  ||     
T  45833395 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaa 45833494  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||  |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  45833495 tagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 45833594  T
Q  207 tcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45833595 agagcttctggtgatctttagcttctgatga 45833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16632434 - 16632669
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| || |       
T  16632434 gagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaatctt 16632533  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  16632534 ttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 16632633  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16632634 atgaactttagcttctagtgatc--ttgcttctgatga 16632669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29680661 - 29680424
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  29680661 gagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 29680562  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||    
T  29680561 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctg 29680462  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     | ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29680461 gtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 29680424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37435652 - 37435428
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  37435652 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37435553  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |   |||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  37435552 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 37435453  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37435452 atgaacttcagcttctggtgatctt 37435428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12811292 - 12811058
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| || | |     
T  12811292 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctattagaa---caagcatccaatgccttcaaatcct 12811196  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  12811195 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 12811096  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||||    
T  12811095 atgaactagagcttctggtgatcttctactactgatga 12811058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601330
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||      
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    || |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||||   |||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  204 acttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     ||| | ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatc--ttgcttctgatga 12601330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19884696 - 19884932
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  19884696 gagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 19884795  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  19884796 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccat-gaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 19884894  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  19884895 atgaactacagcttctggtgattgtcagcttctgatga 19884932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19621178 - 19620962
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||| || || | |     
T  19621178 gagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 19621079  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||    
T  19621078 ttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcctg 19620979  T
Q  200 atgaacttcagcttctg 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  19620978 atgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37985729 - 37985541
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  37985729 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37985630  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 188  Q
    ||  || ||||||||| |||||| |    ||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37985629 ttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 37985541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14605023 - 14604788
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | |    
T  14605023 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 14604924  T
Q  102 tt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||| |||    
T  14604923 ttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctg 14604824  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  14604823 atgaagtttagcttctgatgatc--ttgcttctgatga 14604788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 56034568 - 56034803
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || ||      
T  56034568 gagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattat 56034667  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  56034668 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 56034767  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  56034768 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41114875 - 41114663
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||      
T  41114875 gagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagcc 41114776  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    |||| |||| ||| || ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41114775 gttgcttcattcttctagtcttttgcaatgacaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagct 41114676  T
Q  213 tctggtgatcttt 225  Q
     ||| ||||||||    
T  41114675 cctgatgatcttt 41114663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675402
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | | ||  ||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||| || |||||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T
Q  207 tcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22675432 gcagcttctggggattttttgcttctgatga 22675402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19666366 - 19666567
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| || |||||| || || | |     
T  19666366 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaatcct 19666465  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  19666466 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatctcctg 19666565  T
Q  200 at 201  Q
    ||    
T  19666566 at 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3395584 - 3395808
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || || | |     
T  3395584 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaatcct 3395683  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| |    || |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||    
T  3395684 ttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatctcctg 3395783  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||    
T  3395784 atgaactatagcttctagtgatctt 3395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 9140906 - 9141094
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  9140906 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 9141005  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 188  Q
    ||  || |||| |||| || ||| | |  ||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  9141006 ttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtct 9141094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Original strand, 11915701 - 11915896
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||     
T  11915701 aaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaa 11915800  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11915801 tagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgagcagcctttgaagcttcaattctctcagcttctgatga 11915896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10072929 - 10073146
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||| || | |     
T  10072929 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcct 10073028  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | |  ||||||||| ||| |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  10073029 ttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 10073127  T
Q  200 atgaacttcagcttctggt 218  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  10073128 atgaactactgcttctggt 10073146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19911994 - 19911760
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaa-agcaagcatccaatgcctttaacttcattt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| || || | | ||     
T  19911994 cacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttc 19911895  T
Q  104 gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatg 202  Q
     || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| | || || |||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  19911894 aaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 19911795  T
Q  203 aacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| || |||||| |||||||  |||||||||||    
T  19911794 aactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247472
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  |||    
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaat 17247344  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||| |||| |||||| |||   |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||    |||||| ||||||||||    
T  17247345 tagtcgttgcttcactttcc-aatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaact 17247441  T
Q  207 tcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17247442 gcagcttctggtgattttcagcttctgatga 17247472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413231
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  ||||||      
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |   |||| |||||||||| ||||    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagc 413205  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||    
T  413206 ttctggtgattttcagcttctgatga 413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22089721 - 22089818
Alignment:
Q  139 aatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22089721 aatgttaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatga 22089818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 23123576 - 23123662
Alignment:
Q  151 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23123576 gattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatga 23123662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13576231 - 13575996
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | |     
T  13576231 gagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 13576132  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| |||    
T  13576131 ttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 13576034  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13576033 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 13575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14904473 - 14904249
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| || | |     
T  14904473 gagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaatcct 14904374  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || | |  |||| |||||| | |  |||||||||||||  ||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||| | ||||  ||||| |||    
T  14904373 ttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctg 14904274  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  14904273 atgaactacaacttctggtgatctt 14904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17787962
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaattcctttgaaatagt 17788053  T
Q  112 tgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttca 209  Q
      |||       || || ||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| ||||| |||| |||||    
T  17788052 cattg-------cttctagtcttctgcaatgataagcgtgattaaatcatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctaatgatcttca 17787962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 29121364 - 29121455
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  29121364 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgcctt 29121455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10692845 - 10693064
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  10692845 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10692944  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  10692945 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 10693042  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10693043 atgaactacagcttctggtgat 10693064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10906611 - 10906830
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  10906611 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10906710  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  10906711 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 10906808  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10906809 atgaactacagcttctggtgat 10906830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483952
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 124  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||     
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  125 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 223  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||  |||||  | |||||||  | |||||||||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatct 3483938  T
Q  224 tttgcttctgatga 237  Q
    |  |||||||||||    
T  3483939 tcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833626
Alignment:
Q  60 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 158  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  159 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 14833626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17398791 - 17398699
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  17398791 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 17398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 6517479 - 6517546
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  6517479 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 6517546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540598
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| |||||    
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaat 17540495  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    ||||||||| |||| |||    ||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| ||  |||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  17540496 tagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatgataggcgagattaaatcatttgaacagcc--tgaagcttcaattctttcaacttctgatgatctt 17540593  T
Q  208 cagct 212  Q
    |||||    
T  17540594 cagct 17540598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680064
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  ||     
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 141  Q
    ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 54680064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16853497 - 16853585
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
T  16853497 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgc 16853585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3105536 - 3105469
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||    
T  3105536 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctt 3105469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685511
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattg 8685511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 20977451 - 20977516
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  20977451 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 20977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 8105638 - 8105698
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  8105638 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 8105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 40860661 - 40860749
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  40860661 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 56533172 - 56533112
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  56533172 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 56533112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 22190840 - 22190907
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22190840 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22190907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 38513872 - 38513939
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  38513872 gagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940075
Alignment:
Q  17 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc 16940075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22455096 - 22454859
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22455096 gagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttca 22454997  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22454996 tttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatcttctg 22454897  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22454896 aagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 22454859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 25189392 - 25189629
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25189392 gagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttca 25189491  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25189492 tttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaa 25189591  T
Q  201 tgaac-ttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    | ||| || |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  25189592 taaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39037748 - 39037511
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39037748 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaacttca 39037649  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39037648 tttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatcttctg 39037549  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    || ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||    
T  39037548 atcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatga 39037511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 24377095 - 24377332
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||   |     
T  24377095 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacct 24377194  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  24377195 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttg 24377294  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24377295 atgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 24377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21537353 - 21537117
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   | |    
T  21537353 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctt 21537254  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  21537253 tcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 21537154  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21537153 tgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatga 21537117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23595673 - 23595441
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | | | |||| |||||||||||| || ||||    
T  23595673 gagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaacaagaatccaatgccttcaaattca 23595576  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  23595575 tttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatcttctga 23595476  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23595475 tgatcttcagcttctggtgaac--ttgcttctgatga 23595441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18377012 - 18376775
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  18377012 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 18376913  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| ||||||||||| |     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||      
T  18376912 ttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatcttcaa 18376813  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18376812 atgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatga 18376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19540410 - 19540645
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||   |     
T  19540410 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacct 19540509  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    || ||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  19540510 ttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatg 19540609  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19540610 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 19540645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 25829128 - 25829363
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  25829128 gagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 25829227  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  25829228 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 25829327  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25829328 atgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13964084 - 13963850
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||     
T  13964084 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattct 13963985  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||    
