View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_2 (Length: 514)

Name: NF0172_low_2
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_2
NF0172_low_2
[»] chr1 (107 HSPs)
chr1 (17-493)||(22921509-22921987)
chr1 (17-493)||(33681010-33681488)
chr1 (17-493)||(22237630-22238108)
chr1 (17-493)||(52927623-52928088)
chr1 (17-493)||(20248282-20248756)
chr1 (12-388)||(35981324-35981700)
chr1 (13-489)||(21754052-21754518)
chr1 (17-388)||(20636957-20637330)
chr1 (191-477)||(21861385-21861672)
chr1 (150-388)||(49261448-49261686)
chr1 (12-220)||(28194085-28194294)
chr1 (195-477)||(21896078-21896358)
chr1 (17-480)||(20918620-20919080)
chr1 (205-489)||(16368115-16368401)
chr1 (157-477)||(50686630-50686952)
chr1 (329-493)||(14295507-14295672)
chr1 (260-477)||(50613999-50614219)
chr1 (260-477)||(50621827-50622047)
chr1 (318-493)||(21161719-21161892)
chr1 (226-477)||(41049885-41050138)
chr1 (307-481)||(16758664-16758841)
chr1 (17-179)||(433323-433486)
chr1 (17-143)||(43697712-43697839)
chr1 (374-492)||(50210212-50210330)
chr1 (370-492)||(22532273-22532395)
chr1 (383-477)||(35261086-35261180)
chr1 (336-477)||(45574846-45574989)
chr1 (336-492)||(21475091-21475248)
chr1 (17-85)||(22355827-22355895)
chr1 (17-85)||(22357513-22357581)
chr1 (1-57)||(22831005-22831061)
chr1 (377-492)||(34509784-34509899)
chr1 (14-85)||(38801041-38801112)
chr1 (19-85)||(27250384-27250450)
chr1 (1-70)||(21787669-21787738)
chr1 (336-492)||(13988867-13989024)
chr1 (336-492)||(21923295-21923452)
chr1 (1-57)||(42864838-42864894)
chr1 (370-492)||(21026684-21026806)
chr1 (17-179)||(22532585-22532748)
chr1 (370-492)||(27250724-27250846)
chr1 (191-299)||(12271744-12271852)
chr1 (17-82)||(21301180-21301245)
chr1 (374-482)||(21840778-21840885)
chr1 (336-492)||(23593739-23593896)
chr1 (336-492)||(29298138-29298294)
chr1 (336-492)||(29776689-29776846)
chr1 (336-492)||(31612314-31612471)
chr1 (17-85)||(34510191-34510259)
chr1 (336-492)||(433013-433168)
chr1 (1-79)||(18181748-18181826)
chr1 (329-444)||(22130863-22130976)
chr1 (12-85)||(20135598-20135671)
chr1 (12-85)||(20846867-20846940)
chr1 (140-209)||(26065226-26065295)
chr1 (1-57)||(6152291-6152347)
chr1 (318-477)||(16093825-16093987)
chr1 (17-179)||(50209856-50210018)
chr1 (425-492)||(20847205-20847271)
chr1 (1-56)||(21023075-21023130)
chr1 (17-60)||(21714983-21715026)
chr1 (17-60)||(22468339-22468382)
chr1 (17-83)||(22354214-22354280)
chr1 (329-428)||(51130632-51130729)
chr1 (336-492)||(22123071-22123229)
chr1 (1-57)||(22432410-22432466)
chr1 (14-81)||(20091113-20091180)
chr1 (431-482)||(20454610-20454660)
chr1 (336-475)||(26064959-26065100)
chr1 (1-55)||(3472553-3472607)
chr1 (336-482)||(16361928-16362075)
chr1 (12-118)||(16759104-16759210)
chr1 (336-492)||(13212865-13213023)
chr1 (420-468)||(38801433-38801481)
chr1 (8-107)||(21162117-21162216)
chr1 (445-492)||(21342097-21342144)
chr1 (445-492)||(21346962-21347009)
chr1 (445-492)||(21707168-21707215)
chr1 (445-492)||(21711710-21711757)
chr1 (14-53)||(45489394-45489433)
chr1 (33-123)||(35260713-35260803)
chr1 (33-107)||(41049626-41049700)
chr1 (16-53)||(23818952-23818989)
chr1 (21-57)||(8761280-8761316)
chr1 (12-80)||(21342564-21342632)
chr1 (12-80)||(21347429-21347497)
chr1 (445-493)||(21714545-21714593)
chr1 (445-492)||(15860123-15860170)
chr1 (12-107)||(21895869-21895964)
chr1 (29-107)||(26065383-26065461)
chr1 (16-53)||(12647285-12647322)
chr1 (16-53)||(18882783-18882820)
chr1 (16-53)||(19212283-19212320)
chr1 (16-53)||(20138499-20138536)
chr1 (16-53)||(21305730-21305767)
chr1 (16-53)||(21615853-21615890)
chr1 (16-53)||(24782753-24782790)
chr1 (16-53)||(33797949-33797986)
chr1 (16-53)||(46975883-46975920)
chr1 (1-53)||(3704724-3704776)
chr1 (38-118)||(16367873-16367953)
chr1 (21-53)||(17678245-17678277)
chr1 (13-53)||(18393613-18393653)
chr1 (1-53)||(20228447-20228499)
chr1 (1-53)||(36818946-36818998)
chr1 (139-179)||(38801157-38801197)
chr1 (13-53)||(45310016-45310056)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (17-492)||(6539-7015)
scaffold0621 (191-481)||(8481-8774)
[»] chr7 (135 HSPs)
chr7 (17-492)||(67749-68225)
chr7 (17-493)||(44014181-44014653)
chr7 (17-493)||(18005649-18006120)
chr7 (17-492)||(47831811-47832287)
chr7 (17-493)||(16219358-16219835)
chr7 (17-493)||(810771-811249)
chr7 (29-481)||(16056343-16056795)
chr7 (29-492)||(22072917-22073383)
chr7 (12-388)||(9389332-9389709)
chr7 (17-327)||(16324175-16324485)
chr7 (15-492)||(15754527-15755004)
chr7 (12-492)||(28504938-28505415)
chr7 (13-492)||(34200790-34201266)
chr7 (141-492)||(11995796-11996144)
chr7 (142-481)||(12901338-12901682)
chr7 (38-209)||(12255454-12255625)
chr7 (17-209)||(12756359-12756550)
chr7 (329-492)||(16495406-16495567)
chr7 (38-209)||(2279781-2279952)
chr7 (319-493)||(2280061-2280238)
chr7 (226-477)||(20220039-20220290)
chr7 (17-246)||(2831948-2832176)
chr7 (13-85)||(11995696-11995768)
chr7 (17-246)||(9751192-9751421)
chr7 (373-468)||(12255789-12255886)
chr7 (370-492)||(38227485-38227606)
chr7 (17-179)||(17061602-17061765)
chr7 (13-85)||(27847482-27847554)
chr7 (13-85)||(40443788-40443860)
chr7 (306-481)||(1867924-1868101)
chr7 (374-492)||(3564363-3564481)
chr7 (370-492)||(18456408-18456529)
chr7 (370-492)||(12698835-12698958)
chr7 (336-477)||(13647344-13647487)
chr7 (12-85)||(16385895-16385968)
chr7 (17-179)||(38227796-38227959)
chr7 (310-481)||(14044761-14044935)
chr7 (310-481)||(14354791-14354965)
chr7 (336-492)||(18430713-18430870)
chr7 (336-492)||(27216861-27217018)
chr7 (370-492)||(9509193-9509315)
chr7 (1-60)||(10508709-10508768)
chr7 (191-411)||(15113028-15113248)
chr7 (336-492)||(456322-456479)
chr7 (17-85)||(9509600-9509668)
chr7 (1-57)||(9703703-9703759)
chr7 (336-492)||(11393291-11393448)
chr7 (336-492)||(11972497-11972654)
chr7 (17-85)||(12699243-12699311)
chr7 (336-492)||(14949126-14949283)
chr7 (141-411)||(15116565-15116835)
chr7 (24-179)||(15143686-15143842)
chr7 (336-492)||(15376717-15376874)
chr7 (336-492)||(16232521-16232678)
chr7 (1-57)||(17137690-17137746)
chr7 (336-492)||(18640273-18640430)
chr7 (336-492)||(20385127-20385284)
chr7 (336-492)||(21189599-21189756)
chr7 (336-492)||(24702239-24702396)
chr7 (336-492)||(32125492-32125649)
chr7 (336-492)||(41522918-41523075)
chr7 (336-492)||(41525380-41525537)
chr7 (336-492)||(17061919-17062076)
chr7 (370-480)||(26212012-26212122)
chr7 (17-179)||(44116821-44116983)
chr7 (374-492)||(48273393-48273511)
chr7 (1-78)||(11880668-11880745)
chr7 (319-478)||(19486686-19486847)
chr7 (17-85)||(3564006-3564074)
chr7 (370-478)||(10063813-10063921)
chr7 (1-57)||(12187450-12187506)
chr7 (1-57)||(12321369-12321425)
chr7 (336-492)||(16410060-16410217)
chr7 (336-492)||(24704689-24704843)
chr7 (17-246)||(39267288-39267517)
chr7 (12-65)||(24054897-24054950)
chr7 (374-482)||(24275182-24275289)
chr7 (1-57)||(14430315-14430371)
chr7 (374-493)||(15144037-15144154)
chr7 (1-57)||(15211865-15211921)
chr7 (17-220)||(18302454-18302657)
chr7 (336-492)||(44116510-44116667)
chr7 (370-492)||(16386242-16386365)
chr7 (17-60)||(18154479-18154522)
chr7 (17-60)||(19649127-19649170)
chr7 (1-79)||(2760542-2760620)
chr7 (1-79)||(3272202-3272280)
chr7 (319-473)||(15008441-15008597)
chr7 (27-176)||(21064814-21064964)
chr7 (12-70)||(26212411-26212469)
chr7 (140-209)||(15008263-15008332)
chr7 (336-492)||(3386334-3386491)
chr7 (377-480)||(10589055-10589158)
chr7 (381-492)||(16213685-16213795)
chr7 (377-492)||(40443395-40443509)
chr7 (29-123)||(2529631-2529725)
chr7 (1-53)||(15581108-15581160)
chr7 (445-492)||(13869347-13869394)
chr7 (445-492)||(20110557-20110604)
chr7 (426-492)||(27847881-27847947)
chr7 (16-53)||(8917842-8917879)
chr7 (16-53)||(13462177-13462214)
chr7 (1-53)||(11313064-11313116)
chr7 (1-53)||(12318543-12318595)
chr7 (1-53)||(13635107-13635159)
chr7 (39-107)||(14045213-14045281)
chr7 (39-107)||(14355243-14355311)
chr7 (17-53)||(15604926-15604962)
chr7 (1-53)||(26292811-26292863)
chr7 (17-53)||(42205530-42205566)
chr7 (445-492)||(13831374-13831421)
chr7 (142-209)||(14045035-14045102)
chr7 (142-209)||(14355065-14355132)
chr7 (336-482)||(38898380-38898528)
chr7 (188-246)||(2529866-2529924)
chr7 (38-80)||(9177252-9177294)
chr7 (7-53)||(17701289-17701335)
chr7 (16-53)||(11043-11080)
chr7 (16-53)||(18711-18748)
chr7 (16-53)||(6801628-6801665)
chr7 (16-53)||(9593761-9593798)
chr7 (16-53)||(9644724-9644761)
chr7 (16-53)||(11987628-11987665)
chr7 (16-53)||(13149570-13149607)
chr7 (16-53)||(15728740-15728777)
chr7 (16-53)||(16275907-16275944)
chr7 (16-53)||(16583650-16583687)
chr7 (16-53)||(16724284-16724321)
chr7 (16-53)||(35152021-35152058)
chr7 (16-53)||(48593109-48593146)
chr7 (39-107)||(1867650-1867718)
chr7 (13-53)||(9445808-9445848)
chr7 (375-411)||(16324135-16324171)
chr7 (425-477)||(18203831-18203882)
chr7 (139-179)||(26212311-26212351)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (12-493)||(19267-19750)
scaffold0102 (17-65)||(48103-48151)
[»] chr3 (163 HSPs)
chr3 (17-493)||(15470927-15471403)
chr3 (17-493)||(16097331-16097809)
chr3 (17-492)||(14234491-14234969)
chr3 (17-493)||(16103783-16104259)
chr3 (17-489)||(32307684-32308147)
chr3 (17-493)||(49667726-49668194)
chr3 (12-388)||(1465046-1465423)
chr3 (17-489)||(1644325-1644787)
chr3 (19-493)||(9512923-9513387)
chr3 (13-492)||(13209966-13210444)
chr3 (19-493)||(9520898-9521362)
chr3 (17-387)||(49389286-49389642)
chr3 (277-493)||(12174164-12174377)
chr3 (140-477)||(37250932-37251270)
chr3 (17-284)||(12933952-12934221)
chr3 (12-209)||(2050838-2051033)
chr3 (29-246)||(324485-324702)
chr3 (17-262)||(12171759-12171992)
chr3 (17-209)||(53070341-53070532)
chr3 (17-208)||(17247928-17248119)
chr3 (319-477)||(52523669-52523831)
chr3 (370-492)||(27165251-27165373)
chr3 (140-477)||(22110116-22110454)
chr3 (38-209)||(52523390-52523561)
chr3 (370-492)||(12399213-12399335)
chr3 (17-209)||(42386698-42386890)
chr3 (370-492)||(53301545-53301668)
chr3 (16-179)||(14572904-14573068)
chr3 (319-478)||(24340665-24340826)
chr3 (13-85)||(14179733-14179805)
chr3 (377-492)||(18438538-18438653)
chr3 (370-478)||(23274705-23274813)
chr3 (370-489)||(14572596-14572714)
chr3 (370-492)||(14972858-14972980)
chr3 (370-492)||(17487860-17487982)
chr3 (370-492)||(17499342-17499464)
chr3 (370-492)||(36166599-36166719)
chr3 (17-177)||(14973172-14973333)
chr3 (370-478)||(42386428-42386536)
chr3 (336-477)||(43925977-43926121)
chr3 (370-482)||(21618460-21618570)
chr3 (12-83)||(12399608-12399679)
chr3 (370-492)||(13442278-13442400)
chr3 (370-493)||(14576828-14576950)
chr3 (17-179)||(25476027-25476190)
chr3 (17-179)||(40213363-40213526)
chr3 (398-492)||(11424783-11424876)
chr3 (17-246)||(12340002-12340231)
chr3 (370-492)||(24153204-24153325)
chr3 (17-179)||(11424405-11424568)
chr3 (12-85)||(20698084-20698157)
chr3 (319-478)||(37642207-37642368)
chr3 (1-57)||(321641-321697)
chr3 (336-492)||(7781351-7781508)
chr3 (1-57)||(11298156-11298212)
chr3 (1-57)||(12173221-12173277)
chr3 (17-85)||(17247162-17247230)
chr3 (336-492)||(17463179-17463336)
chr3 (336-492)||(17672627-17672784)
chr3 (17-85)||(18438945-18439013)
chr3 (377-492)||(20698437-20698552)
chr3 (336-492)||(29172587-29172744)
chr3 (336-492)||(34159327-34159484)
chr3 (336-492)||(45606911-45607068)
chr3 (336-492)||(55476492-55476649)
chr3 (17-246)||(14665855-14666084)
chr3 (17-246)||(14735368-14735597)
chr3 (336-491)||(16282815-16282971)
chr3 (370-492)||(23083356-23083478)
chr3 (336-482)||(38961895-38962042)
chr3 (427-492)||(28194694-28194759)
chr3 (339-492)||(28848618-28848772)
chr3 (336-477)||(43550482-43550625)
chr3 (1-57)||(856571-856627)
chr3 (17-85)||(4588457-4588525)
chr3 (336-492)||(8899095-8899252)
chr3 (336-492)||(9707611-9707768)
chr3 (1-57)||(12496690-12496746)
chr3 (1-57)||(14878132-14878188)
chr3 (1-57)||(15060727-15060783)
chr3 (336-492)||(16454285-16454442)
chr3 (1-57)||(17524801-17524857)
chr3 (1-57)||(18383544-18383600)
chr3 (1-57)||(23077105-23077161)
chr3 (17-85)||(26687298-26687366)
chr3 (374-489)||(606324-606441)
chr3 (374-492)||(6469178-6469295)
chr3 (17-246)||(14669010-14669239)
chr3 (374-492)||(25476384-25476502)
chr3 (370-492)||(26686891-26687013)
chr3 (374-492)||(40213720-40213837)
chr3 (370-484)||(43840944-43841058)
chr3 (1-55)||(323026-323080)
chr3 (336-482)||(12567571-12567718)
chr3 (336-482)||(13544036-13544183)
chr3 (379-492)||(55500943-55501055)
chr3 (336-492)||(13151794-13151952)
chr3 (336-492)||(13154259-13154417)
chr3 (17-179)||(14576475-14576638)
chr3 (226-326)||(43927304-43927404)
chr3 (336-477)||(53070657-53070799)
chr3 (336-492)||(10247727-10247884)
chr3 (1-57)||(15051951-15052007)
chr3 (336-492)||(17446659-17446815)
chr3 (17-85)||(17499750-17499818)
chr3 (1-57)||(26190636-26190692)
chr3 (17-85)||(43842589-43842657)
chr3 (17-60)||(15877471-15877514)
chr3 (374-492)||(15977516-15977633)
chr3 (18-85)||(17488268-17488335)
chr3 (18-85)||(30030239-30030306)
chr3 (1-55)||(16369845-16369899)
chr3 (336-482)||(50242833-50242980)
chr3 (319-466)||(22147467-22147616)
chr3 (319-434)||(2051141-2051260)
chr3 (1-57)||(17674202-17674258)
chr3 (6-57)||(3402598-3402649)
chr3 (13-85)||(16809800-16809868)
chr3 (29-80)||(22109929-22109980)
chr3 (434-492)||(17737237-17737294)
chr3 (1-59)||(23052704-23052762)
chr3 (336-491)||(41123892-41124045)
chr3 (13-53)||(1982460-1982500)
chr3 (17-57)||(3389600-3389640)
chr3 (17-85)||(12852006-12852074)
chr3 (17-81)||(23083003-23083067)
chr3 (445-492)||(8499519-8499566)
chr3 (445-492)||(10556986-10557033)
chr3 (29-80)||(14501615-14501666)
chr3 (445-492)||(15412430-15412477)
chr3 (29-80)||(23275157-23275208)
chr3 (445-492)||(45577952-45577999)
chr3 (29-123)||(605945-606039)
chr3 (16-53)||(3834090-3834127)
chr3 (189-246)||(4588602-4588659)
chr3 (1-53)||(326802-326854)
chr3 (13-53)||(11594789-11594829)
chr3 (1-57)||(11852006-11852062)
chr3 (385-492)||(12119780-12119886)
chr3 (1-53)||(15483078-15483130)
chr3 (1-53)||(15849723-15849775)
chr3 (13-53)||(16690635-16690675)
chr3 (13-53)||(16697208-16697248)
chr3 (1-57)||(19725539-19725595)
chr3 (1-53)||(20461138-20461190)
chr3 (1-53)||(31097192-31097244)
chr3 (33-80)||(316612-316659)
chr3 (17-60)||(12037596-12037639)
chr3 (29-80)||(23412827-23412878)
chr3 (445-492)||(44494810-44494857)
chr3 (29-80)||(45797659-45797710)
chr3 (15-53)||(11557037-11557075)
chr3 (33-79)||(43927597-43927643)
chr3 (16-53)||(1598133-1598170)
chr3 (16-53)||(7792999-7793036)
chr3 (189-246)||(12852178-12852235)
chr3 (46-83)||(13442687-13442724)
chr3 (16-53)||(15941557-15941594)
chr3 (16-53)||(16797707-16797744)
chr3 (16-53)||(17242388-17242425)
chr3 (16-53)||(38814800-38814837)
chr3 (431-475)||(13919350-13919393)
chr3 (140-180)||(23083128-23083168)
[»] chr8 (135 HSPs)
chr8 (17-492)||(38854893-38855368)
chr8 (17-493)||(21673707-21674184)
chr8 (17-493)||(23760482-23760962)
chr8 (17-492)||(6520372-6520847)
chr8 (17-493)||(26355340-26355816)
chr8 (109-482)||(21285611-21285985)
chr8 (13-492)||(5865915-5866391)
chr8 (12-492)||(17140920-17141397)
chr8 (12-492)||(21490999-21491476)
chr8 (12-220)||(39834107-39834316)
chr8 (15-492)||(21249388-21249862)
chr8 (15-492)||(21255226-21255700)
chr8 (226-481)||(983252-983512)
chr8 (230-477)||(37116366-37116616)
chr8 (229-477)||(20498581-20498831)
chr8 (205-477)||(17266821-17267096)
chr8 (17-179)||(19801069-19801232)
chr8 (226-477)||(24353039-24353295)
chr8 (17-209)||(41598471-41598663)
chr8 (370-492)||(22626740-22626861)
chr8 (301-478)||(13508009-13508188)
chr8 (370-492)||(16092337-16092459)
chr8 (301-478)||(13597541-13597720)
chr8 (1-85)||(25362777-25362861)
chr8 (370-492)||(21918995-21919117)
chr8 (307-477)||(17439436-17439609)
chr8 (370-492)||(22875069-22875190)
chr8 (336-478)||(17612069-17612213)
chr8 (205-415)||(22364744-22364954)
chr8 (377-492)||(28649046-28649161)
chr8 (13-85)||(45130669-45130741)
chr8 (370-492)||(7372782-7372904)
chr8 (370-492)||(20536212-20536334)
chr8 (377-492)||(31971261-31971375)
chr8 (370-492)||(26219718-26219838)
chr8 (1-78)||(19899510-19899587)
chr8 (336-492)||(1484403-1484560)
chr8 (336-492)||(5853296-5853453)
chr8 (17-85)||(7373160-7373228)
chr8 (336-492)||(14409448-14409605)
chr8 (1-57)||(16185164-16185220)
chr8 (17-85)||(18878879-18878947)
chr8 (336-492)||(20046199-20046356)
chr8 (336-492)||(20403228-20403385)
chr8 (1-57)||(20465666-20465722)
chr8 (17-179)||(20536523-20536687)
chr8 (336-492)||(22001754-22001911)
chr8 (17-85)||(22627146-22627214)
chr8 (17-85)||(23406792-23406860)
chr8 (1-57)||(30642918-30642974)
chr8 (16-84)||(31971656-31971724)
chr8 (17-175)||(16091983-16092142)
chr8 (377-492)||(16199647-16199761)
chr8 (1-60)||(17353564-17353623)
chr8 (370-492)||(18818404-18818526)
chr8 (370-492)||(21923923-21924045)
chr8 (383-492)||(6759262-6759371)
chr8 (17-179)||(6759572-6759736)
chr8 (17-83)||(18818052-18818118)
chr8 (3-57)||(21161744-21161798)
chr8 (3-57)||(21168350-21168404)
chr8 (17-179)||(21923570-21923734)
chr8 (1-79)||(22010306-22010384)
chr8 (383-492)||(23406383-23406492)
chr8 (419-492)||(18879276-18879348)
chr8 (16-85)||(23648964-23649033)
chr8 (1-57)||(23776460-23776517)
chr8 (1-57)||(377714-377770)
chr8 (1-57)||(15602644-15602700)
chr8 (1-57)||(15611096-15611152)
chr8 (13-85)||(16199296-16199368)
chr8 (17-85)||(21918652-21918720)
chr8 (17-85)||(28648686-28648754)
chr8 (1-68)||(16411896-16411963)
chr8 (12-123)||(20499033-20499144)
chr8 (336-482)||(16413320-16413467)
chr8 (370-492)||(26225288-26225408)
chr8 (8-57)||(24756157-24756206)
chr8 (336-492)||(4483282-4483438)
chr8 (336-492)||(15203235-15203392)
chr8 (377-492)||(21395984-21396097)
chr8 (377-492)||(21790477-21790590)
chr8 (336-492)||(41598189-41598346)
chr8 (13-60)||(21389091-21389138)
chr8 (17-179)||(22875381-22875544)
chr8 (336-492)||(4542377-4542534)
chr8 (1-57)||(16409882-16409938)
chr8 (1-57)||(16860964-16861020)
chr8 (1-78)||(19983508-19983587)
chr8 (377-492)||(21389454-21389567)
chr8 (377-492)||(21778780-21778893)
chr8 (337-477)||(19801387-19801527)
chr8 (425-492)||(45131047-45131113)
chr8 (434-492)||(19896266-19896323)
chr8 (16-78)||(19976860-19976922)
chr8 (29-69)||(21286648-21286688)
chr8 (1-53)||(22028973-22029025)
chr8 (17-104)||(21414869-21414956)
chr8 (445-492)||(25484382-25484429)
chr8 (368-415)||(40492844-40492891)
chr8 (29-123)||(982980-983074)
chr8 (29-79)||(13507663-13507713)
chr8 (29-79)||(13597195-13597245)
chr8 (307-477)||(19154816-19154989)
chr8 (22-60)||(21395630-21395668)
chr8 (22-60)||(21790123-21790161)
chr8 (33-106)||(17266574-17266647)
chr8 (16-53)||(18619894-18619931)
chr8 (445-482)||(45290809-45290846)
chr8 (336-492)||(14823775-14823931)
chr8 (1-57)||(19259229-19259284)
chr8 (17-57)||(20856068-20856108)
chr8 (1-49)||(22057768-22057816)
chr8 (1-53)||(23252400-23252452)
chr8 (445-480)||(15070571-15070606)
chr8 (22-57)||(17926355-17926390)
chr8 (445-492)||(19937120-19937167)
chr8 (38-108)||(37116812-37116882)
chr8 (16-53)||(15532304-15532341)
chr8 (16-53)||(15538864-15538901)
chr8 (16-53)||(22113381-22113418)
chr8 (16-53)||(22134884-22134921)
chr8 (16-53)||(22166034-22166071)
chr8 (16-53)||(23834589-23834626)
chr8 (16-53)||(24433890-24433927)
chr8 (16-53)||(30308407-30308444)
chr8 (16-53)||(32599094-32599131)
chr8 (16-53)||(32605626-32605663)
chr8 (16-53)||(39094594-39094631)
chr8 (1-53)||(16231113-16231165)
chr8 (329-420)||(21383887-21383978)
chr8 (139-179)||(21918766-21918806)
chr8 (1-53)||(22045274-22045326)
chr8 (139-179)||(23406696-23406736)
chr8 (16-44)||(23844567-23844595)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (17-493)||(2286-2763)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (17-492)||(39705930-39706405)
chr4 (17-493)||(12774010-12774477)
chr4 (12-388)||(15099457-15099834)
chr4 (17-493)||(8846359-8846854)
chr4 (18-388)||(15190424-15190795)
chr4 (233-481)||(12288066-12288316)
chr4 (13-492)||(15551821-15552296)
chr4 (226-477)||(13700-13953)
chr4 (38-209)||(15464592-15464764)
chr4 (8-458)||(16596686-16597133)
chr4 (205-481)||(43198384-43198661)
chr4 (205-477)||(53081979-53082254)
chr4 (38-209)||(52242856-52243027)
chr4 (17-179)||(13844855-13845018)
chr4 (29-167)||(43198242-43198381)
chr4 (191-477)||(46640272-46640558)
chr4 (373-481)||(52243192-52243302)
chr4 (17-209)||(44928565-44928757)
chr4 (1-83)||(17047710-17047792)
chr4 (17-209)||(21814945-21815136)
chr4 (17-209)||(21815274-21815465)
chr4 (17-209)||(21818367-21818558)
chr4 (374-484)||(16377522-16377630)
chr4 (17-246)||(24028991-24029220)
chr4 (370-492)||(16239965-16240086)
chr4 (377-492)||(7088881-7088996)
chr4 (13-85)||(14052951-14053023)
chr4 (336-492)||(44615289-44615446)
chr4 (370-492)||(7798778-7798900)
chr4 (370-492)||(22636439-22636561)
chr4 (370-492)||(6899895-6900016)
chr4 (370-492)||(8574864-8574984)
chr4 (370-492)||(16270231-16270352)
chr4 (371-492)||(52873363-52873484)
chr4 (336-492)||(12311-12468)
chr4 (17-85)||(3097043-3097111)
chr4 (1-57)||(13569948-13570004)
chr4 (1-57)||(15094209-15094265)
chr4 (336-492)||(15118356-15118513)
chr4 (1-57)||(15121430-15121486)
chr4 (1-57)||(16356580-16356636)
chr4 (336-492)||(18215278-18215435)
chr4 (370-489)||(23374354-23374473)
chr4 (336-492)||(44773091-44773248)
chr4 (336-492)||(52312511-52312668)
chr4 (370-492)||(12902761-12902883)
chr4 (370-492)||(14280317-14280438)
chr4 (370-492)||(54798749-54798871)
chr4 (336-482)||(19618176-19618323)
chr4 (17-106)||(14039039-14039128)
chr4 (1-78)||(44676047-44676124)
chr4 (17-81)||(6190848-6190912)
chr4 (17-85)||(7089277-7089345)
chr4 (1-57)||(12570457-12570513)
chr4 (17-85)||(12903157-12903224)
chr4 (17-85)||(16239634-16239702)
chr4 (1-57)||(16348319-16348375)
chr4 (1-57)||(23843915-23843971)
chr4 (336-492)||(44928883-44929041)
chr4 (336-492)||(50222343-50222500)
chr4 (336-492)||(51463872-51464029)
chr4 (370-492)||(7893707-7893829)
chr4 (370-492)||(44052833-44052955)
chr4 (374-491)||(14038653-14038770)
chr4 (17-246)||(22633855-22634084)
chr4 (419-492)||(3096297-3096369)
chr4 (339-492)||(18239426-18239580)
chr4 (336-492)||(1837513-1837670)
chr4 (336-492)||(19242700-19242857)
chr4 (17-85)||(44053240-44053308)
chr4 (17-175)||(16377164-16377323)
chr4 (17-83)||(13812451-13812517)
chr4 (29-107)||(15868289-15868367)
chr4 (374-482)||(14970751-14970858)
chr4 (17-179)||(15091212-15091376)
chr4 (431-492)||(17046491-17046552)
chr4 (17-78)||(44102627-44102688)
chr4 (336-492)||(3515008-3515165)
chr4 (17-81)||(7799112-7799176)
chr4 (17-85)||(20156932-20157000)
chr4 (17-85)||(22636845-22636913)
chr4 (381-492)||(23803316-23803426)
chr4 (12-107)||(13410-13505)
chr4 (336-482)||(15355328-15355476)
chr4 (434-492)||(7641286-7641343)
chr4 (434-492)||(12610951-12611008)
chr4 (379-492)||(14053306-14053418)
chr4 (141-237)||(3332144-3332240)
chr4 (1-57)||(16487705-16487761)
chr4 (1-53)||(36133600-36133652)
chr4 (336-492)||(44102215-44102372)
chr4 (10-60)||(15124790-15124840)
chr4 (29-79)||(32851868-32851918)
chr4 (16-53)||(3413212-3413249)
chr4 (373-414)||(15464929-15464970)
chr4 (16-53)||(18602398-18602435)
chr4 (16-53)||(18608992-18609029)
chr4 (189-246)||(20157104-20157161)
chr4 (1-53)||(2015194-2015246)
chr4 (13-53)||(11250211-11250251)
chr4 (13-53)||(16351498-16351538)
chr4 (13-44)||(17053483-17053514)
chr4 (425-468)||(17333305-17333347)
chr4 (431-477)||(6190481-6190527)
chr4 (33-107)||(12287791-12287865)
chr4 (144-246)||(13812578-13812680)
chr4 (47-85)||(17046727-17046765)
chr4 (16-53)||(1951414-1951451)
chr4 (16-53)||(14708287-14708324)
chr4 (16-53)||(16243053-16243090)
chr4 (16-53)||(18222031-18222068)
chr4 (16-53)||(18237308-18237345)
chr4 (16-53)||(23139686-23139723)
chr4 (16-53)||(26243318-26243355)
chr4 (12-53)||(27534441-27534482)
chr4 (16-53)||(28569097-28569134)
chr4 (16-53)||(43255813-43255850)
chr4 (16-53)||(45938563-45938600)
chr4 (139-179)||(7089192-7089232)
chr4 (139-179)||(14053068-14053108)
chr4 (139-179)||(17047838-17047878)
chr4 (16-44)||(17152140-17152168)
chr4 (13-53)||(25555932-25555972)
chr4 (139-179)||(44102526-44102566)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (17-493)||(25175853-25176321)
chr2 (39-491)||(28405981-28406436)
chr2 (17-492)||(22133859-22134323)
chr2 (226-466)||(7582-7824)
chr2 (140-477)||(23207296-23207634)
chr2 (226-481)||(18786752-18787009)
chr2 (335-492)||(7679589-7679746)
chr2 (205-477)||(23791292-23791567)
chr2 (17-209)||(23708261-23708452)
chr2 (329-492)||(23071905-23072066)
chr2 (336-492)||(22105413-22105571)
chr2 (370-492)||(298809-298932)
chr2 (336-478)||(19671848-19671991)
chr2 (319-493)||(23708561-23708738)
chr2 (205-477)||(25108906-25109181)
chr2 (17-176)||(23660341-23660501)
chr2 (370-492)||(23060517-23060639)
chr2 (17-179)||(298457-298620)
chr2 (13-85)||(28291940-28292012)
chr2 (1-57)||(45677782-45677838)
chr2 (13-83)||(37765-37835)
chr2 (1-78)||(24658055-24658132)
chr2 (336-492)||(18808944-18809101)
chr2 (26-110)||(23071614-23071698)
chr2 (336-492)||(23130863-23131020)
chr2 (336-492)||(23133330-23133487)
chr2 (17-85)||(23286261-23286329)
chr2 (17-85)||(23654052-23654120)
chr2 (336-492)||(23709536-23709693)
chr2 (336-492)||(23712017-23712174)
chr2 (336-492)||(34402526-34402683)
chr2 (336-492)||(39682314-39682471)
chr2 (370-492)||(22337119-22337241)
chr2 (370-492)||(23076446-23076568)
chr2 (370-492)||(23285869-23285987)
chr2 (370-492)||(23654381-23654503)
chr2 (398-492)||(38138-38231)
chr2 (370-492)||(23660027-23660148)
chr2 (336-482)||(24367785-24367932)
chr2 (336-477)||(20520152-20520295)
chr2 (17-205)||(23076731-23076919)
chr2 (339-492)||(23135591-23135745)
chr2 (1-54)||(40621835-40621888)
chr2 (336-492)||(571398-571555)
chr2 (336-492)||(6725996-6726153)
chr2 (13-85)||(20309505-20309577)
chr2 (191-411)||(22459377-22459598)
chr2 (17-85)||(22730875-22730943)
chr2 (17-85)||(22737822-22737890)
chr2 (1-57)||(25963344-25963400)
chr2 (336-492)||(26505380-26505537)
chr2 (336-492)||(26507858-26508015)
chr2 (17-85)||(27753986-27754054)
chr2 (336-492)||(28577100-28577257)
chr2 (17-81)||(32451571-32451635)
chr2 (370-492)||(22731229-22731351)
chr2 (336-482)||(21155064-21155211)
chr2 (20-179)||(22337431-22337591)
chr2 (1-78)||(24673991-24674068)
chr2 (307-415)||(24697536-24697645)
chr2 (336-492)||(24898199-24898357)
chr2 (336-492)||(24900682-24900840)
chr2 (336-492)||(24903159-24903317)
chr2 (336-492)||(24905636-24905794)
chr2 (336-492)||(24908111-24908269)
chr2 (377-492)||(20309112-20309225)
chr2 (1-57)||(21917943-21917999)
chr2 (432-492)||(23040247-23040306)
chr2 (336-492)||(32039502-32039659)
chr2 (1-57)||(37525100-37525156)
chr2 (7-57)||(22798759-22798809)
chr2 (374-492)||(23103396-23103512)
chr2 (336-482)||(32214925-32215072)
chr2 (419-492)||(8946661-8946733)
chr2 (319-477)||(22413078-22413240)
chr2 (12-65)||(22740598-22740651)
chr2 (12-65)||(22758353-22758406)
chr2 (336-492)||(45029858-45030015)
chr2 (336-491)||(43137301-43137457)
chr2 (1-57)||(22811561-22811617)
chr2 (9-57)||(23019341-23019389)
chr2 (434-482)||(24643054-24643101)
chr2 (445-492)||(22738249-22738296)
chr2 (342-477)||(23004767-23004905)
chr2 (17-60)||(23038468-23038511)
chr2 (17-60)||(23100873-23100916)
chr2 (14-57)||(24654989-24655032)
chr2 (445-492)||(38967375-38967422)
chr2 (159-209)||(20519976-20520026)
chr2 (336-492)||(24529532-24529690)
chr2 (16-53)||(27263667-27263704)
chr2 (27-60)||(44369952-44369985)
chr2 (1-53)||(21318273-21318325)
chr2 (1-53)||(21327204-21327256)
chr2 (13-53)||(24175227-24175267)
chr2 (21-57)||(24716188-24716224)
chr2 (13-53)||(24870307-24870347)
chr2 (12-123)||(18786445-18786556)
chr2 (38-80)||(23005221-23005263)
chr2 (425-475)||(23287384-23287433)
chr2 (38-84)||(39827602-39827648)
chr2 (16-53)||(19928155-19928192)
chr2 (140-193)||(22412900-22412953)
chr2 (16-53)||(22460843-22460880)
chr2 (16-53)||(23187491-23187528)
chr2 (33-106)||(23207744-23207817)
chr2 (16-53)||(23598754-23598791)
chr2 (16-53)||(26125619-26125656)
chr2 (426-475)||(26392403-26392451)
chr2 (16-53)||(40428892-40428929)
chr2 (16-53)||(41667365-41667402)
chr2 (8-65)||(44621358-44621415)
chr2 (139-179)||(20309420-20309460)
chr2 (16-44)||(24735828-24735856)
[»] scaffold0023 (11 HSPs)
scaffold0023 (67-493)||(39864-40292)
scaffold0023 (188-493)||(100377-100683)
scaffold0023 (17-288)||(101602-101873)
scaffold0023 (336-492)||(94412-94569)
scaffold0023 (336-492)||(44455-44613)
scaffold0023 (419-493)||(101502-101576)
scaffold0023 (423-492)||(119879-119948)
scaffold0023 (336-482)||(17444-17591)
scaffold0023 (1-53)||(38127-38179)
scaffold0023 (17-62)||(39651-39696)
scaffold0023 (1-49)||(23294-23342)
[»] chr5 (127 HSPs)
chr5 (17-492)||(21329137-21329614)
chr5 (17-493)||(21565545-21566023)
chr5 (17-493)||(22959175-22959650)
chr5 (29-493)||(26011688-26012154)
chr5 (138-492)||(21501918-21502273)
chr5 (17-492)||(19668902-19669379)
chr5 (12-388)||(21741180-21741545)
chr5 (12-492)||(19660474-19660952)
chr5 (191-477)||(20026756-20027043)
chr5 (12-220)||(5888812-5889021)
chr5 (38-209)||(22144337-22144508)
chr5 (229-477)||(22178072-22178323)
chr5 (370-492)||(21729059-21729181)
chr5 (370-492)||(21808384-21808506)
chr5 (336-477)||(22144068-22144211)
chr5 (370-492)||(23390491-23390613)
chr5 (395-492)||(36314581-36314678)
chr5 (17-179)||(1096783-1096946)
chr5 (17-246)||(22119835-22120064)
chr5 (17-209)||(11580887-11581079)
chr5 (370-492)||(24493573-24493694)
chr5 (17-122)||(21498659-21498764)
chr5 (371-492)||(8286838-8286960)
chr5 (13-85)||(21292619-21292691)
chr5 (17-179)||(36154470-36154633)
chr5 (17-246)||(21871213-21871442)
chr5 (17-246)||(21875493-21875722)
chr5 (370-492)||(13025315-13025436)
chr5 (370-492)||(13095499-13095620)
chr5 (17-107)||(21985789-21985879)
chr5 (370-492)||(22412188-22412309)
chr5 (336-492)||(264772-264929)
chr5 (370-489)||(1096474-1096593)
chr5 (336-492)||(10732944-10733101)
chr5 (336-492)||(11581203-11581360)
chr5 (1-57)||(21887260-21887316)
chr5 (17-85)||(22075419-22075487)
chr5 (17-85)||(23390138-23390206)
chr5 (1-57)||(23512543-23512599)
chr5 (377-492)||(24529224-24529339)
chr5 (336-492)||(29329935-29330092)
chr5 (336-492)||(39363385-39363542)
chr5 (374-492)||(9077956-9078074)
chr5 (390-492)||(21997549-21997651)
chr5 (370-480)||(22075035-22075145)
chr5 (1-60)||(23201802-23201861)
chr5 (370-492)||(25421536-25421658)
chr5 (3-57)||(22032752-22032806)
chr5 (319-478)||(40725871-40726032)
chr5 (1-57)||(14079584-14079640)
chr5 (1-57)||(18769631-18769687)
chr5 (336-492)||(20909013-20909170)
chr5 (1-57)||(21366293-21366349)
chr5 (13-85)||(22107022-22107094)
chr5 (17-85)||(24529632-24529700)
chr5 (17-85)||(25421943-25422011)
chr5 (17-85)||(25431805-25431873)
chr5 (8-60)||(37724337-37724389)
chr5 (336-492)||(42245369-42245526)
chr5 (336-481)||(20902012-20902159)
chr5 (342-444)||(29448054-29448159)
chr5 (336-492)||(2154617-2154775)
chr5 (16-85)||(8286494-8286563)
chr5 (17-179)||(9078268-9078431)
chr5 (17-85)||(13095905-13095973)
chr5 (1-57)||(20805983-20806039)
chr5 (336-492)||(29345981-29346138)
chr5 (1-60)||(23500972-23501031)
chr5 (7-57)||(31342539-31342589)
chr5 (372-476)||(25431414-25431518)
chr5 (339-492)||(39245137-39245291)
chr5 (17-85)||(24493979-24494047)
chr5 (21-85)||(24766983-24767047)
chr5 (336-492)||(29348454-29348611)
chr5 (336-492)||(29350927-29351084)
chr5 (6-57)||(17918794-17918845)
chr5 (336-492)||(36154787-36154941)
chr5 (434-492)||(20918052-20918109)
chr5 (1-42)||(23572510-23572551)
chr5 (17-85)||(13025721-13025789)
chr5 (1-53)||(22760081-22760133)
chr5 (336-492)||(32027394-32027551)
chr5 (445-492)||(10775790-10775837)
chr5 (336-482)||(18319037-18319185)
chr5 (425-492)||(21293020-21293086)
chr5 (445-492)||(23064512-23064559)
chr5 (17-60)||(26704499-26704542)
chr5 (426-477)||(26740697-26740747)
chr5 (17-60)||(26974232-26974275)
chr5 (445-492)||(38619435-38619482)
chr5 (29-123)||(22177797-22177891)
chr5 (189-246)||(24767151-24767208)
chr5 (424-477)||(37723922-37723975)
chr5 (1-53)||(1858614-1858666)
chr5 (13-53)||(12028215-12028255)
chr5 (370-430)||(20766115-20766175)
chr5 (17-53)||(20910454-20910490)
chr5 (139-179)||(22107139-22107179)
chr5 (13-53)||(24222304-24222344)
chr5 (436-492)||(31061069-31061124)
chr5 (14-53)||(26681006-26681045)
chr5 (14-53)||(26952613-26952652)
chr5 (38-80)||(20026526-20026568)
chr5 (426-480)||(26732884-26732937)
chr5 (7-53)||(26742390-26742436)
chr5 (16-53)||(4036636-4036673)
chr5 (16-53)||(16674568-16674605)
chr5 (1-42)||(17410874-17410915)
chr5 (16-53)||(17718092-17718129)
chr5 (16-53)||(18356743-18356780)
chr5 (16-53)||(18784463-18784500)
chr5 (16-53)||(21340420-21340457)
chr5 (16-53)||(21482894-21482931)
chr5 (16-53)||(21884842-21884879)
chr5 (16-53)||(23535242-23535279)
chr5 (16-53)||(24532701-24532738)
chr5 (16-53)||(25229059-25229096)
chr5 (16-53)||(25293215-25293252)
chr5 (142-179)||(25744037-25744074)
chr5 (16-53)||(26172880-26172917)
chr5 (16-53)||(26665784-26665821)
chr5 (16-53)||(26937381-26937418)
chr5 (16-53)||(33409622-33409659)
chr5 (16-53)||(42805836-42805873)
chr5 (16-44)||(20232955-20232983)
chr5 (445-493)||(26704074-26704122)
chr5 (445-493)||(26973807-26973855)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (17-493)||(12942-13419)
scaffold0138 (140-415)||(18002-18277)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (29-481)||(10542-10995)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (17-493)||(129908-130386)
scaffold0010 (373-477)||(60713-60818)
scaffold0010 (140-209)||(60479-60548)
scaffold0010 (16-53)||(23632-23669)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (17-492)||(6615-7092)
scaffold0333 (17-492)||(13995-14472)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (17-493)||(2445-2924)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (17-486)||(6822-7290)
scaffold0556 (29-414)||(8097-8483)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-493)||(32538-33003)
scaffold0034 (17-81)||(51526-51590)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (18-492)||(5765-6240)
[»] chr6 (128 HSPs)
chr6 (17-493)||(19652198-19652674)
chr6 (29-493)||(23019408-23019874)
chr6 (29-437)||(22080391-22080800)
chr6 (17-492)||(29808525-29808999)
chr6 (17-492)||(28496115-28496588)
chr6 (13-492)||(1561307-1561786)
chr6 (140-481)||(19668386-19668728)
chr6 (17-329)||(27332926-27333238)
chr6 (17-329)||(27393666-27393978)
chr6 (8-493)||(4185456-4185939)
chr6 (8-441)||(4667846-4668277)
chr6 (8-441)||(4674693-4675124)
chr6 (8-493)||(31155031-31155515)
chr6 (226-481)||(9098375-9098620)
chr6 (17-211)||(25644607-25644801)
chr6 (226-493)||(20109140-20109412)
chr6 (395-492)||(27333238-27333335)
chr6 (395-492)||(27393978-27394075)
chr6 (8-246)||(4189206-4189444)
chr6 (17-205)||(18457006-18457193)
chr6 (381-487)||(4186376-4186482)
chr6 (17-177)||(25956263-25956424)
chr6 (370-492)||(16496248-16496370)
chr6 (374-492)||(29060544-29060662)
chr6 (17-176)||(19303183-19303343)
chr6 (383-492)||(20076704-20076812)
chr6 (373-481)||(25644335-25644444)
chr6 (336-492)||(1595550-1595707)
chr6 (17-85)||(20637936-20638004)
chr6 (374-492)||(18409826-18409944)
chr6 (336-492)||(22782228-22782385)
chr6 (374-492)||(19303540-19303657)
chr6 (16-85)||(20360612-20360681)
chr6 (336-492)||(2291184-2291341)
chr6 (319-489)||(8227453-8227625)
chr6 (336-492)||(12742318-12742475)
chr6 (13-85)||(16920282-16920354)
chr6 (17-85)||(17287438-17287506)
chr6 (336-492)||(18334596-18334753)
chr6 (17-81)||(18821472-18821536)
chr6 (336-492)||(19005047-19005204)
chr6 (336-492)||(19858923-19859080)
chr6 (377-492)||(20638285-20638400)
chr6 (1-57)||(21739649-21739705)
chr6 (1-57)||(21834517-21834573)
chr6 (17-85)||(22779869-22779937)
chr6 (336-492)||(24422548-24422705)
chr6 (336-492)||(33861795-33861952)
chr6 (336-492)||(33864279-33864436)
chr6 (374-492)||(25629354-25629472)
chr6 (336-492)||(20556898-20557053)
chr6 (336-482)||(30676714-30676861)
chr6 (336-492)||(8055030-8055187)
chr6 (17-85)||(21939794-21939862)
chr6 (17-81)||(25611365-25611429)
chr6 (336-492)||(26924644-26924801)
chr6 (370-492)||(17287791-17287913)
chr6 (370-484)||(20360955-20361069)
chr6 (1-70)||(15041177-15041246)
chr6 (12-65)||(22439230-22439283)
chr6 (17-81)||(15894072-15894136)
chr6 (1-57)||(16523030-16523086)
chr6 (336-492)||(25754810-25754967)
chr6 (17-60)||(19863413-19863456)
chr6 (374-492)||(20593777-20593895)
chr6 (18-81)||(22334525-22334588)
chr6 (390-492)||(25656630-25656731)
chr6 (21-179)||(29060856-29061015)
chr6 (17-107)||(18409469-18409559)
chr6 (13-79)||(22831908-22831974)
chr6 (232-477)||(23076749-23076997)
chr6 (336-482)||(34963384-34963531)
chr6 (228-477)||(35008167-35008419)
chr6 (339-492)||(1540918-1541072)
chr6 (336-477)||(18456735-18456877)
chr6 (12-65)||(22432680-22432733)
chr6 (12-65)||(25641821-25641874)
chr6 (374-482)||(25688513-25688620)
chr6 (377-492)||(16920634-16920747)
chr6 (17-57)||(18180925-18180965)
chr6 (1-53)||(18907549-18907601)
chr6 (17-85)||(20594184-20594252)
chr6 (273-365)||(28103796-28103887)
chr6 (377-492)||(35245590-35245703)
chr6 (434-492)||(25714421-25714478)
chr6 (141-246)||(21939633-21939738)
chr6 (336-492)||(3852021-3852178)
chr6 (13-65)||(11185922-11185974)
chr6 (374-477)||(18461895-18461997)
chr6 (1-53)||(20803190-20803242)
chr6 (1-57)||(22429668-22429724)
chr6 (431-475)||(22831524-22831568)
chr6 (17-179)||(25628997-25629160)
chr6 (336-482)||(16448530-16448678)
chr6 (309-415)||(18696569-18696675)
chr6 (445-492)||(22780297-22780344)
chr6 (433-486)||(11185515-11185568)
chr6 (307-415)||(18706387-18706495)
chr6 (29-106)||(20109605-20109682)
chr6 (27-60)||(22059396-22059429)
chr6 (1-53)||(17804613-17804665)
chr6 (17-81)||(25603027-25603091)
chr6 (17-53)||(27415596-27415632)
chr6 (398-475)||(33443068-33443146)
chr6 (21-60)||(16964957-16964996)
chr6 (434-477)||(18821904-18821946)
chr6 (18-57)||(22405709-22405748)
chr6 (13-51)||(20907631-20907669)
chr6 (7-53)||(25766812-25766858)
chr6 (16-53)||(1587384-1587421)
chr6 (16-53)||(2684994-2685031)
chr6 (16-53)||(5616467-5616504)
chr6 (16-53)||(12496724-12496761)
chr6 (16-53)||(12707104-12707141)
chr6 (16-53)||(16741623-16741660)
chr6 (16-53)||(19663184-19663221)
chr6 (16-53)||(21702703-21702740)
chr6 (1-53)||(1645121-1645173)
chr6 (449-493)||(4738631-4738675)
chr6 (1-53)||(9481931-9481983)
chr6 (29-80)||(18696979-18697031)
chr6 (139-179)||(18821585-18821625)
chr6 (317-365)||(18896256-18896304)
chr6 (13-53)||(19790429-19790469)
chr6 (13-53)||(23657070-23657110)
chr6 (139-179)||(25611489-25611529)
chr6 (21-53)||(27553265-27553297)
chr6 (1-53)||(27567247-27567299)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (17-493)||(132-609)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (187-485)||(5654-5952)
scaffold0278 (17-128)||(5961-6072)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (18-492)||(671-1151)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (185-493)||(14506-14815)
scaffold0008 (1-57)||(30372-30428)
scaffold0008 (16-53)||(2292-2329)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (12-493)||(45426-45910)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (17-495)||(160685-161164)
scaffold0001 (336-482)||(501095-501242)
scaffold0001 (336-492)||(85583-85741)
scaffold0001 (1-53)||(173706-173758)
scaffold0001 (6-53)||(422173-422221)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (188-438)||(2030-2281)
[»] scaffold0476 (5 HSPs)
scaffold0476 (188-492)||(12770-13075)
scaffold0476 (1-57)||(6018-6074)
scaffold0476 (1-57)||(7213-7269)
scaffold0476 (29-118)||(8180-8269)
scaffold0476 (29-106)||(13233-13310)
[»] scaffold0555 (3 HSPs)
scaffold0555 (127-493)||(10293-10659)
scaffold0555 (17-86)||(10210-10279)
scaffold0555 (13-81)||(994-1062)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (188-492)||(62202-62503)
scaffold0028 (17-493)||(132661-133132)
scaffold0028 (336-492)||(136681-136838)
scaffold0028 (336-492)||(139150-139307)
scaffold0028 (336-492)||(144088-144245)
scaffold0028 (336-492)||(134212-134369)
scaffold0028 (336-492)||(141619-141776)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (161-493)||(22459-22788)
scaffold0037 (17-246)||(79974-80203)
scaffold0037 (336-492)||(82073-82230)
scaffold0037 (1-68)||(21196-21263)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (29-475)||(7711-8161)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (17-308)||(15472-15765)
scaffold0020 (390-492)||(15792-15894)
scaffold0020 (17-60)||(179085-179128)
scaffold0020 (445-493)||(178897-178945)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (140-481)||(7841-8180)
scaffold0218 (12-449)||(28917-29354)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (187-482)||(1096-1391)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (12-493)||(32101-32567)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (17-220)||(3207-3411)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (12-492)||(15665-16142)
scaffold0261 (17-65)||(1768-1816)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (8-441)||(9133-9564)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (13-492)||(34127-34603)
scaffold0175 (17-85)||(13503-13571)
scaffold0175 (445-484)||(285-324)
[»] scaffold0021 (7 HSPs)
scaffold0021 (140-477)||(136132-136471)
scaffold0021 (140-477)||(144840-145179)
scaffold0021 (18-143)||(62913-63039)
scaffold0021 (17-85)||(124993-125061)
scaffold0021 (374-477)||(174785-174886)
scaffold0021 (426-492)||(121770-121835)
scaffold0021 (17-58)||(175202-175243)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (13-384)||(1939-2303)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (17-284)||(28451-28720)
scaffold0211 (412-493)||(28806-28888)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (188-492)||(11296-11598)
scaffold0046 (329-492)||(2001-2162)
scaffold0046 (377-492)||(28418-28533)
scaffold0046 (440-492)||(4556-4608)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (140-481)||(103403-103737)
scaffold0040 (33-125)||(103241-103333)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (140-477)||(12587-12924)
scaffold0413 (17-179)||(15257-15420)
scaffold0413 (29-123)||(13017-13111)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (140-477)||(19649-19987)
scaffold0080 (370-492)||(39917-40038)
scaffold0080 (17-179)||(40228-40390)
scaffold0080 (1-57)||(18283-18339)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (205-477)||(6111-6386)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (226-466)||(53398-53640)
scaffold0075 (17-239)||(7936-8158)
scaffold0075 (12-107)||(53108-53203)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (226-473)||(38339-38589)
scaffold0139 (12-58)||(20418-20464)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (140-477)||(128735-129072)
scaffold0022 (205-473)||(78345-78614)
scaffold0022 (370-492)||(116431-116551)
scaffold0022 (38-117)||(128557-128636)
scaffold0022 (33-107)||(80727-80801)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (12-438)||(2082-2505)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (27-179)||(43436-43589)
scaffold0116 (27-179)||(47356-47509)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (389-493)||(23897-24001)
scaffold0100 (17-179)||(20428-20591)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (329-492)||(1025-1186)
scaffold0184 (13-53)||(3874-3914)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (370-492)||(38697-38819)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (226-477)||(97024-97277)
scaffold0006 (226-477)||(106302-106555)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (140-477)||(1562-1900)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (370-492)||(3146-3267)
scaffold0540 (17-179)||(655-818)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (191-415)||(87-311)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (370-477)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (374-492)||(3185-3303)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (8-209)||(1711-1911)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (370-484)||(39489-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (370-484)||(75210-75323)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (18-209)||(20069-20259)
scaffold0031 (336-477)||(20383-20524)
scaffold0031 (12-60)||(65431-65479)
scaffold0031 (1-53)||(53981-54033)
scaffold0031 (370-492)||(128755-128876)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (370-492)||(39862-39983)
scaffold0026 (370-484)||(25908-26021)
scaffold0026 (17-107)||(40245-40335)
scaffold0026 (17-107)||(39573-39663)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (336-481)||(25121-25268)
scaffold0123 (307-415)||(619-727)
scaffold0123 (38-123)||(25555-25640)
[»] scaffold0228 (7 HSPs)
scaffold0228 (17-179)||(4823-4987)
scaffold0228 (17-179)||(12405-12569)
scaffold0228 (17-179)||(22357-22521)
scaffold0228 (370-484)||(4520-4633)
scaffold0228 (370-484)||(12102-12215)
scaffold0228 (370-484)||(22054-22167)
scaffold0228 (7-57)||(18276-18326)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (370-492)||(1855-1977)
scaffold0016 (17-85)||(2262-2330)
scaffold0016 (16-246)||(207160-207390)
scaffold0016 (29-79)||(119205-119255)
[»] scaffold0120 (8 HSPs)
scaffold0120 (370-492)||(32952-33073)
scaffold0120 (370-492)||(45932-46053)
scaffold0120 (17-179)||(32601-32764)
scaffold0120 (17-179)||(46241-46404)
scaffold0120 (374-492)||(16117-16235)
scaffold0120 (17-85)||(16498-16565)
scaffold0120 (434-492)||(17389-17446)
scaffold0120 (1-53)||(19655-19707)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-85)||(1314-1398)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (377-492)||(4853-4968)
scaffold0403 (12-85)||(5248-5321)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (377-477)||(13147-13247)
scaffold0357 (373-481)||(16098-16206)
scaffold0357 (142-209)||(15866-15933)
scaffold0357 (33-123)||(13580-13670)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (1-85)||(3881-3965)
scaffold0165 (1-85)||(7945-8029)
scaffold0165 (373-481)||(27747-27855)
scaffold0165 (29-80)||(27296-27347)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (17-179)||(17096-17259)
scaffold0142 (336-492)||(16785-16942)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (17-209)||(12216-12407)
scaffold0503 (434-477)||(11982-12024)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (319-468)||(11492-11643)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (13-84)||(13896-13967)
scaffold0427 (377-480)||(13513-13615)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-60)||(21433-21492)
scaffold0210 (1-60)||(29325-29384)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (319-468)||(38198-38349)
scaffold0124 (15-85)||(24291-24361)
[»] scaffold0056 (6 HSPs)
scaffold0056 (374-492)||(17214-17334)
scaffold0056 (16-179)||(16856-17020)
scaffold0056 (20-107)||(79007-79094)
scaffold0056 (1-57)||(13704-13760)
scaffold0056 (152-209)||(79107-79163)
scaffold0056 (336-477)||(79288-79430)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (319-478)||(17969-18130)
scaffold0247 (17-85)||(6470-6538)
scaffold0247 (336-482)||(2132-2280)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (205-477)||(569-841)
[»] scaffold1842 (2 HSPs)
scaffold1842 (17-85)||(702-770)
scaffold1842 (370-492)||(1043-1165)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (17-85)||(2727-2795)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (13-85)||(4780-4852)
scaffold0718 (377-492)||(5132-5245)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (13-85)||(701-773)
scaffold0598 (377-492)||(1053-1166)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (13-85)||(10075-10147)
scaffold0456 (377-492)||(10427-10540)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (17-85)||(13250-13318)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (17-85)||(336-404)
scaffold0358 (17-85)||(5112-5180)
scaffold0358 (419-492)||(4716-4788)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (16-179)||(25706-25870)
scaffold0122 (374-489)||(26064-26179)
scaffold0122 (370-492)||(44702-44824)
scaffold0122 (17-85)||(33136-33204)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (13-85)||(32464-32536)
scaffold0113 (377-492)||(32071-32184)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (17-85)||(167632-167700)
scaffold0011 (17-85)||(52323-52391)
scaffold0011 (370-492)||(51917-52039)
scaffold0011 (370-492)||(167973-168095)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-60)||(27256-27315)
[»] scaffold0193 (3 HSPs)
scaffold0193 (370-492)||(13215-13337)
scaffold0193 (17-85)||(13611-13679)
scaffold0193 (16-53)||(9836-9873)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (17-107)||(604-694)
scaffold0395 (431-492)||(4890-4950)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (370-492)||(32946-33067)
scaffold0145 (370-492)||(38765-38886)
scaffold0145 (17-179)||(39076-39238)
scaffold0145 (336-492)||(9750-9908)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (17-179)||(20718-20882)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (17-179)||(16241-16405)
scaffold0217 (374-492)||(16599-16717)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (12-85)||(21301-21374)
scaffold0088 (377-478)||(20928-21030)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (17-85)||(315-383)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (17-85)||(17650-17718)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (17-85)||(16679-16747)
scaffold0351 (379-492)||(16286-16397)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-57)||(15837-15893)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-57)||(6705-6761)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (17-179)||(658-821)
scaffold0292 (370-492)||(3474-3596)
scaffold0292 (17-85)||(3881-3949)
scaffold0292 (370-492)||(347-468)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (336-492)||(20748-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (336-492)||(37822-37979)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-57)||(15976-16032)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (336-492)||(158454-158611)
scaffold0003 (374-492)||(339949-340064)
scaffold0003 (17-179)||(339593-339756)
scaffold0003 (17-53)||(71729-71765)
scaffold0003 (16-53)||(140126-140163)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (1-60)||(875-934)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (16-107)||(5762-5853)
scaffold0647 (370-492)||(6116-6241)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (1-60)||(10448-10507)
scaffold0297 (1-55)||(15306-15360)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (1-79)||(680-758)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (260-477)||(267679-267898)
scaffold0005 (29-107)||(268117-268195)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (374-482)||(10784-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (339-492)||(13393-13547)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (13-70)||(10910-10967)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (370-492)||(8528-8646)
scaffold0121 (17-85)||(8175-8242)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-57)||(2312-2368)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (336-492)||(4695-4852)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (1-53)||(6543-6595)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-57)||(6043-6099)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-57)||(1926-1982)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (17-85)||(18600-18668)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (21-85)||(11170-11234)
scaffold0235 (29-80)||(14055-14106)
scaffold0235 (379-490)||(11447-11558)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (17-85)||(23293-23361)
scaffold0231 (370-492)||(22887-23008)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (336-492)||(13948-14105)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-57)||(4560-4616)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-57)||(3275-3331)
scaffold0158 (1-57)||(6941-6997)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (1-57)||(7726-7782)
scaffold0114 (377-492)||(15466-15580)
scaffold0114 (13-85)||(15114-15186)
scaffold0114 (13-65)||(32914-32966)
[»] scaffold0106 (6 HSPs)
scaffold0106 (377-492)||(1293-1406)
scaffold0106 (377-492)||(7270-7383)
scaffold0106 (13-60)||(16083-16130)
scaffold0106 (13-79)||(1692-1758)
scaffold0106 (13-79)||(7669-7735)
scaffold0106 (431-492)||(15295-15355)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (1-57)||(64290-64346)
scaffold0064 (13-82)||(47389-47458)
scaffold0064 (426-492)||(46999-47065)
[»] scaffold0042 (6 HSPs)
scaffold0042 (1-57)||(34537-34593)
scaffold0042 (370-478)||(24297-24406)
scaffold0042 (17-83)||(23944-24010)
scaffold0042 (6-57)||(41185-41236)
scaffold0042 (16-53)||(64269-64306)
scaffold0042 (16-53)||(76153-76190)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-57)||(46354-46410)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-57)||(13194-13250)
scaffold0029 (336-482)||(11299-11446)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (370-492)||(1956-2078)
scaffold0490 (13-82)||(2355-2424)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (17-236)||(288-506)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (17-246)||(10160-10389)
[»] scaffold0070 (3 HSPs)
scaffold0070 (22-129)||(4890-4997)
scaffold0070 (370-475)||(4545-4650)
scaffold0070 (16-53)||(10319-10356)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (1-55)||(595-649)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (17-107)||(28925-29015)
scaffold0130 (29-123)||(1357-1451)
scaffold0130 (370-414)||(27912-27956)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (17-180)||(8789-8954)