T  13963984 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactg 13963885  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctga 234  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  13963884 atgaactagagcttctagtgatctttaacttctga 13963850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22188208 - 22187971
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |  |    
T  22188208 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcta 22188109  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||    
T  22188108 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctg 22188009  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22188008 atgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatga 22187971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20568853 - 20568632
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||     
T  20568853 acacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 20568754  T
Q  104 gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatg 202  Q
     || | ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  20568753 aaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatg 20568654  T
Q  203 aacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20568653 aactacagcttctggtgatctt 20568632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23235001 - 23235238
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||     
T  23235001 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaattct 23235100  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  23235101 ttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 23235200  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  23235201 atgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatga 23235238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30666983 - 30667220
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  30666983 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaatcct 30667082  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||| ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||    
T  30667083 ttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctg 30667182  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || |||||| |  ||||  |||||||||||    
T  30667183 atgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatga 30667220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9015474 - 9015240
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || | |     
T  9015474 gagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcct 9015377  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  9015376 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 9015277  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  9015276 atgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatga 9015240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41121825 - 41121582
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||| || | |     
T  41121825 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaatcct 41121726  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||| || |||||||    
T  41121725 tttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagcttctga 41121626  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatgatgtccatct 246  Q
    ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||    
T  41121625 tgatcttcagcttctggtga--tgttgcttctgatgaggtgcatct 41121582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10009856 - 10009620
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  10009856 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 10009757  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcact-ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  10009756 ttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcct 10009657  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10009656 gatgaacttcagcttctggtgatcttt--cttctgatga 10009620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24850772 - 24850534
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  24850772 gagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcct 24850673  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || || | |||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||    
T  24850672 ttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 24850573  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24850572 gatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatga 24850534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25037365 - 25037128
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  25037365 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 25037266  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||| |||   ||||||| |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  25037265 ttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 25037166  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  25037165 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 25037128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25041472 - 25041235
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  25041472 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 25041373  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||| |||   ||||||| |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  25041372 ttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 25041273  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  25041272 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 25041235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621447
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30621410 atgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30621447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624068
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30624031 atgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30624068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23184410 - 23184184
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | | | || | |||||||||||| || ||||    
T  23184410 gagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaaca-gaatccaatgccttcaaattca 23184314  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  23184313 tttgaattagtcgt-gcttcactcttctggtcttctgca-tgctaggtgtgattaa-tcctttgaacaacctttgaagctt-aattct-tcatcttctga 23184219  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23184218 tgatcttcagcttctggtgaac--ttgcttctgatga 23184184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26618998
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| ||||||     
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||| |||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgttgatctt 26619001  T
Q  208 cag 210  Q
    |||    
T  26619000 cag 26618998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24576029 - 24576254
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||| || ||||||||||||| | |     
T  24576029 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaatcct 24576128  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtga-ttaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||    
T  24576129 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcct 24576228  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  24576229 aatgaactttagcttctggtgatctt 24576254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272361
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaa-aagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||  ||  ||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||     
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
     ||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagct 22272338  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  22272339 tctggtga--tgttgcttctgatga 22272361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881395
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  || ||||||||||||| ||   |||||||||||| |    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagct 44881272  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    | || |||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  44881273 gctgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagct 44881372  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    | ||||||  | |||||||||||||    
T  44881373 tttggtga--tgttgcttctgatga 44881395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28140725 - 28140509
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || || | |     
T  28140725 gagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaatcct 28140626  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||   || |||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| | |    
T  28140625 ttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatctcccg 28140526  T
Q  200 atgaacttcagcttctg 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  28140525 atgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Original strand, 22317594 - 22317824
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatt-tgaa 106  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| | | ||   ||    
T  22317594 aaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaa 22317693  T
Q  107 ttagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac 205  Q
     |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  |||||  |||||||     
T  22317694 atagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaa 22317793  T
Q  206 ttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    |  ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22317794 tagagcttctggtgattttcagcttctgatg 22317824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115300
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| ||||||||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 19115188  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    |||| |||| ||| |  ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||     
T  19115189 gttgcttcattcttccagtcttctgcaatagtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagca 19115288  T
Q  213 tctggtgatctt 224  Q
     ||| |||||||    
T  19115289 cctgatgatctt 19115300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6573993
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaa 106  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  ||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  107 ttagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
     |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T
Q  205 cttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    || || ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  6574025 ctgcaacttctagtgattttcagcttctgatga 6573993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 38781405 - 38781628
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  || |||||    
T  38781405 gagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38781504  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||| | |  ||||||| || || |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    || |    
T  38781505 gttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatc 38781602  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  38781603 ttctggtgatcttcagcttctgatga 38781628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151905
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||   |||| ||||||     
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  125 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 223  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || | |  ||||| ||||||| || |||||||||||||| |    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattt 20151919  T
Q  224 tttgcttctgatga 237  Q
    |  |||||||||||    
T  20151918 tcagcttctgatga 20151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 24779337 - 24779525
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||| || || | |     
T  24779337 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcct 24779436  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 188  Q
    ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| | ||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24779437 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 40782471 - 40782612
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  40782471 gagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcct 40782570  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg 142  Q
    ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  40782571 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatg 40782612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702956
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||  ||||  ||||| |||  ||| || ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||      
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18702843  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    |||  ||||  || || |||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  18702844 gttacttcatgcttctagtcttctgtaatgatagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaact 18702943  T
Q  213 tctggtgatcttt 225  Q
     ||| ||||||||    
T  18702944 cctgatgatcttt 18702956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18430970 - 18430835
Alignment:
Q  77 aagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttga 176  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  18430970 aagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcatgcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttga 18430871  T
Q  177 agcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18430870 agctttaattctttcagcttctgatgatcttcagct 18430835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28711804 - 28711664
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||||    
T  28711804 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattca 28711705  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 141  Q
    || ||| |||| |||| || ||| | |  ||||||||||||    
T  28711704 ttcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaat 28711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31800993 - 31800905
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||    
T  31800993 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgc 31800905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28551024 - 28550932
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28551024 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28550932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 44840428 - 44840520
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  44840428 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 44840520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260624
Alignment:
Q  33 gtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtc 132  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||| | |||| || | | |   || || |||||| |||||| | |  |||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  133 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatctt 22260624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22776394 - 22776302
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22776394 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22776302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22781772 - 22781680
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22781772 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22781680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 7609107 - 7609191
Alignment:
Q  151 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7609107 gattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 7609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 1587132 - 1587047
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |   ||||||||||||||||    
T  1587132 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttt 1587047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 14581525 - 14581601
Alignment:
Q  17 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  14581525 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 14581601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22258195 - 22258231
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258195 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31968149 - 31968061
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  31968149 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 31968061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 40332081 - 40332173
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  40332081 gagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 40332173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557360
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30557360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 33074220 - 33074267
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaat 48  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33074220 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaat 33074267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35744106 - 35744039
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744106 gagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 35744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277115
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 3277115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785669
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22785669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 22802461 - 22802521
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  22802461 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctt 22802521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28379680 - 28379634
Alignment:
Q  195 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatgatgtc 241  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28379680 ttctgatgaccttctgcttctggtgagcttctgcttctgatgatgtc 28379634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28701322 - 28701244
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||    
T  28701322 agtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgcctt 28701244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30557236 - 30557190
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30557236 catcctctgatgaactgcagcttctggtgatatttagcttctgatga 30557190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 6392634 - 6392694
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6392634 aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 6392694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19498048 - 19498012
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19498048 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19498012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392686
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctttgagaagaaagcatccaatgc 23392686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321950
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgccttt 34321950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39284726 - 39284490
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || ||||    
T  39284726 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattca 39284627  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  39284626 tttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctga 39284527  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39284526 tgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13018666 - 13018432
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  13018666 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaacttcat 13018567  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    || || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||| |||||  |    
T  13018566 ttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatactgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaag--tctcgtcttcata 13018469  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13018468 tgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatga 13018432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41842435 - 41842212
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  41842435 gagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaacttca 41842336  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| || |||| || ||| ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41842335 tttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagctt-aagtctctcatcttctg 41842237  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41842236 atgaacttcagcttctggtgatctt 41842212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21695397 - 21695634
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |       
T  21695397 gagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcat 21695496  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  21695497 tttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttg 21695596  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21695597 atgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21695634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16316719 - 16316484
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | |     
T  16316719 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcct 16316620  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||    
T  16316619 ttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctg 16316520  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16316519 atgaacttcaacttctggtgatc--ttgcttctgatga 16316484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29935520 - 29935286