scaffold0639 (377-492)||(8483-8598)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (374-482)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (377-477)||(51601-51699)
scaffold0032 (13-85)||(51979-52051)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (46-123)||(227865-227942)
scaffold0012 (319-438)||(225465-225585)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-53)||(830-882)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (14-82)||(7013-7081)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (17-85)||(12451-12519)
scaffold0221 (189-246)||(12623-12679)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (17-85)||(10555-10623)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-57)||(15107-15163)
scaffold0081 (1-57)||(24122-24181)
scaffold0081 (1-57)||(39546-39605)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-57)||(44486-44542)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (336-492)||(40401-40558)
scaffold0044 (1-43)||(19614-19656)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (13-57)||(18676-18720)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (17-65)||(70224-70272)
scaffold0004 (1-53)||(10222-10274)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (17-60)||(26834-26877)
scaffold0198 (445-493)||(23842-23890)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (17-60)||(36034-36077)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (17-60)||(36891-36934)
scaffold0131 (445-493)||(36453-36501)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (38-115)||(12376-12453)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (7-60)||(8590-8643)
scaffold0101 (445-482)||(1395-1432)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (8-57)||(190915-190964)
scaffold0017 (8-57)||(192618-192667)
scaffold0017 (13-53)||(14963-15003)
scaffold0017 (13-53)||(19485-19525)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (336-492)||(107-264)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-57)||(1329-1385)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-57)||(16748-16804)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-57)||(18080-18136)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (21-85)||(9480-9544)
scaffold0166 (189-246)||(9648-9705)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-68)||(1711-1778)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (336-479)||(29946-30090)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-79)||(2240-2317)
scaffold0104 (1-79)||(9922-9999)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (29-123)||(24174-24268)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (374-482)||(4308-4415)
scaffold0761 (17-60)||(5952-5995)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (336-480)||(161093-161239)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-57)||(1127-1183)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (13-53)||(1853-1893)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (9-57)||(4863-4911)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (17-57)||(18945-18985)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (17-85)||(10569-10637)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (6-53)||(35153-35200)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (389-477)||(2694-2784)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (22-104)||(2245-2327)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (336-482)||(12253-12400)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (336-492)||(12065-12216)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (26-60)||(32867-32901)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (16-53)||(769-806)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (336-492)||(4215-4373)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (12-53)||(17361-17402)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (18-59)||(9081-9122)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (1-53)||(2217-2269)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-53)||(747-799)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (1-53)||(45534-45586)
scaffold0109 (29-80)||(35524-35575)
scaffold0109 (16-53)||(10955-10992)
scaffold0109 (16-53)||(38472-38509)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (13-53)||(191966-192006)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (1-44)||(11438-11481)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (6-53)||(2078-2125)
scaffold0439 (6-53)||(9938-9985)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-53)||(6913-6960)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (29-80)||(29177-29228)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-43)||(2311-2353)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (16-53)||(345-382)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-42)||(6443-6484)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (16-53)||(2315-2352)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (16-53)||(9345-9382)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (16-53)||(15759-15796)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (16-53)||(18013-18050)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (16-53)||(12169-12206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (16-53)||(18770-18807)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (16-53)||(66068-66105)
scaffold0036 (16-53)||(71209-71246)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (168-209)||(85832-85873)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (17-53)||(1098-1134)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (16-44)||(3183-3211)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (17-53)||(36721-36757)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 22921509 - 22921987
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  22921509 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaaccaggaatagttt 22921608  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| ||| ||| | |||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22921609 aagaacgaatttttgagagttagacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgccttgtttgggttaaat 22921708  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22921709 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatga 22921808  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22921809 tctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 22921908  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22921909 atgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33681488 - 33681010
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  33681488 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 33681389  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  33681388 tagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttgcttatgttaaat 33681289  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| |||| |  ||||||    
T  33681288 gcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga-tgcatatga 33681190  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  33681189 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33681089 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22238108 - 22237630
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||   |||    
T  22238108 ttttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctggaaagattt 22238009  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
      ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22238008 tggaatgaattttgtgagttgcacttgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 22237909  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctg-ttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||  || ||| ||  ||||||    
T  22237908 cgatctttttcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactg-atacatatga 22237810  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22237809 attgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22237710  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22237709 gatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 52927623 - 52928088
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  52927623 ttttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 52927722  T
Q  117 aagaatgaactttggga-gttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
      ||||||| |||   | |||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52927723 tggaatgaattttttaaagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgtt-aggttaaat 52927821  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||  ||||||    
T  52927822 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactg-atgcatatga 52927920  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||    
T  52927921 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcat 52928008  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  52928009 gatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20248756 - 20248282
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||    
T  20248756 ttttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctggagagactt 20248657  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20248656 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttatttaggttaaa 20248558  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |  ||||||| |||| |  |||||    
T  20248557 tgcgattcttgtcgcacaagttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgtc-cagtaagactga-tgcatatg 20248460  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248459 aatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatca 20248363  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20248362 tgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Original strand, 35981324 - 35981700
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||    
T  35981324 tgtagttttgacctttaagtcgaacctt-gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgggat 35981422  T
Q  112 agtttaagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  35981423 agtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggt 35981522  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||| |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||      
T  35981523 taaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-g 35981621  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||  |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35981622 tatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21754518 - 21754052
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||     
T  21754518 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacctgggaag 21754419  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
    | |||| ||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||| |||||    
T  21754418 acttta-gaatgaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgttttacagactgccttgtt-aggtt 21754321  T
Q  212 aaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||    
T  21754320 aaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga-tgcat 21754222  T
Q  311 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatat 410  Q
    ||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21754221 atgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatat 21754131  T
Q  411 catgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21754130 catgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20637330 - 20636957
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgttttt-gagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20637330 ttttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtt 20637231  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20637230 taagaacgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaatcagttacagaatgtcttgtttaggttaaa 20637131  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
     |||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||     
T  20637130 agcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaatt-gtatt 20637032  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
     | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20637031 ttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgtatttgggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 477
Target Start/End: Original strand, 21861385 - 21861672
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  21861385 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttg 21861483  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttg 387  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||    
T  21861484 tttcagtaagcctgaat-attatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatg 21861582  T
Q  388 aattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21861583 acttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 49261686 - 49261448
Alignment:
Q  150 ccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaat 249  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||    
T  49261686 ccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgat 49261587  T
Q  250 cttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtata 348  Q
    ||| || |||||||||||||||  ||| |||| ||||||  || ||||||||| |||||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  49261586 cttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtata 49261488  T
Q  349 tacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261487 tacattatataaattatgttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 28194085 - 28194294
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  28194085 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgaaat 28194184  T
Q  112 agtttaagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  28194185 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacaaaatgtcttgtttaggt 28194284  T
Q  211 taaatgcgat 220  Q
    || |||||||    
T  28194285 tacatgcgat 28194294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 477
Target Start/End: Original strand, 21896078 - 21896358
Alignment:
Q  195 aatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttc 293  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   ||    
T  21896078 aatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgtt---tc 21896173  T
Q  294 agtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaatt 391  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||    
T  21896174 agtaagcctgaat-attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgactt 21896272  T
Q  392 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21896273 gcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20919080 - 20918620
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| ||  |    
T  20919080 ttttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agact 20918982  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||  || ||||| || |   || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||     |||| |||||||||| |||||||| ||    
T  20918981 tagaatttaaatttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtgttaaagaatgcctt-tttaggttgaa 20918884  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || |||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||  | || ||||||| || | |   ||||    
T  20918883 tgcgatctttgtcgttcgacttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactca-tgcttatg 20918785  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |  | |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20918784 aattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 20918688  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 480  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918687 tgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 489
Target Start/End: Original strand, 16368115 - 16368401
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16368115 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 16368214  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16368215 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 16368311  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatg 489  Q
    |||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16368312 tgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 50686952 - 50686630
Alignment:
Q  157 gagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |   |  ||||||| ||||||| ||| |||||| ||   || ||||||||||||| ||||||| ||| | |      
T  50686952 gagtagaggctctcgcctcgcgagcccctgtgagacagaataccttgtt-aggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacgtgagttgatcatgggg 50686854  T
Q  257 gttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacatta 355  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||    
T  50686853 gtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 50686755  T
Q  356 tatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttattta 452  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    |||| ||||||||| ||| |||  |||    
T  50686754 catgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttatta 50686655  T
Q  453 actaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  50686654 actaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 493
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295672
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa---gttgatgatgatgatgt 493  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 477
Target Start/End: Original strand, 50613999 - 50614219
Alignment:
Q  260 agaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 358  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  50613999 agaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacat 50614097  T
Q  359 gaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 455  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||    
T  50614098 gaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaact 50614197  T
Q  456 aagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  50614198 aagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 477
Target Start/End: Original strand, 50621827 - 50622047
Alignment:
Q  260 agaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 358  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  50621827 agaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacat 50621925  T
Q  359 gaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 455  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||    
T  50621926 gaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaact 50622025  T
Q  456 aagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  50622026 aagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21161892 - 21161719
Alignment:
Q  318 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21161892 aatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat 21161795  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  21161794 gatttgcatactgt-tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatgt 21161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Original strand, 41049885 - 41050138
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  || || ||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||    
T  41049885 tcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttg 41049983  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||    
T  41049984 ttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactatttt 41050082  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
      |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41050083 atatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16758841 - 16758664
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16758841 taatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgt 16758742  T
Q  406 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16758741 tatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 433486 - 433323
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  433486 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 433387  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  433386 tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 433323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43697839 - 43697712
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  43697839 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacctggaatagttt 43697740  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctg 143  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  43697739 aagaatggattttcgggagttacacctg 43697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 477
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  383 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45574946 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475248
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21475190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 22355827 - 22355895
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22355827 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 22355895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 22357513 - 22357581
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22357513 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 22357581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22831005 - 22831061
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831005 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 22831061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 38801041 - 38801112
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38801041 tatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 38801112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 27250384 - 27250450
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27250384 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 27250450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 21787669 - 21787738
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  21787669 atgttgaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaat 21787738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988867
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13988925 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923452
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21923394 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 42864838 - 42864894
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42864838 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 42864894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22532748 - 22532585
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| ||   ||     
T  22532748 ttttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaggattg 22532649  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||| | |   || ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22532648 tagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcga 22532585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12271852 - 12271744
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||     
T  12271852 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattg 12271754  T
Q  290 tttcagtaag 299  Q
    ||||||||||    
T  12271753 tttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 21301180 - 21301245
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaa 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21301180 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593896
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23593838 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298138
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29298196 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776689
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29776747 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31612471 - 31612314
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  31612471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 31612373  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31612372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34510259 - 34510191
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34510259 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 34510191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433013
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 18181748 - 18181826
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || | ||||||||    
T  18181748 atgtcgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattag 18181826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 444
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130976
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  428 tgtctatgttgctgttg 444  Q
    || ||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20135671 - 20135598
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20135671 tgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaaga 20135598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 20846867 - 20846940
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20846867 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaaga 20846940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065226
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagg 26065226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6152347 - 6152291
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6152347 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcct 6152291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  318 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  416 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
      || |||  |||||| |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 50209856 - 50210018
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  50209856 ttttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatt 50209953  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||| ||| ||   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  50209954 tagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 50210018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21023130 - 21023075
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcc 56  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21023130 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcc 21023075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21715026 - 21714983
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21715026 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468382
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22468382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 22354214 - 22354280
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  22354214 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaa 22354280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123229
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22432410 - 22432466
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22432410 atgttgaattaagtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22432466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 20091113 - 20091180
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  20091113 tatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattagga 20091180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 482
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454660
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064959
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 432  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||| ||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 3472553 - 3472607
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 55  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3472553 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16362075 - 16361928
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  16362075 atataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-t 16361977  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16361976 gtgttgctgtcg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16759210 - 16759104
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| |     
T  16759210 tgtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaa 16759111  T
Q  112 agtttaa 118  Q
    |||||||    
T  16759110 agtttaa 16759104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 13212865 - 13213023
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  13212865 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 13212963  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13212964 tgcgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 468
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801481
Alignment:
Q  420 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38801481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162117
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21342144 - 21342097
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21342144 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21347009 - 21346962
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21347009 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21707215 - 21707168
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21707215 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21711757 - 21711710
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21711757 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 53
Target Start/End: Original strand, 45489394 - 45489433
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45489394 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45489433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 123
Target Start/End: Original strand, 35260713 - 35260803
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  35260713 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatg 35260803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Original strand, 41049626 - 41049700
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  41049626 gaaccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctg 41049700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 23818952 - 23818989
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23818952 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23818989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 8761280 - 8761316
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8761280 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21342632 - 21342564
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  21342632 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21342564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21347497 - 21347429
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  21347497 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21347429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21714593 - 21714545
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  21714593 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 21714545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 15860123 - 15860170
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  15860123 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 15860170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 21895869 - 21895964
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  21895869 tgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 21895964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26065461 - 26065383
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  26065461 agttgaactttagatgatcctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 26065383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12647322 - 12647285
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12647322 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12647285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18882820 - 18882783
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18882820 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18882783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19212320 - 19212283
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19212320 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19212283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20138536 - 20138499
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20138536 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21305767 - 21305730
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21305767 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21615890 - 21615853
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21615890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21615853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 24782753 - 24782790
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24782753 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24782790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33797986 - 33797949
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33797986 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33797949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 46975920 - 46975883
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46975920 ttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46975883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 3704724 - 3704776
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3704724 atgttgaatttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 3704776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 16367873 - 16367953
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  16367873 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaaaagtttaa 16367953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 17678245 - 17678277
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17678245 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 18393613 - 18393653
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18393613 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 18393653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20228447 - 20228499
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20228447 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 20228499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 36818946 - 36818998
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  36818946 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagt 36818998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 38801157 - 38801197
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38801157 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 38801197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 45310016 - 45310056
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45310016 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 45310056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7015 - 6539
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7015 ttttgacttttgagttgatcctttgatgtttt-gagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagttt 6917  T
Q  117 aagaatgaa-ctt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6916 aagaacgaaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataaa 6817  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6816 tgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatga 6717  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6716 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 6617  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6616 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8774 - 8481
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  8774 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttg 8676  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata--attgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagatgttgt 385  Q
    || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||     
T  8675 ttccagtaagactg-atgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga 8577  T
Q  386 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8576 tgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 135)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 68225 - 67749
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  68225 ttttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaataattt 68126  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    |||||  ||||| |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68125 aagaacaaacttgtgggagttacagatgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 68026  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  68025 gcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatga 67926  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67925 tctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatt-gagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 67827  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  67826 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 44014653 - 44014181
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  44014653 ttttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 44014554  T
Q  117 aagaatgaactttggg-agttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014553 tagaatgaatttttgttagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaatgccttgtttaggttaaat 44014454  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    |||||  || |||||||| |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44014453 gcgatcattgtcgcacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgat 44014356  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44014355 ctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagat---gttgatttgcattcgatattgttatatcatga 44014259  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44014258 tgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18006120 - 18005649
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||      || ||||||||||| |||||||||    
T  18006120 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagat------ttgagattgaacctaaaatagttt 18006027  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  18006026 aagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataa-t 18005928  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18005927 gcgatctttgtcgcacaagttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatga 18005828  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18005827 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 18005728  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005727 atgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 47832287 - 47831811
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  47832287 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatctggaatagttt 47832188  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47832187 aagaacgaattttgagagttacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatg 47832088  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
     |||  || ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  47832087 tgatctttgtcggacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataat 47831989  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47831988 ctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 47831889  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  47831888 atgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 16219358 - 16219835
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16219358 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatagttt 16219457  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219458 aagaatgaatttttgggagttacacgtgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgccttgtt-aggttaaat 16219556  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16219557 gcgatctttgtcgcacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataa 16219655  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16219656 tctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 16219755  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16219756 gatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 810771 - 811249
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  810771 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacctggaaagaatt 810870  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgccca-gttacagaatgccttgtttaggttaa 213  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | |  | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  810871 ta-gaatgaatttttgtgaactgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag-tacttatgttacaaaatgccttgtttaagttaa 810968  T
Q  214 atgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    |||||||  || |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  810969 atgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattg-tat 811067  T
Q  313 gatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  811068 aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatc 811167  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  811168 atgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16056795 - 16056343
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    |||||| | |||| || ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  16056795 agttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 16056696  T
Q  129 t-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    | |||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |     
T  16056695 ttgggaattacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgta 16056597  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16056596 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatga-tataatctaatgttgtt 16056498  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16056497 gttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcat 16056399  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16056398 aatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22073383 - 22072917
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaact 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||  |    
T  22073383 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaatagtttaagaatggattt 22073284  T
Q  128 ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  22073283 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttg-ttaggttaaatgcgatccttgtc 22073185  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22073184 gcacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgtt 22073086  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgc 423  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||    
T  22073085 gttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgc 22072986  T
Q  424 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||    
T  22072985 atagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Original strand, 9389332 - 9389709
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  9389332 tgtacttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 9389431  T
Q  112 agtttaagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||| ||| || || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9389432 agtttaagaacgaatttatgtgagttacagctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtttaggt 9389531  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||| |||||  || || |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |  | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||      
T  9389532 taaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-g 9389630  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9389631 tatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatgagatgttgttga 9389709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16324485 - 16324175
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  16324485 ttttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacctggaatagttt 16324386  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| ||| ||| | |||||  |   |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16324385 aagaacgaatttttgagagttagattggaactcgccatggcgagtagaggccctcgccttgcgaactgcccagttacagaatgccttg-ttaggttaaat 16324287  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16324286 gtgatccttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataa 16324188  T
Q  315 tctaatgttgttg 327  Q
    |||||||||||||    
T  16324187 tctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Original strand, 15754527 - 15755004
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| || |      
T  15754527 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaaaaac 15754626  T
Q  115 ttaagaatgaac---tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
    ||| |||||||    |||| || |   ||| |||||  ||| || ||| | |||||||||||||| || |       ||||| |||||||||||||||||    
T  15754627 tta-gaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcgggagcacttgttttacataatgccttgtttaggtt 15754724  T
Q  212 aaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |  ||    
T  15754725 aaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcat 15754823  T
Q  311 atga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 408  Q
    |||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15754824 atgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattat 15754920  T
Q  409 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  15754921 atcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 28504938 - 28505415
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||     
T  28504938 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa- 28505036  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||  | ||||||||  ||  |||   |  ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| ||||||    
T  28505037 agacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttagg 28505134  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    || ||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||   | || ||||||| |||| |      
T  28505135 ttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactga-tgc 28505233  T
Q  309 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
     |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  || ||||||| |||    
T  28505234 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattatta 28505330  T
Q  408 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28505331 tatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34201266 - 34200790
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||    ||| | |||||||||||| || |    
T  34201266 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatgagattgaacctgtaa-a 34201168  T
Q  113 gtttaagaatgaactttgggagttgcac-ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
    |  | ||||||||  || ||||   |   |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |      |||||| |||||||| ||||||||    
T  34201167 gacttagaatgaaaatttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctt-tttaggtt 34201069  T
Q  212 aaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
    ||||||||| | | ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | |  ||||||| |||| |   |    
T  34201068 aaatgcgatccctgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgctt 34200970  T
Q  311 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttata 409  Q
    ||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34200969 atgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattata 34200873  T
Q  410 tcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34200872 tcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 492
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11996144
Alignment:
Q  141 ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatg 240  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||  ||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatg 11995894  T
Q  241 tgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 339  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||  | |  ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||    
T  11995895 tgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatat 11995993  T
Q  340 aattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11995994 aattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 11996090  T
Q  439 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  11996091 ttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12901682 - 12901338
Alignment:
Q  142 tgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgt 241  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| ||   || ||| ||||||||||||    
T  12901682 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacaccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatgt 12901584  T
Q  242 gagttaatcttagatgt---tag-aaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 336  Q
    ||||| ||||| || ||   ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12901583 gagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgtta 12901485  T
Q  337 tataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||    
T  12901484 tatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgccta 12901386  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12901385 tgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 12255454 - 12255625
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaa-ctttgggagtt 136  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12255454 ttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagtt 12255553  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12255554 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatg-cttgtttagg 12255625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 12756359 - 12756550
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| | || |||    
T  12756359 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatta-ttt 12756457  T
Q  117 aagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  12756458 aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca-aaagccttgtttagg 12756550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495406
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 2279781 - 2279952
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaactttgggagtt 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  2279781 ttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgtaatagtttaagaatggatttttgggtgtt 2279880  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  2279881 acacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaatg-cttgtttagg 2279952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 319 - 493
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280238
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Original strand, 20220039 - 20220290
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  ||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||  ||||| | ||||||    
T  20220039 tcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttag-atgatttgatgttg 20220137  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
    ||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  20220138 ttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 20220234  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
       ||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20220235 atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 2831948 - 2832176
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||| | ||    
T  2831948 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagactt 2832047  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
      |||||||||||||| || |   | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||    
T  2832048 --agaatgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgtcttgtttaggttaaa 2832144  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    || ||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  2832145 tgtgatccttgtcgcacgagttgttatgagtt 2832176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 11995696 - 11995768
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11995696 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 9751192 - 9751421
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | || ||||||||| || ||  |    
T  9751192 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgaggttgaacctggaa-agact 9751290  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || ||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9751291 tagaatgaaactttggagaatttga-ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagcgcttgtgttacagaatgccttgtttagtttaaa 9751389  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  9751390 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 9751421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 468
Target Start/End: Original strand, 12255789 - 12255886
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12255789 tttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12255886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 17061602 - 17061765
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatag-tt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  17061602 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg-gatagatt 17061700  T