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  29935520 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 29935421  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||  || ||||||  ||||| ||||    
T  29935420 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctcctga 29935321  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29935320 tgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 29935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032045
Alignment:
Q  22 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  122 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctc 189  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatactaggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtctc 13032045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 44467060 - 44467298
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  44467060 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 44467159  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  44467160 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 44467259  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44467260 gatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatga 44467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11792903 - 11793140
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | |     
T  11792903 gagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaatgct 11793002  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||  |||||||  |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  11793003 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctg 11793102  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11793103 atgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 11793140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15088516 - 15088753
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || | |     
T  15088516 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcct 15088615  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||    
T  15088616 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctg 15088715  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15088716 atgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatga 15088753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10883335 - 10883099
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || | |     
T  10883335 gagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcct 10883236  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||    
T  10883235 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 10883136  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10883135 atgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatg 10883099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13302806 - 13303030
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | |     
T  13302806 gagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 13302905  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  13302906 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 13303005  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13303006 atgaactacagcttctggtgatctt 13303030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13648725 - 13648960
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |     
T  13648725 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcct 13648824  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  13648825 ttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctg 13648924  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  13648925 atgagctttagcttctgttgatc--ttgcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2913770 - 2913533
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  2913770 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 2913671  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| | |||| | || |||||||||| || ||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||    
T  2913670 ttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatctcctg 2913571  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  2913570 atgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatga 2913533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11319401 - 11319638
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | |     
T  11319401 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcct 11319500  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  ||    
T  11319501 ttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttg 11319600  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11319601 atgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 11319638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 28409035 - 28409271
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | |     
T  28409035 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 28409134  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || || |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||  |||||  ||    
T  28409135 ttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttg 28409234  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  28409235 atgaactttagcttctggtga-ctgttgcttctgatga 28409271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13138057 - 13137833
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |       
T  13138057 gagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctt 13137958  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  13137957 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctt 13137858  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  13137857 atgaactagagcttctggtgatctt 13137833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13894153 - 13893949
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||| || ||| | ||| ||| ||||||||| || | | |||||||    
T  13894153 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaat 13894054  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||    
T  13894053 tagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatgatctt 13893954  T
Q  208 cagct 212  Q
    |||||    
T  13893953 cagct 13893949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19236969
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | |    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 201  Q
    |  || |||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctggt 19237005  T
Q  202 gaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     | |||||||| ||  |||||||  |||||||||||    
T  19237004 aatcttcagctcctaatgatcttcagcttctgatga 19236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21283535 - 21283300
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  21283535 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcct 21283436  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || | |  |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | |||    
T  21283435 ttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctg 21283336  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21283335 atgaacttcaacttctggtgatc--ttgcttctgatga 21283300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21692283 - 21692504
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  21692283 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21692382  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  21692383 ttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatctccta 21692482  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  21692483 atgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22578183 - 22577959
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | |     
T  22578183 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaatcct 22578084  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  22578083 ttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22577984  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22577983 atgaacttcagcttctggtgatctt 22577959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 24788137 - 24788372
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  || | |||||| |||||||||| || | |     
T  24788137 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcct 24788236  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || || | |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  24788237 ttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccta 24788336  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24788337 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 2500034 - 2500271
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||| || || | |     
T  2500034 gagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaatcct 2500133  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  2500134 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 2500233  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |  |||   |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  2500234 aaaaacaagagcttctggtgatcctcagcttctgatga 2500271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 9069558 - 9069795
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |  || | ||||||| |||||||||||| | |     
T  9069558 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaatcct 9069657  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||    
T  9069658 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctg 9069757  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9069758 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatga 9069795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468149
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||| || ||||     
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 15468123  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||    
T  15468124 ttctggtaatcttcagcatctgatga 15468149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33691874 - 33691653
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| || |||||||| |||     
T  33691874 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaattct 33691775  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||    
T  33691774 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatctcctg 33691675  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  33691674 atgaactagagcttctggtgat 33691653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12366910 - 12366675
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| || || | |     
T  12366910 gagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcct 12366811  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |  || || |||    
T  12366810 ttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctg 12366711  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12366710 atgaacttcagcttctggtgacc--ttgcttctgatga 12366675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13730837 - 13730656
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |       
T  13730837 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatctt 13730738  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    ||  || |||  |||| ||||||||  | ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13730737 ttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 13730656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13880100 - 13880337
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| || | |     
T  13880100 gagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaatcct 13880199  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||  |  ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||  | |||    
T  13880200 ttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaattcctg 13880299  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  |||||||  |||||||  |||||||||||    
T  13880300 atgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatga 13880337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5000984 - 5000784
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| || || | |     
T  5000984 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcct 5000885  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcac-tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  5000884 ttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttct 5000785  T
Q  199 g 199  Q
    |    
T  5000784 g 5000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30025901 - 30026138
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||     
T  30025901 gagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaa-ttct 30025999  T
Q  101 ttt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    |||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||| ||| |||  || || |||||||||||  || | |||||||||| ||||||  |||||  |    
T  30026000 tttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctctt 30026099  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30026100 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 30026138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692562
Alignment:
Q  26 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||| |         || ||||||||| ||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctttca---------aaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  126 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880775
Alignment:
Q  25 tagtggttgtac-acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 123  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  124 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctc 191  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctc 13880775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28622518 - 28622283
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||| || | |     
T  28622518 gagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcct 28622419  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||  |||| |||||| | || || |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  28622418 ttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 28622321  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  28622320 atgaactgcagcttctggtgatttttagcttatgatga 28622283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16310069 - 16309978
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16310069 gagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctt 16309978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30944485 - 30944271
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | |     
T  30944485 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 30944386  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  30944385 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30944288  T
Q  200 atgaacttcagcttctg 216  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30944287 atgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16112046 - 16111955
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  16112046 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 16111955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945285
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| || | |     
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||| ||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  30945320 atgaactgcagcttctgatgaac--ttgcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279900
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||  |||| | |||| | |  ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23279915  T
Q  207 tcagcttctggtgat 221  Q
     || |||||||||||    
T  23279914 acaacttctggtgat 23279900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13260777 - 13260561
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||  || | ||||||||||||||       ||||    
T  13260777 gagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgc------tttca 13260684  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |  ||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||  ||||| |||    
T  13260683 taagaa-tagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctg 13260586  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13260585 atgaactttagcttctggtgatctt 13260561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 331641 - 331877
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||| |  | |     
T  331641 gagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagcaa-taagcatccaatgccttcagatcct 331739  T
Q  101 tt-tgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||   || ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| || | ||   || |||||||   |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  331740 ttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatctcct 331838  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  331839 gatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9709964 - 9709729
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | |     
T  9709964 gagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 9709865  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| |||    
T  9709864 ttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 9709767  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9709766 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 9709729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  133 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 216  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48237064 - 48236829
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||  ||||||| || | |     
T  48237064 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcct 48236965  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || | || |||| |||||  |    ||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  48236964 ttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctg 48236867  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  48236866 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 48236829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1293026 - 1293118
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  1293026 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 1293118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 4821470 - 4821561
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  4821470 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 4821561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 14426543 - 14426634
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  14426543 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 14426634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 33605681 - 33605772
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  33605681 gagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 33605772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 14193110 - 14193201
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  14193110 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctt 14193201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 48062982 - 48062890
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48062982 gagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48062890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425531
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14425531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19711175 - 19711108
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  19711175 gagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 19711108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35952850 - 35952783
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  35952850 gagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 35952783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9098251 - 9098205
Alignment:
Q  170 cctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 216  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098251 cctttgaagctttaattctctcatcttctgatgatcttcagcttctg 9098205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 8182926 - 8182971
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtaca 46  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8182926 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaca 8182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098284
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || || | | ||||||||||  |||| |||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactc 9098285  T
Q  125 t 125  Q
    |    
T  9098284 t 9098284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339324
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 27871714 - 27871778
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  27871714 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265614
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2265614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12174313 - 12174269
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12174313 catcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctgat 12174269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193305
Alignment:
Q  171 ctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgat 14193305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24794877 - 24794813
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  24794877 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10188
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||||    
T  9958 gacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatt 10057  T
Q  103 tgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 201  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10058 tgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctgat 10157  T
Q  202 gaacttcagcttctggtgatcttttgcttct 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10158 gaacttcagcttctggtgaactttagcttct 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 220242 - 220474
Alignment:
Q  5 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  220242 cacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaattcatttg 220340  T
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  220341 aattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatga 220440  T
Q  204 acttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  220441 acttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 220474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244172
Alignment:
Q  6 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttga 105  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | |||||    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  106 attagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac 205  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaacgccaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaaacttcaattctctcatcttct-atgatc 244192  T
Q  206 ttcagcttctggtgatcttt 225  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  244191 ttcagctcctgatgatcttt 244172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 377670 - 377433
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||  ||     
T  377670 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcc 377572  T
Q  101 tttgaat-tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||| ||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||    
T  377571 tttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatctcct 377472  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  377471 gatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatga 377433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21028792 - 21029029
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21028792 gagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttca 21028891  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||     
T  21028892 tttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatattcta 21028991  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21028992 atgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21029029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26702210 - 26701973
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26702210 gagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttca 26702111  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  || |||| |||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26702110 tttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctg 26702011  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  26702010 atgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatga 26701973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33256432 - 33256197
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  33256432 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 33256333  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||| || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  33256332 tttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 33256233  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33256232 ttgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 33256197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33276604 - 33276369
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  33276604 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 33276505  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||| || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  33276504 tttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 33276405  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33276404 gtgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 33276369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28492485 - 28492248
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  28492485 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 28492386  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  28492385 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 28492286  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||  ||||||  |||||||||||    
T  28492285 atgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatga 28492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 22153856 - 22154093
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  22153856 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 22153955  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  22153956 ttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22154055  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22154056 atgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatga 22154093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21191946 - 21191766
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  21191946 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 21191847  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21191846 tttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctt 21191766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 12284422 - 12284657
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  12284422 gagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 12284521  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  12284522 ttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 12284621  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12284622 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 12284657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22600263 - 22600026
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  22600263 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22600164  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  22600163 ttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22600064  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22600063 atgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatga 22600026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 1577866 - 1578090
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||     
T  1577866 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaattct 1577965  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  1577966 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 1578065  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||    
T  1578066 ataaactttagcttcttgtgatctt 1578090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 10757420 - 10757656
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  10757420 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 10757519  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  10757520 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 10757619  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  10757620 gatgaacttcagcttttgatgatc--ttgcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024811
Alignment:
Q  17 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  117 attcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 216  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||  | ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatgttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctg 17024830  T
Q  217 gtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||  | |||||||||||||    
T  17024829 gtga--tgttgcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12613895 - 12613700
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||| || || | |     
T  12613895 gagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaat-ct 12613797  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 197  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12613796 tttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttc 12613700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 48704203 - 48704426
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||| || | |     
T  48704203 gagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcct 48704302  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  |||||||||| || |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  48704303 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 48704402  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatct 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  48704403 atgaactttagcttctggtgatct 48704426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1900344 - 1900585
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| | |     
T  1900344 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcct 1900443  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  1900444 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 1900543  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatgatgtc 241  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1900544 atgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatgatgtc 1900585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20954554 - 20954317
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||| || || | |     
T  20954554 gagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcct 20954455  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || | |   ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  20954454 ttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 20954355  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20954354 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 20954317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19717523 - 19717758
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| || | |     
T  19717523 gagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaatcct 19717622  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||| ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |      
T  19717623 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccat 19717722  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19717723 atgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 19717758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 38282566 - 38282802
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| | |     
T  38282566 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcct 38282664  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||   |||| |||||||| |  ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  38282665 ttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 38282764  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  38282765 atgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatga 38282802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785798
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  32785819 atgaactacaacttctagtgat 32785798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22201817 - 22201601
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| || | |     
T  22201817 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22201718  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| || ||| |    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  || ||||||  |||| ||||||  ||||| |||    
T  22201717 ttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatctcctg 22201618  T
Q  200 atgaacttcagcttctg 216  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  22201617 atgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 2267088 - 2267269
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || |||     
T  2267088 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattct 2267187  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2267188 ttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 2267269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 2268530 - 2268763
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||  |||    
T  2268530 gagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaa-atca 2268628  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||| ||  | | |||| || ||||| |  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||| ||     
T  2268629 tttcaa--aatagttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatctccta 2268726  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2268727 atgaactttagcttctagtgat-tgttgcttctgatga 2268763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 36134189 - 36134419
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | |     
T  36134189 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaatcct 36134287  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| | |||| | |  |||||||||| || ||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||||||    
T  36134288 ttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatcttctg 36134387  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctg 233  Q
    ||||    |||||||||||||||||  |||||||    
T  36134388 atga--gacagcttctggtgatcttcagcttctg 36134419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402043
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    ||| |||||| | |  |||||||| | || |||  || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 35402018  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  35402019 tctggtgatcttcagcttctgatga 35402043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22427438 - 22427203
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  22427438 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 22427339  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| |||    
T  22427338 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 22427241  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22427240 atgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatga 22427203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 29215796 - 29216031
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  29215796 gagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 29215895  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | || ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  29215896 ttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 29215993  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| | || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29215994 atgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036373
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||||||    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    ||| |||||| |  | |||||||||| |  |||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 23036398  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  23036397 tctggtgatcttcagcttctgatga 23036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 30893091 - 30893327
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | |||||||| | ||| || || | |     
T  30893091 gagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcct 30893190  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||   ||| |||||||  ||| |||| ||||||| || | || |||| |||||| || |||||| |||||| ||| ||||||  ||||| ||    
T  30893191 ttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcct 30893290  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  30893291 gatgaactttagcttttggtgatc--ttgcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 39201066 - 39200986
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 88  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  39201066 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 39200986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22464878 - 22464716
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagt 111  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||    
T  22464878 gagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcatttcaaattagt 22464780  T
Q  112 tgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt 174  Q
     |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||| |||||||||    
T  22464779 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttt 22464716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16235365 - 16235142
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   | | ||||||| ||||||||| || | | ||  || ||||     
T  16235365 gagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 16235266  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||| | |  |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||  |||||| ||||||    || |    
T  16235265 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaac 16235168  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  16235167 ttctggtgatcttcagcttctgatga 16235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 35040165 - 35040253
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  35040165 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgc 35040253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 46088988 - 46089080
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  46088988 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 46089080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 48570312 - 48570220
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48570312 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48570220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25448647 - 25448556
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  25448647 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 25448556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896523
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaa 156  Q
    ||| |||   || || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18896565 ttgcttcttgcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaa 18896523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 30572203 - 30572263
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30572203 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 30572263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21702813 - 21702880
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21702813 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21702880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 2834701 - 2834780
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||    
T  2834701 gagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgcctt 2834780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 7309973 - 7310054
Alignment:
Q  156 aatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  7309973 aatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatcttcagcttctgatga 7310054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 19215611 - 19215676
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  19215611 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctc 19215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 23024787 - 23024852
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23024787 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 23024852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 237
Target Start/End: Original strand, 12284648 - 12284689
Alignment:
Q  194 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12284648 cttctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 12284689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21121145 - 21121057
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21121145 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2327509 - 2327454
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  2327509 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 2327454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 10250985 - 10251076
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||  |||||  || |  ||||||||||||||||    
T  10250985 gagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgcctt 10251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 44821626 - 44821559
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  44821626 gagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 44821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7744982 - 7744936
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7744982 catcttctgatgaactgcagcttctggtgatatatggcttctgatga 7744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  16 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2327331 - 2327287
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2327331 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttctgat 2327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263465
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctt 14263465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21135241 - 21135153
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  21135241 gagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204937
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10123
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||    
T  9903 gagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaattca 10002  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10003 tttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgctagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatcttctga 10102  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10103 tgaacttcagcttctggtgat 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30460
Alignment:
Q  60 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 158  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  159 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 30460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17701737 - 17701971
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||  |   ||||||||||||||| || | |     