Q  116 taagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||  ||||||| || |   |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17061701 ttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 17061765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 27847482 - 27847554
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27847482 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaga 27847554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 40443860 - 40443788
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40443860 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 40443788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 481
Target Start/End: Original strand, 1867924 - 1868101
Alignment:
Q  306 ttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattg 404  Q
    |||| ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  1867924 ttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattg 1868022  T
Q  405 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1868023 ttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 467  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  468 ttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647344
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13647387 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 16385895 - 16385968
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16385895 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 16385968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38227959 - 38227796
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  38227959 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatt 38227861  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||   ||| ||| |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  38227860 tagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 38227796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  408 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  408 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430713
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18430771 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216861
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27216919 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 10508709 - 10508768
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508709 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 10508768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15113248 - 15113028
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgtta 289  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||     
T  15113248 acaggatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattg 15113150  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||  | |||||  |  |||||  ||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||   ||||||||||| |||    
T  15113149 tttcagtaagactg-atttatatgagttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatga 15113051  T
Q  389 attgcattcgatattgttatatc 411  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  15113050 cttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456322
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  456380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9509668 - 9509600
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9509668 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 9509600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9703759 - 9703703
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703759 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393448
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11393390 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972497
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11972555 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12699311 - 12699243
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12699311 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12699243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949283
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14949225 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15116835 - 15116565
Alignment:
Q  141 ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatg 240  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||||| |||||||||| ||   || |||||||||||||||    
T  15116835 ctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatg 15116737  T
Q  241 tgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 339  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||  | ||||| ||  |||||  ||||    
T  15116736 tgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactg-atgtatatgagttgatgttatttataatgtgatat 15116638  T
Q  340 aattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||| | |||   ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15116637 aattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 15143686 - 15143842
Alignment:
Q  24 ttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||| ||   ||| ||||||    
T  15143686 ttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg 15143785  T
Q  124 aac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    ||| |||| || |   ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15143786 aacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 15143842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376874
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15376816 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232521
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16232579 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17137690 - 17137746
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17137690 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17137746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640273
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18640331 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385284
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20385226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189756
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21189698 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702239
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24702297 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125492
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32125550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522918
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41522976 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525380
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41525438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062076
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg-ctg 17062017  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17062018 agttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  469 tggtctaagttg 480  Q
     |||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44116983 - 44116821
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||| | || || ||    
T  44116983 ttttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccggaa-agatt 44116885  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44116884 tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 44116821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11880745 - 11880668
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  11880745 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486847
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 3564006 - 3564074
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3564006 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 3564074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 478
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063921
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||     
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  470 ggtctaagt 478  Q
     ||||||||    
T  10063913 agtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12187506 - 12187450
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12187506 atgttgaattctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 12187450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 12321369 - 12321425
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12321369 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcct 12321425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410060
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16410118 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704689
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||| |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24704746 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 39267288 - 39267517
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  39267288 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 39267386  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  39267387 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 39267485  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    || |||  || |||||||||||| | ||||||    
T  39267486 tgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 39267517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24054950 - 24054897
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24054950 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 24054897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14430371 - 14430315
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14430371 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 14430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 493
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144154
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15211921 - 15211865
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15211921 atgttgaattctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15211865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18302657 - 18302454
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  18302657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 18302559  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||| ||||||||    |    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18302558 tagaatgaaactttggataatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccatgtttaggttaaat 18302459  T
Q  216 gcgat 220  Q
    |||||    
T  18302458 gcgat 18302454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116510
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 44116569  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44116568 gtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| |||| | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 18154479 - 18154522
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154479 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 19649127 - 19649170
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19649127 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2760620 - 2760542
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  2760620 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 2760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3272280 - 3272202
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  3272280 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 3272202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 473
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga-- 415  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    || |||  |||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 21064814 - 21064964
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||   ||| | ||||||||| || |||||| | ||||| ||     
T  21064814 tgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttagaatgagattgaacttggaatagtgtcagaatggat 21064913  T
Q  126 ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcg 176  Q
     |||| | |||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21064914 ttttgagtgttttaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21064964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26212469 - 26212411
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaat 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  26212469 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaat 26212411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Original strand, 15008263 - 15008332
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15008263 cctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttgtagaataccttgtttagg 15008332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3386491 - 3386334
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3386491 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3386393  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3386392 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  476 agttg 480  Q
    |||||    
T  10589059 agttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  381 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 479  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  480 gatgatgatgatg 492  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529725
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgacaaagtttaaaaatg 2529725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15581160 - 15581108
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15581160 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13869394 - 13869347
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13869394 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20110604 - 20110557
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20110604 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 492
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8917879 - 8917842
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8917879 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 8917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13462214 - 13462177
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13462214 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11313116 - 11313064
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11313116 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12318595 - 12318543
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12318595 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagt 12318543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13635107 - 13635159
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13635107 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045213
Alignment:
Q  39 tagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 14045213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355243
Alignment:
Q  39 tagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 14355243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15604962
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26292863 - 26292811
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26292863 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26292811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 42205566 - 42205530
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42205566 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 42205530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13831421 - 13831374
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  13831421 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 13831374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14045102 - 14045035
Alignment:
Q  142 tgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||| |||| | ||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14045102 tgaactcgccatagcgagtagagtggctcgcctcgcgagctgcccagtttcagaataccttgtttagg 14045035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14355132 - 14355065
Alignment:
Q  142 tgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||| |||| | ||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14355132 tgaactcgccatagcgagtagagtggctcgcctcgcgagctgcccagtttcagaataccttgtttagg 14355065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 38898380 - 38898528
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| |    
T  38898380 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg-c 38898478  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38898479 tgtgtcgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 2529866 - 2529924
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  2529866 gttacagaatgccttaattaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 2529924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177294
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 9177294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 17701289 - 17701335
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17701289 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11080
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11043 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18748
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18711 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 6801665 - 6801628
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6801665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 6801628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9593798 - 9593761
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9593798 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9593761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9644761 - 9644724
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9644761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9644724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11987665 - 11987628
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11987665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11987628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13149607 - 13149570
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13149607 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13149570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15728777 - 15728740
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15728777 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15728740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16275944 - 16275907
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16275944 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16275907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16583687 - 16583650
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16583687 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16583650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16724284 - 16724321
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16724284 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35152058 - 35152021
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35152058 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 48593109 - 48593146
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48593109 tttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagt 48593146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867718
Alignment:
Q  39 tagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 1867718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 9445808 - 9445848
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9445808 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagt 9445848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  375 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26212351 - 26212311
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26212351 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 26212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19750 - 19267
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||     
T  19750 tgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacctggaaa 19651  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
      ||| |||||||| |||   | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  19650 gattttagaatgaatttttatgtgttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgcttatgt 19551  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19550 taaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaa 19451  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttata 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19450 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttata 19351  T
Q  410 tcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19350 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 48103 - 48151
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48103 ttttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgt 48151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 163)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15471403 - 15470927
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15471403 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagttt 15471304  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15471303 aagaacgaattttgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatg 15471204  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || |||||||||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15471203 cgatctttgtcgcacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgat 15471105  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15471104 ctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 15471006  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15471005 atgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16097809 - 16097331
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||   |||    
T  16097809 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacctgaaaagattt 16097710  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  16097709 tagaatgaatttttgtgaattggacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgtcttgtttatgttaaat 16097610  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||    
T  16097609 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatga 16097511  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16097510 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14234969 - 14234491
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||     
T  14234969 ttttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacccgaaatagtt- 14234871  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234870 aagaatgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 14234771  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttat--ttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    | |||  || ||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  | |    
T  14234770 gtgatctttgtcgaacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaatt-gttt 14234672  T
Q  313 gatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14234671 aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 14234572  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||    
T  14234571 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16104259 - 16103783
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||  || | ||    
T  16104259 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctgggaagactt 16104160  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga--actgcccagttacagaatgccttgtttaggttaa 213  Q
    || || |||| |||| || ||| | | ||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||    |||||||| |||||||||||||||||    
T  16104159 ta-gattgaattttgtgaattgaatccgaactcgtcgtggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtactggt--gttacagactgccttgtttaggttaa 16104063  T
Q  214 atgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||  ||||    
T  16104062 atgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagact-aatccatat 16103964  T
Q  313 gatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16103963 gaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatc 16103865  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16103864 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 32308147 - 32307684
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || | ||    
T  32308147 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagactt 32308048  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||||||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32308047 ta-gaatgaattttgggaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaat 32307949  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||| |||| |   |||||    
T  32307948 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactga-tgcttatga 32307850  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
      ||||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32307849 attaatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatg 32307759  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32307758 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 49667726 - 49668194
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||   |||    
T  49667726 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttt-gagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattt 49667824  T
Q  117 aagaatgaact-ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| | ||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49667825 tagaatgaaatattgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaat 49667924  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||||||    
T  49667925 acgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga-tgcatatga 49668023  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataat--tgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg-ttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
          |||| ||||    |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49668024 ------gttgatgtt----gtatataatgctgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgtttgttg-attgcattcgatattgttatatc 49668112  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49668113 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Original strand, 1465046 - 1465423
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  1465046 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaat 1465145  T
Q  112 agtttaagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    | |||||||| ||| || || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1465146 aatttaagaacgaatttgtgtgagttgcacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggt 1465245  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||| |  ||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||| ||||||||||| |||      
T  1465246 taaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggatt-g 1465344  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    | |  |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1465345 tttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 1644325 - 1644787
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| || | ||    
T  1644325 ttttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgagaagactt 1644424  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  1644425 ta-gaatgaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacaaactgccttgtttaagttaaat 1644523  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||    
T  1644524 gcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatga 1644622  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
      | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  1644623 attgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatg 1644713  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1644714 atgatttgcatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9513387 - 9512923
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||   ||| |    
T  9513387 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagatttta 9513288  T
Q  119 gaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||||| |||  | ||  |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9513287 gaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgagattacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatg 9513188  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||     
T  9513187 cgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaa 9513089  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
     | ||||||||  |||||        || ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9513088 ttgatgttgtttataatg--------ttttatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatga 9513001  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9513000 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Original strand, 13209966 - 13210444
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| || |    
T  13209966 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa-a 13210063  T
Q  113 gtttaagaatgaa--ct-ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |  | ||||||||  || ||| || |   ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||    
T  13210064 gacttagaatgaaaactcttgagaatgtgacc-gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttagg 13210162  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||   ||| ||||||| |||| |      
T  13210163 ttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctga-tgc 13210261  T
Q  309 atatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtt 406  Q
    ||||||  | ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||    
T  13210262 atatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattatt 13210358  T
Q  407 atatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13210359 atatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9521362 - 9520898
Alignment:
Q  19 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||   ||| |    
T  9521362 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagatttta 9521263  T
Q  119 gaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||||| |||  | ||  |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9521262 gaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgagattacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatg 9521163  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||||| |||| |  ||||||     
T  9521162 cgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaa 9521064  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
     | ||||||||  |||||        |  ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9521063 ttgatgttgtttataatg--------tgttatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatga 9520976  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9520975 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 387
Target Start/End: Original strand, 49389286 - 49389642
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||    
T  49389286 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactt 49389385  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||               ||| | |||||||||||||||||    
T  49389386 ta-gaatgaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc---------------agactaccttgtttaggttaaat 49389469  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||    
T  49389470 gcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg-atgcatatga 49389568  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttg 387  Q
      | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389569 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 277 - 493
Target Start/End: Original strand, 12174164 - 12174377
Alignment:
Q  277 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatattt 375  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12174164 cttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt 12174262  T
Q  376 gagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12174263 gagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12174359  T
Q  476 agttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12174360 agttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37251270
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||   || ||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttg-ttaggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgat 37251030  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| ||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||    
T  37251031 gtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgata 37251129  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||    
T  37251130 taaatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatg 37251228  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37251229 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Original strand, 12933952 - 12934221
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||   |||    
T  12933952 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattt 12934051  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||| || |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||        |||||||| | |||||||||||||||||    
T  12934052 tagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtacttgtgttacagacttccttgtttaggttaaat 12934151  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgt 284  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12934152 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgt 12934221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 2050838 - 2051033
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||    
T  2050838 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc--gaat 2050935  T
Q  112 agtttaagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2050936 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacaaaatg-cttgtttagg 2051033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 324702 - 324485
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aatagtttaagaatgaact 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  324702 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac-tgagaatagtttaagaatgaatt 324604  T
Q  128 tt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttct 226  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||   || |    
T  324603 tttgggagttgcacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgt 324505  T
Q  227 cgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    || || ||||||||||||||    
T  324504 cgtacaagttgatgtgagtt 324485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 12171759 - 12171992
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||             |||||||| | | | ||    
T  12171759 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagat-------------tgaacctggagagactt 12171845  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171846 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaa 12171944  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttaga 262  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12171945 tgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 53070341 - 53070532
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| | || ||     
T  53070341 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt- 53070439  T
Q  117 aagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||||||  || || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53070440 aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 53070532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 17247928 - 17248119
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  17247928 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 17248027  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttag 208  Q
     |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||    
T  17248028 tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttag 17248119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 415  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  416 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165251
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 27165274  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  27165273 ggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110454
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||  ||||||| ||||| |||| ||   || |||||||| |||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgtt-aggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgat 22110214  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| ||| |    || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  |||||  |||    
T  22110215 gtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttgaagttgttaataatgtgata 22110313  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||| | | ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||    
T  22110314 taaatgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 22110412  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110413 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 52523390 - 52523561
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaactttgggagtt 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || || | |||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  52523390 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaacagtttaagaatggatttttgggagtt 52523489  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52523490 acacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccagttacagaatg-cttgtttagg 52523561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42386890 - 42386698
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||    ||| |  |||||||||||||||||||     
T  42386890 ttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtt- 42386792  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42386791 aagaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 42386698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301668
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgt-tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  53301645 cggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14573068 - 14572904
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || ||      
T  14573068 tttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agac 14572970  T
Q  116 taagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | ||||||||  |||||| | |   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14572969 ttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 14572904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340826
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    | | |||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14179805 - 14179733
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14179805 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 14179733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274705
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||     
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 23274714  T
Q  470 ggtctaagt 478  Q
     ||||||||    
T  23274713 agtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14972980 - 14972858
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972980 atatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14973333 - 14973172
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| |||| ||||   |||    
T  14973333 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaaccagaaaagattt 14973234  T
Q  117 aagaatgaactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgc 177  Q
     |||| ||||||| ||| ||   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14973233 tagaaagaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 14973172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  469 tggtctaagt 478  Q
     |||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 432  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  470 ggtctaagttgat 482  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12399679 - 12399608
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12399679 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 12399608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 493
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576950
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatgt 14576950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 25476027 - 25476190
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||| | |||| ||||||| ||   |||    
T  25476027 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagatcgaacctggaaagattt 25476126  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||| ||| |   |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25476127 tagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcga 25476190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 40213363 - 40213526
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| ||   ||     
T  40213363 ttttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 40213462  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  40213463 tagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 40213526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  398 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12340231 - 12340002
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  12340231 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 12340133  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||| ||||||||    |  | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12340132 tagaatgaaactttggagaatctaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacataatgccttgtttaggttaaat 12340033  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    | |||  || |||||||||||| || |||||    
T  12340032 gtgatctttgtcgcacgagttgttgagagtt 12340002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 11424405 - 11424568
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  11424405 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctggaa-agatt 11424503  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||   ||| | | |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11424504 tagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 11424568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 20698084 - 20698157
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20698084 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 20698157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642368
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 321641 - 321697
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321641 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781508
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7781450 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11298156 - 11298212
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11298156 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11298212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12173277 - 12173221
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173277 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12173221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 17247162 - 17247230
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17247162 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaaga 17247230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463179
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17463237 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672627
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17672686  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17672685 atgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18439013 - 18438945
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18439013 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 18438945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159327
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34159385 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607068
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45607010 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476492
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  55476550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14666084 - 14665855
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  14666084 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 14665986  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  14665985 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 14665887  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  14665886 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 14665855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14735597 - 14735368
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  14735597 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 14735499  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  14735498 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 14735400  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  14735399 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 14735368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282971
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 491  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16282914 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962042
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194694
Alignment:
Q  427 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848772
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28848717 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 856627 - 856571
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  856627 atgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 856571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588525
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 4588525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899095
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  8899153 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707768
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 9707709  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9707710 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12496746 - 12496690
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12496746 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 12496690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 14878132 - 14878188
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14878132 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcct 14878188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15060783 - 15060727
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15060783 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15060727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454442
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16454384 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17524801 - 17524857
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17524801 atgtagaattcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18383544 - 18383600
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18383544 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18383600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23077105 - 23077161
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23077105 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgcct 23077161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26687366 - 26687298
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26687366 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaaga 26687298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606441
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  472 tctaagttg-atgatgatg 489  Q
    | |||| || |||||||||    
T  606423 tataagatgaatgatgatg 606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469295
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14669239 - 14669010
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  14669239 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 14669141  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  14669140 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 14669042  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    | ||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  14669041 ttcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 14669010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  469 tggtctaagttgatga 484  Q
     ||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 323080 - 323026
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 55  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  323080 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567571
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 12567620  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544036
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 13544085  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  379 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  478 ttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151952
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13151893 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154417
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13154358 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 14576475 - 14576638
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | | |||||||||| || ||  |    
T  14576475 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa-agact 14576573  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||  |||||| | |   |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14576574 tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 14576638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43927404 - 43927304
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  43927404 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttg 43927306  T
Q  325 tt 326  Q
    ||    
T  43927305 tt 43927304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53070756 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247884
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10247826 gtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15052007 - 15051951
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15052007 atgttgaattctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15051951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446815
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  17446758 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17499818 - 17499750
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17499818 ttttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 17499750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 26190636 - 26190692
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26190636 atgttgaattatgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 26190692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 43842657 - 43842589
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  43842657 ttttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaaga 43842589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877514
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 15877514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17488335 - 17488268
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17488335 tttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 17488268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30030306 - 30030239
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  30030306 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaaga 30030239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16369899 - 16369845
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 55  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16369899 atgttgaattctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242833
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 50242882  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50242881 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 466
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147616
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 466  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 434
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 415  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  416 -tgatttgcatactgtctat 434  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17674202 - 17674258
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17674202 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Original strand, 3402598 - 3402649
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3402598 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16809868 - 16809800
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||||    
T  16809868 gtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaaca----taataatgattaggaaaga 16809800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 22109929 - 22109980
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22109929 agttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 22109980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 23052704 - 23052762
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 59  Q
    |||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23052704 atgttgaattttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 41124045 - 41123892