T  17701737 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaatcct 17701836  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17701837 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctg 17701936  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17701937 atgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctga 17701971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19707498 - 19707721
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||| ||| ||||||||| || ||||    
T  19707498 gagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattca 19707597  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19707598 tttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctga 19707697  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  19707698 tgatcttcagcttctggcgatctt 19707721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18321318 - 18321081
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | || | |     
T  18321318 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcct 18321219  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  18321218 ttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 18321119  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18321118 atgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatga 18321081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 43644888 - 43645090
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  43644888 gagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattca 43644987  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||    
T  43644988 tttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctttgattctctcatcttccga 43645087  T
Q  201 tga 203  Q
    |||    
T  43645088 tga 43645090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19156188 - 19156425
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  19156188 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 19156287  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||||  ||    
T  19156288 ttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttg 19156387  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  19156388 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 19156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083084
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  125 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 223  Q
    | ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc- 33083071  T
Q  224 tttgcttctgatga 237  Q
     |||||||||||||    
T  33083072 -ttgcttctgatga 33083084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 39693527 - 39693764
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  39693527 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 39693626  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  39693627 ttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 39693726  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39693727 atgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 39693764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12757922 - 12757687
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  12757922 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 12757823  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||  ||||| |||    
T  12757822 ttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctg 12757723  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||||||  |||| |||||||||||  |||||||||    
T  12757722 atgaactagagctactggtgatcttcagcttctgat 12757687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 602879 - 602642
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  602879 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 602780  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||  ||| | |||    
T  602779 ttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctg 602680  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  602679 atgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatga 602642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16188976 - 16189200
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||  |||    
T  16188976 gagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaa-atca 16189074  T
Q  101 ttt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    |||  || |||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  16189075 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 16189174  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  16189175 aatgaacttcggcttctggtgatctt 16189200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16207298 - 16207535
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  16207298 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 16207397  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  16207398 ttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctg 16207497  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16207498 atgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatga 16207535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17525888 - 17525652
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  17525888 gagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 17525789  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  |||||||||| || |||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||    
T  17525788 ttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcct 17525689  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  17525688 gatgaactacagtttctggtgatc--ttgcttctgatga 17525652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16681462 - 16681238
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | |     
T  16681462 gagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 16681363  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  16681362 ttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 16681263  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  16681262 atgaactttagcttctagtgatctt 16681238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943466
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaa-agcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaa 106  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||| || | | ||  ||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  107 ttagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  205 cttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19943434 cttcagcttctagtgatctttagcttctgatga 19943466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24646330 - 24646565
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||  || | |     
T  24646330 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaatcct 24646429  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||  |||||  ||    
T  24646430 ttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcttg 24646529  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  24646530 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 24646565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21932875 - 21933112
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| | |     
T  21932875 gagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcct 21932974  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| ||||||||    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  21932975 ttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 21933074  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21933075 atgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatga 21933112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18718993 - 18719228
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  18718993 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 18719092  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
     |  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| ||   || |||| |||||| || ||| |||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  18719093 atcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 18719192  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18719193 aagaacttaagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17914451 - 17914688
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | |     
T  17914451 gagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcct 17914550  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  || || ||     
T  17914551 ttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactccta 17914650  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  17914651 atgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatga 17914688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17441966 - 17441732
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| || | |     
T  17441966 gagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatg-cttcaaatcct 17441868  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| || | ||| |  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  17441867 ttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctg 17441768  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17441767 atgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 17441732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18121265 - 18121031
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  || | |||||||||||||||||||| | |     
T  18121265 gagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcct 18121169  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||    
T  18121168 ttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 18121069  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18121068 atgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatga 18121031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18679807 - 18680042
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  18679807 gagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 18679906  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
     |  || |||| |||| || ||||  |||||||| ||||||| |||| || |||| |||||| || || ||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  18679907 atcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 18680006  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  18680007 atgaaatgaagcttctagtgatc--ttgcttctgatga 18680042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23185385 - 23185150
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | |     
T  23185385 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 23185286  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||| |||    
T  23185285 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctg 23185188  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  23185187 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 23185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685348
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||  ||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgctagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatgatct 18685350  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  18685349 tc 18685348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722597
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatct 18722599  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  18722598 tc 18722597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730942
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatct 18730944  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  18730943 tc 18730942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30421588 - 30421352
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt--aaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 98  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| || |     
T  30421588 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaa-tgtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 30421490  T
Q  99 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 197  Q
    ||||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||||    
T  30421489 cattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatcttc 30421392  T
Q  198 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30421391 tgatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17267466 - 17267700
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| || || | |     
T  17267466 gagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcct 17267565  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||| ||||| |||||||    |||||| ||||||| || | || |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  17267566 ttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 17267664  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17267665 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 17267700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20382553 - 20382318
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||| | | || || | |     
T  20382553 gagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcct 20382454  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||   | |||  |||| |||||||  || ||||| |||||||  | | || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||| |||    
T  20382453 ttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctg 20382354  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20382353 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 20382318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263535
Alignment:
Q  15 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  115 tgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagct-tgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    || |||||||| || |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| |||||  |||||||||||||    
T  23263557 tctgatgatc--ttgcttctgatga 23263535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 29693307 - 29693544
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || || | |     
T  29693307 gagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcct 29693406  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||  |||  ||||| ||||| ||||||  ||||| ||     
T  29693407 ttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatctccta 29693506  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  29693507 atgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatga 29693544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461588
Alignment:
Q  15 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  115 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcag 210  Q
    || |||| ||| || ||||||||||||| || ||  |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||| ||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatgatatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagcttaaattcgttcagcttctgatgatcttcag 22461588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17797414 - 17797649
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  17797414 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaattcct 17797513  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  ||||  ||||| | |  |||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||  |  ||||| |||    
T  17797514 ttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatctcctg 17797611  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17797612 atgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 17797649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 22745608 - 22745716
Alignment:
Q  130 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 228  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  22745608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 22745707  T
Q  229 ttctgatga 237  Q
    |||||||||    
T  22745708 ttctgatga 22745716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40845546 - 40845455
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  40845546 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40845455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 25164062 - 25164129
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  25164062 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactctt 25164129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15336246 - 15336028
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | |    
T  15336246 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15336147  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| ||||    
T  15336146 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15336049  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15336048 tgaactacagcttctggtgat 15336028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15425311 - 15425093
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | |    
T  15425311 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15425212  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| ||||    
T  15425211 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15425114  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15425113 tgaactacagcttctggtgat 15425093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15516615 - 15516397
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | |    
T  15516615 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctt 15516516  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| ||||    
T  15516515 tcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 15516418  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15516417 tgaactacagcttctggtgat 15516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14989610 - 14989519
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14989610 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14989519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 9320567 - 9320627
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  9320567 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctctt 9320627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45538598 - 45538458
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | |     
T  45538598 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcct 45538499  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 141  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  45538498 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 45538458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 6407718 - 6407785
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  6407718 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctt 6407785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18151805 - 18151714
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  18151805 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 18151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 22673770 - 22673837
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22673770 gagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22673837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 24551266 - 24551357
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  24551266 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 24551357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19956482 - 19956341
Alignment:
Q  19 tggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 118  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||||  |||| ||||||||||| ||  |  ||| |||||||||||| || | | || |||||||| |||| |    
T  19956482 tggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgct 19956383  T
Q  119 tcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcc 160  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||    
T  19956382 tcactcttctgatcttctacaatactaggcgaggttaaatcc 19956341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Original strand, 1237641 - 1237769
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||  || | |||  |||||||||||| || | | ||  || ||||     
T  1237641 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 1237740  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaat 141  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||    
T  1237741 gttgcttcacttttccggtcttctgcaat 1237769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 22663120 - 22663175
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22663120 gagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22663175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 7018454 - 7018418
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018454 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7018418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 9320751 - 9320795
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9320751 catcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctgat 9320795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20259690 - 20259654
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20259690 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20259654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21046320 - 21046284
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21046320 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21046284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 6007 - 6241
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  6007 gagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 6106  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6107 tttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatcttctga 6206  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||    
T  6207 tgaacttcaacttctagtga--tattgcttctgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16032524 - 16032761
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  16032524 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 16032623  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16032624 ttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtgataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctga 16032723  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatgatgtc 241  Q