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41124045 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41123947  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 491  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  41123946 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 1982460 - 1982500
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982460 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1982500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389640
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3389640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 12852006 - 12852074
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12852006 ttttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 12852074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 23083003 - 23083067
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||    
T  23083003 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattagga 23083067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8499566 - 8499519
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8499566 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556986
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501615
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15412477 - 15412430
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15412477 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275157
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 23275157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577999
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 605945 - 606039
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||  |   ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  605945 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaaaagtttaaaaatg 606039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 3834127 - 3834090
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3834127 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 3834090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 4588602 - 4588659
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||||    
T  4588602 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagtt 4588659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 326802 - 326854
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  326802 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 326854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 11594789 - 11594829
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11594789 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11594829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11852062 - 11852006
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11852062 atgttgaatttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 492
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119886
Alignment:
Q  385 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatg 483  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  484 atgatgatg 492  Q
    | |||||||    
T  12119878 aagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15483130 - 15483078
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15483130 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15483078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 15849723 - 15849775
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15849723 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15849775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16690675 - 16690635
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16690675 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16697248 - 16697208
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16697248 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16697208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 19725539 - 19725595
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  19725539 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgcct 19725595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20461138 - 20461190
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20461138 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 31097192 - 31097244
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31097192 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 31097244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 316659 - 316612
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  316659 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 316612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 12037596 - 12037639
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12037596 ttttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 12037639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 23412827 - 23412878
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  23412827 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattagg 23412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44494857 - 44494810
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  44494857 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45797710 - 45797659
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45797710 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Original strand, 11557037 - 11557075
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11557037 attttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 43927643 - 43927597
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43927643 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattag 43927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 1598133 - 1598170
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1598133 tttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagt 1598170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 7792999 - 7793036
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7792999 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 12852178 - 12852235
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| | ||||||    
T  12852178 ttacagaatgccatgtttaggttaaatgcgatccttgtagtacgagttgttatgagtt 12852235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 13442724 - 13442687
Alignment:
Q  46 ttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13442724 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 13442687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 15941557 - 15941594
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15941557 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15941594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16797707 - 16797744
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16797707 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 17242425 - 17242388
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17242425 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17242388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38814837 - 38814800
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38814837 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38814800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13919393 - 13919350
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13919393 ctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 23083128 - 23083168
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaa 180  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23083128 ccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaa 23083168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 135)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 38854893 - 38855368
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  38854893 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacctggaatagttt 38854992  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  38854993 aagaacgaattttgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgccttgcttaggttaaaca 38855092  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  38855093 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataat 38855191  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38855192 ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 38855291  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38855292 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21674184 - 21673707
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  21674184 ttttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 21674085  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21674084 tagaatgaatatttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaatgccttgtttaggataaat 21673985  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    |||||  || |||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673984 gcgatctttgtcgcacaagttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgat 21673885  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21673884 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattatattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 21673785  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21673784 tgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 23760482 - 23760962
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23760482 ttttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaatagttt 23760581  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23760582 aagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccaaggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttg-ttaggataaat 23760680  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt----atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaata 311  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||     | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23760681 gcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaata 23760780  T
Q  312 tgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23760781 tgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatc 23760880  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23760881 atgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6520847 - 6520372
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6520847 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagattaagactgaacctgaaatagttt 6520748  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||||| | ||| | |||||  ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6520747 aagaatggatttttgagagttagacctgaattcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaaactgcccaattacagaatgctttgtt-aggttaaat 6520649  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || | ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  6520648 gcgatctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataa 6520550  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6520549 tctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 6520450  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6520449 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 26355340 - 26355816
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  26355340 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacctggaaagactt 26355439  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | || ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355440 ta-gaatgaatttttgtgaattgtacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaatgccttgtttatgttaaa 26355538  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| || ||  |||||| ||| ||  |||||    
T  26355539 tgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactg-atgcatatg 26355637  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    |  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26355638 aattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgttgttg-attgcattcgatattgttatatcgt 26355736  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26355737 gatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 109 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21285985 - 21285611
Alignment:
Q  109 aatagtttaagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgttta 207  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |    
T  21285985 aatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttgtt-a 21285887  T
Q  208 ggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaat 306  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21285886 ggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaat 21285787  T
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21285786 ta-tataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 21285688  T
Q  406 tatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21285687 tatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Original strand, 5865915 - 5866391
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| |    
T  5865915 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-a 5866013  T
Q  113 gtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |  | ||||||||  ||  |||   |  ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||||    
T  5866014 gacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggt 5866111  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    | ||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |       
T  5866112 tgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgct 5866210  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 408  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  5866211 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattat 5866307  T
Q  409 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  5866308 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17141397 - 17140920
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||     
T  17141397 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa- 17141299  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgggagttgcac-ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    ||  | ||||||||  ||  |||   ||  | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||| ||||| |||||||    
T  17141298 agacttagaatgaaaatttagagaatcagaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttaggt 17141200  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    | ||||||||  || ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |       
T  17141199 tgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgct 17141101  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 408  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  17141100 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattat 17141004  T
Q  409 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  17141003 gtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21491476 - 21490999
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaa 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||    
T  21491476 tgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaa 21491377  T
Q  111 tagtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttag 208  Q
     | ||  ||||||||  ||  |||   |  |||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |      ||||||||||||||| |||||    
T  21491376 gactt--agaatgaaaatttagagaatctgacca-aacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttag 21491281  T
Q  209 gttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatt 307  Q
    ||| ||||||||  || | |  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |     
T  21491280 gttgaatgcgatctttgtagttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tg 21491182  T
Q  308 aatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtt 406  Q
      |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||| ||||| ||    
T  21491181 cctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcaatattatt 21491085  T
Q  407 atatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21491084 atatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39834316 - 39834107
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  39834316 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 39834217  T
Q  112 agtttaagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  39834216 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaataccttgtttaagt 39834117  T
Q  211 taaatgcgat 220  Q
    ||||||||||    
T  39834116 taaatgcgat 39834107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21249862 - 21249388
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | ||| |||||||| || ||     
T  21249862 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaa-aga 21249764  T
Q  115 ttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtta 212  Q
     |  |||||||  || ||||   |  ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||||||    
T  21249763 cttggaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggtta 21249666  T
Q  213 aatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    ||||||||  || |||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  | | ||| |||| |||| |   |||    
T  21249665 aatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccctgctgttaatgtctcactaagactga-tgcttat 21249567  T
Q  313 gatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  21249566 gaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatc 21249470  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21249469 atgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21255700 - 21255226
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||     
T  21255700 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-aga 21255602  T
Q  115 ttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtta 212  Q
     |  |||||||  || ||||   |  ||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |       |||||||||||||| |||||||||    
T  21255601 cttggaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagcatttgtattacagaatgcctt-tttaggtta 21255504  T
Q  213 aatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    ||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  | | ||| |||| |||| |   |||    
T  21255503 aatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccctgctgttaatgtctcactaagactga-tgcttat 21255405  T
Q  313 gatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  21255404 gaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatc 21255308  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21255307 atgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 481
Target Start/End: Original strand, 983252 - 983512
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt----atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatg 321  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  983252 tcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaatta-tatgattgaatg 983350  T
Q  322 ttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tga 418  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |      
T  983351 ttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttg 983449  T
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 37116616 - 37116366
Alignment:
Q  230 acgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgt 328  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||      
T  37116616 acgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaa 37116518  T
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 425  Q
    |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 37116418  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37116417 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 229 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20498831 - 20498581
Alignment:
Q  229 cacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| ||||  || |||||| | ||||||||     
T  20498831 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttt 20498733  T
Q  328 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||    
T  20498732 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacat 20498633  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20498632 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 17266821 - 17267096
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||   |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17266821 ttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctg 17266920  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17266921 aatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 17267019  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17267020 tgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 19801069 - 19801232
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19801069 ttttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacctggaatagttt 19801168  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19801169 aagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcga 19801232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24353295 - 24353039
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatt---tcagtaagcctgaattaatatgatctaatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |   | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24353295 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatg 24353197  T
Q  322 ttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tga 418  Q
    |||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  24353196 ttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgt 24353098  T
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24353097 tttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41598663 - 41598471
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  41598663 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 41598564  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||    
T  41598563 tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttagg 41598471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Original strand, 13508009 - 13508188
Alignment:
Q  301 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 398  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13508009 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 13508108  T
Q  399 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13508109 atattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Original strand, 13597541 - 13597720
Alignment:
Q  301 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 398  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||    
T  13597541 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcg 13597640  T
Q  399 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13597641 atattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 25362777 - 25362861
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  25362777 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaaga 25362861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 477
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439609
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  406 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  17439536 tatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 478
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612213
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    ||||| || | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22364954 - 22364744
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||   |   | | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22364954 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 22364855  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | || |||||    
T  22364854 aatt-atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatat 22364757  T
Q  403 tgttatatcatga 415  Q
    |||||||||||||    
T  22364756 tgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649161
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 45130669 - 45130741
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45130669 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 45130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19899587 - 19899510
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  19899587 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484403
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1484461 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853453
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5853395 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7373228 - 7373160
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7373228 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 7373160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409605
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 14409546  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14409547 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16185220 - 16185164
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185220 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcct 16185164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 18878879 - 18878947
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18878879 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 18878947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046356
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20046298 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403228
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20403286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 20465666 - 20465722
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20465666 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20536687 - 20536523
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| ||   ||     
T  20536687 ttttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 20536588  T
Q  117 aagaatg-aactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| ||||| ||||| |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20536587 tagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 20536523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001754
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22001812 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22627214 - 22627146
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22627214 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 22627146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23406860 - 23406792
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23406860 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23406792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30642918 - 30642974
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30642918 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 30642974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 31971724 - 31971656
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaag 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31971724 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 31971656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 16091983 - 16092142
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||||||   |||    
T  16091983 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacctgaaaagattt 16092082  T
Q  117 aagaatgaactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctc 175  Q
    || ||  |||||| ||| ||   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  16092083 aaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 16092142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||| | ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 17353564 - 17353623
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17353564 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaa 17353623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759262
Alignment:
Q  383 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  482 tgatgatgatg 492  Q
    ||| |||||||    
T  6759272 tgaagatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6759736 - 6759572
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||| | |||||| ||    
T  6759736 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaaata-tt 6759638  T
Q  116 taagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | ||||||||   ||||| | |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  6759637 ttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 6759572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 18818052 - 18818118
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18818052 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 18818118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 21161744 - 21161798
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21161744 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcct 21161798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 21168350 - 21168404
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21168350 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcct 21168404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 21923570 - 21923734
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||  | ||||||||||||||| || ||    
T  21923570 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtaggatgagattgaacctgaaa-agatt 21923668  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagt-tgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||   ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21923669 tagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcga 21923734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 22010306 - 22010384
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  22010306 atgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406383
Alignment:
Q  383 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  482 tgatgatgatg 492  Q
    ||| |||||||    
T  23406393 tgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23649033 - 23648964
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23649033 tttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23648964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23776460 - 23776517
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacc-ttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23776460 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcct 23776517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 377770 - 377714
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  377770 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 377714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15602644 - 15602700
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15602644 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15602700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15611096 - 15611152
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15611096 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15611152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 16199296 - 16199368
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  16199296 gtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaaga 16199368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 21918652 - 21918720
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21918652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaaga 21918720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 28648686 - 28648754
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  28648686 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 28648754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16411896 - 16411963
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgta 68  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  16411896 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgta 16411963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20499144 - 20499033
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| |     
T  20499144 tgtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctgagaa 20499045  T
Q  112 agtttaagaatg 123  Q
    ||||||| ||||    
T  20499044 agtttaaaaatg 20499033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413467
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 16413418  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24756206 - 24756157
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756206 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 24756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483282
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4483339 gtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203392
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  15203334 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598189
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 41598248  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41598247 gtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 21389091 - 21389138
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21389091 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 21389138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22875544 - 22875381
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||| ||||||||||||||| | |||   || ||||||||| ||   |||    
T  22875544 ttttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtagaacgaggttgaacctggaaagattt 22875445  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  22875444 tagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcga 22875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 4542377 - 4542534
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||  ||| |    
T  4542377 atataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-t 4542475  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4542476 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16409882 - 16409938
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16409882 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16409938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16860964 - 16861020
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16860964 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16861020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19983587 - 19983508
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  19983587 atgtagaattctgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 477
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  337 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 434  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19801486 gttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19976922 - 19976860
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  19976922 ttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19976860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21286688 - 21286648
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21286688 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtgtaa 21286648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22029025 - 22028973
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22029025 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 21414869 - 21414956
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaac 104  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  21414869 tttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484429
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 415
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  368 tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 982980 - 983074
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||| |   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  982980 agttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatg 983074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507713
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597245
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 477
Target Start/End: Original strand, 19154816 - 19154989
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |  ||| ||| || ||||||||| | ||| | |||||| |    
T  19154816 taatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattat 19154915  T
Q  406 tatatcatgat--gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||  |||  | |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19154916 tatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395668
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 21395668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790161
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 21790161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Original strand, 17266574 - 17266647
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||    
T  17266574 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18619931 - 18619894
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18619931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18619894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 482
Target Start/End: Original strand, 45290809 - 45290846
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290809 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14823931 - 14823775
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  14823931 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14823833  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  14823832 gtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatg 14823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 19259229 - 19259284
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19259229 atgttgaattcttgaattttgacttttgagttgaaccttagatg-ctttgagtgcct 19259284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 20856068 - 20856108
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20856068 ttttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20856108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22057816 - 22057768
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgttttt 49  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22057816 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 23252400 - 23252452
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23252400 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15070606 - 15070571
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15070606 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926390
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17926390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 19937120 - 19937167
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  19937120 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 19937167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116812
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctga 37116812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15532341 - 15532304
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15532341 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15538901 - 15538864
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15538901 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15538864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 22113381 - 22113418
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22113381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22113418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 22134884 - 22134921
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22134884 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22134921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 22166034 - 22166071
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22166034 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22166071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23834626 - 23834589
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23834626 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23834589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 24433890 - 24433927
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24433890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 30308407 - 30308444
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30308407 tttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 30308444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 32599131 - 32599094
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32599131 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 32605663 - 32605626
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32605663 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 39094594 - 39094631
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39094594 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 39094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 16231113 - 16231165
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16231113 atgtcgaattctgagttttcgacttttgatttgaaccttagatgtctttgagt 16231165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 420  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 21918766 - 21918806
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21918766 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 21918806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22045326 - 22045274
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22045326 atgtcgaattctgagtttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22045274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23406736 - 23406696
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23406736 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 23406696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 23844567 - 23844595
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844567 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 23844595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 2286 - 2763
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||     
T  2286 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggattagtt- 2384  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| | |||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2385 aagaacgtacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggataaat 2484  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2485 gcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatga 2584  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2585 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatg 2684  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2685 atgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 39705930 - 39706405
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39705930 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacctggaatagttt 39706029  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39706030 aagaacgaattttgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatg 39706129  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  39706130 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaatt-atatgat 39706228  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39706229 ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatga 39706328  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39706329 tgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12774477 - 12774010
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | | |  |    
T  12774477 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacctggagagacgt 12774378  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12774377 ta-gaatgaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaat 12774279  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||    
T  12774278 gcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatga 12774180  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
      | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12774179 attgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatg 12774089  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774088 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15099834 - 15099457
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  15099834 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 15099735  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  15099734 agtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgtcttgtttaggt 15099635  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||      
T  15099634 taaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-g 15099536  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099535 tatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8846854 - 8846359
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  8846854 ttttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 8846755  T
Q  117 aagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8846754 tagaatgaattttttgtgagttgcaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttatgttaaa 8846655  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||| ||| ||  |||||    
T  8846654 tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactg-atgcatatg 8846556  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaatt----------------gcatt 396  Q
    |  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||                |||||    
T  8846555 aattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcatt 8846456  T
Q  397 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8846455 cgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190424
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttta 117  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaatagttta 15190696  T
Q  118 agaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
    |||||| | ||| ||| ||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15190695 agaatggatttttgggcgttacatctgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaag 15190596  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |    
T  15190595 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-gtatatt 15190497  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190496 ctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 481
Target Start/End: Original strand, 12288066 - 12288316
Alignment:
Q  233 agttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  12288066 agttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttggtaa 12288164  T
Q  332 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatact 428  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  12288165 tgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatact 12288263  T
Q  429 gtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12288264 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15552296 - 15551821
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||| ||||| || |    
T  15552296 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa-a 15552198  T
Q  113 gtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |  | ||||| ||  || ||||   |  ||| |||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||| |      |||||| |||| ||| |||||||    
T  15552197 gacttagaatcaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgagcattggtgttacaaaatgtctt-tttaggt 15552100  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
     |||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  | |  ||||||| |||| |   |    
T  15552099 aaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttaccctgctgttaatgtcccagtaagactga-tgctt 15552001  T
Q  311 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttata 409  Q
    ||||   ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || | ||||||||| |||||    
T  15552000 atgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattata 15551904  T
Q  410 tcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15551903 tcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Original strand, 13700 - 13953
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||||| ||||  |  |||||| | ||||||    
T  13700 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttgatgttg 13798  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 422  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  13799 tttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttg 13898  T
Q  423 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13899 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 15464592 - 15464764
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaacttt-gggagtt 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||    
T  15464592 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgggtgtt 15464691  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15464692 acacctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttagg 15464764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16597133 - 16596686
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  16597133 attctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16597034  T
Q  108 aaatagtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     || ||  | ||||||||  ||  |||   |  ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |      ||||||||||||||| ||    
T  16597033 gaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagtagaggttctcgccccgcgggcgtttgtgttacagaatgcctt-tt 16596937  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctga 304  Q
    |||||| |||| |||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||  |||||| ||||    
T  16596936 taggttgaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactga 16596837  T
Q  305 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
     |   ||| |  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || |||||||||||    
T  16596836 -tgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatatt 16596741  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 458  Q
     ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596740 attatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 481
Target Start/End: Original strand, 43198384 - 43198661
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||  |   ||| || | ||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||| ||     
T  43198384 ttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagact- 43198479  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgata 401  Q
    |||  ||||||  | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  43198480 aatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgata 43198579  T
Q  402 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    | ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198580 tggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 53081979 - 53082254
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatctt-agatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcct 302  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| |||||  |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53081979 ttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 53082078  T
Q  303 gaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgata 401  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  53082079 gaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgata 53082176  T
Q  402 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082177 ttgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 52242856 - 52243027
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaact-ttgggagtt 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  52242856 ttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagtt 52242955  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52242956 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttagg 52243027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13845018 - 13844855
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  13845018 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagatcaagatttaacctggaatagttt 13844919  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13844918 aagaatggatttttgggagttacacctgtacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 13844855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 43198242 - 43198381
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaa-tgaact 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |    
T  43198242 agttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacatggaatagtttaagaattgattt 43198341  T
Q  128 ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggct 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43198342 ttgggagttacacctgaactcaccatagcgagtagaggct 43198381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 477
Target Start/End: Original strand, 46640272 - 46640558
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||     
T  46640272 acagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggg-gtaagaaactaagttgcttatcttactgttattg 46640369  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttga 388  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||  | |||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| ||||    
T  46640370 tttcagtaaacctgaatta-tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatgttattga 46640467  T
Q  389 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
     || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46640468 ttttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243302
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 470  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52243291  T