    || |||||| |||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  16032724 tg-acttcaacttcgggtga--tattgcttatgatgatgtc 16032761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29951598 - 29951363
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  29951598 gagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 29951499  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29951498 ttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctg 29951399  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  29951398 atgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgat 29951363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30000752 - 30000517
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  30000752 gagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30000653  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30000652 ttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctg 30000553  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgat 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30000552 atgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgat 30000517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 6090731 - 6090968
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||| || | |     
T  6090731 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaatcct 6090830  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||  ||||| |||    
T  6090831 ttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctg 6090930  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6090931 atgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatga 6090968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49642922 - 49642685
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  49642922 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaatcct 49642823  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  49642822 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 49642723  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  49642722 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatga 49642685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14393164 - 14392940
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  14393164 gagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 14393065  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   |||| ||     
T  14393064 ttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatctccta 14392965  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  14392964 atgaacttcagcttctagtgatctt 14392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12389032 - 12388821
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||     
T  12389032 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaattct 12388933  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12388932 tttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattctagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctta 12388833  T
Q  201 tgaacttcagct 212  Q
    ||| ||||||||    
T  12388832 tgatcttcagct 12388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249361
Alignment:
Q  15 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 114  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  115 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaatgatcttcagct 19249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725306
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| || | | |||||||    
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatctt 20725292  T
Q  208 cagcttctggtgat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  20725293 cagcttctggtgat 20725306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 37467332 - 37467567
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  37467332 gagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 37467431  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |  ||||| |||    
T  37467432 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatctcctg 37467531  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37467532 atgaactactgcttctggtgatc--ttgcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 52920405 - 52920641
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | |     
T  52920405 gagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatac- 52920503  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||  ||||| |||    
T  52920504 tttaaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctg 52920603  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52920604 atgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 52920641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12963245 - 12963010
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||   |     
T  12963245 gagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaacct 12963146  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    | | || ||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||| |  |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  12963145 tctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctg 12963046  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12963045 atgaactacaacttctggtgatc--ttgcttctgatga 12963010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17239082 - 17238847
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  17239082 gagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 17238983  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  17238982 ttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctt 17238883  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17238882 atgcacttcatcttctggtgatc--ttgcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 41495001 - 41495179
Alignment:
Q  4 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||     
T  41495001 acacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttc 41495100  T
Q  104 gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
     || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41495101 aaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13948335 - 13948572
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  13948335 gagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 13948434  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| |||    
T  13948435 ttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 13948534  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13948535 atgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatga 13948572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 31303385 - 31303622
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| ||| || | |     
T  31303385 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcct 31303484  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||    
T  31303485 ttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctg 31303584  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31303585 agtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 31303622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 2561187 - 2561424
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||  ||| || | |     
T  2561187 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaatcct 2561286  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  2561287 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 2561386  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||    
T  2561387 atgaactagagcttctggtgattctcagcttctgatga 2561424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177566
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||||| |   ||||||||| || | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||  |||    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagc 38177592  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38177591 ttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 20646153 - 20646391
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  20646153 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 20646252  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |||||||||| ||||| || | || ||| |||| ||||| ||| || ||| |||||| ||||||  ||||| ||    
T  20646253 ttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatctcct 20646352  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20646353 gatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 20646391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18121770 - 18121545
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| |||||||||||| | | ||  || |||||    
T  18121770 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtt 18121671  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgtt-aggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||  |||    
T  18121670 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagc 18121571  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18121570 ttctggtgatctttagcttatgatga 18121545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 28582105 - 28582326
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||| | |     
T  28582105 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcct 28582204  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |   ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  28582205 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 28582304  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  28582305 atgaaatagagcttctggtgat 28582326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15903197 - 15903435
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt-aaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| || || | |    
T  15903197 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcc 15903296  T
Q  100 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
     ||  || |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  15903297 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcct 15903396  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| || | |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  15903397 gataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatga 15903435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13780744 - 13780575
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  13780744 gagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaatcct 13780645  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaa 169  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||    
T  13780644 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16658778 - 16658541
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || | |     
T  16658778 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcct 16658679  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| || |||| || | || |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |||    
T  16658678 ttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatctcctg 16658579  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16658578 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 47207706 - 47207941
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  47207706 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcat 47207804  T
Q  102 tt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | |  |||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |  | |  ||||| ||    
T  47207805 ttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcct 47207902  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47207903 gatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47207941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969563
Alignment:
Q  16 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  || |  |||||||||||||| | || | | ||  || ||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  116 gattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 214  Q
    | || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | || |||||||  ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  215 tggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||  || ||||||||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatga 14969563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12726390 - 12726166
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| || || | |     
T  12726390 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 12726291  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||  |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||   |||| |||    
T  12726290 ttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatctcctg 12726191  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12726190 atgaacttcaacttcttgtgatctt 12726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18142900 - 18142677
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| |||||||||||| | | ||  || |||||    
T  18142900 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtt 18142801  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| | | |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||  |||    
T  18142800 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagc 18142701  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||    
T  18142700 ttctgatgaac--ttgcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 40799873 - 40800108
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| || | |     
T  40799873 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaatact 40799972  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| ||| || | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |    |||||  ||    
T  40799973 ttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatctcttg 40800070  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  40800071 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47405581 - 47405346
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || | ||| |||| |||||||| || | |     
T  47405581 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcct 47405482  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||| | | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||  ||    
T  47405481 ttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtg 47405384  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47405383 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47405346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824256
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattcact 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| ||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaa-atcatttcaaaatagttgttgcttcact 13824190  T
Q  124 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 188  Q
    || |  ||||||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 13824256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968528
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||  ||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaat 12968411  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||| |||  ||||  || || ||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||  |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||  | |    
T  12968412 tagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatgatagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttcaaatctttcagcttctgatggtcct 12968511  T
Q  208 cagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  12968512 cagctcctgatgatctt 12968528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26417832 - 26417616
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||   |||  ||||| |||  ||| |   ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26417832 aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaat 26417733  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||  |||| |||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  26417732 tagccgttgcttcattcttctagtcttctggaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatctt 26417633  T
Q  208 cagcttctggtgatctt 224  Q
    || || ||| |||||||    
T  26417632 caactcctgatgatctt 26417616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22804183 - 22804092
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  22804183 gagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgcctt 22804092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20627578 - 20627356
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  20627578 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttg 20627479  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    ||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||| | |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| || ||    
T  20627478 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaact 20627381  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||    
T  20627380 tctggtgattttcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538146
Alignment:
Q  15 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| |||||| ||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  115 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    || |||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagctt 23538146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19889103 - 19888869
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  || || ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  19889103 gagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 19889006  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtaca-acctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||  |||||  |    
T  19889005 ttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctctt 19888906  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  19888905 gatgaactttagcttctagtgatc--ttgcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49553637 - 49553425
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||     
T  49553637 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 49553538  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
      || ||||||||     |||||||||||| |||| ||   ||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  49553537 actgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggc 49553438  T
Q  212 ttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||    
T  49553437 ttctggtgatctt 49553425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 11223569 - 11223653
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  11223569 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 11223653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 11868268 - 11868335
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11868268 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25398415 - 25398348
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25398415 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctt 25398348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 53056887 - 53056796
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  53056887 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 53056796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955517
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14955517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21605814 - 21605726
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21605814 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 21640878 - 21640954
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  21640878 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgc 21640954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 29855415 - 29855499
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  29855415 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgcctt 29855499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 46796527 - 46796460
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  46796527 gagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 46796460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349826
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||   || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||||||| |    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaag 178  Q
    ||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||  ||| |||| ||||| |||||||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaag 46349826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21636830 - 21636742
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21636830 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24775694 - 24775554
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || |  |||||| ||||||||| || | |     
T  24775694 gagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcct 24775595  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 141  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  24775594 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 24775554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785130
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2785130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 22140763 - 22140850
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 88  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   | ||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  22140763 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 22140850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 30054377 - 30054310
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30054377 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 33583240 - 33583295
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33583240 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 33583295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 1728175 - 1728129