Q  471 gtctaagttga 481  Q
    |||||||||||    
T  52243292 gtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 44928565 - 44928757
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  44928565 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 44928664  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     |||||| |||||||||| |   ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928665 tagaatgaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttagg 44928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 17047710 - 17047792
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17047710 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaa 17047792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21814945 - 21815136
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    ||| | | | |||||||| | ||  ||    
T  21814945 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggatta-att 21815043  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||  ||||| || || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21815044 aagaatgaactttttggaagctg-acttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 21815136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21815274 - 21815465
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    ||| | | | |||||||| | ||  ||    
T  21815274 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggatta-att 21815372  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||  ||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21815373 aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 21815465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21818367 - 21818558
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    ||| | | | |||||||| | ||  ||    
T  21818367 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggatta-att 21818465  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||  ||||| || || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21818466 aagaatgaactttttggaagctg-acttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 21818558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  474 taagttgatga 484  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24029220 - 24028991
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  24029220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 24029122  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  24029121 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 24029023  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  24029022 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 24028991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattg-ttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 14052951 - 14053023
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  14052951 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaaga 14053023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615289
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44615347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||     
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 492
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  371 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12468
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12410 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3097111 - 3097043
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3097111 ttttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 3097043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13570004 - 13569948
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13570004 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15094265 - 15094209
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15094265 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15094209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118513
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15118455 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15121430 - 15121486
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15121430 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15121486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16356580 - 16356636
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16356580 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16356636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215435
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 18215376  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18215377 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 489
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatg 489  Q
     | ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773248
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44773190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312511
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  52312569 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618323
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| ||    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ct 19618274  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14039128 - 14039039
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  | ||| | |||||||||||    
T  14039128 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatgagattgaacct 14039039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44676124 - 44676047
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  44676124 atgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6190912 - 6190848
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6190912 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattagga 6190848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7089345 - 7089277
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7089345 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 7089277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12570513 - 12570457
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570513 atgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12570457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12903224 - 12903157
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12903224 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12903157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 16239634 - 16239702
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16239634 ttttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 16239702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16348319 - 16348375
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16348319 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23843971 - 23843915
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843971 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 23843915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929041
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44928983 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 50222343 - 50222500
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  50222343 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-t 50222441  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  50222442 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464029
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 51463970  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  51463971 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     || |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgat 491  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 22633855 - 22634084
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  22633855 ttttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 22633953  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||| ||||||||    |     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22633954 tagaatgaaactttggataatcagattgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaat 22634053  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||  || |||||||| ||| | ||||||    
T  22634054 gcgatctttgtcgcacgatttgttatgagtt 22634084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Original strand, 18239426 - 18239580
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  18239426 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 18239524  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18239525 ctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 1837513 - 1837670
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1837513 atataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1837611  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1837612 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242700
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19242758 gtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 44053308 - 44053240
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  44053308 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaaga 44053240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 16377164 - 16377323
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |  | ||  | |||||||||||| |||  |      
T  16377164 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaatgatcg 16377263  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctc 175  Q
     ||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  16377264 tagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 16377323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 13812451 - 13812517
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13812451 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaa 13812517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868367
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 15868367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15091376 - 15091212
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  15091376 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaggattt 15091277  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||   ||||| | |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  15091276 tagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 15091212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046491
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44102688 - 44102627
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  44102688 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgatta 44102627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515008
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | |||||| ||    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ct 3515067  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3515066 gtgttgctgttgttt-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7799176 - 7799112
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7799176 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattagga 7799112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 20156932 - 20157000
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20156932 ttttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 20157000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22636913 - 22636845
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  22636913 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaaga 22636845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803426
Alignment:
Q  381 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 479  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  480 gatgatgatgatg 492  Q
    ||| | |||||||    
T  23803414 gattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13505
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  13410 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355476
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 15355426  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 492
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  379 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  479 tgatgatgatgatg 492  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332144
Alignment:
Q  141 ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttg 237  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcatgagttg 3332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16487705 - 16487761
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  16487705 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcct 16487761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 36133600 - 36133652
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36133600 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36133652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44102372 - 44102215
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  44102372 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 44102274  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44102273 gtgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 15124790 - 15124840
Alignment:
Q  10 tctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15124790 tctgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaa 15124840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851868
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 3413249 - 3413212
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3413249 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 414
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602435
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609029
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 20157104 - 20157161
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  20157104 ttacagagtgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 20157161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2015246 - 2015194
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2015246 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2015194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 11250211 - 11250251
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11250211 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11250251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 16351498 - 16351538
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16351498 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16351538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 17053514 - 17053483
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053514 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 17053483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333305
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgagt 17333305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6190527 - 6190481
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6190527 ctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Original strand, 12287791 - 12287865
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  12287791 gaaccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 12287865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 246
Target Start/End: Original strand, 13812578 - 13812680
Alignment:
Q  144 aactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtga 243  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | |||    
T  13812578 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatga 13812677  T
Q  244 gtt 246  Q
    |||    
T  13812678 gtt 13812680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046727
Alignment:
Q  47 tttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 17046727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 1951414 - 1951451
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1951414 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1951451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 14708287 - 14708324
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14708287 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16243053 - 16243090
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16243053 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16243090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18222031 - 18222068
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18222031 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18222068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18237345 - 18237308
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18237345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18237308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23139723 - 23139686
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23139723 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23139686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 26243318 - 26243355
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26243318 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26243355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27534482 - 27534441
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27534482 tgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27534441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 28569097 - 28569134
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28569097 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 43255813 - 43255850
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43255813 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45938600 - 45938563
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45938600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 45938563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7089232 - 7089192
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7089232 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 7089192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 14053068 - 14053108
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14053068 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcga 14053108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 17047838 - 17047878
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17047838 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17047878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 17152140 - 17152168
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152140 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 17152168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25555972 - 25555932
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25555972 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 25555932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44102566 - 44102526
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44102566 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 44102526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25176321 - 25175853
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25176321 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacctggaatagttt 25176222  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    |||||  ||  |||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           
T  25176221 aagaacagatttttgagagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgccttgtttag------- 25176129  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
       ||  || |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25176128 ---atctttgtcgcacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatga 25176032  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25176031 tctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 25175932  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25175931 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 39 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28405981
Alignment:
Q  39 tagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactttgg-gagttg 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   ||| ||||| || ||| | ||  ||    
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaataaaattttgtgaactg 28406337  T
Q  138 cacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgccca-gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagtt 236  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28406336 aacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc-aagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtt 28406238  T
Q  237 gatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggt 335  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28406237 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggt 28406138  T
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctat 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28406137 atataattgtatatacattttatgaattaagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctat 28406038  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 491  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28406037 gttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 22133859 - 22134323
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || | ||    
T  22133859 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagactt 22133958  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||| ||  || || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22133959 ta-gaatgaattttgtgaactgaac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaat 22134056  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| |  ||||||    
T  22134057 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactga-tgcatatga 22134155  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
      |  |||||||  |||||        |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22134156 attggtgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatg 22134246  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  22134247 atgatttgcatactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 7582 - 7824
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7582 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttg 7680  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 422  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  7681 ttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttg 7780  T
Q  423 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 466  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7781 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23207634 - 23207296
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||   || ||||||||||||||    
T  23207634 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgat 23207536  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| ||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||    
T  23207535 gtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgata 23207437  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgt 436  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||    
T  23207436 taaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgt 23207337  T
Q  437 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23207336 tgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 226 - 481
Target Start/End: Original strand, 18786752 - 18787009
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||     
T  18786752 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatta-tatgattgaatgtta 18786850  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||    
T  18786851 ttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt 18786949  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18786950 gcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 335 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679589
Alignment:
Q  335 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23791567 - 23791292
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23791567 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 23791468  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23791467 aatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 23791369  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    | |||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23791368 ttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 23708261 - 23708452
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  23708261 ttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaagttcgtagattgagattgaatcggaa-tagttt 23708359  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23708360 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttagg 23708452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 492
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072066
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105413
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22105471 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671848
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 434  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 319 - 493
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708738
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 25109181 - 25108906
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || |||||||||||||||| |||| ||| | |   | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25109181 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 25109082  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||   || |||||    
T  25109081 aatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatat 25108983  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||||  |  |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25108982 tgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23660501 - 23660341
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  23660501 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 23660402  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcg 176  Q
     |||||| |||||| ||| |   |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23660401 tagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 23660341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 298457 - 298620
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    ||  | |||||||||||| || || ||    
T  298457 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacctggaa-agatt 298555  T
Q  117 aagaatg-aactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| ||||| ||||| |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  298556 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 298620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 28291940 - 28292012
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  28291940 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaaga 28292012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 45677782 - 45677838
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45677782 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 37765 - 37835
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37765 gtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 37835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24658132 - 24658055
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  24658132 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808944
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18809002 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071698
Alignment:
Q  26 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa 23071698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130863
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23130921 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133330
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23133388 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23286329 - 23286261
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23286329 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23286261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 23654052 - 23654120
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23654052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23654120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709693
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23709635 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712174
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23712116 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402683
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34402625 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682314
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39682372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  398 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||     
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367785
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520295
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 432  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23076919 - 23076731
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||  | |||||| ||||| || || ||    
T  23076919 ttttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa-agatt 23076821  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     |||||| |||||||| | |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||||||||    
T  23076820 tagaatgaaactttggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt 23076731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135591
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23135646 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 40621835 - 40621888
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 54  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621835 atgttgaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 40621888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571398
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  571456 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6725996
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6726054 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20309577 - 20309505
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  20309577 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaaga 20309505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 411
Target Start/End: Original strand, 22459377 - 22459598
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  22459377 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattg 22459475  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttg 387  Q
    |||||||||| ||| ||  ||| ||  | ||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||  ||| |  |||||  ||||||||||||||| ||    
T  22459476 tttcagtaagactg-atgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatg 22459574  T
Q  388 aattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    | || |||| ||| ||||||||||    
T  22459575 actttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 22730875 - 22730943
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22730875 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 22730943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 22737822 - 22737890
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22737822 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaaga 22737890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 25963344 - 25963400
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25963344 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 25963400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26505537 - 26505380
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26505537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26505439  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26505438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26508015 - 26507858
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| ||    
T  26508015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ct 26507917  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26507916 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27754054 - 27753986
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27754054 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaaga 27753986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577100
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28577158 gcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 32451571 - 32451635
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32451571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattagga 32451635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155211
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22337591 - 22337431
Alignment:
Q  20 tgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaag 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || || || ||    
T  22337591 tgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agatttag 22337493  T
Q  120 aatg-aactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||| ||||||  |||||   ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22337492 aatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22337431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24674068 - 24673991
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||| || ||| |||||    
T  24674068 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgccttaagatgtttattgaagatta 24673991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Original strand, 24697536 - 24697645
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24697536 taatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgt 24697635  T
Q  406 tatatcatga 415  Q
    ||||||||||    
T  24697636 tatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898357
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24898298 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900840
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24900781 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903317
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24903258 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905794
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24905735 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908269
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24908210 gtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21917943 - 21917999
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21917943 atgttgaattctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgcct 21917999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 492
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039659
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32039601 gtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 37525156 - 37525100
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37525156 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 37525100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 22798759 - 22798809
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22798759 aattctatacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 22798809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  474 taagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215072
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 32215023  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattg-ttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 477
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcg--atattgttatatcatga 415  Q
    ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  416 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
      || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 22740598 - 22740651
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22740598 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22740651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 22758353 - 22758406
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22758353 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22758406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 45029858 - 45030015
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  45029858 atataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-t 45029956  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45029957 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 43137457 - 43137301
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |  ||    
T  43137457 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatta-ct 43137359  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 491  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  43137358 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22811561 - 22811617
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22811561 atgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgcct 22811617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 23019341 - 23019389
Alignment:
Q  9 ttctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23019341 ttctgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcct 23019389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 482
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 22738249 - 22738296
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004767
Alignment:
Q  342 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   ||||  ||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttg 23004806  T
Q  439 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23004805 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23038511 - 23038468
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23038511 ttttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 23100873 - 23100916
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23100873 ttttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Original strand, 24654989 - 24655032
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24654989 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 24655032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38967422 - 38967375
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38967422 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 20519976 - 20520026
Alignment:
Q  159 gtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20519976 gtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagg 20520026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 24529532 - 24529690
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  24529532 atataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga- 24529630  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24529631 tgtgttgttgttg-ttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27263704 - 27263667
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27263704 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 27263667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44369985
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 21318273 - 21318325
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21318273 atgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21318325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 21327204 - 21327256
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21327204 atgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21327256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24175267 - 24175227
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24175267 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24175227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 24716188 - 24716224
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24716188 gacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcct 24716224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24870347 - 24870307
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24870347 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24870307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 18786445 - 18786556
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| |     
T  18786445 tgtagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacacgtatattattgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaa 18786544  T
Q  112 agtttaagaatg 123  Q
    ||||||| ||||    
T  18786545 agtttaaaaatg 18786556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005221
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 23005221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaag 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 19928155 - 19928192
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19928155 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19928192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Original strand, 22412900 - 22412953
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttaca 193  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22412900 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttaca 22412953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 22460843 - 22460880
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22460843 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22460880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23187528 - 23187491
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23187528 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23187491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23207817 - 23207744
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct 106  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||    
T  23207817 gaactttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23598791 - 23598754
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23598791 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26125656 - 26125619
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26125656 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26125619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 40428929 - 40428892
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40428929 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41667402 - 41667365
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41667402 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 44621415 - 44621358
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  44621415 attctgtgtttttgagttgtgagtttaaccttaggtgtttgtgagggcctgaacatgt 44621358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20309460 - 20309420
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20309460 acctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcga 20309420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24735856 - 24735828
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735856 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 24735828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 11)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 67 - 493
Target Start/End: Original strand, 39864 - 40292
Alignment:
Q  67 taatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagagg 165  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||    
T  39864 taataatggttaggaaagattggagattgacattcaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccatggcaagtagagg 39963  T
Q  166 ctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaac 265  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39964 ctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 40063  T
Q  266 taagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 364  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40064 taagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 40163  T
Q  365 tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40164 tgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcat 40263  T
Q  465 gagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40264 gagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 188 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 100683 - 100377
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 286  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  100683 gttacaaaatgccttgtctaagttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttg 100584  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 386  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100583 ttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttaatatttgagatgttgtt 100484  T
Q  387 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 486  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100483 gatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatg 100384  T
Q  487 atgatgt 493  Q
    |||||||    
T  100383 atgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 101873 - 101602
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||    
T  101873 tttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactt 101774  T
Q  116 taagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    || ||||||| |||| ||  |  |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||        |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  101773 ta-gaatgaattttgtgaacttgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagtacttgtgttatagactgtcttgtttaggttaaat 101675  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgtt 288  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  101674 gtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttctcttgttgttgtt 101602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94412
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  94470 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44455
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtc 431  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||     
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44514 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101502
Alignment:
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  423 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17591
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17542  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17543 gtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 38127 - 38179
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38127 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagt 38179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 39651 - 39696
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaaca 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39651 ttttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaaca 39696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23294 - 23342
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgttttt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23294 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatagatattttt 23342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 127)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 21329137 - 21329614
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||| |||    
T  21329137 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaataattt 21329236  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329237 aggaatgaatttttgggagttgcacttgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgccttgtttaggttaaat 21329336  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  21329337 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataa 21329435  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  21329436 tctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattat 21329535  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21329536 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21566023 - 21565545
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  21566023 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 21565924  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21565923 tagaatgaattttcgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaatgacttgtttatgtaaaat 21565824  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| |||| |  ||||||    
T  21565823 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga-tgcatatga 21565725  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565724 attgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 22959175 - 22959650
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||    
T  22959175 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactt 22959274  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959275 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaa 22959373  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||| |||| |  |||||    
T  22959374 tgcgattcttgttgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactga-tgcatatg 22959472  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |   ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22959473 aatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatca 22959569  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959570 tgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 493
Target Start/End: Original strand, 26011688 - 26012154
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||   | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  26011688 agttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 26011787  T
Q  129 t-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||    
T  26011788 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatctttgtc 26011886  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  26011887 acacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctgatgttgtt 26011985  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  26011986 gttgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcat 26012085  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  26012086 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 138 - 492
Target Start/End: Original strand, 21501918 - 21502273
Alignment:
Q  138 cacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttg 237  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  21501918 cacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttg 21502015  T
Q  238 atgtgagttaatcttagatgttagaaa-ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggt 335  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21502016 atgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtt 21502115  T
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctat 21502215  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21502216 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19669379 - 19668902
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||| | ||    
T  19669379 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgtggaaagactt 19669280  T
Q  116 taagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaa 213  Q
    || ||||||| |||  | || ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | | ||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19669279 ta-gaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgtttaggataa 19669181  T
Q  214 atgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatat 312  Q
    ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||    
T  19669180 atgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatat 19669082  T
Q  313 gatc--taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttata 409  Q
    ||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19669081 gaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttata 19668985  T
Q  410 tcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19668984 tcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Original strand, 21741180 - 21741545
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||| |||    
T  21741180 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaat 21741279  T
Q  112 agtttaagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  21741280 agtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctaaccagttacataatgtcttgtttaggt 21741379  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    |||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||      
T  21741380 taaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaagcctggatt-g 21741478  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 388  Q
    |||  ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741479 tatattctaatgt------------tatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 19660474 - 19660952
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  || | ||||| |||||| ||     
T  19660474 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatgagattaaacctggaa- 19660572  T
Q  112 agtttaagaatgaa--ctttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttag 208  Q
    ||  | ||||||||  |||||| || |   ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||| ||||| |||||    
T  19660573 agacttagaatgaaaactttggagaatctaacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttag 19660670  T
Q  209 gttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatt 307  Q
    ||| ||||| ||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |     
T  19660671 gttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tg 19660769  T
Q  308 aatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtt 406  Q
      |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| ||  |||||||||  ||    
T  19660770 cttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttatattcgatatcatt 19660866  T
Q  407 atatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  19660867 atatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 477
Target Start/End: Original strand, 20026756 - 20027043
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||   || |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  20026756 acagaatgccttgtt-agcttaaatgtgaccgttgtcgcacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttg 20026854  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttga 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  20026855 tttcagtaagcctgaatta-tatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttga 20026952  T
Q  389 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20026953 attgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 5888812 - 5889021
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||    
T  5888812 tgtagttttgacctttaagtcgaagcttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaat 5888911  T
Q  112 agtttaagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5888912 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgtttaggt 5889011  T
Q  211 taaatgcgat 220  Q
    ||||||||||    
T  5889012 taaatgcgat 5889021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22144508 - 22144337
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaactttgggagtt 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  22144508 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagtt 22144409  T
Q  137 gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22144408 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttagg 22144337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 229 - 477
Target Start/End: Original strand, 22178072 - 22178323
Alignment:
Q  229 cacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 327  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||     
T  22178072 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatta-tatgattggatgttgtta 22178170  T
Q  328 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 424  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |    
T  22178171 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttata 22178270  T
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22178271 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144068
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  395 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1096946 - 1096783
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||| ||| ||   ||     
T  1096946 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagattg 1096847  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||| | |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1096846 cagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 1096783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 22119835 - 22120064
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  22119835 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 22119933  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  22119934 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 22120032  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  22120033 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 22120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 11580887 - 11581079
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatag-tt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  11580887 ttttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg-gatagatt 11580985  T
Q  116 taagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    | |||||  ||||||| || |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  11580986 ttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaatg-cttgtttagg 11581079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||     
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 21498659 - 21498764
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||     
T  21498659 ttttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacctggaatagttg 21498758  T
Q  117 aagaat 122  Q
    ||||||    
T  21498759 aagaat 21498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 492
Target Start/End: Original strand, 8286838 - 8286960
Alignment:
Q  371 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8286838 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  8286937 cggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 21292619 - 21292691
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21292619 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaaga 21292691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 36154470 - 36154633
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatag-tt 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  36154470 ttttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctg-gatagatt 36154568  T
Q  116 taagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||  ||||||| || |   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36154569 ttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 36154633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 21871213 - 21871442
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || || ||    
T  21871213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa-agatt 21871311  T
Q  117 a-agaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    |  ||||| || |||| || |   ||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||||| ||  |||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  21871312 atggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg-ctaggttaaa 21871410  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
     ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||    
T  21871411 cgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagtt 21871442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 21875493 - 21875722
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || || ||    
T  21875493 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa-agatt 21875591  T
Q  117 a-agaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    |  ||||| || |||| || |   ||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||||| ||  |||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  21875592 atggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg-ctaggttaaa 21875690  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
     ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||    
T  21875691 cgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagtt 21875722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 21985789 - 21985879
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  21985789 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 21985879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||     
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264929
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  264871 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1096593 - 1096474
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1096593 atatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatg 489  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581360
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11581302 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21887316 - 21887260
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21887316 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21887260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22075487 - 22075419
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22075487 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaaga 22075419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 23390138 - 23390206
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23390138 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23390206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23512599 - 23512543
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23512599 atgttgaattctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 23512543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329935
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29329993 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363385
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39363443 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997651
Alignment:
Q  390 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 488  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  489 gatg 492  Q
    ||||    
T  21997648 gatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  469 tggtctaagttg 480  Q
     |||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23201861 - 23201802
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201861 atgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23201802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22032806 - 22032752
Alignment:
Q  3 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032806 gttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22032752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725871
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14079640 - 14079584
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14079640 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 14079584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18769631 - 18769687
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18769631 atgttgaattctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18769687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909013
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20909071 gtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21366293 - 21366349
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21366293 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21366349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 22107022 - 22107094
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22107022 gtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 22107094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24529700 - 24529632
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24529700 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 24529632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25422011 - 25421943
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25422011 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaaga 25421943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25431873 - 25431805
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25431873 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaaga 25431805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37724389 - 37724337
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724389 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 37724337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245526
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42245468 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 481
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902159
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 20902110  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448054
Alignment:
Q  342 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  439 ctgttg 444  Q
    ||||||    
T  29448059 ctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 2154617 - 2154775
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2154617 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 2154715  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2154716 tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 8286494 - 8286563
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  8286494 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaaga 8286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9078431 - 9078268
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  9078431 ttttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatt 9078333  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||  |||| | | |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9078332 tagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 9078268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13095973 - 13095905
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13095973 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 13095905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20806039 - 20805983
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20806039 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcct 20805983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345981
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29346039 gtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 23500972 - 23501031
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23500972 atgtagaattctgtattcctaacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 31342589 - 31342539
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31342589 aattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 31342539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  372 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 470  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  471 gtctaa 476  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245137
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39245192 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24494047 - 24493979
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24494047 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 24493979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 24766983 - 24767047
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  24766983 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaaga 24767047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29348611 - 29348454
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29348611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29348513  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29348512 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29348454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29351084 - 29350927
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29351084 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29350986  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29350985 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29350927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Original strand, 17918794 - 17918845
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17918794 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154941
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 36154885  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  36154886 gtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 23572551 - 23572510
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 42  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572551 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13025789 - 13025721
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13025789 ttttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 13025721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22760133 - 22760081
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22760133 atgttgatttccgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22760081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32027551 - 32027394
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32027551 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32027453  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32027452 gtgttgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319185
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 18319135  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23064559 - 23064512
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26704542 - 26704499
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26704542 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26704499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 477
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26974275 - 26974232
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26974275 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26974232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38619482 - 38619435
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 22177797 - 22177891
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||    
T  22177797 agttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagtttgaacctgagaaagtttaaaaatg 22177891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 24767151 - 24767208
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | ||||||    
T  24767151 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 24767208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  424 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1858614 - 1858666
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1858614 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 12028215 - 12028255
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12028215 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 12028255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 430
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 430  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 20910454 - 20910490
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20910454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 20910490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 22107139 - 22107179
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22107139 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22107179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24222344 - 24222304
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24222344 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24222304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31061124 - 31061069
Alignment:
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31061124 ttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26681045 - 26681006
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26681045 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 26681006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26952652 - 26952613
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26952652 tattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 26952613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Original strand, 20026526 - 20026568
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20026526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 20026568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 480
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 480  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 26742390 - 26742436
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26742390 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 4036673 - 4036636
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4036673 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16674605 - 16674568
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16674605 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16674568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 17410915 - 17410874
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 42  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17410915 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaga 17410874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 17718092 - 17718129
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17718092 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17718129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18356780 - 18356743
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18356780 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18356743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18784500 - 18784463
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18784500 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 21340420 - 21340457
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21340420 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21482931 - 21482894
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21482931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 21884842 - 21884879
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21884842 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21884879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 23535242 - 23535279
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23535242 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23535279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 24532701 - 24532738
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24532701 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24532738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 25229059 - 25229096
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25229059 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 25293215 - 25293252
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25293215 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744037
Alignment:
Q  142 tgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 25744037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26172917 - 26172880
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26172917 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26172880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 26665784 - 26665821
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26665784 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26665821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 26937381 - 26937418
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26937381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26937418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33409659 - 33409622
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33409659 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33409622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 42805873 - 42805836
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42805873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20232983 - 20232955
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232983 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 20232955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26704122 - 26704074
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26704122 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26704074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26973855 - 26973807
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26973855 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 12942
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13419 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagttt 13320  T
Q  117 aagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13319 aagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttg-ttaggttaaat 13221  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    | |||  || || |||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |    
T  13220 gtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-ggataa 13122  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13121 tctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 13022  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13021 gctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 415
Target Start/End: Original strand, 18002 - 18277
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagtta--cagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttg 237  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |  || ||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||    
T  18002 cctgaactcgccatagcgagtggaggctctcgcctcgcgagc--cctagtgagacagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttg 18098  T
Q  238 atgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 336  Q
    ||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  |    
T  18099 atgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttgatgttgttattaatgtga 18197  T
Q  337 tataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18198 tataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10542
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10995 agttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaatagtttaagaatgaattt 10896  T
Q  129 tgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    | | ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | || |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  10895 ttgtgagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctctgtc 10797  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10796 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgtt 10698  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10697 gttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 10598  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10597 actgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 130386 - 129908
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  130386 ttttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagttt 130287  T
Q  117 aagaatgaacttt-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||||| | ||| |||| || ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  130286 aagaatggatttttgggaattacacctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtttaggataaat 130187  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||    
T  130186 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatga 130088  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130087 attgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 129988  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  129987 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 477
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60818
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T
Q  471 gtctaag 477  Q
    || ||||    
T  60812 gtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60548
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatacattgtttagg 60548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23669 - 23632
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23669 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6615
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7092 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagttt 6993  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    |||||| ||  ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6992 aagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaat 6893  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6892 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatga 6794  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  6793 tctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat 6694  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6693 catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14472 - 13995
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14472 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagttt 14373  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    |||||| ||  ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14372 aagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaat 14273  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  14272 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatga 14174  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  14173 tctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat 14074  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14073 catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2924
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| ||   |||    
T  2445 ttttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctgtaaagattt 2544  T
Q  117 aagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatg 216  Q
     |||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2545 tagaatgaaatttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggaaaaatg 2644  T
Q  217 cgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2645 tgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgat 2744  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatata----cattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2745 ctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatatacattttatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2842  T
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2843 atgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7290 - 6822
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  7290 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 7191  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7190 tagaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaat 7091  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||    
T  7090 gcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactg-atgcatatga 6992  T
Q  315 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
      ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6991 attaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcat 6895  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 486  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6894 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8483 - 8097
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaact 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  8483 agttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 8384  T
Q  128 ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| |||  || ||    
T  8383 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagttgtccagttacataatgctttg-ttaggtataatgtgatctttgtc 8285  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8284 tcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgtt 8186  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8185 gttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 33003 - 32538
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | ||    
T  33003 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaatagtctaagaatggattt 32904  T
Q  129 t-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||    
T  32903 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatctttgtc 32805  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  32804 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttttt 32706  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  32705 gttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcat 32607  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  32606 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 51526 - 51590
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51526 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattagga 51590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 492
Target Start/End: Original strand, 5765 - 6240
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttta 117  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||| | |||||||||    
T  5765 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaaccagtaatagttta 5864  T
Q  118 agaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgc 217  Q
    || ||| | |||| || |||||||||||||| || | | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5865 aggatggattttgtgatttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgc 5964  T
Q  218 gatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatc 316  Q
    |||  || |||| | ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  5965 gatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaatt-gtataatc 6063  T
Q  317 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6064 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatga 6163  T
Q  416 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6164 tgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 128)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19652674 - 19652198
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  19652674 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacctggaaagactt 19652575  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19652574 ta-gaatgaatttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaataccttgtttaggataaa 19652476  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| |  |||||    
T  19652475 tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactga-tgcatatg 19652377  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcat 413  Q
    |  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652376 aattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatgttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 19652278  T
Q  414 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652277 gatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23019874 - 23019408
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  23019874 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatattttaagaatgaattt 23019775  T
Q  129 t-gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  || ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  || ||    
T  23019774 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagttgtccaattacaaaatgc-ttggttaggttaaatgcgatctttgtc 23019676  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||    
T  23019675 gaacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctaatgtcgtt 23019577  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  23019576 gttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcat 23019477  T
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    ||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||    
T  23019476 actgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatgaaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 437
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080800
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaactt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  129 -tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
     ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||      | ||||||  |||||||||||   |||||||| ||| ||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtctgacagaacaccttgtttaggaataatgcgatccttgtc 22080590  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||    
T  22080591 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgtt 22080690  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 426  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22080691 gttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcata 22080789  T
Q  427 ctgtctatgtt 437  Q
    ||| |||||||    
T  22080790 ctgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 29808525 - 29808999
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  29808525 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 29808624  T
Q  116 taagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    | |||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||     
T  29808625 ttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa- 29808723  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |  |||||    
T  29808724 tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatg 29808822  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29808823 aattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 29808919  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  29808920 tgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 28496115 - 28496588
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | |||||||||||| || ||  |    
T  28496115 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agact 28496213  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     ||||||||   |||| || |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||     
T  28496214 tagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa- 28496312  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||| |||| |  |||||    
T  28496313 tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatg 28496411  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  28496412 aattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 28496508  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28496509 tgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1561786 - 1561307
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| || |    
T  1561786 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaaaa 1561687  T
Q  113 gtttaagaatgaac---tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
      ||| |||||||    |||| || |   ||| |||||  ||| || ||| | |||||||||||||| || |       ||||| |||||||||||||||    
T  1561686 actta-gaatgaaaacttttgagaatctgacc-gaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcgggagcacttgttttacataatgccttgtttagg 1561589  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |      
T  1561588 ttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgc 1561490  T
Q  309 atatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtt 406  Q
    |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||    
T  1561489 atatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattatt 1561393  T
Q  407 atatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  1561392 atatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 140 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668386
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgat 19668630  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19668629 gtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgta-tatgatgtagtgttgttgataatgttata 19668531  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  19668530 tagttgtatatacattacatgaattacgtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatg 19668432  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19668431 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 329
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27333238
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | || ||||||||| ||   |||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattt 27333025  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27333026 tagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttg-ttaggttaaat 27333124  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |    
T  27333125 gtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt-gtataa 27333223  T
Q  315 tctaatgttgttgtt 329  Q
    || ||||||||||||    
T  27333224 tccaatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 329
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393978
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | || ||||||||| ||   |||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattt 27393765  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27393766 tagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttg-ttaggttaaat 27393864  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga 314  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |    
T  27393865 gtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt-gtataa 27393963  T
Q  315 tctaatgttgttgtt 329  Q
    || ||||||||||||    
T  27393964 tccaatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 493
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185939
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctg 4185555  T
Q  108 -aaatagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     ||| |||||| ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||      
T  4185556 gaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaatgccttg-c 4185653  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctga 304  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||  || | || ||||| | || |||| || || |    
T  4185654 taggttaaatgcgatccttgccgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtct-a 4185752  T
Q  305 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
    |||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  4185753 att-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatatt 4185849  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  4185850 gttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4185939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4668277
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| |||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4667945  T
Q  108 -aaatagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     ||| |||||| ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||      
T  4667946 gaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttg-c 4668043  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctga 304  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || |    
T  4668044 taggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-a 4668142  T
Q  305 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
    |||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  4668143 att-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatatt 4668239  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4668240 gttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4675124
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| |||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4674792  T
Q  108 -aaatagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     ||| |||||| ||||||| ||| | ||  || |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  4674793 gaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaaccttaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct 4674891  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctga 304  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || |    
T  4674892 -aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-a 4674989  T
Q  305 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
    |||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  4674990 att-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatatt 4675086  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4675087 gttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 493
Target Start/End: Original strand, 31155031 - 31155515
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  31155031 attctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 31155130  T
Q  108 aaatagttta-agaatgaact--ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgt 204  Q
     || || | | | || ||| |  |||||| | | ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||  |||||||||    
T  31155131 gaa-agatcagaaaacgaattccttgggaat-gaacctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctacccctttacaacatgccttgt 31155228  T
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||  ||||||||||  || |||||||||| | || |||| || ||     
T  31155229 t-aggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgttgtgagatgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtcta 31155327  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    ||||  | | |||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| || |||   |||| |||||||||||||||||    
T  31155328 aattttt-taatccgatgatgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatat 31155424  T
Q  403 tgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg-ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  31155425 tgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatgt 31155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 481
Target Start/End: Original strand, 9098375 - 9098620
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  9098375 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgtt- 9098472  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
               |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  9098473 -----------atataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt 9098560  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098561 gcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25644801 - 25644607
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25644801 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagttt 25644702  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25644701 aagaatggatttttgggagttacacccgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatg-cttgtttaggtt 25644607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20109412 - 20109140
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||  |||||| ||||  || ||| |  | ||||||    
T  20109412 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgta-tatcaattgatgttg 20109314  T
Q  325 ttgttaatggtatataat--tgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 420  Q
    ||  |||||  |||||||  |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||    
T  20109313 tttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttt 20109214  T
Q  421 tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  20109213 tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 492
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  395 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 492
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  395 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189206
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| |||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4189345  T
Q  108 -aaatagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     ||| |||||| ||||||| ||| | ||  || |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||      
T  4189344 gaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctaaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttg-c 4189247  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  4189246 taggttaaatgcgatcgttgtcgcacgagttgttgtgagtt 4189206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18457193 - 18457006
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| | || ||     
T  18457193 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt- 18457095  T
Q  117 aagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
    |||||||||||||  || || || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  18457094 aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtt 18457006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  381 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  481 atgatga 487  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 25956263 - 25956424
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  25956263 ttttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacctggaatagttt 25956362  T
Q  117 aagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgc 177  Q
    |||||| ||  ||| |||||| |||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25956363 aagaatggattttttggagttacacctgtattcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 25956424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 19303183 - 19303343
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| || ||    
T  19303183 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agatt 19303281  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcg 176  Q
     ||||||||   ||||| | |   |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  19303282 tagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 19303343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076704
Alignment:
Q  383 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  483 gatgatgatg 492  Q
    || |||||||    
T  20076713 gaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25644444 - 25644335
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 471  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644444 tttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcgg 25644345  T
Q  472 tctaagttga 481  Q
    ||||||||||    
T  25644344 tctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595550
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  1595608 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 20637936 - 20638004
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20637936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 20638004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782228
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 22782287  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22782286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  474 taagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 20360612 - 20360681
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20360612 tttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 20360681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291341
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2291283 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 489
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227625
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742318
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12742376 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 16920282 - 16920354
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  16920282 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaaga 16920354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 17287438 - 17287506
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17287438 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 17287506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334753
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18334695 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821536
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattagga 18821536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005047
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19005105 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859080
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19859022 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21739649 - 21739705
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739649 atgttgaattctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21739705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21834517 - 21834573
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21834517 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21834573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 22779869 - 22779937
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22779869 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 22779937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422548
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24422606 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861795
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33861853 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864279
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33864337 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttg-taatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557053
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20556996 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676861
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ct 30676812  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055030
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8055088 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21939862 - 21939794
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21939862 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaaga 21939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 25611365 - 25611429
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25611365 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagga 25611429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 26924644 - 26924801
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  26924644 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 26924742  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26924743 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  469 tggtctaagttgatga 484  Q
     | |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 15041177 - 15041246
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaat 70  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15041177 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaat 15041246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22439283 - 22439230
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22439283 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 15894072 - 15894136
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15894072 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattagga 15894136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16523030 - 16523086
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16523030 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgcct 16523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754810
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 25754869  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25754868 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19863413