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1728175 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 49666553 - 49666519
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49666553 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 49666519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9700196 - 9700131
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9700196 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 9700131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25398282 - 25398230
Alignment:
Q  151 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  25398282 gattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatga 25398230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 49332 - 49569
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  49332 gagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 49431  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  ||||| |||    
T  49432 ttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctg 49531  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  49532 atgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 49569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 32485 - 32722
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | |     
T  32485 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaatcct 32584  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||  |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  32585 ttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 32684  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  32685 atgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatga 32722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 389
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctt 389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284801
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| || | |     
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  23284764 atgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatga 23284801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15987233 - 15987437
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact-tc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |  |    
T  15987233 gagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccc 15987332  T
Q  100 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
     ||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15987333 ttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttct 15987432  T
Q  199 gatga 203  Q
    |||||    
T  15987433 gatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 9717843 - 9718079
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| | |     
T  9717843 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcct 9717942  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  9717943 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 9718042  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  9718043 atgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatg 9718079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640364
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | |||||||||||     
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctctcagcttctgatgaa 10640364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20112849 - 20112614
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  20112849 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 20112750  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  |||||  |    
T  20112749 ttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctctt 20112650  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctga 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20112649 gatgaacttcagcttcaggtgatctttagcttctga 20112614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13602172 - 13602409
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||| || ||||    
T  13602172 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaa-ttca 13602270  T
Q  101 ttt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    |||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  13602271 tttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 13602370  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  13602371 gatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatga 13602409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26972375 - 26972140
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| | |     
T  26972375 gagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaatcct 26972278  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  26972277 ttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 26972178  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26972177 atgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatga 26972140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 32544265 - 32544502
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || |||||||||||||||| | |     
T  32544265 gagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaatcct 32544364  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  32544365 ttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 32544464  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  32544465 atgaactagagcttatggtgattttcagcttctgatga 32544502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470904
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||  ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 213  Q
    ||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgctaggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaactt 19470882  T
Q  214 ctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    || ||||  | |||||||||||||    
T  19470883 cttgtga--tgttgcttctgatga 19470904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15302200 - 15302435
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |     
T  15302200 gagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcct 15302299  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||     
T  15302300 ttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctccta 15302399  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  15302400 atgagctttagcttttggtgatc--ttgcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15531761 - 15531536
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||       
T  15531761 gagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataacc 15531662  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| || |    
T  15531661 gttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaac 15531562  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||    
T  15531561 ttctggtgatcttatgattctgatga 15531536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435769
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| ||| |||||| || || | | ||  || ||||     
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 13435743  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  13435744 ttatggtgatcttctgcttctgatga 13435769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24116828 - 24117053
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |     
T  24116828 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcct 24116927  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || ||   | |  |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24116928 ttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatcttct 24117027  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24117028 gatgaacttcatcttctggtgatctt 24117053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19086158 - 19086372
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |          
T  19086158 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttca------ 19086251  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgta-caacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
        || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| | || || ||| ||||| ||||||  ||||| ||    
T  19086252 ----aaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatctcct 19086346  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19086347 gatgaacttcagcttctggtgatctt 19086372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14100582 - 14100373
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | | ||  ||     
T  14100582 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14100483  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 206  Q
    ||||||||  |||||||| |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  14100482 tagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaact 14100383  T
Q  207 tcagcttctg 216  Q
    ||||||||||    
T  14100382 tcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 19623980 - 19624203
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactt-tgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||  ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  19623980 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 19624078  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||   | |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| | || || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||    
T  19624079 ttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctg 19624178  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19624179 atgaacttcagcttctggtgatctt 19624203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 18378314 - 18378495
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || | |     
T  18378314 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaatcct 18378413  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    ||  || ||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18378414 ttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagctt 18378495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12715569 - 12715333
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||||| |||| |  |||    
T  12715569 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatg-ctttcaaatca 12715471  T
Q  101 ttt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttc 197  Q
    |||  || |||| |||| ||||||||     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||| |    
T  12715470 tttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 12715371  T
Q  198 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12715370 tgatgaactacaacttctagtgatc--ttgcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 29918018 - 29918250
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||  ||||||| || |   |    
T  29918018 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttt 29918117  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    |  || |||| |||| |||||| | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  29918118 tcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 29918216  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    |||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  29918217 tgaactacagcttctgatgaac--ttgcttctgatg 29918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 22802153 - 22802376
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||  || | ||     
T  22802153 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtc 22802252  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||| | |  ||| ||||||||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| || |    
T  22802253 gttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaac 22802350  T
Q  212 ttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||    
T  22802351 ttctggtgattttcagcttctgatga 22802376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625335
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||||| || | | ||| || |||  |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgc-tttcaaatagccg 21625212  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 212  Q
    ||| || ||||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||    || ||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaact 21625310  T
Q  213 tctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  21625311 tctggtgatcttcagcttctgatga 21625335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 18435556 - 18435793
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  18435556 gagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 18435655  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | || ||||| || || | |||| || |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||  ||||| |||    
T  18435656 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctg 18435755  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  18435756 atgaactagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 18435793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 25594068 - 25594155
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  25594068 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 26943577 - 26943735
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | | |      
T  26943577 agacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatccta 26943676  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcc 160  Q
    ||||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26943677 ttgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgctagacatgattaaatcc 26943735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688980
Alignment:
Q  25 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 124  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  ||| |||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  125 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 216  Q
    | |  || |||| ||||| || | || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaag--tcgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16265299 - 16265211
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  16265299 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 16265211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730672
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | |     
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 181  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||  ||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctt 20730672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 15954703 - 15954794
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  15954703 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgcctt 15954794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235216
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgcctt 21235216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22076556 - 22076489
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22076556 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 22076489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20488060 - 20487976
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  20488060 aaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 20487976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 25597608 - 25597716
Alignment:
Q  130 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 228  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||  ||    
T  25597608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 25597707  T
Q  229 ttctgatga 237  Q
    || ||||||    
T  25597708 ttatgatga 25597716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423328
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctt 12423328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16336127 - 16336194
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16336127 gagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 16336194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349085
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 12349085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 16877220 - 16877280
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16877220 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 16877280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618335
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 21618335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 33352075 - 33352008
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  33352075 gagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 33352008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 19482752 - 19482817
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  19482752 gagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 19482817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451595
Alignment:
Q  31 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 130  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||| |  | |||| |||||| || || | |  |  ||||||| |||| ||||||||    |    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  131 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 222  Q
    |||||||||||| |||| ||  | | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 34451595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 17381521 - 17381588
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  17381521 gagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 17381588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17316674 - 17316609
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 66  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316674 gagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19066167 - 19066079
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  19066167 gagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19833175 - 19833115
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19833175 aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 19833115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 25930642 - 25930714
Alignment:
Q  166 acaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatgat 238  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  25930642 acaaactttgaagcttccagtctttcagcttcagatgatcttcaacttctgatgatcttcagcttctgatgat 25930714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10219 - 9997
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |     
T  10219 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcct 10120  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttct 198  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  10119 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcct 10020  T
Q  199 gatgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10019 gatgaacttcagcttctggtgat 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14883 - 14816
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14883 gagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 14648 - 14883
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | |     
T  14648 gagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcct 14747  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||     
T  14748 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttccta 14847  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14848 atgatttttagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 1660 - 1895
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || || | |     
T  1660 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 1759  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  1760 ttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 1859  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1860 atgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18732 - 18495
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| || | |     
T  18732 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcct 18633  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    ||| |||    
T  18632 ttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctg 18533  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18532 atgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatga 18495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19583 - 19359
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| | |     
T  19583 gagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcct 19484  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  19483 ttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctc 19384  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  19383 atgaactacaacttctggtgatctt 19359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 99316 - 99270
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  99316 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 99270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 159055 - 159270
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||| || ||||    
T  159055 gagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaattca 159154  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  159155 tttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttttga 159254  T
Q  201 tgaacttcagcttctg 216  Q
    ||  ||||||||||||    
T  159255 tggtcttcagcttctg 159270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 39529 - 39662
Alignment:
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  39529 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 39628  T
Q  204 acttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39629 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 137589 - 137722
Alignment:
Q  105 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 203  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  137589 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 137688  T
Q  204 acttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  137689 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 37414 - 37463
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 62  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37414 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 135474 - 135523
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 62  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  135474 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12209 - 12431
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || |||     
T  12209 gagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattct 12308  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    ||| |||    
T  12309 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctg 12408  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatc 222  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  12409 atgaactagagcttctggtgatc 12431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26086 - 25849
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  26086 gagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 25987  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||    
T  25986 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 25887  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25886 atgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatga 25849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5801 - 5577
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  | |     
T  5801 gagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcatatcct 5702  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||| ||||| | |||||| |   |||||| ||||  || | || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  5701 ttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctg 5602  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  5601 atgaacttcagcttcaggtgatctt 5577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 60016 - 60240
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | |     
T  60016 gagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcct 60115  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||| | || | || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  60116 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctg 60215  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  60216 atgaactttagcttctggtgatctt 60240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 7926 - 8161
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || || | |     
T  7926 gagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcct 8025  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| |    ||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||    
T  8026 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctg 8125  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  8126 atgaactttagcttctggttatc--ttgcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 151906 - 151783
Alignment:
Q  76 caagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttg 175  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  151906 caagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgtttcacgtttctggtcttctacaatactaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttg 151807  T
Q  176 aagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  151806 aagctttaagtctctcatcttctg 151783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27540 - 27305
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | | |     
T  27540 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcct 27441  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
     |  || ||| ||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  27440 atcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 27341  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  27340 atgaacttcagcatctggtgatc--ttgcttctgatga 27305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15117 - 15352
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |     
T  15117 gagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcct 15216  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| ||     
T  15217 ttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctt 15316  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15317 atgcacttcatcttctggtgatc--ttgcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1925
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | |     
T  1690 gagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcct 1789  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||     
T  1790 ttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttccta 1889  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||  || ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  1890 atgatttttagcttctagtgatc--ttgcttctgatga 1925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 475 - 712
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  475 gagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 574  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| |||    
T  575 ttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctg 674  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  675 atgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatga 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36886 - 36649
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  36886 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 36787  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  36786 ttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 36687  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36686 atgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatga 36649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 42119 - 42356
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |     
T  42119 gagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 42218  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  42219 ttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 42318  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42319 atgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatga 42356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 22676 - 22913
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||| || | |     
T  22676 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 22775  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  22776 ttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 22875  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  22876 atgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatga 22913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44023 - 43822
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || |   |||||||    
T  44023 aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaat 43924  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||   ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  43923 tagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatgatctt 43824  T
Q  208 ca 209  Q
    ||    
T  43823 ca 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40846
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||| | | | ||||  ||||||| || ||| |    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  102 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 201  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgat 40837  T
Q  202 gaacttcag 210  Q
    || ||||||    
T  40838 gatcttcag 40846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36061
Alignment:
Q  15 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  115 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 214  Q
    || |||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| |||||||||     
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagctta 36082  T
Q  215 tggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||  | |||||||||||||    
T  36081 tggtga--tgttgcttctgatga 36061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 25776 - 25712
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  25776 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34915 - 34827
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  34915 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 212355 - 212590
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | |    
T  212355 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctt 212454  T
Q  102 tt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||| |||    
T  212455 ttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctg 212554  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  212555 atgaagtttagcttctgatgatc--ttgcttctgatga 212590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6073
Alignment:
Q  60 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 158  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  159 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatg 236  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 6073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7940
Alignment:
Q  6 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttga 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || ||| |||||||||||| | | |   |    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  106 attagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 204  Q
    | |||| || | |||||||| |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T
Q  205 cttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
     |  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7908 atagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10204
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| || || | |     
T  9969 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcct 10068  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||| |||  |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  10069 ttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 10168  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  10169 atgaacttcaacttcttgtgatc--ttgcttctgatga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1409
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||| |||| ||| |  || | ||||||||||| || | | |||||| |||| |    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  114 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 213  Q
    ||| |||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctc 1420  T
Q  214 ctggtgatctt 224  Q
    ||| |||||||    
T  1419 ctgatgatctt 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21082 - 20845
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  || |  |||||||||||||||| || | |     
T  21082 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcct 20983  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  20982 ttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttg 20883  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  20882 atgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatga 20845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5849
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||     
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttc-caacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaa 5732  T
Q  108 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 207  Q
    |||| |||| |||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  5733 tagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatgataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatctt 5832  T
Q  208 cagcttctggtgatctt 224  Q
    || || ||| |||||||    
T  5833 caactcctgatgatctt 5849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4821
Alignment:
Q  19 tggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 118  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| || | |    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  119 tcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctgg 217  Q
    |||||||    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctgg 4841  T
Q  218 tgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||  |||| ||||||    
T  4840 tgatcttcagcttatgatga 4821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 13571 - 13735
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  13571 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 13670  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattg 164  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13671 ttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattg 13735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103791
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagtt 112  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||  ||||||  || |||      
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcc-ttaatatcatttcaaaatagcc 103683  T
Q  113 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 211  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  103684 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 103783  T
Q  212 ttctggtg 219  Q
    ||||||||    
T  103784 ttctggtg 103791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15793 - 16011
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  15793 gagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaagtcc 15892  T
Q  100 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaa-cctttgaagcttgaagtctctcatcttc 197  Q
     ||  || || ||| || |||||||  |||||||| ||||| | || | || |||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||  ||||| |    
T  15893 tttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcatctcc 15992  T
Q  198 tgatgaacttcagcttctg 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15993 tgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 89931
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  90166 gagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 90067  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    ||  || |||  |||| |||||||| |  |||||||| |||  |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  90066 ttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 89969  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  89968 atgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 89931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19031 - 19255
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| | |     
T  19031 gagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcct 19130  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 199  Q
    |   || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||   |||  |||    
T  19131 tccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatcacctg 19230  T
Q  200 atgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||    
T  19231 atgaaatagagcttctggtgatctt 19255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 9560 - 9624
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||    
T  9560 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgct 9624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22242 - 22151
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | | | ||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||    
T  22242 gagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgcctt 22151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 74581 - 74788
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 100  Q
    |||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||| |||| || | |     
T  74581 gagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaatcct 74680  T
Q  101 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctga 200  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||             ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  74681 tttgaattagccgttgattaaatc-------------caatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctga 74767  T
Q  201 tgaacttcagcttctggtgat 221  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  74768 tgatgttcagcttctggtgat 74788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5934 - 5813
Alignment:
Q  118 ttcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  5934 ttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttct 5835  T
Q  216 ggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5834 ggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1408
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 1408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 3
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10019
Alignment:
Q  31 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 130  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||  ||||||||  |||    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  131 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 224  Q
    ||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||| || |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt 10019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 7824 - 7858
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 35  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7824 gagacacaaactgagtagaggagatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 215601 - 215517
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  215601 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 215517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 675
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  766 gagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1778
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 89  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2039
Alignment:
Q  17 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 60803 - 60894
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  60803 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctt 60894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 662
Alignment:
Q  130 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 228  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  768 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgc 671  T
Q  229 ttctgatga 237  Q
    |||||||||    
T  670 ttctgatga 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 78477 - 78386
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    |||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  78477 gagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgcctt 78386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 9168 - 9246
Alignment:
Q  14 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  9168 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17876 - 17784
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 93  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  ||    |||||||||||||||||    
T  17876 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttt 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6839 - 6760
Alignment:
Q  13 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||    
T  6839 gagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 6760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2841 - 2774
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  2841 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 2774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25510 - 25443
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  25510 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15850 - 15813
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15850 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4916
Alignment:
Q  130 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 188  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4975 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15642
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 92  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | |||||||||| ||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgcctt 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 7383 - 7448
Alignment:
Q  3 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7383 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9282
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9326 catctcctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatga 9282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7221
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 47  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 7221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 5713 - 5646
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  5713 gagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctt 5646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 60789 - 60743
Alignment:
Q  191 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  60789 catcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatga 60743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164990
Alignment:
Q  2 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctt 164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 6006 - 6043
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 38  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6006 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13448 - 13407
Alignment:
Q  196 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctgatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13448 tctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatga 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3939
Alignment:
Q  8 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 68  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2738
Alignment:
Q  1 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 65  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||    
T  2802 gagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1137 times since January 2019
Visitors: 2244