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19863413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 22334525 - 22334588
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22334525 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattagga 22334588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656630
Alignment:
Q  390 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 488  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25656634  T
Q  489 gatg 492  Q
    ||||    
T  25656633 gatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29061015 - 29060856
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaaga 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||||| ||   ||  |||    
T  29061015 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtaga 29060916  T
Q  121 atgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||| ||||| | |   |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  29060915 atgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcga 29060856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 18409469 - 18409559
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  18409469 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 18409559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22831974 - 22831908
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||  |||||||    
T  22831974 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattag 22831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23076997 - 23076749
Alignment:
Q  232 gagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgtta 330  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||||  ||    
T  23076997 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg-atatagatgatttgatgttgttaata 23076899  T
Q  331 atggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatac 427  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| || ||||||||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   |||    
T  23076898 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtac 23076799  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076798 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963384
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34963432 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 35008419 - 35008167
Alignment:
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||||    
T  35008419 gcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctg-atatagatgatttgatgttgtt 35008321  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgc 423  Q
      |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| || |||| |||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||      
T  35008320 aataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttat 35008221  T
Q  424 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
     ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35008220 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541072
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  1541017 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18456877 - 18456735
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  18456877 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 18456779  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456778 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22432733 - 22432680
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22432733 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgt 22432680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 25641821 - 25641874
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25641821 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 25641874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18180965 - 18180925
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180965 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18180925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18907601 - 18907549
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907601 atgtcgaattctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 18907549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20594252 - 20594184
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  20594252 tttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaaga 20594184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 365
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  273 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 365  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21939738 - 21939633
Alignment:
Q  141 ctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatg 240  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |     
T  21939738 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgtta 21939639  T
Q  241 tgagtt 246  Q
    ||||||    
T  21939638 tgagtt 21939633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 3852021 - 3852178
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| | || ||||| || ||| | ||||| | |    
T  3852021 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3852119  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3852120 gtgttgctgttg-ttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11185974 - 11185922
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11185974 gtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgt 11185922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  473 ctaag 477  Q
    |||||    
T  18461899 ctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20803190 - 20803242
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20803190 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22429668 - 22429724
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22429668 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcct 22429724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831524
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 25628997 - 25629160
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||| | || | |||||||||||| || | ||| | ||||||||||| |||||| ||    
T  25628997 ttttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaaata-tt 25629095  T
Q  116 taagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | ||||| ||| |||| || |   ||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25629096 ttagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcga 25629160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448678
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 16448628  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696569
Alignment:
Q  309 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  408 tatcatga 415  Q
    ||||||||    
T  18696576 tatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 22780297 - 22780344
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22780297 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 486  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18706495 - 18706387
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  18706495 taatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgt 18706397  T
Q  406 tatatcatga 415  Q
    ||||||||||    
T  18706396 tatatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20109682 - 20109605
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct 106  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||    
T  20109682 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 60
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059429
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 17804665 - 17804613
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17804665 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17804613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 25603027 - 25603091
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25603027 ttttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagga 25603091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 27415596 - 27415632
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27415596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  398 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16964996
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaa 16964996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 477
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18821904 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405748
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgcct 22405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 51
Target Start/End: Original strand, 20907631 - 20907669
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttga 51  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20907631 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttga 20907669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 25766812 - 25766858
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25766812 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25766858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 1587384 - 1587421
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1587384 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 2684994 - 2685031
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2684994 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2685031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 5616467 - 5616504
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5616467 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12496761 - 12496724
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12496761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagt 12496724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12707141 - 12707104
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12707141 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12707104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16741660 - 16741623
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16741660 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16741623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19663221 - 19663184
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19663221 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19663184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21702740 - 21702703
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21702740 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21702703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 1645173 - 1645121
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1645173 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagt 1645121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 493
Target Start/End: Original strand, 4738631 - 4738675
Alignment:
Q  449 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  4738631 tttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 9481931 - 9481983
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9481931 atgtcgaattctgagtttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9481983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18697031 - 18696979
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatg-tttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18697031 agttgaactttagatgatttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 18696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 18821585 - 18821625
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18821585 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 18821625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 365
Target Start/End: Original strand, 18896256 - 18896304
Alignment:
Q  317 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 365  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18896256 taatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattat 18896304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 19790429 - 19790469
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19790429 gtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 19790469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 23657070 - 23657110
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23657070 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 23657110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 25611489 - 25611529
Alignment:
Q  139 acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25611489 acctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcga 25611529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 27553265 - 27553297
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27553265 gacttttgagttgaaccttggatgtttttgagt 27553297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 27567247 - 27567299
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27567247 atgttgatttttgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagt 27567299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 132
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||   |||    
T  609 ttttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacttggaaagattt 510  T
Q  117 aagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  509 tagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaat 410  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgat 315  Q
    |||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||| ||  ||||||     
T  409 gcgatctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgttatcttgctgttgttgttctagtgagactg-atacatatgaa 311  T
Q  316 ctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
     | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  310 ttgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 211  T
Q  415 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  210 atgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 187 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5952 - 5654
Alignment:
Q  187 agttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgttatcttgctgttg 286  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  5952 agttacagaatgccttatttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtttttatcttgttgttg 5853  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 386  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852 ttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 5753  T
Q  387 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgat 485  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5752 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 5961
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  6072 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacttggaatagttt 5973  T
Q  117 aagaatgaactt 128  Q
    ||||||||||||    
T  5972 aagaatgaactt 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 492
Target Start/End: Original strand, 671 - 1151
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagatag------gagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |      |||||| |||||||||||| |||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattgagattgaacctgtaat 770  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  771 agtttaaggatggattttgtgagttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggtt 870  T
Q  212 aaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagtt-gttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||       
T  871 aaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta 970  T
Q  311 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttata 409  Q
    |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  971 a--atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttata 1068  T
Q  410 tcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1069 tcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 185 - 493
Target Start/End: Original strand, 14506 - 14815
Alignment:
Q  185 ccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgt-tatcttgctg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14506 ccagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctg 14605  T
Q  284 ttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgtt 383  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14606 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgtt 14705  T
Q  384 gttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatg 483  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14706 gttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14805  T
Q  484 atgatgatgt 493  Q
    ||||||||||    
T  14806 atgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30372 - 30428
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30372 atgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 30428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2329 - 2292
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2329 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Original strand, 45426 - 45910
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aa 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||    
T  45426 tgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacctggtaa 45525  T
Q  111 tagtttaagaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttag 208  Q
     | |||| ||||||| |||  | || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||    
T  45526 gacttta-gaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttag 45624  T
Q  209 gttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatt 307  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  || || ||||||| |||| |     
T  45625 gataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactga-tg 45723  T
Q  308 aatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtt 406  Q
     ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  45724 catatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgtt 45823  T
Q  407 atatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45824 atatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 161164 - 160685
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaa-atagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||    
T  161164 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagactt 161065  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | ||  || ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||  |  | |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  161064 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaagtcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaatgtcttggttaggataaa 160966  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatg 313  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||| |  |||||    
T  160965 tgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactga-tgcatatg 160867  T
Q  314 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatca 412  Q
    |  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  160866 aattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatca 160768  T
Q  413 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgtcc 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160767 tgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501095
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || ||    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ct 501144  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 85583 - 85741
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  85583 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 85681  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  85682 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 173758 - 173706
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  173758 atgtcgaattctgagtttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagt 173706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 422173 - 422221
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttga-cttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  422173 gaattttgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 422221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 188 - 438
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 386  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgatatttgagatgttgtt 2229  T
Q  387 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2230 gatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 188 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13075 - 12770
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13075 gttacaaaatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttg 12976  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgt 385  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||     
T  12975 ttgttccagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttga 12877  T
Q  386 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgat 485  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12876 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 12777  T
Q  486 gatgatg 492  Q
     ||||||    
T  12776 tatgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6074 - 6018
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6074 atgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7269 - 7213
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7269 atgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8269 - 8180
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaa 118  Q
    |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8269 agttgaactttagttgtttctaagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaa 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13310 - 13233
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct 106  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||    
T  13310 agttgaactttagttgtttatgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 127 - 493
Target Start/End: Original strand, 10293 - 10659
Alignment:
Q  127 tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttct 226  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||  || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  10293 tttgtgagttacacctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgt 10391  T
Q  227 cgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgt 325  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | |||||||    
T  10392 tgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgt 10490  T
Q  326 tgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgca 424  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10491 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgca 10590  T
Q  425 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  10591 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10279
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagat 86  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  10210 ttttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaagat 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 994
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagga 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||||||||    
T  1062 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattagga 994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 188 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 62503 - 62202
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 286  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  62503 gttactgaatgccttgtttatgttaa-tgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 62405  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 386  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62404 ttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgtt 62305  T
Q  387 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 486  Q
    |   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  62304 g---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatg 62208  T
Q  487 atgatg 492  Q
    ||||||    
T  62207 atgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 133132 - 132661
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  133132 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactt 133033  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga--actgcccagttacagaatgccttgtttaggtta 212  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  133032 ta-gaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtc--ttacataatgccttgtttaggtta 132936  T
Q  213 aatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaata 311  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||| |  |||    
T  132935 aatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcata 132837  T
Q  312 tgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 411  Q
    |||  | ||||||||  ||||| | ||||      ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  132836 tgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatc 132744  T
Q  412 atgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132743 atgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136681
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  136739 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139150
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  139208 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144088
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  144146 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134212
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  134270 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141619
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  141677 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 493
Target Start/End: Original strand, 22459 - 22788
Alignment:
Q  161 agaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgtta 260  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22459 agaggctctcgccttgcgaatgacccagttacagaaagtcttgcttatgctaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 22558  T
Q  261 gaaactaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatg 359  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| | || ||||||| |||| |  ||||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22559 gaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactga-tgcatat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatg 22653  T
Q  360 aattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 458  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22654 aattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaag 22753  T
Q  459 ctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22754 ctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 79974 - 80203
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  79974 ttttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 80072  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||||| |||||||| || |   | ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  80073 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcaatagtattacagaatgccttgtttaggttaaa 80171  T
Q  215 tgcgatgcttc-tcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  80172 tgcgat-cttcgtcgcacgagttgttatgagtt 80203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82073
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ct 82132  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  82131 gtgttgctgttg-ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21196 - 21263
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgta 68  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  21196 atgtcgaattctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgta 21263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 475
Target Start/End: Original strand, 7711 - 8161
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaa-ct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  7711 agttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaatagtttaagaatgaattt 7810  T
Q  128 ttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctc 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || ||    
T  7811 ttgggggttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgccttg-ctaggttaaatgcgatctttgtc 7909  T
Q  228 gcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 326  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| || ||| ||  ||||||| | ||||||||    
T  7910 gcaagaattgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactg-atgtatatgatttgatgttgtt 8008  T
Q  327 gttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttg 422  Q
      |||||  |||||||| |||||||||||  |||||||| | || || ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  8009 tataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttg 8108  T
Q  423 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8109 catactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 15472 - 15765
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15472 ttttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacctggaatagttt 15571  T
Q  117 aagaatgaactttg-ggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||||| | |||  ||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15572 aagaatggatttttcggaattacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttatgttaaat 15671  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15672 gtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta 15765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15894
Alignment:
Q  390 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T
Q  490 atg 492  Q
    |||    
T  15892 atg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 179128 - 179085
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  179128 ttttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 178945 - 178897
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  178945 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 178897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 481
Target Start/End: Original strand, 7841 - 8180
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7841 cctgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgtt-agggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgat 7939  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  7940 gtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttg---tttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttgataatgttata 8035  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||    
T  8036 tagttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatg 8134  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8135 ttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 449
Target Start/End: Original strand, 28917 - 29354
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaa 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||    
T  28917 tgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaa 29016  T
Q  111 tagtttaagaatg--aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttag 208  Q
     | ||  ||||||  || || | || |   ||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| || |      ||||||||||||||| |||||    
T  29017 gactt--agaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttag 29112  T
Q  209 gttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatt 307  Q
    ||| ||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||     
T  29113 gttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactg-atg 29211  T
Q  308 aatatgatctaatgttgttgtta---atggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
      |||||  |||||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||| ||||   |||| ||| || |||||||||||    
T  29212 cttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatatt 29308  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttat 449  Q
     ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  29309 attatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 187 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1096
Alignment:
Q  187 agttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgtt 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||| ||||    
T  1391 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgtt 1293  T
Q  286 gttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttg 384  Q
    ||| || ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  1292 gttgttccagtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttg 1194  T
Q  385 ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1193 atgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32567 - 32101
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg-aaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  32567 tgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaa 32468  T
Q  111 tagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
     | |||| ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||||    
T  32467 gacttta-gaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttagg 32369  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    |||||||||||  || |||||| |||||||          |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||| |      
T  32368 ttaaatgcgatctttgtcgcactagttgat----------cttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgc 32280  T
Q  309 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 408  Q
    ||||||  | ||||||||  ||||| | ||||      ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  32279 atatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttat 32187  T
Q  409 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32186 atcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3207
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3411 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagttt 3312  T
Q  117 aagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3311 aagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaat 3212  T
Q  216 gcgat 220  Q
    |||||    
T  3211 gcgat 3207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16142 - 15665
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||     
T  16142 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa- 16044  T
Q  112 agtttaagaatgaactttgggagttgc--acctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||  | | ||||||  ||  |||   |  ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||| ||||||    
T  16043 agactcaaaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctt-tttagg 15946  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    |  ||||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||| |||| ||     
T  15945 tggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactga-ttc 15847  T
Q  309 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
     |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||    
T  15846 ttatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattatta 15750  T
Q  408 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15749 tatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1816 - 1768
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1816 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9133
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||  | ||| | |||||| |||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 9465  T
Q  108 -aaatagtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt 205  Q
     ||| |||||| ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||      
T  9464 gaaagagttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttg-c 9367  T
Q  206 taggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctga 304  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||| | || |||| || || |    
T  9366 taggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-a 9268  T
Q  305 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatatt 403  Q
    |||  | | ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  9267 att-gtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat--gaagttgatgaattgcattcgatatt 9171  T
Q  404 gttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9170 gttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34603 - 34127
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| |    
T  34603 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-a 34505  T
Q  113 gtttaagaatgaactttgggag--ttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggt 210  Q
    |  | ||||||||  || ||||  |   ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |     |||||| ||| |||| |||||||    
T  34504 gacttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctt-tttaggt 34407  T
Q  211 taaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaa 309  Q
    | ||||||||  || | |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||       
T  34406 tgaatgcgatctttgttgttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactg-atgct 34308  T
Q  310 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttat 408  Q
    |||||  |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  34307 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattat 34211  T
Q  409 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34210 atcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13503
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaga 13503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 324 - 285
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 484  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  324 gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 7)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136471
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||   || ||| ||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgat 136230  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtat 337  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  136231 gtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttat 136329  T
Q  338 ataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctat 434  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| ||||    
T  136330 atagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 136428  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    || |||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  136429 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 144840 - 145179
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||   || ||| ||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgat 144938  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtat 337  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  144939 gtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttat 145037  T
Q  338 ataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctat 434  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| ||||    
T  145038 atagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 145136  T
Q  435 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    || |||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  145137 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 63039 - 62913
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  63039 tttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaata-ttt 62941  T
Q  117 aagaatgaa-ctttgggagttgcacctg 143  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  62940 tagaatgaatttttgtgagttgcacctg 62913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 125061 - 124993
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  125061 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174785
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 174789  T
Q  474 taag 477  Q
    ||||    
T  174788 taag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 175243 - 175202
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 1939 - 2303
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaata 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||      
T  1939 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacataaaaag 2038  T
Q  113 gtttaagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggtt 211  Q
      || |||||||| ||| | ||  || |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  2039 actttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggtt 2138  T
Q  212 aaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaat 310  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||| ||| ||  ||    
T  2139 aaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactg-atgcat 2237  T
Q  311 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 384  Q
    ||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2238 atgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgatattcgagatgttg 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28720
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctga-aatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   || | ||    
T  28451 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctacgaagactt 28550  T
Q  116 taagaatgaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
    || ||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  28551 ta-gaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaa 28649  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgt 284  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28650 tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgt 28720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 493
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28888
Alignment:
Q  412 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11296
Alignment:
Q  188 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttg 286  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||     
T  11598 gttacagaatgccctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgtta 11499  T
Q  287 ttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgt 385  Q
     | ||  |||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  11498 atgttcaagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 11403  T
Q  386 tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgat 485  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  11402 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 11303  T
Q  486 gatgatg 492  Q
    |||||||    
T  11302 gatgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2001
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  440 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 481
Target Start/End: Original strand, 103403 - 103737
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||   || ||| ||||||||||    
T  103403 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgat 103501  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||     
T  103502 gtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgttatg 103600  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgt 436  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  ||      ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  ||||||    
T  103601 tagttgtatatacattacatgaattatgt--at------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgt 103692  T
Q  437 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  103693 tgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Original strand, 103241 - 103333
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatgaa 125  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  103241 gaaccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaa 103333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12924 - 12587
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||||  ||||||| |||||||||| ||   || |||||||||| |||    
T  12924 cctgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggat 12826  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||   ||| || | ||||||||  |||||  |||    
T  12825 gtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtct-aatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgata 12727  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgttga--tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 436  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12726 taattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgt 12628  T
Q  437 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12627 tgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 15257 - 15420
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatag-tt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||| |||  |||| ||    
T  15257 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctg-gatagatt 15355  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  15356 ttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcga 15420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13111 - 13017
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  13111 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatg 13017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 19649 - 19987
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||   || ||||||| ||||||    
T  19649 cctgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgat 19747  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
     |||||| ||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||  |||||  |||    
T  19748 atgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaatt-atatgatttgatgttattaataatgtgata 19846  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||| | ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||    
T  19847 taaatgtatatgcattacatgagttatttatgat-gctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatg 19945  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19946 ttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40228
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||||| | | ||     
T  40390 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctgacaga-ttg 40292  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||| | |   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40291 tagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 40228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18283 - 18339
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18283 atgtcgaattctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 18339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6386
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  6111 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctg 6210  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6211 aatta-tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 6309  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6310 tgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 53398 - 53640
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||| | || ||||||| ||||  |  |||||| | ||||||    
T  53398 tcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttgatgttg 53496  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 422  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  53497 tttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttg 53596  T
Q  423 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 466  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53597 catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 7936 - 8158
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  7936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 8034  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 215  Q
     |||||| ||||||||    |  | | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8035 tagaatgaaactttggagaatctaacagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtgttacagaatgccttgtttaggttaaat 8134  T
Q  216 gcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    |||||  || ||||||||||||||    
T  8135 gcgatctttgtcgcacgagttgat 8158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 53108 - 53203
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  53108 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 53203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38589 - 38339
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  38589 tcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttg 38491  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
       ||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||    
T  38490 agattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt 38391  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
      |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  38390 atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20464 - 20418
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 128735 - 129072
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |      ||||||| |||||||||||||   ||||||  || ||||||||| || |    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcctgtaagacagaataccttgtttaggttgt-tgcgatctttgtcgcacgagatgtt 128833  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
     |||||| ||| | |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  |||    
T  128834 atgagttgatcatggg-gtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgata 128931  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||    
T  128932 tatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatg 129031  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  129032 ttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 78614 - 78345
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||| ||||||||||||||| ||| | |  || || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  78614 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 78515  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  78514 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 78418  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    |||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  78417 tgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 128557 - 128636
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttta 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  128557 ttagatgattttaagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagttatgagattgagattgaacctggaaaagttta 128636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 80801 - 80727
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  80801 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 80727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 438
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2505
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaat 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||     
T  2082 tgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa- 2180  T
Q  112 agtttaagaatg--aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||  | ||||||  || || | || |   ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||| ||||||    
T  2181 agacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgtgttacagaatgcctt-tttagg 2278  T
Q  210 ttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaag-ttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 308  Q
    || ||||||||  ||  ||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||  | || ||||||| ||| ||      
T  2279 ttgaatgcgatctttgccgttcgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactg-atgc 2377  T
Q  309 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 407  Q
     |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| |||    
T  2378 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattatta 2474  T
Q  408 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2475 tatcatgatggtttgcatacggtctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43589
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggat 43535  T
Q  126 ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43536 ttttgggagttacacctgtactcgccatgacgagtagaggctctcgcctcgcga 43589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47509
Alignment:
Q  27 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaat-gaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggat 47455  T
Q  126 ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||||||| |||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47456 ttttgggagttacacctgtactagccatgacgagtagaggctctcgcctcgcga 47509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 389 - 493
Target Start/End: Original strand, 23897 - 24001
Alignment:
Q  389 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23897 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  489 gatgt 493  Q
    |||||    
T  23997 gatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20591 - 20428
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  20591 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacctggaa-agatt 20493  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     |||||| |||||| ||||||   |||||| ||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  20492 tagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcga 20428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 492
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1186
Alignment:
Q  329 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  428 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 3874 - 3914
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3874 gtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38819
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagta 38796  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  38797 ggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 97277 - 97024
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||    
T  97277 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatggg-gtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttg 97180  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  97179 ttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 97080  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
       ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97079 atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 106555 - 106302
Alignment:
Q  226 tcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||    
T  106555 tcgcacgagttgatgtgagttgatcatggg-gtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttg 106458  T
Q  325 ttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgattt 421  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  106457 ttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 106358  T
Q  422 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
       ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106357 atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 1562 - 1900
Alignment:
Q  140 cctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgat 239  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||   || ||||||||||||||    
T  1562 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttgtt-aggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgat 1660  T
Q  240 gtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 338  Q
    ||||||| |||||    || |||||||||||||  |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||  |||    
T  1661 gtgagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgata 1759  T
Q  339 taattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 435  Q
    ||| ||||||| ||||| || |||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||  |||||    
T  1760 taaatgtatatgcattacataaattatatatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatg 1858  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||  |||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1859 ttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3267
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 3244  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  3245 ggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 655 - 818
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||| ||||||   ||     
T  655 ttttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgaaaagattg 754  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||| | |   |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  755 tagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcga 818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 87
Alignment:
Q  191 acagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgt-tatcttgctgttgtta 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||   || |||||| |||||||||||||| ||| | |  || |||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  311 acagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttg 213  T
Q  290 tttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttga 388  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  212 tttcagtaagcctaaattaa-atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattga 114  T
Q  389 attgcattcgatattgttatatcatga 415  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  113 tttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  470 ggtctaag 477  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1911
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  1711 attctgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 1809  T
Q  108 aaatagtttaagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgttt 206  Q
     ||   ||| |||||| |||||||| | |   ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  1810 gaaagattttagaatgaaactttggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgttt 1908  T
Q  207 agg 209  Q
    |||    
T  1909 agg 1911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  470 ggtctaagttgatga 484  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  470 ggtctaagttgatga 484  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 20069 - 20259
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttta 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  | ||| | |||||||||||| | || || |    
T  20069 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-a 20167  T
Q  118 agaatgaacttt--gggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||||  || || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20168 agaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacagaa-gccttgtttagg 20259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 433  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20482 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 65431 - 65479
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65431 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 54033 - 53981
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54033 atgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 53981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 128876 - 128755
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |  | | | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  128876 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttg-ttatttaactaagttgcatgagtt 128778  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||| | |||||||    
T  128777 ggtctaatttgattaagatgatg 128755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  470 ggtctaagttgatga 484  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40335 - 40245
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  40335 ttttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacctg 40245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 39573 - 39663
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  39573 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 39663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25121
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 432  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 481  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 619
Alignment:
Q  307 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 405  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgt 629  T
Q  406 tatatcatga 415  Q
    ||||||||||    
T  628 tatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25555
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| || || ||||||| ||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaaaagtttaaaaatg 25555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4823
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  4987 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 4888  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  4887 ttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12405
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  12569 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 12470  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  12469 ttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 12405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22521 - 22357
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  22521 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 22422  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  22421 ttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  469 tggtctaagttgatga 484  Q
     |||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  469 tggtctaagttgatga 484  Q
     |||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  469 tggtctaagttgatga 484  Q
     |||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 18276 - 18326
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18276 aattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2262
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2330 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 207160 - 207390
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  | ||  | |||||||||||| || ||      
T  207160 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agac 207258  T
Q  116 taagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaa 213  Q
    | |||||| |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       ||||| ||||| |||||||||||||    
T  207259 ttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacacaatgctttgtttaggttaa 207357  T
Q  214 atgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  207358 atgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 207390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 119205 - 119255
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  119205 agttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 119255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 8)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 32601 - 32764
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  32601 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattt 32700  T
Q  117 aagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  | ||| |||||||| ||||||||||    
T  32701 tagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcga 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46404 - 46241
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| ||   |||    
T  46404 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattt 46305  T
Q  117 aagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  | ||| |||||||| ||||||||||    
T  46304 tagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcga 46241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16565 - 16498
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16565 ttttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 16498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19707
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19655 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1398 - 1314
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  1398 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaaga 1314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5321 - 5248
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  5321 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaaga 5248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13147
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  477 g 477  Q
    |    
T  13147 g 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16206
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 16197  T
Q  473 ctaagttga 481  Q
    |||||||||    
T  16198 ctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15933
Alignment:
Q  142 tgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttagg 15933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13670 - 13580
Alignment:
Q  33 gaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13670 gaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaagaatg 13580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3965 - 3881
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  3965 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaaga 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8029 - 7945
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  8029 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaaga 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27855
Alignment:
Q  373 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 27846  T
Q  473 ctaagttga 481  Q
    |||||||||    
T  27847 ctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 27296 - 27347
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27296 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 27347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17259 - 17096
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatag-tt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  17259 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg-gatagatt 17161  T
Q  116 taagaat-gaactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||  ||||||| || |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17160 ttagaataaaactttgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16785
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  ||    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ct 16844  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16843 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12216
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| | ||  ||    
T  12407 ttttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatta-att 12309  T
Q  117 aagaatgaac--tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    ||||||||||  ||||| |  || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  12308 aagaatgaactttttggaaactg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccctgtttagg 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  434 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12024 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11492
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 11492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13896
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaag 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13967 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 13896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||| | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  477 gttg 480  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 21433 - 21492
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21433 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 29325 - 29384
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 468
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38349
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 24291 - 24361
Alignment:
Q  15 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24291 atttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 24361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 6)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 470  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  471 gtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 16856 - 17020
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || || |    
T  16856 tttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agat 16954  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagtt-gcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||| ||| ||   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  16955 ttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcga 17020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 79007 - 79094
Alignment:
Q  20 tgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||    
T  79007 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatgagattgaacctg 79094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 13704 - 13760
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13704 atgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcct 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 79107 - 79163
Alignment:
Q  152 atggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  79107 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttagg 79163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 477
Target Start/End: Original strand, 79288 - 79430
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtct 432  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  79288 atatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg 79387  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  79388 -tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18130
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    | | |||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 6470 - 6538
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6470 ttttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 2132 - 2280
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  2132 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 2230  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2231 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 841 - 569
Alignment:
Q  205 ttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagttaatcttagatgttagaaactaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctg 303  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  841 ttaggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatatg-gtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctg 743  T
Q  304 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatat 402  Q
    ||||| |||||| | || || |   ||||   |||| | ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  742 aatta-tatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatat 646  T
Q  403 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  645 tgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 702 - 770
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2795
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2727 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 4780 - 4852
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4780 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 701 - 773
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  701 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaaga 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10147
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10075 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 10147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10540
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaa 10524  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| ||| |||||||    
T  10525 gttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 13250 - 13318
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13250 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 13318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 336
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  404 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5180 - 5112
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5180 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 5112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  419 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25870
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||||   ||    
T  25706 tttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagatt 25805  T
Q  116 taagaatgaa-ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
      ||||||||  ||||| | |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  25806 gtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 25870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  473 ctaagttgatgatgatg 489  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 33136 - 33204
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  33136 ttttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaaga 33204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32464
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  32536 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaaga 32464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 167632 - 167700
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  167632 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 167700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 52391 - 52323
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52391 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 52323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27315 - 27256
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27315 atgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13679 - 13611
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  13679 ttttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaaga 13611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9836
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 604 - 694
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  604 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacctg 694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 492
Target Start/End: Original strand, 4890 - 4950
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4890 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |     
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39238 - 39076
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || || ||    
T  39238 ttttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatt 39140  T
Q  117 aagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
      ||||| |||||  ||| |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  39139 ttgaatgaaacttgtggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 39076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9750
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||||     
T  9908 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt- 9810  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9809 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20882 - 20718
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || || ||    
T  20882 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agatt 20784  T
Q  117 a-agaatg-aactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| ||||| ||||| |   |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  20783 atagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 20718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16405
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    ||| | |||||||||||| ||   |||    
T  16241 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctggaaagattt 16340  T
Q  117 aagaatgaa--ctttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
      |||||||   ||||| | |   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16341 tcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 16405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  473 ctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21374 - 21301
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  21374 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 21301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 377 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  476 agt 478  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 315
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  383 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 17650 - 17718
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17650 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 17718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16747 - 16679
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16747 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 16679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  379 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 478  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  479 tgatgatgatgatg 492  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15893 - 15837
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 6705 - 6761
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6705 atgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 658
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  821 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagaatt 722  T
Q  116 taagaatg-aactttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
    | |||||| |||||| ||| |   | |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  721 t-agaatgaaacttttggaatctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcga 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3881
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3949 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20748
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20806 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37822
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  37880 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15976 - 16032
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15976 atgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 16032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158611
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  158553 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340064
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 473  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  474 taagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||| || |||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 339593 - 339756
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||||| ||   ||     
T  339593 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 339692  T
Q  117 aagaatgaac-tttgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcga 179  Q
     ||||||||| ||||||| |   || ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  339693 tagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 339756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 71765 - 71729
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  71765 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 71729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 140163 - 140126
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  140163 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 140126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 875 - 934
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  875 atgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 5762 - 5853
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||    
T  5762 ttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacctg 5853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 466  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  467 gttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10507
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10448 atgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaa 10507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15360
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 55  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15306 atgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 15360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 758 - 680
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  758 atgttgaaatctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 267898 - 267679
Alignment:
Q  260 agaaactaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatat 358  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  267898 agaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatga-tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacat 267800  T
Q  359 gaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 455  Q
    ||||||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  ||||||| |||| |||  ||||||    
T  267799 gaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaact 267701  T
Q  456 aagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  267700 aagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 268195 - 268117
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||    
T  268195 agttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 268117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13393
Alignment:
Q  339 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 435  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  436 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13448 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 10910 - 10967
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaat 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10910 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaat 10967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 469  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||     
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  470 ggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 8175 - 8242
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8175 ttttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 8242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2368 - 2312
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2368 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4695
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 4754  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4753 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 6595 - 6543
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595 atgttgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 6043 - 6099
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6043 atgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1926
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1982 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18668
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18600 ttttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 18668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11234
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14055
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 490
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  379 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  478 ttgatgatgatga 490  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23361 - 23293
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23361 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 23293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13948
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14006 gtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4616
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4560 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcct 4616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3275
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3331 atgttgaatcctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6997 - 6941
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6997 atgttgaattttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7782 - 7726
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7782 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 7726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15186
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  15114 gtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaaga 15186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 32914 - 32966
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32914 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgt 32966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 6)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  477 gttgatgatgatgatg 492  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16130 - 16083
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16130 gtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1692
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  1758 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattag 1692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7735 - 7669
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  7735 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattag 7669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 492
Target Start/End: Original strand, 15295 - 15355
Alignment:
Q  431 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  15295 ctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 64290 - 64346
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  64290 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 64346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 47458 - 47389
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaa 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  47458 gtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaa 47389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  426 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 6)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 34537 - 34593
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34537 atgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 478
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 467  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  468 ttggtctaagt 478  Q
    | |||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 23944 - 24010
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaa 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23944 ttttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 24010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Original strand, 41185 - 41236
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41185 gaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcct 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64269
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  64306 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 64269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 76190 - 76153
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  76190 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 76153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 46354 - 46410
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46354 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 46410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13250 - 13194
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13250 atgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 13194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11299
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 11348  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1956
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  469 tggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     |||||||| || ||| |||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2355
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaa 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  2424 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaa 2355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 288
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||||| ||    
T  506 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaatactt 408  T
Q  116 taagaat-gaactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaa 213  Q
      ||||| ||||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||    
T  407 --agaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtattacagaatgccttgtttaggttaa 311  T
Q  214 atgcgatgcttctcgcacgagtt 236  Q
    |||||||  || |||||||||||    
T  310 atgcgatctttgtcgcacgagtt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 10160
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagttt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||  | ||  | |||||||||||| || ||  |    
T  10389 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 10291  T
Q  117 aagaatg-aactttgg-gagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttaggttaaa 214  Q
     |||| | |||||||| || |   | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||    
T  10290 tagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaa 10192  T
Q  215 tgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||  || ||| |||||||| | ||||||    
T  10191 tgcgatctttgtcgtacgagttgttatgagtt 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4890
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||| |||| ||||| | ||| | |||||||||||||||   ||| ||||    
T  4997 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtagaatgagattgaacctgaaaagattttagaa 4898  T
Q  122 tgaacttt 129  Q
    ||||||||    
T  4897 tgaacttt 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4545
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 468  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||| || || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4650 atatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagttgcatgagt 4552  T
Q  469 tggtcta 475  Q
     ||||||    
T  4551 cggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10319
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10356 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 10319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 595
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  649 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgc 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 29015 - 28925
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctg 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  29015 ttttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 28925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 1357 - 1451
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||| |   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  1357 agttgaacttcagatgattttgagtgcctgaacatgtatattaatgattagacaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatg 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27912
Alignment:
Q  370 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  27956 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8789
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacct-gaaatagtt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||| | |     
T  8954 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagattg 8855  T
Q  116 taagaatgaactt-tgggagttgcacctgaactcaccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgaa 180  Q
    ||| |  |||||| ||||| |   |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  8854 taaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaa 8789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 475  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  476 agttgatgatgatgatg 492  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  377 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 476  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 52051 - 51979
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  52051 gtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaaga 51979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227865
Alignment:
Q  46 ttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatg 227865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  319 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 416  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  417 gatttgcatactgtctatgttg 438  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 882 - 830
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  882 atgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7081 - 7013
Alignment:
Q  14 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaa 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  7081 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaa 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 12451 - 12519
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12451 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaaga 12519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 12623 - 12679
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  12623 ttacagaatgc-ttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacgagttgttatgagtt 12679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10555
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10623 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaaga 10555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15163 - 15107
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163 atgttgaattctattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24181 - 24122
Alignment:
Q  1 atgttgaattctg---tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24181 atgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcct 24122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 39605 - 39546
Alignment:
Q  1 atgttgaattctg---tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39605 atgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcct 39546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44542 - 44486
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44542 atgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40401
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  40459 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19656 - 19614
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 43  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 19614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18720 - 18676
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 70224
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 70224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 10222 - 10274
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10222 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 10274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26877 - 26834
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 23890 - 23842
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  23890 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 23842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 36034 - 36077
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36034 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36934 - 36891
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36453
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36501 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 36453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12453 - 12376
Alignment:
Q  38 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtt 115  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||    
T  12453 ttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtt 12376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 8590 - 8643
Alignment:
Q  7 aattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8590 aattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaa 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 482
Target Start/End: Original strand, 1395 - 1432
Alignment:
Q  445 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1395 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 190915 - 190964
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  190915 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 190964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 192618 - 192667
Alignment:
Q  8 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  192618 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 192667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 14963 - 15003
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14963 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 19485 - 19525
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 107
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  165 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1329
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1385 atgtcgaattctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16748 - 16804
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16748 atgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgcct 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18080 - 18136
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18080 atgtagaattctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9544
Alignment:
Q  21 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  9480 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaaga 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 9648 - 9705
Alignment:
Q  189 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatgcttctcgcacgagttgatgtgagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | ||||||    
T  9648 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 9705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1778
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgta 68  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  1711 atgtcgaattttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgta 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29946
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 479  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29991 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 2240
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  2317 atgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9999 - 9922
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattag 79  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| | ||||||    
T  9999 atgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 24174 - 24268
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaacctgaaatagtttaagaatg 123  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24174 agttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaatagtttaaaaatg 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4308
Alignment:
Q  374 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 472  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  473 ctaagttgat 482  Q
    ||||||||||    
T  4317 ctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 5952 - 5995
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5952 ttttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161239
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| |    
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-c 161191  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 480  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1183
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1127 atgtcgaattctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 1893 - 1853
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1893 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4911 - 4863
Alignment:
Q  9 ttctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4911 ttctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcct 4863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 18945 - 18985
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18945 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10637 - 10569
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  || |  |||||||||||||    
T  10637 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaaga 10569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 35153 - 35200
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35153 gaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 35200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  389 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 477  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||| ||||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2245
Alignment:
Q  22 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattaggaaagataggagatttagattgaac 104  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   | | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  2327 actttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 482
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12400
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||  |||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || ||| ||    
T  12253 atataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ct 12351  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 482  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12352 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12216 - 12065
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 432  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  12216 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactg-ct 12118  T
Q  433 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
     ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12117 gtgttgctgtt-------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32867
Alignment:
Q  26 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 32867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 769
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  806 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4373 - 4215
Alignment:
Q  336 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 431  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  4373 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactg-c 4275  T
Q  432 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 492  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4274 tgtgtcgctgtcg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17402
Alignment:
Q  12 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17361 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Original strand, 9081 - 9122
Alignment:
Q  18 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 59  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9081 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2269 - 2217
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2269 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 747
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  799 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45586 - 45534
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45586 atgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35575
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  35524 agttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 10955 - 10992
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10955 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38509
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38472 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 191966 - 192006
Alignment:
Q  13 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  191966 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagt 192006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11438 - 11481
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11438 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatg 11481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 2078 - 2125
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2078 gaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 9938 - 9985
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9938 gaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 6913 - 6960
Alignment:
Q  6 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6913 gaattttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 29228 - 29177
Alignment:
Q  29 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaatgatgattagg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  29228 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattagg 29177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2353
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 43  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2311 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 2353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 345
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  382 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 6484 - 6443
Alignment:
Q  1 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 42  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484 atgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaga 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2315
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2352 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 9345 - 9382
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9345 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15759
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15796 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 18013 - 18050
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18013 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12206 - 12169
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12206 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18807 - 18770
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18807 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 66068 - 66105
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  66068 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 66105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 71209 - 71246
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  71209 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 71246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 85873 - 85832
Alignment:
Q  168 ctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgccttgtttagg 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  85873 ctcgcctcgcgagctgcccagtttcagaataccttgtttagg 85832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1134
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1098 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3211
Alignment:
Q  16 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3183 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 3211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 36757 - 36721
Alignment:
Q  17 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36757 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 857 times since January 2019
Visitors: 2241